期刊文献+
共找到239篇文章
< 1 2 12 >
每页显示 20 50 100
HSVd靶向性ds-sRNA对感病番茄miRNA表达影响的分析
1
作者 李经纬 唐文琨 +2 位作者 严溢 王娅 张万萍 《核农学报》 CAS 北大核心 2025年第2期262-274,共13页
序列与类病毒基因组一致的外源ds-sRNA可在短时间内沉默类病毒基因组,miRNAs广泛参与基因表达调控,在这一生物过程中发挥重要作用。为了挖掘参与外源ds-sRNA沉默类病毒基因组的核心miRNAs,通过对感染啤酒花矮化类病毒(HSVd)的番茄植株... 序列与类病毒基因组一致的外源ds-sRNA可在短时间内沉默类病毒基因组,miRNAs广泛参与基因表达调控,在这一生物过程中发挥重要作用。为了挖掘参与外源ds-sRNA沉默类病毒基因组的核心miRNAs,通过对感染啤酒花矮化类病毒(HSVd)的番茄植株外源施用靶向基因组不同分区的dssRNA,并在施用后不同时间段测定类病毒全基因组滴度,确定靶向HSVd中央保守区的ds-sRNA施用36 h对HSVd沉默效率最佳。基于最佳处理,对样本进行miRNA-seq、降解组测序以及关键miRNAs的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。结果表明,与ddH2O处理对照相比,miRNA-seq中检出参与调控植物抗性的sly-MIR10528-p3和参与调控基因沉默的ptc-miR162a_R+1的表达量变化显著,qRT-PCR检出目标miRNA表达趋势与测序数据一致;降解组检测中,sly-MIR10528-p3和ptc-miR162a_R+1的表达趋势与miRNA-seq检测结果基本一致,另外检出参与调控病毒防御的sly-miR162、调控非生物胁迫抗性的vvi-miR3630-3p_L-2R-1_1ss21AT和参与调控基因沉默的bna-MIR169c-p3_2ss12GC17TG的表达量变化显著。本次检测共获得52个显著差异表达的新miRNA信息。本研究结果可为番茄抗病育种和分子药物开发提供新的理论基础和技术支持。 展开更多
关键词 番茄 啤酒花矮化类病毒 靶向性ds-srna miRNA-seq 降解组测序
在线阅读 下载PDF
细菌sRNA在感染免疫中的作用机制
2
作者 王方鸿 周鹏 +2 位作者 刘红伟 马鹏 尹卫国 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第12期2271-2273,2277,共4页
sRNA(small non-coding RNA)是一类广泛存在于真核和原核生物中,长度为50~500nt的非编码小RNA。随着研究技术的发展,越来越多sRNA及其功能正逐步被阐述。sRNA广泛参与调节铁稳态、代谢反应、应激反应等多种途径来调节细菌感染免疫反应... sRNA(small non-coding RNA)是一类广泛存在于真核和原核生物中,长度为50~500nt的非编码小RNA。随着研究技术的发展,越来越多sRNA及其功能正逐步被阐述。sRNA广泛参与调节铁稳态、代谢反应、应激反应等多种途径来调节细菌感染免疫反应。该综述拟针对近期国内外研究热点,对细菌sRNA在感染免疫中的作用机制研究进展进行概述。 展开更多
关键词 srna 细菌感染 感染 免疫
暂未订购
基于16sRNA测序技术研究重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化
3
作者 方斗 张朝龙 +4 位作者 肖硕 李玉欣 汪珍忠 钟丽珊 黄焕雷 《心血管病学进展》 2025年第6期559-564,共6页
目的 分析单纯重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化,探索在三尖瓣关闭不全患者进行菌群干预治疗的可行性。方法 以2022年9月—2023年10月连续入住广东省人民医院心外科的单纯重度三尖瓣关闭不全患者为三尖瓣关闭不全试验组(T组,n=20)... 目的 分析单纯重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化,探索在三尖瓣关闭不全患者进行菌群干预治疗的可行性。方法 以2022年9月—2023年10月连续入住广东省人民医院心外科的单纯重度三尖瓣关闭不全患者为三尖瓣关闭不全试验组(T组,n=20);每纳入1例试验组患者时,同期在住院拟行手术治疗的单纯重度二尖瓣关闭不全患者中随机抽取1例纳入二尖瓣关闭不全对照组(M组,n=20);另外,每纳入2例试验组患者时,在正常人群中选取1例健康成年人纳入健康对照组(N组,n=10)。使用无菌器皿采集T、M、N组三组人群的粪便样本,进行16sRNA测序,根据测序结果进行生物学分析。结果 α多样性显示,T组患者肠道菌群Simpson、Sobs、Chao1、ACE指数低于M组和N组,但无统计学差异(P>0.05)。β多样性显示,T、M和N组三组之间呈彼此分离的情况。菌群与右心功能指标的相关性分析显示,瘤胃球菌科、颤螺菌目、Ruminococcus_sp_N15MGS-57、食葡糖罗斯拜瑞氏菌的相对丰度与三尖瓣环收缩期位移呈正相关。结论 重度三尖瓣关闭不全患者存在肠道菌群紊乱,并且多种菌群与重度三尖瓣关闭不全患者的右心功能存在明显的相关性,提示肠道菌群与重度三尖瓣关闭不全的发生发展有一定的相关性。 展开更多
