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马铃薯块茎花色素苷合成相关R2R3 MYB蛋白基因的克隆和功能分析 被引量：11
1
作者 谈欢 刘玉汇 +3 位作者 李丽霞 王丽 李元铭 张俊莲 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1021-1031,共11页
植物花色素苷的合成代谢受转录因子的调控,其中R2R3 MYB为最主要的转录调控因子。本研究以彩色四倍体马铃薯为试材,克隆了R2R3 MYB基因家族里调控马铃薯块茎花色素苷合成R2R3 MYB-St AN1的3个同源基因,并利用生物信息学分析、稳定烟草... 植物花色素苷的合成代谢受转录因子的调控,其中R2R3 MYB为最主要的转录调控因子。本研究以彩色四倍体马铃薯为试材,克隆了R2R3 MYB基因家族里调控马铃薯块茎花色素苷合成R2R3 MYB-St AN1的3个同源基因,并利用生物信息学分析、稳定烟草遗传转化、q PCR等方法对这3个同源基因的结构和功能进行分析和鉴定,结果表明,这3个同源基因均含有R2和R3保守结构域,其主要差别在于C端由10个氨基酸序列组成的重复结构(R)数目不同,根据R数目将其分别命名为St AN1-R0、St AN1-R1和St AN1-R3,其蛋白分子量分别为28 047.91、29 458.35和31 527.60 Da,等电点(p I)分别为6.14、6.90和8.39,均为亲水蛋白。通过转化烟草发现,转入St AN1-R0、St AN1-R1和St AN1-R3后,烟草叶片叶色变化明显,其中转St AN1-R1烟草叶色呈深红色,其叶片花色素苷含量最高。进一步利用q PCR分析表明,外源St AN1使烟草叶片花色素苷合成代谢途径的关键基因(Nt CHS、Nt CHI、Nt F3H、Nt F3’H、Nt DFR、Nt ANS、Nt UFGT)上调表达,同时烟草内源Ntb HLH基因的表达显著上升;St AN1-R1可以高效地调控烟草内源Ntb HLH基因和结构基因Nt DFR和Nt ANS的表达。结果表明,St AN1的3个同源蛋白均可以调控花色素苷的合成,而只含一个重复序列R的St AN1调控花色素苷合成的能力最强。 展开更多
关键词 马铃薯 花色素苷 r2r3 myb 基因克隆 生物信息学分析 烟草转化 基因表达分析
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香椿R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1克隆、表达与功能分析 被引量：1
2
作者 唐彩群 雷秀锦 +3 位作者 赵艳 吴嫦琴 杨安妮 徐启江 《北方园艺》 北大核心 2025年第13期8-17,共10页
以‘红香椿’嫩叶为试材,采用RT-PCR技术克隆了R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1,利用生物信息学方法分析该基因的序列结构、保守结构域、进化关系和蛋白质三维结构、理化性质,采用RT-qPCR技术分析该基因组织特异性表达模式,构建过表达载体,... 以‘红香椿’嫩叶为试材,采用RT-PCR技术克隆了R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1,利用生物信息学方法分析该基因的序列结构、保守结构域、进化关系和蛋白质三维结构、理化性质,采用RT-qPCR技术分析该基因组织特异性表达模式,构建过表达载体,利用农杆菌介导的浸花法转化拟南芥,验证功能,以期为深入解析该基因在香椿花青素合成中的功能提供参考依据。结果表明:TsMYB1基因开放阅读框为831 bp,编码1个由276个氨基酸组成、相对分子量为31.427 kDa、理论等电点为8.24的稳定亲水碱性蛋白。TsMYB1蛋白含有R2R3-MYB蛋白家族保守的R2和R3结构域。二级结构预测其α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规则卷曲所占比例分别为28.99%、5.43%、9.42%和56.16%。该基因编码的氨基酸序列与MaMYB序列相似度达69.93%,进化关系较为密切。TsMYB1在香椿各组织中有特异性表达,在叶中表达量最高,其次是茎,在根中表达量最低。过表达TsMYB1的拟南芥植株叶片花青素积累增加,叶色由绿变紫。TsMYB1基因编码1个R2R3-MYB转录因子,其表达具有组织特异性,具有促进植物花青素合成功能。 展开更多
关键词 香椿 r2r3-myb转录因子 花青素
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绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选 被引量：3
3
作者 郭飞翔 李春霞 +3 位作者 周爽 郭彬彬 张均 马超 《作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期117-133,共17页
