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青海省鼠疫菌单核苷酸多态性分析
1
作者 何建 靳娟 +5 位作者 李胜 柏吉祥 金泳 张丽 杨晓艳 辛有全 《中华卫生杀虫药械》 2025年第1期103-106,共4页
目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用... 目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。使用Illumina HiSeq 2000平台对250株鼠疫菌进行全基因测序,根据文献中鼠疫菌全基因组SNPs分析方法,基于133株国内外鼠疫菌株及假结核耶尔森菌IP32953,比对2 298个SNP位点,用MEGA 6.0软件对250株青海省鼠疫菌以及32株参考菌株构建系统发育关系。结果 青海省250株鼠疫菌分布于8个市(州),31个县(区)。其中海西州共66株,海北州共70株,海南州共28株,玉树州共62株,黄南州、果洛州、西宁市、海东市共24株。基于2 298个SNPs位点的聚类结果显示,青海省250株鼠疫菌分布在5个亚分支中,分别为0.PE分支6株(2.0%),1.IN分支235株(94.0%),2.ANT分支4株(1.6%),2.MED分支1株(0.4%),3.ANT分支4株(1.6%)。结论 青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌SNP基因型具有高度多样性,地区分布特征明显。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) SNP基因分型 青海省
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青海省海南州鼠疫耶尔森菌单核苷酸多态性分析
2
作者 张丽 靳娟 +5 位作者 何建 杨晓艳 辛有全 柏吉祥 张晓璐 李胜 《中华卫生杀虫药械》 2025年第3期270-273,共4页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据比对2298个SNP位点的变异情况,构建系统发育树,分析该疫源地鼠疫菌种群结构。结果海南州31株鼠疫菌生物型均为古典型,29株鼠疫菌的生态型为青藏高原型,2株为祁连山型;31株鼠疫菌均聚类至1.IN谱系1.IN2分支;1.IN2支群是该地的优势种群,海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地稳定存在。结论青海省海南州鼠疫菌菌株保守性高,系统发育的聚类与地理位置对应关系较好,SNP检测方法可以用于鼠疫菌暴发疫情的溯源分析。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) 海南州 鼠疫疫源地 基因分型
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OmniLog TM微生物鉴定系统在青海高原野生型鼠疫噬菌体宿主谱检测中的应用研究 被引量：2
3
作者 李存香 祁芝珍 +6 位作者 张青雯 赵海红 马龙 游陪松 杨建国 吴海生 冯建萍 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期21-25,共5页
目的采用两种微量法检测青海高原野生型鼠疫噬菌体的宿主谱,为今后噬菌体生态学研究和基于宿主范围噬菌体分类研究提供科学依据。方法基于OmniLog TM微生物鉴定系统微量法和微量点滴法,检测3株鼠疫噬菌体对2株鼠疫耶尔森菌(鼠疫疫苗株EV... 目的采用两种微量法检测青海高原野生型鼠疫噬菌体的宿主谱,为今后噬菌体生态学研究和基于宿主范围噬菌体分类研究提供科学依据。方法基于OmniLog TM微生物鉴定系统微量法和微量点滴法,检测3株鼠疫噬菌体对2株鼠疫耶尔森菌(鼠疫疫苗株EV 76、614F)和4株非鼠疫耶尔森菌(假结核耶尔森菌PTB3、PTB5、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2)的裂解情况。结果476号、087号和072204号鼠疫噬菌体均能成功感染鼠疫疫苗株EV 76、614F并依赖其生长繁殖,且基于OmniLog TM系统33℃培养48 h也能够观察到试验孔中四唑类染料颜色随着噬菌体数量的增加和宿主菌数量的减少而变淡。利用微量点滴法检测3株鼠疫噬菌体对4株非鼠疫耶尔森菌敏感性结果显示,28℃和37℃时476号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB5敏感,而087号和072204号对其不敏感;476号、087号和072204号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB3、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2这3株非鼠疫耶尔森菌均不敏感,且基于OmniLog TM系统观察到试验孔与对照孔中细菌生长曲线和四唑类染料颜色分别呈现相似对应的结果。然而,以鼠疫疫苗株EV 76、614F为宿主菌,37℃时072204号鼠疫噬菌体微量点滴于固体培养基上不显示噬菌斑。结论基于OmniLog TM检测系统的噬菌体宿主范围测定法可以作为一种替代传统检测宿主谱的测定方法,在噬菌体与宿主菌相互作用研究中具有较好的应用价值。 展开更多
