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《微生物学通报》 CSCD 北大核心

作品数10334被引量60218H指数63
《微生物学通报》(月刊)是由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办,以微生物学基础研究及技术创新与应用为主的综合性学术期刊。本刊为中文核心期刊、中国科技核心期刊、CSCD核心期刊,曾获国家优秀科技...查看详情>>
  • 主办单位中国科学院微生物研究所;中国微生物学会
  • 国际标准连续出版物号0253-2654
  • 国内统一连续出版物号11-1996/Q
  • 出版周期月刊
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热休克蛋白100家族ClpL对猪链球菌2型应激和致病性的影响 被引量:1
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作者 祝昊丹 王锐 +4 位作者 周俊明 王丹丹 胡屹屹 倪艳秀 李彬 《微生物学通报》 北大核心 2025年第2期668-678,共11页
【背景】酪蛋白水解蛋白酶L(caseinolytic protease L,ClpL)是热休克蛋白100(heat shock protein 100,HSP100)家族成员,参与多种细胞内生物学过程包括应激耐受反应、长期存活、毒力和抗生素抗性等,在病原菌的致病过程中发挥重要作用。... 【背景】酪蛋白水解蛋白酶L(caseinolytic protease L,ClpL)是热休克蛋白100(heat shock protein 100,HSP100)家族成员,参与多种细胞内生物学过程包括应激耐受反应、长期存活、毒力和抗生素抗性等,在病原菌的致病过程中发挥重要作用。【目的】阐明HSP100/ClpL对猪链球菌2型(Streptococcus suis type 2)强毒株的应激耐受和毒力的影响。【方法】利用温敏自杀质粒pSET4s构建了SsClpL基因缺失株ΔclpL;利用大肠杆菌-猪链球菌穿梭质粒pSET2构建了互补株CΔclpL;比较亲本株SS2-1、ΔclpL和CΔclpL在各种应激环境(高温、氧化性应激和酸应激)和血液中的生存能力;利用小鼠感染模型和体内竞争试验评价clpL缺失前后细菌的毒力变化。【结果】clpL缺失后,SS2在各种应激环境中的生存能力明显减弱;同时在猪全血中的存活能力也显著降低;对BALB/c小鼠的致病力有所降低,在体内的定殖能力明显降低。【结论】SsClpL与猪链球菌的应激耐受和致病性密切相关。 展开更多
关键词 猪链球菌2型 热休克蛋白100家族ClpL 应激耐受 致病性
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大语言模型+智能评价的“双智”赋能现代工科微生物学混合式课程教学研究与实践 被引量:6
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作者 谢晖 朱守平 +1 位作者 刘鹏 陈雪利 《微生物学通报》 北大核心 2025年第1期445-456,共12页
教育数字化转型背景下的高等教育呈现出多元化、个性化和智能化的发展趋势,传统的教学模式已不能完全满足学生的多样化学习需求。现代工科微生物学课程结合西安电子科技大学电子信息学科优势,以培养具备跨学科创新型电子信息特色生物医... 教育数字化转型背景下的高等教育呈现出多元化、个性化和智能化的发展趋势,传统的教学模式已不能完全满足学生的多样化学习需求。现代工科微生物学课程结合西安电子科技大学电子信息学科优势,以培养具备跨学科创新型电子信息特色生物医学工程优秀人才及未来领军人才为主要目标,具有很强的应用导向性、学科交叉性和深度挑战性,在当今人工智能+教育背景下,深度融合人工智能手段开展教学改革工作的重要性不言而喻。本文通过对我校生物医学工程专业本课程的混合式教学实践情况,重点探讨了基于大语言模型的人机协同学习模式与团队自主研发全过程深度网络智能评价模型在课程设计和教学过程中的应用。一方面鼓励学生科学利用AI技术辅助学习,通过基于大语言模型的人机协同学习模式,充分发挥人工智能技术在辅助教学中的作用。学生与其进行互动式学习,获取所需知识和反馈,提高学习效率。同时,基于全过程智能评价平台发挥引导和监督作用,确保学习质量。研究实践结果表明该教学模式有效提升了教与学的质量和效果,为数字化转型背景下的高等教育课程改革实践提供了一定的范式和经验。 展开更多
关键词 大语言模型 全过程智能评价 现代工科微生物学 混合式教学 人机协同学习
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欧文氏菌H3和克锡勒氏菌S10的筛选与鉴定及其耐盐促生效果
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作者 薛沛成 于祖隆 +3 位作者 高志伟 魏明 成斌 伍国强 《微生物学通报》 北大核心 2025年第9期4038-4054,共17页
