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High-throughput sequencing of highbush blueberry transcriptome and analysis of basic helix-loop-helix transcription factors 被引量:8
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作者 SONG Yang LIU Hong-di +5 位作者 ZHOU Qiang ZHANG Hong-jun ZHANG Zhi-dong LI Ya-dong WANG Hai-bo LIU Feng-zhi 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2017年第3期591-604,共14页
The highbush blueberry(Vaccinium corymbosum),Duke,was used to construct a de novo transcriptome sequence library and to perform data statistical analysis.Mega 4,CLC Sequence Viewer 6 software,and quantitative PCR we... The highbush blueberry(Vaccinium corymbosum),Duke,was used to construct a de novo transcriptome sequence library and to perform data statistical analysis.Mega 4,CLC Sequence Viewer 6 software,and quantitative PCR were employed for bioinformatics and expression analyses of the basic helix-loop-helix(BHLH)transcription factors of the sequencing library.The results showed that 28.38 gigabytes of valid data were obtained from transcriptome sequencing and were assembled into 108 033 unigenes.Functional annotation showed that 32 244 unigenes were annotated into Clusters of Orthologous Groups(COG)and Gene Ontology(GO)databases,whereas the rest of the 75 789 unigenes had no matching information.By using COG and GO classification tools,sequences with annotation information were divided into 25 and 52 categories,respectively,which involved transport and metabolism,transcriptional regulation,and signal transduction.Analysis of the transcriptome library identified a total of 59 BHLH genes.Sequence analysis revealed that 55 genes of that contained a complete BHLH domain.Furthermore,phylogenetic analysis showed that BHLH genes of blueberry(Duke)could be divided into 13 sub-groups.PCR results showed that 45 genes were expressed at various developmental stages of buds,stems,leaves,flowers,and fruits,suggesting that the function of BHLH was associated with the development of different tissues and organs of blueberry,Duke.The present study would provided a foundation for further investigations on the classification and functions of the blueberry BHLH family. 展开更多
关键词 BLUEBERRY BIOINFORMATICS transcdptome sequencing basic helix-loop-helix transcription factor
