16S rRNA在医学微生物鉴定中的应用
被引量:9
摘要
随着分子生物学的快速发展以及该技术在医学微生物研究中的应用,16S rRNA作为微生物分类依据已得到广泛认同,本文就其基因特征、技术步骤、临床应用及注意事项的新进展作一简要综述。
出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2010年第4期349-350,共2页
International Journal of Laboratory Medicine
基金
陕西省卫生厅科学研究基金项目(H0813)
参考文献12
-
1Roth A,Fischer M,Hamid ME,et al.Differentiation of phylogenetically related slowly growing mycobacteria based on 16S-23S rRNA gene internal transcribed spacer sequences[J].J Clin Microbiol,1998,36:139-147.
-
2Teng LJ,Hsueh PR,Huang YH,et al.Identification of Bacteroides thetaiotaomicron on the basis of an unexpected specific amplicon of universal 16S ribosomal DNA PCR[J].J Clin Microbiol,2004,42(4):1727-1730.
-
3黄华,徐传彬,高国全,陆淼泉.人苍白杆菌深圳分离株16S rRNA基因部分核苷酸序列分析[J].国际检验医学杂志,2006,27(7):577-579. 被引量:4
-
4Maidak BL,Cole JR,Parker CT Jr,et al.A new version of the RDP(ribosome database project)[J].Nucleic Acids Res,1999,27:171.
-
5Turenne CY,Wttwick E,Hoban DJ,et al.Rapid identification of bacteria frompositive blood cultures by fuuorescene-based PCR-single-strand conformation polymorphism analysis of the 16S rRNA gene[J].J Clin Microbiol,2000,38(2):513.
-
6朱中元,王海波,谢勇,谢萌,王莉,朱义明,郭洁.基因芯片技术检测结核分支杆菌耐利福平基因突变的研究[J].国际检验医学杂志,2008,29(8):679-682. 被引量:2
-
7Call DR,Borucki MK,Loge FJ.Detection of bacteria pathogens in environmental samples using DNA microassays[J].J Microbiol Methods,2003,53(2):235-243.
-
8Cee JE,Sacchi CT,Glass MB,et al.Use of 16S rRNA gene sequencing for rapid I dentification and differentiation of burkholderia pseudomallei and B.mallei[J].J Clin Microbiol,2003,41(10):4647-4654.
-
9Drancourt M,Berger P,Raoult D.Systematic 16S rRNA gene sequencing of atypical clinical isolates identified 27 new bacterial species associated with humans[J].J Clin Microbiol,2004,42(5):2197-2202.
-
10杨祖卿,尚世强.16S rRNA基因在临床上的应用进展[J].国外医学(儿科学分册),2005,32(4):252-255. 被引量:11
二级参考文献35
-
1Espinal MA. The global situation of MDR-TB [J]. Tuberculosis (Edinb), 2003, 83(1-3); 44-51.
-
2Hillemann D, Weizenegger M, Kubica T, et al. Use of the genotype MTBDR assay for rapid detection of rifampin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis complex isolates [J]. J Clin Microbiol, 2005, 43(8): 3699-3703.
-
3Alexander DC, Jones JR, Liu J. A rifampin-hypersensitive mutant reveals differences between strains of Mycobacterium smeg matis and presence of a novel transposon, IS1623 [J]. Antimi crob Agents Chemother, 2003, 47(10): 3208-3213.
-
4Nash KA, Gaytan A, Inderlied CB. Detection of rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis by use of a rapid, simple and specific RNA/RNA mismatch assay [J]. J Infect Dis, 1997 176(2) : 533-536.
-
5Troesch A, Nguyen H, Miyada CG, et al. Mycobacterium species identification and rifampin resistance testing with high-density DNA probe arrays [J]. J Clin Microbiol, 1999, 37(1): 49-55.
-
6黄华 彭常军.人类苍白杆菌致脑膜炎一例[J].中华医学检验杂志,1999,229:241-241.
-
7Turenne CY, Witwicki E, Hoban DJ, et al. Rapid identification of bacteria from positive blood cultures by fluorescence-based PCR-single-strand conformation polymorphism analysis of the 16S RNA gene [ J ]. J Clin Microbiol,2000, 38(2) :513-520.
-
8Corless CE, Guiver M, Borrow R, et al. Contamination and sensitivity issues with a real-time universal 16S rRNA PCR[J]J Clin Microbiol,2000,38(5):1747-1752.
-
9Yang S, Lin S, Kelen GD, et al. Quantitative multiprobe PCR assay for simultaneous detection and identification to species level of bacterial pathogens[J] .J Clin Microbiol,2002,40(9):3449-3454.
-
10Rogers GB, Hart CA, Mason JR, et al. Bacterial diversity in case of lung infection in cystic fibrosis patients: 16S ribosomal DNA (rDNA)length heterogeneity PCR and 16S rDNA terminal restriction fragment length polymorphism profiling[ J ]. J Clin Microbiol, 2004,41 ( 8 ): 3548-3558.