【背景】盐胁迫下部分植物根际微生物可促进农作物生长。【目的】从甘肃省兰州市和景泰县盐碱地植物根际中分离筛选耐盐菌株,测定植物促生特性。【方法】通过耐盐能力、生理生化特征和16S rRNA基因测序对菌株H3和S10进行菌种鉴定;在150 ... 【背景】盐胁迫下部分植物根际微生物可促进农作物生长。【目的】从甘肃省兰州市和景泰县盐碱地植物根际中分离筛选耐盐菌株,测定植物促生特性。【方法】通过耐盐能力、生理生化特征和16S rRNA基因测序对菌株H3和S10进行菌种鉴定;在150 mmol/L NaCl胁迫下检测2株菌对小麦(Triticum aestivum)幼苗的促生作用。【结果】菌株H3和S10对NaCl耐受性分别为11%和21%,2株菌具有固氮、溶磷、解钾、产铁载体和吲哚-3-乙酸的促生效果,经鉴定菌株H3为欧文氏菌(Erwinia sp.),菌株S10为克锡勒氏菌(Kushneria sp.)。在正常条件和盐胁迫下,复合接种比单独接种更能显著促进小麦幼苗生长,也能更好地增加小麦可溶性物质积累以及提高抗氧化酶系统活性,更有利于缓解盐胁迫对小麦幼苗的不利影响。【结论】单独接种和复合接种均能显著提高小麦耐盐性,并且复合接种的效果优于单独接种。 展开更多
关键词 植物根际促生菌 欧文氏菌 克锡勒氏菌 耐盐性 复合接种
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微生物调控小麦金属元素吸收与积累的研究进展
4
作者 师旖旎 肖宏坤 +2 位作者 齐艳利 李成伟 孙忠科 《微生物学通报》 北大核心 2025年第7期2984-2996,共13页
作为主粮,小麦对保障国家粮食安全和人民食品安全至关重要。金属矿质元素对植物生长和人类膳食健康都具有重要作用。小麦生产中,既面临土壤有害微量矿质元素过量胁迫植物生长的问题,也面临有益矿质元素积累不足的问题。作为主粮,小麦籽... 作为主粮,小麦对保障国家粮食安全和人民食品安全至关重要。金属矿质元素对植物生长和人类膳食健康都具有重要作用。小麦生产中,既面临土壤有害微量矿质元素过量胁迫植物生长的问题,也面临有益矿质元素积累不足的问题。作为主粮,小麦籽粒中有益微量矿质元素不足会导致人类严重的健康障碍,被称为“隐性饥饿”,是重要的营养问题。微生物能够环保高效地阻控或促进小麦吸收微量矿质元素,这为缓解矿质元素过量导致的非生物胁迫和可食部分积累不足导致的营养强化问题提供了绿色方案。一方面,本文从微生物-植物互作角度出发,以有害矿质元素(Cu,Cd)为例,总结了微生物阻抗小麦对这2种元素的吸收策略,以及缓解它们胁迫的分子机制。另一方面,本文分析了微生物对小麦吸收、转运和积累2种有益矿质元素(Fe,Zn)的调节作用。特别是解析了内生菌促进小麦富集铁和锌元素的机制,展望了其在绿色高效农业发展方面的前景,为微生物促进小麦高效生产和品质提升提供了理论参考和应用指导。 展开更多
关键词 小麦 微生物 微量元素稳态 非生物胁迫 营养强化
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工程化沙门氏菌外膜囊泡在疫苗应用中的研究进展
5
作者 张雯瑾 刘欣雨 +3 位作者 陈垚霖 卞晓萍 刘青 孔庆科 《微生物学通报》 北大核心 2025年第8期3657-3668,共12页
近年来,外膜囊泡(outer membrane vesicles,OMVs)已在新型疫苗的开发和传染病的预防中得到应用。沙门氏菌(Salmonella)OMVs是一种非复制纳米级球状颗粒,具有良好的免疫原性,可作为免疫佐剂;也可作为异源抗原的递送载体,诱导宿主产生针... 近年来,外膜囊泡(outer membrane vesicles,OMVs)已在新型疫苗的开发和传染病的预防中得到应用。沙门氏菌(Salmonella)OMVs是一种非复制纳米级球状颗粒,具有良好的免疫原性,可作为免疫佐剂;也可作为异源抗原的递送载体,诱导宿主产生针对异源抗原的特异性免疫反应。因此,沙门氏菌OMVs逐渐成为研发高效新型疫苗的理想载体。现对OMVs的组成成分、形成机制、制备方法以及沙门氏菌来源的OMVs载体在疫苗研究中的应用优势与现状、现存问题和解决思路进行阐述,以期为沙门氏菌OMVs在疫苗领域的构建、开发及其应用方面提供思路。 展开更多
关键词 外膜囊泡 疫苗 沙门氏菌 疫苗载体
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猪δ冠状病毒S1蛋白的真核表达及多克隆抗体制备
6
作者 崔世龙 魏晓锋 +4 位作者 司伏生 于瑞嵩 董世娟 陈冰清 李春华 《微生物学通报》 北大核心 2025年第9期4171-4181,共11页
