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Polymorphisms in mucin genes in the development of gastric cancer 被引量:6
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作者 Rong Wen Fang Gao +1 位作者 Cheng-Jiang Zhou Yan-Bin Jia 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE CAS 2015年第11期328-337,共10页
Gastric cancer(GC) is the third leading cause of cancerrelated death worldwide.In areas of high prevalence,such as Japan,South Korea and China,most cases of GC are related to Helicobacter pylori(H.pylori),which involv... Gastric cancer(GC) is the third leading cause of cancerrelated death worldwide.In areas of high prevalence,such as Japan,South Korea and China,most cases of GC are related to Helicobacter pylori(H.pylori),which involves well-characterized sequential stages,including infection,atrophic gastritis,intestinal metaplasia,dysplasia,and GC.Mucins are the most abundant highmolecular-weight glycoproteins in mucus,which is the first line of defense and plays a major role in blocking pathogenic factors.Normal gastric mucosa shows expression of MUC1,MUC5 AC and MUC6 that is specific to cell type.However,the specific pattern of MUC1,MUC5 AC and MUC6 expression is changed in gastric carcinogenesis,accompanied by de novo expression of secreted MUC2.Recent studies have provided evidence that variations in these mucin genes affect many steps of GC development,such as H.pylori infection,and gastric precancerous lesions.In this review,we focus on studies of the association between polymorphisms in mucin genes and development of GC.This information should be helpful for the early detection,surveillance,and treatment of GC. 展开更多
关键词 GASTRIC cancer HELICOBACTER PYLORI GENETIC polymor
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Evaluation of VEGF gene polymorphisms and proliferative diabetic retinopathy in Mexican population 被引量:12
2
作者 Roberto Gonzalez-Salinas Maria C Garcia-Gutierrez +10 位作者 Gerardo Garcia-Aguirre Virgilio Morales-Canton Raul Velez-Montoya Vidal R Soberon-Ventura Victoria Gonzalez Rodrigo Lechuga Pablo Garcia-Solis David G Garcia-Gutierrez Marco Vinicio Garcia-Solis Manuel Saenz de Viteri Juan C Solis-S 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2017年第1期135-139,共5页
AIM: To assess if the included vascular endothelial growth factor (VEGF) polymorphisms rs3025035, rs3025021 and rs2010963 are associated to proliferative retinopathy in a Mexican population with type 2 diabetes mel... AIM: To assess if the included vascular endothelial growth factor (VEGF) polymorphisms rs3025035, rs3025021 and rs2010963 are associated to proliferative retinopathy in a Mexican population with type 2 diabetes mellitus (T2DM). METHODS: A case-control study was conducted in adult individuals with T2DM associated to proliferative retinopathy or non-proliferative retinopathy from Oct. 2014 to Jun. 2015 from the Retina Department of the Asociation to Prevent Blindness in Mexico. The selected patients were