共引文献18
-
1张芳,宋力.16S rRNA基因检测在新生儿败血症早期诊断中的研究进展[J].医学综述,2006,12(17):1035-1037. 被引量:5
-
2贾艳,雷连成,何礼洋,杨洋,韩俊友,韩文瑜.猪源肺炎克雷伯菌的分离与鉴定[J].吉林农业大学学报,2007,29(2):196-199. 被引量:7
-
3王岚峰,王建华,李运生,耿果霞,李勤凡.TMPD降解菌Staphylococcus pasteuri的鉴定[J].安徽农业科学,2007,35(12):3500-3501.
-
4黄华,彭常军,徐传彬,陆淼泉.人苍白杆菌脂多糖的制备及致病性的初步研究[J].国际检验医学杂志,2007,28(6):481-482. 被引量:1
-
5王洪臣,王敏,刘洪祥,骆健美,张锦丽.优良醋酸菌种AC2005的鉴定[J].现代食品科技,2008,24(6):513-516. 被引量:6
-
6付晓艳.分析16S rRNA基因部分序列鉴定一株乳酸菌[J].哈尔滨医科大学学报,2008,42(3):265-267. 被引量:7
-
7黄华,彭常军,徐传彬,陆淼泉.人苍白杆菌外膜蛋白的抗原性及其对羊布鲁菌交叉保护性的初步研究[J].国际检验医学杂志,2008,29(8):685-686.
-
8李运生,王岚峰,王建华.TMPD降解菌Klebsiella oxytoca的鉴定[J].山东农业大学学报(自然科学版),2009,40(3):345-348.
-
9曾涛,朱中元,张荣意.结核分枝杆菌耐异烟肼katG基因LiPA检测研究[J].中国热带医学,2009,9(9):1655-1657. 被引量:1
-
10应燕玲,许先国,朱发明,吕杭军,严力行.16S rDNA快速鉴定血液制品中污染细菌的测序方法的建立[J].中华微生物学和免疫学杂志,2009,29(10):880-883. 被引量:2
同被引文献120
-
1温博贵,李冠武,韩新光,柏素云.牙龈卟啉菌rRNA基因间隔区的序列测定[J].现代口腔医学杂志,2004,18(6):489-491. 被引量:1
-
2管怀进,陆宏.两步聚合酶链反应法快速诊断感染性角膜炎和眼内炎病原体的研究[J].中华眼科杂志,2004,40(12):819-823. 被引量:14
-
3夏涵,府伟灵,陈鸣,黄庆,赵猛,赵渝徽,王丰,罗阳.快速提取细菌DNA方法的研究[J].现代预防医学,2005,32(5):571-573. 被引量:72
-
4屈超义,闫元奎,王丽娅,孙声桃,杨潇远,李振勇,唐罗生.多重PCR对真菌性角膜炎主要致病菌的菌属鉴定[J].现代生物医学进展,2007,7(7):1013-1015. 被引量:5
-
5Ashimoto A,Chen C,Bakker I,et al.Polymerase chain reaction detection of 8 putative periodontal pathogens in subgingival plaque of gingivitis and advanced periodontitis lesions[J].Oral Microbio1 Immunol,1996,1l(4):266-273.
-
6Tran SD,Rudney JD.Multiplex PCR using conserved and species-specific 16S rRNA gene primers for simultaneous detection of Actinobacillus actinomycetemcomitans and Porphyromonas gingivalis[J].J Clin Microbiol,1996,34(11):2674-2678.
-
7Conrads G,Mutters R,Fischer J,et al.PCR reaction and dot-blot hybridization to monitor the distribution of oral pathogens within plaque samples of periodontally healthy individuals[J].J Periodontol,1996,67(10):994-1003.
-
8Wilson KH,Blitchington RB,Greene RC.Amplification of bacterial 16S ribosomal DNA with polymerase chain reaction[J].J Clin Microbiol,1990,28(9):1942-1946.
-
9Watanabe K,Frommel TO.Porphyromonas gingivalis,Actinobacillus actinomycetemcomitans and Treponema denticola detection in oral plaque samples using the polymerase chain reaction[J].J Clin Periodontol,1996,23(3):212-219.
-
10Haffajee AD,Socransky SS,Smith C,et al.The use of DNA probe to examine the distribution of subgingival species in subjects with different levels of periodontal destruction[J].J Clin Periodontol,1992,19(2):84-91.
引证文献9
-
1吕敏琼,桂勤,叶薇,邓燕,关映红,麦瑞芝,李冠武.惠州地区客家人牙周病致病菌PCR分析[J].国际检验医学杂志,2010,31(11):1270-1271. 被引量:2
-
2张志明,朱建伟,李建平.实时荧光定量聚合酶链反应在检测大肠埃希菌引起血流感染中的应用[J].新乡医学院学报,2011,28(1):1-3.