关键词 重度三尖瓣关闭不全 肠道菌群 心力衰竭 16srna测序
暂未订购
sRNA113 regulates Pseudomonas plecoglossicida motility to affect immune response against infection in pearl gentian grouper
4
作者 Li He Mei-Qin Mao +5 位作者 Ling-Min Zhao Qi Li Hui Ge Jiao-Nan Zhang Jiao-Lin Zhang Qing-Pi Yan 《Zoological Research》 2025年第1期152-164,共13页
Small RNAs(sRNAs)are a class of molecules capable of perceiving environmental changes and exerting posttranscriptional regulation over target gene expression,thereby influencing bacterial virulence and host immune res... Small RNAs(sRNAs)are a class of molecules capable of perceiving environmental changes and exerting posttranscriptional regulation over target gene expression,thereby influencing bacterial virulence and host immune responses.Pseudomonas plecoglossicida is a pathogenic bacterium that poses a significant threat to aquatic animal health.However,the regulatory mechanisms of sRNAs in P.plecoglossicida remain unclear.This study focused on sRNA113,previously identified as a potential regulator of the fliP gene,a key component of the lateral flagellar type III secretion system.To investigate the effects of sRNA113on P.plecoglossicida virulence,as well as its role in regulating pathogenic processes and host immune responses,mutant strains lacking this sRNA were generated and analyzed.Deletion of sRNA113 resulted in the up-regulation of lateral flagellar type III secretion system-related genes in P.plecoglossicida,which enhanced bacterial swarming motility,biofilm formation,and chemotaxis ability in vitro.In vivo infection experiments with pearl gentian grouper revealed that sRNA113 deletion enhanced the pathogenicity of P.plecoglossicida.This heightened virulence was attributed to the up-regulation of genes associated with the lateral flagellar type III secretion system,resulting in higher bacterial loads within host tissues.This amplification of pathogenic activity intensified tissue damage,disrupted immune responses,and impaired the ability of the host to clear infection,ultimately leading to mortality.These findings underscore the critical role of sRNA113 in regulating the virulence of P.plecoglossicida and its interaction with host immune defenses.This study provides a foundation for further exploration of sRNAmediated mechanisms in bacterial pathogenesis and hostpathogen interactions,contributing to a deeper understanding of virulence regulation and immune evasion in aquatic pathogens. 展开更多