adults with a diagnosis of T2DM ≥5y. All subjects had a comprehensive ocular examination and the classification of the retinopathy severity was made considering the Early Treatment Diabetic Retinopathy Study (ETDRS) standardization protocols. Genomic DNA was extracted from whole fresh blood. All samples were genotyped by qPCR for selected VEGF polymorphisms. Hardy-Weinberg equilibrium was calculated by comparing Chi-square values between the expected and the observed values for genotype counts.RESULTS: In total 142 individuals were enrolled, 71 individuals with T2DM and associated proliferative retinopathy and 71 individuals with non-proliferative retinopathy. One-sided Fisher’s exact test was performed for rs3025021 [OR (95% CI)=0.44(0.08-2.2); P=0.25] and rs2010963 [OR (95% CI)=0.63(0.25-1.6); P=0.23]. The minor allelic frequencies obtained were 26% for rs3025021, 10% for rs3025035 and 61% for rs2010963. The pairwise linkage disequilibrium between the three SNP was assessed, and was as follows: rs3025021 vs rs3025035: D’=1.0, r2=0.1043, P≤0.0001; rs3025021 vs rs2010963: D’=0.442, r2=0.0446, P=0.149; rs3025035 vs rs2010963: D’=0.505, r2=0.0214, P=0.142.CONCLUSION: This is the first analysis involving VEGF polymorphisms and proliferative diabetic retinopathy in a Mexican population. A major finding of the present study is that none of the polymorphisms studied was significantly associated with proliferative retinopathy. Based on these results, we can infer that different populations have different associations for the same polymorphisms. 展开更多
关键词 vascular endothelial growth factor polymor-phism proliferative diabetic retinopathy non-proliferative diabetic retinopathy rs3025021 rs3025035 rs2010963
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Polymorphism of heat shock protein 70-2 and enterocutaneous fistula in Chinese population 被引量:1
3
作者 Jun Chen Jian-An Ren +8 位作者 Gang Han Guo-Sheng Gu Ge-Fei Wang Xiu-Wen Wu Bo Zhou Dong Hu Yin Wu Yun-Zhao Zhao Jie-Shou Li 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2014年第35期12559-12565,共7页
AIM: To investigate whether the heat shock protein 70-2 (HSP70-2) polymorphism is associated with enterocutaneous fistulas in a Chinese population.
关键词 Enterocutaneous fistulas Single nucleotide polymorphisms Heat shock protein HSP70-2
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Relationship of Toll-Like Receptors 2 and 4 Gene Polymorphisms with Essential Hypertension in Chinese Han Population
4
作者 Huabei Wu Shijie Yin 《Journal of Biosciences and Medicines》 CAS 2023年第2期53-63,共11页