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺... R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。 展开更多
关键词 绿豆 r2r3-myb转录因子 转录因子家族分析 类黄酮合成调控基因
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牡丹R2R3-MYB基因家族鉴定及花色形成相关基因筛选
4
作者 闫庚洋 高文 +2 位作者 李航 尚烨 张菊平 《河南农业科学》 北大核心 2025年第12期121-137,共17页
基于牡丹全基因组数据对R2R3-MYB基因家族进行鉴定,研究其在牡丹花色形成中的作用,确定关键调控基因。利用生物信息学方法进行理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、顺式作用元件、表达相关性及蛋白质互作分析,并通过qRT-PCR验证... 基于牡丹全基因组数据对R2R3-MYB基因家族进行鉴定,研究其在牡丹花色形成中的作用,确定关键调控基因。利用生物信息学方法进行理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、顺式作用元件、表达相关性及蛋白质互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在牡丹样品中的表达模式。结果表明,共鉴定出78个牡丹R2R3-MYB转录因子,均位于细胞核,多为亲水性的不稳定蛋白,具有丰富的顺式作用元件以及N端高度保守的R2、R3结构域。系统进化将78个成员分为26个亚族(P1—P26),其中牡丹Ps2RMYB21、Ps2RMYB38和Ps2RMYB33分别与已知调控花色苷合成的拟南芥S4、S7同亚族,具有对应亚族特有的保守基序。Ps2RMYB33、Ps2RMYB38在正常萼片、彩色萼片、正常花瓣中的表达量依次升高,与结构基因PsCHS、PsCHI3、PsF3H1、PsDFR1、PsANS、PsUFGT4表达模式相同,表现为极显著的正相关性,与花色苷积累趋势一致。Ps2RMYB21与上述结构基因的表达模式相反,呈极显著负相关性,与花色苷积累趋势相反。qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致。综上,Ps2RMYB21、Ps2RMYB33、Ps2RMYB38是调控牡丹花色形成的3个关键基因。 展开更多
关键词 牡丹 花色 r2r3-myb基因家族 生物信息学分析 花色苷合成调控基因
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美人蕉R2R3-MYB基因家族的鉴定及与花青素相关成员的表达分析
5
作者 杨晨欣 李梦秀 +2 位作者 姜唐 张文娥 潘学军 《生物技术通报》 北大核心 2025年第12期201-213,共13页
【目的】鉴定美人蕉(Canna indica)R2R3-MYB基因家族,分析其在不同花色中的表达模式,为美人蕉花色分子调控机制及新品种培育提供理论参考。【方法】以模式植物拟南芥R2R3-MYB蛋白序列为参考,结合HMM模型和BLAST检索从美人蕉基因组中鉴定... 【目的】鉴定美人蕉(Canna indica)R2R3-MYB基因家族,分析其在不同花色中的表达模式,为美人蕉花色分子调控机制及新品种培育提供理论参考。【方法】以模式植物拟南芥R2R3-MYB蛋白序列为参考,结合HMM模型和BLAST检索从美人蕉基因组中鉴定R2R3-MYB基因家族成员,分析其理化性质、亚细胞定位、系统发育树、染色体分布、保守基序及启动子顺式作用元件;基于课题组前期8个美人蕉品种转录组数据,通过TBtools可视化分析获得其在盛花期花瓣中的表达模式。选取4个不同花色品种(橙色‘印丽’、粉色‘Grand Due’、红色‘安旺’、黄色‘洒金’)的花瓣,通过实时荧光定量PCR检测11个候选CiMYBs基因的表达模式,分析基因表达与花瓣花青素、类黄酮含量的关系;以拟南芥蛋白预测美人蕉中的蛋白互作。【结果】共鉴定出185个美人蕉R2R3-MYB基因,编码蛋白均为亲水性核定位蛋白,分布于9条染色体上。约94%的成员含有核心保守基序(Motif1、Motif2、Motif3),启动子区富含光响应元件。系统发育分析将其与拟南芥同源蛋白划分为30个亚组,其中11个基因与拟南芥中调控花色素合成的MYB蛋白同源;RNA-seq结果显示11个候选基因在不同花色美人蕉品种中差异表达;互作网络预测表明CiMYB65与花青素合成关键基因DFRA显著共表达,直接调控花青素合成。RT-qPCR分析发现CiMYB21、CiMYB39、CiMYB65和CiMYB20分别在‘Grand Due’‘洒金’‘安旺’‘印丽’中表达量最高,且基因表达量与花青素含量及黄酮醇含量呈显著正相关。【结论】美人蕉基因组含有185个R2R3-MYB基因,其中CiMYB20、CiMYB39、CiMYB65等基因可通过调节花青素合成参与调控美人蕉花色形成。 展开更多
