为了解新疆喀什地区鸽A群轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行情况和遗传进化特征,使用实时荧光RT-PCR方法,对2024年从新疆喀什地区9个鸽场采集的165份鸽拭子样品进行RVA核酸检测,选取8份代表性阳性样品,针对RVA的2个中和基因VP7和VP...为了解新疆喀什地区鸽A群轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行情况和遗传进化特征,使用实时荧光RT-PCR方法,对2024年从新疆喀什地区9个鸽场采集的165份鸽拭子样品进行RVA核酸检测,选取8份代表性阳性样品,针对RVA的2个中和基因VP7和VP4进行RT-PCR扩增及序列测定,并进行核苷酸同源性和遗传进化分析。结果显示:在165份鸽拭子样品中共检测出16份RVA阳性样品,个体阳性率为9.70%(16/165),阳性样品分布在8个鸽场;对代表性阳性样品进行VP7和VP4基因遗传进化分析发现,8份样品均属于G18P[17]基因型,其中VP7核苷酸同源性为85.2%~99.9%,与18株参考毒株的同源性为58.3%~98.7%,VP4核苷酸同源性为89.5%~99.7%,与18株参考毒株的同源性为52.8%~95.8%。阳性代表样品XJ-92、XJ-63、XJ-110、XJ-01均与美国鸽源毒株WVL21015-FL具有较高的亲缘性,推测可能来自同一次暴发或同一来源;XJ-71与其他阳性代表样品的亲缘性较远,同源性为89.5%~91.4%,与澳大利亚毒株VIC亲缘性最近,同源性为88.6%。结果表明:新疆喀什地区鸽群RVA感染严重,污染面较广,G18P[17]为优势流行基因型;新疆鸽群中流行的RVA属于同一进化分支或来自同一传染源,其在传播过程中可能发生了基因突变或基因组重配。建议持续强化RVA监测,加强养鸽场饲养管理,加快鸽RVA疫苗研发进程,以控制鸽RVA的流行与传播。展开更多
文摘为了解新疆喀什地区鸽A群轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行情况和遗传进化特征,使用实时荧光RT-PCR方法,对2024年从新疆喀什地区9个鸽场采集的165份鸽拭子样品进行RVA核酸检测,选取8份代表性阳性样品,针对RVA的2个中和基因VP7和VP4进行RT-PCR扩增及序列测定,并进行核苷酸同源性和遗传进化分析。结果显示:在165份鸽拭子样品中共检测出16份RVA阳性样品,个体阳性率为9.70%(16/165),阳性样品分布在8个鸽场;对代表性阳性样品进行VP7和VP4基因遗传进化分析发现,8份样品均属于G18P[17]基因型,其中VP7核苷酸同源性为85.2%~99.9%,与18株参考毒株的同源性为58.3%~98.7%,VP4核苷酸同源性为89.5%~99.7%,与18株参考毒株的同源性为52.8%~95.8%。阳性代表样品XJ-92、XJ-63、XJ-110、XJ-01均与美国鸽源毒株WVL21015-FL具有较高的亲缘性,推测可能来自同一次暴发或同一来源;XJ-71与其他阳性代表样品的亲缘性较远,同源性为89.5%~91.4%,与澳大利亚毒株VIC亲缘性最近,同源性为88.6%。结果表明:新疆喀什地区鸽群RVA感染严重,污染面较广,G18P[17]为优势流行基因型;新疆鸽群中流行的RVA属于同一进化分支或来自同一传染源,其在传播过程中可能发生了基因突变或基因组重配。建议持续强化RVA监测,加强养鸽场饲养管理,加快鸽RVA疫苗研发进程,以控制鸽RVA的流行与传播。