Objective: There are numerous studies suggesting that genetic polymor-phisms of inflammation factors Toll-like receptors 2 and 4 (TLR2, TLR4) might play a role in the pathophysiological process of hypertension. In thi... Objective: There are numerous studies suggesting that genetic polymor-phisms of inflammation factors Toll-like receptors 2 and 4 (TLR2, TLR4) might play a role in the pathophysiological process of hypertension. In this study, we evaluated the association in a sample of members of the Chinese Han population. Method: We selected four single nucleotide polymor-phisms (SNP) of TLR2 (rs3804099, rs3804100, rs7656411) and TLR4 (rs1927906) genes, and measured the distributions of genotypic and allelic frequencies in 1063 participants, including 391 essential hypertension pa-tients and 672 controls. Result: No significant differences in the genotypic and allelic frequencies of the four SNPs were detected between cases and controls. However, three haplotypes, CCG, TTG and TTT of TLR2, were significantly associated with a decrease in the risk of essential hyperten-sion (OR: 0.512, 95% CI: 0.397 - 0.660, P P = 0.0038;OR: 0.797, 95% CI: 0.667 - 0.952, P = 0.0122, respectively). Inversely, the risk of essential hypertension increased sig-nificantly in patients with the CTG, TCG or TCT haplotypes (OR: 2.924, 95% CI: 2.157 - 3.963, P P P Conclusion: Our study suggested that haplotypes (CCG, TTG, TTT, CTG, TCG and TCT) of TLR2 might have profound effects on the development of essential hypertension in the Chinese Han population. 展开更多
关键词 Toll-Like Receptor 2 Toll-Like Receptor 4 Single-Nucleotide polymor-phisms Essential Hypertension INFLAMMATION
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亲子关系对青少年亲社会行为的影响:主观幸福感的中介作用和5-HTR1A基因rs6295多态性的调节作用 被引量:4
5
作者 何震 詹林 +3 位作者 曾子豪 刘双金 杨琴 胡义秋 《中国临床心理学杂志》 北大核心 2025年第1期195-201,共7页
目的:基于基因-环境-内表型-行为模型,考察亲子关系、主观幸福感、5-HTR1A基因rs6295多态性对青少年亲社会行为的影响。方法:采取问卷法对701名初中学生进行调查,并结合DNA分型技术获取5-HTR1A基因的SNP位点。结果:(1)亲子关系显著正向... 目的:基于基因-环境-内表型-行为模型,考察亲子关系、主观幸福感、5-HTR1A基因rs6295多态性对青少年亲社会行为的影响。方法:采取问卷法对701名初中学生进行调查,并结合DNA分型技术获取5-HTR1A基因的SNP位点。结果:(1)亲子关系显著正向预测青少年亲社会行为;(2)主观幸福感在亲子关系和亲社会行为之间起中介作用;(3)rs6295多态性在亲子关系与主观幸福感之间起调节作用,具体表现为,相比携带rs6295位点G/C和C/C基因型的个体,携带rs6295位点G/G基因型的个体亲子关系对主观幸福感的正向预测作用更强。结论:亲子关系显著正向预测青少年亲社会行为,主观幸福感在其中发挥中介作用,且rs6295多态性调节亲子关系对主观幸福感的影响。G/G基因型个体的亲子关系对主观幸福感的正向预测效应更强,G/G基因型为敏感基因型。 展开更多
关键词 亲子关系 主观幸福感 亲社会行为 5-HTR1A基因 rs6295多态性
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中国汉族健康男性细胞色素P450酶2C19遗传多态性对艾司西酞普兰在人体内代谢的影响 被引量:15
6
作者 杨琴 司天梅 舒良 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期33-36,共4页
目的评价中国汉族健康男性志愿者细胞色素P450(CYP450)2C19遗传多态性对艾司西酞普兰(抗抑郁症和惊恐障碍药)在人体内代谢的影响。方法16名志愿者单次口服艾司西酞普兰后,用PCR-测序法测定其CYP2C19基因的基因型,即野生基因型(*1/*1)含... 目的评价中国汉族健康男性志愿者细胞色素P450(CYP450)2C19遗传多态性对艾司西酞普兰(抗抑郁症和惊恐障碍药)在人体内代谢的影响。方法16名志愿者单次口服艾司西酞普兰后,用PCR-测序法测定其CYP2C19基因的基因型,即野生基因型(*1/*1)含有1个突变基因组(*1/*2或*1/*3)及含有2个突变基因组(*2/*2,*3/*3或*2/*3)。用高效液相色谱-荧光检测法测定其血药浓度。比较艾司西酞普兰在CYP2C19不同基因型代谢的差异。结果随突变基因数目增多,血浆艾司西酞普兰AUC显著升高(P<0.01),CLs显著降低(P<0.01)。CLs、AUC0-t及AUC0-∝的差异在3组间表现出基因剂量效应倾向。结论CYP2C19遗传多态性是影响艾司西酞普兰药物代谢的重要因素。 展开更多
关键词 艾司西酞普兰 药代动力学 细胞色素P450 2C19 多态性 高效液相 色谱-荧光
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PCR-SSCP分析实践 被引量:12
7
作者 蔡辉国 陈佩贞 +3 位作者 张立冬 彭琼 纪新军 马双 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1995年第5期473-475,共3页
介绍了一种在一般实验室都能使用的适用于SSCP分析电泳的改良方法.并对如何设计引物、选择PCR条件和分析结果进行了讨论.
