摘要
目的 基于ESTIMATE算法探讨胃腺癌(Stomach adenocarcinoma,STAD)肿瘤微环境中基质评分和免疫评分与STAD患者的预后和临床特征相关性,并提出了几个与肿瘤微环境相关的STAD预后生物标志物。方法 我们使用来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的数据和ESTIMATE算法评估了STAD的基质和免疫评分,评价评分与STAD患者预后和临床特征的关系。根据评分获得差异表达基因,并鉴定预后相关基因。功能富集分析和蛋白互作网络(PPI网络)进一步揭示这些基因参与的生物学过程。结果 基质评分与STAD患者的预后相关,基质及免疫评分均与临床特征相关。通过基质和免疫评分识别出241个共同差异基因,组建出一个PPI网络,同时进行单变量Cox回归分析。接下来对PPI网络中的核心节点基因与上述单变量Cox回归分析获取的显著性基因交叉分析,获得11个与STAD患者生存相关的基因,分别是:MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5。我们选择其中三个关键基因(MPO,ELANE和BPI)进行单基因分析,并阐明它们与临床病理特征的关系。结论 肿瘤微环境的基质和免疫评分与STAD患者的预后及临床特征相关,我们确定了11个可能与肿瘤微环境相关并影响STAD患者预后的基因(MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5),其中MPO、ELANE和BPI可能是STAD潜在的预后标志物和治疗靶点。
出处
《现代消化及介入诊疗》
2022年第11期1436-1442,共7页
Modern Interventional Diagnosis and Treatment in Gastroenterology
基金
安徽省自然科学基金(1908085MH262、2008085QH379、2008085QH413)
2019年度医学物理与技术安徽省重点实验室开放基金(LMPT201907)。