【背景】猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)是2012年首次报道的一种猪肠道冠状病毒,主要引起以腹泻、呕吐和脱水为特征的猪胃肠道疾病,与猪流行性腹泻、猪传染性胃肠炎等的临床症状类似,难以区别。PDCoV具有4种结构蛋白,棘... 【背景】猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)是2012年首次报道的一种猪肠道冠状病毒,主要引起以腹泻、呕吐和脱水为特征的猪胃肠道疾病,与猪流行性腹泻、猪传染性胃肠炎等的临床症状类似,难以区别。PDCoV具有4种结构蛋白,棘突(spike,S)蛋白位于PDCoV病毒粒子表面,由S1和S22个亚基组成,是病毒中和抗体的主要靶标。【目的】应用真核系统表达PDCoV S1蛋白并进行纯化,制备该蛋白的多克隆抗体。【方法】通过RT-PCR技术扩增PDCoV CHN-JS-2018的S1基因,连接到pCAGGS真核表达载体中,构建pCAGGS-PDCoV-S1-mFc和pCAGGS-PDCoV-S1-hFc真核表达质粒,经测序正确后转染HEK293T细胞,采用间接免疫荧光(immunofluorescence assay,IFA)和Western blotting检测重组蛋白表达。以纯化的PDCoV-S1-mFc重组蛋白免疫BALB/c小鼠,制备多克隆抗体,IFA检验多抗血清的反应原性,间接ELISA测定多抗血清效价。【结果】构建的pCAGGS-PDCoV-S1-mFc和pCAGGS-PDCoV-S1-hFc真核表达质粒能够在HEK293T细胞中表达,并与PDCoV阳性小鼠血清特异性结合,制备的PDCoV S1重组蛋白的多克隆抗体效价达到1:64000以上,中和抗体效价为1:185,可用于猪δ冠状病毒检测的间接免疫荧光试验、Western blotting检测。【结论】本研究真核表达的PDCoV S1重组蛋白具有较强的免疫原性,可诱导小鼠产生较高效价的抗体,制备的多克隆抗体具有良好的反应性和中和活性,为后续开展PDCo V诊断、S1单克隆抗体制备、疫苗研制等奠定了基础。 展开更多
关键词 猪δ冠状病毒 S蛋白 真核表达 多克隆抗体
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微生物细胞工厂利用果糖合成高价值化学品
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作者 刘志强 曹伟洁 +2 位作者 薛怀千 冯旭东 刘护 《微生物学通报》 2025年第11期4942-4958,共17页
果糖是动植物和微生物中参与代谢的重要单糖之一。以果糖为原料,通过微生物细胞工厂合成高附加值化学品,是实现绿色生物制造的关键。果糖是生物体糖代谢中可利用的第二大单糖,因此构建高效代谢果糖的微生物细胞工厂对其利用有重要意义... 果糖是动植物和微生物中参与代谢的重要单糖之一。以果糖为原料,通过微生物细胞工厂合成高附加值化学品,是实现绿色生物制造的关键。果糖是生物体糖代谢中可利用的第二大单糖,因此构建高效代谢果糖的微生物细胞工厂对其利用有重要意义。但与葡萄糖相比,大部分微生物代谢果糖的效率较低,这限制了果糖的应用。随着微生物代谢机制的深入研究和现代生物技术的发展,相关科研成果显著提高了微生物代谢果糖的效率,并拓展了其衍生品的种类。本文通过综述生物中存在的果糖代谢途径及其主要衍生产品,总结了不同底盘细胞利用果糖的代谢调控策略,概括了利用果糖合成相关产品的技术方案和研究进展,最后对其技术瓶颈和未来的发展方向进行了讨论和展望。 展开更多
关键词 果糖 果糖代谢途径 微生物细胞工厂
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人工智能辅助综合设计性实验教学:以“环境微生物检测实验项目”为例
8
作者 何宝燕 王立立 +2 位作者 谢志旺 陆钢 李取生 《微生物学通报》 2025年第11期5406-5414,共9页
综合设计性实验是本科实验教学的重中之重,是培养本科生综合实践和创新能力的主要举措之一。目前多数综合设计性实验由教师设计,学生按照既定步骤完成,不利于学生自主创新能力的培养。本文以环境微生物实验课程中的微生物检测项目为例,... 综合设计性实验是本科实验教学的重中之重,是培养本科生综合实践和创新能力的主要举措之一。目前多数综合设计性实验由教师设计,学生按照既定步骤完成,不利于学生自主创新能力的培养。本文以环境微生物实验课程中的微生物检测项目为例,基于人工智能(artificial intelligence, AI)技术,引导学生以解决实际科学问题为导向,自主选题、设计实验方案、规范操作,按照国家相关行业标准评价实验结果,并在实验报告中引入“科技报告范式”,帮助学生建立科学思维和自主探究能力。教师利用AI批改学生的实验方案、实验报告等,并建立全过程、多维度的实验项目评价体系,引导学生在实践过程中培养自身的综合创新能力和团队合作精神。本案例将为AI赋能实验教学提供经验和借鉴。 展开更多
关键词 人工智能 环境微生物 实验教学 综合设计性实验 案例
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《微生物学通报》第十一届编委会名单
9
《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期F0003-F0003,共1页
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Species diversity of Hygrophorus(Hygrophoraceae,Agaricales)in Shanxi Province and description of Hygrophorus brunneodiscoides sp.nov. 被引量:1