关键词 聚合酶链反应 单链构象多态性 临床检验
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茄子种质资源遗传多样性和群体结构分析 被引量:15
8
作者 何倚剑 刘卫东 +2 位作者 柳李旺 王倩 崔群香 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期13-20,共8页
采用SRAP分子标记技术,对国内外70份茄子材料的遗传多样性和群体结构进行了分析。结果表明:21对引物共扩增出375条条带,平均每条引物扩增出17.8条条带,其中多态性条带共72个,多态性比例为19.2%,各种质间遗传相似系数变幅为0.388 9~0.95... 采用SRAP分子标记技术,对国内外70份茄子材料的遗传多样性和群体结构进行了分析。结果表明:21对引物共扩增出375条条带,平均每条引物扩增出17.8条条带,其中多态性条带共72个,多态性比例为19.2%,各种质间遗传相似系数变幅为0.388 9~0.958 3,平均值为0.705 3,表明参试材料间存在着一定的遗传差异,但遗传基础比较狭窄。群体结构分析则得出84.29%的材料遗传结构相对比较单一,仅15.71%拥有复杂的遗传背景。从材料划分类群来看,遗传多样性和群体结构分析结果基本一致,只有少数遗传背景复杂的材料类群划分有些差异。 展开更多
关键词 茄子 遗传多样性 群体结构 SRAP
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环孢素A的药物基因组学与个体化用药的研究现状及进展 被引量:11
9
作者 戴映 张晶 +1 位作者 林美钦 宋洪涛 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2014年第8期931-936,共6页
环孢素(CsA)作为一种新型强效免疫抑制剂,近年来广泛应用于器官移植术后的抗排斥反应治疗。由于其治疗指数狭窄,个体间差异大,如何在临床合理使用CsA一直是广大学者关注的热点。CsA的生物利用度和代谢主要受药物代谢酶CYP3A和转运蛋白P... 环孢素(CsA)作为一种新型强效免疫抑制剂,近年来广泛应用于器官移植术后的抗排斥反应治疗。由于其治疗指数狭窄,个体间差异大,如何在临床合理使用CsA一直是广大学者关注的热点。CsA的生物利用度和代谢主要受药物代谢酶CYP3A和转运蛋白P-糖蛋白(P-gp)的影响,而不同个体间CYP3A与多药耐药基因(MDR1)基因多态性则是CYP3A酶和P-gp产生活性差异的分子机制。此外,合并用药、饮食结构等非遗传因素也是影响CsA疗效的重要原因,本文就近年来CsA药物基因组学研究进展结合非遗传因素予以综述,为临床个体化用药提供参考,确保患者安全合理用药。 展开更多
关键词 环孢素A 基因多态性 多药耐药基因 MDR1 合并用药
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335例心脑血管病患者阿司匹林抵抗与环氧化酶2基因多态性位点的相关性 被引量:9
10
作者 徐旭 陈忠云 +2 位作者 李婧 梁国威 杨旭 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2013年第6期602-606,共5页
目的探讨心脑血管病患者环氧化酶2(COX-2)基因单核苷酸多态性(SNP)位点-1195G>A和-765G>C与阿司匹林抵抗(AR)的相关性。方法纳入中国北方汉族冠心病及缺血性脑卒中患者335例,根据血小板聚集率分为AR组27例、阿司匹林半抵抗(ASR)... 目的探讨心脑血管病患者环氧化酶2(COX-2)基因单核苷酸多态性(SNP)位点-1195G>A和-765G>C与阿司匹林抵抗(AR)的相关性。方法纳入中国北方汉族冠心病及缺血性脑卒中患者335例,根据血小板聚集率分为AR组27例、阿司匹林半抵抗(ASR)组68例和阿司匹林敏感(AS)组240例。SNP检测采用实时荧光定量PCR方法,使用SHEsis软件构建单体型。并进行分析。结果 AS组、ASR和AR组-1195G>A位点的GG、GA、AA分布频率比较,差异有统计学意义(P=0.003);3组-1195G>A位点隐性模型GA+AA和GG基因型分布频率亦存在统计学差异(P<0.01),3组等位基因A分布频率比较,差异有统计学意义(P=0.009)。3组-765G>C位点基因型、等位基因型分布频率比较,差异无统计学意义(P=0.822)。AS组与ASR组、AS组与AR组单体型G-G和A-G分布频率均存在统计学差异(P<0.05,P<0.01)。相关因素校正后,logistic回归分析显示,COX-2的-1195G>A GA+AA基因型仍与AR和ASR的发生显著相关(OR=3.381,95%CI:1.439~7.944)。结论 COX-2基因的-1195G>A等位基因A可能与AR及ASR的发生具有关联性,可能是AR及ASR发生的一个遗传易感性标记位点。 展开更多
关键词 心血管疾病 脑血管障碍 环氧化酶2 阿司匹林 多态性 单核苷酸 基因频率 基因型
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文山山地乌骨鸡微卫星DNA多态性分析 被引量:10
11
作者 苗永旺 叶朗惠 +2 位作者 陈涛 霍金龙 李大林 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期63-66,共4页
