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青海省鼠疫菌单核苷酸多态性分析
1
作者 何建 靳娟 +5 位作者 李胜 柏吉祥 金泳 张丽 杨晓艳 辛有全 《中华卫生杀虫药械》 2025年第1期103-106,共4页
目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用... 目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。使用Illumina HiSeq 2000平台对250株鼠疫菌进行全基因测序,根据文献中鼠疫菌全基因组SNPs分析方法,基于133株国内外鼠疫菌株及假结核耶尔森菌IP32953,比对2 298个SNP位点,用MEGA 6.0软件对250株青海省鼠疫菌以及32株参考菌株构建系统发育关系。结果 青海省250株鼠疫菌分布于8个市(州),31个县(区)。其中海西州共66株,海北州共70株,海南州共28株,玉树州共62株,黄南州、果洛州、西宁市、海东市共24株。基于2 298个SNPs位点的聚类结果显示,青海省250株鼠疫菌分布在5个亚分支中,分别为0.PE分支6株(2.0%),1.IN分支235株(94.0%),2.ANT分支4株(1.6%),2.MED分支1株(0.4%),3.ANT分支4株(1.6%)。结论 青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌SNP基因型具有高度多样性,地区分布特征明显。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) SNP基因分型 青海省
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青海省海南州鼠疫耶尔森菌单核苷酸多态性分析
2
作者 张丽 靳娟 +5 位作者 何建 杨晓艳 辛有全 柏吉祥 张晓璐 李胜 《中华卫生杀虫药械》 2025年第3期270-273,共4页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据比对2298个SNP位点的变异情况,构建系统发育树,分析该疫源地鼠疫菌种群结构。结果海南州31株鼠疫菌生物型均为古典型,29株鼠疫菌的生态型为青藏高原型,2株为祁连山型;31株鼠疫菌均聚类至1.IN谱系1.IN2分支;1.IN2支群是该地的优势种群,海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地稳定存在。结论青海省海南州鼠疫菌菌株保守性高,系统发育的聚类与地理位置对应关系较好,SNP检测方法可以用于鼠疫菌暴发疫情的溯源分析。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) 海南州 鼠疫疫源地 基因分型
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鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究 被引量：78
3
作者 周冬生 韩延平 +18 位作者 宋亚军 童宗中 裴德翠 戴二黑 张玲 包静月 李敏 崔百忠 张秀清 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期204-210,共7页
目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析... 目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布 ,同时进行基因组岛分析。结果　在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出 2 2个DFR ,基于DFR图谱 ,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成 14个基因组型。鼠疫耶尔森菌共有 2 1个基因组岛 ,其中 18个已存在于假结核杆菌中 ,余下 3个为鼠疫耶尔森菌独有。结论　探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布 ,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化 ;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统 ;建立了各基因组型别间的系统发育关系 ,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系 。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 基因组进化 生态位适应
