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Mendelian randomization analysis:the causal relationship between statins and eye diseases
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作者 Lian-Tai Song Jia-Meng Wei +5 位作者 Hao-Ting Jia Feng-Yi Zhang Qing-Fang Deng Yi-Xiao Wang Huai-Zhi Qin Qian Xu 《Medical Data Mining》 2024年第4期34-40,共7页
Background:The specific role of statins in the field of ophthalmology is not clear.Statins have the advantages of pleiotropic,relatively safety and low cost,and are a promising choice for the prevention and management... Background:The specific role of statins in the field of ophthalmology is not clear.Statins have the advantages of pleiotropic,relatively safety and low cost,and are a promising choice for the prevention and management of eye diseases.Nevertheless,there is a divergence of findings regarding the correlation between statin treatment and ocular conditions.Hence,our intention is to investigate the impact of statins on eye conditions through the utilization of Mendelian randomization(MR).Methods:The UK Biobank provided data on five statins,while the FinnGen database provided data on six eye diseases,including age-related macular degeneration,glaucoma,diabetic retinopathy,senile cataract,drug-induced cataract,and other cataracts.Causality exploration involved the utilization of various methods including inverse variance weighted(IVW),weighted median,weighted multivariate(weighted mode),and MR-Egger regression.To assess the reliability of the findings,funnel analysis,MR-Egger regression,leave-one-out method,and Cochran’s Q test were employed.Additionally,reverse MR analysis was performed to evaluate the potential for reverse causality between statin use and eye diseases.Results:Based on IVW analysis,there were three pairs of positive results with significant(P<0.05)causal relationship,including atorvastatin and drug-induced cataract(odds ratio(OR)=1.65E-05,95%confidence interval(CI):2.24E-09–0.12;P_(IVW)=0.02),rosuvastatin and drug-induced cataract(OR=2.77E-18,95%CI:7.53E-35–0.1;P_(IVW)=0.04)and fluvastatin with senile cataract(OR=0.5,95%CI:0.25–0.99;P_(IVW)=0.05).No significant causal relationship was observed between other types of statins and eye diseases.Sensitivity analysis found that the results were robust.Reverse MR analysis indicated no evidence of reverse causality between statin use and the examined eye diseases.Conclusion:Our study finally verified the strong causal relationship between three drugs and two diseases(atorvastatin and rosuvastatin and drug cataract,fluvastatin and senile cataract).This study confirms that statins may reduce the risk of certain eye diseases and provides new insights into the prevention and treatment of eye diseases.Furthermore,the lack of reverse causality reinforces the reliability of these associations. 展开更多
