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基于信息离散性度量方法的大肠杆菌全基因组比较研究

Research on Genome Comparison of Escherichia coli Based on a New Measure of Information Discrepancy
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摘要 应用方伟武教授提出的一种新的信息离散性度量方法———FDOD (functionofdegreeofdisagreement)方法对致病性大肠杆菌O1 5 7∶H7和非致病性大肠杆菌K 1 2的全基因组序列进行了比较 ,分析了二者的相似序列部分 ,及差异较大的序列部分 ,证实了大肠杆菌O1 5 7∶H7核酸序列注释中可能致病的特有序列与正常序列的不同。 A new information theory method,which is noted for FDOD (function of degree of disagreement) to compare genome sequences of Escherichia coli O157∶H7 with Escherichia coli K\|12 was applied.In this process,it gets their similar sequences and verifies the special sequences of Escherichia coli O157∶H7 as their annotation illustrate.
出处 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2003年第11期57-62,共6页 China Biotechnology
基金 国家自然科学基金资助项目 ( 90 10 3 0 3 3 ) ( 2 0 1760 0 5)
关键词 致病性大肠杆菌 子序列分布 信息熵 基因组 信息离散性度量法 Escherichia coli O157:H7 Subsequence distribution Information discrepancy
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