关键词 Pseudomonas plecoglossicida srna Virulence Pearl gentian grouper Immune response
在线阅读 下载PDF
The decoction and blood-entering sRNAs of Fritillaria thunbergii Miq. (Zhebeimu) relieve chronic obstructive pulmonary disease by PTGS2-NOS2-XPC-ABCC1 axis
5
作者 Yue Wan Sheng-Tao Hu +6 位作者 Kai-Rui Liu Yu-Zhe Chang Si-Han Tang Zhi-Ru Yang Ling Zheng Hao Guo Jun Kang 《Traditional Medicine Research》 2025年第10期76-86,共11页
Background:Chronic obstructive pulmonary disease(COPD)is a progressive chronic inflammatory disease characterized by irreversible airflow limitation.Fritillaria thunbergii Miq.Zhebeimu(ZBM)has a long history in treati... Background:Chronic obstructive pulmonary disease(COPD)is a progressive chronic inflammatory disease characterized by irreversible airflow limitation.Fritillaria thunbergii Miq.Zhebeimu(ZBM)has a long history in treating COPD,but the underlying mechanism is still unclear.Methods:This study explored the pathological mechanism of COPD through RNA-Seq analysis and single-cell sequencing data analysis.And the mechanism of ZBM and blood entering sRNAs for COPD was verified with network pharmacology analysis and in vitro experiments.Results:The results showed that inflammation and oxidative stress exacerbated the progression of COPD,and the expression of HSP90AA1,PTGS2,and AGRN genes significantly increased in the lung tissue of patients.Network pharmacology analysis suggests that the natural products contained in ZBM may directly target HSP90AA1,PTGS2,and AGRN for the treatment of COPD.Analysis of the blood entering sRNA contained in the decoction of ZBM revealed its excellent antioxidant and anti-macrophage polarization effects.Meanwhile,ZBM decoction,sRNA2,and sRNA5 reduce oxidative stress and inflammation by acting on prostaglandin-endoperoxide synthase 2(PTGS2),nitric oxide synthase 2(NOS2),ATP-binding cassette,subfamily C member 1(ABCC1),and xeroderma pigmentosum complementation group C(XPC)genes.Conclusion:Our study demonstrated that ZBM extract and ZBM derived sRNA2 and sRNA5 can relieve COPD by regulating PTGS2-NOS2-XPC-ABCC1 axis. 展开更多