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ON INVERSES AND ALGEBRAIC LOOPS OF CO-H-SPACES
2
作者 Dae-Woong LEE 《Acta Mathematica Scientia》 SCIE CSCD 2014年第4期1193-1211,共19页
In this paper we study the properties of homotopy inverses of comultiplications and Mgebraic loops of co-H-spaces based on a wedge of spheres. We also investigate a method to construct new comultiplications out of old... In this paper we study the properties of homotopy inverses of comultiplications and Mgebraic loops of co-H-spaces based on a wedge of spheres. We also investigate a method to construct new comultiplications out of old ones by using a group action. We are primarily interested in the algebraic loops which have inversive, power-associative and Moufang properties for some comultiplications. 展开更多
关键词 INVERSES co-H-spaces comultiplications basic (Whitehead) product Hopf- Hilton invariants algebraic loops inversivity power-associativity Moufang property
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樟树bHLH基因家族鉴定及其在两个化学型中的表达分析
3
作者 周生财 林仕雄 +3 位作者 宋敏燕 胡现铬 童再康 张俊红 《分子植物育种》 北大核心 2025年第9期2948-2959,共12页
植物碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)作为植物第二大类转录因子,广泛参与其生长发育、次生代谢合成调控等。本研究旨在全基因组范围内鉴定樟树(Cinnamomum camphora)bHLH转录因子,并研究其在两个化学型中的表达模式。本... 植物碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)作为植物第二大类转录因子,广泛参与其生长发育、次生代谢合成调控等。本研究旨在全基因组范围内鉴定樟树(Cinnamomum camphora)bHLH转录因子,并研究其在两个化学型中的表达模式。本研究在全基因组范围内鉴定樟树bHLH家族成员,运用生物信息学分析其蛋白质理化性质、保守基序(motif)和系统进化等,基于樟树两个化学型(脑樟和芳樟)转录组数据分析bHLH成员的表达模式,并运用RT-qPCR进行验证。在樟树中鉴定出148个bHLH成员,大部分bHLH蛋白质分子富含酸性氨基酸且为亲水蛋白质;可分为24个亚家族,保守基序中motif 1和motif 2出现频率最高;转录组数据表明,27个bHLH基因在脑樟叶片中显著上调表达,分布于13个樟树bHLH亚家族,并用定量PCR验证了6个bHLH成员在两个化学型中的表达模式。本研究结果为进一步揭示樟树bHLH转录因子调控萜类物质的合成提供了参考依据。 展开更多
关键词 樟树 bHLH基因家族 萜类物质 化学型
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向日葵bHLH转录因子家族的鉴定及逆境应答基因筛选
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作者 高宇 付畅 《分子植物育种》 北大核心 2025年第8期2474-2489,共16页
向日葵(Helianthus annuus L.)对盐碱有较强的耐性,是世界上重要的经济作物,碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子是参与真核生物生长发育以及逆境应答的重要调控因子。本研究利用生物信息学方法对向日葵中bHLH转录... 向日葵(Helianthus annuus L.)对盐碱有较强的耐性,是世界上重要的经济作物,碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子是参与真核生物生长发育以及逆境应答的重要调控因子。本研究利用生物信息学方法对向日葵中bHLH转录因子家族进行了全基因组鉴定与分析,共鉴定出139个HabHLH基因,系统分析了向日葵中bHLH转录因子家族成员的分类、基本理化性质、进化关系、基因结构、染色体定位、保守基序、启动子元件、蛋白质互作、基因共线性及表达模式,筛选了逆境应答HabHLHs基因。促进了对向日葵中bHLH家族基因的多样性和进化上的认识,为探索向日葵bHLH转录因子家族成员的功能和在抗逆分子育种中的应用提供了重要的参考信息。 展开更多