关键词 mendel randomization STATINS eye diseases
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基于二分搜索改进Karnik-Mendel算法的广义二型模糊逻辑系统降型
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作者 陈阳 王涛 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2020年第8期1448-1453,共6页
广义二型模糊逻辑系统在近年来被广泛关注,降型仍然是系统的核心模块。改进Karnik-Mendel算法是最流行的降型算法。根据广义二型模糊集的α-平面表达理论,提出一类二分搜索改进Karnik-Mendel算法来完成广义二型模糊逻辑系统质心降型。... 广义二型模糊逻辑系统在近年来被广泛关注,降型仍然是系统的核心模块。改进Karnik-Mendel算法是最流行的降型算法。根据广义二型模糊集的α-平面表达理论,提出一类二分搜索改进Karnik-Mendel算法来完成广义二型模糊逻辑系统质心降型。在取相同的主变量采样率情况下,通过2个计算机仿真示例说明,该算法在不损失计算精度的前提下可取得比改进Karnik-Mendel算法更高的计算效率。 展开更多
关键词 广义二型模糊逻辑系统 降型 改进Karnik-mendel算法 二分搜索改进Karnik-mendel算法 计算机仿真
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基于Wang-Mendel模型的有约束模糊预测控制 被引量:3
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作者 张立 高宪文 +2 位作者 李申明 赵娟平 王介生 《控制与决策》 EI CSCD 北大核心 2010年第9期1384-1388,共5页
为解决多输入系统Wang-Mendel(WM)建模过程中输入量取舍困难和未选用的输入量影响模型精度的问题,通过引入前一时刻输出作为当前时刻输入的一部分对WM建模方法进行了改进;在此基础上建立多步递推模糊预测模型.同时,为了减少有约束预测... 为解决多输入系统Wang-Mendel(WM)建模过程中输入量取舍困难和未选用的输入量影响模型精度的问题,通过引入前一时刻输出作为当前时刻输入的一部分对WM建模方法进行了改进;在此基础上建立多步递推模糊预测模型.同时,为了减少有约束预测控制优化的求解时间,提出一种利用模糊控制器分担控制量及控制增量约束的模糊预测复合控制策略.通过对回转窑煅烧温度模型的仿真,验证了建模和控制方法的有效性. 展开更多
关键词 Wang-mendel模型 模糊预测控制 约束 回转窑
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区间型二型模糊集重心的直接Karnik-Mendel算法 被引量:2
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作者 胡怀中 张伟斌 杨华南 《系统仿真学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期2326-2328,共3页
区间型二型模糊集重心区间的计算在区间型二型模糊系统中有重要的应用。Karnik-Mendel迭代算法是目前计算此区间的常用算法。但是迭代的计算模糊集合的重心,使得该算法的效率受到很大的影响。证明了区间型二型模糊集上、下限隶属度函数... 区间型二型模糊集重心区间的计算在区间型二型模糊系统中有重要的应用。Karnik-Mendel迭代算法是目前计算此区间的常用算法。但是迭代的计算模糊集合的重心,使得该算法的效率受到很大的影响。证明了区间型二型模糊集上、下限隶属度函数分界点的取值与重心值间的数值关系,并据此提出一种直接Karnik-Mendel算法。仿真实验表明,该算法能将重心区间的计算时间缩短65%-75%。 展开更多
关键词 二型模糊逻辑 Karnik-mendel算法 降型 模糊系统
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离散型和连续型改进Karnik-Mendel算法在高阶模糊系统降型中的关系研究 被引量:4
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作者 陈阳 王涛 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2021年第11期2027-2034,共8页
降型是广义二型模糊逻辑系统的核心模块。比较和分析了离散改进Karnik-Mendel(EKM)算法中求和运算和连续EKM(CEKM)算法中求积分运算,基于广义二型模糊集的α-平面表达理论,扩展EKM算法计算完成广义二型模糊逻辑系统质心降型。当计算广... 降型是广义二型模糊逻辑系统的核心模块。比较和分析了离散改进Karnik-Mendel(EKM)算法中求和运算和连续EKM(CEKM)算法中求积分运算,基于广义二型模糊集的α-平面表达理论,扩展EKM算法计算完成广义二型模糊逻辑系统质心降型。当计算广义二型模糊逻辑系统的质心降型集和质心解模糊化值时,用2个仿真实验说明了当适当增加广义二型模糊集主变量采样个数时,离散EKM算法的计算结果可以准确地逼近CEKM算法。 展开更多
