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基于16S rDNA测序及LC-MS技术探讨四妙勇安汤对糖尿病溃疡小鼠的促愈机制
1
作者 赵亚男 魏建梁 +1 位作者 李秋 刘明 《中华中医药杂志》 北大核心 2025年第2期893-900,共8页
目的:观察四妙勇安汤对糖尿病溃疡小鼠肠道菌群及创面代谢组学的影响。方法:雄性C57/BL6小鼠采用高脂高糖饲料联合链脲佐菌素液腹腔注射法制备糖尿病模型,分别取正常对照组与糖尿病组制作溃疡模型,并分为对照组、模型组、四妙勇安汤组... 目的:观察四妙勇安汤对糖尿病溃疡小鼠肠道菌群及创面代谢组学的影响。方法:雄性C57/BL6小鼠采用高脂高糖饲料联合链脲佐菌素液腹腔注射法制备糖尿病模型,分别取正常对照组与糖尿病组制作溃疡模型,并分为对照组、模型组、四妙勇安汤组。四妙勇安汤组给予四妙勇安汤水煎液灌胃,余给予0.9%氯化钠溶液灌胃。于造模后第7天采用16S rDNA测序技术检测小鼠肠道菌群的变化,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术检测创面代谢组学的变化。结果:对照组在造模后第3、7天创面愈合率显著高于同期模型组和四妙勇安汤组(P<0.05),四妙勇安汤组创面愈合率显著高于同期模型组(P<0.05)。3组小鼠肠道菌群结构明显不同,对照组丰度最高的为乳杆菌属、乳杆菌科、乳杆菌目;模型组丰度最高的为梭菌目、梭菌纲;四妙勇安汤组丰度最高的为p_75_a5属、梭菌属、鞘脂杆菌纲等。3组创面代谢组学有明显差异,集中在脂质代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢等方面。差异代谢产物主要涉及Hedgehog通路、嘧啶代谢等代谢通路。结论:糖尿病溃疡小鼠肠道菌群结构及创面代谢组学较非糖尿病溃疡小鼠发生了明显变化,四妙勇安汤干预后改变了小鼠肠道菌群结构及创面代谢产物,并达到了促进创面愈合的目的。 展开更多
关键词 糖尿病溃疡 四妙勇安汤 肠道菌群 代谢组学 促愈机制 16s rdna测序 液相色谱-质谱联用
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基于16S rDNA扩增子分析柑橘黄龙病植株叶片中脉内生细菌菌群
2
作者 张利平 刘顺民 +2 位作者 蒲占湑 朱莉 吕佳 《浙江农业科学》 2025年第2期440-444,共5页
文章以黄龙病菌亚洲种为样本分析柑橘黄龙病植株叶片中脉的内生细菌种群,通过对发病样本(HLB)总共24个,空白样本(HC)12个,进行16S rDNA V3-V4区扩增子测序,通过生物信息学分析得到60种有注释的微生物OTU(可认为是60种微生物),发现HC组... 文章以黄龙病菌亚洲种为样本分析柑橘黄龙病植株叶片中脉的内生细菌种群,通过对发病样本(HLB)总共24个,空白样本(HC)12个,进行16S rDNA V3-V4区扩增子测序,通过生物信息学分析得到60种有注释的微生物OTU(可认为是60种微生物),发现HC组有54种OTU,HLB组只有38种OTU,其中HC组注释到属水平的有38个属,HLB组有30个属,在HLB组中,黄龙病菌(Candidatus Liberibacter)是优势菌群,平均占比达到81.35%,而在HC组中并未发现黄龙病菌。通过t-test分析发现,发病组和健康组中的Cadidatus Liberibacter和Roseburia2个微生物的占比在属水平上具有显著差异;根据Spearman秩相关性分析发现黄龙病菌与拟杆菌属(Bacteroides)、梭形杆菌属(Fusobacterium)及罗氏菌属(Roseburia)3个属呈正相关,与鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、放线菌属(Amnibacterium)、甲基杆菌属(Methylobacterium)及Beijerinckiaceae 1174-901-12这4个属呈负相关。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 16s rdna 内生细菌
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基于16S rDNA基因测序分析原发性高血压患者眼表菌群特征 被引量：1
3
作者 张婷 杨杨 +2 位作者 李爽乐 向圣锦 曹文斋 《中华高血压杂志(中英文)》 北大核心 2025年第8期749-757,共9页
目的基于16S rDNA高通量测序分析原发性高血压患者眼表菌群的构成及特征,为高血压相关眼病的预防及治疗提供新思路。方法选择2022年7月至12月自贡市第一人民医院门诊就诊的60例原发性高血压患者为高血压组,选择同期30名健康志愿者为对... 目的基于16S rDNA高通量测序分析原发性高血压患者眼表菌群的构成及特征,为高血压相关眼病的预防及治疗提供新思路。方法选择2022年7月至12月自贡市第一人民医院门诊就诊的60例原发性高血压患者为高血压组,选择同期30名健康志愿者为对照组。通过高通量测序技术对眼表细菌16S rDNA基因的V3~V4可变区进行检测,比较两组眼表菌群的差异。结果测序共得到6544987条有效序列,3748个操作分类单元(OTUs),其中高血压组特有OTUs为1296个,对照组特有OTUs为476个。多样性分析显示,高血压组菌群α多样性的基于丰度的覆盖估计值(ACE)指数[494.03(356.68,888.36)比385.86(333.99,502.88),Z=-2.019,P=0.043]及Chao1指数[387.50(260.00,558.10)比343.15(256.45,413.55),Z=-2.009,P=0.045]高于对照组,β多样性分析显示两组间群落结构存在差异(P<0.05)。