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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用 被引量：15
1
作者 张成岗 欧阳曙光 +5 位作者 张绍文 瞿祥虎 鱼咏涛 周钢桥 吴松锋 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第2期263-266,共4页
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大... 基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 . 展开更多
关键词 PC机 LINUX操作系统 软件 生物信息学 大规模测序 核酸序列
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基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用 被引量：1
2
作者 符志彦 卢阳 +2 位作者 叶兰汀 何智良 徐安龙 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期60-63,共4页
基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜... 基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜索进行相似性分析。该系统可以加速大规模EST测序的分析速度。 展开更多
关键词 cDNA序列自动分析系统 大规模测序 unix/linux操作系统 phred/phrap软件 stackpack软件 blast软件 系统开发 MYSQL数据库
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