关键词 向日葵 碱性螺旋-环-螺旋转录因子 鉴定 抗逆 筛选
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bHLH47对番茄果实茉莉酸合成的调控机制
5
作者 师瑞茜 常枭荣 +2 位作者 余金兰 孙丹丹 路来风 《食品科学技术学报》 北大核心 2025年第4期128-137,共10页
作为植物抵御灰霉菌等腐生性致病菌的主要调控物质之一,茉莉酸在番茄果实成熟过程中的变化规律及其调控机制尚不清楚。因此,采用酶联免疫吸附实验测定不同成熟期番茄果实表皮组织中的茉莉酸含量,结合实时荧光定量PCR分析茉莉酸关键合成... 作为植物抵御灰霉菌等腐生性致病菌的主要调控物质之一,茉莉酸在番茄果实成熟过程中的变化规律及其调控机制尚不清楚。因此,采用酶联免疫吸附实验测定不同成熟期番茄果实表皮组织中的茉莉酸含量,结合实时荧光定量PCR分析茉莉酸关键合成基因13-脂氧化酶(LOXD)、12-氧-植物二烯酸还原酶3(OPR3)和丙二烯氧化物合酶(AOS)等的表达量。以成熟与抗病双响应转录因子碱性螺旋-环-螺旋蛋白编码基因47(bHLH47)作为研究对象,通过病毒诱导的基因沉默技术研究bHLH47对番茄果实茉莉酸合成的调控作用。结果表明,绿熟期番茄果实中的茉莉酸浓度最高,为1.63 nmol/L;而红熟期果实中的茉莉酸浓度最低,为1.28 nmol/L。与小果期果实相比,红熟期果实中OPR3基因表达显著下调,降低了89.38%,表明茉莉酸合成受番茄果实成熟度的影响。在bHLH47基因沉默的番茄果实中,茉莉酸浓度增加了24.44%,OPR3基因的表达量相比对照组提高了2.3倍,12-氧-植物二烯酸还原酶(OPR)浓度增加了10.61%。研究表明,转录因子bHLH47通过负调控OPR3基因的表达来调控茉莉酸的合成,从而影响成熟过程中番茄果实对灰霉菌的抵抗能力。研究旨在阐明番茄果实成熟过程中灰霉菌易感性增加的茉莉合成的调控机制,为番茄采后腐烂损失控制提供理论参考。 展开更多
关键词 茉莉酸 碱性螺旋-环-螺旋蛋白编码基因47 病毒诱导的基因沉默 番茄 转录调控
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血清AEP、CTRP4、BHLHE40与2型糖尿病患者糖脂代谢及颈动脉粥样硬化的关系
6
作者 胡艳艳 雷庆华 +4 位作者 王闪闪 王志娟 李军华 马晓云 李霞 《检验医学与临床》 2025年第16期2171-2176,共6页
目的分析2型糖尿病(T2DM)患者血清天冬酰胺内肽酶(AEP)、补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4(CTRP4)、碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)与糖脂代谢及颈动脉粥样硬化(CAS)的关系。方法选择2022年2月至2023年12月于该院门诊就诊的T2DM患者... 目的分析2型糖尿病(T2DM)患者血清天冬酰胺内肽酶(AEP)、补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4(CTRP4)、碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)与糖脂代谢及颈动脉粥样硬化(CAS)的关系。方法选择2022年2月至2023年12月于该院门诊就诊的T2DM患者210例作为T2DM组,另外选取同期在该院体检的体检健康者100例作为对照组。根据有无CAS将T2DM患者分为单纯T2DM组和CAS组。检测所有研究对象血清AEP、CTRP4、BHLHE40及糖脂代谢指标水平。采用Pearson相关分析T2DM患者血清AEP、CTRP4、BHLHE40水平与糖脂代谢指标的相关性;采用多因素Logistic回归分析T2DM患者发生CAS的影响因素。结果T2DM组的空腹血糖(FPG)、糖化血红蛋白(HbA1c)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)及血清AEP、BHLHE40水平均高于对照组(P<0.05),CTRP4水平低于对照组(P<0.05)。T2DM患者血清AEP、BHLHE40水平与FPG、HbA1c、TG、LDL-C水平及HOMA-IR均呈正相关(P<0.05),CTRP4水平与FPG、HbA1c、TG、LDL-C水平及HOMA-IR均呈负相关(P<0.05)。210例T2DM患者中发生CAS 138例(CAS组),单纯T2DM组72例。CAS组年龄、糖尿病病程、收缩压、HbA1c、LDL-C及血清AEP、BHLHE40水平均高于单纯T2DM组(P<0.05),CTRP4水平则低于单纯T2DM组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,LDL-C、AEP、BHLHE40水平升高均是T2DM患者发生CAS的危险因素(P<0.05),CTRP4水平升高是T2DM患者发生CAS的保护因素(P<0.05)。结论T2DM患者血清AEP、BHLHE40水平升高,CTRP4水平降低,三者与T2DM患者的糖脂代谢关系密切,且是T2DM患者发生CAS的影响因素。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖脂代谢 胰岛素抵抗 颈动脉粥样硬化 天冬酰胺内肽酶 补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4 碱性螺旋-环-螺旋转录因子40