菌群相对丰度分析显示,高血压组放线菌门丰度[0.203(0.123,0.319)比0.117(0.058,0.181),Z=-2.441,P=0.015]、棒状杆菌属丰度[0.123(0.051,0.230)比0.034(0.017,0.100),Z=-2.822,P=0.004]高于对照组。特征性细菌线性判别分析显示,与对照组相比,高血压组放线菌门及放线菌纲,棒状杆菌目及棒状杆菌科、棒状杆菌属丰度增高。功能分析发现高血压组在烟酸和烟酰胺代谢、花生四烯酸代谢、核黄素代谢等14条通路上富集。结论高血压患者较健康人群的眼表菌群在多样性、相对丰度及特征性菌类方面发生了显著变化。 展开更多
关键词 眼表菌群 眼表微生物 高血压 16s rdna
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基于16S rDNA测序的硅沉着病小鼠肺部和肠道菌群特征分析
4
作者 杨思思 唐小翠 +2 位作者 赵晓航 王娜 姚武 《郑州大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第2期158-161,共4页
目的:探讨硅沉着病小鼠肺部和肠道菌群特征。方法:将20只雄性C57BL/6N小鼠随机分为对照组和SiO_(2)组,每组10只,SiO_(2)组采用吸入式气管滴注SiO_(2)悬液法构建硅沉着病模型。于第56天处死小鼠,采用实时荧光定量PCR法检测肺组织中IL-6、... 目的:探讨硅沉着病小鼠肺部和肠道菌群特征。方法:将20只雄性C57BL/6N小鼠随机分为对照组和SiO_(2)组,每组10只,SiO_(2)组采用吸入式气管滴注SiO_(2)悬液法构建硅沉着病模型。于第56天处死小鼠,采用实时荧光定量PCR法检测肺组织中IL-6、IL-1β、TNF-α、α-SMA、COL1A1和TGF-βmRNA的表达,采用Western blot法检测肺组织中α-SMA蛋白的表达;收集肺泡灌洗液和粪便样本,采用16S rDNA测序方法检测肺部和肠道菌群的丰度和α多样性。结果:与对照组相比,SiO_(2)组小鼠肺组织中IL-6、IL-1β、TNF-α、COL1A1、TGF-β、α-SMA mRNA表达水平和α-SMA蛋白表达水平均升高(P<0.05)。两组小鼠肺部和肠道菌群存在共同的差异菌群且变化相反,α多样性指标比较差异无统计学意义(P>0.05)。SiO_(2)组小鼠疣微菌门、阿克曼菌属和阿克曼菌等在肠道减少而在肺部增加(P<0.05)。结论:硅沉着病小鼠肺部和肠道菌群发生变化并影响硅沉着病的发生发展。 展开更多
关键词 硅沉着病 肺纤维化 肺部菌群 肠道菌群 16s rdna测序 小鼠
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基于16S rDNA高通量测序技术探究三味阿拉坦其其格散对功能性消化不良大鼠肠道菌群的影响
5
作者 彭斯格热希 兴安 +2 位作者 吉日木巴图 齐和日玛 萨仁高娃 《中华中医药杂志》 北大核心 2025年第7期3393-3398,共6页
目的:研究三味阿拉坦其其格散对功能性消化不良(FD)大鼠肠道菌群的影响。方法:将SD大鼠32只随机分成正常组、模型组、多潘立酮组、三味阿拉坦其其格散组,采用不规则喂养加夹尾刺激法建立FD大鼠模型,造模同时药物干预15 d,观察各组大鼠... 目的:研究三味阿拉坦其其格散对功能性消化不良(FD)大鼠肠道菌群的影响。方法:将SD大鼠32只随机分成正常组、模型组、多潘立酮组、三味阿拉坦其其格散组,采用不规则喂养加夹尾刺激法建立FD大鼠模型,造模同时药物干预15 d,观察各组大鼠一般状态,测定胃内残留率及小肠推进率,用16S rDNA高通量测序技术分析三味阿拉坦其其格散对FD大鼠肠道菌群的影响。结果:与正常组比较,模型组大鼠胃内残留率显著上升(P<0.05),小肠推进率显著降低(P<0.05)。与模型组比较,给药组大鼠胃内残留率显著降低(P<0.05),小肠推进率显著上升(P<0.05)。FD大鼠用三味阿拉坦其其格散干预后,大鼠肠道菌群结构有明显变化,与模型组比较,三味阿拉坦其其格散组显著提高了肠道菌群的丰富性和多样性(P<0.01,P<0.05)。与模型组比较,三味阿拉坦其其格散组厚壁菌门与拟杆菌门的比值明显提高,乳酸杆菌属的相对丰度明显增加。三味阿拉坦其其格散干预FD大鼠后改变了肠道菌群优势菌种相对丰度。结论:三味阿拉坦其其格散能够改善FD大鼠的症状,调节其肠道菌群结构,上调有益菌相对丰度,提高肠道菌群丰富性和多样性,从而成为防治FD的重要途径之一。 展开更多
关键词 三味阿拉坦其其格散 功能性消化不良 16s rdna高通量测序技术 肠道菌群
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基于16S rDNA测序探讨滋肾通关方对慢性非细菌性前列腺炎大鼠“肠-前列腺”轴的影响 被引量：2
6
作者 李晰然 陈梦娇 +4 位作者 邹恺平 赵晨光 代兴斌 张晓清 刘顺 《中国实验方剂学杂志》 北大核心 2025年第7期63-71,共9页