-
3张志明,李建平,朱建伟.16S rRNA在检测肺炎克雷伯菌引起血流感染中的应用[J].中国热带医学,2011,11(3):272-273. 被引量:2
-
4姚纲,胡红焱,梁慧,张健鹏.应用16 S rRNA基因序列分析快速鉴定临床标本中的革兰氏阳性杆菌[J].中国当代医药,2014,21(7):94-95. 被引量:1
-
5姚纲,张健鹏.乳酸杆菌基因鉴定技术研究进展[J].国际检验医学杂志,2014,35(18):2504-2506. 被引量:2
-
6张宁,马燕粉,胡健,杨波,张凯歌,徐纪茹,王晓琴.自发性细菌性腹膜炎病原学快速诊断方法的应用研究[J].山西医科大学学报,2015,46(5):459-463. 被引量:3
-
7赵格,谢立信.感染性角膜炎的分子诊断技术研究进展[J].中华眼科杂志,2015,51(9):709-714. 被引量:6
-
8路振香,郭伟娜,龚争,刘畅,汪训磊.仔猪黄痢病原菌的分子生物学鉴定及多重耐药基因检测[J].畜牧与饲料科学,2017,38(6):12-15.
-
9张玲玲.16SrRNA序列分析法在医学微生物鉴定中的应用研究[J].化工设计通讯,2017,43(12):178-179. 被引量:4
二级引证文献20
-
1冯志俊,闫宏.聚合酶链反应检测成人牙周病患者病原菌的诊断价值[J].中华医院感染学杂志,2013,23(2):476-477. 被引量:4
-
2何小娟.专业化牙齿清洁技术防治牙周炎的效果[J].临床医学工程,2014,21(1):84-85. 被引量:1
-
3姚纲,陈永红,胡红焱,张健鹏.棒状乳杆菌4个管家基因PCR引物的设计与验证[J].中国医学工程,2015,23(8):86-87. 被引量:2
-
4李先峰,王影,李贞贞,唐立.肠道菌群与糖尿病相关性研究进展[J].中国微生态学杂志,2015,27(10):1224-1228. 被引量:9
-
5程军,王飞燕,张思明,王恺隽,郭志超,崔凯.荧光定量PCR基因检测在心血管病患者术后血流感染的诊断应用[J].中华医院感染学杂志,2015,25(23):5290-5292. 被引量:1
-
6黄君华,黄凤霞,张书婉,余建华.16SrDNA测序在儿童自发性细菌性腹膜炎病原学诊断中的作用[J].山西医科大学学报,2016,47(8):764-767. 被引量:1
-
7李柏胜,谢兰丰,刘岩红,沈思兰,钱方兴,郑万方.肝硬化自发性细菌性腹膜炎患者粪便大肠杆菌毒力基因Colv和腹水细菌分布的相关性[J].肝脏,2017,22(5):424-426. 被引量:8
-
8路振香,宗嫚嫚,刘畅,郭伟娜.鸡源棒状杆菌的分离鉴定及同源性分析[J].当代畜牧,2017,46(6):54-56. 被引量:2
-
9夏金伟,蔡莎莎,叶丽君,喻长法,段达荣.PCR在腹膜透析相关性腹膜炎中的应用[J].中国卫生检验杂志,2017,27(23):3388-3390.
-
10刘立春,张秋文,刘素媛.涂片法与培养法对细菌性及真菌性角膜炎实验室诊断价值[J].临床军医杂志,2018,46(7):796-797. 被引量:5
-
1张娜.髋关节置换的功能锻炼探讨[J].现代中西医结合杂志,2010,19(13):1662-1664. 被引量:2
-
2孙丹丹,刘晓华.肠球菌感染分布及耐药性分析与临床检验学研究[J].中国医药指南,2014,12(13):148-149.
-
3许建红,林丽君,许淑花,陈莹.聚焦解决模式在乳腺癌患者健康教育中的应用[J].天津护理,2014,22(6):542-542. 被引量:3
-
4闫惠萍.母婴床旁护理模式对产妇自我护理能力的影响[J].河北医药,2012,34(2):304-305. 被引量:7
-
5董丽.心理障碍可能源于基因变异[J].解放军健康,2007(2):19-19. 被引量:1
-
6朱小佳,罗迎霞,程维,刘雪琴.老年专科领域的核心问题[J].中国老年学杂志,2015,35(3):634-637. 被引量:6
-
7李日清.择期剖宫产新生儿窒息的原因分析及护理干预[J].广西医学,2007,29(5):770-771. 被引量:2
-
8雷智.现代输血新观念[J].人人健康,2003,0(4):37-37.
-
9吴晓燕,张贵祥.扩散加权成像在乳腺癌中的的临床应用进展[J].中国医学影像技术,2012,28(11):2094-2097. 被引量:4
-
10胡文杰.输血有望不分血型[J].教师博览(上旬刊),1997,0(11):43-43.