关键词 广义二型模糊逻辑系统 质心 改进Karnik-mendel算法 计算精度 计算机仿真
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基于加权Karnik-Mendel算法的区间二型模糊集质心计算 被引量:3
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作者 陈阳 王涛 《模糊系统与数学》 北大核心 2020年第3期98-110,共13页
区间二型模糊集的质心计算(也称降型)在二型模糊逻辑系统中起着很重要的作用。Karnik-Mendel(KM)算法是完成降型的标准算法。本文介绍了区间二型模糊集相关理论,比较了离散KM算法与连续KM(continuous KM,CKM)算法中的运算,通过数值分析... 区间二型模糊集的质心计算(也称降型)在二型模糊逻辑系统中起着很重要的作用。Karnik-Mendel(KM)算法是完成降型的标准算法。本文介绍了区间二型模糊集相关理论,比较了离散KM算法与连续KM(continuous KM,CKM)算法中的运算,通过数值分析技术中牛顿-柯特斯求积公式将KM算法扩展成三种不同形式的加权KM(weighted KM,WKM)算法,而KM算法只是WKM算法的一种特例。计算机仿真例子用来阐述和分析WKM算法的表现,其在计算两种不对称区间二型模糊集质心时可取得比KM算法更小的绝对误差和更快的计算速度,这给二型模糊集及其模糊逻辑系统设计和应用提供了潜在的价值。 展开更多
关键词 区间二型模糊集 质心 牛顿-柯特斯求积公式 加权Karnik-mendel算法 计算机仿真
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广义二型模糊逻辑系统质心降型及加权Karnik-Mendel算法 被引量:1
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作者 陈阳 王涛 《模糊系统与数学》 北大核心 2020年第5期116-126,共11页
随着广义二型模糊集的α-平面表达理论被提出,广义二型模糊逻辑系统在近年成为学术界热点研究问题。本文比较了离散Karnik-Mendel(KM)算法与连续版本的KM(continuous version of KM,CKM)算法中的运算,通过数值积分中牛顿-柯斯特求积公式... 随着广义二型模糊集的α-平面表达理论被提出,广义二型模糊逻辑系统在近年成为学术界热点研究问题。本文比较了离散Karnik-Mendel(KM)算法与连续版本的KM(continuous version of KM,CKM)算法中的运算,通过数值积分中牛顿-柯斯特求积公式把KM算法扩展成三种不同形式的加权KM(weighted KM,WKM)算法,而KM算法只是WKM算法在取特殊权重值下的一种例子。两个计算机仿真例子用来阐述和分析WKM算法的表现。总体来说,WKM算法在计算广义二型模糊逻辑系统质心解模糊化值时可取得比KM算法更小的绝对误差和更快的收敛速度,这给二型模糊逻辑系统的设计和应用提供了潜在的价值。 展开更多
关键词 广义二型模糊逻辑系统 质心降型 加权Karnik-mendel算法 误差 计算机仿真
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Wang-Mendel模糊模型控制规则的提取及应用 被引量:2
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作者 沈骏 李少远 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2007年第9期1524-1528,共5页
针对如何利用系统的模糊模型设计模糊控制器,提出以系统的模糊规则库为基础,提取模糊规则中的信息获得控制规则的方法。以钢铁工业中连续退火炉的加热炉为对象进行了仿真,首先提取描述对象输入-输出映射关系的模糊规则组成完备规则库,... 针对如何利用系统的模糊模型设计模糊控制器,提出以系统的模糊规则库为基础,提取模糊规则中的信息获得控制规则的方法。以钢铁工业中连续退火炉的加热炉为对象进行了仿真,首先提取描述对象输入-输出映射关系的模糊规则组成完备规则库,并以此为基础提取控制规则补偿输出偏差。仿真结果表明能够达到期望的效果。 展开更多
关键词 模糊控制 控制规则 Wang-mendel模型 多输入单输出系统 连续退火炉
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Handgrip strength and the risk of major depressive disorder:a two-sample Mendelian randomisation study
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作者 Nanxi Li Rui Zhou Bin Zhang 《General Psychiatry》 CAS CSCD 2022年第5期347-353,共7页