目的:基于“肠-前列腺”轴理论,通过检测炎症因子表达水平和慢性非细菌性前列腺炎(CNP)大鼠肠道菌群的组成结构,探究滋肾通关方及方中肉桂治疗CNP大鼠的作用与机制。方法:42只SD大鼠随机挑选8只作为正常组,其余动物采用注射角叉菜胶的... 目的:基于“肠-前列腺”轴理论,通过检测炎症因子表达水平和慢性非细菌性前列腺炎(CNP)大鼠肠道菌群的组成结构,探究滋肾通关方及方中肉桂治疗CNP大鼠的作用与机制。方法:42只SD大鼠随机挑选8只作为正常组,其余动物采用注射角叉菜胶的方法制备CNP模型,造模成功后将其中32大鼠随机分为模型组、宁泌泰胶囊组(0.50 g·kg^(-1))、滋肾通关方组(2.00 g·kg^(-1))、黄柏-知母药对组(2.00 g·kg^(-1)),每组8只,给药组分别给予相应药液灌胃,正常组和模型组给予等量生理盐水灌胃,1次/d,连续给药14 d。收集大鼠前列腺组织并进行苏木素-伊红(HE)染色和马松(Masson)染色,观察各组大鼠前列腺组织病理变化。利用酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测大鼠血清中白细胞介素-8(IL-8)、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)、免疫球蛋白M(IgM)、分泌型IgA(sIgA)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、转化生长因子-β(1 TGF-β_(1))水平。利用16S rDNA测序分析给药前后肠道菌群变化。结果:各给药组均可缓解CNP大鼠的炎症症状,提高抗炎因子的表达水平,降低促炎因子的表达水平,以滋肾通关方组最明显。与正常组比较,模型组大鼠IL-8、hs-CRP、sIgA、IgM、iNOS表达水平均显著增加(P<0.01);与模型组比较,各个给药组上述炎症因子表达水平均显著降低(P<0.01);与黄柏-知母药对组比较,滋肾通关方组TGF-β_(1)表达水平明显降低(P<0.05),IgM表达水平显著增加(P<0.01)。肠道菌群结果显示,与黄柏-知母药对组比较,在目水平上,滋肾通关方组可以显著降低条件致病菌拟杆菌目(Bacteroidales)、Acidaminococcales、红螺菌目(Rhodospirillales)、梭菌目(Clostridiales)、迷踪菌目(Elusimicrobiales)菌群的相对丰度(P<0.01);在属水平上,显著降低致病菌毛螺菌属和拟杆菌属菌群的相对丰度(P<0.01),显著增加有益菌瘤胃球菌属和乳酸杆菌属等菌群的相对丰度(P<0.01)。结论:滋肾通关方可降低肠道有害菌水平、提升肠道有益菌水平,并下调血清炎症因子表达,方中配伍的少量肉桂可能对滋肾通关方治疗CNP起到关键作用。 展开更多
关键词 慢性非细菌性前列腺炎 肠道菌群 炎症因子 滋肾通关方 “肠-前列腺”轴 16s rdna测序
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基于16S rDNA研究腹膜透析相关腹膜炎患者肠道菌群状况
7
作者 向剑锋 王宇晖 +2 位作者 童孟立 翁宁 陈钏霞 《中国中西医结合肾病杂志》 2025年第5期417-419,I0006,I0007,共5页
目的:探讨腹膜透析相关腹膜炎(peritoneal dialysis associated peritonitis,PDAP)患者肠道菌群分布特点及临床特点。方法:收集2021年6月—2021年10月在杭州市中医院的85例持续性非卧床腹膜透析(continuous ambulatory peritoneal dialy... 目的:探讨腹膜透析相关腹膜炎(peritoneal dialysis associated peritonitis,PDAP)患者肠道菌群分布特点及临床特点。方法:收集2021年6月—2021年10月在杭州市中医院的85例持续性非卧床腹膜透析(continuous ambulatory peritoneal dialysis,CAPD)患者的临床资料和粪便样本,根据国际腹膜透析协会(international society for peritoneal dialysis,ISPD)诊断标准分为PDAP组(28例)和非PDAP组(57例)。采用16S rDNA基因高通量测序技术分析两组患者肠道菌群的组成和多样性。结果:(1)PDAP组患者的透析龄、心衰病史、谷丙转氨酶、血β2微球蛋白明显高于非PDAP组(P<0.05),而血红蛋白(hemoglobin,Hb)和残余肾功能(residual renal function,RRF)明显低于非PDAP组(P<0.05)。(2)粪便16S rDNA检测显示:①PDAP和非PDAP组,门水平上肠道菌群优势菌种前五种均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia),而PDAP组拟杆菌属明显低于非PDAP组。②在属水平上,与非PDAP组相比,PDAP组罗斯氏菌属(Roseburia)、泰泽菌属4(Tyzzerella4)丰度增多,而布劳特氏菌属(Blautia)、瘤胃球菌属2(Ruminococcus2)、阿克曼菌属(Akkermansia)、毛梭菌属(Lachnoclostridium)、毛螺菌属(Lachnospira)丰度减少(P<0.05)。③在种水平上,与非PDAP组相比,PDAP组未分类活泼瘤胃球菌属(Ruminococcus-gnavus-group-unclassified)丰度增多,而未分类普雷沃氏菌属-9(Prevotella-9-unclassified)、未分类瘤胃球菌2(Ruminococcus-2-unclassified)、未分类瘤胃球菌1(Ruminococcus-1-unclassified)及单形拟杆菌(Bacteroides-uniformis)丰度减少(P<0.05)。④与非PDAP组相比,PDAP组肠道菌群的α多样性显著降低(P<0.05),β多样性分析也显示出组间差异。⑤在LEfSe分析中,PDAP组中的有影响的特征性菌种较非PDAP组减少。结论:(1)PDAP的发生会使PD患者肠道菌群丰富度减少。(2)PDAP组与非PDAP组之间存在肠道菌群差异。(3)在PDAP患者中,产生丁酸盐的普雷沃氏菌和阿克曼菌的数量明显减少,这可能是因为这些菌类产生的大量丁酸盐与患者体内产生的炎症因子结合,从而导致细菌数量的急剧下降。 展开更多
