[目的]分析泛癌中的COL5A1基因及蛋白表达水平,并探讨其与临床预后和肿瘤免疫浸润的关系。[方法]分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肿瘤患者的数据,采用TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、人类蛋白图谱(human prote...[目的]分析泛癌中的COL5A1基因及蛋白表达水平,并探讨其与临床预后和肿瘤免疫浸润的关系。[方法]分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肿瘤患者的数据,采用TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、人类蛋白图谱(human protein atlas,HPA)和STRING分析等生物信息学工具分析COL5A1基因与泛癌的关系。[结果] COL5A1在17种不同肿瘤和癌旁组织中的表达水平有差异。COL5A1高表达与膀胱尿路上皮癌、肺鳞状细胞癌、肺腺癌、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌、甲状腺癌、卵巢癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和胃腺癌总生存期相关(P均<0.05)。COL5A1表达与肿瘤微环境免疫检查点、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性显著性相关。COL5A1表达与B细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和抗原递呈细胞相关。[结论] COL5A1是肿瘤微环境的重要组成部分,影响免疫细胞浸润,可作为评估多种恶性肿瘤的免疫浸润和预后分析的肿瘤标志物。展开更多
文摘[目的]分析泛癌中的COL5A1基因及蛋白表达水平,并探讨其与临床预后和肿瘤免疫浸润的关系。[方法]分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肿瘤患者的数据,采用TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、人类蛋白图谱(human protein atlas,HPA)和STRING分析等生物信息学工具分析COL5A1基因与泛癌的关系。[结果] COL5A1在17种不同肿瘤和癌旁组织中的表达水平有差异。COL5A1高表达与膀胱尿路上皮癌、肺鳞状细胞癌、肺腺癌、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌、甲状腺癌、卵巢癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和胃腺癌总生存期相关(P均<0.05)。COL5A1表达与肿瘤微环境免疫检查点、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性显著性相关。COL5A1表达与B细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和抗原递呈细胞相关。[结论] COL5A1是肿瘤微环境的重要组成部分,影响免疫细胞浸润,可作为评估多种恶性肿瘤的免疫浸润和预后分析的肿瘤标志物。
