摘要
利用分子力学和量子化学方法研究了双铂核药物[{transPtCl(NH_(3))_(2)}_(2)(μNH_(2)(CH_(2))_(n)NH_(2))]^(2+)与寡聚DNA片段d(ATATGTACATAT)·d(ATGTGTACATAT)复合物的几何构型和电子结构.计算结果表明,Pt配合物与DNA中碱基G的N7原子形成了较强的配位键,并与O6原子之间存在较强的静电作用,使药物与DNA产生稳定作用,药物中的烃链的伸缩性使得DNA在键合药物后其构型并未发生大的变化.同时,铂配合物中配体NH3上的H与其邻近的鸟嘌呤的O6,DNA中磷酸根上的O以及与其邻近的碱基T上的O或N等电负性较大的原子间形成的氢键及弱氢键也是影响Pt配合物与DNA键合及其几何结构变化的重要因素.这些化学键和氢键是药物分子能够对DNA进行识别的重要基础.因此,可以认为药物结合后所引起DNA的变形较小可能是药物与顺铂产生不同的抗癌机理的主要原因.
Detailed studies of the geometrical and electrical configuration of the composite compound of the di-nuclear platinum compound[{trans-PtCl(NH_(3))_(2)}_(2)(μ-NH_(2)(CH_(2))_(n)NH_(2))]^(2+)and the 12-mer duplex d(ATATG^(*)TACATAT)·d(ATATG^(*)TACATAT)were performed by using the molecular mechanics and quantum chemistry methods.The investigating result shows that the coordinate bonds between Pt of the dinuclear platinum composite compound and two N7's of guanines in the DNA duplex are the most important interaction and hydrogen bond interactions are critical factors influencing the configuration of the composite compound.Based on the calculation results,we claim that little distortion of DNA binding the di-nuclear platinum complex may result in a significantly different antitumor activity from cis-platin.
作者
黄素兰
郝兰
谭宏伟
陈光巨
HUANG Su—Lan;HAO Lan;TAN Hong—Wei;CHEN Guang—Ju(Department of Chemistry,Bering Normal University,Being 100875,China)
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期531-534,共4页
Chemical Journal of Chinese Universities
基金
国家自然科学基金(批准号:20231010,20271009)
国家重点基础研究发展计划(批准号:G2004CB719900,G2000078101)资助.
