摘要
为挖掘出与耐盐相关的基因,解析谷子耐盐机制和指导谷子耐盐育种提供理论支撑,本研究以宛谷098为试验材料,对盐胁迫前后谷子苗期倒二叶叶片进行转录组de novo测序,并采用实时荧光定量RT-PCR进行功能基因验证。结果表明,本研究通过de novo转录组测序检测到宛谷098盐胁迫前后倒二叶中1793个差异表达基因(其中上调基因1054个,下调基因739个),主要为细胞质翻译、细胞质核糖体、核糖体亚基、核糖体的结构成分、依赖信号识别颗粒(SRP)的共翻译蛋白靶向膜等基因。根据GO注释分析发现,参与生物过程的基因差异表达最多,其次是细胞组分,而参与分子功能的基因较少;差异基因数量最高的5个GO项是细胞质翻译和依赖SRP的共翻译蛋白靶向膜2个生物过程、细胞质核糖体和核糖体亚基2个细胞组分、核糖体的结构成分1个分子功能。KEGG代谢途径富集分析结果表明,DEG主要富集在苯丙氨酸代谢、细胞色素P450对异种生物的代谢、药物代谢-细胞色素P450、氨基酸和核苷酸糖代谢、谷胱甘肽代谢等代谢途径和苯丙氨酸的生物合成、类黄酮的生物合成、类胡萝卜素的生物合成等生物学合成上。谷胱甘肽转移酶主要参与细胞色素P450对异种生物的代谢通路、药物代谢-细胞色素P450通路、谷胱甘肽代谢通路、药物代谢-其他酶等通路,参与了活性氧清除过程;核糖体蛋白基因家族是调控植物抗逆性的宝贵资源,在植物耐盐性方面发挥着重要作用。本研究表明,谷子盐胁迫前后基因表达差异显著。
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第14期55-62,共8页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
河南省重点研发专项(编号:231111110300)
国家现代农业产业技术体系专项(编号:nycytx-CARS-06)
河南省农业科学院科技创新团队项目(编号:2022KJCHXTD33)
河南省农业良种攻关项目(编号:2022010401)。
