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16S rDNA-RFLP分析新疆快生大豆根瘤菌的分类地位 被引量:8
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作者 彭桂香 陈文新 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期237-241,共5页
采用16S rDNA-RFLP技术,对自新疆土壤中捕捉的34株快生大豆根瘤菌及相关己知种的模式菌株进行了比较分析。从酶切图谱类型和聚类结果表明,所有新分离的菌株与S.xinjiangensis的图谱类型基本一致,而与S... 采用16S rDNA-RFLP技术,对自新疆土壤中捕捉的34株快生大豆根瘤菌及相关己知种的模式菌株进行了比较分析。从酶切图谱类型和聚类结果表明,所有新分离的菌株与S.xinjiangensis的图谱类型基本一致,而与S .fredii的图谱类型有明显差异,与S. meliloti; S. saheli, S. medicae, S. teranga也不相同。 34株新分离的菌株全部与S.xingjiangensis菌株在90%的相似性水平上聚在一起。再一次肯定了S. fredii与S. xinjiangensis快生大豆根瘤菌属于两个不同的类群,为两个独立的种。我们还将用更多的分析方法进一步证实他们的分类地位。 展开更多
关键词 16S rdna-rflp 新疆 快生大豆根瘤菌
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应用16S rDNA-RFLP方法分析宁夏地区稻田土壤细菌的多样性 被引量:17
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作者 张建萍 董乃源 +4 位作者 余浩滨 周勇军 陆永良 耿锐梅 余柳青 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期586-592,共7页
水稻是宁夏地区主要粮食作物,水稻种植也具有维持生态系统平衡,防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品... 水稻是宁夏地区主要粮食作物,水稻种植也具有维持生态系统平衡,防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA,构建其16S rDNA克隆文库,用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到74种酶切带型,序列分析发现77.3%的克隆序列与环境中未培养细菌的16S rDNA序列有较高的相似性,仅有22.7%的克隆序列与数据库中可培养细菌有较高的相似性,表明宁夏稻区土壤中的多数细菌尚未培养。系统发育研究发现74个序列分属于12个类群,其中变形细菌所占比例最大(37.8%),依次为酸杆菌(16.2%)、放线菌(12.2%)、拟杆菌(10.8%)、绿屈挠菌(10.8%)、浮游霉菌(8.1%),另外有少量厚壁菌门、芽单胞菌门和疣微菌门细菌克隆。在变形细菌的序列中包括α、β、γ和δ4个类型,比例分别为13.5%、5.4%、12.2%和6.8%。表明宁夏稻区土壤中优势细菌类群为变形杆菌和酸杆菌,且土壤细菌类群具有丰富的多样性。 展开更多
关键词 水稻田 土壤细菌多样性 16S rDNA克隆文库 RFLP分析
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16S rDNA-RFLP分析六氯苯好氧降解菌群的结构及其多样性 被引量:10
3
作者 刘婷 陈朱蕾 +2 位作者 曹丽 孙蔚旻 沈韫芬 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期758-762,共5页
从某化工厂排水沟底泥中取样,经2个月的富集驯化得到六氯苯好氧降解菌群。通过测定该微生物菌群在降解六氯苯过程中累积耗氧量、微生物生长曲线及Cl-浓度的变化,证明在好氧条件下该微生物菌群能够以六氯苯为唯一碳源和能源生长。当培养... 从某化工厂排水沟底泥中取样,经2个月的富集驯化得到六氯苯好氧降解菌群。通过测定该微生物菌群在降解六氯苯过程中累积耗氧量、微生物生长曲线及Cl-浓度的变化,证明在好氧条件下该微生物菌群能够以六氯苯为唯一碳源和能源生长。当培养温度为30℃,pH为7.0时,该菌群能在18d内将无机盐培养基中浓度为4.5mg/L的六氯苯降解55%以上,降解速率达到137.5μg/(L.d)。对降解菌群提取总DNA,选择性扩增细菌16S rDNA片段,建立克隆文库。通过限制性内切酶(限制性内切酶HaeⅢ和RsaⅠ)分析,得到9种不同的谱型,其中3种谱型是主要谱型。对主要谱型的克隆子测序,结果表明,它们分别与Alcaligenes和Azospirillum菌属相似性最高。该菌群在去除环境中难降解的有机氯污染物方面具有应用前景。 展开更多
关键词 六氯苯 好氧降解 菌群 16S RDNA RFLP
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成年大熊猫肠道菌群多样性的16S rDNA-RFLP分析 被引量:10