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鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析 被引量：40
4
作者 宋亚军 童宗中 +26 位作者 王津 郭兆彪 汪莉 韩延平 张建国 裴德翠 周冬生 秦海鸥 庞昕 韩玉军 翟俊辉 李敏 祁芝珍 金丽霞 戴瑞霞 崔百忠 陈峰 李胜霆 叶辰 杜宗敏 王效义 王俊 于军 杨焕明 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-199,共8页
目的　测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法　采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组... 目的　测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法　采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组方法对 910 0 1与另外 2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究。结果　910 0 1菌株的基因组包括 1条染色体和 4个质粒 (pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY)。pPCP1质粒长度为 96 0 9bp,与参考菌株基本一致 ;pCD1质粒是编码Ⅲ型分泌系统的质粒 ,长度为70 15 9bp,编码情况与参考菌株基本相同 ,但重排导致了质粒的结构与参考菌株存在差异 ;pMT1质粒长度为10 6 6 4 2bp,保留了较多的原始质粒片段 ,毒力相关基因与参考菌株没有差异 ;pCRY质粒是本研究中新发现的质粒 ,在国内外研究中未曾报道 ,这一质粒长度为2 174 2bp ,具有独立复制能力 ,有一群编码Ⅳ型分泌系统的基因。 910 0 1菌株的染色体长度为4 5 95 0 6 5bp,有 4 0 37个编码序列 (CDS) ,其中 14 1个是假基因 ;染色体中存在着非常丰富的插入序列 ,由于存在IS序列介导的基因组重排 ,910 0 1菌株染色体的结构与参考菌株存在较大差异。通过比较基因组学分析 ,初步确定了910 0 1菌株甘油降解阳性、硝酸盐还原阴性、阿拉? 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 基因组 进化 序列分析 DNA
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新疆准噶尔盆地的大沙鼠首次分离出鼠疫菌 被引量：37
5
作者 蒋卫 阿不里米提 +3 位作者 热娜 布仁明德 戴翔 孙石 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第12期1051-1051,共1页
关键词 新疆维吾尔自治区 鼠疫菌 大沙鼠 盆地 自然疫源性疾病 动物间鼠疫 离出 首次 20世纪 未发现
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鼠疫耶尔森菌生物型变异遗传基础的研究和新生物型——田鼠型的提出 被引量：25
6
作者 周冬生 童宗中 +16 位作者 宋亚军 张玲 裴德翠 庞昕 韩延平 李敏 崔百忠 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期211-215,共5页
目的　探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法　通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果　田鼠鼠疫自然疫源... 目的　探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法　通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果　田鼠鼠疫自然疫源地菌株在毒力、生化表型和分子特征上与其他型别鼠疫耶尔森菌相差很大。所有脱氮阴性菌株的napA基因发生了突变 ,所有甘油利用阴性菌株的 glpD基因发生了突变 ,所有阿拉伯糖利用阴性菌株的araC基因发生了突变。结论　提出了一个新的生物型———田鼠型 ;相应糖醇代谢相关基因发生突变是 4个生物型变异的遗传基础。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 生物型 突变
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鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析 被引量：21
7