关键词 噬菌体 鼠疫菌 宿主谱 OmniLog TM微生物鉴定系统 点滴法
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喜马拉雅旱獭血清中鼠疫噬菌体特异性抗体检测 被引量：1
4
作者 杨建国 游培松 +9 位作者 张晓璐 李光辉 李翔 李胜 冯建萍 金泳 赵海红 王永顺 谷昕玥 李存香 《医学动物防制》 2024年第8期770-773,共4页
目的利用微量板法间接检测青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中特异性鼠疫噬菌体抗体,为该地区鼠疫流行态势分析、噬菌体与哺乳动物机体免疫系统的相互作用提供理论依据。方法采用微量板法经间接血细胞凝集试验,检测497份采集于2020—2021... 目的利用微量板法间接检测青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中特异性鼠疫噬菌体抗体,为该地区鼠疫流行态势分析、噬菌体与哺乳动物机体免疫系统的相互作用提供理论依据。方法采用微量板法经间接血细胞凝集试验,检测497份采集于2020—2021年青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中的鼠疫耶尔森菌荚膜蛋白FraI抗体,再以1株温和性鼠疫噬菌体和1株裂解性鼠疫噬菌体为抗原,采用微量板法和双层琼脂平板法间接检测喜马拉雅旱獭血清中的鼠疫噬菌体抗体。结果采用微量板法经间接血细胞凝集试验检测497份喜马拉雅旱獭血清中鼠疫耶尔森菌荚膜蛋白FraI抗体,均为阴性;其次497份血清分别与2株不同类型鼠疫噬菌体进行中和试验,基于点滴法在上述血清中均未检测到鼠疫噬菌体免疫抗体,间接提示兴海县鼠疫耶尔森菌的数量可能与特定噬菌体的出现相关。结论2010—2019年兴海县鼠疫疫源地未发现动物间鼠疫流行,喜马拉雅旱獭血清中未检出特异性鼠疫噬菌体抗体可能与当地的鼠疫流行形式和强度有关。 展开更多
关键词 噬菌体 喜马拉雅旱獭 血清 免疫抗体 流行病学 鼠疫
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鼠疫耶尔森菌低钙应答V抗原人源单克隆抗体筛选与鉴定
5
作者 张黎 郑滨洋 +5 位作者 张琪 吴海莲 潘红星 朱凤才 吴海生 周剑芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期15-20,共6页
目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用L... 目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用LcrV对文库进行富集筛选,将获得的抗体基因表达成人IgG1后,测定抗体与LcrV抗原结合的特异性、亲和力、免疫调节功能以及保护能力。结果成功构建了鼠疫耶尔森菌人源ScFv抗体文库,库容量为7.54×10^(8)。抗体文库经LcrV筛选后获得了3株抗LcrV抗体,命名为RV-B4、RV-D1和RV-E8。3株抗体重链为VH1-46和VH3-30,轻链分别为VL1-51、VK3-20和VK1-39。3株抗体经ELISA及Western blot验证均与LcrV特异性结合,其与V抗原结合的解离常数(KD)分别为2.1 nmol/L、1.24 nmol/L和42 nmol/L。RV-D1体外降低人THP-1分泌TNF-α,动物攻毒试验中未发现抗LcrV抗体的保护效果。结论从鼠疫疫苗免疫人群获得了靶向低钙应答V抗原的人源抗体,以结合抗体为主,不能有效阻断病菌感染。所获得的单抗为鼠疫免疫基础研究、鼠疫诊断应用提供了候选材料。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 低钙应答V抗原 噬菌体展示 重组抗体 保护效果
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青海省三江源地区鼠疫耶尔森菌基因组单核苷酸多态性分析研究
6
作者 柏吉祥 靳娟 +7 位作者 李胜 辛有全 杨晓艳 张丽 金泳 李翔 应凯业 何建 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第6期639-643,共5页
目的通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省三江源地区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)种群结构特点,为该地区鼠疫科学防控提供理论依据。方法选取三江源地区81株代表性鼠疫菌,通过比对全基因组测序数据中的2298个SNPs位... 目的通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省三江源地区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)种群结构特点,为该地区鼠疫科学防控提供理论依据。方法选取三江源地区81株代表性鼠疫菌,通过比对全基因组测序数据中的2298个SNPs位点的变异情况,用MEGA 6.0软件完成系统发育树,分析该地区鼠疫菌种群结构及分布特征。结果81株鼠疫菌分布在3个SNPs分支中,分别为1.IN、2.ANT和0.PE。在整个三江源地区鼠疫自然疫源地中1.IN支群为该地区优势种群,均为喜马拉雅旱獭自然疫源地鼠疫菌,2.ANT和0.PE支群散在分布于玉树藏族自治州的称多县、囊谦县、曲麻莱县,青海田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌仅存在0.PE4C支群。结论三江源地区鼠疫菌全基因组SNP呈现明显的地区分布特征,可为该地区鼠疫疫情流行病学调查提供科学提示。 展开更多