4
作者 何廷美 崔婷婷 +10 位作者 钟志军 王承东 何永果 王燚 张和民 李德生 李才武 张婷婷 罗永久 程安春 彭广能 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1121-1127,共7页
为探究秋季(9~11月)成年大熊猫肠道菌群的多样性,以细菌16SrDNA通用引物扩增粪样总细菌16SrDNA基因并构建文库,然后采用16SrDNA基因限制性片段长度多态性(restriction fragmentlength polymorphism,RFLP)技术对成年大熊猫秋季肠道菌群... 为探究秋季(9~11月)成年大熊猫肠道菌群的多样性,以细菌16SrDNA通用引物扩增粪样总细菌16SrDNA基因并构建文库,然后采用16SrDNA基因限制性片段长度多态性(restriction fragmentlength polymorphism,RFLP)技术对成年大熊猫秋季肠道菌群多样性进行分析。结果显示,大肠杆菌、假单胞菌、链球菌和鞘氨醇杆菌为大熊猫秋季肠道内的优势菌群,肠道内细菌多样性9月较高,11月较低。结果表明,16SrDNA-RFLP技术能用于成年大熊猫肠道菌群多样性的研究。 展开更多
关键词 大熊猫 肠道菌群 多样性 16S RDNA 限制性片段长度多态性
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人参内生可培养细菌16S rDNA-RFLP分析 被引量:10
5
作者 姜云 尹望 +1 位作者 陈长卿 倪瑞卿 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期34-39,共6页
以我国吉林省5个不同地区来源的健康人参植株为实验材料,分别从根茎叶不同器官分离获得了152株内生细菌,利用HhaⅠ、HinfⅠ和HaeⅢ3种限制性内切酶对所有供试菌株的16 S rDNA片段进行了RFLP分析。聚类分析结果表明,供试菌株在相似性为83... 以我国吉林省5个不同地区来源的健康人参植株为实验材料,分别从根茎叶不同器官分离获得了152株内生细菌,利用HhaⅠ、HinfⅠ和HaeⅢ3种限制性内切酶对所有供试菌株的16 S rDNA片段进行了RFLP分析。聚类分析结果表明,供试菌株在相似性为83%水平上可分为18个类群,不同地区内生细菌的遗传多样性存在差异,其中抚松县和吉林农业大学的菌株多样性较高;不同器官蕴含的菌株数目也存在差异,茎部和根部蕴含菌株较为丰富。研究结果期望为了解人参内生细菌的种群结构,明确菌株种类奠定基础。 展开更多
关键词 人参 内生细菌 16 S rDNA—RFLP 多样性
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商洛多花胡枝子根瘤菌16S rDNA-RFLP分析及系统发育研究 被引量:7
6
作者 冀玉良 韦革宏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期925-932,共8页
利用16S rDNA-RFLP和全序列测定方法,对分离自商洛地区5个分布点的59株多花胡枝子根瘤菌进行了RFLP分析和系统发育研究.结果表明:(1)42株供试菌株归属根瘤菌属(Rhizobium)、11株归属中华根瘤菌属(Sinorhizobium).其余6株非根瘤菌中3株... 利用16S rDNA-RFLP和全序列测定方法,对分离自商洛地区5个分布点的59株多花胡枝子根瘤菌进行了RFLP分析和系统发育研究.结果表明:(1)42株供试菌株归属根瘤菌属(Rhizobium)、11株归属中华根瘤菌属(Sinorhizobium).其余6株非根瘤菌中3株是嗜麦芽黄单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)、3株是解淀粉类芽孢杆菌(Paenibacillus amylolyticus),说明胡枝子根瘤内生菌较为丰富且类型多样.(2)结合供试菌株的地理生境分析,发现来自不同采集点的菌株有些具有同样的遗传类型,而来自同一采集点的菌株遗传类型却有差异,证明胡枝子根瘤菌在分群类别上与地理环境之间没有明确的对应关系,地理环境并非根瘤菌多样性形成的主要因素.建议今后对根瘤菌多样性研究应从根瘤菌与寄主植物物之间的共生选择进化,特别是对共生体系中基因的横向转移方面进行深入探讨. 展开更多
关键词 根瘤菌 16SrDNA RFLP 多花胡枝子 系统发育
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三个根瘤菌新亚群的 16SrDNA-RFLP 分析 被引量:8
7
作者 闫爱民 陈文新 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1998年第9期50-54,共5页