10
作者 ZHANG Yuxin MAO Ning +2 位作者 LI Ying LI Ting FAN Li 《微生物学通报》 CSCD 北大核心 2024年第12期5159-5176,共18页
[Background]Hygrophorus,belonging to Basidiomycota,Agaricomycetes,Agaricales,Hygrophoraceae,is widely distributed all around the world.[Objective]To investigate the species of Hygrophorus and enrich the knowledge abou... [Background]Hygrophorus,belonging to Basidiomycota,Agaricomycetes,Agaricales,Hygrophoraceae,is widely distributed all around the world.[Objective]To investigate the species of Hygrophorus and enrich the knowledge about the species diversity of this genus in Shanxi Province.[Methods]We collected fungal specimens,observed and characterized their morphology.After DNA extraction,the internal transcribed spacer(ITS)was sequenced.Phylogenetic trees were constructed based on the maximum likelihood method and Bayesian inference.[Results]Eleven species of Hygrophorus were identified based on the morphological and molecular evidence,including ten known species and a new species.This article described the macroscopic and microscopic morphological characteristics of the new species Hygrophorus brunneodiscoides in detail.The basidiocarp photos of ten known species and a key to the species of Hygrophorus in Shanxi Province were provided.[Conclusion]We identified a new species,H.brunneodiscoides,in China,confirmed 11 species of Hygrophorus in Shanxi Province,and briefed their geographical distribution and associations with hosts according to the field observation. 展开更多
关键词 edible mushroom novel species TAXONOMY BASIDIOMYCETES
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通过基于功能微生物的项目式学习来提升本科生科研素养 被引量:3
11
作者 崔泽林 姚玉峰 +3 位作者 刘畅 李擎天 郭晓奎 冯婷婷 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1355-1362,共8页
本科生科研素养的养成对其继续深造具有重要意义,如何有效培养学生的科研能力并使其养成良好的科研素养成为当下高等教育亟须探究的重要议题。本研究尝试通过基于学生的兴趣爱好对具有一定知识背景的本科生进行分组,以小组形式分别对某... 本科生科研素养的养成对其继续深造具有重要意义,如何有效培养学生的科研能力并使其养成良好的科研素养成为当下高等教育亟须探究的重要议题。本研究尝试通过基于学生的兴趣爱好对具有一定知识背景的本科生进行分组,以小组形式分别对某特定生境来源微生物的分离、筛选、鉴定及其功能进行项目式研究来培养学生的科研素养。这种以学生为主体的自主研究能够激发学生主动学习热情,培养学生学习的自主性和科研素养。研究发现对该类项目的研究首先能涵盖传统实验课程所涉及的基础实验内容,有助于微生物实验基本操作的系统掌握;其次,以小组的方式使得学生的主观能动性和团队协作能力得到发挥,各小组均能分离到相关目标微生物,并能完成对目标微生物基本特性和功能的研究;最后,能就目标微生物相关领域某主题发表综述论文,有效培养学生的科研素养。由此可见,特殊生境功能微生物分离、筛选及鉴定的项目式研究不失为高校本科生科研素养培养的重要题材。 展开更多