利用位于家鸡24条染色体上的33个微卫星标记对云南文山山地乌骨鸡50个个体进行了遗传多样性检测。共检测到118个等位基因,每个座位等位基因数目从2到9个不等,平均等位基因数为3.5758±1.5619,有效等位基因数在1.4274—6.125... 利用位于家鸡24条染色体上的33个微卫星标记对云南文山山地乌骨鸡50个个体进行了遗传多样性检测。共检测到118个等位基因,每个座位等位基因数目从2到9个不等,平均等位基因数为3.5758±1.5619,有效等位基因数在1.4274—6.1250之间,平均为2.9750±1.1389;群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.8927±0.2172,0.6214±0.1259和0.5447±0.1528。研究结果表明:文山山地乌骨鸡群体内存在丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 文山山地乌骨鸡 微卫星标记 遗传变异 多态信息含量 杂合度
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红细胞补体受体1分子水平及其基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的关联研究 被引量:11
12
作者 胡金川 田亚平 +6 位作者 江朝光 温新宇 高艳红 董矜 郭广宏 王玲 董振南 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2013年第7期729-733,共5页
目的我国系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发病率居世界首位,治疗属世界难题。SLE的发病机制尚不明确,许多研究表明,SLE患者红细胞补体受体1(complement receptor type 1,CR1)分子水平及功能低下,但未见研究对CR1基因... 目的我国系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发病率居世界首位,治疗属世界难题。SLE的发病机制尚不明确,许多研究表明,SLE患者红细胞补体受体1(complement receptor type 1,CR1)分子水平及功能低下,但未见研究对CR1基因与SLE遗传易感性的关联进行报道。文中旨在探讨红细胞CR1分子水平及其基因单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms,SNP)与SLE的关联。方法检测SLE患者(SLE组)及健康人(对照组)红细胞CR1分子水平及5个标签SNP位点基因型,比较对照组CR1基因各SNP位点基因型对应CR1分子水平的差异,以及SLE组和对照组组间红细胞CR1分子水平和CR1基因各SNP位点基因型、等位基因的分布差异,计算比值比(OR)及其95%CI。结果对照组CR1基因rs3818361C>T/TT基因型携带者红细胞CR1水平低于CC、CT基因型者(P<0.05),rs11118167T>C/TC、CC基因型携带者红细胞CR1水平低于TT基因型者(P<0.01),rs9429945C>T/CT、TT基因型携带者红细胞CR1水平低于CC基因型者(P<0.01)。SLE组CR1几何平均荧光强度比值(geometric mean fluorescence intensity ratio,GMFIR)低于对照组(P<0.01);有3个标签SNP位点与SLE发病关联(P<0.01或P<0.05),与非携带者比较,CR1-rs4844600G>A/GG基因型(OR:8.672,95%CI:3.864~19.462)及G等位基因(OR:7.419,95%CI:3.425~16.073)、CR1-rs3818361C>T/CC基因型(OR:1.872,95%CI:1.113~3.149)及C等位基因(OR:1.575,95%CI:1.067~2.325)、CR1-rs11118167T>C/TT基因型(OR:2.083,95%CI:1.065~4.071)及T等位基因(OR:1.941,95%CI:1.050~3.588)携带者患SLE风险增加。结论健康人CR1基因rs3818361C>T/TT基因型、rs11118167T>C/TC、CC基因型和rs9429945C>T/CT、TT基因型携带者红细胞CR1水平低于该SNP位点其他基因型携带者。SLE患者红细胞CR1分子水平降低,CR1基因rs4844600G>A、rs3818361C>T、rs11118167T>C等3个SNP位点与SLE发病关联,其易感基因型CR1-rs4844600G>A/GG、CR1-rs3818361C>T/CC和CR1-rs11118167T>C/TT与SLE患者CR1分子水平低无关。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 红细胞免疫 补体受体1 单核苷酸多态性 关联研究
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利用最大似然法进行水稻产量性状基因的分子作图 被引量:12
13
作者 徐云碧 申宗坦 +1 位作者 陈英 朱立煌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1995年第1期46-52,共7页
