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Bi-PASA技术及其在RYR1基因多态性研究中的应用 被引量:3
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作者 吴彦宁 刘红林 +2 位作者 陈杰 徐银学 姜志华 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期69-71,共3页
双向PCR扩增特异等位基因 (Bi PASA)是一项建立在PCR基础之上的分子生物学新技术。它通过 2对引物的一次PCR反应可以迅速、有效地检测出基因组中单个碱基的突变 ,从而识别个体基因型的差异。现以猪氟烷基因即兰尼定受体 (Ryanodinerecep... 双向PCR扩增特异等位基因 (Bi PASA)是一项建立在PCR基础之上的分子生物学新技术。它通过 2对引物的一次PCR反应可以迅速、有效地检测出基因组中单个碱基的突变 ,从而识别个体基因型的差异。现以猪氟烷基因即兰尼定受体 (Ryanodinereceptor 1 )基因的多态性检测为例 ,介绍该技术的基本原理。 展开更多
关键词 bi-pasa技术 RYR1基因多态性 杂合子 纯合子
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猪STCH基因的Bi-PASA遗传标记及多态性研究 被引量:2
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作者 史宪伟 魏麟 韩洪金 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期76-81,共6页
微粒体应激 70蛋白三磷酸腺苷酶 (STCH)基因属于应激 70蛋白基因伴侣家族 ,在机体免疫反应和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物 ,PCR扩增到猪STCH基因第5外显子 4 4 5bp片段。序列测定显示 ,猪STCH... 微粒体应激 70蛋白三磷酸腺苷酶 (STCH)基因属于应激 70蛋白基因伴侣家族 ,在机体免疫反应和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物 ,PCR扩增到猪STCH基因第5外显子 4 4 5bp片段。序列测定显示 ,猪STCH基因与人和小鼠STCH基因分别具有 87 13%和 80 4 5 %的同源性。通过测定和比较中国梅山猪、欧洲约克夏猪及PIC商品猪的STCH基因序列 ,发现在猪STCH基因编码区第 5外显子 10 5 0位点上存在一个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法 (Bi PASA)建立了检测猪STCH基因变异的遗传标记 ,并用该标记分析了STCH基因在中国家猪 (梅山猪、荣昌猪和金华猪 )、欧洲家猪 (约克夏猪、大白猪 )、商品猪 (PIC合成系 )以及欧洲野猪的基因频率和多态性。本研究建立的Bi PASA遗传标记和基因变异信息 ,将为进一步分析猪STCH基因变异与经济性状的相关分析提供基础资料。 展开更多
关键词 STCH基因 bi-pasa 遗传多态性 遗传标记 微粒体应激70蛋白三磷酸腺苷酶 经济性状
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猪TLR2基因Bi-PASA遗传标记的建立及多态性研究 被引量:5
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作者 刘胜贵 魏麟 +3 位作者 史宪伟 张俭 姚元枝 付明 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2007年第1期7-9,共3页
根据人和小鼠TLR2基因序列设计了特异性PCR引物,优化PCR条件后扩增到中国梅山猪、欧洲约克夏猪、PIC-2系及PIC-3系商品猪的TLR2基因690 bp的基因片段,并对其进行序列分析。序列分析结果显示,猪TLR2基因多态性程度低,发现在猪TLR2基因编... 根据人和小鼠TLR2基因序列设计了特异性PCR引物,优化PCR条件后扩增到中国梅山猪、欧洲约克夏猪、PIC-2系及PIC-3系商品猪的TLR2基因690 bp的基因片段,并对其进行序列分析。序列分析结果显示,猪TLR2基因多态性程度低,发现在猪TLR2基因编码区第1 255位点上存在1个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法(B i-PASA)建立了检测猪TLR2基因变异的遗传标记。利用猪TLR2基因的B i-PASA标记,分析了TLR2基因在大河乌猪、撒坝猪和黔邵花猪中的基因频率和多态性。研究建立的B i-PASA遗传标记和基因变异信息,将为进一步分析猪TLR2基因变异与疾病抵抗力及经济性状的相关分析提供基础资料。 展开更多
关键词 TLR2 Bi—PASA 多态性 遗传标记
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Study on Genetic Marker Bi-PASA of Porcine STCH Gene 被引量:1