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基本螺旋-环-螺旋家族成员E40在免疫细胞中的研究进展
7
作者 罗镇颉 张登容 +3 位作者 刘春瑶 高玲 龙仙萍 汪松 《中国免疫学杂志》 北大核心 2025年第6期1512-1516,共5页
免疫细胞由骨髓里的造血干细胞增殖分化形成,包括淋巴细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等,它们参与了机体的免疫防御、免疫稳定和免疫监视,是免疫系统不可或缺的基本成分。基本螺旋-环-螺旋家族成员E40(basic helix-loop-helix E40,BHLHE40)... 免疫细胞由骨髓里的造血干细胞增殖分化形成,包括淋巴细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等,它们参与了机体的免疫防御、免疫稳定和免疫监视,是免疫系统不可或缺的基本成分。基本螺旋-环-螺旋家族成员E40(basic helix-loop-helix E40,BHLHE40)已被证实在脂肪生成、肿瘤发生、昼夜节律和缺氧反应等过程中发挥重要作用。近年研究发现,BHLHE40在免疫细胞活化、细胞周期、自我更新和细胞因子产生等方面也扮演着重要角色。本文将对BHLHE40在各个时期的发现、命名、结构和作用机制,以及在免疫细胞中的研究进展等进行综述,以期在基因层面为免疫相关性疾病的治疗提供新靶点。 展开更多
关键词 基本螺旋-环-螺旋家族成员E40 免疫细胞活化 细胞周期 自我更新 细胞因子
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计算机基础课程“四位一体”教学模式改革与实践 被引量:2
8
作者 唐贤芳 仲崇丽 段林 《办公自动化》 2025年第6期28-30,共3页
针对计算机基础课程实践过程中面临的问题,基于OBE理念,秉承“德育为先、学生中心、持续优化”的教育思想,坚持能力素质为导向,提出“四位一体”教学闭环模式的改革与创新。聚焦四位,从教学内容、实践活动,延拓学习及赛教融合等多角度... 针对计算机基础课程实践过程中面临的问题,基于OBE理念,秉承“德育为先、学生中心、持续优化”的教育思想,坚持能力素质为导向,提出“四位一体”教学闭环模式的改革与创新。聚焦四位,从教学内容、实践活动,延拓学习及赛教融合等多角度进行改革,不断持续改进和优化,培养出学生利用计算机分析和解决问题的综合能力和素养,实现知识传授、能力培养与价值塑造的人才培养目标,为计算机类相关课程的改革提供有益借鉴。 展开更多
关键词 计算机基础课程 四位一体 教学闭环
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bHLH转录因子调控植物活性成分生物合成的研究进展 被引量:24
9
作者 张鑫 宋经元 +5 位作者 胡鸢雷 徐江 徐志超 季爱加 罗红梅 陈士林 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期435-442,共8页
转录因子是在转录水平上调控基因表达的关键因素之一,在植物生长发育、活性成分合成和环境变化响应中起着重要作用。本文对植物中bHLH转录因子的结构和分类进行了概述,并详细阐述了bHLH转录因子调控植物中类黄酮、生物碱、萜类等活性成... 转录因子是在转录水平上调控基因表达的关键因素之一,在植物生长发育、活性成分合成和环境变化响应中起着重要作用。本文对植物中bHLH转录因子的结构和分类进行了概述,并详细阐述了bHLH转录因子调控植物中类黄酮、生物碱、萜类等活性成分生物合成的研究进展,探索利用bHLH转录因子提高药用植物有效物质的生物学基础。文章强调模式植物的参考作用,突出现代基因组学、转录组学、代谢组学和生物信息学等多学科理论的交叉与融合对bHLH转录因子发掘和准确功能鉴定的促进作用。加速研究bHLH转录因子调控活性成分生物合成机制,对促进中药材育种和品种改良技术的发展,缓解国内外中草药资源枯竭的境况具有重要意义。 展开更多
关键词 BHLH 转录因子 活性成分 药用植物
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含复铰平面运动链型综合中消极子链的识别方法 被引量:7
10
作者 宋黎 黄勇 杨坚 《机械设计》 CSCD 北大核心 2004年第2期46-48,共3页
提出了在运动链中识别消极子链的生成树 -基本回路法。通过能够反映复铰和多副杆等结构特点的构件邻接矩阵 ,得到运动链的广度优先生成树。由生成树的弦将运动链分解成为数目确定的基本回路。利用基本回路或基本回路的并所形成子链的活... 提出了在运动链中识别消极子链的生成树 -基本回路法。通过能够反映复铰和多副杆等结构特点的构件邻接矩阵 ,得到运动链的广度优先生成树。由生成树的弦将运动链分解成为数目确定的基本回路。利用基本回路或基本回路的并所形成子链的活动度识别消极子链。研究表明 ,该方法适用于无复铰和含复铰平面运动链 ,并且具有运动链分解形式选择唯一、简单。 展开更多