关键词 美人蕉 r2r3-myb转录因子 花色 花青素合成 系统发育分析 RT-QPCR 基因功能
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芋花青素合成相关R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析
6
作者 陈玥雯 曾程红 +7 位作者 程琦 邓婵 曾鹏程 唐雨菲 李慧英 周庆红 黄英金 朱强龙 《南方农业学报》 北大核心 2025年第8期2421-2438,共18页
【目的】鉴定并分析芋R2R3-MYB基因家族成员,为揭示R2R3-MYB基因家族在芋球茎花青素生物合成途径中的分子作用机制,选育高花青素芋品种提供参考依据。【方法】以赣芋2号白肉芋和赣芋3号红肉芋为试验材料,通过p H示差法测定2种芋3个球茎... 【目的】鉴定并分析芋R2R3-MYB基因家族成员,为揭示R2R3-MYB基因家族在芋球茎花青素生物合成途径中的分子作用机制,选育高花青素芋品种提供参考依据。【方法】以赣芋2号白肉芋和赣芋3号红肉芋为试验材料,通过p H示差法测定2种芋3个球茎发育期(膨大前期、膨大中期和膨大后期)芋肉和皮层组织中的总花青苷含量。利用生物信息学方法从芋全基因组数据库中鉴定芋R2R3-MYB基因家族成员,并分析预测其蛋白理化性质、保守结构域、染色体定位、基因结构特征,使用MEGA 7.0构建R2R3-MYB家族成员系统发育树,结合芋球茎膨大后期芋R2R3-MYB家族基因的表达量筛选与花青素生物合成相关的基因,通过相关分析和实时荧光定量PCR检测进一步鉴定出重要芋花青素合成基因。【结果】在3个芋球茎发育期,同一组织赣芋3号红肉芋中总花青苷含量均显著高于赣芋2号白肉芋(P<0.05,下同)。球茎膨大后期赣芋3号红肉芋皮层组织中总花青苷含量在所有样品中最高,达6.23 mg/100 g。芋全基因组中共筛选出97个芋R2R3-MYB基因家族成员,均定位于细胞核,不均等地分布在芋13条染色体及9个重叠群上。大多数的蛋白编码200~400个氨基酸残基,蛋白呈酸性,稳定性较差。MYB结构域的R2和R3重复序列虽然表现出不同的特征氨基酸模式,但在芋和拟南芥间高度保守。芋的96个R2R3-MYB家族基因均包含Motif 1、Motif 2和Motif 3以及1~5个内含子。不同作物R2R3-MYB家族成员系统发育分析结果显示,芋R2R3-MYB蛋白划分为29个亚家族,其中有8个芋R2R3-MYB家族蛋白与参与花青素合成相关的拟南芥蛋白亲缘关系较近。转录组测序及相关分析结果表明,基因CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89在赣芋3号红肉芋球茎膨大后期表达量较高,而在赣芋2号白肉芋球茎中表达量较低;上述3个基因与总花青苷含量呈显著或极显著(P<0.01)正相关。芋花青苷合成相关基因CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89的相对表达量与转录组测序结果基本一致。【结论】在芋中共鉴定出97个R2R3-MYB基因家族成员,该家族基因在进化过程中具有一定保守性和多样性。筛选到3个与红肉芋花青素生物合成相关的重要调控基因,分别是CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89。 展开更多
关键词 芋 r2r3-myb基因家族 花青素生物合成 基因表达
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蓝莓R2R3-MYB基因鉴定及类黄酮调控基因表达分析
7
作者 刘佳丽 宋经荣 +4 位作者 赵文宇 张馨元 赵子洋 曹一博 张凌云 《生物技术通报》 北大核心 2025年第9期124-138,共15页
【目的】解析蓝莓R2R3-MYB转录因子家族在类黄酮调控中的表达模式,为探究蓝莓参与类黄酮合成调控机制提供理论基础。【方法】运用生物信息学手段,对蓝莓R2R3-MYB基因的理化性质、亚细胞定位等进行分析;通过RT-qPCR检测VcMYBs基因在不同... 【目的】解析蓝莓R2R3-MYB转录因子家族在类黄酮调控中的表达模式,为探究蓝莓参与类黄酮合成调控机制提供理论基础。【方法】运用生物信息学手段,对蓝莓R2R3-MYB基因的理化性质、亚细胞定位等进行分析;通过RT-qPCR检测VcMYBs基因在不同组织和果实发育期的表达。【结果】在蓝莓中鉴定出278个R2R3-MYB基因,其氨基酸序列长度为160-970 aa;多数成员亚细胞定位在细胞核,进化树分析将VcMYBs分为23个亚家族,同亚家族基因结构特性相似;顺式作用元件分析表明,VcMYBs可能参与生物和非生物胁迫、激素响应、植物生长发育以及光响应;从可能参与类黄酮合成调控的基因(SG4、SG5、SG6和SG7)中随机选择14个,RT-q PCR分析显示,多数VcMYBs基因在果实中表达水平较高,其中,VcMYB91(SG6)和VcMYB56(SG5)等基因在绿果期低表达,成熟期高表达,可能参与果实着色;然而VcMYB88(SG4)和VcMYB96(SG4)等基因在绿果期高表达,成熟期低表达,可能抑制果实着色;VcMYB236(SG7)和VcMYB44(SG7)基因可能参与黄酮醇合成。【结论】全基因组分析鉴定出278个蓝莓R2R3-MYB基因,解析发现SG5/6亚组4个基因(VcMYB56、VcMYB91等)调控花青素合成,SG4/5亚组6个基因(VcMYB88、VcMYB96等)参与原花青素合成,SG7亚组2个基因(VcMYB236、VcMYB44)可能调控黄酮醇代谢。 展开更多