Background Major depressive disorder(MDD)is a common psychiatric disease and a leading cause of disability worldwide.Handgrip strength(HGS)as an objective physical fitness test is a practical index for identifying man... Background Major depressive disorder(MDD)is a common psychiatric disease and a leading cause of disability worldwide.Handgrip strength(HGS)as an objective physical fitness test is a practical index for identifying many diseases.Previous studies drew different conclusions about the relationship between HGS and MDD.Aims We aim to explore whether HGS has an effect on the risk of MDD.Methods HGS-related single-nucleotide polymorphisms identified by a genome-wide association study were used as instrumental variables in this Mendelian randomisation(MR)study.Summary data on MDD were obtained from the Psychiatric Genomics Consortium.Four methods were applied,including inverse variance weighted(IVW),MR Egger,weighted median and weighted mode.Additional sensitivity analyses,including leave-one-out,heterogeneity test,pleiotropy test and confounders identification,were conducted to test the robustness of our results.Results Each 1 kg increase in left HGS is associated with a 21.95%reduction in the risk of MDD(OR_(IVW)=0.781,95%CI:0.650 to 0.937,p=0.009),while no significant correlation exists in the estimation of right HGS(p=0.146).Sensitivity analyses demonstrated statistical significance(β_(IVW)=−0.195,p=0.023)after excluding some genetic loci that cause pleiotropy.Conclusions Increased left HGS is associated with a reduced risk of MDD.In the future,it may be used as an index for the clinical screening,observation and treatment of MDD. 展开更多
关键词 STRENGTH RANDOM mendel
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MENDEL分析软件在遗传流行病学两位点连锁分析中的应用 被引量:1
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作者 安平 沈福民 胡应 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1993年第4期229-233,共5页
以估算似然值(Likelihood)为目的的Elston-Stewart算式问世至今已20年,这期间用于家系资料遗传学分析的数学模型与统计方法的研究亦经历了质的飞跃,其中可应用于连锁分析的计算机软件或软件包大致有:LIPED、LINKAGE、MAPMAKER、
关键词 mendel软件 遗传病 流行病学
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基于孟德尔随机化和网络药理学分析肠道菌群与慢性阻塞性肺疾病的因果关系
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作者 李博 孙潺 +4 位作者 代岩 许学宗 张轩斌 尹硕鑫 赵江 《医学理论与实践》 2025年第14期2356-2360,2370,共6页
目的:探究肠道菌群与慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间的因果关系。方法:利用公开可获得的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据来进行孟德尔随机化分析。肠道菌群相关GWAS数据来自MiBioGen。COPD的汇总统计数据来自OpenGWAS。工具变量的选择严格... 目的:探究肠道菌群与慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间的因果关系。方法:利用公开可获得的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据来进行孟德尔随机化分析。肠道菌群相关GWAS数据来自MiBioGen。COPD的汇总统计数据来自OpenGWAS。工具变量的选择严格按照预设的纳入和排除标准。采用MR-Egger、加权中位数、逆方差加权(IVW)、加权模式和简单模式来评估肠道菌群与COPD的因果关系。