期刊文献+

水稻基因组中的小RNA

原文传递
导出
摘要 水稻是一种很重要的模式植物,其基因组框架图的完成将对植物生物学和遗传进化学等学科的研究做出巨大贡献.目前,水稻科研工作者们在绘制水稻完成图谱的同时,也正在对水稻中基因和非编码区序列进行着深入的研究.非编码RNA在生物系统中有着很重要的作用.小RNA是非编码RNA的一种,我们在水稻基因组中寻找已知小RNA序列,并且在拟南芥、玉米、酵母、线虫、老鼠和猪这6个物种中一一进行比对,结果在552个小RNA的数据库中找到160个小RNA,它们存在于水稻的108个Scaffold中,其中绝大部分(99.41%)都位于基因预测的内含子区.19个小RNA只存在于水稻基因组中.发现了两段U14小RNA保守片段,一段是位于同系列的5个小RNAZMU14SNR9(s)中,它们只出现在3个植物物种上,其中86%序列都是和水稻、拟南芥、玉米重复的序列;另一段保守的小RNA是XLHS7CU14,它出现在除猪以外的其他6个物种中.所有这些结果显示小RNA在植物和动物之间并没有明显的界限.
出处 《中国科学(C辑)》 CSCD 北大核心 2002年第6期494-499,共6页 Science in China(Series C)
  • 相关文献

参考文献8

  • 1地军,胡松年,等.灿稻(Oryza Sativa ssp.indica)全基因组框架序列[J].科学通报,2001,46(23):1937-1941. 被引量:15
  • 2Yu J, Hu S N, Wang J, et al. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativaL. ssp. indica). Science, 2002, 296: 79~91
  • 3Eddy S R, Noncoding RNA genes. Curr Opin Genet Dev, 1999, 9: 695-699
  • 4Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendecket W, et al. Identification of novel genes coding for small expressed RNAs. Science, 2001, 294: 853~858
  • 5Altschul S F, Gish W, Miller W, et al. Basic local alignment search tool. J Mol Biol, 1990, 215: 403-410
  • 6Thompson J D. CLUSTALW: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Research, 1994, 22: 4673
  • 7Xia L, Liu J, Sage C, et al. Intronic U14 snoRNAs of Xenopus laevis are located in two different parent genes and can be processed from their introns during early oogenesis. Nucleic Acids Research, 1995, 23(23): 4844~4849
  • 8Storz G. An expanding universe of noncoding RNAs. Science, 2002, 296(5571): 1260-1263

二级参考文献2

共引文献14

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部