关键词 16s rdna 肠道微生物群 腹膜透析 腹膜透析相关腹膜炎
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基于16S rDNA和代谢组学技术的笑气中毒小鼠肠道微生物研究
8
作者 刘聪颖 张枫林 +4 位作者 李耀光 章雯 贠克明 严江伟 贾娟 《中国法医学杂志》 2025年第4期438-443,449,共7页
目的利用16S rDNA和代谢组学技术分析笑气中毒小鼠肠道菌群结构及其代谢物的变化,并分析肠道菌群和代谢物之间的相关性,进而探讨肠道微生物与笑气中毒机制的关联性。方法C57BL/6小鼠被随机分成对照组和笑气中毒组(n=6),将小鼠放置于染... 目的利用16S rDNA和代谢组学技术分析笑气中毒小鼠肠道菌群结构及其代谢物的变化,并分析肠道菌群和代谢物之间的相关性,进而探讨肠道微生物与笑气中毒机制的关联性。方法C57BL/6小鼠被随机分成对照组和笑气中毒组(n=6),将小鼠放置于染毒装置中,中毒组每次给予90000 ppm笑气,染毒28天,2次/天,每次1 h;对照组给予空气。末次染毒结束24 h后收集小鼠粪便,利用16S rDNA测序技术分析微生物菌群结构差异,筛选显著差异菌群;利用代谢组学技术检测粪便样本中代谢物的变化,寻找差异代谢物,并对得到的肠道差异菌群和差异代谢物进行相关性分析。结果16S rDNA结果显示,笑气中毒组较对照组肠道菌群的丰富度升高而物种多样性无显著变化,两组之间肠道菌群结构也存在显著差异。代谢组学结果显示共筛选出112种与笑气中毒相关的显著差异代谢物,主要涉及cAMP信号通路和鞘脂代谢2条代谢通路。Spearman相关性分析发现肠道差异菌群与差异代谢物之间存在密切的关联性。结论笑气中毒后会引起机体肠道菌群结构和代谢物谱改变,且肠道菌群丰度的变化影响多条代谢通路,这可能与笑气中毒会损伤神经系统和血液系统有关,为笑气中毒机制的进一步研究和临床治疗提供依据。 展开更多
关键词 笑气中毒 16s rdna 代谢组学 差异菌群 差异代谢物
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基于16s rDNA测序技术探讨加味孔圣枕中丹对卒中后抑郁大鼠肠道菌群影响
9
作者 欧春雪 宋爱珍 +3 位作者 吴俏兰 高祖 高琳 于华芸 《辽宁中医药大学学报》 2025年第6期19-25,共7页
目的研究加味孔圣枕中丹对卒中后抑郁(post-stroke depression,PSD)大鼠肠道菌群的影响。方法采用线栓法大脑中动脉闭塞结合孤养与慢性不可预知温和应激法制备PSD大鼠模型。造模成功的24只大鼠按随机数字表法分为模型组(model组)、加味... 目的研究加味孔圣枕中丹对卒中后抑郁(post-stroke depression,PSD)大鼠肠道菌群的影响。方法采用线栓法大脑中动脉闭塞结合孤养与慢性不可预知温和应激法制备PSD大鼠模型。造模成功的24只大鼠按随机数字表法分为模型组(model组)、加味孔圣枕中丹组(JWKSZZ组),另设空白组(control组),每组12只。JWKSZZ组给予11.34 g/kg中药水煎液灌胃,control组和model组给予等量0.9%氯化钠溶液灌胃,1次/d,干预4周。利用蔗糖偏好实验、强迫游泳实验进行行为学评价;HE染色观察海马CA1区神经元形态变化;16s rDNA扩增子测序技术进行肠道菌群检测。结果与control组相比,model组大鼠体质量显著下降,糖水偏好率降低明显,游泳不动时间显著延长(P<0.01),大鼠海马CA1区神经元形态受损,放线菌门和变形菌门相对丰度升高,拟杆菌门和厚壁菌门相对丰度降低;与model组比较,JWKSZZ组能明显增加PSD大鼠体质量,提高其糖水偏好率,缩短游泳不动时间(P<0.01),改善海马CA1区锥体神经元形态,改变PSD大鼠肠道菌群组成结构,降低放线菌门和变形菌门相对丰度,升高拟杆菌门和厚壁菌门相对丰度,改变普雷沃菌科、普雷沃氏菌属、紫单胞菌科、颤螺旋菌属等群落相对丰度。结论加味孔圣枕中丹改善PSD模型大鼠抑郁样行为可能与影响大鼠肠道微生物群落的结构和相对丰度,改善肠道微生物紊乱相关。 展开更多
关键词 加味孔圣枕中丹 卒中后抑郁 肠道菌群 16s rdna
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基于16S rDNA测序探讨补阳还五汤辅助治疗缺血性脑卒中患者肠道菌群的影响
10
作者 官玥玥 张晓宇 +4 位作者 黄小容 秦荣 杨杏 巫可曼 舒建中 《中医学》 2025年第10期4510-4522,共13页