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作者 Nunu SUN Shuren SI 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2019年第6期6-8,14,共4页
[Objectives] This study was conducted to establish the genetic marker Bi-PASA of STCH gene in Jinfen white pig and New Shanxi black pig. [Methods] The polymorphism of STCH gene was detected in Jinfen white pig and New... [Objectives] This study was conducted to establish the genetic marker Bi-PASA of STCH gene in Jinfen white pig and New Shanxi black pig. [Methods] The polymorphism of STCH gene was detected in Jinfen white pig and New Shanxi black pig by bidirectional PCR amplification of specific alleles. [Results] There were two alleles(A, B) and three genotypes(AA, AB and BB) in Jinfen white pig and New Shanxi black pig. The PopGene32 analysis showed that the polymorphic site of STCH gene in Jinfen white pig accorded with the Hardy-Weinberg equilibrium(P>0.05), while that of new Shanxi black pig did not meet the Hardy-Weinberg equilibrium(P<0.01). The results of chi-square test showed that the polymorphic site of STCH gene was significantly different in genotype distribution between the two pig breeds(P<0.01). [Conclusions] The establishment of the genetic marker Bi-PASA of STCH gene in Jinfen white pig and new Shanxi black pig could provide basic biological data for improving disease resistance of pigs and establishing disease-resistant populations. 展开更多
关键词 STCH Jinfen white pig New Shanxi black pig bi-pasa POLYMORPHISM
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两个山西地方猪种TLR2基因Bi-PASA遗传标记的多态性研究
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作者 孙奴奴 蔡凯玲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第4期64-66,共3页
为分析晋汾白猪和新山西黑猪TLR2基因第1 255位点编码区的变异信息,试验利用双向特定等位基因PCR扩增法(Bi-PASA)建立TLR2基因变异的遗传标记。结果表明:晋汾白猪和新山西黑猪分别检测到A、B一对等位基因和AA、AB、BB三种基因型,晋汾白... 为分析晋汾白猪和新山西黑猪TLR2基因第1 255位点编码区的变异信息,试验利用双向特定等位基因PCR扩增法(Bi-PASA)建立TLR2基因变异的遗传标记。结果表明:晋汾白猪和新山西黑猪分别检测到A、B一对等位基因和AA、AB、BB三种基因型,晋汾白猪的等位基因频率(A、B)分别为0.609 2和0.390 8,在TLR2基因第1 255位点不符合Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01);新山西黑猪等位基因频率(A、B)分别为0.682 7和0.317 3, TLR2基因第1 255位点符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);晋汾白猪和新山西黑猪的纯合度分别为0.747 1,0.480 8,香农指数分别为0.669 1,0.624 8;晋汾白猪和新山西黑猪在TLR2基因的多态位点的基因型分布差异极显著(P<0.01)。说明成功建立晋汾白猪和新山西黑猪TLR2基因Bi-PASA遗传标记,可为进一步研究疾病抵抗力、建立抗病群体提供基础资料。 展开更多
