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青年羊驼耳部和背部皮肤组织中miRNA差异表达研究 被引量:17
1
作者 赫晓燕 郝欢庆 +5 位作者 刘丹丹 范瑞文 曹靖 朱芷葳 董彦君 邢海权 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1016-1022,共7页
羊驼是毛用型经济动物,其耳部和背部的毛发品质和生长速度存在差异.MicroRNA(miRNA)是新发现的一类在转录后水平调控基因表达的非编码RNA分子,为比较miRNA在羊驼耳部和背部皮肤的表达差异,从而探讨miRNA在羊驼皮肤和毛囊发育过程中的调... 羊驼是毛用型经济动物,其耳部和背部的毛发品质和生长速度存在差异.MicroRNA(miRNA)是新发现的一类在转录后水平调控基因表达的非编码RNA分子,为比较miRNA在羊驼耳部和背部皮肤的表达差异,从而探讨miRNA在羊驼皮肤和毛囊发育过程中的调控作用,本实验提取羊驼皮肤总RNA,制备了羊驼皮肤miRNA芯片,通过与Affymetrix多物种miRNA芯片跨物种杂交对耳部和背部皮肤的miRNA进行筛选,并通过实时荧光定量PCR进行了验证,同时利用在线生物信息软件预测miRNA靶基因.结果显示,羊驼耳部和背部皮肤中高表达差异2倍以上的miRNA有39个,实时荧光定量PCR检测let-7b和miR-24在2个部位皮肤中的差异表达量与miRNA基因芯片结果一致;预测到let-7b和miR-24的靶基因中包含有与毛囊生长发育和毛发品质相关的基因,提示这些miRNA可能参与羊驼皮肤和毛囊的生长发育、更新以及毛发品质的调控. 展开更多
关键词 羊驼 耳部 背部 皮肤 mirna芯片 微RNA 差异表达
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PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达谱的检测及初步筛选分析 被引量:4
2
作者 张怀璧 徐川 +2 位作者 施扬 陈洁 张秋娟 《世界中西医结合杂志》 2015年第4期543-548,共6页
目的检测及初步筛选分析PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达谱。方法采集20例PRL型垂体瘤患者和20例健康志愿者血清,通过RNA提取技术、miRNA TLDA芯片技术检测血清miRNA、采用软件Data AssistTMSoftware进行数据分析和处理,筛选出差异性表达... 目的检测及初步筛选分析PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达谱。方法采集20例PRL型垂体瘤患者和20例健康志愿者血清,通过RNA提取技术、miRNA TLDA芯片技术检测血清miRNA、采用软件Data AssistTMSoftware进行数据分析和处理,筛选出差异性表达的miRNA。结果以差异表达量大于2倍,芯片检测的相对定量平均CT值小于40为标准,初步筛选出PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达上调的有3个,表达下调的有25个,共计28个。结论 PRL型垂体瘤患者和健康志愿者血清miRNA具有内源表达的差异性,可以为进一步验证特异性血清miRNA的表达,探索药物临床疗效机制研究提供理论和实验依据。 展开更多
关键词 PRL型垂体瘤 血清mirna 芯片检测
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盐胁迫条件下不同耐盐棉花miRNA差异表达研究 被引量:12
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作者 李春贺 阴祖军 +1 位作者 刘玉栋 沈法富 《山东农业科学》 2009年第7期12-17,共6页
植物miRNAs在基因表达、生长发育和抵抗胁迫等方面有十分重要的作用。本试验以耐盐棉花品系山农91-11和盐敏感棉花品种鲁棉6号为试材,利用miRNA基因芯片杂交技术,分析盐胁迫条件下棉花幼苗miRNA的差异表达。结果表明:在盐胁迫条件下,共... 植物miRNAs在基因表达、生长发育和抵抗胁迫等方面有十分重要的作用。本试验以耐盐棉花品系山农91-11和盐敏感棉花品种鲁棉6号为试材,利用miRNA基因芯片杂交技术,分析盐胁迫条件下棉花幼苗miRNA的差异表达。结果表明:在盐胁迫条件下,共有27个miRNAs在山农91-11和鲁棉6号之间差异表达,其中山农91-11比鲁棉6号表达上调的miRNAs有11个,其中功能已知的10个分别属于miR156、miR164、miR167、miR397和miR399家族,表达下调的miRNAs有16个,其中功能已知的2个属于miR156、miR172家族。对这些miRNA家族作用的靶基因进行分析表明,这些miRNAs参与植物逆境条件下的信号传导,可能对棉花耐盐机制有重要作用。 展开更多