作者 周冬生 韩延平 +17 位作者 戴二黑 宋亚军 包静月 裴德翠 李敏 崔百忠 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期200-203,共4页
目的　研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法　挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果　设计了若干质控... 目的　研制鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片 ,并将其用于比较基因组分析。方法　挑选出 4 0 0 5条鼠疫耶尔森菌基因 ,PCR扩增各基因 ,以纯化的PCR产物点样制备芯片 ,采用双色荧光杂交策略 ,进行芯片比较基因组杂交。结果　设计了若干质控杂交组合 ,芯片杂交结果与全基因组测序结果完全一致。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 比较基因组学
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中国自然感染鼠疫杆菌的蚤、蜱、螨与虱类 被引量：11
8
作者 王祖郧 魏柏青 +2 位作者 张珊瑚 戴瑞霞 李存香 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期307-309,共3页
关键词 鼠疫杆菌 自然感染 跳蚤 自然疫源性疾病 中国 啮齿动物 人间鼠疫 节肢动物
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鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究 被引量：16
9
作者 韩延平 周冬生 +16 位作者 宋亚军 裴德翠 李敏 崔百忠 包静月 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期307-309,共3页
目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8... 目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8条基因 ,均是鼠疫耶尔森菌DNA标识序列。针对其中 3条基因设计PCR引物 ,能特异性扩增出鼠疫耶尔森菌 ,与来自其他非鼠疫耶尔森菌的DNA无交叉反应。结论　鼠疫耶尔森菌存在DNA标识序列 ,并能用于鼠疫耶尔森菌的快速检测与鉴定。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 DNA芯片 标识序列
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中国鼠疫菌某些生化特征及流行病学意义 被引量：11
10
作者 董兴齐 李敏 +5 位作者 夏连续 王鹏 崔百忠 孙连芝 俞东征 海荣 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2003年第6期460-462,共3页
目的　探讨中国鼠疫菌株生化表征的遗传变异与分型地位。方法　采用平皿 -单菌落法 ,实验观察我国17个生态型共 3 3 6株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果　发现松辽平原、滇闽居民区和滇西纵谷区 3个生态... 目的　探讨中国鼠疫菌株生化表征的遗传变异与分型地位。方法　采用平皿 -单菌落法 ,实验观察我国17个生态型共 3 3 6株鼠疫菌酵解麦芽糖、鼠李糖、阿胶糖、甘油及脱氮反应的变化。结果　发现松辽平原、滇闽居民区和滇西纵谷区 3个生态型部分菌株对甘油、阿胶糖、麦芽糖酵解有变异 ,可同时出现酵解和不酵解的单菌落 ,而且特性较稳定 ;其余 14个生态型鼠疫菌单菌落酵解能力与过去资料报道一致无明显变化 ;根据实验结果可将中国鼠疫菌分为 12个生化型。结论　我国鼠疫菌对糖酵解特性稳定 ,具有一定的分型意义 ,滇闽居民区与滇西纵谷区生态型鼠疫菌株可能源于一个祖先。 展开更多
关键词 鼠疫菌 生化特征 流行病学 遗传变异 分型地位
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用双重式聚合酶链反应技术检测鼠疫菌的实验研究 被引量：18
11
作者 吴明寿 张丽云 +2 位作者 张洪英 郭英 黄坚华 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 1999年第1期55-56,共2页
近几年来，随着分子生物技术的迅猛发展，国内外学者对聚合酶链反应（ＰＣＲ）用于鼠疫的检测十分关注。Ｈｉｎｎｅｂｕｓｃｈ等〔１〕（１９９３）用Ｐｌａ基因序列，以特异性片段为引物，建立了检测印鼠客蚤体内鼠疫菌的ＰＣＲ方法。... 近几年来，随着分子生物技术的迅猛发展，国内外学者对聚合酶链反应（ＰＣＲ）用于鼠疫的检测十分关注。Ｈｉｎｎｅｂｕｓｃｈ等〔１〕（１９９３）用Ｐｌａ基因序列，以特异性片段为引物，建立了检测印鼠客蚤体内鼠疫菌的ＰＣＲ方法。Ｈｉｒｏｋｏ氏等〔２〕（１９９６）... 展开更多
