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Engineering guide RNA to reduce the off-target effects of CRISPR 被引量:4
1
作者 Jing Wu Hao Yin 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2019年第11期523-529,共7页
As versatile and robust genome editing tools,clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)technologies have been broadly used in basic research,biotechnology,and therapeutic development.Off-target ... As versatile and robust genome editing tools,clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)technologies have been broadly used in basic research,biotechnology,and therapeutic development.Off-target mutagenesis by CRISPR systems has been demonstrated,and various methods have been developed to markedly increase their specificity.In this review,we highlight the efforts of producing and modifying guide RNA(gRNA)to minimize off-target activities,including sequence and structure design,tuning expression and chemical modification.The modalities of gRNA engineering can be applied across CRISPR systems.In conjunction with CRISPR protein effectors,the engineered gRNA enables efficient and precise genome editing. 展开更多
关键词 CRISPR GENOME EDITING Engineered guide RNA off-target effects
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采用蛋白组学技术分析质粒介导siRNA的“Off-target”效应 被引量:1
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作者 周昌华 章崇杰 +2 位作者 彭晓东 魏大鹏 王光迪 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期170-180,共11页
siRNA的"脱靶效应"(off-target effects)是RNA干扰应用研究领域的热点问题.采用蛋白组学技术对质粒介导的siRNA稳定沉默原癌基因c-myc可能存在的"off-target"效应进行初步研究,为siRNA靶向特异性的系统评价奠定理... siRNA的"脱靶效应"(off-target effects)是RNA干扰应用研究领域的热点问题.采用蛋白组学技术对质粒介导的siRNA稳定沉默原癌基因c-myc可能存在的"off-target"效应进行初步研究,为siRNA靶向特异性的系统评价奠定理论与实验基础.构建靶向c-myc的siRNA真核表达质粒p-Mat01-1及其错配质粒p-Mis09-1,空质粒pEGFP-C1为对照,并稳定转染MCF-7人乳腺癌细胞.通过RT-PCR和Western印迹分析结果显示p-Mat01-1稳定转染克隆中c-myc/c-MYC的表达降低.采用2-DE及LC-ESI-MS/MS等方法,研究了p-Mat01-1与pEGFP-C1稳定转染克隆的蛋白组表达差异.结果显示,p-Mat01-1稳定转染克隆中有47个c-myc非调控蛋白点表达升高或降低,约占423个随机检测蛋白点的11.1%.这些蛋白涉及细胞骨架、代谢、增殖、信号传导、分子伴侣、氧化还原等多条途径.实验结果表明,质粒介导靶向c-myc的siRNA在MCF-7细胞中存在明显的"off-target"效应,提示在设计siRNA实验及应用研究时应系统考察其靶向特异性. 展开更多
关键词 C-MYC RNA干扰 小干扰RNA 脱靶效应 蛋白组学
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系统循证医学:推动中医药疗效研究的新方向 被引量:9