关键词 棉花 mirna芯片 盐胁迫 差异表达
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miRNA-122a靶基因预测及生物信息学分析 被引量:6
4
作者 蒋永容 陈川 +9 位作者 张志敏 郑继军 许文 罗美林 戴楠 李梦侠 杨宇馨 李增鹏 王东 王阁 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2011年第16期931-934,共4页
目的:利用基因芯片技术分析肝癌HepG2细胞和正常肝上皮LO2细胞中miRNA的表达,并对HepG2细胞中低表达的miRNA-122a进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为以miRNA-122a为靶点的基因治疗提供理论和实验基础。方法:利用基因芯片技术检测He... 目的:利用基因芯片技术分析肝癌HepG2细胞和正常肝上皮LO2细胞中miRNA的表达,并对HepG2细胞中低表达的miRNA-122a进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为以miRNA-122a为靶点的基因治疗提供理论和实验基础。方法:利用基因芯片技术检测HepG2细胞和LO2细胞中miRNA-122a表达水平,通过生物信息学预测miRNA-122a的靶基因,并对其靶基因进行功能富集分析(GO-analysis)、信号转导通路富集分析(Pathway-analysis)和蛋白质相互作用网络分析。结果:与LO2细胞比较,miRNA-122a在HepG2细胞中呈低表达。miRNA-122a预测靶基因有1104个,其靶基因集合功能分别富集于碳水化合物生物合成、核苷酸代谢、细胞因子受体结合、细胞周期等生物学过程(P<0.001);信号转导通路显著富集于JAK-STAT信号通路、Wnt信号通路、MAPK信号通路、ErbB信号通路、细胞周期等信号转导通路(P<0.001)。结论:miRNA-122a在HepG2细胞中呈现低表达,miRNA-122a预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中。 展开更多
关键词 mirna-122a 基因芯片 靶基因 生物信息学
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肾透明细胞癌相关特异性miRNAs差异表达谱 被引量:7
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作者 葛京平 徐锋 +7 位作者 程文 杨斌 张春妮 高建平 张征宇 张庆玲 许传亮 孙颖浩 《医学研究生学报》 CAS 2011年第8期789-794,共6页
目的研究证实肿瘤组织miRNAs表达水平较正常组织可特异性下调或上调,这一现象揭示miRNA在肿瘤发生、发展等过程中扮演重要角色。文中就肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)肿瘤相关特异性微小RNA(mi-croRNAs,miRNAs)... 目的研究证实肿瘤组织miRNAs表达水平较正常组织可特异性下调或上调,这一现象揭示miRNA在肿瘤发生、发展等过程中扮演重要角色。文中就肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)肿瘤相关特异性微小RNA(mi-croRNAs,miRNAs)表达谱及意义进行探讨。方法取手术切除新鲜肾透明细胞癌及其癌旁正常肾组织,提取总RNA,进行RNA质量检测后采用微阵列基因芯片对其相关特异性miRNAs进行分析,应用荧光定量RT-PCR方法验证。结果Ⅰ级ccRCC与癌旁正常肾组织共有24个差异表达miRNAs,其中12个上调,12个下调;Ⅱ级共有35个差异表达miRNAs,其中18个上调,17个下调;Ⅲ级共有34个差异表达miRNAs,其中18个上调,16个下调;Ⅰ级+Ⅱ级+Ⅲ级ccRCC与癌旁正常肾组织共有81个差异表达miRNAs,其中33个上调,48个下调;以表达差异在2倍及以上为标准进行比较,ccRCC与癌旁正常肾组织共有11个差异表达的miRNAs,其中,hsa-miR-487a、hsa-miR-491-3p、hsa-miR-452表达上调,hsa-miR-142-3p、hsa-miR-22、hsa-miR-299-3p、hsa-miR-29a、hsa-miR-429、hsa-miR-532-5p、hsa-miR-199a-5p、hsa-miR-125b表达下调。结论与癌旁正常肾组织中存在肿瘤相关特异性miRNAs表达谱,这种miRNAs差异可能导致ccRCC的发生及发展。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 微阵列基因芯片 mirnaS