本研究旨在探讨补阳还五汤对缺血性脑卒中患者肠道菌群的影响,并基于16S rDNA测序技术揭示其潜在改善机制。研究纳入52例符合标准的缺血性脑卒中患者,随机分为西医治疗组(33例)和补阳还五汤辅助治疗组(19例),另选取21名健康志愿者作为... 本研究旨在探讨补阳还五汤对缺血性脑卒中患者肠道菌群的影响,并基于16S rDNA测序技术揭示其潜在改善机制。研究纳入52例符合标准的缺血性脑卒中患者,随机分为西医治疗组(33例)和补阳还五汤辅助治疗组(19例),另选取21名健康志愿者作为正常对照组。西医治疗组接受脑梗死常规治疗(含抗血小板聚集、调脂稳斑等),补阳还五汤辅助治疗组在上述治疗基础上加用补阳还五汤。本研究将上述三组人群的16S rDNA测序数据,与公开数据库中中国地区健康中老年人群、长寿老人及百岁老人的同类数据进行标准化处理后合并,开展肠道菌群对比分析。结果显示,与健康对照组相比,缺血性脑卒中患者肠道菌群结构存在显著差异,表现为α多样性(如Chao1指数)升高,部分被报道与炎症相关的菌属(如Actinomyces、Ileibacterium、Corynebacterium和Desulfovibrio等)丰度呈升高趋势;而长寿老人肠道菌群中,部分产短链脂肪酸(SCFA)相关菌属(如Coprococcus、Alistipes、Blautia、Lachnospira和Eubacterium等)丰度较高,与SCFA的益生作用特征相符。补阳还五汤为治疗中风相关病症的经典中药方剂,本研究发现其辅助治疗可改变脑卒中患者的肠道菌群结构,其中部分被认为具有潜在益生功能的菌属(如Lactobacillus)丰度升高,且能改善肠道炎症状态,这种菌群结构的调整可能为患者神经功能恢复创造有利条件。 展开更多
关键词 补阳还五汤 缺血性脑卒中 肠道菌群 16s rdna测序 短链脂肪酸
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基于16S rDNA高通量测序探讨弓形虫对鸡肠道微生物的影响
11
作者 邓晓瑛 石佳佳 +2 位作者 杨成昊 鲁超 陈小庆 《生物灾害科学》 2025年第2期235-244,共10页
【目的】研究旨在探讨弓形虫感染对鸡肠道菌群的影响,为阐明弓形虫与肠道菌群的相互作用机制,并为防治弓形虫病提供新思路。【方法】选取20只7日龄和10只28日龄的健康鸡,分为感染组和对照组,通过16S rDNA高通量测序分析了感染后第11天... 【目的】研究旨在探讨弓形虫感染对鸡肠道菌群的影响,为阐明弓形虫与肠道菌群的相互作用机制,并为防治弓形虫病提供新思路。【方法】选取20只7日龄和10只28日龄的健康鸡,分为感染组和对照组,通过16S rDNA高通量测序分析了感染后第11天的盲肠微生物组成。【结果】感染组与对照组相比,在微生物多样性上存在差异。相比7日龄对照组,7日龄感染组中,厚壁菌门的丰度显著升高(P<0.05),而放线菌门显著降低(P<0.05)。属水平上,乳酸杆菌属、双歧杆菌属极显著减少(P<0.01),拟杆菌属显著增加(P<0.05)。28日龄感染组中,拟杆菌门丰度显著升高(P<0.05),属水平上,乳酸杆菌属极显著减少(P<0.01),拟杆菌属极显著增加(P<0.01)。此外,7日龄感染组的乳酸杆菌属相对丰度占比高于28日龄感染组,而拟杆菌属则相反。【结论】弓形虫感染可能改变鸡肠道微生物组成,尤其对雏鸡的影响更为严重,可能导致更高的死亡率。 展开更多
关键词 弓形虫 肉鸡 16s rdna 肠道微生物
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基于16S rDNA基因测序技术探索肝硬化患者的肠道菌群特征
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作者 马驰 付新年 +5 位作者 毛孝周 罗江焰 王鑫鑫 马笑盈 杨涓 郑盛 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年第5期694-700,共7页
目的通过比较肝硬化患者与健康志愿者的肠道菌群特征,探索肝硬化患者与健康人群的肠道菌群差异及关联。方法选取2023年2月至2023年8月就诊于云南省第三人民医院的37例肝硬化患者(包含乙肝肝硬化11例,酒精性肝硬化12例,其他病因所致肝硬... 目的通过比较肝硬化患者与健康志愿者的肠道菌群特征,探索肝硬化患者与健康人群的肠道菌群差异及关联。方法选取2023年2月至2023年8月就诊于云南省第三人民医院的37例肝硬化患者(包含乙肝肝硬化11例,酒精性肝硬化12例,其他病因所致肝硬化14例),以及同期37名健康志愿者。收集研究对象的新鲜粪便样本,采用16S rDNA高通量测序技术检测肠道菌群,进行菌群多样性及组成分析。结果肝硬化患者与健康志愿者的肠道菌群在丰富度、均匀度及群落结构上均有差异。而同处于肝硬化阶段,乙肝肝硬化与酒精性肝硬化菌群特征比较,差异有统计学意义(P<0.05)。此外,LEfSe分析显示,肝硬化组优势菌属为链球菌属(Streptococcus)和大肠杆菌—志贺菌属(Escherlchia_Shigella)。PICRUSt分析显示,肝硬化组细菌的膜转运、碳水化合物代谢、聚糖生物合成和代谢功能基因含量高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论肝硬化患者与健康志愿者相比,具有显著差异的肠道菌群特征,其中Streptococcus和Escherlchia_Shigella作为肝硬化患者属水平上的优势菌属,其可能成为诊断肝硬化的生物学标志物;肝硬化患者肠道菌群特征改变可能导致基因功能变化,从而促进肝硬化发生、发展。 展开更多
关键词 肝硬化 肠道菌群 16s rdna测序 LEfSe分析 菌群功能预测
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基于16S rDNA基因测序技术探索慢性肝病患者的肠道菌群特征
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作者 马驰 杨涓 +5 位作者 郑盛 付新年 罗江焰 王鑫鑫 马笑盈 毛孝周 《肝脏》 2025年第5期683-689,共7页