关键词 消极子链 含复铰平面运动链 邻接矩阵 生成树 基本回路法
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水稻bHLH基因家族成员表达模式分析 被引量:9
11
作者 李晓星 蒋海雄 +4 位作者 黄青云 夏令 张红心 张大兵 陈亮 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第B05期73-77,共5页
为了研究碱性-螺旋-环-螺旋(basic-helix-loop-helix,bHLH)转录因子的生物学功能,通过对开源数据库TIGR中水稻基因序列的预测,我们找到了水稻中的部分bHLH转录因子家族成员.用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法在水稻根、茎、叶、花... 为了研究碱性-螺旋-环-螺旋(basic-helix-loop-helix,bHLH)转录因子的生物学功能,通过对开源数据库TIGR中水稻基因序列的预测,我们找到了水稻中的部分bHLH转录因子家族成员.用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)的方法在水稻根、茎、叶、花和种子中,对这些成员的表达模式进行分析,然后与已有的拟南芥的表达信息进行比较.结果显示,部分序列相似度较高的bHLH基因,表达模式也较为相似,说明其在功能上可能存在联系. 展开更多
关键词 水稻 拟南芥 碱性-螺旋-环-螺旋转录因子家族 表达分析
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全铰链平面连杆机构运动综合的结构类型优选方法 被引量:10
12
作者 宋黎 范崇辉 《机械工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第3期132-137,共6页
提出全铰链平面连杆机构运动综合的结构类型优选的基本方法。建立全铰链平面连杆机构运动方程计算机自动生成的规格化方法。根据含复铰平面运动链的构件邻接矩阵,获得其广度优先生成树,进而确定基本回路,由此利用计算机自动生成机构的... 提出全铰链平面连杆机构运动综合的结构类型优选的基本方法。建立全铰链平面连杆机构运动方程计算机自动生成的规格化方法。根据含复铰平面运动链的构件邻接矩阵,获得其广度优先生成树,进而确定基本回路,由此利用计算机自动生成机构的位置、角速度和角加速度方程,从而在计算机构学的意义上将运动链的拓扑结构关系与机构运动分析联系了起来。在此基础上提出计算机自动生成邻接构件之间的三角形约束条件的规格化方法,并给出结构类型优选的基本思想和基本算法。 展开更多
关键词 全铰链平面连杆机构 运动综合 结构类型优选 邻接矩阵 基本回路
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纬编针织物基本组织的计算机三维模拟 被引量:14
13
作者 瞿畅 王君泽 李波 《纺织学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第11期136-140,共5页
针对当前针织物模拟技术存在的缺陷及不足,探索计算机模拟纬编针织物的新方法。在Visual Basic环境下,以Pierce模型为基础,采用圆形截面,由三次B样条曲线模拟纱线路径,利用虚拟现实建模语言(VRML)实现纬编针织物线圈及基本组织的计算机... 针对当前针织物模拟技术存在的缺陷及不足,探索计算机模拟纬编针织物的新方法。在Visual Basic环境下,以Pierce模型为基础,采用圆形截面,由三次B样条曲线模拟纱线路径,利用虚拟现实建模语言(VRML)实现纬编针织物线圈及基本组织的计算机三维模拟。模拟结果很好地表现了针织组织在空间的串套关系以及整体效果,可通过网络浏览器直接进行浏览;模拟图像便于网络发布,并可动态对其进行任意的平移、缩放、旋转等操作。 展开更多
关键词 纬编针织物 基本组织 线圈模型 三维模拟 虚拟现实建模语言
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家蚕bHLH转录因子Bmsage可溶性表达、纯化与结构分析 被引量:3
14
作者 何华伟 位曙光 +5 位作者 王叶菁 刘莉娜 李珍珍 赵朋 常怀普 赵萍 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1395-1407,共13页
碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,... 碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,然而当前对其性质和结构了解不多。为研究其性质、结构和生物学功能,构建了NusA、MBP、SUMO、Trx和His融合标签的Bmsage重组原核表达载体,通过改变诱导温度和IPTG浓度,确定了Bmsage在大肠杆菌中可溶性表达的最佳载体和表达条件,进而通过镍柱亲和层析纯化获得了Bmsage,利用圆二色光谱研究了其二级结构。结果表明,NusA与MBP标签可显著增强Bmsage在大肠杆菌中的可溶性表达,但难以与Bmsage分离。SUMO标签有一定的助溶效果,并且能够与Bmsage有效分离。其他标签对Bmsage可溶性表达的效果不明显。圆二色光谱分析表明Bmsage含有α-helix结构,推测SUMO标签可能促进了Bmsage折叠形成类天然的结构。这些工作为深入研究Bmsage的性质、结构与功能建立了基础,同时也为其他类似蛋白的表达纯化提供了参考。 展开更多