本研究根据对估计标记-数量性状基因座位(QTL)之间重组率的两种分析方法(矩量法和最大似然法)、两种方差模型(QTL基因型之间的方差同质和异质模型)的分析,揭示了LOD值在标记-QTL连锁检测上所得结果的相关性高于重... 本研究根据对估计标记-数量性状基因座位(QTL)之间重组率的两种分析方法(矩量法和最大似然法)、两种方差模型(QTL基因型之间的方差同质和异质模型)的分析,揭示了LOD值在标记-QTL连锁检测上所得结果的相关性高于重组率估计值的相关性。采用最大似然法和异质方差模型,估计了水稻产量构成有关的QTL与分布于11对染色体上的51个限制性片段长度多态性(RFLP)标记之间的重组率,并对似然比(以LOD值表示)进行X ̄2检验,发现7个存在显著连锁关系的标记-性状组合,其平均重组率为10.0%。这些标记分布于第1、5、6、8和11等5对染色体上,涉及7个RFLP标记和3个产量构成性状,即每穗颖花数(RG573、RZ617、RG103)、单株穗数(RG64B)和每穗实粒数(RG101、RG244、RG653)。 展开更多
关键词 水稻 DNA RFLP 产量性状 最大似然法 基因
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β3-AR Trp64Arg遗传多态性对T2DM患者罗格列酮疗效的影响 被引量:5
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作者 李慧华 杨敏 +2 位作者 余敏 周宏灏 刘昭前 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期317-321,共5页
目的探讨β3肾上腺素受体(β3-adrenergic receptor,β3-AR)Trp64Arg基因变异在中国健康人群和2型糖尿病(type2diabetes,T2DM)患者中的分布频率,查明该遗传多态性对罗格列酮在T2DM患者中疗效的影响。方法采用聚合酶链式反应-限制性片断... 目的探讨β3肾上腺素受体(β3-adrenergic receptor,β3-AR)Trp64Arg基因变异在中国健康人群和2型糖尿病(type2diabetes,T2DM)患者中的分布频率,查明该遗传多态性对罗格列酮在T2DM患者中疗效的影响。方法采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性(polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)对255名T2DM患者和148名健康对照者进行β3-ARTrp64Arg基因型分析,并在T2DM组中随机选取34名患者每天口服4mg罗格列酮,持续12wk。服药前和服药第12周末进行血糖、血胰岛素以及糖化血红蛋白等指标的测定。结果β3-AR Trp64Arg等位基因的发生频率符合Hardy-Wein-berg平衡,64Arg等位基因在T2DM组和健康对照组的频率分别为0.13和0.17。罗格列酮治疗12wk后,Trp64Arg基因型患者甘油三酯的下降值低于Trp64Trp型患者(P<0.05),但后者对低密度脂蛋白胆固醇(P<0.01)与脂联素(P<0.05)的作用优于Trp64Arg基因型患者。结论β3-AR Trp64Arg遗传多态性与中国汉族人群T2DM发病无明显相关性,但对2型糖尿病中罗格列酮的疗效存在一定影响。 展开更多
关键词 Β3肾上腺素受体 基因多态性 2型糖尿病 罗格列
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CYP2D6基因多态性与抗精神病药物的个体化应用 被引量:9
15
作者 陈冰 蔡卫民 杨婉花 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2012年第9期1067-1074,共8页
CYP2D6是一种重要的细胞色素P450酶,存在着显著的基因多态性。CYP2D6在抗精神病类药物的代谢中发挥着重要作用,与许多抗精神病药物药动学及药效学的个体间变异存在着密切联系,检测CYP2D6基因型有助于患者抗精神病药物治疗方案的选择和调... CYP2D6是一种重要的细胞色素P450酶,存在着显著的基因多态性。CYP2D6在抗精神病类药物的代谢中发挥着重要作用,与许多抗精神病药物药动学及药效学的个体间变异存在着密切联系,检测CYP2D6基因型有助于患者抗精神病药物治疗方案的选择和调整,提高用药的安全性和有效性。本文综述CYP2D6基因多态性对抗精神病药物的药动学、不良反应及药物相互作用的影响,探讨了CYP2D6基因型检测在抗精神病个体化治疗中的应用前景。 展开更多
关键词 CYP2D6 基因多态性 抗精神病药物 药动学 不良反应
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基于二代测序数据开发以93-11为亲本的水稻SNP-dCAPS标记的研究实例 被引量:9
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作者 杨广阔 陈子强 +3 位作者 陈在杰 苏军 陈松彪 王锋 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1288-1295,共8页