目的探索慢性肝病患者与健康人群的肠道菌群差异及关联。方法选择2023年2月至2023年8月就诊于云南省第三人民医院(大理大学第二附属医院)的60例慢性肝病患者(其中慢性乙型肝炎16例,肝硬化37例,肝细胞癌7例),以及37例健康志愿者。提取粪... 目的探索慢性肝病患者与健康人群的肠道菌群差异及关联。方法选择2023年2月至2023年8月就诊于云南省第三人民医院(大理大学第二附属医院)的60例慢性肝病患者(其中慢性乙型肝炎16例,肝硬化37例,肝细胞癌7例),以及37例健康志愿者。提取粪便样本DNA并采用16S rDNA高通量测序技术检测肠道菌群,进行菌群多样性及组成分析。结果在Alpha多样性方面,与健康对照组相比,各慢性肝病组患者肠道菌群的丰富度及多样性均有显著降低,且在慢性乙型肝炎→肝硬化→肝细胞癌进展过程中,菌群丰富度及多样性在不断下降。在物种丰度上,随着慢性乙型肝炎→肝硬化→肝细胞癌进展,大肠杆菌-志贺菌属(Escherlchia-Shigella)丰度不断升高。在属水平上筛选出的差异物种中,与健康对照组相比,各慢性肝病组的粪杆菌属(Faecalibacterium)、琼脂杆菌属(Agathobacter)、普氏菌属(Prevotella-9)、小杆菌属(Dialister)、罗氏菌属(Roseburia)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、粪球菌属(Coprococcus)、罕见小球菌属(Subdoligranulum)等8个菌属相对丰度降低。LEfSe分析显示不同慢性肝病阶段肠道优势菌属存在差异。结论慢性肝病组患者与健康对照组人群相比,具有显著性差异的肠道菌群特征,其中大肠杆菌-志贺菌属(Escherlchia-Shigella)丰度的改变可能介导慢性乙型肝炎→肝硬化→肝细胞癌的进展。并且随着慢性乙型肝炎→肝硬化→肝细胞癌疾病进展,肠道优势菌属亦在发生变化。 展开更多
关键词 慢性肝病 肠道菌群 16s rdna测序 多样性分析 差异物种分析
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16S rDNA技术在刺参养殖池塘水质生态调控中的应用
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作者 刘双连 刘永兴 +3 位作者 宋晓阳 李林晗 方珍 段盛文 《中国水产》 2025年第6期35-36,共2页
微生物检测法有利于改善水环境,也能在一定程度上增强刺参机体免疫力。在刺参养殖池塘中构建微生态系统,最基本的工作条件就是对池塘水体环境和底质环境中的微生物检测与监测。当前,传统的微生物检测方法已无法满足快速检测需要,16S rDN... 微生物检测法有利于改善水环境,也能在一定程度上增强刺参机体免疫力。在刺参养殖池塘中构建微生态系统,最基本的工作条件就是对池塘水体环境和底质环境中的微生物检测与监测。当前,传统的微生物检测方法已无法满足快速检测需要,16S rDNA基因测序技术较一代、二代等传统基因测序技术来说在微生物生态学、农业等多个领域的应用日益广泛。本文介绍了16S rDNA基因测序技术在刺参养殖池塘水质生态调控中的应用,以期为其将来在水产养殖细菌生态系统构建与水质控制领域的应用提供参考借鉴。 展开更多
关键词 刺参养殖 16s rdna技术 水质生态调控
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带状疱疹患者肠道菌群特征:基于16S rDNA高通量测序分析
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作者 邓小月 王维珍 张嬴政 《皮肤性病诊疗学杂志》 2025年第2期108-114,共7页
目的通过16S rDNA高通量测序分析带状疱疹患者与健康人群肠道菌群多样性、结构及丰度差异,分析带状疱疹与肠道菌群关系。方法选取2022年1月至2023年12月就诊于江阴市中医院疼痛科的带状疱疹患者30例(HZ组),同时选取30例健康人作为对照组... 目的通过16S rDNA高通量测序分析带状疱疹患者与健康人群肠道菌群多样性、结构及丰度差异,分析带状疱疹与肠道菌群关系。方法选取2022年1月至2023年12月就诊于江阴市中医院疼痛科的带状疱疹患者30例(HZ组),同时选取30例健康人作为对照组(HC组)。提取研究对象粪便样本中细菌总DNA,根据16S rDNA V3-V4高变区设计引物进行扩增测序,比较两组肠道菌群的差异。结果HZ组肠道菌群的丰富度及多样性显著低于HC组;在门水平上,HZ组厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度低于HC组(P=0.014),而变形杆菌(Proteobacteria)相对丰度高于HC组(P=0.002);在属分类水平,HZ组埃希氏-志贺菌属(Escherichia-Shigella)(P=0.004)、克雷白氏杆菌属(Klebsiella)(P=0.030)、乳杆菌属(Lactobacillus)(P=0.013)相对丰度高于HC组,而粪杆菌属(Faecalibacterium)(P=0.003)、Eubacterium_hallii_group(P=0.013)相对丰度低于HC组。结论带状疱疹患者肠道菌群在物种、功能的结构和丰度等方面与健康人群相比均存在一定差异,提示肠道菌群中特定差异的细菌种类及其功能在带状疱疹病毒感染机制中可能起重要作用。 展开更多
关键词 带状疱疹 16s rdna高通量测序 肠道菌群
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基于16S rDNA探讨健脾温阳解毒颗粒治疗脾肾阳虚型艾滋病相关腹泻的临床疗效 被引量：3