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基于基因芯片技术研究定痫丸对氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187表达的影响 被引量:5
6
作者 吴琼 汪顺贵 +4 位作者 郭雪峰 李华琼 陈爱玲 刁丽梅 仇小强 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2019年第1期116-120,I0007,共6页
目的:研究定痫丸对氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187表达的影响。方法:采用基因芯片技术筛选出氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织差异表达基因,并运用q-PCR技术验证其差异性表达。予定痫丸悬混液灌胃,运用q-PCR技术检测定痫丸... 目的:研究定痫丸对氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187表达的影响。方法:采用基因芯片技术筛选出氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织差异表达基因,并运用q-PCR技术验证其差异性表达。予定痫丸悬混液灌胃,运用q-PCR技术检测定痫丸悬混液对癫痫小鼠海马组织差异基因的表达。结果:通过基因芯片筛选出癫痫小鼠海马组织中差异表达miRNA下调18个,上调10个。筛选出miRNA-187,运用q-PCR技术验证了其表达下调(P<0.05)。经定痫丸悬混液干预后,发现癫痫小鼠海马组织miRNA-187表达上调(P<0.05)。结论:定痫丸可能通过上调miRNA-187对癫痫起到治疗作用,初步揭示定痫丸治疗癫痫的分子机制。 展开更多
关键词 定痫丸 基因芯片 癫痫 mirna-187
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结直肠癌肝转移特定基因miRNA芯片甄别 被引量:3
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作者 骆成玉 杨鋆 +2 位作者 季晓昕 于德明 赵兴飞 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2013年第15期1165-1167,1185,共4页
目的:筛选结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移miRNA对应的特定基因。方法:收集10例CRC患者肿瘤组织标本,其中同时伴肝转移者5例,无远处器官转移5例。应用miRNA芯片方法对两组样本的miRNA表达差异情况进行研究,并通过实时定量RT-PCR... 目的:筛选结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移miRNA对应的特定基因。方法:收集10例CRC患者肿瘤组织标本,其中同时伴肝转移者5例,无远处器官转移5例。应用miRNA芯片方法对两组样本的miRNA表达差异情况进行研究,并通过实时定量RT-PCR对miRNA的芯片表达差异进行验证,再利用软件预测靶基因。结果:总RNA提取的质量分析显示,每份样品总RNA的A260/A280为2.11~2.15。电泳结果显示,每份样品的总RNA均有清晰的28S和18S条带,RNA完好无降解,质量符合miRNA芯片的质量要求。肝转移组较非转移组筛选出6种CRC表达失调的miRNA,其中上调的为miR-224、miR-1236和miR-622,下调的为miR-155、miR-342-5p和miR-363,miR-224的差异信号值最高(>500)。芯片实验显示,hsa-miR-224在肝转移组呈现显著性上调,P=0.038 2;而hsa-miR-155在肝转移组却呈现显著性下调,P=0.043 2。miR-224的表达倍数在肝转移CRC组织中较非转移组表达上调(Fold change=2.47),P=0.016 6。结论:可调控CRC肝转移的特定基因miR-224的筛选,可作为早期诊断治疗的新手段。 展开更多