采用Cochran’s Q检验、MR-Egger截距检验和留一分析法对异质性和多效性进行分析。另外通过R语言进行KEGG及GO富集分析以确定肠道菌群和COPD间潜在的基因和治疗靶点。结果:IVW分析结果显示,梭状芽孢杆菌属(OR=1.465,P<0.05)与COPD的发病风险呈正相关;毛螺菌属(OR=0.727,P<0.05)、苏黎世杆菌属(OR=0.724,P<0.05)与COPD的发病风险呈负相关。未发现显著异质性、水平多效性、离群值,且分析结果具有很好的敏感性。KEGG分析结果提示,肠道菌群可能是通过癌症蛋白多糖、Rap1、cAMP等信号通路干预COPD。GO富集分析结果提示,肠道菌群干预COPD的生物过程主要有应激反应、酶原激活、长期突触增强等。涉及的细胞组分主要有郎飞结、基底外侧质膜、突触后膜等。涉及的分子功能主要有前列腺素跨膜转运体活性、组蛋白H3K9甲基转移酶活性、类花生酸跨膜转运活性等。结论:本研究揭示了一些与COPD有因果关系的细菌类群,这一发现有助于确定最佳的肠道微生物群特征,并且通过网络药理学方法初步确定了肠道菌群干预COPD的作用机制,未来研究有必要剖析特定细菌类群在COPD病理生理学中的潜在作用机制。 展开更多
关键词 肠道菌群 慢性阻塞性肺疾病 孟德尔随机化 网络药理学
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双样本孟德尔随机化研究哮喘与气虚表型的相关性
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作者 杨敏 戴和森 黄平富 《中医临床研究》 2025年第20期1-10,共10页
目的:采用双样本孟德尔随机化分析方法探讨哮喘与气虚表型之间的关联。方法:哮喘数据集主要来源于Valette K等研究,气虚质主要通过全身去脂重量(Whole Body Fat–free Mass,WBFFM)、虚弱指数(Frailty Index,FI)、近两周内疲劳嗜睡频率(F... 目的:采用双样本孟德尔随机化分析方法探讨哮喘与气虚表型之间的关联。方法:哮喘数据集主要来源于Valette K等研究,气虚质主要通过全身去脂重量(Whole Body Fat–free Mass,WBFFM)、虚弱指数(Frailty Index,FI)、近两周内疲劳嗜睡频率(Frequency of Tiredness and Lethargy in Last 2 Weeks,FT)、上呼吸道感染(Upper Respiratory Tract Infection,URTI)、头晕目眩、记忆力减退等主要体质特征表现,FI数据来自Janice L Atkins的研究,WBFFM数据、FT通过IEU Open GWAS数据库下载,URTI、头晕目眩、记忆力减退通过芬兰基因数据库下载。通过R语言Two–Sample MR软件包进行孟德尔随机化分析,将逆方差加权(IVW)方法作为主要分析方法,通过MR–Egger、Weighted median、Simple mode、Weighted mode验证其可靠性,并进行异质性检验、敏感性分析、多效性分析。结果:IVW分析结果表明,哮喘与WBFFM呈负相关(OR=0.988 5,95%CI=0.979 2~0.997 9),与FI(OR=1.117 3,95%CI=1.095 0~1.139 1)、头晕目眩(OR=1.076 0,95%CI=1.017 0~1.138 2)、URTI(OR=1.121 4,95%CI=1.080 9~1.163 3)呈正相关,结果具有显著性。哮喘与记忆力减退(OR=1.015 8,95%CI=0.910 0~1.133 9)、FT(OR=1.010 4,95%CI=0.999 0~1.021 2,P=0.056 1)呈正相关,但结果缺乏显著性。异质性检验提示不存在异质性,敏感性分析均显示稳健,且未显示多效性。结论:哮喘可增加多项气虚表型的风险,在哮喘的诊疗中应及时识别患者是否存在继发性气虚,及时干预,“既病防变”。 展开更多
关键词 哮喘 气虚 孟德尔随机化
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基于“胃不和则卧不安”探讨胃食管反流病和失眠的关联性:一项两样本孟德尔随机化研究 被引量:2
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作者 吴千言 徐小港 +2 位作者 张清源 张敬文 章德林 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2025年第3期867-877,共11页
目的 基于“胃不和则卧不安”理论,采用两样本孟德尔随机化方法探讨胃食管反流病与失眠间的因果关系。方法 汇总数据来源于全基因组关联研究,暴露因素为胃食管反流病,结局变量为失眠;孟德尔随机化分析通过逆方差加权法、MR-Egger法、简... 目的 基于“胃不和则卧不安”理论,采用两样本孟德尔随机化方法探讨胃食管反流病与失眠间的因果关系。方法 汇总数据来源于全基因组关联研究,暴露因素为胃食管反流病,结局变量为失眠;孟德尔随机化分析通过逆方差加权法、MR-Egger法、简单模型法、加权模型法和加权中位数法实现;敏感性分析包括多效性检验、异质性检验和逐个剔除检验,且依次采用MR-Egger法、Cochran Q检验法和留一法计算。结果 共筛选75个单核苷酸多态性。逆方差加权法结果显示,胃食管反流病会增加失眠发生风险(OR=1.255,95%CI:1.071-1.470,P<0.05);加权中位数法同样证实胃食管反流病与失眠具有正向因果关系(OR=1.403,95%CI:1.117-1.762,P<0.05)。多项敏感性分析提示研究孟德尔随机化分析结果不存在多效性和异质性,验证了研究结果的稳定性。结论 胃食管反流病与失眠之间存在正向的因果关系,从遗传角度丰富了“胃不和则卧不安”理论内涵,亦为进一步深入研究奠定了基础。 展开更多