关键词 TLR2基因 bi-pasa 晋汾白猪 新山西黑猪 多态性
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瓢鸡3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)的Bi-PASA分子标记与沙门菌易感性的相关性研究 被引量:1
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作者 黄梦阳 李杨 +5 位作者 张林云 陈多珍 富国文 杨向东 罗袁山 史宪伟 《中国家禽》 北大核心 2019年第19期10-15,共6页
研究以3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)为鸡沙门菌易感性候选基因,以瓢鸡成年鸡沙门菌阳性群体与阴性对照群体为研究对象,采用序列测定和双向PCR扩增特异等位基因标记(Bi-PASA)技术,分析了3个防御素基因变异与沙门菌易感性的相关... 研究以3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)为鸡沙门菌易感性候选基因,以瓢鸡成年鸡沙门菌阳性群体与阴性对照群体为研究对象,采用序列测定和双向PCR扩增特异等位基因标记(Bi-PASA)技术,分析了3个防御素基因变异与沙门菌易感性的相关性。结果显示:在瓢鸡每个防御素基因编码区均检测到一个引起氨基酸变异的多态位点,分别建立了3个防御素基因的Bi-PASA分子标记;AvBD5基因A799G位点与瓢鸡沙门菌易感性的相关性达到极显著水平(P=0.0039),AvBD14基因的A2096T位点达到显著水平(P=0.017),而AvBD4相关性不显著(P=0.599);根据比值比(OR)与95%CI确定了每个防御素基因的保护基因型与易感基因型。研究结果对阐明防御素基因与沙门菌易感性的关系以及建立沙门菌抵抗力鸡群具有重要意义。 展开更多
关键词 瓢鸡 沙门菌 防御素基因 双向特异等位基因PCR扩增 相关性
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梅山猪ob基因多态性与繁殖性状的相关性研究 被引量:7
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作者 刘桂琼 姜勋平 丁家桐 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2002年第4期15-16,共2页
本文利用Bi-PASA方法研究了梅山猪ob基因的 3714位点多态性与繁殖性能的相关。ob基因经Bi-PASA扩增以后出现 3个条带 ,表现为 3种基因型 (AA型、AB型和BB型 ) ,两个等位基因A和B。经方差分析检验 ,AA型母猪的产仔数显著低于AB型和BB型... 本文利用Bi-PASA方法研究了梅山猪ob基因的 3714位点多态性与繁殖性能的相关。ob基因经Bi-PASA扩增以后出现 3个条带 ,表现为 3种基因型 (AA型、AB型和BB型 ) ,两个等位基因A和B。经方差分析检验 ,AA型母猪的产仔数显著低于AB型和BB型个体的产仔数 (P <0 .0 5 ,10 .4头与 11.7和 11.6头 )。而AA型仔猪生后生长速度显著高于AB型和BB型 (P <0 .0 5 ,4 .5 5 3kg与 4 .0 4 4t4 .0 4 3,2 0日龄 ;7.6 2 1kg与 6 .6 0 4和 6 .6kg ,35日龄 ) ,试验猪群ob基因处于平衡状态 。 展开更多
关键词 多态性 繁殖性状 相关性 梅山猪 肥胖基因 瘦蛋白 bi-pasa
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猪OB基因不同基因型与胴体性状关系的研究 被引量:2
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作者 掌子凯 《动物科学与动物医学》 2002年第2期6-10,共5页
猪可划分为三种不同的经济类型 ,即脂肪型、兼用型和瘦肉型。自 2 0世纪 4 0年代动物数量遗传学和现代家畜营养学问世以来 ,猪的遗传育种研究发展到一个新的阶段。猪的育种方向经历了由脂肪型向兼用型以及向瘦肉型的演变过程 ,其研究手... 猪可划分为三种不同的经济类型 ,即脂肪型、兼用型和瘦肉型。自 2 0世纪 4 0年代动物数量遗传学和现代家畜营养学问世以来 ,猪的遗传育种研究发展到一个新的阶段。猪的育种方向经历了由脂肪型向兼用型以及向瘦肉型的演变过程 ,其研究手段也从以动物生产性能表型剖析为基础的传统育种方法向以直接对基因型进行选择的现代分子生物学技术转变。近年来 ,国外通过大量的研究 ,已经发现人和小鼠的 OB基因与其脂肪蓄积有关 ,OB基因及其表达产物 -“瘦蛋白”(leptin)可以降低采食量、加快代谢速度和减少脂肪。本文采用 Bi- PASA(Bidirectional of SpecificAlleles双向 PCR扩增特殊等位基因 )新技术 ,对 8头长× (大二 )和杜× (长大 )猪的瘦蛋白基因(OB基因 )的不同基因型与胴体性状的关系进行了多态性研究。检测到 3种带型 ,2个等位基因和2种基因型。通过多态性分析、t检验和方差分析等 ,分析、检测了各基因型间的不同胴体性状的差异 ,发现长大二中的 14 5号、杜长大中的 312号 OB基因为 G/G型 (突变纯合子 ) ,肌内脂肪含量在杂交组合中最高 ,表明 OB基因的突变纯合子 G/G型可能与猪的脂肪沉积有关 ,显示 展开更多