在对新疆、内蒙干旱地区采集的48株苜蓿、草木樨、锦鸡儿根瘤菌进行数值分类和SDS-PAGE全细胞蛋白分析的基础上,对数值分类确立的三个亚群进行了16SrDNA-RFLP分析,在87%的相似性水平上,三个新亚群的菌株相... 在对新疆、内蒙干旱地区采集的48株苜蓿、草木樨、锦鸡儿根瘤菌进行数值分类和SDS-PAGE全细胞蛋白分析的基础上,对数值分类确立的三个亚群进行了16SrDNA-RFLP分析,在87%的相似性水平上,三个新亚群的菌株相应聚类成群。其中第2亚群属于Sinorhizobium分枝,与S.meliloti,S.fredi.S.teranga,S.Saheli在92%的相似水平上聚在一起。第3亚群则与Rhizobium处于同一分枝且与属内各已知种相互区分开,可能为一独立的种。第1亚群有可能为一独立的属,值得进一步研究。此结果进一步证实来自干旱地区的根瘤菌具有很大特异性。 展开更多
关键词 根瘤菌 DNA-RFLP 新亚群 数值分类
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16S rDNA-RFLP技术鉴定西藏地区乳制品中的乳杆菌 被引量:16
8
作者 于洁 孙志宏 +5 位作者 张家超 艾日登才次克 张彦斌 杨梅 孙天松 张和平 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期804-810,共7页
将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰... 将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱将菌种鉴定到种的水平。根据16S rDNA-RFLP的结果从中选出8株有代表性的菌株进行生理生化实验和16S rDNA序列的测定,实验结果与RFLP鉴定结果相吻合,表明此方法是一种快速、准确的可用于大量乳杆菌分类和鉴定的方法。 展开更多
关键词 乳杆菌 鉴定 限制性片段长度多态性(RFLP) 16S RDNA序列
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福矛高温大曲中芽孢杆菌16S rDNA-RFLP及系统发育分析 被引量:5
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作者 颜林春 张守财 +3 位作者 马校卫 汤二将 黄祖新 陈由强 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期53-58,共6页
目的:从福建建瓯黄华山酿酒有限公司高温大曲中分离出89株芽孢杆菌,通过初步筛选鉴定并进行微生物多样性研究。方法:对其16S rDNA进行PCR-RFLP分析和系统发育研究。结果:初步筛选得到的18株芽孢杆菌被HhaⅠ和MspⅠ酶切聚类分为四大组。... 目的:从福建建瓯黄华山酿酒有限公司高温大曲中分离出89株芽孢杆菌,通过初步筛选鉴定并进行微生物多样性研究。方法:对其16S rDNA进行PCR-RFLP分析和系统发育研究。结果:初步筛选得到的18株芽孢杆菌被HhaⅠ和MspⅠ酶切聚类分为四大组。通过系统发育分析样品中有6株Bacillus subtilis,4株Bacillus cereus,2株Bacillus sonorensis,2株Bacillus licheni-formis,以及Bacillus pumilus、Bacillus oleronius、Bacillus coagulans和Bacillus thuringiensis各1株。结论:研究显示该高温大曲中可培养芽孢杆菌具有微生物多样性。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 酱香型白酒 高温大曲 16S rDNAPCR-RFLP 系统进化分析
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16S rDNA-RFLP法快速鉴定蒙古国传统乳制品中的乳酸菌 被引量:7
10
作者 艾日登才次克 于洁 +4 位作者 杜晓华 李莉 王炜宏 孙天松 张和平 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2009年第2期63-68,共6页
以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图... 以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图谱分析,将49株乳杆菌和2株片球菌准确鉴定到种,其他4株肠球菌鉴定到属。采用16S rDNA-RFLP方法鉴定乳酸菌具有准确性,可靠性和高效性。 展开更多
关键词 乳酸菌 快速鉴定 限制性片段长度多态性(RFLP) 16S RDNA序列分析
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16S rDNA-RFLP分析不同产地人参内生菌的多态性 被引量:6
11
作者 万红娇 谢燕飞 +2 位作者 谢斌 朱金华 马广强 《江西中医药大学学报》 2015年第5期51-54,共4页
目的:采用16S r DNA—RFLP方法分析比较不同产地、品种人参内生菌的差异,为探讨人参内生菌对其药材的影响奠定基础。方法:收集不同产地、不同品种人参,用细菌基因提取试剂盒提取人参内生菌基因组,扩增内生菌16S r DNA片段后,用RFLP(限... 目的:采用16S r DNA—RFLP方法分析比较不同产地、品种人参内生菌的差异,为探讨人参内生菌对其药材的影响奠定基础。方法:收集不同产地、不同品种人参,用细菌基因提取试剂盒提取人参内生菌基因组,扩增内生菌16S r DNA片段后,用RFLP(限制性酶切片段分析)方法分析不同产地、不同品种人参内生菌的多态性。结果:不同产地、不同品种人参均含有内生细菌,且内生细菌菌种组成有明显差异。结论:不同产地的人参有不同的人参内生菌,通过鉴定内生菌可鉴定人参的产地。 展开更多