关键词 碱性螺旋-环-螺旋 Bmsage MBP NUSA SUMO 纯化
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绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:15
15
作者 陈红霖 胡亮亮 +2 位作者 王丽侠 王素华 程须珍 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1159-1167,共9页
bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组... bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。结果表明,bHLH转录因子理化性质差异较大;含有2个保守结构域,分别位于N端的碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区,碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件;bHLH基因在11条染色体上分布不均匀,5号、7号和8号染色体上分布较多,1号、4号和10号染色体上分布较少,大部分基因含有1~9个不等的内含子,在染色体上成簇状分布;122个bHLH转录因子可分为11个亚家族。多数bHLH基因在绿豆根、茎、叶、花和种子等组织中均有表达,但具有组织表达特异性,且不同基因表达量差异较大。本研究为进一步研究绿豆bHLH转录因子家族的生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 绿豆 BHLH 转录因子 生物信息学分析
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环状给水管网拓扑关系的自动搜索 被引量:2
16
作者 杨伟伟 沈时兴 黄健 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1565-1567,共3页
文章研究环状给水管网拓扑关系的自动生成,减少数据输入量,方便给水管网的水力计算。利用Au-toCAD下的Visual LISP开发语言编制程序,实现对给水管网节点和管段的自动编号,进而自动生成邻接矩阵;在此基础上,结合图论的有关知识完成基环... 文章研究环状给水管网拓扑关系的自动生成,减少数据输入量,方便给水管网的水力计算。利用Au-toCAD下的Visual LISP开发语言编制程序,实现对给水管网节点和管段的自动编号,进而自动生成邻接矩阵;在此基础上,结合图论的有关知识完成基环的自动搜索,同时能识别基环的公共管段;通过数据转化,利用邻接矩阵生成管网基本关系矩阵。 展开更多
关键词 给水管网 拓扑关系 基环
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果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析 被引量:6
17
作者 刘洪超 胡澍 涂心明 《重庆医学》 CAS 北大核心 2015年第17期2311-2314,共4页
目的利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能。方法基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析。结果Tap蛋白为不稳定... 目的利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能。方法基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析。结果Tap蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜区和信号肽,在细胞核中发挥生物学效应,具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域。Tap蛋白与来源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致,Tap蛋白与人类和啮齿动物的编码产物高度同源,在系统发生树中距离最近。结论果蝇Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型结构,可能在果蝇胚胎发育早期的神经发生、分化等过程中发挥作用。 展开更多
关键词 Tap蛋白 螺旋-环-螺旋构型 分子结构 计算生物学 果蝇 黑腹
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基于动态循环信息熵的密码函数筛选技术 被引量:3