关键词 胃不和则卧不安 胃食管反流病 失眠 关联性 孟德尔随机化
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两样本孟德尔随机化分析乳腺癌与骨质疏松症的因果关系 被引量:2
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作者 牛丁忍 李志翔 +2 位作者 杨青 李强 冯晓玲 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第1期55-61,共7页
目的应用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)法分析乳腺癌(breast cancer,BC)与骨质疏松症(osteoporosis,OP)之间的因果关联。方法使用公开的全基因组关联研究数据集(GWAS),暴露因素为BC,结局变量为OP,采用逆方差加权法(IVW)、... 目的应用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)法分析乳腺癌(breast cancer,BC)与骨质疏松症(osteoporosis,OP)之间的因果关联。方法使用公开的全基因组关联研究数据集(GWAS),暴露因素为BC,结局变量为OP,采用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法(WME)和MR-Egger回归分析BC与OP的因果关系,其中以IVW为主要分析方法。并采用异质性检验、多效性检验及敏感性分析评估研究结果是否稳健。结果IVW分析结果表明BC可能是OP的危险因素(OR=1.09,95%CI:1.03~1.16,P<0.05)。此外,异质性检验、多效性检验及敏感性分析未观察到水平多效性和异质性,表明研究结果稳健可靠。结论BC与OP之间可能存在较为显著的潜在因果关系,BC可能会增加OP的发病风险,这为研究OP的生物学机制及其早期防治提供了新线索,也为循证医学研究提供了新方向。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 乳腺癌 骨质疏松症 流行病学
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生成式人工智能在数字化模拟孟德尔杂交实验中的应用 被引量:1
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作者 陈余 林琦 郑好 《生物学教学》 北大核心 2025年第2期48-50,共3页
以使用ChatGPT对“模拟孟德尔杂交实验”进行数字化创新为例,探究生成式人工智能在辅助高中生物学模拟实验数字化中的应用,并为高中生物学教师提供使用范例。
关键词 生成式人工智能 模拟孟德尔杂交实验 实验数字化
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肠道菌群与脓毒症的因果关系:一项两样本孟德尔随机化研究
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作者 赵振 张天鹏 +2 位作者 杜宇璠 杨洁 王国兴 《临床和实验医学杂志》 2025年第13期1353-1357,共5页
目的采用孟德尔随机化(MR)方法探讨肠道菌群与脓毒症之间的因果关系。方法回顾性选择微生物基因组多中心联盟肠道微生物全基因组关联研究(GWAS)数据(n=18340)作为暴露因素,选取UK Biobank数据库中脓毒症病例(n=11643)和健康对照(n=4748... 目的采用孟德尔随机化(MR)方法探讨肠道菌群与脓毒症之间的因果关系。方法回顾性选择微生物基因组多中心联盟肠道微生物全基因组关联研究(GWAS)数据(n=18340)作为暴露因素,选取UK Biobank数据库中脓毒症病例(n=11643)和健康对照(n=474841)作为结局指标。通过筛选单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,以逆方差加权法(IVW)为主要分析方法,并进行异质性、多效性、敏感性分析。结果共发现8类与脓毒症存在因果关联的肠道菌群。瘤胃球菌属(ID-11368,OR=1.11,95%CI:1.02~1.22,P=0.022)、梭菌科(ID-1869,OR=1.21,95%CI:1.04~1.40,P=0.011)、γ-变形菌纲(ID-3303,OR=1.37,95%CI:1.08~1.73,P=0.009)丰度升高与脓毒症患病风险增加相关。黏胶球形菌门(ID-2238,OR=0.89,95%CI:0.80~0.99,P=0.035)、食物谷菌目(ID-2254,OR=0.86,95%CI:0.78~0.94,P=0.002)、李斯特菌属(ID-2183,OR=0.85,95%CI:0.74~0.97,P=0.016)、粪球菌属(ID-11302,OR=0.81,95%CI:0.69~0.94,P=0.006)、黏胶球形菌纲(ID-2250,OR=0.86,95%CI:0.78~0.94,P=0.001)丰度升高对脓毒症发病具有保护作用。结论本研究通过MR分析证实多种肠道微生物群与脓毒症存在显著因果关联,为阐明肠道菌群在脓毒症发病机制中的作用提供新的循证依据。 展开更多
关键词 脓毒症 肠道菌群 孟德尔随机化方法 发病机制
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EGR1通过AMPK/Nrf2通路对缺血性卒中神经细胞损伤的保护作用
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作者 张亭玉 程嘉琪 +1 位作者 田宇诗 海英 《免疫学杂志》 2025年第7期476-482,共7页
