开发适用于西瓜种质基因分型的KASP(kompetitive allele specific PCR)标记,并构建种质指纹图谱,对促进西瓜种质资源的保护、品种鉴定和遗传改良具有重要的科学意义。根据西瓜重测序数据分析鉴定的高质量核苷酸多态性(single nucleotide...开发适用于西瓜种质基因分型的KASP(kompetitive allele specific PCR)标记,并构建种质指纹图谱,对促进西瓜种质资源的保护、品种鉴定和遗传改良具有重要的科学意义。根据西瓜重测序数据分析鉴定的高质量核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,共设计50个KASP标记,并在43份西瓜材料中进行基因分型,进一步通过聚类分析和指纹图谱构建,评估其遗传多样性。结果表明:KASP标记设计的成功率为40.0%,但不同染色体上KASP标记成功率有所差异,其中1号和7号染色体的成功率最高,达到75.0%;挑选16个最优KASP标记,根据其在43份西瓜材料中的基因分型结果构建指纹图谱,将其转化为二维码,便于快速识别和查询西瓜材料遗传信息;对43份材料进行聚类分析,发现饲用西瓜大都形成了一个独立的分支,且遗传距离相近,而黏籽西瓜和栽培西瓜则在多个分支中分布,遗传距离相对较远,充分显示出它们之间遗传的多样性和复杂性。试验成功开发并应用西瓜KASP标记技术,为西瓜遗传研究与种质资源评价提供了新的工具和方法,也为西瓜的品种鉴定和种质资源管理提供了科学依据。展开更多