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作者 谭婧 王雯 +24 位作者 李玲 刘青松 梅凡 王子晨 陈晨 秦璇 丁玲 王礼群 刘佳利 罗小超 刘学红 何逸飞 王文玲 任燕 赖钦淮 熊益权 姚明宏 徐嘉悦 姚于勤 陈素君 蒋静文 陈雏 郜洁 金钊 孙鑫 《中国循证医学杂志》 北大核心 2025年第2期125-133,共9页
中医药是中华民族的瑰宝,疗效是中医药生存发展的根基,确保有效是中医药传承创新的核心命题。然而,中医药体系的高度复杂性导致其疗效在研发与应用中常偏离预期(即“疗效脱靶”),是中医药面临的关键挑战。笔者团队基于前期工作提出了面... 中医药是中华民族的瑰宝,疗效是中医药生存发展的根基,确保有效是中医药传承创新的核心命题。然而,中医药体系的高度复杂性导致其疗效在研发与应用中常偏离预期(即“疗效脱靶”),是中医药面临的关键挑战。笔者团队基于前期工作提出了面向中医药复杂干预的创新思路(“系统循证医学”)。其核心思想是:针对中医药“疗效生成”和“疗效测量”问题,融合临床与非临床药效评价手段,构建“疗效靶标识别-疗效作用发现-疗效精准验证”的系统化中医药疗效评价路径,确保中医药疗效呈现,实现中医药“疗效精准打靶”。进一步整合药学、信息、生物技术,多维度解析中医药的靶标网络和作用机理,为阐释中医药防治疾病的科学原理提供基础支撑。在此基础上,笔者团队融合真实世界数据大队列、临床试验、证据合成与快速推荐方法,以及信息技术、生物医药技术,构建了中医药干预(如针灸、已上市中药)的系统循证模型(6R模型),并在孕产、重症、骨关节疾病等领域进行了应用。 展开更多
关键词 中医药 复杂干预 疗效脱靶 多学科整合 系统循证医学
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Antitumor and off-target effects of cholesterol-conjugated let-7a mimics in an orthotopic hepatocellular carcinoma xenograft nude mouse model 被引量:1
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作者 Jian Guan Mingyang Liu +9 位作者 Xin Li Liangrui Zhou Xueyu Dong Wei Dai Yu Xia Tao Yang Shaojuan Guo Xingqi Li Yehua Han Yufeng Luo 《Journal of Bio-X Research》 2022年第4期181-196,共16页
Objective: To explore the antitumor and potential off-target effects of systemically delivered cholesterol-conjugatedlet-7a mimics(Chol-let-7a) and control mimics(Chol-miRCtrl) on hepatocellular carcinomain vivo.Metho... Objective: To explore the antitumor and potential off-target effects of systemically delivered cholesterol-conjugatedlet-7a mimics(Chol-let-7a) and control mimics(Chol-miRCtrl) on hepatocellular carcinomain vivo.Methods: The antitumor effects of two intravenous dosing regimens ofChol-let-7a on heptocellular carcinoma growth were compared using an orthotopic xenograft mouse model. Off-targets were analyzed with histopathological and ultrapathological features of heparenal tissue and cells in theChol-let-7a-, Chol-miRCtrl-, and saline-treated (blank) xenograft mice and normal control mice. Then,let-7a abundance in orthotopic tumors, corresponding paracancerous hepatic tissue, and normal liver tissue from healthy nude mice was examined by reverse transcription-polymerase chain reaction. The distribution ofChol-let-7a andChol-miRCtrl in vivo was examined by whole-animal imaging and frozen-sections