关键词 OB基因 胴体性状 bi-pasa
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二花脸猪obese基因3714位点多态性与产仔性状的相关性 被引量:5
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作者 孙梅 陈杰 +2 位作者 赵茹茜 韦习会 刘红林 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期71-73,共3页
利用Bi PASA技术检测了二花脸猪OB基因的多态性 ,并且分析了其与母猪产仔性能的相关性。结果显示 ,OB基因在第 371 4碱基处存在G/T替换 ,经Bi PASA检测后分别定义为等位基因G和T。在二花脸母猪群中 ,等位基因G和T的频率分别为 0 339和 ... 利用Bi PASA技术检测了二花脸猪OB基因的多态性 ,并且分析了其与母猪产仔性能的相关性。结果显示 ,OB基因在第 371 4碱基处存在G/T替换 ,经Bi PASA检测后分别定义为等位基因G和T。在二花脸母猪群中 ,等位基因G和T的频率分别为 0 339和 0 6 6 1。方差分析发现 ,G/G基因型个体的头胎产仔数以及平均产仔数略低于G/T型和T/T型个体 ,但相互之间无显著差异 ;在最高产仔数性状上 ,G/G型个体显著低于G/T型和T/T型个体 (P <0 0 5 )。 展开更多
关键词 二花脸猪 obese基因 多态性 产仔性状 相关性 肥胖
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几种常规实验室适用的单核苷酸多态性检测方法原理与应用 被引量:5
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作者 王威 仇玉兰 +1 位作者 孙品 夏昭林 《职业卫生与应急救援》 2006年第4期177-179,共3页
该文讨论了适用于常规实验室的一些单核苷酸多态性(SNP)检测方法,比较了不同方法在SNP检测中的优缺点,并介绍了一些新的方法。
关键词 单核苷酸多态性 PCR—RFLP PCR—SSCPI ARMS Bi—PASA 多重PCR
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双向等位基因特异性PCR与限制性片段长度多态性基因分型方法比较
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作者 黄嫄 兰雅娴 +3 位作者 赵雅 王林 王晓春 马虹 《现代生物医学进展》 CAS 2017年第28期5436-5440,共5页
目的:比较双向等位基因特异性PCR(Bi-PASA)法与聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(RFLP)法对EZH2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs887569基因分型结果有无差异,并用Bi-PASA法对EZH2基因rs17171119位点基因分型后分析与结直肠癌(CRC)... 目的:比较双向等位基因特异性PCR(Bi-PASA)法与聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(RFLP)法对EZH2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs887569基因分型结果有无差异,并用Bi-PASA法对EZH2基因rs17171119位点基因分型后分析与结直肠癌(CRC)易感性的相关性。方法:提取96名CRC患者与100名体检健康者的外周血DNA,分别用Bi-PASA法与聚合PCR-RFLP法检测EZH2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs887569基因型,对两种分型结果进行比较;使用Bi-PASA法对EZH2基因rs17171119位点进行基因分型后用病例-对照方法分析该SNPs在中国人群中的分布。结果:Bi-PASA与PCR-RFLP对EZH2基因rs887569位点基因分型的准确率分别为99.5%和100%;EZH2基因的rs17171119 SNPs位点多态性与结直肠癌易感性无显著相关性(P=0.938,OR=0.846,95%CI:0.586-1.221)。结论:Bi-PASA是一种简单有效检测SNPs的方法,分型结果较为可靠;rs17171119 SNPs位点多态性与结直肠癌易感性无关,但本结论还有待更大样本量基因分型的验证。 展开更多
关键词 结直肠癌 EZH2 单核苷酸多态性 Bi—PASA PCR—RFLP
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