关键词 蓝莓 r2r3-myb 生物信息学 组织表达模式 不同果实发育期 类黄酮合成
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紫薇R2R3-MYB基因家族鉴定及其外源激素响应表达分析
8
作者 刘子依 王景芸 +1 位作者 续言 蔡明 《江西农业大学学报》 北大核心 2025年第4期947-960,共14页
【目的】旨在探究紫薇R2R3-LiMYB基因家族的特征及其在外源激素响应中的作用,为紫薇芳香品种的分子育种提供理论基础。【方法】以三年生紫薇‘Whit III’盆栽苗为试验材料,基于紫薇基因组,采用生物信息学方法对R2R3-LiMYB家族进行全基... 【目的】旨在探究紫薇R2R3-LiMYB基因家族的特征及其在外源激素响应中的作用,为紫薇芳香品种的分子育种提供理论基础。【方法】以三年生紫薇‘Whit III’盆栽苗为试验材料,基于紫薇基因组,采用生物信息学方法对R2R3-LiMYB家族进行全基因组鉴定,并通过qPCR技术检测分析17个在开花期表达的R2R3-LiMYBs基因在茉莉酸甲酯(0.25%)和水杨酸(0.4,0.7,1.5 g/L)处理下的表达模式。【结果】(1)在紫薇基因组中共鉴定出207个R2R3-LiMYBs基因,其不均匀分布于24条染色体上,主要定位于细胞核、线粒体和叶绿体。系统进化分析将紫薇与拟南芥的R2R3-MYBs分为21个亚组,其中3个进化枝仅包含R2R3-AtMYBs基因。(2)顺式作用元件分析表明,R2R3-LiMYBs基因的启动子区域含有大量光响应、非生物胁迫响应及激素响应元件,且不同成员具有不同的元件组合。(3)表达模式分析显示,多数R2R3-LiMYBs基因在紫薇初开期和盛开期高表达;qPCR结果表明12个R2R3-LiMYBs经过0.25%MeJA处理后下调表达,但其表达量有差异;只有Lin_chr3_1451和Lin_chr10_0902在3个质量浓度的SA处理下表达量均下调,其余R2R3-LiMYBs经过SA处理后上调表达,但不同基因对不同质量浓度的SA的响应模式各异,其中6个基因在0.7 g/L处理下表达量最高。【结论】R2R3-LiMYBs基因在花发育过程中呈现阶段特异性表达,并对植物激素信号(如茉莉酸甲酯和水杨酸)表现出动态响应,其表达水平受激素质量浓度调控。R2R3-LiMYBs基因可能参与紫薇对MeJA和SA的复杂响应机制。 展开更多
关键词 紫薇 r2r3-myb基因家族 生物信息学 外源激素响应 表达模式
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基于T2T基因组鉴定大豆R2R3-MYB基因家族及干旱和盐胁迫下的表达分析
9
作者 李志强 罗正乾 +4 位作者 徐琳黎 周国慧 屈丝雨 刘恩良 顼东婷 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期141-152,共12页
【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系... 【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系统鉴定和进化分析,并使用RT-qPCR对该家族的基因在干旱和盐胁迫下进行表达分析。【结果】大豆基因组中包含324个R2R3-MYB基因,新鉴定到77个,分布在20条染色体上。进化分析结果显示大豆R2R3-MYB家族基因可分为4个亚组,共线性基因对在进化树的分支上距离更近。通过启动子分析发现,与ABA和抗旱相关的顺式作用元件最多。通过表达分析,推测10个基因参与了大豆耐盐过程,其中GmMYB19和GmMYB76已被报道,GmMYB89和GmMYB214是首次鉴定并发现可能与大豆抗旱耐盐性有关。【结论】在大豆中鉴定到321个R2R3-MYB家族基因,通过干旱和盐胁迫诱导的表达模式分析确定了10个抗旱耐盐的候选基因。 展开更多
关键词 大豆 r2r3-myb基因家族 生物信息学分析 干旱和盐胁迫 表达分析 T2T
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长白落叶松R2R3-MYB基因家族鉴定及表达分析
10
作者 赵佳丽 刘刚 +3 位作者 韩勇 张旭 赵冷冰 樊巍 《吉林林业科技》 2025年第5期1-6,共6页
