本研究使用Illumina Hi Seq平台通过转录组测序对蕨菜可食用期的茎(NJ)和蜷缩叶(JY)以及不可食用期的老茎(LJ)和老叶(LY)样本进行序列分析,获得了26.56 Gb数据,76427个unigene,序列平均长度为1013 bp,其中42177(55.19%)个unigene在Nr、N...本研究使用Illumina Hi Seq平台通过转录组测序对蕨菜可食用期的茎(NJ)和蜷缩叶(JY)以及不可食用期的老茎(LJ)和老叶(LY)样本进行序列分析,获得了26.56 Gb数据,76427个unigene,序列平均长度为1013 bp,其中42177(55.19%)个unigene在Nr、Nt、Swiss-Prot、KEGG、KOG、InterPro和GO数据库获得注释信息。重点分析了蕨菜中与萜类生物合成相关途径unigene133个,主要参与萜类骨架生物合成、单萜化合物生物合成、倍半萜化合物生物合成、二萜和四萜化合物生物合成。其中,NJ与JY比对,差异显著表达基因47个,NJ与LJ比对,差异显著表达基因35个,NJ与LY比对,差异显著表达基因43个。这些基因为进一步深入挖掘蕨菜功能基因、研究萜类化合物等天然活性成分和天然毒素等生物合成与代谢调控分子机制提供依据。展开更多
文摘本研究使用Illumina Hi Seq平台通过转录组测序对蕨菜可食用期的茎(NJ)和蜷缩叶(JY)以及不可食用期的老茎(LJ)和老叶(LY)样本进行序列分析,获得了26.56 Gb数据,76427个unigene,序列平均长度为1013 bp,其中42177(55.19%)个unigene在Nr、Nt、Swiss-Prot、KEGG、KOG、InterPro和GO数据库获得注释信息。重点分析了蕨菜中与萜类生物合成相关途径unigene133个,主要参与萜类骨架生物合成、单萜化合物生物合成、倍半萜化合物生物合成、二萜和四萜化合物生物合成。其中,NJ与JY比对,差异显著表达基因47个,NJ与LJ比对,差异显著表达基因35个,NJ与LY比对,差异显著表达基因43个。这些基因为进一步深入挖掘蕨菜功能基因、研究萜类化合物等天然活性成分和天然毒素等生物合成与代谢调控分子机制提供依据。