关键词 chronic obstructive pulmonary Zhebeimu srnas active ingredients
暂未订购
不同感染来源疟原虫虫株的18S sRNA基因同源性分析 被引量:10
6
作者 朱垚吉 邓艳 +3 位作者 毛祥华 王剑 陈梦妮 董莹 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第4期331-334,339,共5页
目的分析云南省不同感染来源疟原虫株的遗传差异。方法采集不同地区疟疾患者的血样,利用巢式PCR扩增疟原虫18SsRNA基因,扩增产物进行双向测序分析,以分子进化树描述18SsRNA基因序列的同源程度。结果对2012年8月~2013年8月期间诊断为云... 目的分析云南省不同感染来源疟原虫株的遗传差异。方法采集不同地区疟疾患者的血样,利用巢式PCR扩增疟原虫18SsRNA基因,扩增产物进行双向测序分析,以分子进化树描述18SsRNA基因序列的同源程度。结果对2012年8月~2013年8月期间诊断为云南当地感染的全部疟疾患者22例及感染地为缅甸、非洲、老挝的13例疟疾患者血样进行18SsRNA基因巢式PCR扩增,8份检出恶性疟原虫目的基因片段(205bp)、35份检出间日疟原虫目标片段(120bp)。对43份PCR扩增阳性产物进行测序分析,其中8株恶性疟原虫的18SsRNA基因进化树显示属云南本地感染的虫株与非洲虫株分布在不同亚支,但均与鸡疟原虫(Plasmodium gallinaceum)(Accession:M61723)遗传进化关系较近;35株间日疟原虫的18SsRNA基因进化树显示所有虫株均集中在一个进化分支内,与食蟹猴疟原虫(P.cynomolgi)(Accession:L07559)遗传关系较近,89%的云南本地感染虫株与南美两个虫株(Accession:X13926、U03079)同在一个进化亚支。结论恶性疟原虫不同地理株的18SsRNA基因序列差异性较间日疟原虫株间的差异性更明显。 展开更多
关键词 疟原虫 地理株 18S srna 基因 同源性
原文传递
肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq表达与纯化 被引量:8
7
作者 孟宪臣 孟霞 +3 位作者 聂佳佳 厚华艳 王勇祥 朱国强 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期1-4,19,共5页
利用pET原核表达系统和亲和层析表达纯化肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq。首先构建含靶基因hfq的重组表达质粒pET28a(+)-hfq,经PCR及双酶切鉴定构建正确,再将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导目的基因高效表达。SDS-PAGE及Western ... 利用pET原核表达系统和亲和层析表达纯化肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq。首先构建含靶基因hfq的重组表达质粒pET28a(+)-hfq,经PCR及双酶切鉴定构建正确,再将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导目的基因高效表达。SDS-PAGE及Western blot结果表明:Hfq在大肠杆菌中成功表达,蛋白分子质量约为16.6ku,且主要存在于上清中,以可溶形式表达。进一步对表达产物进行Ni 2+亲和层析纯化,获得纯度较高的融合蛋白,为研究Hfq蛋白与sRNA的相互作用以及sRNA的调控机制提供基础。 展开更多
关键词 肠炎沙门氏菌 Hfq蛋白 srna 表达 纯化
暂未订购
细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展 被引量:8
8
作者 王立贵 赵雅琳 李伍举 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-5,共5页
细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文... 细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类,分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法;其次,将sRNA靶标预测方法分为2类,分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法;最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,并探讨了进一步的发展方向。 展开更多
