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一种高密度基因芯片设计的新方法 被引量:5

A New Method of High Density Gene Chip Design
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摘要 基因芯片是一种由高密度寡核苷酸探针所形成的微阵列 .本文首先提出一种基因芯片上寡核苷酸探针设计的新思想 ,即变长变覆盖探针优化设计方法 ,通过该方法设计的寡核苷酸探针的杂交解链温度最大程度地保持一致 ,可有效地减少碱基杂交错配 ,提高基因芯片检测结果的可靠性 .根据上述核心思想 。 Gene chip is a kind of microarray with high density of oligonucleotide.In this paper,we present a new approach of gene chip design,by which an optimum set of oligonucleotide probes can be generated using dynamic programming.The probes have nearly the same melting temperature Tm,and are of variable length and variable overlap.The methods of designing gene chips detecting DNA mutation or SNPs are also proposed in this paper.
出处 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第3期293-296,共4页 Acta Electronica Sinica
基金 国家自然科学基金!(No .69971 0 1 0 )
关键词 基因芯片 探针设计 动态规划 DNA芯片 gene chip probe design dynamic programming
  • 相关文献

参考文献1

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同被引文献43

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引证文献5

二级引证文献18

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