关键词 微小RNA 基因芯片 结直肠肿瘤 肝转移 特定基因
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宣威地区肺腺癌病人肺组织特异miRNAs表达谱和靶基因及其信号通路预测 被引量:2
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作者 陈帅 周永春 +9 位作者 陈颖 陈小波 李光剑 杨加鹏 雷玉洁 赵光强 黄秋博 杨长绍 杜亚茜 黄云超 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期238-244,共7页
目的筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路。方法选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌mi... 目的筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路。方法选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌miRNAs差异表达谱,AGO分析和KEGG Pathway分析预测其miRNAs的生物与肺癌相关的靶基因和信号通路。结果 miRNAs芯片检测:与非宣威肺腺癌比较,宣威肺腺癌差异表达显著的特异miRNAs 34个:表达上调的miRNAs有23个,表达下调的miRNAs有11个。AGO富集分析及KEGG数据库映射分析发现:预测主要集中在PI3K/Alt信号通路附近,其预测靶基因有:GF、RTK、SOS、IRS1、BCAP、CYTOKINSR、ECM、ITGB、FAK和GβY,可能对肺癌生物学功能产生影响的靶基因主要集中在PI3K/Alt,WNT和MAPK通路。结论筛选出这些特异性miRNAs可能在宣威肺腺癌癌变和进展中起重要作用,预测的靶基因可能与调节PI3K/Alt,WNT和MAPK信号通路的作用有关。 展开更多
关键词 mirna芯片 mirnaS 宣威肺腺癌 靶基因 信号通路
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miRNA芯片研究大鼠脑创伤后3天皮层miRNA的差异表达 被引量:2
9
作者 陈芳莲 李耀华 +1 位作者 雷平 张建宁 《临床和实验医学杂志》 2010年第22期1681-1683,共3页
目的筛选大鼠脑创伤3 d后皮层差异表达的miRNA,为颅脑创伤治疗中的miRNA干预策略提供可供选择的目标miRNA。方法将6例创伤后3 d的大鼠大脑皮层组织混匀代表该组样本,将6例正常对照的大鼠大脑皮层组织混匀代表该组样本。利用miRNA芯片检... 目的筛选大鼠脑创伤3 d后皮层差异表达的miRNA,为颅脑创伤治疗中的miRNA干预策略提供可供选择的目标miRNA。方法将6例创伤后3 d的大鼠大脑皮层组织混匀代表该组样本,将6例正常对照的大鼠大脑皮层组织混匀代表该组样本。利用miRNA芯片检测伤后3 d的创伤大脑皮层组织与正常对照的差异表达基因。并随机挑选差异表达基因作定量聚合酶链反应(PCR)验证。结果与正常对照相比,创伤后3 d组共有251个miRNA表达,其中,2倍以上差异表达上调的20个,2倍以上差异表达下调的5个。定量PCR验证结果提示芯片结果可信。结论创伤大鼠大脑皮层的差异表达miRNA在以前的脑创伤文献中鲜有报道,对其干预有望成为颅脑创伤基因治疗的新方向。 展开更多
关键词 大鼠 脑创伤 mirna芯片 差异表达
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基于基因芯片技术研究氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187的表达及GO和KEGG分析 被引量:6
10
作者 吴琼 汪顺贵 +4 位作者 郭雪峰 李华琼 陈爱玲 刁丽梅 仇小强 《中风与神经疾病杂志》 CAS 2018年第6期517-521,共5页