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作者 刘晶晶 彭鑫 +4 位作者 唐丽燕 杨欣怡 张毅 阎玉萍 张春梅 《中药药理与临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期9-14,共6页
目的:基于16S rDNA观察健脾温阳解毒颗粒治疗脾肾阳虚型艾滋病相关腹泻的临床疗效。方法:采用随机对照临床研究,将40例患者分为治疗组(20例)和对照组(20例),治疗组给予健脾温阳解毒颗粒,对照组给予蒙脱石散,疗程4 w,观察两组病例组内、... 目的:基于16S rDNA观察健脾温阳解毒颗粒治疗脾肾阳虚型艾滋病相关腹泻的临床疗效。方法:采用随机对照临床研究,将40例患者分为治疗组(20例)和对照组(20例),治疗组给予健脾温阳解毒颗粒,对照组给予蒙脱石散,疗程4 w,观察两组病例组内、组间治疗前后的临床疗效和肠道菌群变化。结果:治疗组总有效率85%(17/20),对照组为65%(13/20),两组比较差异没有统计学意义(P>0.05)。与治疗前相比较,治疗组在门水平上,可显著减少蓝藻门丰度,在属水平上可显著增加粪杆菌属、多尔氏菌属、Anaerostipes、粪球菌_3、丁酸球菌属丰度,减少Nakamurella、氨基酸球菌属、颤螺旋菌属丰度(P<0.05);治疗后,与对照组比较,治疗组总症状积分差值明显升高(P<0.05);肠道菌群与临床症状相关性分析,胃脘痞满与氨基酸球菌、粪杆菌属丰度呈正相关,胃脘疼痛与粪杆菌属、颤螺旋菌属丰度呈正相关,食欲减退与多尔氏菌属、粪球菌-3丰度呈负相关(P<0.05)。结论:健脾温阳解毒颗粒治疗脾肾阳虚型艾滋病相关腹泻临床疗效优于蒙脱石散,安全性好,可以改善患者临床症状,提高患者肠道菌群多样性,减轻肠道炎症,对肠道菌群有调节作用。 展开更多
关键词 健脾温阳解毒颗粒 艾滋病相关腹泻 临床疗效 16s rdna 粪杆菌属 颤螺旋菌属
原文传递
基于16S rDNA测序分析地榆七柏汤对溃疡性结肠炎大鼠肠道菌群的影响 被引量：1
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作者 雷云霞 靳瑾 +1 位作者 何磊 张慧田 《现代中西医结合杂志》 CAS 2024年第8期1023-1028,1037,共7页
目的观察地榆七柏汤对湿热型溃疡性结肠炎大鼠肠道菌群的影响,探讨其治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法取84只Wistar大鼠,随机选择9只作为空白组,其余大鼠采用高糖高脂饮食+葡聚糖硫酸钠法建立湿热型溃疡性结肠炎模型。将造模成功大鼠... 目的观察地榆七柏汤对湿热型溃疡性结肠炎大鼠肠道菌群的影响,探讨其治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法取84只Wistar大鼠,随机选择9只作为空白组,其余大鼠采用高糖高脂饮食+葡聚糖硫酸钠法建立湿热型溃疡性结肠炎模型。将造模成功大鼠随机分为模型组、柳氮磺胺吡啶组及地榆七柏汤低、中、高剂量组,每组14只。柳氮磺胺吡啶组给予柳氮磺胺吡啶混悬液300 mg/kg灌肠,地榆七柏汤低、中、高剂量组分别给予含生药0.5 g/mL、1 g/mL、3 g/mL的地榆七柏汤保留灌肠,模型组和空白组给予等量生理盐水灌肠,均1次/d,连续干预14 d。观察大鼠一般状况,进行疾病活动度指数(DAI)评分,HE染色观察结肠组织病理形态,采用16S rDNA测序技术分析粪便菌群物种组成情况。结果与模型组比较,各药物组大鼠腹泻、便血等症状明显好转,DAI评分明显降低(P均<0.05),结肠组织病理损伤明显减轻。菌群构成方面,模型组大鼠毛螺菌属(Lachnospiraceae)、Mucispirillum属丰度均明显低于空白组(P均<0.05),各药物组均明显高于模型组(P均<0.05);模型组大鼠肠杆菌科(Enterobacteriaceae)丰度明显高于空白组(P<0.05),各药物组均明显低于模型组(P均<0.05)。结论地榆七柏汤可明显减轻湿热型溃疡性结肠炎大鼠疾病活动度和肠黏膜炎性损伤,其机制可能与调节肠道菌群、提升有益菌丰度、降低致病菌丰度相关。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 地榆七柏汤 肠道菌群 16s rdna
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蔓柏生发方改善小鼠的雄激素性脱发可能与肠道菌群相关:基于16S rDNA分析 被引量：1
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作者 彭丽倩 肖常青 +8 位作者 王雨诗 李燕红 许端倪 黄久遂 梁碧华 赵铁 朱慧兰 卢月 李振洁 《皮肤性病诊疗学杂志》 2024年第9期577-587,共11页