作为第一个全基因组序列被测定的籼稻材料,93-11,已成为开展水稻分子遗传、功能基因定位和克隆等研究的最重要亲本之一。公共数据库公布的93-11序列为开发水稻SNP标记奠定了重要基础,但其序列中存在的部分错误,也给相应研究工作带来困... 作为第一个全基因组序列被测定的籼稻材料,93-11,已成为开展水稻分子遗传、功能基因定位和克隆等研究的最重要亲本之一。公共数据库公布的93-11序列为开发水稻SNP标记奠定了重要基础,但其序列中存在的部分错误,也给相应研究工作带来困扰。本研究通过双重参考日本晴序列和93-11序列,进行候选SNP位点碱基多重比对,建立了一个推测、甄别93-11公共数据库误差序列,开发SNP标记的实践方法。基于本研究建立的方法,针对一个涉及稻瘟病抗性材料P400突变基因所定位区间,结合d CAPS策略,展示了高效开发SNP-d CAPS标记的实例。研究结果表明,本研究建立的方法对利用93-11为亲本,开展水稻功能基因分离等工作,有积极的借鉴意义。 展开更多
关键词 水稻 93-11 单核苷酸多态性 衍生剪切扩增多态性
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凡纳滨对虾引进亲虾及其子一代的遗传多样性研究 被引量:8
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作者 李锋 林继辉 刘楚吾 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期64-68,共5页
采用Operon公司的16个引物对两个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)引进亲本群体及其子一代对虾的基因组DNA多态性进行了检测。第一个亲虾群体对16个引物共获得78个位点,其中多态位点数为48个,占61.54%;其子代对虾共获得89个位点,其中... 采用Operon公司的16个引物对两个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)引进亲本群体及其子一代对虾的基因组DNA多态性进行了检测。第一个亲虾群体对16个引物共获得78个位点,其中多态位点数为48个,占61.54%;其子代对虾共获得89个位点,其中多态位点数为50个,占56.18%。第二个亲虾群体对16个引物共获得97个位点,其中多态位点数为49个,占50.52%,其子代对虾共获得93个位点,多态位点数为28个,占30.11%。单个引物获得的标记数为1~8个。第一个亲本群体及其子代个体间的平均遗传距离分别是0.1959±0.0392和0.1435±0.0268;第二个亲本群体及其子代个体间的平均遗传距离分别为0.0922±0.0189和0.0621±0.0148。两个亲本群体间的遗传距离为0.6546±0.0794,两个子代群体间的遗传距离为0.7087±0.0656。在OPF-09、OPZ-11两个引物的扩增结果中,发现两个亲本群体及其子代有差异标记。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) 随机扩增多态性DNA(RAPD) 遗传多样性
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CMYA5基因多态性与新疆维吾尔族精神分裂症的关联性研究 被引量:5
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作者 罗晓 张丽丽 +2 位作者 韩书贤 安志国 伊琦忠 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期726-730,共5页
目的探讨心肌病相关基因5(cardiomyopathy associated 5,CMYA5)rs3828611位点基因多态性与新疆维吾尔族人群精神分裂症的关联性。方法通过Taq-man探针分型技术,对684例维吾尔族精神分裂症患者及678名维吾尔族正常对照的CMYA5基因rs3828... 目的探讨心肌病相关基因5(cardiomyopathy associated 5,CMYA5)rs3828611位点基因多态性与新疆维吾尔族人群精神分裂症的关联性。方法通过Taq-man探针分型技术,对684例维吾尔族精神分裂症患者及678名维吾尔族正常对照的CMYA5基因rs3828611位点进行基因分型,采用阳性与阴性症状量表(positive and negative symptoms scale,PANSS)评估患者症状。结果患者组与对照组间,rs3828611位点基因型与等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05);患者组男性与对照组男性、患者组女性与对照组女性间rs3828611位点基因型与等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05);青少年发病的患者与青少年对照之间,以及成年发病的患者与成年对照间等位基因和基因型频率差异无统计学意义(P>0.05)。不同基因型患者之间PANSS量表评分差异无统计学意义(P>0.05)。结论 CMYA5基因rs3828611位点多态性与新疆维吾尔族精神分裂症无明显关联。 展开更多
关键词 精神分裂症 心肌病相关基因5 rs3828611位点 单核苷酸多态性
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Genetic epidemiology of irritable bowel syndrome 被引量:22
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作者 Jasbir Makker Sridhar Chilimuri Jonathan N Bella 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第40期11353-11361,共9页
