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二温式PCR在特异短核酸探针合成中的应用 被引量:8

Synthesis of Specific and Short RNA Probes with Two-temperature PCR
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摘要 经基因库序列比对确定花生白藜芦醇合酶基因(RS)中的特异序列(长度约108 bp)。以此为模板设计分别含有SalI和SacI酶切位点的一对上、下游引物,并应用二温式PCR扩增得到该特异短片段。将该特异片段正向连接到pBlueskriptIIKS(+)的多克隆位点上,利用T7 RNA聚合酶在体外转录合成地高辛标记的反义特异短核酸探针。该特异短核酸探针的合成为后续RS基因在花生组织器官中表达的RNA原位杂交研究打下了基础。 The Arachis hypogaea resveratrol synthase (RS) mRNA specific fragment was determined by NCBI BLAST. Primers with the two restriction enzymes of Sal Ⅰ or Sac Ⅰ were designed and two-temperature PCR was used to amplify the specific and short fragment. The fragment was eventually linked to the multiple cloning site of vector pBlueskript Ⅱ KS (+). By means of the T7 promoter in the pBlueskript Ⅱ KS (+) and using the specific fragment as a templet to synthesize Digoxigeninlabeled antisense specific and short RNA probe in vitro transcription with T7 RNA polymerases. The synthesis of probes laid a foundation for the research of the expression of RS gene in peanut by RNA in situ hybridization.
出处 《花生学报》 2008年第3期5-10,共6页 Journal of Peanut Science
基金 农业部“948”重大项目资助(2006-G37) 国家公益性行业(农业)科研专项项目(nyhyzx07-019) 国家“863”计划项目(2007AA100701)
关键词 二温式PCR 花生 白藜芦醇合酶 核酸探针 Two-temperature PCR Arachis hypogaea L. Resveratrol Synthase
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