目的基于基因芯片技术研究氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187的表达及GO和KEGG分析。方法选取氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织,采用基因芯片技术挖掘差异基因,并运用q-PCR对芯片结果进行验证,利用Target Scan、miRBase、rna22... 目的基于基因芯片技术研究氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织miRNA-187的表达及GO和KEGG分析。方法选取氯化锂-匹罗卡品致痫小鼠海马组织,采用基因芯片技术挖掘差异基因,并运用q-PCR对芯片结果进行验证,利用Target Scan、miRBase、rna22预测靶基因、DAVID综合分析工具进行GO功能富集分析及KEGG信号通路分析。结果挖掘到与癫痫相关差异基因miRNA-187,利用Target Scan、miRBase、rna22 3种软件预测miRNA-187的靶基因,取交集得到107个共同的靶基因,并进行富集分析得到19个基因功能(P<0.05)和7个信号通路(P<0.05)。结论通过生物信息学方法,初步分析了miRNA-187在癫痫中可能参与调控的靶基因和信号通路,为下一步实验验证miRNA-187在癫痫的调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 基因芯片 癫痫 mirna-187 GO分析 KEGG分析
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鼻咽非角化性癌miRNAs的差异表达及意义 被引量:4
11
作者 汪春福 邹桂华 +1 位作者 温寿清 邓院萍 《实用临床医学(江西)》 CAS 2008年第8期1-3,共3页
目的分析鼻咽非角化性癌和癌旁慢性炎症组织的miRNAs差异表达谱。方法显微切割鼻咽非角化性癌及癌旁慢性炎症组织,提取RNA,分离小分子RNA,并用miRNAs芯片制作的微阵列进行杂交,杂交后通过芯片扫描和数据分析获得鼻咽非角化性癌miRNAs差... 目的分析鼻咽非角化性癌和癌旁慢性炎症组织的miRNAs差异表达谱。方法显微切割鼻咽非角化性癌及癌旁慢性炎症组织,提取RNA,分离小分子RNA,并用miRNAs芯片制作的微阵列进行杂交,杂交后通过芯片扫描和数据分析获得鼻咽非角化性癌miRNAs差异表达谱。结果鼻咽非角化性癌中表达上调的6个miR-NAs中,其差异表达在2倍以上的有2个miRNAs;表达下调的7个miRNAs中,其差异表达在2倍以上的有1个miRNAs。结论鼻咽非角化性癌中存在差异表达的miRNAs,包括miR-203、miR-503、miR-424、miR-141、miR-148α、miR-25、miR-195和miR-15α等,提示这些miRNAs可能与鼻咽非角化性癌发生发展有关,可作为鼻咽非角化性癌候选分子标记物,为进一步研究鼻咽非角化性癌的标记物提供帮助。 展开更多
关键词 鼻咽非角化性癌 显微切割 mirnas芯片
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基于miRNA芯片技术探索大黄灵仙胶囊对炎性胆管细胞的多维调控 被引量:6
12
作者 王清坚 王明刚 +2 位作者 王兵 胡嗣钦 俞渊 《广州中医药大学学报》 CAS 2018年第2期289-296,共8页
【目的】探讨大黄灵仙胶囊(DLXC)对炎性胆管细胞miRNAs表达的影响。【方法】取处于对数生长期,生长状态良好的大鼠肝内胆管内皮细胞,以脂多糖(LPS,5μg/m L)处理构建炎性状态的胆管细胞模型,应用DLXC(1 mg/m L)进行干预,共培养72 h后收... 【目的】探讨大黄灵仙胶囊(DLXC)对炎性胆管细胞miRNAs表达的影响。【方法】取处于对数生长期,生长状态良好的大鼠肝内胆管内皮细胞,以脂多糖(LPS,5μg/m L)处理构建炎性状态的胆管细胞模型,应用DLXC(1 mg/m L)进行干预,共培养72 h后收集胆管细胞总RNA,进行miRNA芯片检测及生物信息学分析。【结果】DLXC可调控炎性胆管细胞内30个miRNAs的表达,影响胆管细胞信号转导、有机化合物反应及缺氧应激等生物学过程,细胞质、内质网及膜筏等细胞组份,信号转导活性、转录调控区的DNA结合及电压门控钾通道活性等分子生物功能;影响低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、环磷酸鸟苷酸—丝氨酸(c GMP-PKG)信号通路、肿瘤坏死因子α(TNF-α)信号通路、趋化因子信号转导通路、凋亡信号通路、磷酸酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路及Toll-like受体信号通路。【结论】以miRNAs为靶点可实现DLXC对炎性胆管细胞的多维调控。 展开更多