关键词 功能微生物 分离和鉴定 项目式学习 科研素养
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马尔尼菲篮状菌Septin基因家族鉴定及表达分析
12
作者 张单 何涓 +2 位作者 王仁巧 黄买银 李玉叶 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4535-4544,共10页
【背景】马尔尼菲篮状菌(Talaromyces marneffei)是重要的致死性病原真菌。【目的】探究T.marneffei隔膜蛋白Septin基因家族的基本特征和表达模式。【方法】通过生物信息学方法鉴定T.marneffei Septin基因家族成员,并分析基因结构、理... 【背景】马尔尼菲篮状菌(Talaromyces marneffei)是重要的致死性病原真菌。【目的】探究T.marneffei隔膜蛋白Septin基因家族的基本特征和表达模式。【方法】通过生物信息学方法鉴定T.marneffei Septin基因家族成员,并分析基因结构、理化性质、二级结构、三级结构和亚细胞定位,同时通过实时荧光定量PCR技术分析Septin基因家族在T.marneffei菌丝相和酵母相不同时相的表达情况。【结果】共鉴定出5个Septin基因家族成员,氨基酸长度在346-575 aa之间,均具有GTP-CDC结合域,均属于亲水性蛋白。亚细胞定位主要位于细胞核和线粒体基质。二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,三级结构复杂。不同病原真菌核心Septin高度保守。TmSep2和TmSep4 mRNA表达量在酵母相较菌丝相明显升高,TmSep5 mRNA表达量在酵母相较菌丝相明显降低。TmSep1和TmSep3 mRNA表达量在酵母相较菌丝相略有上升,但无显著差异。【结论】Septin基因家族各基因在T.marneffei双相转换不同时相表达情况不同,部分差异显著,暗示其可能在T.marneffei双相形态转换和致病中发挥重要作用。本研究为进一步探究Septin在T.marneffei中发挥的功能及调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 马尔尼菲篮状菌 隔膜蛋白 生物信息学分析 实时荧光定量PCR 基因表达
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脓毒症与肠道微生物疗法的文献计量学和可视化分析
13
作者 周飞 罗利亚 +5 位作者 陈雷 刘紫怡 张婧 党倩倩 洛松巴宗 董晨明 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3706-3723,共18页
【背景】肠道微生物在脓毒症发生发展中的机制已被广泛报道,基于肠道微生物群在脓毒症中的重要作用,微生物疗法通过调节肠道微生物群结构或产物的方式或许能够成为脓毒症常规治疗之外的有效补充,然而微生物疗法的安全性问题一直是限制... 【背景】肠道微生物在脓毒症发生发展中的机制已被广泛报道,基于肠道微生物群在脓毒症中的重要作用,微生物疗法通过调节肠道微生物群结构或产物的方式或许能够成为脓毒症常规治疗之外的有效补充,然而微生物疗法的安全性问题一直是限制其大规模应用的主要因素。我国脓毒症患者的数量众多,并且在脓毒症与微生物疗法相关研究领域起步较晚,通过分析和借鉴国际上有关于脓毒症与肠道微生物疗法的相关研究,对推动我国在该领域的深入发展具有重要意义。【目的】分析脓毒症与肠道微生物疗法的研究现状、研究热点与前沿趋势。【方法】检索Web of Science(WOS)核心合集数据库和中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)数据库中2001年1月至2023年11月期间收录的关于脓毒症与肠道微生物疗法的相关文献,通过CiteSpace软件对其发文量、发文国家、发文机构、发文作者、期刊和关键词等进行可视化分析。【结果】经过数据检索和筛选,最终于WOS核心合集数据库纳入可供分析的文献807篇、CNKI数据库49篇。从WOS发现,在脓毒症与肠道微生物疗法研究中发文量最多的国家为美国(the United States,the US),中心度最高的国家为瑞典(Sweden);发文量最多的机构为西澳大学(University of Western Australia),而中心度最高的为伦敦大学(University of London),高产作者有PATOLE S、RAO S、ATHALYEJAPE G和FANG H等,高频关键词包括necrotizing enterocolitis、sepsis、double blind、preterm infants和gut microbiota等,主要聚类方向有#0 necrotizing enterocolitis、#1 enteral nutrition、#2 preterm infants、#3 fecal microbiota transplantion、#4 critical care、#5 Escherichia coli、#6 sepsis和#7 acute pancreatitis等。