MYB基因家族广泛参与植物生长发育、次生代谢及生物和非生物胁迫等生理活动。本研究利用生物信息学对长白落叶松R2R3-MYB家族基因进行筛选与鉴定,并对其蛋白理化性质与系统发育树进行分析。长白落叶松转录组测序结果共鉴定到12个R2R3-MY... MYB基因家族广泛参与植物生长发育、次生代谢及生物和非生物胁迫等生理活动。本研究利用生物信息学对长白落叶松R2R3-MYB家族基因进行筛选与鉴定,并对其蛋白理化性质与系统发育树进行分析。长白落叶松转录组测序结果共鉴定到12个R2R3-MYB基因;大部分为酸性不稳定亲水蛋白;亚细胞定位预测均位于细胞核;系统发育树显示12个蛋白被分为8个亚族;干旱胁迫条件下,R2R3-MYB基因均受到诱导表达并具有不同的响应模式。本研究可为深入研究长白落叶松MYB基因响应干旱胁迫应答机制提供理论基础。 展开更多
关键词 长白落叶松 r2r3-myb基因家族 生物信息学 干旱胁迫
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干旱胁迫下外源ABA对香樟R2R3-MYB亚家族转录因子表达的影响
11
作者 关信 郑洋群 +2 位作者 张亚东 王毅 郑元 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第2期51-63,共13页
R2R3-MYB亚家族转录因子与植物生长发育和抗逆性相关,其通过与下游靶基因特异性结合增强植物的抗逆能力。本研究基于香樟全基因组数据,鉴定了90个R2R3-MYB亚家族成员(CcMYB1~CcMYB90),并对其生物信息学及外源ABA调控干旱胁迫下的表达模... R2R3-MYB亚家族转录因子与植物生长发育和抗逆性相关,其通过与下游靶基因特异性结合增强植物的抗逆能力。本研究基于香樟全基因组数据,鉴定了90个R2R3-MYB亚家族成员(CcMYB1~CcMYB90),并对其生物信息学及外源ABA调控干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果表明,R2R3-MYB亚家族基因结构相似,功能多样,大多数基因与抗旱通路和植物激素反应相关;基于转录组数据基因表达谱分析,在干旱胁迫下CcMYB2、CcMYB9、CcMYB21、CcMYB46、CcMYB63、CcMYB84等通过正调控参与香樟抗旱物质的合成;结合顺式作用元件中参与涉及干旱诱导性的MYB结合位点,CcMYB16、CcMYB51、CcMYB52可能通过ABA信号通路中的去磷酸化过程,参与干旱胁迫调控,CcMYB2、CcMYB21、CcMYB22、CcMYB61、CcMYB63可能与干旱胁迫下ABA介导的气孔运动相关。 展开更多
关键词 香樟 外源ABA 干旱胁迫 r2r3-myb亚家族 转录因子 基因表达
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太子参R2R3-MYB转录因子鉴定及表达分析
12
作者 黄以书 何华 +5 位作者 周涛 潘琪 刘红霞 徐娇 欧小宏 江维克 《广西植物》 北大核心 2025年第5期931-942,共12页
R2R3-MYB转录因子在植物的生长发育、逆境响应及次生代谢等过程具有重要的调控作用。为了探究太子参中R2R3-MYB转录因子的时空表达模式并筛选参与调控环肽B生物合成的R2R3-MYB转录因子,该研究基于太子参的全长转录组数据库,从太子参中... R2R3-MYB转录因子在植物的生长发育、逆境响应及次生代谢等过程具有重要的调控作用。为了探究太子参中R2R3-MYB转录因子的时空表达模式并筛选参与调控环肽B生物合成的R2R3-MYB转录因子,该研究基于太子参的全长转录组数据库,从太子参中鉴定到15个R2R3-MYB转录因子,利用生物信息学方法对其理化性质、保守基序和系统进化关系进行分析,并运用qRT-PCR对其组织表达和激素脱落酸(abscisic acid,ABA)诱导的表达模式进行研究。结果表明:(1)15个PhR2R3-MYB蛋白亚细胞定位于细胞核,大部分PhR2R3-MYB蛋白为亲水性不稳定蛋白。与拟南芥R2R3-MYB蛋白一同构建系统进化树,可将PhR2R3-MYB蛋白分为8个亚组,其中6个亚组能分别与拟南芥R2R3-MYB转录因子聚类。(2)PhR2R3-MYB基因在太子参植物中具有组织表达特异性,其中2个基因——PhMYB 4和PhMYB 8在块根韧皮部中特异性高表达。相关性分析显示,PhMYB 4和PhMYB 8基因表达量与太子参中环肽B含量及prePhHB基因表达量均呈显著正相关,推测PhMYB4和PhMYB8可能参与了太子参中环肽B的生物合成调控。(3)ABA处理后,PhMYB 4基因呈现出先降低后升高再降低的表达趋势,而PhMYB 8基因的表达受到了抑制,表明PhMYB 4和PhMYB 8基因均响应ABA信号。该研究结果为后续探究PhR2R3-MYB基因的功能奠定了基础,为研究PhR2R3-MYB转录因子调控环肽B生物合成的分子机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 太子参 r2r3-myb转录因子 环肽B 生物信息学分析 表达分析