关键词 鼠疫菌 全基因组 单核苷酸多态性 基因分型 三江源地区
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基于OmniLog TM系统评价鼠疫噬菌体在不同培养基中的生长情况
7
作者 李翔 赵海红 +3 位作者 吴海生 张青雯 祁芝珍 李存香 《医学动物防制》 2024年第8期747-749,754,共4页
目的2022年11月利用OmniLog TM微生物鉴定系统评价诊断用鼠疫噬菌体在赫金格尔消化液培养基(简称“赫氏肉汤”)、溶菌肉汤(luria-bertani,LB)液体培养基和IF-A培养基中的生长情况,为鼠疫噬菌体的筛选和生物学特性鉴定提供科学依据。方... 目的2022年11月利用OmniLog TM微生物鉴定系统评价诊断用鼠疫噬菌体在赫金格尔消化液培养基(简称“赫氏肉汤”)、溶菌肉汤(luria-bertani,LB)液体培养基和IF-A培养基中的生长情况,为鼠疫噬菌体的筛选和生物学特性鉴定提供科学依据。方法以鼠疫弱毒菌EV 76株为宿主菌,基于OmniLog TM微生物鉴定系统,利用无菌96孔微量培养板在33℃环境作用48h,检测诊断用鼠疫噬菌体分别在赫氏肉汤、LB液体培养基和IF-A培养基中的生长情况。结果以赫氏肉汤、LB液体培养基为培养介质,试验列生长曲线几乎呈一条横线,且细菌浓度的对数值不超过100,对照组列中宿主菌呈对应的S型生长曲线;试验孔中四唑类染料的颜色随着噬菌体数量的减少和宿主菌数量的增多而逐渐加深。以IF-A培养基为培养介质,其试验列未显示任何生长曲线。结论三种液体培养基鼠疫噬菌体生长情况相比较,赫氏肉汤更优用于鼠疫耶尔森菌与噬菌体的相互作用研究,IF-A培养基更适合于其他微生物的生长。 展开更多
关键词 赫金格尔消化液培养基 Luria-bertani液体培养基 IF-A培养基 鼠疫噬菌体 微生物鉴定系统 生长曲线 四唑染料 指纹图谱
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鼠疫菌培养基及培养条件的优化 被引量：1
8
作者 冯建萍 《青海畜牧兽医杂志》 2024年第1期60-61,共2页
本试验对鼠疫菌培养基制备过程中涉及鼠疫菌生长的诸因素进行优化并作效果评价,目的在于筛选出适合鼠疫菌生长的优质培养基,从而保证鼠疫防控工作的顺利开展。
关键词 鼠疫菌 培养基 培养优化
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甘肃高台县喜马拉雅旱獭分布范围及鼠疫发生风险调查分析 被引量：1
9
作者 安文静 席进孝 +5 位作者 何爱伟 王鼎盛 徐大琴 蒲秀华 杨欢 戎宾国 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1194-1198,共5页
目的开展甘肃省张掖市高台县喜马拉雅旱獭分布范围调查,分析鼠疫发生的风险,为该地鼠疫防控提供科学依据。方法采用现场调查和全球定位系统(GPS)相结合的方法开展高台县喜马拉雅旱獭分布范围、自然地理景观特征的调查。采用查阅资料和... 目的开展甘肃省张掖市高台县喜马拉雅旱獭分布范围调查,分析鼠疫发生的风险,为该地鼠疫防控提供科学依据。方法采用现场调查和全球定位系统(GPS)相结合的方法开展高台县喜马拉雅旱獭分布范围、自然地理景观特征的调查。采用查阅资料和入户走访等方法调查旱獭分布区人口信息和风俗习惯。采用弓形夹法捕获喜马拉雅旱獭,采集血液、肝、脾、心、肺、肾、股骨及体表媒介动物等样本,按照《鼠疫诊断标准》(WS279-2008)进行病原学、血清学检测。结果高台县新坝镇旱獭分布在16个村庄(53.33%),其中和平村(100%)分布最广,其次为照一村(79.17%)、西上村(55.32%),其余均在50%以下。旱獭直接威胁村民方面,和平村、东大村、照一村均为100%,西上村为90.59%,其余均在50%以下。旱獭染蚤率为30.77%(16/52)、蚤指数为1.48(77/52),主要体表媒介动物是硬蜱、体虱、谢氏山蚤、斧形盖蚤,分别占72.31%(517/715)、16.92%(121/715)、6.43%(46/715)、4.20%(30/715)。采集旱獭肝、脾组织各52份,体表媒介动物75组715匹,细菌学培养均未发现鼠疫杆菌,RIHA检测鼠疫F1抗原均为阴性;采集旱獭血清52份,IHA检测鼠疫特异性F1抗体均为阴性。结论张掖市高台县存在人间鼠疫发生的风险,建议将高台县纳入甘肃省鼠情调查和疫源地检索县,同时加强健康宣传教育和医务人员培训,做好重点人员的管控和应急储备,必要时进行保护性灭獭灭蚤,防止鼠疫的发生和流行。 展开更多
关键词 喜马拉雅旱獭 分布范围 鼠疫发生风险 高台县
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鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究 被引量：78