关键词 srna 预测 靶标 细菌
在线阅读 下载PDF
sRNA伴侣蛋白Hfq敲除条件下沙门菌的转录组分析 被引量:6
9
作者 李晨 王开功 +3 位作者 周碧君 文明 刘丽娟 杨琦 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期461-469,共9页
为探明沙门菌(Salmonella)在sRNA伴侣蛋白Hfq敲除条件下转录组变化情况。本试验采用HiSeq测序平台对沙门菌LT2菌株及其Hfq敲除株进行高通量测序,通过DESeq2差异分析方法筛选敲除sRNA伴侣蛋白Hfq条件下的差异表达基因,对其进行生物信息... 为探明沙门菌(Salmonella)在sRNA伴侣蛋白Hfq敲除条件下转录组变化情况。本试验采用HiSeq测序平台对沙门菌LT2菌株及其Hfq敲除株进行高通量测序,通过DESeq2差异分析方法筛选敲除sRNA伴侣蛋白Hfq条件下的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析。结果显示,对照组和试验组分别得到12 753 534条、8 254 308条Clean Reads。通过DESeq2差异分析获得差异基因1 055个,其中表达上调基因516个,表达下调基因539个。GO功能显著性富集分析表明显著差异表达基因主要富集在钴胺素代谢过程、钴胺素生物合成过程、碳水化合物代谢过程等生物过程中。Pathway显著性富集分析表明显著差异表达基因富集到细菌趋化性、丙酸代谢和碳代谢等11个信号通路中。结果表明,本试验应用RNA-seq技术丰富了sRNA伴侣蛋白Hfq调控基因数量,筛选出20个受伴侣蛋白Hfq调控的显著差异表达基因,其中4个基因功能及编码蛋白未知,注释了差异表达基因的生物学功能及信号通路,推断Hfq在细菌对数期主要通过影响营养提供和趋化性等途径,继而影响细菌的正常生理活动,为Hfq协同sRNA的调控机理研究及sRNA靶基因的筛选奠定了基础。 展开更多
关键词 沙门菌 srna伴侣蛋白Hfq 转录组测序
原文传递
鸡白痢沙门菌sRNA的预测及毒力相关sRNA的筛选
10
作者 何婷 冉旭华 +2 位作者 丁永辉 孙羽伶 李天森 《家畜生态学报》 北大核心 2025年第10期81-88,共8页
为预测鸡白痢沙门菌中存在的非编码sRNA,筛选与细菌存活及致病相关的sRNA,该试验利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术对鸡白痢沙门菌进行测序,选取具有代表性的sRNA进行生物信息学分析及其靶基因预测,通过RT-PCR对候选sRNA进行验证,最终在... 为预测鸡白痢沙门菌中存在的非编码sRNA,筛选与细菌存活及致病相关的sRNA,该试验利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术对鸡白痢沙门菌进行测序,选取具有代表性的sRNA进行生物信息学分析及其靶基因预测,通过RT-PCR对候选sRNA进行验证,最终在鸡巨噬细胞HD11感染模型中检测候选sRNA转录水平情况。结果显示:sRNA-seq得到111条新预测的sRNA,筛选出7条Reads数最高的sRNA;二级结构预测显示7条sRNA均有典型的茎环结构;靶基因KEGG和GO富集分析表明候选sRNA涉及跨膜转运和细菌代谢等多项生理过程;RT-PCR结果显示,候选sRNA中有5条检测到转录水平;细胞感染模型试验结果显示,sRNA12最有可能参与细菌感染及致病过程。该研究发现了鸡白痢沙门菌的新的sRNA,同时筛选出可能参与细菌生存和致病过程的sRNA,为深入探究鸡白痢沙门菌的致病机制及潜在抑菌靶点提供科学依据。 展开更多
关键词 鸡白痢沙门菌 非编码小RNA 靶基因预测 胞内生存
在线阅读 下载PDF
sRNA STnc1220基因缺失株对鼠伤寒沙门菌生物学特性和致病力的影响 被引量:2
11
作者 李娜 宁程程 +6 位作者 郭蕴 季春辉 王立霞 张亚萍 孟庆玲 乔军 才学鹏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期188-194,共7页
为探究鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220的分子特征、生物学功能及对细菌毒力的影响,通过PCR扩增了鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220基因,分析了其分子特征,利用TargetRNA2网站预测STnc1220基因可能调控的靶基因;利用λ-Red同源重组技术构建沙门菌(S... 为探究鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220的分子特征、生物学功能及对细菌毒力的影响,通过PCR扩增了鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220基因,分析了其分子特征,利用TargetRNA2网站预测STnc1220基因可能调控的靶基因;利用λ-Red同源重组技术构建沙门菌(STM)-基因缺失突变株,并与亲本SL1344比较,对其生长特性、生化特性、遗传稳定性、生物被膜(BF)形成能力、在不同应激环境中(pH值、H_(2)O_(2)、高盐和乙醇胁迫环境)的适应性、通过黏附侵染巨噬细胞和小鼠感染试验对致病力进行研究。