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海岛棉R2R3-MYB基因家族的鉴定及其在黄萎病胁迫下的表达分析
13
作者 胡欣贵 赵杰银 +2 位作者 陆佳欣 陈全家 曲延英 《山东农业科学》 北大核心 2025年第6期1-14,共14页
R2R3-MYB转录因子在植物响应胁迫过程中发挥着重要作用。本研究基于海岛棉基因组数据,系统鉴定了海岛棉R2R3-MYB基因家族成员,利用生物信息学方法对海岛棉R2R3-MYB家族基因进行了系统进化、结构、理化性质和启动子顺式作用元件分析,利... R2R3-MYB转录因子在植物响应胁迫过程中发挥着重要作用。本研究基于海岛棉基因组数据,系统鉴定了海岛棉R2R3-MYB基因家族成员,利用生物信息学方法对海岛棉R2R3-MYB家族基因进行了系统进化、结构、理化性质和启动子顺式作用元件分析,利用转录组表达谱筛选出5个抗黄萎病候选基因,并通过实时荧光定量PCR对各候选基因在黄萎病、水杨酸(SA)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导下的表达规律进行分析。结果显示,海岛棉基因组中包含98个R2R3-MYB基因,分布于25条染色体上;进化树结果表明,在海岛棉中R2R3-MYB基因家族成员可分成3个亚组,在进化上相对保守;启动子分析发现多个响应植物激素和胁迫相关的顺式作用元件;黄萎病胁迫后的表达模式分析发现,海岛棉R2R3-MYB基因在黄萎病胁迫后均存在不同程度的差异表达,筛选得到5个海岛棉抗黄萎病候选基因(GbMYB-21、GbMYB-34、GbMYB-39、GbMYB-76和GbMYB-83),它们均受到黄萎病胁迫以及SA和MeJA诱导表达。总之,本研究表明海岛棉R2R3-MYB基因家族在棉花抗病方面具有重要作用,该结论可为进一步研究海岛棉R2R3-MYB基因功能和棉花抗黄萎病的分子机制提供理论依据。 展开更多
关键词 海岛棉 r2r3-myb基因家族 生物信息学分析 黄萎病胁迫 表达分析
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板栗R2R3-MYB基因家族的鉴定及表达分析
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作者 刘亚明 杨涌 +3 位作者 康肖肖 王萌 王东升 张海娥 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2025年第8期47-59,共13页
R2R3-MYB转录因子是植物中最大的MYB亚家族,广泛参与调节植物生长发育和胁迫响应。对板栗R2R3-MYB基因家族进行全基因组鉴定,分析其在染色体上分布、亚细胞定位、系统进化关系、蛋白基序、基因结构、保守结构域,最后通过转录组和RT-qPC... R2R3-MYB转录因子是植物中最大的MYB亚家族,广泛参与调节植物生长发育和胁迫响应。对板栗R2R3-MYB基因家族进行全基因组鉴定,分析其在染色体上分布、亚细胞定位、系统进化关系、蛋白基序、基因结构、保守结构域,最后通过转录组和RT-qPCR分析CmR2R3-MYB基因在干旱胁迫下的表达。结果表明,共鉴定出141个CmR2R3-MYB基因,不均等地分布于12条染色体与1条contig片段。系统进化树将其分为6个亚家族。有7个CmR2R3-MYB基因在干旱胁迫下差异表达,其中CmMYB89表达量上调,CmMYB32、CmMYB95、CmMYB91、CmMYB119、CmMYB131及CmMYB104表达量下调,表明这些基因可能与板栗抗旱性密切相关。以上研究结果为进一步探究R2R3-MYB基因家族在板栗响应干旱胁迫方面的作用奠定了理论基础。 展开更多
关键词 板栗 干旱 r2r3-myb基因家族
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百合花青素苷呈色类型中3种R2R3-MYBs基因的差异表达 被引量：18
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作者 曹雨薇 徐雷锋 +5 位作者 杨盼盼 徐华 何国仁 唐玉超 任君芳 明军 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期955-963,共9页