observation. The experiments were approved by the Institutional Research Board of Peking Union Medical College Hospital.Results: Continuous treatment withChol-let-7a resulted in tumors that were 35.86% and 40.02% the size of those in theChol-miRCtrl and blank xenograft group (P < 0.01 andP < 0.01, respectively), while intermittent dosing withChol-let-7a resulted in tumors that were 65.42% and 56.66% the size of those in theChol-miRCtrl and the blank control group, respectively (P < 0.05 andP < 0.05). In addition, some histopathological and ultrapathological features were only observed after treatment with the two cholesterol-conjugated molecules, however mild with intermittent dosingChol-let-7a treatment, such as diffuse sinusoidal dilation and edema, primarily around the centrolobular vein in heptic tissues;mild hypercellularity with dilated capillary lumens in the renal tissue;and some organelle abnormalities found in heptic and renal cells. Furthermore, whole-animal imaging showed thatChol-let-7a andChol-miRCtrl were predominantly distributed in the liver, kidney, and bladder regions after injection, and that the concentration ofChol-let-7a andChol-miRCtrl in the kidney and the bladder decreased much slowly in the xenograft animals, especially in theChol-miRCtrl group. Finally, RT-PCR analysis showed thatlet-7a levels were significantly increased in Chol-let-7a-treated xenografts compared withChol-miRCtrl group (P=0.003) and blank xenograft group (P=0.001);however, the level was only equivalent to 50.6% and 40.7% of that in paracancerous hepatic tissue and hepatic tissue in normal mice, respectively.Conclusions: Chol-let-7a, administered either continuously or intermittently, showed effective antitumor efficacy.Chol-let-7a had some off-target effects, such as mild acute hepatitis-like inflammation and non-specific drug-induced kidney injury. The intermittent dosing regimen resulted in less damage than the continuous regimen, while maintaining relatively satisfactory antitumor efficacy, which could be useful for the investigation and possible clinical use of miRNA treatment regimens in the future. 展开更多
关键词 drug-induced renal injury hepatic toxicity in vivo off target effects let-7 mimics nonviral delivery vector