结果显示,STnc1220基因全长73 bp、其上游5′-UTR存在-10和-35启动子结合位点,预测其潜在的靶基因为barA基因;试验成功构建缺失株STM-ΔSTnc1220,且具有良好的遗传稳定性;与SL1344亲本株相比,缺失株的生长速度、生化特性及生物被膜形成能力没有发生改变;在pH=4.8,pH=9和H_(2)O_(2)条件下生长速率差异不显著,但在4%NaCl环境下,缺失株在7 h后生长速率明显高于亲本株,在3.8%乙醇环境中缺失株在对数期的生长速率显著升高(P<0.05);其对巨噬细胞中黏附和侵袭能力极显著降低(P<0.01),小鼠LD_(50)显著升高,对小鼠的肝脏和脾脏的病理损伤致病力减弱。表明STnc1220基因在环境适应性和毒力调控中发挥了重要的作用。为阐明鼠伤寒沙门菌的致病机制提供理论依据。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 srna STnc1220 生物学特性 毒力
在线阅读 下载PDF
致病菌与宿主相互作用中sRNA的调控作用 被引量:4
12
作者 李泽 祝丙华 +2 位作者 叶中杨 王立贵 宋宏彬 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第3期327-332,共6页
sRNA在细菌的生命过程中发挥重要调控作用,可以调节自身基因改变新陈代谢,在不利的宿主环境(pH、温度、氧化物等)中生存下来,而且越来越多证据表明sRNA在与宿主细胞相互作用中,能够直接影响宿主基因表达,尤其是免疫基因,降低宿主免疫反... sRNA在细菌的生命过程中发挥重要调控作用,可以调节自身基因改变新陈代谢,在不利的宿主环境(pH、温度、氧化物等)中生存下来,而且越来越多证据表明sRNA在与宿主细胞相互作用中,能够直接影响宿主基因表达,尤其是免疫基因,降低宿主免疫反应,改变宿主细胞内环境,最终破坏宿主细胞,引起疾病的发生。但目前致病菌sRNA与宿主相互作用的研究仍处在初级阶段,还没有相关系统综述。现结合国内外最新研究前沿以及实验室相关研究工作,详细论述sRNA在与宿主相互作用中的具体调控方式,为细菌sRNA进一步研究提供有益帮助。 展开更多
关键词 致病菌srna 宿主 相互作用
原文传递
伤寒沙门菌sRNA S2959增强细菌动力和生物膜形成能力 被引量:5
13
作者 陆仁飞 孙嘉瑶 黄新祥 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第10期774-778,共5页
目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通... 目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通过sRNA S2959缺陷株和野生株的生长曲线实验观察sRNA S2959缺失后对细菌生长的影响;通过细菌sRNA S2959缺陷株、空载体株、回补株的泳动能力实验和生物膜实验观察sRNA S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响;再用定量PCR(q PCR)方法检测细菌鞭毛相关基因在sRNA S2959相关菌株中的表达水平。结果成功制备sRNA S2959缺陷株和回补株; sRNA S2959缺陷株和野生株在LB和TSB液体培养基中的生长曲线无明显差异;与野生株相比,sRNA S2959缺陷株的泳动能力和生物膜形成能力下调(P<0.05),而回补株的泳动能力和生物膜形成能力较缺陷株显著增加(P<0.05); q PCR结果显示,高表达sRNA S2959后,细菌鞭毛相关基因(flh D、fli A和flj B)的mRNA水平分别上调大约4、3和6倍。结论伤寒沙门菌sRNA S2959促进鞭毛的表达,进一步上调伤寒沙门菌动力以及生物膜的形成能力。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 srna 动力 生物膜
暂未订购
人工sRNAs沉默csrA基因以优化大肠杆菌生产L-酪氨酸 被引量:3
14
作者 姚元锋 赵莹 赵广荣 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期60-65,共6页