以亚洲百合系、LA系(麝香百合×亚洲百合)以及野生原种等7个不同呈色类型百合花被片为试验材料,通过RT-PCR扩增检测3种R2R3-MYBs基因Lh MYB12、LhMYB6和LrMYB15在花被片斑点和斑线中的表达,筛选出具有调控作用的LhMYB12和Lh MYB6,... 以亚洲百合系、LA系(麝香百合×亚洲百合)以及野生原种等7个不同呈色类型百合花被片为试验材料,通过RT-PCR扩增检测3种R2R3-MYBs基因Lh MYB12、LhMYB6和LrMYB15在花被片斑点和斑线中的表达,筛选出具有调控作用的LhMYB12和Lh MYB6,并对其进行全长序列的克隆和序列分析。结果表明:LhMYB12在亚洲百合花被片的斑线和溅泼状斑点中表达,LhMYB12和LhMYB6在LA系百合斑线和斑点中表达,在野生原种南川百合(Lilium rosthornii)、湖北百合(L. henryi)和欧洲百合(L. martagon)的花被片不同呈色类型中只有LhMYB12表达,未检测到LrMYB15参与本试验材料的调控。获得的LhMYB12和Lh MYB6全长序列分别为763和797bp,包括ORF区744和705bp,编码247个和234个氨基酸,与已经克隆的百合属LhMYB12、Lh SorMYB12和LhMYB6相似性为78%～88%。表明LhMYB12在百合杂交种和野生原种的呈色类型中均起重要作用,是一个广泛存在的R2R3-MYBs。LhMYB6在LA中与LhMYB12共同发挥作用。本研究揭示了调控百合花被片花青素苷不同呈色类型的R2R3-MYBs在不同品种类群中的差异表达。 展开更多
关键词 百合 花青素苷 呈色类型 r2r3-mybs
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越橘果实转录组及R2R3-MYB转录因子分析 被引量：13
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作者 宋杨 刘红弟 +1 位作者 张红军 窦连登 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2383-2394,共12页
以‘泽西’越橘(Vaccinium corymbosum‘Jersey’)不同发育阶段的果实为试材,构建De novo转录组测序文库并进行数据分析,利用Web Logo 3、CLC Sequence Viewer 6等软件和荧光定量PCR技术对所获数据中的R2R3-MYB转录因子进行生物信息学... 以‘泽西’越橘(Vaccinium corymbosum‘Jersey’)不同发育阶段的果实为试材,构建De novo转录组测序文库并进行数据分析,利用Web Logo 3、CLC Sequence Viewer 6等软件和荧光定量PCR技术对所获数据中的R2R3-MYB转录因子进行生物信息学分析和表达分析。结果表明,转录组测序共获得有效数据6.01 Gb,通过组装得到Unigene序列60 481个。功能注释结果显示,有39 612个Unigene可以注释到GO和COG等数据库上;20 869个Unigene无匹配信息。利用GO和COG分类工具可将这些序列分别划分为55个和25个功能类别,涉及信号转导和转录调控等功能。利用所获数据分析越橘R2R3-MYB基因,结果表明共得到21个R2R3-MYB。序列分析显示,这21个基因均含有完整的R2R3-MYB区域,在此区域内2(G)和4(W)等30个氨基酸保守不变。进化树分析结果显示,越橘R2R3-MYB基因分为11个亚组。其中,S4、S5和S6亚组中有6个基因涉及到花青苷生物合成。荧光定量PCR结果分析显示,这6个基因在果实发育的7个阶段均能表达,但表达模式不同,这6个基因可能对越橘果实着色具有一定作用。 展开更多
关键词 越橘 转录组测序 r2r3-myb 转录因子 生物信息学
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菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析 被引量：11
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作者 陈哲 胡福初 +3 位作者 阮城城 范鸿雁 郭利军 张治礼 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1958-1971,共14页
R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要。本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,... R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要。本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,研究了乙烯利处理后菠萝顶端分生组织MYB基因的表达模式。研究结果显示,菠萝基因组含有103个R2R3-AcMYB转录因子,其中67个的基因结构组成为3(外显子)+2(内含子),17个为2(外显子)+1(内含子)。103个R2R3-AcMYB蛋白中,有31个偏碱性,55个显酸性和17个呈中性。亚细胞定位预测显示,有67个编码蛋白定位于细胞质,20个定位于细胞核。保守基序分析发现,有91个R2R3-AcMYB的序列包含SANT结构的motif 1和motif 2。系统进化树分析表明,81个R2R3-AcMYB转录因子可以分别被归入18个亚组,其余22个R2R3-AcMYB转录因子则未能进行明确归类。基于转录组数据和荧光定量PCR分析结果,发现菠萝顶端分生组织中多个MYB基因的表达受到乙烯利的诱导或抑制,暗示这些基因可能参与了乙烯利诱导条件下菠萝生长发育(包括开花诱导等)调控。这些研究结果为进一步挖掘菠萝激素响应、生长发育和开花调控等基因,揭示菠萝生长发育调控机制提供了数据支持。 展开更多