从CNKI可知,国内主要研究机构有南方医科大学、郑州大学和河北医科大学等,关键词包括脓毒症、益生菌、肠道菌群和肠内营养等,主要聚类方向为#0免疫功能、#1肠道菌群、#2肠内营养、#3脓毒症、#4感染和#5粪菌移植等。【结论】利用CiteSpace软件对脓毒症与肠道微生物疗法的研究进行文献计量及可视化分析,发现该研究方向持续受到全球各科研机构及研究者的关注,脓毒症和necrotizing enterocolitis这两个关键词分别代表了国内外脓毒症与肠道微生物疗法相关研究中的热点词,并且该领域的研究正逐步从探索研究阶段向临床应用转变。 展开更多
关键词 脓毒症 益生菌 肠道菌群 微生物疗法 坏死性小肠结肠炎 文献计量学 可视化分析
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在“微生物遗传学”课程全英文教学中提升教学效果的探索 被引量:1
14
作者 吴卫辉 靳永新 +2 位作者 李明春 喻其林 魏东盛 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1088-1100,共13页
在双一流建设中,国际交流与合作是重要一环。全英文专业课程能够在加强学生对专业知识的掌握、理解和运用能力的同时,提升专业语言的阅读、表述与写作水平。然而,如何在全英文教学中达到“两性一度”的目标,提升学生兴趣和课堂参与度,... 在双一流建设中,国际交流与合作是重要一环。全英文专业课程能够在加强学生对专业知识的掌握、理解和运用能力的同时,提升专业语言的阅读、表述与写作水平。然而,如何在全英文教学中达到“两性一度”的目标,提升学生兴趣和课堂参与度,切实提高学生的专业能力和英语交流能力,值得探究。本校专业选修课“微生物遗传学”全英文教学已超过10年,在教学过程中,突出以学生为本、能力培养的核心理念,对课程内容、教学实施、语言能力和考核方式等方面进行不断的探索和改革。在教学内容上,根据学生的知识储备和需求,将知识学习与科学逻辑和实验技术融会贯通;在课堂教学过程中,结合学生的英语水平,将讲授、提问和讨论有机结合,提升学生专注度和英文交流能力;在习题设计上,采用拓展性问题使学生对课堂知识活学活用;在考试内容和形式上,采用开放模式锻炼学生运用专业知识结合英文文献解决问题的能力,达到提升科研水平的目标。经过不断地探索与实践,本课程激发了学生主动学习的热情和课堂参与度,使学生们在充分理解、掌握课堂内容的基础上,提升了科研能力和专业英语水平,取得了良好的全英文教学效果。 展开更多
关键词 微生物遗传学 全英文教学 教学质量
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仙山湖国家湿地公园湿地与旱地土壤细菌群落结构特征比较 被引量:2
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作者 曾慧慧 蒋敏 +5 位作者 赵明星 张宪翠 朱力力 毛伟华 吴酬飞 张立钦 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1983-1994,共12页
【背景】湿地土壤微生物群落结构会因环境的变化自我调整,因而不同湿地环境会形成不同土壤菌群结构和分布特征。【目的】研究旱地与湿地土壤不同利用方式对土壤细菌的影响,以仙山湖国家湿地公园湿地和旱地两种土地利用方式(0-20 cm)作... 【背景】湿地土壤微生物群落结构会因环境的变化自我调整,因而不同湿地环境会形成不同土壤菌群结构和分布特征。【目的】研究旱地与湿地土壤不同利用方式对土壤细菌的影响,以仙山湖国家湿地公园湿地和旱地两种土地利用方式(0-20 cm)作为研究对象。【方法】利用高通量测序技术对土壤细菌群落的物种组成、α多样性和丰度等进行分析,并结合土壤理化因子分析影响菌群结构的环境因子。【结果】仙山湖湿地系统土壤中存在的细菌隶属于49个门147个纲。在仙山湖湿地土壤的优势菌门(OTU>1%)中,旱地的优势菌门为酸杆菌门(Acidobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、泉古菌门(Crenarchaeota)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)和拟杆菌门(Bacteroidetes);湿地的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)。在优势菌属(OTU>0.3%)中,旱地的优势菌属为Candidatus Solibacter、柯里氏念珠菌属(CandidatusKoribacter)、红游动菌属(Rhodoplanes)、伯克霍尔德菌属(Burkholderia)和分枝杆菌属(Mycobacterium),湿地的优势菌属为地杆菌属(Geobacter)、拟杆菌属(Bacteroides)、慢生型根瘤菌属(Bradyrhizobium)、Dok59、神奇甲基菌属(Candidatus Methylomirabilis)和黄杆菌属(Flavobacterium)。湿地土壤与旱地土壤优势OTU均与有机质含量呈正相关,与含水量、pH呈负相关。此外,线性判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)显示了旱地与湿地的土壤生物标记物与土壤理化性质的关系。【结论】土地利用方式变化能显著改变仙山湖国家湿地公园湿地土壤的细菌菌群结构,可为湿地土壤的保护提供理论依据。 展开更多