关键词 人参 16S RDNA RFLP 内生菌
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黄华属根瘤菌的16S rDNA-RFLP分析 被引量:1
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作者 赵美玲 鞠文庭 +2 位作者 郭军康 冯春生 韦革宏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期680-685,共6页
采用16S rDNA-RFLP及序列分析方法,对分离自黄华属的披针叶黄华、喀什黄华和光叶黄华根瘤菌进行分析研究.结果表明,分离得到的33株根瘤菌在种水平上具有丰富的遗传多样性,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、中华根瘤菌属(Si... 采用16S rDNA-RFLP及序列分析方法,对分离自黄华属的披针叶黄华、喀什黄华和光叶黄华根瘤菌进行分析研究.结果表明,分离得到的33株根瘤菌在种水平上具有丰富的遗传多样性,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)和土壤杆菌属(Agrobacterium).其中,以CCNWGS0011和CCNWGS0010-1为代表的5株根瘤菌构成独立的分支,可能为潜在的新种. 展开更多
关键词 黄华属 根瘤菌 RFLP 16S RDNA序列分析 遗传多样性
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仿刺参肠道可培养微生物多样性研究 被引量:15
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作者 张文姬 侯红漫 +2 位作者 张公亮 李琴艳 杜晨萌 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期149-151,155,共4页
为了解大连地区仿刺参肠道可培养微生物种群的多样性信息,用2216、TCBS和葡萄糖琼脂培养基从大连地区冬、春两季的仿刺参肠道中共分离得到141株细菌,通过16SrDNA-RFLP分析后,得到17个不同的类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行16Sr... 为了解大连地区仿刺参肠道可培养微生物种群的多样性信息,用2216、TCBS和葡萄糖琼脂培养基从大连地区冬、春两季的仿刺参肠道中共分离得到141株细菌,通过16SrDNA-RFLP分析后,得到17个不同的类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行16SrDNA序列测定和系统发育分析,结果表明,大连地区仿刺参肠道细菌主要包括假单胞菌属(Pseudomonas),弧菌属(Vibrio),芽孢杆菌属(Bacillus),希瓦氏菌属(Shewanella),交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas),不动杆菌属(Acinetobacter),气球菌属(Aerococcus),发光菌属(Photobacterium),葡萄球菌菌属(Staphylococcus)和Kushneria菌属共10个菌属。说明大连地区仿刺参肠道可培养微生物具有一定的多样性。 展开更多
关键词 仿刺参 可培养微生物 16Srdna-rflp 系统发育分析
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厌氧复合菌群JZ-1降解拟除虫菊酯的特性和组成多样性研究 被引量:2
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作者 张松柏 尹乐斌 +4 位作者 刘勇 张德咏 罗香文 成飞雪 罗源华 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1150-1155,共6页
从农药厂废水中分离到能够降解多种拟除虫菊酯的复合菌群JZ-1,对该菌群降解特性研究结果表明,最佳降解条件为pH7、温度30℃;在最佳条件下培养15d,对100mg·L-1甲氰菊酯、氟氯氰菊酯、氯氰菊酯的降解率分别为53.27%、33.36%、41.39%... 从农药厂废水中分离到能够降解多种拟除虫菊酯的复合菌群JZ-1,对该菌群降解特性研究结果表明,最佳降解条件为pH7、温度30℃;在最佳条件下培养15d,对100mg·L-1甲氰菊酯、氟氯氰菊酯、氯氰菊酯的降解率分别为53.27%、33.36%、41.39%。对该菌群的16S rDNA进行扩增和RFLP及测序分析结果表明,该菌群含有丰富的细菌资源,该菌群的优势种群包括红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)和紫单孢菌科细菌(Porphyromonadaceae bacterium)。该研究为拟除虫菊酯的降解菌资源的挖掘和利用提供了理论参考。 展开更多