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CAR-T细胞疗法在食管癌治疗中的研究进展 被引量:1
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作者 安艳辉 翟景明 +2 位作者 杨如月 庞天舒 梁高峰 《食管疾病》 2025年第1期16-20,41,共6页
嵌合抗原受体修饰T细胞(chimeric antigen receptor T cells,CAR-T)疗法在血液肿瘤中表现出良好的治疗效果,同时,针对实体瘤的CAR-T细胞研究也表现出很好的潜力。食管癌(esophageal cancer,EC)在我国发病率及死亡率均位居前列,传统手术... 嵌合抗原受体修饰T细胞(chimeric antigen receptor T cells,CAR-T)疗法在血液肿瘤中表现出良好的治疗效果,同时,针对实体瘤的CAR-T细胞研究也表现出很好的潜力。食管癌(esophageal cancer,EC)在我国发病率及死亡率均位居前列,传统手术及放化疗均有不同程度的缺点,亟需新的治疗手段来弥补当前治疗的不足。本文就CAR-T疗法在食管癌治疗中亟需解决的问题及其应对策略来展开论述,以期为食管癌基础及临床研究提供参考。 展开更多
关键词 CAR-T 食管癌 脱靶效应 肿瘤微环境
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多靶点CAR-T细胞疗法在急性B淋巴细胞白血病中的应用 被引量:1
6
作者 曹金金 杜娟 +4 位作者 瞿姗娜 朱明宇 汪洋 胡翰 刘滨磊 《基础医学与临床》 2025年第5期675-680,共6页
嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞疗法作为一种新型细胞免疫疗法,在治疗恶性血液瘤尤其是急性B淋巴细胞白血病的临床上已经展现出较好的疗效。然而,单一靶点选择存在抗原丧失和免疫逃逸等问题,因此多靶点治疗策略逐渐受到关注。多靶点CAR-T是... 嵌合抗原受体T(CAR-T)细胞疗法作为一种新型细胞免疫疗法,在治疗恶性血液瘤尤其是急性B淋巴细胞白血病的临床上已经展现出较好的疗效。然而,单一靶点选择存在抗原丧失和免疫逃逸等问题,因此多靶点治疗策略逐渐受到关注。多靶点CAR-T是通过同时靶向多个肿瘤相关抗原,既能有效避免单一靶点导致的抗原逃逸问题,降低了复发风险,又有望提高治疗效果。本文主要介绍了多靶点CAR-T细胞疗法的结构类型以及治疗急性B淋巴细胞白血病的临床试验应用,期望在未来为治疗急性B淋巴细胞白血病提供参考。 展开更多
关键词 多靶点 CAR-T细胞疗法 急性B淋巴细胞白血病 脱靶效应 肿瘤相关抗原
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水稻愈伤特异性启动子P_(OsCSPpro)在花生愈伤中的功能鉴定及碱基编辑效率分析
7
作者 薛璐璐 李晓娜 +7 位作者 罗丹丹 刘涵 渠鹏宇 黄冰艳 韩锁义 董文召 石磊 张新友 《中国油料作物学报》 北大核心 2025年第5期1091-1099,共9页
CRISPR/Cas9基因编辑系统的脱靶问题是研究者们一直以来的重点关注问题,采用愈伤特异性启动子驱动Cas9蛋白能够降低编辑株系成苗后的脱靶风险。为有效降低脱靶效应,本研究克隆了一个源自水稻的愈伤特异性启动子P_(OsCSPpro),研究了其在... CRISPR/Cas9基因编辑系统的脱靶问题是研究者们一直以来的重点关注问题,采用愈伤特异性启动子驱动Cas9蛋白能够降低编辑株系成苗后的脱靶风险。为有效降低脱靶效应,本研究克隆了一个源自水稻的愈伤特异性启动子P_(OsCSPpro),研究了其在花生愈伤中的表达活性及碱基编辑效率。GUS组织化学染色结果表明,该启动子在花生愈伤中具有活性。选择AhALS2基因第190位氨基酸P190为靶点,以该启动子驱动胞嘧啶脱氨酶和nCas9蛋白,构建碱基编辑载体并转化花生,对该启动子的编辑效率进行检验。结果表明,P_(OsCSPpro)驱动的胞嘧啶碱基编辑器在花生中具有编辑活性,编辑效率为3.6%。 展开更多
关键词 花生 愈伤特异性启动子 P_(OsCSPpro) 脱靶效应 GUS报告基因 碱基编辑
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昆虫RNAi:二十年回顾与展望
8
作者 吕子豪 马海宾 张文庆 《应用昆虫学报》 北大核心 2025年第5期1299-1313,共15页
自21世纪初我国系统开展昆虫RNAi研究以来,该领域取得了显著进展,科研论文的发表数量与质量现均已达到国际先进水平。本文系统回顾了近二十年来RNAi技术对中国昆虫学研究的重大推动作用。借助RNAi技术,我国学者在昆虫基因功能解析方面... 自21世纪初我国系统开展昆虫RNAi研究以来,该领域取得了显著进展,科研论文的发表数量与质量现均已达到国际先进水平。本文系统回顾了近二十年来RNAi技术对中国昆虫学研究的重大推动作用。借助RNAi技术,我国学者在昆虫基因功能解析方面不断深入,揭示了昆虫翅型分化等重要生物过程的分子机制。同时,研究者们逐步探索了RNAi技术在田间应用的潜力,在靶标基因筛选、dsRNA递送技术、RNAi脱靶风险预测及产业化应用等方面积累了大量成果。目前,我国在政策支持与技术储备方面已具备良好基础,加快推进RNA生物农药的研发与应用,将显著提升我国农林产业的科技竞争力,为推动农林业绿色可持续发展提供有力支撑。 展开更多
