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真菌Ndt80-like蛋白研究进展
1
作者 谢靖 张钦 +2 位作者 刘欢 王颖 何群 《中国农业大学学报》 北大核心 2026年第1期1-10,共10页
为全面了解Ndt80-like蛋白功能、探究其作为靶点开发抗真菌药物的潜力,以“Ndt80”、“Ndt80-like protein”和“真菌”为关键词,检索国内外相关文献,总结分析Ndt80-like蛋白的结构和其在有性生殖、减数分裂、环境营养感知和细胞代谢重... 为全面了解Ndt80-like蛋白功能、探究其作为靶点开发抗真菌药物的潜力,以“Ndt80”、“Ndt80-like protein”和“真菌”为关键词,检索国内外相关文献,总结分析Ndt80-like蛋白的结构和其在有性生殖、减数分裂、环境营养感知和细胞代谢重塑等方面的功能,并对Ndt80-like蛋白作为靶点开发抗真菌药物的可行性进行展望。结果表明:1)子囊菌(Ascomycetes)和担子菌(Basidiomycetes)的Ndt80-like蛋白DNA结合结构域高度保守,激活结构域高度可变;2)真菌Ndt80-like蛋白是调控有性生殖和减数分裂的关键转录激活因子;3)Ndt80-like蛋白通过整合多种营养信号来调控真菌的发育和环境适应性。综上,真菌Ndt80-like蛋白作为p53-like超家族转录因子,在真菌的有性生殖、生长发育、代谢重塑、环境胁迫响应及侵染致病的过程中发挥了核心作用,在真菌病害防控及高效工业生产底盘菌株构建中具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 Ndt80-like蛋白 Ndt80 VIB-1 FSD-1 真菌
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转录因子CsMYB75-like-2调控茶树花青素合成的分子机制研究
2
作者 周慧 崔悠 +5 位作者 陈雯剑 杜悦阳 张欢 苏鸿锋 张凯凯 张凌云 《茶叶科学》 北大核心 2026年第1期20-34,共15页
花青素作为植物重要的次生代谢产物,赋予植物多彩的颜色,吸引昆虫授粉,抵抗生物和非生物胁迫,对植物生长发育和繁殖具有重要意义。以高花青素茶树品种‘紫娟’为试验材料,探究R2R3-MYB型转录因子CsMYB75-like-2对茶树花青素合成的调控... 花青素作为植物重要的次生代谢产物,赋予植物多彩的颜色,吸引昆虫授粉,抵抗生物和非生物胁迫,对植物生长发育和繁殖具有重要意义。以高花青素茶树品种‘紫娟’为试验材料,探究R2R3-MYB型转录因子CsMYB75-like-2对茶树花青素合成的调控机制。结果表明,CsMYB75-like-2属于花青素合成的SG6亚族,该基因在紫化茶树品种中的表达量显著高于绿色茶树品种,且在幼嫩组织特异性高表达,不同茶树品种中CsMYB75-like-2的蛋白编码区高度保守。亚细胞定位和酵母转录活性试验证实,CsMYB75-like-2是一个核膜共定位的激活型转录因子;遮阴试验表明,CsMYB75-like-2及下游基因(CsDFR和CsFLS)的表达水平与花青素含量呈正相关。与CsMYB75-like-1功能不同,CsMYB75-like-2对花青素合成关键基因CsANS无直接调控作用;其与CsMYB308、CsMYB114等MYB家族成员形成互作调控网络。研究结果可为解析茶树花青素合成分子机制及紫化茶树品种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 茶树 花青素 CsMYB75-like-2 调控机制
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钩藤钩发育相关SEPALLATA-like基因的克隆与表达分析
3
作者 黄明慧 罗秋妹 +3 位作者 刘畅 魏升华 李涛 桑思宏 《广西植物》 北大核心 2026年第3期492-506,共15页