目的通过孟德尔随机化(MR)、生物信息学和缺血性卒中(IS)体外模型探究早期生长反应蛋白1(EGR1)/腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)/核因子E2相关因子2(Nrf2)通路改善Neuro-2a细胞损伤的作用机制。方法基于MR分析鉴定与IS遗传易感性相关的血液蛋... 目的通过孟德尔随机化(MR)、生物信息学和缺血性卒中(IS)体外模型探究早期生长反应蛋白1(EGR1)/腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)/核因子E2相关因子2(Nrf2)通路改善Neuro-2a细胞损伤的作用机制。方法基于MR分析鉴定与IS遗传易感性相关的血液蛋白;后对GSE22255数据集进行综合分析,包括GSEA、免疫细胞浸润和差异表达分析;在与MR结果进行联合分析后鉴定出与IS发生发展密切相关的转录因子,并进一步利用体外实验验证关键基因的生物学功能。结果MR分析确定了712种与IS易感性相关的蛋白;从GSE22255数据集中鉴定了2357个差异表达基因,与MR结果联合分析后确定了75个交集基因和34个转录因子;体外实验发现敲低EGR1表达可显著抑制氧-葡萄糖剥夺/再灌注诱导的Neuro-2a细胞损伤,机制可能与上调p-AMPK和Nrf2蛋白表达相关。结论通过整合MR分析、转录组学和体外实验方法揭示了75个IS易感性基因和转录因子EGR1在IS发病中的潜在作用,为IS的治疗药物研发提供了理论依据。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 孟德尔随机化 遗传易感性 Neuro-2a细胞损伤 早期生长反应蛋白1
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肠道微生物群与2型糖尿病之间的相关性研究
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作者 杨新萍 王博 马艳 《糖尿病新世界》 2025年第11期14-17,28,共5页
目的评估肠道菌群与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性研究。方法基于人类基因组-菌群关联研究国际联盟(microbiome genome consortium,MiBioGen)(n=18340)与T2DM全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS... 目的评估肠道菌群与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性研究。方法基于人类基因组-菌群关联研究国际联盟(microbiome genome consortium,MiBioGen)(n=18340)与T2DM全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)数据(n=433540),采用双样本孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)分析,以逆方差加权法(inverse variance weighting,IVW)为核心方法,验证8种菌属与T2DM的因果关联。结果从119个属水平单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)中筛选出8个关键菌属用于MR分析,所有SNP的F统计量均>10,排除弱工具变量干扰。具体包括:胜利谷菌属(10SNP)、瘤胃球菌科UCG010群(7SNP)、毛螺菌科NK4A136群(12SNP)、瘤胃球菌属1型(11SNP)、真杆菌属结节群(8SNP)、丹毒梭菌属(15SNP)、罗姆布茨菌属(11SNP)、肠杆形菌属(7SNP);瘤胃球菌科UCG010群(OR=1.099,95%CI:1.001~1.207)、毛螺菌科NK4A136群(OR=1.071,95%CI:1.003~1.144)、真杆菌属结节群(OR=1.057,95%CI:1.011~1.105)及胜利谷菌属(OR=1.046,95%CI:1.007~1.088)与T2DM风险呈正相关;而瘤胃球菌属1型(OR=0.912,95%CI:0.842~0.988)、丹毒梭菌属(OR=0.945,95%CI:0.893~0.973)、罗姆布茨菌属(OR=0.929,95%CI:0.868~0.993)和肠杆形菌属(OR=0.917,95%CI:0.857~0.981)则呈负相关;异质性检验(IVW/MR-Egger均P>0.05)及异常值检测均未发现显著异质性或多效性。结论本研究通过筛选8个关键菌属进行了MR分析,瘤胃球菌科UCG010群、毛螺菌科NK4A136群、真杆菌属结节群及胜利谷菌属、瘤胃球菌属1型、丹毒梭菌属、罗姆布茨菌属和肠杆形菌属与T2DM发生密切相关。 展开更多
关键词 肠道菌群 2型糖尿病 孟德尔随机化
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脂代谢与肝生长因子:孟德尔随机化研究
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作者 钟文卿 韩冰 《临床医学进展》 2025年第4期1294-1301,共8页