关键词 昆虫 RNA干扰 基因功能 RNA生物农药 害虫控制 脱靶效应
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靶向实体瘤CAR-T细胞设计:安全性与通用性提升策略
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作者 邱毓灵 廖天艺 +1 位作者 刘宝瑞 李茹恬 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第6期559-569,共11页
嵌合抗原受体基因修饰T细胞(CAR-T细胞)疗法是一种肿瘤免疫治疗方法:来自人体的T细胞在体外经遗传学修饰、表达特异性嵌合抗原受体(CAR),然后将其回输入患者体内,用于靶向识别和消除肿瘤细胞。尽管CAR-T细胞疗法在血液系统肿瘤治疗中取... 嵌合抗原受体基因修饰T细胞(CAR-T细胞)疗法是一种肿瘤免疫治疗方法:来自人体的T细胞在体外经遗传学修饰、表达特异性嵌合抗原受体(CAR),然后将其回输入患者体内,用于靶向识别和消除肿瘤细胞。尽管CAR-T细胞疗法在血液系统肿瘤治疗中取得了较为显著的成功,其在实体瘤治疗中仍面临障碍。细胞因子释放综合征(CRS)等免疫相关不良反应(irAE)制约了CAR-T细胞的安全应用,肿瘤相关抗原(TAA)的异质性限制了单一CAR-T细胞的广谱适用性,也制约了其通用型开发。鉴于此,要使CAR-T细胞疗法在实体瘤临床治疗中得到应用,还需开展进一步的改良与提升研究。本文围绕实体瘤中CAR-T细胞疗法,从“CAR基因修饰策略”、“通用免疫受体的再靶向策略”及“抗原通用性‘赋靶’策略”三个方面对CAR-T细胞领域中为提高安全性和通用性所进行的探索进行述评,系统剖析各策略的研究路径、优势及局限性,并展望未来发展方向。通过综述CAR-T细胞安全性和普适性设计策略的进展,本文旨在为实体瘤的CAR-T细胞疗法研发提供创新思路。 展开更多
关键词 实体瘤免疫治疗 嵌合抗原T细胞疗法 脱靶效应 开关CAR-T细胞
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CRISPR-Cas9基因编辑系统及其在昆虫中的应用研究进展
10
作者 张秋朗 刘志飞 +2 位作者 张贝贝 钟军 张旺和 《生物灾害科学》 2025年第4期622-630,共9页
CRISPR-Cas9基因编辑系统自问世以来就在生命科学研究领域得到广泛应用。近年来,随着脱靶效应、显微注射等技术不断改良,该技术也被广泛应用于昆虫学领域的相关研究。通过对CRISPR-Cas9基因编辑系统在昆虫研究中的技术进展进行概述,并... CRISPR-Cas9基因编辑系统自问世以来就在生命科学研究领域得到广泛应用。近年来,随着脱靶效应、显微注射等技术不断改良,该技术也被广泛应用于昆虫学领域的相关研究。通过对CRISPR-Cas9基因编辑系统在昆虫研究中的技术进展进行概述,并就该技术在昆虫基因编辑及基因功能方面的研究进展进行总结,旨在为利用CRISPR-Cas9基因编辑系统对昆虫基因功能的研究、害虫防治以及经济性昆虫分子改良等领域的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 CRISP-Cas9 基因编辑 脱靶效应 昆虫
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CRISPR/Cas9系统中sgRNA设计与脱靶效应评估 被引量:23
11
作者 谢胜松 张懿 +4 位作者 张利生 李广磊 赵长志 倪攀 赵书红 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1125-1136,共12页
基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术,已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种的基因组改造。如何提高CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点,而使用高效且特异的sg RNA(Small gu... 基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术,已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种的基因组改造。如何提高CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点,而使用高效且特异的sg RNA(Small guide RNA)是基因组改造成功的关键性因素之一。目前,已有多款针对CRISPR/Cas9技术的sg RNA设计和/或脱靶效应评估软件,但不同的软件各有优缺点。本文重点对16款sg RNA设计和脱靶效应评估在线和单机版软件的特点进行了阐述,通过制定38项评估指标对不同软件进行了比较分析,最后对11种用于检测基因组编辑效率和脱靶的实验方法,以及如何筛选高效且特异的sg RNA进行了归纳总结。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9系统 基因组编辑 sgRNA 脱靶效应