钩器官是药用植物钩藤的特殊结构,也是主要药用部位,与花序被认为属于同源器官,但是钩如何发育而来尚不清楚。为解析钩器官的来源及其发育机制,该研究通过RT-PCR及RACE技术克隆了3个钩藤MADS-box转录因子家族SEPALLATA(SEP)-like基因的... 钩器官是药用植物钩藤的特殊结构,也是主要药用部位,与花序被认为属于同源器官,但是钩如何发育而来尚不清楚。为解析钩器官的来源及其发育机制,该研究通过RT-PCR及RACE技术克隆了3个钩藤MADS-box转录因子家族SEPALLATA(SEP)-like基因的完整编码区序列,并采用生物信息学预测、亚细胞定位、转录激活实验、RT-qPCR方法初步分析其功能。结果表明:(1)UrSEP1、UrSEP3.1、UrSEP3.2的全长cDNA序列长度分别为931、981、1 097 bp,编码区长度分别为738、726、729 bp,分别编码245个、241个、242个氨基酸,蛋白序列中均包含保守的MADS结构域、K-box、SEPⅠ和SEPⅡ基序。(2)系统进化树分析显示,UrSEPs与小粒咖啡CaSEPs的亲缘关系最近,其中UrSEP1属于LOFSEP亚类中的SEP1/2分支,UrSEP3.1和UrSEP3.2同属于SEP3亚类。(3)亚细胞定位发现,UrSEPs均定位于细胞核,说明UrSEPs在核中发挥作用,其中UrSEP1和UrSEP3.2具有转录激活活性,提示UrSEP1和UrSEP3.2能够直接结合DNA序列。(4)UrSEPs基因的RT-qPCR结果表明了钩与花序的同源性和二者发育上的分歧,UrSEP3.1和UrSEP3.2在钩中的转录水平均显著高于根、茎、叶,并且在钩与花序两种发育过程中具有类似的表达模式;UrSEP1在钩芽中的表达量明显上升,高于其他营养组织及花序芽,并在钩与花序发育过程中具有相反的表达模式。综上认为,UrSEP1、UrSEP3.1和UrSEP3.2参与了钩的发育,并可能在钩和花序早期发育命运分歧中发挥作用。该研究从基因层面为揭示钩藤钩器官的来源提供了线索,为解析其形态建成的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 钩藤 SEPALLATA-like 基因克隆 亚细胞定位 转录激活活性 表达分析
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松弛非线性SHSS-like迭代法求解绝对值方程
4
作者 杨胜楠 王洋 《牡丹江师范学院学报(自然科学版)》 2026年第1期15-20,共6页
采用松弛非线性SHSS-like迭代法求解绝对值方程并研究其收敛性.实验结果表明,当绝对值方程系数矩阵A的Hermitian部分占优时,松弛非线性SHSS-like迭代法比松弛非线性HSS迭代法更有效,求解绝对值方程(AVE)更稳健高效.
关键词 绝对值方程 HSS-like迭代法 HSS迭代 松弛迭代
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拟Koszul-like模
5
作者 吕家凤 包科维 +1 位作者 叶晓晓 王一帆 《浙江师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2011年第2期121-125,共5页
主要讨论了诺特半完全代数上有限生成模的Koszul-like性质.受分次Koszul-like模的极小分次投射分解的启发,定义了拟Koszul-like模.讨论了拟Koszul-like模的Ext模的性质,把Koszul-like模的一些性质推广到拟Koszul-like模的情形.
关键词 Koszul-like代数 Koszul-like模 拟Koszul-like代数 拟Koszul-like模 Ext-模
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干扰转录因子StMYB90-like对彩色马铃薯花青素合成的影响 被引量：1
6
作者 潘阳 王立春 +5 位作者 付学鹏 田国奎 王海艳 李凤云 庞泽 李明雪 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第10期56-60,共5页
为明确转录因子StMYB90-like在花青素合成代谢中的调控机制,以彩色马铃薯黑金刚为研究对象,基于前期生物信息学筛选的转录因子StMYB90-like,通过干扰载体构建、遗传转化、荧光定量分析、花青素含量的测定,对转基因马铃薯进行检测和分析... 为明确转录因子StMYB90-like在花青素合成代谢中的调控机制,以彩色马铃薯黑金刚为研究对象,基于前期生物信息学筛选的转录因子StMYB90-like,通过干扰载体构建、遗传转化、荧光定量分析、花青素含量的测定,对转基因马铃薯进行检测和分析。结果表明,干扰彩色马铃薯黑金刚中转录因子StMYB90-like的表达后,其自身表达量显著降低,且马铃薯叶片中的花青素含量极显著降低了47.94%,马铃薯块茎颜色变浅,马铃薯块茎中的花青素含量显著降低了9.79%。说明转录因子StMYB90-like能够正向调控彩色马铃薯中花青素的合成,推测其可能通过上调花青素生物合成相关结构基因的方式调控马铃薯花青素的合成和积累。 展开更多