10
作者 周冬生 韩延平 +18 位作者 宋亚军 童宗中 裴德翠 戴二黑 张玲 包静月 李敏 崔百忠 张秀清 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期204-210,共7页
目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析... 目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布 ,同时进行基因组岛分析。结果　在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出 2 2个DFR ,基于DFR图谱 ,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成 14个基因组型。鼠疫耶尔森菌共有 2 1个基因组岛 ,其中 18个已存在于假结核杆菌中 ,余下 3个为鼠疫耶尔森菌独有。结论　探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布 ,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化 ;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统 ;建立了各基因组型别间的系统发育关系 ,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系 。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 基因组进化 生态位适应
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鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析 被引量：40
11
作者 宋亚军 童宗中 +26 位作者 王津 郭兆彪 汪莉 韩延平 张建国 裴德翠 周冬生 秦海鸥 庞昕 韩玉军 翟俊辉 李敏 祁芝珍 金丽霞 戴瑞霞 崔百忠 陈峰 李胜霆 叶辰 杜宗敏 王效义 王俊 于军 杨焕明 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-199,共8页
目的　测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法　采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组... 目的　测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法　采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组方法对 910 0 1与另外 2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究。结果　910 0 1菌株的基因组包括 1条染色体和 4个质粒 (pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY)。pPCP1质粒长度为 96 0 9bp,与参考菌株基本一致 ;pCD1质粒是编码Ⅲ型分泌系统的质粒 ,长度为70 15 9bp,编码情况与参考菌株基本相同 ,但重排导致了质粒的结构与参考菌株存在差异 ;pMT1质粒长度为10 6 6 4 2bp,保留了较多的原始质粒片段 ,毒力相关基因与参考菌株没有差异 ;pCRY质粒是本研究中新发现的质粒 ,在国内外研究中未曾报道 ,这一质粒长度为2 174 2bp ,具有独立复制能力 ,有一群编码Ⅳ型分泌系统的基因。 910 0 1菌株的染色体长度为4 5 95 0 6 5bp,有 4 0 37个编码序列 (CDS) ,其中 14 1个是假基因 ;染色体中存在着非常丰富的插入序列 ,由于存在IS序列介导的基因组重排 ,910 0 1菌株染色体的结构与参考菌株存在较大差异。通过比较基因组学分析 ,初步确定了910 0 1菌株甘油降解阳性、硝酸盐还原阴性、阿拉? 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 基因组 进化 序列分析 DNA
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新疆准噶尔盆地的大沙鼠首次分离出鼠疫菌 被引量：37
12
作者 蒋卫 阿不里米提 +3 位作者 热娜 布仁明德 戴翔 孙石 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第12期1051-1051,共1页
关键词 新疆维吾尔自治区 鼠疫菌 大沙鼠 盆地 自然疫源性疾病 动物间鼠疫 离出 首次 20世纪 未发现
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鼠疫耶尔森菌生物型变异遗传基础的研究和新生物型——田鼠型的提出 被引量：25
13
作者 周冬生 童宗中 +16 位作者 宋亚军 张玲 裴德翠 庞昕 韩延平 李敏 崔百忠 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期211-215,共5页
