目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(Ultra high performance liquid chromatography-Quadrupole time of flight mass spectrometry, UPLC-QTOF-MS)技术和网络药理学探究绞股蓝改善阿尔兹海默病的化学成分及其作用机制。...目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(Ultra high performance liquid chromatography-Quadrupole time of flight mass spectrometry, UPLC-QTOF-MS)技术和网络药理学探究绞股蓝改善阿尔兹海默病的化学成分及其作用机制。方法:采用UPLC-QTOF-MS技术鉴定绞股蓝中的化学成分。采用SwissTargetPredection、GeneCards、OMIM数据库获取成分靶点和疾病靶点,使用STRING数据库构建关键靶点蛋白相互作用,利用Cytoscape软件构建核心靶点基因网络图和成分-靶点-通路图,通过DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析。结果:从绞股蓝中共计鉴定出72个皂苷类成分。网络药理学分析表明化合物Gypenoside LI、damulin A、Gypenoside LVII等具有潜在防治阿尔茨海默病的作用,且主要与炎症相关的PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等有关。结论:绞股蓝皂苷可能通过抑制神经炎症发挥防治阿尔茨海默病的作用。展开更多
文摘目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(Ultra high performance liquid chromatography-Quadrupole time of flight mass spectrometry, UPLC-QTOF-MS)技术和网络药理学探究绞股蓝改善阿尔兹海默病的化学成分及其作用机制。方法:采用UPLC-QTOF-MS技术鉴定绞股蓝中的化学成分。采用SwissTargetPredection、GeneCards、OMIM数据库获取成分靶点和疾病靶点,使用STRING数据库构建关键靶点蛋白相互作用,利用Cytoscape软件构建核心靶点基因网络图和成分-靶点-通路图,通过DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析。结果:从绞股蓝中共计鉴定出72个皂苷类成分。网络药理学分析表明化合物Gypenoside LI、damulin A、Gypenoside LVII等具有潜在防治阿尔茨海默病的作用,且主要与炎症相关的PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等有关。结论:绞股蓝皂苷可能通过抑制神经炎症发挥防治阿尔茨海默病的作用。
文摘目的:基于超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱(UHPLC-QTOF-MS^(E))分析并经数字量化处理,结合随机森林(Random Forest,RF)算法构建数据辨识模型,以实现中华草龟、巴西龟、台湾龟、鳄鱼龟、鳖甲基原的数字化鉴定。方法:经样品预处理后,对不同来源、不同批次的龟甲进行UPLC-QTOF-MS^(E)分析,并以混合样品为基准进行峰位校正、提取并经量化处理,获取反映多肽离子信息的精确质量数-保留时间数据对(Exact Mass Retention Time,EMRT)。然后基于信息增益率的特征筛选获取重要多肽离子信息,结合随机森林(RF)算法进行数据建模,同时基于内部交叉验证中的准确率(Acc)、精确率(P)、曲线下面积(AUC)等参数进行模型评价。最后基于最优模型进行龟甲基原的鉴定验证分析。结果:基于信息增益率的特征筛选,得到71个特征多肽信息,建立的RF模型具有优秀的辨识效果,准确率、精确率以及AUC均大于0.950且外部鉴定验证的正确率为100.0%。结论:基于UHPLC-QTOF-MS^(E)分析,并结合RF算法能够高效准确地实现不同来源龟甲基原的数字化鉴定,可为龟甲的质量控制及基原考证提供参考和帮助。