关键词 大黄灵仙胶囊 mirnaS 炎性应激 基因芯片 胆管细胞 细胞培养
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人牙髓干细胞向成牙本质细胞定向分化过程中miRNAs表达谱筛选及鉴定 被引量:11
13
作者 张萍 朱聪惠 +1 位作者 张纲 谭颖徽 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期212-216,共5页
目的:筛选人牙髓干细胞向成牙本质细胞定向分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法:体外分离、培养和鉴定人牙髓干细胞,miRNAs芯片筛选牙髓干细胞向成牙本质细胞分化过程中差异表达的miRNAs,并通过TargetScan数据... 目的:筛选人牙髓干细胞向成牙本质细胞定向分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法:体外分离、培养和鉴定人牙髓干细胞,miRNAs芯片筛选牙髓干细胞向成牙本质细胞分化过程中差异表达的miRNAs,并通过TargetScan数据库预测靶基因,实时定量PCR法对结果进行初步鉴定。结果:人牙髓干细胞vimentin、nestin、GFAP和I型胶原4种细胞表型均表达;成脂诱导3周后细胞内有油红O染色阳性脂滴出现;成牙本质诱导可见钙结节形成;基因芯片结果显示,牙髓干细胞向成牙本质细胞分化过程中,发生2倍以上表达变化的miRNAs有6条,其中上调3条,下调3条。通过miRNA靶标预测工具预测靶基因,发现hsa-miR-633和hsa-miR-210有与牙髓干细胞分化相关的靶基因;real time-PCR验证hsa-miR-633和hsa-miR-210表达变化与基因芯片结果相符。结论:人牙髓干细胞经诱导向成牙本质细胞分化过程中miRNAs表达谱具有显著变化,为牙髓干细胞分化机制研究提供了新的提示。 展开更多
关键词 mirnaS 牙髓干细胞 芯片 定向分化 成牙本质细胞
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心房颤动患者心房组织中差异表达miRNA的初步研究 被引量:2
14
作者 李闺琴 张磊善 +2 位作者 杨晓燕 唐惠芳 雷小勇 《临床与病理杂志》 CAS 2014年第1期29-33,共5页
目的:应用基因芯片技术研究心房颤动(房颤)患者心房组织中miRNA的表达谱,分析差异表达的miRNA,为进一步研究miRNA在房颤发生、发展中的作用奠定基础。方法:采用miRNA基因芯片技术检测房颤患者和非房颤患者心房组织样本中miRNA的表达水平... 目的:应用基因芯片技术研究心房颤动(房颤)患者心房组织中miRNA的表达谱,分析差异表达的miRNA,为进一步研究miRNA在房颤发生、发展中的作用奠定基础。方法:采用miRNA基因芯片技术检测房颤患者和非房颤患者心房组织样本中miRNA的表达水平;采用实时定量PCR(quantitative real time PCR,qRT PCR)对部分差异表达的miRNA进行验证。结果:MiRNA基因芯片分析结果显示,与非房颤组织相比,房颤组织中差异表达的miRNA共有26个,其中16个miRNA表达上调,10个miRNA表达下调。qRT PCR验证结果与芯片结果相一致。结论:MiRNA在房颤患者心房组织中存在差异性表达。 展开更多
关键词 基因芯片 心房颤动 mirna 差异表达
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HBV感染后慢性化进展过程中miRNA表达HBV基因型P基因点突变的研究 被引量:2
15
作者 敖家富 冀文娟 +2 位作者 张静 顾国浩 蒋敏 《浙江临床医学》 2015年第2期180-182,共3页
目的探讨HBV感染引起的肝脏病变慢性化进展为慢性乙肝、肝硬化、肝癌之相关因素,分析各因素在肝脏病变慢性化演变过程中的作用及在诊断、治疗、判断预后中的应用价值。方法采用xMAP液态芯片技术定量检测HBV相关肝痛标本中PBMCmiR-191、... 目的探讨HBV感染引起的肝脏病变慢性化进展为慢性乙肝、肝硬化、肝癌之相关因素,分析各因素在肝脏病变慢性化演变过程中的作用及在诊断、治疗、判断预后中的应用价值。方法采用xMAP液态芯片技术定量检测HBV相关肝痛标本中PBMCmiR-191、-223、-222、-145、-21、-31、-126、-20a、-372的表达水平; 采用直接测序法检测相应血清标本HBV基因型7ZP基因区耐药位点突变;对HBV相关肝病慢性化进展的各可能相关因素包括性别、年龄、HBV基因型、HBVDNA载量水平、HBeAg状态、miRNA表达水平作多因素Logistic回归分析,探讨参与HBV感染引起的肝脏病变慢性化演变过程的相关因素。