丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目...丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目前尚无文献报道SERINC2与泛癌及肿瘤免疫的关系。因此,基于SERINC2预测PAAD的预后,可为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定基础。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)和人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库中SERINC2在正常和肿瘤组织中的表达水平数据,证实SERINC2在多种癌症中异常高表达,且与临床病理分期显著相关(P<0.05)。通过基因组稳定性相关癌症分析(Genomic Stability Associated Cancer Analysis,GSCA)数据库分析拷贝数变异和甲基化对SERINC2表达的影响,发现拷贝数变异与SERINC2表达呈正相关,而甲基化水平则呈负相关(P<0.05)。使用TCGA数据库进一步分析SERINC2表达水平与免疫细胞浸润和肿瘤微环境评分的相关性,发现SERINC2表达与免疫检查点基因、免疫治疗、免疫浸润显著相关,并与肿瘤微环境评分在多数癌种中负相关(P<0.05)。使用“limma”包筛选出25个差异基因,构建的PAAD预后模型可有效区分高危/低危患者的生存预后。通过54例PAAD患者的免疫组化(immunohistochemical,IHC)验证SERINC2高表达与PAAD不良预后显著相关(中位总体生存期:19.67 vs 50.52个月,P=0.029)。上述结果表明,本研究为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定了基础。展开更多
目的:分析肿瘤患者输血相容性检测过程中的疑难情况,综合不同实验方法准确鉴定血型抗原和抗体,保障患者输血安全。方法:对2021年01月至2024年01月医院送检我中心的肿瘤患者血型及合血疑难样本进一步检测。血清中检出意外抗体的标本进行...目的:分析肿瘤患者输血相容性检测过程中的疑难情况,综合不同实验方法准确鉴定血型抗原和抗体,保障患者输血安全。方法:对2021年01月至2024年01月医院送检我中心的肿瘤患者血型及合血疑难样本进一步检测。血清中检出意外抗体的标本进行抗体筛查、鉴定和对应血型抗原确认;ABO疑难血型标本应用盐水试管法、吸收放散等血清学实验综合判断;疑似亚型标本提取DNA,应用序列特异性引物PCR(PCR-SSP)法进行基因检测,典型标本进行三代测序即单分子实时荧光测序(single molecule real time sequencing,SMRT)分析。结果:255例送检肿瘤患者疑难样本中,148例检出意外抗体,出现频率以抗-Lea最高(21.9%),其次为抗-E(20.6%)、抗-M(18.7%),26例样本(16.8%)未确定抗体特异性。107例样本血型鉴定困难:43例样本ABO血型复核无异常,35例样本ABO血型抗体减弱,29例样本表现为血清学亚型,其中PCR-SSP证实11例为亚型。3例典型样本血清学表现为A亚B,PCR-SSP基因分型结果分别为B(A)02/O01,B(A)04/O02,A1B;SMRT测序基因分型结果分别为ABO*BA.02/O.01.01,ABO*BA.04/O.01.02,ABO*A1.02/B.01,未发现新突变。结论:血型意外抗体、ABO血型抗原减弱及抗体减弱是构成肿瘤患者输血相容性检测疑难问题的主要原因。未来可考虑将RH和MNS血型抗原纳入献血者检测范围,并引入分子生物学技术,为患者制定个体化输血策略提供参考。展开更多
文摘丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目前尚无文献报道SERINC2与泛癌及肿瘤免疫的关系。因此,基于SERINC2预测PAAD的预后,可为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定基础。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)和人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库中SERINC2在正常和肿瘤组织中的表达水平数据,证实SERINC2在多种癌症中异常高表达,且与临床病理分期显著相关(P<0.05)。通过基因组稳定性相关癌症分析(Genomic Stability Associated Cancer Analysis,GSCA)数据库分析拷贝数变异和甲基化对SERINC2表达的影响,发现拷贝数变异与SERINC2表达呈正相关,而甲基化水平则呈负相关(P<0.05)。使用TCGA数据库进一步分析SERINC2表达水平与免疫细胞浸润和肿瘤微环境评分的相关性,发现SERINC2表达与免疫检查点基因、免疫治疗、免疫浸润显著相关,并与肿瘤微环境评分在多数癌种中负相关(P<0.05)。使用“limma”包筛选出25个差异基因,构建的PAAD预后模型可有效区分高危/低危患者的生存预后。通过54例PAAD患者的免疫组化(immunohistochemical,IHC)验证SERINC2高表达与PAAD不良预后显著相关(中位总体生存期:19.67 vs 50.52个月,P=0.029)。上述结果表明,本研究为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定了基础。
文摘目的:分析肿瘤患者输血相容性检测过程中的疑难情况,综合不同实验方法准确鉴定血型抗原和抗体,保障患者输血安全。方法:对2021年01月至2024年01月医院送检我中心的肿瘤患者血型及合血疑难样本进一步检测。血清中检出意外抗体的标本进行抗体筛查、鉴定和对应血型抗原确认;ABO疑难血型标本应用盐水试管法、吸收放散等血清学实验综合判断;疑似亚型标本提取DNA,应用序列特异性引物PCR(PCR-SSP)法进行基因检测,典型标本进行三代测序即单分子实时荧光测序(single molecule real time sequencing,SMRT)分析。结果:255例送检肿瘤患者疑难样本中,148例检出意外抗体,出现频率以抗-Lea最高(21.9%),其次为抗-E(20.6%)、抗-M(18.7%),26例样本(16.8%)未确定抗体特异性。107例样本血型鉴定困难:43例样本ABO血型复核无异常,35例样本ABO血型抗体减弱,29例样本表现为血清学亚型,其中PCR-SSP证实11例为亚型。3例典型样本血清学表现为A亚B,PCR-SSP基因分型结果分别为B(A)02/O01,B(A)04/O02,A1B;SMRT测序基因分型结果分别为ABO*BA.02/O.01.01,ABO*BA.04/O.01.02,ABO*A1.02/B.01,未发现新突变。结论:血型意外抗体、ABO血型抗原减弱及抗体减弱是构成肿瘤患者输血相容性检测疑难问题的主要原因。未来可考虑将RH和MNS血型抗原纳入献血者检测范围,并引入分子生物学技术,为患者制定个体化输血策略提供参考。