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CRISPR/Cas9的应用及脱靶效应研究进展 被引量:49
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作者 郑武 谷峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1003-1010,共8页
CRISPR/Cas9基因编辑技术在生命科学领域掀起了一场全新的技术革命,该技术可以对基因组特定位点进行靶向编辑,包括缺失、插入、修复等。CRISPR/Cas9比锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)技术更易于操作,而且更高效。... CRISPR/Cas9基因编辑技术在生命科学领域掀起了一场全新的技术革命,该技术可以对基因组特定位点进行靶向编辑,包括缺失、插入、修复等。CRISPR/Cas9比锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)技术更易于操作,而且更高效。CRISPR/Cas9系统中的向导RNA(Single guide RNA,sg RNA)是一段与目标DNA片段匹配的RNA序列,指导Cas9蛋白对基因组进行识别。研究发现,设计的sg RNA会与非靶点DNA序列错配,引入非预期的基因突变,即脱靶效应(Off-target effects)。脱靶效应严重制约了CRISPR/Cas9基因编辑技术的广泛应用。为了避免脱靶效应,研究者对影响脱靶效应的因素进行了系统研究并提出了许多降低脱靶效应的方法。文章总结了CRISPR/Cas9系统的应用及脱靶效应研究进展,以期为相关领域的工作提供参考。 展开更多
关键词 基因组编辑 CRISPR/Cas9 脱靶效应 RNA
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基于CRISPR/Cas9系统的OsbHLH116基因编辑及其脱靶效应分析 被引量:4
13
作者 杜彦修 季新 +5 位作者 陈会杰 彭廷 张静 李俊周 孙红正 赵全志 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期577-586,共10页
以水稻OsbHLH116基因为编辑对象,根据基因编码区序列(CDS)在第一外显子区域设计长度为19bp的sgRNA,化学合成sgRNA的寡核苷酸序列,然后与CRISPR/Cas9系统表达载体pBUN411连接,再用农杆菌介导法获得水稻转基因株系,最后利用酶切和测序相... 以水稻OsbHLH116基因为编辑对象,根据基因编码区序列(CDS)在第一外显子区域设计长度为19bp的sgRNA,化学合成sgRNA的寡核苷酸序列,然后与CRISPR/Cas9系统表达载体pBUN411连接,再用农杆菌介导法获得水稻转基因株系,最后利用酶切和测序相结合的方法对OsbHLH116突变体进行了筛选鉴定和脱靶效应分析。结果表明,所构建的pBUN411-gRNA载体成功实现了对基因OsbHLH116的定向编辑。酶切分析表明在选取的10株T0代转基因苗中得到了6个OsbHLH116突变单株。对6个突变单株进行了TA克隆测序分析,发现了纯合突变、双等位突变和杂合突变3种类型。酶切分析表明2个潜在脱靶位点均未发生脱靶效应。 展开更多
关键词 水稻 基因编辑 CRISPR/Cas9 脱靶效应 OsbHLH116
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CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术研究进展 被引量:19
14
作者 李聪 曹文广 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1531-1542,共12页
CRISPR/Cas9(Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)是最近发现的一种新型的基因组定点编辑技术。CRISPR即成簇的、有规律的、间隔短回文重复序列,是人们在研究大肠杆菌编码的碱性... CRISPR/Cas9(Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)是最近发现的一种新型的基因组定点编辑技术。CRISPR即成簇的、有规律的、间隔短回文重复序列,是人们在研究大肠杆菌编码的碱性磷酸酶基因时发现的,它原本是存在于细菌和古细菌基因组中含有多个短重复序列的基因位点,能够为自身提供一种特异性免疫保护机制,抵御外来病毒、质粒等遗传元件的入侵。