结果HBVC基因型、DNA载量持续高水平表达、miR-20a表达上调、miR-126及miR-223表达下调是在乙肝慢性化进展中有统计学意义的影响因素(P〈0.05),而HBeAg状态、自然状态下发生的耐药相关位点突变,年龄、性别等因素差异无统计学意义(P〉0.05)。结论C基因型,HBVDNA持续高载量以及miR-126、-223低表达,miR-20a高表达可能是导致乙肝慢性化的相关因素,尤其可能是肝癌发生的危险因子,常规检测基因型、HBV DNA及miRNA的定量检测可为监测病情、判断预后、及时治疗预防乙肝慢性化进展提供资料。 展开更多
关键词 HBV基因型 xMAP液态芯片 mirna P基因突变
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系统性红斑狼疮患者外周血B淋巴细胞中狼疮活动相关miRNA的筛选 被引量:7
16
作者 陈芳 陈朝生 +5 位作者 章慧娣 薛向阳 丁晓凯 孙莉 陈丹 黄朝兴 《温州医学院学报》 CAS 2013年第2期106-111,共6页
目的:通过筛选系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血B淋巴细胞中与狼疮活动相关的microRNA(miRNA),探讨B淋巴细胞参与SLE发病的机制。方法:选取45例重度活动期SLE患者作为研究对象,另选20例稳定期SLE患者和10例健康体检者分别作为对照,采集外... 目的:通过筛选系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血B淋巴细胞中与狼疮活动相关的microRNA(miRNA),探讨B淋巴细胞参与SLE发病的机制。方法:选取45例重度活动期SLE患者作为研究对象,另选20例稳定期SLE患者和10例健康体检者分别作为对照,采集外周静脉血,用磁珠阴性分选法分离B淋巴细胞并提取RNA,将每组单个样本RNA混成组总RNA,进行组间芯片分析。实时荧光定量PCR(RealtimePCR)验证miRNA芯片检测结果。结果:重度活动期SLE患者外周血B淋巴细胞中有16条差异表达的miRNA,其中下调10条,上调6条。Realtime PCR对其中2条(miR-181a、miR-103)miRNA的验证结果与芯片检测所示具有较好的一致性。结论:SLE患者病情活动性与B淋巴细胞中miRNA异常表达密切相关。 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 mirna 免疫磁珠 B淋巴细胞 芯片
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基因芯片筛选新疆哈萨克族食管癌与癌旁正常组织间差异表达miRNA及其功能验证 被引量:3
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作者 刘涛 王淑霞 +3 位作者 卢晓梅 王育珊 苏银霞 姚华 《新疆医学》 2020年第10期1005-1009,共5页
目的基因芯片筛选新疆哈萨克族食管癌组织和癌旁正常组织差异表达miRNA及其功能验证,为进一步研究miRNAs在食管癌发生发展中的作用机制提供理论依据。方法收集6对新疆哈萨克族食管癌患者癌组织及癌旁正常组织,miRNA微阵列芯片分析食管... 目的基因芯片筛选新疆哈萨克族食管癌组织和癌旁正常组织差异表达miRNA及其功能验证,为进一步研究miRNAs在食管癌发生发展中的作用机制提供理论依据。方法收集6对新疆哈萨克族食管癌患者癌组织及癌旁正常组织,miRNA微阵列芯片分析食管癌组织及癌旁正常组织的差异miRNA,实时荧光定量PCR验证miR-155在食管癌组织及癌旁组织中的表达,并在细胞水平上采用四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色法、细胞划痕、和细胞周期实验验证其与食管癌恶性表型的相关性。结果与癌旁正常组织相比,共筛选出差异miRNA 69个,其中包括上调miRNA 56个,下调miRNA13个。并对筛选出的上调基因miR-155进行实时荧光定量PCR验证和细胞功能验证,miR-155在癌组织中表达明显高于癌旁组织,与芯片结果一致;并且在细胞水平上促进了食管癌细胞增殖、迁移,阻值食管癌细胞于S期。结论基因芯片筛选并验证了miR-155参与了食管癌的恶性表型。 展开更多
关键词 基因芯片 mirna 食管癌
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新构建FlaA N/C蛋白辐射防护相关miRNA芯片谱研究