sRNAs作为一种强有力的基因表达调控工具,在真核生物中得到了广泛的应用。随着微生物中sRNAs的不断发现以及其调控机制的逐渐明确,新近开发的人工sRNA工程在微生物代谢工程的改造上也展现了巨大的优势。通过对大肠杆菌负调控L-酪氨酸生... sRNAs作为一种强有力的基因表达调控工具,在真核生物中得到了广泛的应用。随着微生物中sRNAs的不断发现以及其调控机制的逐渐明确,新近开发的人工sRNA工程在微生物代谢工程的改造上也展现了巨大的优势。通过对大肠杆菌负调控L-酪氨酸生物合成途径的碳贮藏调控因子(csrA)基因的sRNAs进行了人工设计和筛选,分析了对L-酪氨酸合成的影响。结果表明,所设计的sRNA能有效提高L-酪氨酸的合成,较高拷贝数的短anti-csrA sRNA2比较长的sRNA1更有效,使L-酪氨酸产量提高了1.2倍。sRNA工程技术是一种有效的负调控全局代谢途径的策略,其在合成生物学以及微生物细胞工厂构建上必将有着更广泛的应用。 展开更多
关键词 人工srnas 基因沉默 csrA L-酪氨酸
原文传递
木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘 被引量:2
15
作者 丛汉卿 龙娅丽 +2 位作者 王荣香 孙化鹏 乔飞 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2427-2435,共9页
为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中... 为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中分别获得12 092 109条和11 499 655条sRNA序列。花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979和2 603条靶基因。最终筛选出8种与开花调控相关和3种花色调控相关的microRNAs。表达分析显示,miRNAs在两样品间呈现出较大的整体性差异,并且在功能与代谢通路上也不尽相同;开花相关microRNAs中表达差异较大的为miR156、miR172和miR169,其中miR156表达量在花序中高于幼叶,而miR172表达量在花序中低于幼叶,推测其功能为抑制后续的开花过程,避免过度开花。本研究分析了木薯花序与幼叶中sRNA的整体特性,通过表达差异分析初步明确了microRNAs对木薯开花的调控,为进一步深入探索奠定了基础。 展开更多
关键词 木薯 srna MICRORNA 开花 表达特性
在线阅读 下载PDF
儿童耐药肺炎支原体DNA载量与23sRNA基因2063位点突变的相关性分析 被引量:3
16
作者 朱美君 季菊花 +3 位作者 朱洁 宋磊 周峰 赵金华 《中国儿童保健杂志》 CAS CSCD 2021年第9期1017-1020,1029,共5页
目的分析儿童耐药支原体肺炎的肺炎支原体(MP)DNA载量与23sRNA2063位点突变的相关性,以期为MP肺炎的治疗提供参考。方法选取2017年12月-2019年12月在南通市第一人民医院治疗的MP肺炎患儿158例,对所有患者进行药敏试验,根据抗生素耐药性... 目的分析儿童耐药支原体肺炎的肺炎支原体(MP)DNA载量与23sRNA2063位点突变的相关性,以期为MP肺炎的治疗提供参考。方法选取2017年12月-2019年12月在南通市第一人民医院治疗的MP肺炎患儿158例,对所有患者进行药敏试验,根据抗生素耐药性将患者分为耐药组(n=112)和非耐药组(n=46)。比较两组患者咽拭子MPDNA载量指数(MPLI)及23sRNA基因2063位点突变率,分析患者MPLI与临床指标的关系,采用ROC曲线分析MPLI对耐药MP肺炎的诊断价值,并分析患者MPLI与23sRNA基因2063位点突变的相关性。结果耐药组MPLI低于非耐药组(t=4.373,P<0.001);MPLI诊断耐药MP肺炎的AUC为0.698,截点值为5.16;MPLI阳性组在退热时间≥3 d、咳嗽咯痰消失时间≥5 d、胸部阴影消失时间≥10 d、合并肺外并发症方面的人数比例大于阴性组(χ^(2)=17.584、19.237、44.724、11.075,P<0.001);经多元Logistics回归分析得,退热时间≥3 d、咳嗽咳痰消失时间≥5 d、胸部阴影消失时间≥10 d、合并肺外并发症是影响MP肺炎患儿MPLI表达的相关因素(OR=1.420、1.573、1.670、1.598,P<0.001);耐药组23sRNA基因2063位点基因突变率高于非耐药组(χ^(2)=52.484,P<0.001);MP肺炎患儿MPLI表达水平与23sRNA基因2063位点突变呈负相关(r=-0.538,P<0.001)。结论耐药肺炎支原体患儿MPLI表达与临床症状消失时间等临床指标有关,与23sRNA基因2063位点突变率呈负相关,且MPLI表达对耐药MP肺炎具有诊断价值。 展开更多
关键词 耐药支原体肺炎 儿童 支原体DNA载量 23srna基因突变位点
原文传递
空气-SRNA-4催化剂磁流化床动力学研究 被引量:3
17
作者 赵亚南 何晨晨 +2 位作者 张恺 范秀凯 曹长青 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第5期480-484,共5页