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作者 李继中 蒋烈辉 +1 位作者 舒辉 常瑞 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2014年第4期1025-1028,1033,共5页
二进制代码中的密码算法识别与筛选对于恶意软件分析、密码算法应用安全性验证有着重要意义。分析了密码函数代码实现中内存数据操作特征和基本块循环结构特征,根据二进制数据的信息熵理论,实验验证了密码算法内存操作数据的高熵值特性... 二进制代码中的密码算法识别与筛选对于恶意软件分析、密码算法应用安全性验证有着重要意义。分析了密码函数代码实现中内存数据操作特征和基本块循环结构特征,根据二进制数据的信息熵理论,实验验证了密码算法内存操作数据的高熵值特性,构建了基于动态循环信息熵的密码函数筛选模型,并采用动静结合的方法重构基本块循环中的动态读写内存数据。测试结果表明了筛选模型的可靠性和准确性。 展开更多
关键词 密码函数 基本块循环 信息熵 动态插桩 内存数据重构
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子宫内膜癌组织Runx3、Twist1表达与临床病理特点及预后的关系 被引量:9
19
作者 王劲红 杜林 +2 位作者 蒋萍 陈英超 姜娟 《山东医药》 CAS 2020年第13期5-8,共4页
目的探讨子宫内膜癌(EC)组织中RUNX家族转录因子3(Runx3)、Twist家族碱性螺旋-环-螺旋转录因子1(Twist1)表达与临床病理参数和预后的关系。方法选择80例EC患者,通过荧光定量PCR法检测子宫内膜癌组织及癌旁组织中Runx3、Twist1表达,比较... 目的探讨子宫内膜癌(EC)组织中RUNX家族转录因子3(Runx3)、Twist家族碱性螺旋-环-螺旋转录因子1(Twist1)表达与临床病理参数和预后的关系。方法选择80例EC患者,通过荧光定量PCR法检测子宫内膜癌组织及癌旁组织中Runx3、Twist1表达,比较两种组织Runx3、Twist1表达量,并对Runx3、Twist1表达与子宫内膜癌患者临床病理学特征之间的关系进行分析,采用Kaplan-Meier法分析不同Runx3、Twist1表达与患者预后生存的关系。结果与癌旁组织相比,EC组织中Runx3表达降低,Twist1表达增高(P均<0.05)。EC组织中Runx3和Twist1表达呈负相关(r=-0.611,P<0.05)。EC组织中Runx3、Twist1表达与肿瘤临床分期、肿瘤分化程度有关(P均<0.05),而与年龄、病理类型、肿瘤大小、肌层浸润深度及淋巴结转移无关(P均>0.05)。低Runx3表达组3年生存率低于高Runx3表达组,高Twist1表达组3年生存率低于低Twist1表达组(P均<0.05)。结论EC中Runx3表达下调,Twist1表达上调,两者表达与肿瘤分期、肿瘤分化程度及预后有关。 展开更多
关键词 子宫内膜肿瘤 RUNX家族转录因子3 Twist家族碱性螺旋-环-螺旋转录因子1 临床特点 预后
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RT-PCR法检测神经源性分化因子mRNA在大鼠脑发育过程中的表达 被引量:2
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作者 郭玮 刘晓艳 +3 位作者 柯荔宁 李玉宇 林凌 徐剑文 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期26-30,共5页
目的观察大鼠不同发育时期脑内神经源性分化因子(NeuroD)mRNA表达量的变化,探讨其对神经细胞的分化和成熟发挥的作用。方法提取不同发育阶段大鼠不同脑组织中的mRNA,RT-PCR法反转录扩增NeuroD和β-actin,利用凝胶成像系统检测其相对表... 目的观察大鼠不同发育时期脑内神经源性分化因子(NeuroD)mRNA表达量的变化,探讨其对神经细胞的分化和成熟发挥的作用。方法提取不同发育阶段大鼠不同脑组织中的mRNA,RT-PCR法反转录扩增NeuroD和β-actin,利用凝胶成像系统检测其相对表达量。结果 NeuroD在受孕7.5d(E7.5)时出现表达,在E10.5和E21.5时分别达到两次高峰,平均吸光度值为20437.88±598.28和14482.23±1134.49,表达水平显著高于其他各组(P<0.01),NeuroD/β-actin比值在E12.5、E18.5和E21.5分别为1.59±0.09、1.61±0.07和1.70±0.11,显著高于其他时间段(P<0.01)。结论在大鼠脑发育过程中,NeuroD mRNA的表达呈明显时间特异性,在E10.5左右大鼠各原始脑泡的形成过程中,NeuroD mRNA明显增高;在胚胎发育的晚期,脑组织形态进一步完善和成熟的过程中NeuroD达到第二次表达高峰,与鼠脑的发育过程相符。推测NeuroD对鼠脑的早期神经细胞分化以及晚期细胞的成熟均起一定作用。 展开更多
关键词 神经源性分化因子 碱性螺旋-环-螺旋 神经发育 神经分化 反转录-聚合酶链反应 大鼠
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