关键词 厌氧复合菌群 拟除虫菊酯 降解特性 16S rdna-rflp
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广西柑橘黄龙病植株韧皮部内生细菌多样性分析 被引量:25
15
作者 王爱华 殷幼平 +4 位作者 熊红利 李颜方 李佳 贤家旭 王中康 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期4823-4833,共11页
【目的】对柑橘健康植株和感染黄龙病植株的韧皮部内生细菌的多样性进行比较分析,为研究柑橘植株韧皮部内生细菌与黄龙病菌之间的相互关系奠定基础。【方法】采用常规分离培养与分子鉴定的方法和基于16S rDNA基因的限制性酶切长度多态性... 【目的】对柑橘健康植株和感染黄龙病植株的韧皮部内生细菌的多样性进行比较分析,为研究柑橘植株韧皮部内生细菌与黄龙病菌之间的相互关系奠定基础。【方法】采用常规分离培养与分子鉴定的方法和基于16S rDNA基因的限制性酶切长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析的方法。【结果】用常规分离与分子鉴定方法获得10个属细菌类群,其中芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、考克氏菌属(Kocuria sp.)为无症健株的优势菌群;微杆菌属(Microbacterium sp.)、芽孢杆菌属、假单胞菌属和考克氏菌属.为黄龙病罹病植株的优势菌群。PCR-RFLP方法得到29种酶切图谱,共鉴定出10属可培养细菌以及11种不可培养细菌。健株与病株中Dyella sp.、Pseudomonas sp.、Serratia sp.和未培养细菌所占比例均大于5%。柑橘健株与病株中细菌的种群密度和菌群种类存在明显差异。【结论】研究结果表明柑橘健株和病株韧皮部组织中的内生细菌优势菌群存在明显差异,而伴生细菌的优势菌群与黄龙病菌的相互关系正在深入分析研究。 展开更多
关键词 黄龙病 内生细菌 16S rDNA RFLP 种群多样性
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家蚕肠道细菌种群结构分析 被引量:19
16
作者 田贞华 惠丰立 +2 位作者 柯涛 阚云超 文桢中 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期592-595,共4页
用普通培养基和稀释培养基从家蚕4龄幼虫肠道中分离到109株细菌,通过16S rDNA-RFLP分析后,得到14个不同类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育分析,结果表明,家蚕肠道细菌主要分布在芽孢杆菌属(Bacillus)... 用普通培养基和稀释培养基从家蚕4龄幼虫肠道中分离到109株细菌,通过16S rDNA-RFLP分析后,得到14个不同类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育分析,结果表明,家蚕肠道细菌主要分布在芽孢杆菌属(Bacillus)、节杆菌属(Arthrobacter)、肠杆菌属(Enterobacter)、微杆菌属(Microbacteri-um)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、短杆菌属(Brevibacterium)、纤维微杆菌属(Cellulosimicrobium)、肠球菌属(Entero-coccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、棒状杆菌属(Corynebacterium)10个已知细菌属和另外1个分支中,揭示了家蚕肠道细菌种群的多样性。 展开更多
关键词 家蚕 肠道细菌 16S RDNA 限制片段长度多态性 系统发育分析
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沙冬青根瘤菌遗传多样性和系统发育分析 被引量:7
17
作者 毕江涛 贺达汉 +2 位作者 陈卫民 谢瑞梅 韦革宏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期695-703,共9页