关键词 鼠疫菌 PCR 检测
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梁河家鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义 被引量：10
12
作者 张海鹏 钟佑宏 +5 位作者 段存娟 郭牧 段彪 李伟 王鹏 吴鹤松 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期589-592,共4页
目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进... 目的调查梁河县家鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法2017年采集梁河家鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,同时挑取部分噬菌体进行电镜扫描。结果共获得338份标本(黄胸鼠234只,臭鼩鼱43只,其余61只),分离到29株鼠疫噬菌体,总分离率为8.58%(29/338),其中19株分离自黄胸鼠,分离率为8.12%(19/234),8株分离自臭鼩鼱,分离率为18.6%(8/43);4个乡镇全部有分离到鼠疫噬菌体,其中遮岛镇分离率最高为16.13%(5/31);初次分离这些鼠疫噬菌体时,其噬斑在双层平板上表现为大(直径≥2.0 mm)、中(≥1.0 mm,≤2.0 mm)及小(≤1.0 mm)3种噬斑;2株有代表性噬菌体皆为肌尾病毒科噬菌体。结论梁河家鼠鼠疫疫源地中普遍存在鼠疫噬菌体,黄胸鼠是主要的携带宿主,所分鼠疫噬菌体为肌尾病毒科噬菌体且具有多态性,值得进一步研究。 展开更多
关键词 鼠疫噬菌体 鼠疫疫源地 流行病学 梁河县
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云南鼠疫耶尔森菌基因分型研究 被引量：9
13
作者 吴明寿 戴二黑 +11 位作者 郭英 钟佑宏 郭兆彪 刘海洪 杜春红 王鹏 黄鹏 于国林 董兴齐 王津 宋亚军 杨瑞馥 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期475-478,共4页
目的通过对来自云南省鼠疫自然疫源地155株鼠疫菌进行基因分型,了解鼠疫菌的进化规律。方法根据22个差异区段(differentregions,DFR)设计引物,PCR扩增鼠疫菌的每个DFR。结果滇西山地闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地137株鼠疫菌的基... 目的通过对来自云南省鼠疫自然疫源地155株鼠疫菌进行基因分型,了解鼠疫菌的进化规律。方法根据22个差异区段(differentregions,DFR)设计引物,PCR扩增鼠疫菌的每个DFR。结果滇西山地闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地137株鼠疫菌的基因型均为9型。滇西山地齐氏姬鼠大绒鼠鼠疫自然疫源地18株鼠疫菌,有10株菌为7型,8株菌为9型。结论滇西山地齐氏姬鼠大绒鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌的基因型为7型和9型,而滇闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌的基因型主要为9型。两疫源地鼠疫菌在遗传关系上有亲缘性,后者可能由前者进化而来。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 聚合酶链反应 比较基因组学 差异区段
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我国鼠疫耶尔森菌最大质粒的研究 被引量：7
14
作者 李敏 祁芝珍 +5 位作者 金丽霞 马英 赵海红 辛有全 李存香 杨晓艳 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2004年第1期48-50,共3页
