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基于生物信息学分析子痫前期中miR-943的作用研究
1
作者
沈婕
沈树娜
+2 位作者
林元
邓森灵
郑华玲
《生殖医学杂志》
2025年第6期826-832,共7页
目的对子痫前期(PE)相关的miR-943靶基因进行生物信息学分析,为miR-943在子痫前期发生机制中的研究提供新方向。方法从基因表达数据库(GEO)中数据集GSE206988中筛选出在子痫前期患者的胎盘组织中表达显著下调的miR-943,利用miRPathDB、T...
目的对子痫前期(PE)相关的miR-943靶基因进行生物信息学分析,为miR-943在子痫前期发生机制中的研究提供新方向。方法从基因表达数据库(GEO)中数据集GSE206988中筛选出在子痫前期患者的胎盘组织中表达显著下调的miR-943,利用miRPathDB、TargetScan数据库进行靶基因预测,并通过韦恩图取其交集数据,利用clusterProfiler R包行靶基因的基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,应用数据库STRING构建靶基因的蛋白质相互作用网络(PPI)。结果TargetScan和miRPathDB同时预测获得的靶基因共36个。GO功能注释共富集到15项,细胞组分(CC)主要富集于信号识别颗粒和内质网,分子功能(MF)主要富集于胎盘生长因子激活受体活性、蛋白磷酸酶调节活性等。KEGG通路富集分析显示,miR-943靶基因主要与PI3K-Akt、cAMP、MAPK等信号通路有关。结论miR-943的靶基因功能与胎盘生长因子激活受体活性、蛋白磷酸酶调节活性等有关,参与的信号通路与PE关系密切,miR-943可能通过对靶基因的调控参与到PE的发生发展。
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关键词
子痫前期
mirna-943
生物信息学分析
暂未订购
题名
基于生物信息学分析子痫前期中miR-943的作用研究
1
作者
沈婕
沈树娜
林元
邓森灵
郑华玲
机构
海南西部中心医院产科
出处
《生殖医学杂志》
2025年第6期826-832,共7页
基金
海南省自然科学基金(822RC853)。
文摘
目的对子痫前期(PE)相关的miR-943靶基因进行生物信息学分析,为miR-943在子痫前期发生机制中的研究提供新方向。方法从基因表达数据库(GEO)中数据集GSE206988中筛选出在子痫前期患者的胎盘组织中表达显著下调的miR-943,利用miRPathDB、TargetScan数据库进行靶基因预测,并通过韦恩图取其交集数据,利用clusterProfiler R包行靶基因的基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,应用数据库STRING构建靶基因的蛋白质相互作用网络(PPI)。结果TargetScan和miRPathDB同时预测获得的靶基因共36个。GO功能注释共富集到15项,细胞组分(CC)主要富集于信号识别颗粒和内质网,分子功能(MF)主要富集于胎盘生长因子激活受体活性、蛋白磷酸酶调节活性等。KEGG通路富集分析显示,miR-943靶基因主要与PI3K-Akt、cAMP、MAPK等信号通路有关。结论miR-943的靶基因功能与胎盘生长因子激活受体活性、蛋白磷酸酶调节活性等有关,参与的信号通路与PE关系密切,miR-943可能通过对靶基因的调控参与到PE的发生发展。
关键词
子痫前期
mirna-943
生物信息学分析
Keywords
Preeclampsia
mirna-943
Bioinformatics analysis
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析子痫前期中miR-943的作用研究
沈婕
沈树娜
林元
邓森灵
郑华玲
《生殖医学杂志》
2025
0
暂未订购
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