CRISPR系统主要依赖cr RNA(CRISPR RNA)和tracr RNA(Trans-activating chimeric RNA)结合并导向Cas(CRISPR-associated system)蛋白来对外源DNA进行序列特异性降解。目前已经发现了3种类型的CRISPR/Cas系统:Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。其中Ⅱ型系统组分较为简单,主要依赖的是Cas9核心蛋白,在RNA的介导下,Cas9蛋白能够识别靶序列进行切割造成DNA的双链断裂(Double-strand breaks,DSB)。在此基础上,人们可以对基因组的特定位点进行基因打靶、基因定点插入、基因修复等各种遗传操作。这种新的基因组定点编辑技术比类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nuclease,TALEN)和锌指核酸酶(Zinc-finger nuclease,ZFN)技术设计更加简单、更容易操作,势必会有更广泛的应用。目前,利用该技术已在多个物种的细胞和个体水平上实现了遗传操作。文中将从CRISPR/Cas9的来源、结构、作用机理方面介绍其研究进展,为开展这一领域的研究工作提供参考。 展开更多
关键词 基因编辑 CRISPR/Cas9系统 单链向导RNA 脱靶效应
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干扰RNA的非靶免疫副作用及其siRNA序列设计与化学修饰 被引量:3
15
作者 韩秋菊 张彩 +1 位作者 张建 田志刚 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第4期343-347,共5页
siRNA介导的RNA干扰技术已经成为基因功能研究和开展疾病治疗的有用工具.近年发现,siRNA在哺乳动物体内可激活天然免疫系统,诱导干扰素等炎症因子的分泌,并且可非特异性抑制某些非靶基因的表达,有可能极大限制RNA干扰技术的应用.进行高... siRNA介导的RNA干扰技术已经成为基因功能研究和开展疾病治疗的有用工具.近年发现,siRNA在哺乳动物体内可激活天然免疫系统,诱导干扰素等炎症因子的分泌,并且可非特异性抑制某些非靶基因的表达,有可能极大限制RNA干扰技术的应用.进行高效特异性siRNA的设计和修饰,以保持或者增强siRNA的特异性靶基因沉默作用,又消除siRNA对机体的非靶免疫副作用,成为使siRNA安全有效应用于临床治疗的关键. 展开更多
关键词 RNA干扰 SIRNA TLR 非靶效应
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siRNA脱靶效应类型与规避策略 被引量:2
16
作者 唐德平 毛爱红 +2 位作者 廖世奇 薛林贵 张柄林 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期113-119,共7页
小干扰RNAs(small interfere RNAs,siRNAs)能够特异性沉默靶基因,现已广泛应用于阐明基因功能,鉴定药物靶点,开发比目前更有效的治疗药物。然而siRNA脱靶效应(off-target effects,OTEs)导致基因沉默实验中表型效应解释复杂化,引起siRNA... 小干扰RNAs(small interfere RNAs,siRNAs)能够特异性沉默靶基因,现已广泛应用于阐明基因功能,鉴定药物靶点,开发比目前更有效的治疗药物。然而siRNA脱靶效应(off-target effects,OTEs)导致基因沉默实验中表型效应解释复杂化,引起siRNA治疗毒副作用。与siRNA有关的脱靶效应有microRNA样脱靶效应、免疫刺激、RNAi元件饱和三种类型。综述了siRNA脱靶效应类型及减轻脱靶效应的方法,以增强该技术的实用性。 展开更多
关键词 RNA干扰 小干扰RNA 脱靶效应 MICRORNA 样脱靶效应
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RNA干扰非特异性研究进展 被引量:4
17
作者 韩继波 陈晨 +1 位作者 陈始明 陶泽璋 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期27-30,共4页
RNA干扰(RNA i)靶向基因治疗是目前研究的热点,其依赖序列特异性的基因表达调节为生物学发展带来重大突破。然而在应用RNA i时所产生的一系列非特异性反应阻碍了RNA i进一步的临床应用,这其中主要包括脱靶基因抑制和内在免疫副反应等。... RNA干扰(RNA i)靶向基因治疗是目前研究的热点,其依赖序列特异性的基因表达调节为生物学发展带来重大突破。然而在应用RNA i时所产生的一系列非特异性反应阻碍了RNA i进一步的临床应用,这其中主要包括脱靶基因抑制和内在免疫副反应等。主要从非特异性反应的产生机制、脱靶效应的预测和RNA i非特异性的控制3个方面对近几年研究成果进行综述,探讨临床应用前景。 展开更多
关键词 RNA干扰 非特异性反应 脱靶效应 免疫副反应
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基于CRISPR/Cas9系统定点编辑小鼠MAD2L1基因及其脱靶效应分析 被引量:4