关键词 湿地 旱地 16S rRNA基因 高通量测序
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环境抗生素耐药性风险评价中最小抑菌浓度的研究进展 被引量:3
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作者 李菲菲 杨文迪 +1 位作者 陈吕军 温东辉 《微生物学通报》 CSCD 北大核心 2024年第12期4984-5005,共22页
环境中抗生素耐药性(antimicrobial resistance,AMR)的产生和传播对人类健康构成了严重威胁,最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)是评价环境中抗生素耐药性风险的关键指标。本研究基于文献梳理,发现常用的MIC测试方法... 环境中抗生素耐药性(antimicrobial resistance,AMR)的产生和传播对人类健康构成了严重威胁,最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)是评价环境中抗生素耐药性风险的关键指标。本研究基于文献梳理,发现常用的MIC测试方法中大部分采用肉汤微稀释法,其次是琼脂稀释法和E-test法,测试方法的不同对MIC值的影响不明显。基于EUCAST数据库,梳理了目前针对不同菌种和抗生素的MIC测试数据,发现革兰氏阴性菌(G^(-))的AMR问题得到了更多关注,其MIC数据量远大于革兰氏阳性菌(G^(+)),然而,G^(+)对抗生素的耐药性比G^(-)更强。鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)和屎肠球菌(Enterococcus faecium)分别是G^(-)和G^(+)中耐药性最强的细菌。有关AMR的研究主要集中于β-内酰胺类抗生素,而磺胺类和多肽类研究相对较少。在所研究的抗生素中,细菌对氨苄西林钠、链霉素和夫西地酸的耐药性最强。本研究梳理和总结了MIC测试方法与数据研究现状,指出目前数据远远不足,建议持续扩大MIC研究的覆盖面,并促进耐药信息共享。 展开更多
关键词 抗生素 抗生素耐药性 最小抑菌浓度 最小选择浓度 风险评价
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基于文献计量的微生物胞外聚合物研究可视化分析 被引量:1
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作者 陈君帅 赵辉 +3 位作者 闫华晓 张威 姚术涵 韩作振 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4768-4786,共19页
【背景】胞外聚合物是微生物分泌的高分子聚合物,在环境治理、材料科学、生物医学等领域具有重要的应用价值。【目的】探讨胞外聚合物研究现状、研究热点和发展趋势。【方法】采用文献计量学方法,基于Web of Science核心合集数据库,检索... 【背景】胞外聚合物是微生物分泌的高分子聚合物,在环境治理、材料科学、生物医学等领域具有重要的应用价值。【目的】探讨胞外聚合物研究现状、研究热点和发展趋势。【方法】采用文献计量学方法,基于Web of Science核心合集数据库,检索近10年胞外聚合物相关文献,利用VOSviewer软件进行统计分析。【结果】胞外聚合物研究发文量呈上升趋势,中国发文量居首,但质量有待提高;研究热点主要集中在环境治理、生物制造和生物矿化等领域;微塑料降解是当前研究热点之一。【结论】本研究为深入了解胞外聚合物研究现状以及把握发展趋势提供了依据。 展开更多
关键词 微生物胞外聚合物 文献计量学 VOSviewer 聚类分析 知识图谱
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贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)JJYY防控土传病害效果评价及其全基因组测序分析和抗菌成分鉴定 被引量:14
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作者 王麒 许婧霞 +7 位作者 张亚妮 孙婧 张升潮 王腊 冯作山 易菊平 杨亚珍 胡洪涛 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期155-171,共17页