目的　研究我国鼠疫菌最大质粒的特性及地理分布特征。方法　采用Kado和Liu法提取我国各鼠疫自然疫源地 2 0 2 6株鼠疫菌的质粒 ,经琼脂糖凝胶电泳进行检测分析。结果　我国鼠疫菌具有分类属性的最大质粒有 3种 ,其相对分子质量分别为 5... 目的　研究我国鼠疫菌最大质粒的特性及地理分布特征。方法　采用Kado和Liu法提取我国各鼠疫自然疫源地 2 0 2 6株鼠疫菌的质粒 ,经琼脂糖凝胶电泳进行检测分析。结果　我国鼠疫菌具有分类属性的最大质粒有 3种 ,其相对分子质量分别为 5 2× 10 6、65× 10 6和 90× 10 6,有明显的地理分布特征。 5 2× 10 6质粒分布在祁连山南、北麓和青海湖环湖地区 ,90× 10 6质粒仅分布在藏北高原的那曲地区和青海青南高原的玉树、曲麻莱、格尔木的部分地区 ,其余各鼠疫疫源地的鼠疫菌其最大质粒均为 65× 10 6。结论　我国鼠疫菌最大质粒的特点及地理分布对研究鼠疫自然疫源地空间结构和鼠疫菌的遗传学特性具有重要意义。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 质粒 地理分布 琼脂糖凝胶电泳 鼠疫 自然疫源
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云南省家、野两型鼠疫菌生化特性及营养需求的比较研究 被引量：7
15
作者 王鹏 郭英 +5 位作者 石丽媛 张洪英 于国林 董兴齐 海荣 俞东征 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期217-220,共4页
目的　探讨云南家、野两型鼠疫菌株间遗传背景的关系。方法　采用固体平皿法 ,对云南省 32株家、野两型鼠疫菌 ,进行了生化特性及营养需求的研究。结果　 12 1株家鼠鼠疫菌株中 ,16株为典型菌株 ,3株分别在发酵麦芽糖、甘油时出现了阴... 目的　探讨云南家、野两型鼠疫菌株间遗传背景的关系。方法　采用固体平皿法 ,对云南省 32株家、野两型鼠疫菌 ,进行了生化特性及营养需求的研究。结果　 12 1株家鼠鼠疫菌株中 ,16株为典型菌株 ,3株分别在发酵麦芽糖、甘油时出现了阴性和阳性两种发酵菌落 ,2株显现与野鼠鼠疫相似的生化特性。其中 12株为Pgm+ ,8株有 Pgm+和 Pgm-两种菌落 ,1株为 Pgm-。19株对谷氨酸半依赖 ,2株对谷氨酸不依赖 ,2 1株均为苯丙氨酸依赖 ;2 11株野鼠鼠疫菌株中 ,8株为典型菌株 ,2株分别在发酵麦芽糖、甘油时出现了阴性和阳性两种发酵菌落 ,1株发酵麦芽糖阳性。 9株为 Pgm+ ,2株有 Pgm+和 Pgm-两种菌落。 3株对谷氨酸半依赖 ,8株对谷氨酸不依赖 ,11株均为苯丙氨酸依赖。结论　云南省家、野两型鼠疫菌具有亲缘性 ,家鼠鼠疫可能是由野鼠鼠疫传入的。 展开更多
关键词 云南 家鼠 生化特性 营养需求 鼠疫菌 野鼠
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鼠疫菌PCR检测方法的研究 被引量：30
16
作者 张景林 李宏伟 +4 位作者 王洪喜 史书文 王武芳 宝建喜 岳明祥 《中国地方病防治》 北大核心 1995年第1期16-17,共2页
本文采用聚合酶链反应(PCR)技术,通过扩增鼠疫菌9.5kb质粒pla基因上一个456bp片段,用于鼠疫菌的快速诊断。对4株鼠疫菌参考株PCR扩增后,琼脂糖凝胶电泳分析均呈现单—DNA扩增区带,其分子量大小与预期结果相符。对13株非鼠疫菌参考株作... 本文采用聚合酶链反应(PCR)技术,通过扩增鼠疫菌9.5kb质粒pla基因上一个456bp片段,用于鼠疫菌的快速诊断。对4株鼠疫菌参考株PCR扩增后,琼脂糖凝胶电泳分析均呈现单—DNA扩增区带,其分子量大小与预期结果相符。对13株非鼠疫菌参考株作平行实验,PCR扩增后未见扩增区带。其检测的敏感性为10个cfu。全部实验可在4h内完成。对鼠疫菌的快速诊断和分子流行病学调查具有重要意义。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 鼠疫菌 诊断
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多重PCR快速鉴定鼠疫耶尔森氏菌 被引量：19
17
作者 于学东 裴德翠 +4 位作者 宋亚军 郭兆彪 王津 李永勤 杨瑞馥 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2003年第3期98-100,107,共4页
目的　建立鼠疫耶尔森氏菌多重PCR鉴定系统 ,用于鼠疫耶尔森氏菌的快速鉴定。方法　针对分别存在于pFra、pRst质粒上毒力基因caf1和pla ,以及一段 2 76bp染色体序列 3a分别设计引物。采用多重PCR技术 ,同时检测caf1、pla、3a三个靶序列... 目的　建立鼠疫耶尔森氏菌多重PCR鉴定系统 ,用于鼠疫耶尔森氏菌的快速鉴定。方法　针对分别存在于pFra、pRst质粒上毒力基因caf1和pla ,以及一段 2 76bp染色体序列 3a分别设计引物。采用多重PCR技术 ,同时检测caf1、pla、3a三个靶序列。结果　应用该多重PCR反应体系 ,对我国鼠疫耶尔森氏菌 17个生态型及新发现的青海田鼠鼠疫疫源地菌株的多重PCR扩增结果表明 ,实验菌株中除 2株分别缺失pFra、pPst质粒而扩增出 2条产物带外 ,其余 5 2株均扩增出预期的 3条产物带 ,相关菌株均阴性 ,其检测灵敏度为 1× 10 -4ngDNA。 结论　该方法用于鼠疫耶尔森氏菌的鉴定简便、快捷 ,具有很高的特异性和敏感性 。 展开更多
