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基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析 被引量：2

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摘要 SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒已被世界卫生组织确认为SARS传染病的病原体,它的全基因组测序工作分别由中国、加拿大、美国等国的研究小组完成。然而它的起源仍是一个谜为了探寻SARS冠状病毒的来源,基于FDOD(function of degree of disagreement)方法,对12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒进行了全基因组比较,构造出种系进化无根树。结果表明,这两类病毒(分别由12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒构成)虽然都来自冠状病毒属,但它们位于两个不同的进化分支上。冠状病毒属中的3个组被准确地重构。根据得到的结果,推测SARS冠状病毒更类似于第一组中的冠状病毒。根据种系进化树的拓扑结构和各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系,推测各SARS冠状病毒分离株分别位于进化树上两个大的分支,这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息。
作者 齐震 狐昱 李蔚 陈燕俊 张治华 孙世伟 卢宏超 张京芬 卜东波 凌伦奖 陈润生
机构地区 中国科学院生物物理研究所 中国科学院计算技术研究所 中国科学院北京基因组研究所
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第12期1242-1245,共4页 Chinese Science Bulletin
基金 国家高技术研究发展计划(批准号:2002AA231031) 中国科学院知识创新工程(批准号:KSCX2-2-07和KJCX1-08)资助项目.
关键词 SARS冠状病毒 种系进化 传染途径 FDOD
分类号 R373 [医药卫生—病原生物学]
  • 相关文献

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共引文献16

同被引文献21

  • 1秦鄂德,祝庆余,于曼,范宝昌,常国辉,司炳银,杨保安,彭文明,姜涛,刘伯华,邓永强,刘洪,张雨,王翠娥,李豫川,甘永华,李晓萸,吕富双,谭刚,曹务春,杨瑞馥,汪建,李蔚,徐祖元,李彦,吴清发,林伟,陈维军,唐琳,邓亚军,韩玉军,李昌峰,雷蒙,李国庆,李文杰,吕宏,石建萍,童宗中,张峰,李松岗,刘斌,刘斯奇,董伟,王俊,黄家树,于军,杨焕明.SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析[J].科学通报,2003,48(11):1127-1134. 被引量：17
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引证文献2

二级引证文献4

科学通报
2003年 第12期

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