目的　探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法　通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果　田鼠鼠疫自然疫源... 目的　探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法　通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果　田鼠鼠疫自然疫源地菌株在毒力、生化表型和分子特征上与其他型别鼠疫耶尔森菌相差很大。所有脱氮阴性菌株的napA基因发生了突变 ,所有甘油利用阴性菌株的 glpD基因发生了突变 ,所有阿拉伯糖利用阴性菌株的araC基因发生了突变。结论　提出了一个新的生物型———田鼠型 ;相应糖醇代谢相关基因发生突变是 4个生物型变异的遗传基础。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 生物型 突变
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鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析 被引量：21
14
作者 周冬生 韩延平 +17 位作者 戴二黑 宋亚军 包静月 裴德翠 李敏 崔百忠 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期200-203,共4页
目的　研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法　挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果　设计了若干质控... 目的　研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法　挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果　设计了若干质控杂交组合 ,芯片杂交结果与全基因组测序结果完全一致。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 比较基因组学
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中国自然感染鼠疫杆菌的蚤、蜱、螨与虱类 被引量：11
15
作者 王祖郧 魏柏青 +2 位作者 张珊瑚 戴瑞霞 李存香 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期307-309,共3页
关键词 鼠疫杆菌 自然感染 跳蚤 自然疫源性疾病 中国 啮齿动物 人间鼠疫 节肢动物
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鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究 被引量：16
16
作者 韩延平 周冬生 +16 位作者 宋亚军 裴德翠 李敏 崔百忠 包静月 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期307-309,共3页
目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8... 目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8条基因 ,均是鼠疫耶尔森菌DNA标识序列。针对其中 3条基因设计PCR引物 ,能特异性扩增出鼠疫耶尔森菌 ,与来自其他非鼠疫耶尔森菌的DNA无交叉反应。结论　鼠疫耶尔森菌存在DNA标识序列 ,并能用于鼠疫耶尔森菌的快速检测与鉴定。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 标识序列
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中国鼠疫菌某些生化特征及流行病学意义 被引量：11
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作者 董兴齐 李敏 +5 位作者 夏连续 王鹏 崔百忠 孙连芝 俞东征 海荣 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2003年第6期460-462,共3页
目的　探讨中国鼠疫菌株生化表征的遗传变异与分型地位。方法　采用平皿 -单菌落法 ,实验观察我国17个生态型共 3 3 6株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果　发现松辽平原、滇闽居民区和滇西纵谷区 3个生态... 目的　探讨中国鼠疫菌株生化表征的遗传变异与分型地位。方法　采用平皿 -单菌落法 ,实验观察我国17个生态型共 3 3 6株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果　发现松辽平原、滇闽居民区和滇西纵谷区 3个生态型部分菌株对甘油、阿胶糖、麦芽糖酵解有变异 ,可同时出现酵解和不酵解的单菌落 ,而且特性较稳定 ;其余 14个生态型鼠疫菌单菌落酵解能力与过去资料报道一致无明显变化 ;根据实验结果可将中国鼠疫菌分为 12个生化型。结论　我国鼠疫菌对糖酵解特性稳定 ,具有一定的分型意义 ,滇闽居民区与滇西纵谷区生态型鼠疫菌株可能源于一个祖先。 展开更多