Irritable bowel syndrome(IBS) is the most common functional gastrointestinal disorder characterized by presence of abdominal pain or discomfort associated with altered bowel habits. It has three main subtypes- constip... Irritable bowel syndrome(IBS) is the most common functional gastrointestinal disorder characterized by presence of abdominal pain or discomfort associated with altered bowel habits. It has three main subtypes- constipation predominant IBS(C-IBS),diarrhea predominant IBS(D-IBS) and IBS with mixed featuresof both diarrhea as well as constipation(M-IBS). Its pathophysiology and underlying mechanisms remain elusive. It is traditionally believed that IBS is a result of multiple factors including hypersensitivity of the bowel,altered bowel motility,inflammation and stress. Initial studies have shown familial aggregation of IBS suggesting shared genetic or environmental factors. Twin studies of IBS from different parts of world have shown higher concordance rates among monozygotic twins than dizygotic twins,and thus suggesting a genetic component to this disorder. Multiple studies have tried to link single-nucleotide polymorphisms(SNPs) to IBS but there is little evidence that these SNPs are functional. Various molecules have been studied and investigated by the researchers. Serotonin,a known neurotransmitter and a local hormone in the enteric nervous system,has been most extensively explored. At this time,the underlying gene pathways,genes and functional variants linked with IBS remain unknown and the promise of genetically-determined risk prediction and personalize medicine remain unfulfilled. However,molecular biological technologies continue to evolve rapidly and genetic investigations offer much promise in the intervention,treatment and prevention of IBS. 展开更多
关键词 IRRITABLE BOWEL SYNDROME Single-nucleotide polymor
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福建太平洋牡蛎种群微卫星DNA分析 被引量:4
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作者 陈曦 黄勤 +1 位作者 江锦祥 马平 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期548-554,共7页
本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性... 本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性.与Genebank提供的相关序列比较,福建太平洋牡蛎与Genebank样品应属同源,其中漳浦霞美和厦门白礁的样品则可能代表同一种群的两个衍生品系.本项调查结果同时显示,近亲繁殖的育苗方式已经导致福建太平洋牡蛎种群裂化;任其发展不利于维护良种优势.本次采集的样品中未发现显示葡萄牙牡蛎、熊本牡蛎和美洲牡蛎微卫星特征的个体. 展开更多
关键词 太平洋牡蛎 近江牡蛎 微卫星DNA 种群裂化
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