【背景】土传病害是世界农业可持续发展的关键限制因子,在我国蔬菜和中药材上发生日趋严重,引起严重的连作障碍。生物防治对环境和农产品安全,是目前研究的热点和重点。【目的】明确对土传病原菌具有广谱抗菌活性菌株JJYY的种类及其防... 【背景】土传病害是世界农业可持续发展的关键限制因子,在我国蔬菜和中药材上发生日趋严重,引起严重的连作障碍。生物防治对环境和农产品安全,是目前研究的热点和重点。【目的】明确对土传病原菌具有广谱抗菌活性菌株JJYY的种类及其防控效果和主要抗菌产物,为新型生物农药开发奠定基础。【方法】结合扫描电镜观察、生理生化分析和16S rRNA基因扩增测序技术鉴定菌株JJYY。分别利用比浊法和菌丝生长抑制法测定该菌提取物对4种土传病原细菌和5种土传病原真菌的EC50,利用盆栽试验评价对番茄青枯病等病害的防控效果。利用二代Illumina NovaSeq与三代PacBioSequel相结合测序技术对菌株JJYY进行全基因组测序,使用PGAP等软件进行基因注释等分析,利用反相制备液相色谱和质谱初步分离鉴定抗菌物质。【结果】菌株JJYY是一株贝莱斯芽孢杆菌(Bacillusvelezensis),该菌提取物对4种土传细菌和5种土传真菌的EC50分别为0.940-1.092 mg/mL和2.733-3.678 mg/mL。对番茄青枯病、菊花根腐病和辣椒枯萎病的最高防效在80.00%-87.74%之间,与化学药剂链霉素或噁霉灵无显著差异(P>0.05)。该菌基因组大小为3929792 bp,编码3895个基因,与B.velezensis JS25R和B.subtilis 168具有3445个和2997个同源编码基因。预测该基因组共有12个次级代谢产物合成功能基因簇。从该菌株提取物中共分离出9种抗菌组分,其中2个初步判定为已知大环内酯类抗生素macrolactin D和7-O-malonyl-macrolactin A。【结论】菌株JJYY是一株对土传病原细菌和真菌病害均有较高防效的贝莱斯芽孢杆菌,该菌基因组与已知贝莱斯芽孢杆菌不同,并产生多种已知和未知的抗菌物质,继续深入分析鉴定其抗菌物质和抗菌机制将为开发新型高效的生物农药奠定良好基础。 展开更多
关键词 贝莱斯芽孢杆菌 土传病害 青枯病 抗菌活性 反相制备液相色谱 质谱
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亮斑扁角水虻幼虫酶解制备蛋白胨工艺优化及蛋白胨性质 被引量:3
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作者 马石霞 刘高强 +5 位作者 冶秀燕 周筱力 李新鹏 刘文钊 丁功涛 陈士恩 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期5337-5349,共13页
【背景】用于餐厨垃圾等有机废弃物处理的亮斑扁角水虻(Hermetia illucens,HI)含有丰富的氨基酸和营养物质,是一种优质、经济的蛋白来源。【目的】利用亮斑扁角水虻幼虫(Hermetia illucens larvae,HIL)制备蛋白胨用于细菌培养,为亮斑扁... 【背景】用于餐厨垃圾等有机废弃物处理的亮斑扁角水虻(Hermetia illucens,HI)含有丰富的氨基酸和营养物质,是一种优质、经济的蛋白来源。【目的】利用亮斑扁角水虻幼虫(Hermetia illucens larvae,HIL)制备蛋白胨用于细菌培养,为亮斑扁角水虻的应用方式提供新的思路。【方法】以亮斑扁角水虻幼虫为原料,利用单因素试验确定最佳酶解条件,对比分析HIL蛋白胨和市售胰蛋白胨的基本性质和功能性状,并进行细菌培养、生物化学试验,利用两种蛋白胨分别培养大肠杆菌(Escherichia coli)ATCC 25922模式细菌并通过生长动力学分析评价应用效果。【结果】制备HIL蛋白胨的最佳酶解工艺为按1.3%(质量分数)添加复合酶(胰酶:碱性蛋白酶质量比为1:1),在pH 7.0、54℃条件下反应4 h,此时HIL的水解度为(19.34±0.15)%。HIL蛋白胨和市售胰蛋白胨的功能性状和生物化学试验差异不显著(P>0.05)。大肠杆菌ATCC 25922在HIL蛋白胨培养基中生长的Xmax和λ分别为6.44和2.45,在市售胰蛋白胨生长的Xmax和λ分别为6.14和3.19,差异均不显著(P>0.05)。【结论】在培养大肠杆菌时,HIL蛋白胨可以替代胰蛋白胨作为微生物培养基的成分。 展开更多
关键词 亮斑扁角水虻幼虫 蛋白胨 细菌培养 生长动力学
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2023年中国微生物学会及各专业委员会学术活动计划表
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《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期I0005-I0006,共2页
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