关键词 鼠疫菌 生化特征 流行病学 遗传变异 分型地位
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用双重式聚合酶链反应技术检测鼠疫菌的实验研究 被引量：18
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作者 吴明寿 张丽云 +2 位作者 张洪英 郭英 黄坚华 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 1999年第1期55-56,共2页
近几年来，随着分子生物技术的迅猛发展，国内外学者对聚合酶链反应（ＰＣＲ）用于鼠疫的检测十分关注。Ｈｉｎｎｅｂｕｓｃｈ等〔１〕（１９９３）用Ｐｌａ基因序列，以特异性片段为引物，建立了检测印鼠客蚤体内鼠疫菌的ＰＣＲ方法。... 近几年来，随着分子生物技术的迅猛发展，国内外学者对聚合酶链反应（ＰＣＲ）用于鼠疫的检测十分关注。Ｈｉｎｎｅｂｕｓｃｈ等〔１〕（１９９３）用Ｐｌａ基因序列，以特异性片段为引物，建立了检测印鼠客蚤体内鼠疫菌的ＰＣＲ方法。Ｈｉｒｏｋｏ氏等〔２〕（１９９６）... 展开更多
关键词 鼠疫菌 PCR 检测
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梁河家鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义 被引量：10
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作者 张海鹏 钟佑宏 +5 位作者 段存娟 郭牧 段彪 李伟 王鹏 吴鹤松 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期589-592,共4页
目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进... 目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进行电镜扫描。结果共获得338份标本(黄胸鼠234只,臭鼩鼱43只,其余61只),分离到29株鼠疫噬菌体,总分离率为8.58%(29/338),其中19株分离自黄胸鼠,分离率为8.12%(19/234),8株分离自臭鼩鼱,分离率为18.6%(8/43);4个乡镇全部有分离到鼠疫噬菌体,其中遮岛镇分离率最高为16.13%(5/31);初次分离这些鼠疫噬菌体时,其噬斑在双层平板上表现为大(直径≥2.0 mm)、中(≥1.0 mm,≤2.0 mm)及小(≤1.0 mm)3种噬斑;2株有代表性噬菌体皆为肌尾病毒科噬菌体。结论梁河家鼠鼠疫疫源地中普遍存在鼠疫噬菌体,黄胸鼠是主要的携带宿主,所分鼠疫噬菌体为肌尾病毒科噬菌体且具有多态性,值得进一步研究。 展开更多
关键词 鼠疫噬菌体 鼠疫疫源地 流行病学 梁河县
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云南鼠疫耶尔森菌基因分型研究 被引量：9
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作者 吴明寿 戴二黑 +11 位作者 郭英 钟佑宏 郭兆彪 刘海洪 杜春红 王鹏 黄鹏 于国林 董兴齐 王津 宋亚军 杨瑞馥 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期475-478,共4页
目的通过对来自云南省鼠疫自然疫源地155株鼠疫菌进行基因分型,了解鼠疫菌的进化规律。方法根据22个差异区段(differentregions,DFR)设计引物,PCR扩增鼠疫菌的每个DFR。结果滇西山地闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地137株鼠疫菌的基... 目的通过对来自云南省鼠疫自然疫源地155株鼠疫菌进行基因分型,了解鼠疫菌的进化规律。方法根据22个差异区段(differentregions,DFR)设计引物,PCR扩增鼠疫菌的每个DFR。结果滇西山地闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地137株鼠疫菌的基因型均为9型。滇西山地齐氏姬鼠大绒鼠鼠疫自然疫源地18株鼠疫菌,有10株菌为7型,8株菌为9型。结论滇西山地齐氏姬鼠大绒鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌的基因型为7型和9型,而滇闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌的基因型主要为9型。两疫源地鼠疫菌在遗传关系上有亲缘性,后者可能由前者进化而来。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 聚合酶链反应 比较基因组学 差异区段
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