关键词 多重PCR 快速鉴定 鼠疫耶尔森氏菌 鼠疫
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四川石渠县鼠疫耶尔森菌的分子生物学特征 被引量：6
18
作者 海荣 魏建春 +2 位作者 蔡虹 周艳 张建华 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2002年第1期48-52,共5页
目的 :对四川省石渠县鼠疫耶尔森菌的遗传特性进行分析 ,并与其他类型的鼠疫菌株相比较。方法 :特征性基因的PCR扩增、随机扩增多态性DNA、脉冲场电泳、rRNA基因指纹图分析等。结果 :石渠县的菌株为典型的鼠疫菌株 ,具有鼠疫强毒菌的典... 目的 :对四川省石渠县鼠疫耶尔森菌的遗传特性进行分析 ,并与其他类型的鼠疫菌株相比较。方法 :特征性基因的PCR扩增、随机扩增多态性DNA、脉冲场电泳、rRNA基因指纹图分析等。结果 :石渠县的菌株为典型的鼠疫菌株 ,具有鼠疫强毒菌的典型特征。从该县青海田鼠中分离的鼠疫菌株 ,其分子生物学特征与我国其他疫源地中的鼠疫菌株明显不同。结论 :该地可能存在一种新类型的鼠疫自然疫源地 ,其鼠疫菌属于一单独型别 ;1999年该县发生的人间鼠疫 ,感染来自该疫源地之外 ;对该疫源地仍须密切监视 ,以确定其对人类的威胁。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 分子生物学特征 四川 石渠
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玉树藏族自治州藏系绵羊鼠疫生态流行病学特征分析 被引量：8
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作者 熊浩明 杨晓艳 +8 位作者 何建 靳娟 辛有全 吴海莲 祁美英 杨汉青 代瑞霞 魏柏青 祁芝珍 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第10期893-896,共4页
目的分析玉树藏族自治州藏系绵羊鼠疫生态流行病学特征。方法汇总玉树藏族自治州藏系绵羊鼠疫相关流行病学资料,对分离自藏系绵羊的13株鼠疫菌株进行生化试验、毒力测定、毒力因子鉴定和差异区段(DFR)分型检测,分析流行病学特征。结果... 目的分析玉树藏族自治州藏系绵羊鼠疫生态流行病学特征。方法汇总玉树藏族自治州藏系绵羊鼠疫相关流行病学资料,对分离自藏系绵羊的13株鼠疫菌株进行生化试验、毒力测定、毒力因子鉴定和差异区段(DFR)分型检测,分析流行病学特征。结果从青海省玉树藏族自治州藏系绵羊体内分离的鼠疫菌共13株,主要分布在玉树市、囊谦县、治多县。由藏系绵羊作为传染源引起人间鼠疫7起18例,死亡9例,主要分布在玉树市、杂多县、囊谦县,首发病例均因剥、食死鼠疫的藏羊引起,其次为接触鼠疫病人而感染。13株鼠疫菌株的生态型均为青藏高原型。毒力因子及毒力检测显示13株鼠疫菌均为强毒菌。鼠疫菌基因型(DFR)检测显示10株玉树市、1株治多县、1株囊谦县分离的菌株为5型,1株囊谦县分离的菌株为7型。结论玉树藏族自治州藏系绵羊分离株鼠疫杆菌具备青藏高原鼠疫病原体特征,增加了当地鼠疫流行传播的风险,应结合流行病学特征,采取有效措施控制鼠疫的发生和流行。 展开更多
关键词 鼠疫 藏系绵羊 生态流行病学 玉树藏族自治州
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棕形额蚤传播鼠疫媒介效能的实验研究 被引量：15
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作者 赵文红 何晋候 +2 位作者 张洪英 梁云 胡晓玲 《中国地方病防治》 北大核心 1996年第5期274-275,共2页
棕形额蚤Frontopsylla spadix是一广布蚤种,在云南剑川野鼠鼠疫疫源地种群组成中居第4位,是齐氏姬鼠、黄胸鼠、褐家鼠的重要寄生蚤之一,在该疫源地棕形额蚤的自然感染率为0.67％,1975～1994年从此蚤分离到鼠疫菌14株,仅次于方叶栉眼蚤... 棕形额蚤Frontopsylla spadix是一广布蚤种,在云南剑川野鼠鼠疫疫源地种群组成中居第4位,是齐氏姬鼠、黄胸鼠、褐家鼠的重要寄生蚤之一,在该疫源地棕形额蚤的自然感染率为0.67％,1975～1994年从此蚤分离到鼠疫菌14株,仅次于方叶栉眼蚤而高于特新蚤指名亚种。为弄清云南剑川野鼠鼠疫疫源地主要蚤种的媒介地位,作者系统研究了棕形额蚤传播鼠疫的媒介效能。1 材料和方法1.1 材料1.1.1 实验室 全自动恒温恒湿室,面积10m^2,温度19±0.5C,湿度80±5％。1.1.2 实验动物 展开更多
关键词 鼠疫 鼠疫杆菌 棕形额蚤 传播
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