18
作者 陈丽香 彭秀华 +5 位作者 谭丹 韩铖潇 赵锐 王超 李顺 周晓辉 《中国实验动物学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期587-593,共7页
目的建立利用CRISPR/Cas9系统对小鼠MAD2L1基因第二外显子基因编辑的方法体系,并分析CRISPR/Cas9对MAD2L1基因编辑的脱靶效应。方法通过CHOPCHOP网站设计位于小鼠MAD2L1基因第二外显子的靶点序列,并构建Cas9-MAD2L1载体,将该载体转染到N... 目的建立利用CRISPR/Cas9系统对小鼠MAD2L1基因第二外显子基因编辑的方法体系,并分析CRISPR/Cas9对MAD2L1基因编辑的脱靶效应。方法通过CHOPCHOP网站设计位于小鼠MAD2L1基因第二外显子的靶点序列,并构建Cas9-MAD2L1载体,将该载体转染到NIH/3T3细胞中,通过嘌呤霉素筛选并结合荧光显微镜观察GFP后,提取细胞转染后的基因组DNA,利用PCR方法,结合T7E1分析和桑格尔测序,鉴定对小鼠MAD2L1基因编辑情况,并对转染后的NIH/3T3细胞进行CRISPR/Cas9脱靶效应分析。结果将Cas9-MAD2L1载体转染到NIH/3T3细胞并进行嘌呤霉素筛选后,荧光显微镜下观察到大量表达GFP的细胞,PCR结合T7E1结果显示,以转染后的细胞DNA为模板扩增出的228 bp MAD2L1 PCR产物,可被酶切成166 bp和62 bp片段,测序结果显示,成功对MAD2L1基因第二外显子靶点处进行基因编辑,脱靶效应分析未检测到CRISPR/Cas9有对脱靶位点进行基因编辑。结论成功建立对小鼠MAD2L1基因第二外显子进行基因编辑的方法体系,设计的对MAD2L1基因编辑靶点未检测到脱靶效应的发生。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 小鼠 MAD2L1 脱靶效应
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RNA干扰在肿瘤治疗中的研究进展 被引量:5
19
作者 袁慎俊 胡卫 陈涛 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1367-1370,1374,共5页
恶性肿瘤是威胁人类健康的一大杀手,目前所采取的手术、放化疗等治疗措施效果并不理想。本文介绍了RNA干扰(RNAi)的相关作用机制及其在肿瘤治疗中的应用,并叙述了RNAi用于治疗时的递送方式、引起的脱靶效应和免疫反应,提示RNAi用于治疗... 恶性肿瘤是威胁人类健康的一大杀手,目前所采取的手术、放化疗等治疗措施效果并不理想。本文介绍了RNA干扰(RNAi)的相关作用机制及其在肿瘤治疗中的应用,并叙述了RNAi用于治疗时的递送方式、引起的脱靶效应和免疫反应,提示RNAi用于治疗时存在的一些问题,通过进一步的研究,基于RNAi的肿瘤治疗有望成为一种肿瘤治疗新方法。 展开更多
关键词 RNA干扰 肿瘤治疗方案 脱靶效应 免疫反应
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CRISPR/Cas9系统中的脱靶效应及检测技术研究进展 被引量:9
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作者 张晨 雷展 +2 位作者 李凯 商颖 许文涛 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期78-87,共10页
聚类规则间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白(Cas9蛋白)已经成为精确编辑基因组的强大工具。CRISPR/Cas9系统源自于细菌和古生菌的免疫机制,结构简单、易于设计,仅... 聚类规则间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白(Cas9蛋白)已经成为精确编辑基因组的强大工具。CRISPR/Cas9系统源自于细菌和古生菌的免疫机制,结构简单、易于设计,仅需改变单引导RNA(single-guide RNA,sgRNA)上的一小段序列即可快速实现对不同基因位点的编辑。与锌指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFN)和转录激活因子样效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALEN)技术相比,CRISPR/Cas9系统基因编辑效率更高、特异性更强。但在应用过程中不可避免的脱靶事件严重限制了CRISPR/Cas9系统的进一步发展,因此本篇文章就CRISPR/Cas9系统的脱靶类型、影响因素、降低策略以及脱靶检测技术进行综述。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 脱靶效应 影响因素 降低策略 检测技术
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