背景:脂代谢异常与多种肝脏疾病的关系备受关注。研究表明,脂质代谢异常通常与肝脏的储备功能降低有关。肝生长因子对于肝脏的生长和修复至关重要,然而,当前的研究尚未明确证实脂代谢水平异常与肝生长因子功能衰退之间的直接因果联系。... 背景:脂代谢异常与多种肝脏疾病的关系备受关注。研究表明,脂质代谢异常通常与肝脏的储备功能降低有关。肝生长因子对于肝脏的生长和修复至关重要,然而,当前的研究尚未明确证实脂代谢水平异常与肝生长因子功能衰退之间的直接因果联系。在肝脏疾病的研究中,总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和甘油三酯(TG)等脂质代谢指标扮演着关键角色。方法:本研究利用全基因组关联研究(GWAS)数据,旨在深入探讨甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)与肝生长因子(HGF)之间的关系。我们将遗传变异作为工具变量,通过孟德尔随机化(MR)方法评估胆固醇水平与肝生长因子之间的因果关系。本研究选择逆方差加权(IVW)方法作为主要的分析工具。我们采用了MR-Egger回归、关联性分析和连锁不平衡检测等方法。还进行了F检验,水平多效性和异质性等检测。结果:随机效应IVW结果为TC-HGF:比值比(OR) = 0.887,95%置信区间(CI) = [0.795, 0.991],P = 0.034,LDL-C-HGF:比值比(OR) = 0.862,95%置信区间(CI) = [0.771, 0.964],P = 0.009,证明TC和HGF之间存在负相关,且我们发现是LDL-C和HGF存在负相关。结论:本研究结果显示,基因预测的较高胆固醇水平,特别是低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C),与肝生长因子(HGF)风险间存在负向关系。 展开更多
关键词 胆固醇 低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C) 肝生长因子(HGF)孟德尔随机化
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Morgan’s Mistake Leads to a Revolution in Genetics
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作者 Muying Zhou 《Open Journal of Genetics》 CAS 2024年第2期27-36,共10页
This paper reviews the authors research since 2018 on Mendels gene assumption. The main conclusion is that Morgans misreading of Mendels gene assumption would lead to the inevitable Copernican-like revolution (geocent... This paper reviews the authors research since 2018 on Mendels gene assumption. The main conclusion is that Morgans misreading of Mendels gene assumption would lead to the inevitable Copernican-like revolution (geocentrism replaced by heliocentrism) in genetics. The evidence for this judgment comes from written records in Morgans The Theory of the Gene. The result of Mendels experiment proposed the second question of genetics (template question), aim at which he assumed the gene was the element controlling individual specification. This led to dualistic genetics (two elements forming the germplasm). However, the gene located by Morgan was germplasm able to give rise to the individualthe answer to the first question of genetics. It ushered in gene-monistic genetics. The confirmation of the gene as DNA has opened a new era of physical verification of gene intension. The inability of DNA to build 3,5-phosphodiester bonds revealed that the gene has neither the ability to produce individuals nor is it self-replicating;consequently, the basis of gene monistic genetics completely collapsed. Instead, the universal fact that the eggs transcriptase initiates DNA (genome) transcription giving rise to the individual (unless accidents occur) confirms that Mendelian dualistic genetics is scientific genetics. 展开更多
关键词 mendel MORGAN GERMPLASM Genes Transcriptase
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