目的基于16S rDNA技术探索蔓柏生发方对雄激素性脱发(AGA)小鼠的肠道菌群影响。方法将36只C57BL/6小鼠随机分成6组:空白对照组、模型对照组、阳性药物组以及蔓柏生发方高、中、低组,每组6只。剔除所有小鼠脊背部2 cm×3 cm面积的毛... 目的基于16S rDNA技术探索蔓柏生发方对雄激素性脱发(AGA)小鼠的肠道菌群影响。方法将36只C57BL/6小鼠随机分成6组:空白对照组、模型对照组、阳性药物组以及蔓柏生发方高、中、低组,每组6只。剔除所有小鼠脊背部2 cm×3 cm面积的毛发,除空白对照组外,其他组使用丙酸睾酮稀释液在小鼠背部脱毛区域进行皮下多点注射制备AGA模型,每只总剂量为0.1 mg/d。空白对照组和模型对照组在小鼠剃毛处外涂生理盐水,每只1.0 mL/d;阳性药物组涂5%米诺地尔酊,每只1.0 mL/d;蔓柏生发方高、中、低组分别灌胃不同浓度的蔓柏生发方(5.0 g/kg、2.5 g/kg、1.25 g/kg),连续给药30 d。30 d后留取脱毛区皮肤进行病理学观察,收集小鼠粪便进行16S rDNA分析。结果与模型组相比,蔓柏生发方组毛囊数量均明显增多,其中高剂量组可见毛囊呈现生长期样形态,接近空白组毛囊形态。多样性分析结果显示,与空白组比较,模型组肠道菌群丰富度、多样性明显下降,而蔓柏生发方对模型小鼠的肠道菌群丰富度有良好的上调作用,同时其作用具有浓度依赖性,高剂量组对菌群的调控作用最为显著。肠道菌群的α多样性指数在模型组与蔓柏生发方组之间存在显著差异(P<0.05)。结论蔓柏生发方能显著提高AGA小鼠肠道菌群的丰富度和多样性,其对AGA模型小鼠脱毛的治疗作用可能与其调节肠道微生物多样性有关。 展开更多
关键词 雄激素性脱发 蔓柏生发方 16s rdna技术 肠道菌群
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应用16S rDNA高通量测序分析孤独症谱系障碍患儿肠道菌群的变化 被引量：1
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作者 吴怡 覃秋琴 +3 位作者 杨莹 梁淑恒 何筱胤 宁怀军 《广西医学》 CAS 2024年第9期1322-1329,共8页
目的 基于16S rDNA高通量测序分析孤独症谱系障碍(ASD)患儿肠道菌群的变化。方法 收集25例ASD患儿(ASD组)和22例健康儿童(对照组)的新鲜粪便样本,提取两组样本DNA,通过16S rDNA高通量测序和生物信息分析评估两组研究对象肠道菌群的变化... 目的 基于16S rDNA高通量测序分析孤独症谱系障碍(ASD)患儿肠道菌群的变化。方法 收集25例ASD患儿(ASD组)和22例健康儿童(对照组)的新鲜粪便样本,提取两组样本DNA,通过16S rDNA高通量测序和生物信息分析评估两组研究对象肠道菌群的变化情况。结果 在门水平上,两组的优势菌门均为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、脱硫菌门;在属水平上,ASD组的优势菌属为拟杆菌属、双歧杆菌属、志贺-大肠杆菌属、普氏菌属、链球菌属、克雷伯氏菌属、副拟杆菌属、肠杆菌属、小杆菌属、考拉杆菌属。两组研究对象肠道菌群的α多样性及β多样性无明显差异。ASD组中疣微菌门、疣微菌纲、疣微菌目、阿克曼菌科、阿克曼菌属显著富集。ASD组的婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌的相对丰度低于对照组(P<0.05)。结论 与正常儿童相比,ASD患儿存在肠道菌群失调,疣微菌门、阿克曼菌属相对丰度增加,婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌相对丰度减少,但目前对于ASD患儿肠道菌群的改变未有统一结论,仍需进一步深入研究。 展开更多
关键词 孤独症谱系障碍 肠道菌群 16s rdna 高通量测序
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基于16S rDNA测序分析中药复方石苦秦散对腹泻小鼠盲肠的影响
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作者 姜玲玲 许浩翔 +4 位作者 周景瑞 雷露 李婷 张亚楠 余波 《贵州农业科学》 CAS 2024年第3期86-96,共11页
【目的】探明止泻中药复方石苦秦散对蓖麻油和番泻叶所致腹泻小鼠肠道微生物的影响,为研究石苦秦散止泻作用机制奠定基础。【方法】将70只小鼠分为正常对照组、阳性药物组、蓖麻油模型组、蓖麻油中药预防组、番泻叶模型组、番泻叶中药... 【目的】探明止泻中药复方石苦秦散对蓖麻油和番泻叶所致腹泻小鼠肠道微生物的影响,为研究石苦秦散止泻作用机制奠定基础。【方法】将70只小鼠分为正常对照组、阳性药物组、蓖麻油模型组、蓖麻油中药预防组、番泻叶模型组、番泻叶中药预防组和番泻叶中药治疗组,按试验设计进行灌胃处理后,观察各组小鼠腹泻情况,针对不同药物腹泻模型采集十二指肠、盲肠观察肠道病理变化,最后采集各组盲肠内容物进行16S rDNA测序。【结果】腹泻指数显示,灌胃1 h番泻叶中药预防组和中药治疗组均极显著(P<0.01)低于番泻叶模型组;蓖麻油模型灌胃2 h与正常对照组差异极显著。肠道病理变化主要为制造腹泻模型后黏膜下层有少量炎性细胞浸润,除正常对照组外其他组肌层和浆膜变薄。盲肠Alpha测序显示,蓖麻油造模后,中药预防组能显著提高盲肠菌群丰度和多样性;Beta多样性PCoA分析表明,蓖麻油模型组与其他组样本明显分开;物种分类显示,2种药物腹泻模型处理后中药预防组和治疗组均不同程度提高拟杆菌门(Bacteroidetes)、软壁菌门(Tenericutes)丰度,降低变形菌门(Proteobacteria)丰度;属水平在正常范围内,降低乳杆菌(Lactobacillus)和大肠杆菌(Escherichia)丰度,提高有益菌Mucispirillum和拟普雷沃菌属(Alloprevotella)丰度。【结论】蓖麻油和番泻叶小鼠腹泻模型使用中药复方石苦秦散预防和治疗后,可明显改善肠道微生物丰度,特别是炎症反应相关的微生物,说明石苦秦散可通过调整肠道炎症修复发挥止泻作用。 展开更多
关键词 小鼠 腹泻指数 石苦秦散 盲肠菌群 16s rdna测序
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