关键词 菠萝 r2r3-myb 生物信息学 乙烯利 基因表达
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葡萄中盐诱导的R2R3-MYB基因的筛选与表达分析 被引量：9
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作者 王春荣 王庆杰 +2 位作者 李晓玲 姚玉新 郝玉金 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期529-535,共7页
以葡萄砧木‘1103P’为试材,筛选获得了4个受盐强烈诱导的R2R3-MYB基因,系统进化分析表明其编码蛋白属于不同的拟南芥R2R3-MYB亚组。该4个基因在根、茎、叶和果实中呈组成型表达,但具有不同的表达水平,尤其是VvMYB112在葡萄根系中具有... 以葡萄砧木‘1103P’为试材,筛选获得了4个受盐强烈诱导的R2R3-MYB基因,系统进化分析表明其编码蛋白属于不同的拟南芥R2R3-MYB亚组。该4个基因在根、茎、叶和果实中呈组成型表达,但具有不同的表达水平,尤其是VvMYB112在葡萄根系中具有较高的表达水平。在4个基因中,VvMYB112能响应100～200 mmol·L-1高盐处理。此外,VvMYB112和VvMYB15也能被聚乙二醇(PEG6000)和低温诱导,而VvMYB107和VvMYB87对PEG6000和低温不敏感或受其抑制。表明这4个基因可能通过不同的途径介导抗盐性。 展开更多
关键词 葡萄 r2r3-myb 转录因子 盐 基因表达
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R2R3-MYB调控果实花色苷合成的研究进展 被引量：21
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作者 朱婷婷 梁东 夏惠 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期985-991,共7页
果皮颜色是决定果实品质和商品价值的重要因子之一,R2R3-MYB转录因子对花色苷的生物合成起着重要的调控作用。本综述从R2R3-MYB转录因子对花色苷合成的正负调控作用,特异性及与其它因子共同调控的花色苷合成网络等方面,介绍了近年来国内... 果皮颜色是决定果实品质和商品价值的重要因子之一,R2R3-MYB转录因子对花色苷的生物合成起着重要的调控作用。本综述从R2R3-MYB转录因子对花色苷合成的正负调控作用,特异性及与其它因子共同调控的花色苷合成网络等方面,介绍了近年来国内外R2R3-MYB在果树上调控花色苷合成的研究。并对今后果树上果实着色的研究作了展望,旨在为进一步开展本领域研究提供相关依据。 展开更多
关键词 果树 r2r3-myb 花色苷
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欧美杨R2R3-MYB家族新基因PeMYBF1的克隆及表达(英文) 被引量：3
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作者 宿红艳 王磊 +2 位作者 王仲礼 朱路英 孔冬瑞 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第1期42-49,共8页
利用同源克隆方法首次从欧美杨雄花序克隆到1个R2R3-MYB基因PeMYBF1。序列分析结果显示:该基因编码的蛋白质具有典型R2R3-MYB转录因子序列特征,即N端含有2个由53个氨基酸组成的MYB结构域,暗示PeMYBF1是1个欧美杨R2R3-MYB转录因子家族的... 利用同源克隆方法首次从欧美杨雄花序克隆到1个R2R3-MYB基因PeMYBF1。序列分析结果显示:该基因编码的蛋白质具有典型R2R3-MYB转录因子序列特征,即N端含有2个由53个氨基酸组成的MYB结构域,暗示PeMYBF1是1个欧美杨R2R3-MYB转录因子家族的新成员。聚类分析表明:PeMYBF1归属为第19亚组,该亚组成员在花发育过程中发挥重要作用。器官特异性表达模式分析结果显示:PeMYBF1特异在雄花序和雌花序中表达,暗示PeMYBF1可能参与欧美杨花发育的调控。进一步的分析结果显示:PeMYBF1在不同发育时期花序中的表达水平受到严格调控。 展开更多
关键词 花发育 欧美杨 r2r3-MY B GENE
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