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作者 许颖 王丹 +3 位作者 石娇 周晓萍 王建 常晓松 《成都医学院学报》 CAS 2014年第3期249-252,共4页
目的通过miRNA芯片谱研究,分析FlaA N/C蛋白辐射防护功能的转录后调控机制。方法FlaA N/C蛋白皮下注射小鼠2h后,取小肠组织进行miRNA芯片谱分析,芯片谱结果用生物信息学方法预测miRNA作用靶点及可能相关的信号通路。结果 FlaA N/C皮下... 目的通过miRNA芯片谱研究,分析FlaA N/C蛋白辐射防护功能的转录后调控机制。方法FlaA N/C蛋白皮下注射小鼠2h后,取小肠组织进行miRNA芯片谱分析,芯片谱结果用生物信息学方法预测miRNA作用靶点及可能相关的信号通路。结果 FlaA N/C皮下注射后2h有108个miRNA上调,59个miRNA下调,差异miRNA预测靶点主要集中在NF-κB、PI3K-Akt、p53和Caspase等信号通路。结论凋亡相关信号通路在FlaA N/C介导辐射防护机制中具有重要作用,有必要针对凋亡相关miRNAs网络开展辐射防护机制研究。 展开更多
关键词 辐射防护 mirna芯片谱 凋亡相关信号通路
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吸烟者外周血单个核细胞差异表达miRNA与mRNA调控网络
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作者 党晓敏 曲晓艳 +5 位作者 尚东 杨岚 王维嘉 李莹 李飞燕 常颖 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期709-714,751,共7页
目的探讨吸烟者外周血单个核细胞(PBMC)差异表达的miRNA与mRNA调控网络及相关信号通路。方法收集20名健康非吸烟者与17名健康吸烟者的外周静脉血,分离PBMC后提取总RNA,分别进行miRNA和mRNA表达谱芯片检测。在差异表达的miRNA和mRNA范围... 目的探讨吸烟者外周血单个核细胞(PBMC)差异表达的miRNA与mRNA调控网络及相关信号通路。方法收集20名健康非吸烟者与17名健康吸烟者的外周静脉血,分离PBMC后提取总RNA,分别进行miRNA和mRNA表达谱芯片检测。在差异表达的miRNA和mRNA范围内通过数据库预测miRNA对mRNA的调控关系,并进行信号通路富集分析。结果与健康非吸烟者相比,吸烟者PBMC有miRNA与mRNA的差异表达,其差异表达基因的GO富集分析表明,血小板来源生长因子信号通路、胆囊收缩素受体信号通路、T细胞活化和表皮生长因子受体信号通路是主要的信号通路。结论吸烟者PBMC中差异表达的miRNA与mRNA调控网络可能与某些疾病的潜在危险因素相关。 展开更多
关键词 吸烟 mirna 基因芯片 信号通路
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基于基因芯片对癫痫小鼠海马组织miRNA-204表达的研究及生物信息学分析 被引量:1
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作者 吴琼 吕婷婷 刁丽梅 《中风与神经疾病杂志》 CAS 2022年第6期493-495,共3页
目的基于基因芯片对癫痫小鼠海马组织miRNA-204表达进行分析研究。方法选取癫痫小鼠海马组织,利用基因芯片技术检测出差异基因,并利用生物信息学对其靶基因进行富集分析和通路分析。结果本实验检测到与癫痫相关差异基因miRNA-204表达下... 目的基于基因芯片对癫痫小鼠海马组织miRNA-204表达进行分析研究。方法选取癫痫小鼠海马组织,利用基因芯片技术检测出差异基因,并利用生物信息学对其靶基因进行富集分析和通路分析。结果本实验检测到与癫痫相关差异基因miRNA-204表达下调,预测到相关457个相交集靶基因,富集分析得到27个基因功能(P<0.01)和16个信号通路(P<0.05)。结论通过分析,明确miRNA-204表达下调对癫痫小鼠的影响,并分析出miRNA-204相关通路Wnt,为进一步研究miRNA-204作用于癫痫的调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 基因芯片 癫痫 mirna-204 WNT通路 生物信息学分析
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