在内径和高分别为140mm和1600 mm气固磁流化床反应器内,分别以空气和SRNA-4催化剂(平均粒径50μm)为气相和固相,采用不同外加磁场强度对磁流化床动力学进行了研究。应用计算流体力学软件FLUENT 6.2对磁流化床内局部固含率和床层压降进... 在内径和高分别为140mm和1600 mm气固磁流化床反应器内,分别以空气和SRNA-4催化剂(平均粒径50μm)为气相和固相,采用不同外加磁场强度对磁流化床动力学进行了研究。应用计算流体力学软件FLUENT 6.2对磁流化床内局部固含率和床层压降进行了模拟计算。模拟结果显示:无磁场作用时,随表观气速增加,床层界面变化剧烈,床内局部固含率的分布极不均匀,床层压降升高。随着磁场强度增加,气泡的数目和尺寸减小,床中局部固含率增大,且分布变得较均匀,床层压降呈现下降趋势。模拟结果与实验数据吻合良好。 展开更多
关键词 srna-4 磁流化床 磁场强度 模拟
在线阅读 下载PDF
常规培养与缺氧条件下BCG菌体内外sRNA的表达检测 被引量:1
18
作者 韩雪 顾伟 +4 位作者 李婷 范云帆 张文莉 赵吉子 付英梅 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第2期60-66,共7页
近期发现细菌的sRNA在菌体内和菌体外均具有一定的生物学功能。为研究结核分枝杆菌菌体内外sRNA的表达情况,通过分析卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin Vaccine,BCG)菌体和外泌体RNA测序结果,采用RT-qPCR法检测常规培养与缺氧条件下BCG... 近期发现细菌的sRNA在菌体内和菌体外均具有一定的生物学功能。为研究结核分枝杆菌菌体内外sRNA的表达情况,通过分析卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin Vaccine,BCG)菌体和外泌体RNA测序结果,采用RT-qPCR法检测常规培养与缺氧条件下BCG菌体内外sRNA相对表达量,分析菌体内外sRNA谱的差异。结果显示,常规培养时,菌体内丰度较高的sRNA为MTS2823、MTS1338与ASdes,菌体外丰度较高的为Mcr3、MTS2823和AS1890。菌体内受缺氧诱导表达增加的是MTS2823、MTS1338、MTS0997和G2。其中MTS1338与G2的启动子区发现了DosR的结合基序。无论是否缺氧,MTS0997、G2、Mcr7和AS1890在菌体外的相对表达量均高于菌体内,而C8只在缺氧时菌体外表达增高。研究揭示了BCG菌体内外sRNA表达谱不同,且一部分sRNA在常规培养和缺氧应激时向菌体外释放,同时发现了细菌受缺氧诱导的sRNA种类。 展开更多
关键词 卡介苗(BCG) 细胞外RNA 细菌srna 缺氧 RT-QPCR
在线阅读 下载PDF
布鲁菌sRNA研究进展 被引量:1
19
作者 董浩 彭小薇 +6 位作者 赵柏林 孙雨 曲萍 王晓英 胡冬梅 石慧 宋晓晖 《动物医学进展》 北大核心 2016年第8期91-94,共4页
布鲁菌病是一种危害严重的人兽共患病,威胁着畜牧业的发展和人类的公共卫生安全。作为布鲁菌病的病原,布鲁菌能够耐受宿主体内的各种杀菌机制并持续的生存。细菌的sRNA在基因组中被转录,但绝大多数sRNA并不编码蛋白质。sRNA通过碱基配对... 布鲁菌病是一种危害严重的人兽共患病,威胁着畜牧业的发展和人类的公共卫生安全。作为布鲁菌病的病原,布鲁菌能够耐受宿主体内的各种杀菌机制并持续的生存。细菌的sRNA在基因组中被转录,但绝大多数sRNA并不编码蛋白质。sRNA通过碱基配对与mRNA结合,影响mRNA的稳定性或翻译,从而调控细菌代谢、群体感应、环境应激及细菌毒力基因表达等生物过程。通过sRNA调控毒力相关基因表达,使布鲁菌可以耐受多种胞内应激环境。目前为止,仅有少数布鲁菌sRNA的功能得到了较全面的研究,论文对这些sRNA的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 布鲁菌 srna 基因表达 毒力基因
在线阅读 下载PDF
sRNASVM——基于SVM方法构建大肠杆菌sRNA预测模型(英文) 被引量:1
20
作者 王立贵 应晓敏 +2 位作者 曹源 查磊 李伍举 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期287-293,共7页
在理解细菌与环境的相互作用方面,细菌sRNA的识别发挥重要作用。文章介绍了一个通过增加训练集中实验证实的sRNA来构建细菌sRNA预测模型的策略,并以大肠杆菌K-12的sRNA预测为例来说明策略的可行性。结果表明,按此策略构建的模型sRNASVM... 在理解细菌与环境的相互作用方面,细菌sRNA的识别发挥重要作用。文章介绍了一个通过增加训练集中实验证实的sRNA来构建细菌sRNA预测模型的策略,并以大肠杆菌K-12的sRNA预测为例来说明策略的可行性。结果表明,按此策略构建的模型sRNASVM的10倍交叉检验精度达到92.45%,高于目前文献中报道的精度。因此,构建的这一模型将为实验发现sRNA提供较好的生物信息学支持。有关模型和详细结果可以从网站http://ccb.bmi.ac.cn/srnasvm/下载。 展开更多
关键词 srna 支持向量集 预测
原文传递
上一页 1 2 12 下一页 到第
使用帮助 返回顶部