利用16S rDNA RFLP、16S-23S rDNA RFLP和16S rDNA序列分析方法,对分离自宁夏和内蒙古阿拉善地区的沙冬青根瘤菌进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,分离自不同地区沙冬青根瘤菌的44株测试菌株分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhiz... 利用16S rDNA RFLP、16S-23S rDNA RFLP和16S rDNA序列分析方法,对分离自宁夏和内蒙古阿拉善地区的沙冬青根瘤菌进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明,分离自不同地区沙冬青根瘤菌的44株测试菌株分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、叶杆菌属(Phylobacterium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)5个属种。受寄主和地理环境因素的影响,沙冬青根瘤菌具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 沙冬青 根瘤菌 16SrDNA RFLP 16S^23SrDNA RFLP 序列分析 遗传多样性 系统发育树
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树木溃疡病病原真菌类群分子遗传多样性研究Ⅰ.——小穴壳菌属、疡壳孢属、壳囊孢属、盾壳霉属分类地位的分子证明 被引量:37
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作者 张星耀 赵仕光 +2 位作者 朴春根 吕全 贾秀贞 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第3期34-40,共7页
小穴壳菌属(DothiorelaSac.)(有性阶段是葡萄座腔菌属BotryosphaeriaCas.)、疡壳孢属(DothichizaLib.)、壳囊孢属(CytosporaEhrenb.)、盾壳霉属(Coniot... 小穴壳菌属(DothiorelaSac.)(有性阶段是葡萄座腔菌属BotryosphaeriaCas.)、疡壳孢属(DothichizaLib.)、壳囊孢属(CytosporaEhrenb.)、盾壳霉属(ConiothyriumSacc.)等4属真菌是引起树木溃疡病的主要病原真菌类群,是我国现阶段森林的重大有害生物。本文报道了这4个属的真菌基于28SrDNAPCRRFLP和RAPD解析的分类学研究结果,15个供试菌株聚为4类,每一类即一属,在分子水平上证明了其属的传统分类地位的客观性。 展开更多
关键词 树木 溃疡病 病原真菌 分类学 分子遗传多样性
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南海有毒塔玛亚历山大藻的分子地理标记分析 被引量:14
19
作者 陈月琴 邱小忠 +3 位作者 屈良鹄 曾陇梅 齐雨藻 郑磊 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期45-51,共7页
采用聚合酶键扩增反应(PCR)和限制性片段长度多态性分析(RFLP)方法,对1992年5月和1994年间月采自中国南海大鹏湾、大亚湾、香港海域的赤潮有毒甲藻塔玛亚历山大藻8个不同地理株的核糖体小亚基RNA基因(Ss-rDNA)进行分析,并与北... 采用聚合酶键扩增反应(PCR)和限制性片段长度多态性分析(RFLP)方法,对1992年5月和1994年间月采自中国南海大鹏湾、大亚湾、香港海域的赤潮有毒甲藻塔玛亚历山大藻8个不同地理株的核糖体小亚基RNA基因(Ss-rDNA)进行分析,并与北美、西欧等地的比较。结果表明,中国南海的塔玛亚历山大藻缺少B基因,这与北美等地的塔玛亚历山大藻(包括有毒和无毒株)不同,而与西欧、澳洲等地的有毒和无毒株相似,提示B基因的存在可以作为一种分子地理标记而不是藻种有毒的标记。 展开更多
关键词 塔玛亚历山大藻 分子地理标记 南海 有毒藻 红潮
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中国柑橘黄龙病病原16SrDNA序列研究 被引量:32
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作者 丁芳 洪霓 +2 位作者 钟云 易干军 王国平 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期649-654,共6页
运用PCR技术对来自中国7省区不同寄主上的黄龙病病原16SrDNA基因区进行了PCR-RFLP-SSCP分析,采用3种限制性内切酶进行单酶切、双酶切及三酶切反应,对酶切产物进行了单链构象多态性(SSCP)分析。结果表明:来自7省区不同寄主上9个黄龙病病... 运用PCR技术对来自中国7省区不同寄主上的黄龙病病原16SrDNA基因区进行了PCR-RFLP-SSCP分析,采用3种限制性内切酶进行单酶切、双酶切及三酶切反应,对酶切产物进行了单链构象多态性(SSCP)分析。结果表明:来自7省区不同寄主上9个黄龙病病原菌分离物的16SrDNA无可见变异;同时对9个有代表性的分离物16SrDNA进行了克隆测序,序列多重比对结果与PCR-RFLP-SSCP一致,从而在分子水平上证明了中国柑橘黄龙病病原菌的16SrDNA序列高度保守,在不同的地域、寄主内没有发现分子变异,为进一步研究柑橘黄龙病病原菌系统进化奠定了基础。 展开更多
关键词 柑橘 黄龙病 病原菌 16S RDNA PCR-RFLP-SSCP 克隆 序列分析
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