关键词 彩色马铃薯 花青素 遗传转化 转录因子 StMYB90-like
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菊花CmMYB15-like基因抗旱性功能鉴定 被引量：2
7
作者 史志坤 张怡雪 +3 位作者 宋子燕 张开明 李永华 李菲 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第2期369-379,共11页
菊花(Chrysanthemum morifolium)具有重要的观赏与经济价值,干旱会降低其产量和品质,造成巨大经济损失。挖掘菊花中的抗旱基因,培育抗旱品种是解决上述问题的重要手段。MYB转录因子参与植物生长发育和响应非生物胁迫。本研究在拟南芥中... 菊花(Chrysanthemum morifolium)具有重要的观赏与经济价值,干旱会降低其产量和品质,造成巨大经济损失。挖掘菊花中的抗旱基因,培育抗旱品种是解决上述问题的重要手段。MYB转录因子参与植物生长发育和响应非生物胁迫。本研究在拟南芥中异源表达菊花CmMYB15-like基因,通过观察干旱胁迫后的表型变化,测定相对含水量、丙二醛含量、可溶性糖含量、超氧化物歧化酶活性、木质素含量等指标,探究该基因的抗旱性功能。结果显示,过表达CmMYB15-like拟南芥的存活率、相对含水量、超氧化物歧化酶活性、可溶性糖含量较野生型显著升高,丙二醛含量较野生型显著下降;幼苗主根长度及侧根数目较野生型显著升高。此外,AtPAL2、AtPAL4、At4CL1等木质素合成相关基因表达显著上调,木质素含量显著提高。这些结果表明,CmMYB15-like参与拟南芥干旱胁迫反应,为菊花抗旱基因资源筛选和品种培育提供一定理论依据。 展开更多
关键词 菊花 MYB转录因子 CmMYB15-like 拟南芥 抗旱
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林氏扇头蜱抗菌肽Microplusin-like基因原核表达及抗菌功能 被引量：1
8
作者 彭维祺 谢子芳 +4 位作者 李晴 黎明成 陈杰 朱勇川 赵建国 《中国热带医学》 北大核心 2025年第7期882-889,共8页
目的 探究林氏扇头蜱抗菌肽Microplusin-like基因的抗菌功能,为了解林氏扇头蜱先天免疫系统和开发蜱类防控药物、新型抗菌药物替代提供新的参考依据。方法 根据林氏扇头蜱Microplusin-like基因序列设计特异性引物,提取林氏扇头蜱RNA并... 目的 探究林氏扇头蜱抗菌肽Microplusin-like基因的抗菌功能,为了解林氏扇头蜱先天免疫系统和开发蜱类防控药物、新型抗菌药物替代提供新的参考依据。方法 根据林氏扇头蜱Microplusin-like基因序列设计特异性引物,提取林氏扇头蜱RNA并反转录为cDNA,通过PCR扩增基因片段,将基因片段连接至pCold-SUMO质粒,构建重组表达载体pCold-SUMO/Microplusin-like后,转入大肠埃希菌Rosetta(DE3)感受态细胞,经诱导表达、纯化后获得蛋白;通过滤纸片法测定重组蛋白对大肠埃希菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌的抑菌圈,通过微量对倍稀释法测定其对大肠埃希菌、沙门菌的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC)和最低杀菌浓度(minimum bactericidal concentration,MBC),并通过测定该蛋白对大肠埃希菌生长曲线、时间-杀菌曲线的影响探究其抑菌效果;通过扫描电镜及透射电镜观察重组蛋白对大肠埃希菌微观形态的影响,并结合分子对接技术探究重组蛋白的抑菌机制。结果 林氏扇头蜱Microplusin-like基因扩增所得片段长度为333 bp,构建了原核表达载体pCold-SUMO/Microplusin-like,经诱导表达、纯化后获得蛋白,大小约为29 kDa。抑菌试验结果表明,重组蛋白对大肠埃希菌(ATCC 25922、1515、987P、K88、K99)及鸡白痢沙门菌CVCC1791的抑菌圈直径分别为15.8、20.58、18.33、15.4、18.24、18.18 mm,表现出中度或高度敏感;MIC(MBC)分别为0.625(5)、0.625(>5)、0.625(5)、1.25(>5)、0.625(>5)、0.625(>5)mg/mL,存在一定差异;对金黄色葡萄球菌无抑制作用;生长曲线及时间-杀菌曲线测定发现,重组蛋白抑菌活性呈浓度依赖性。扫描及透射电镜显示经重组蛋白处理后大肠埃希菌菌体皱缩,边缘模糊,细胞壁及细胞膜出现破损,内容物外泄,细胞内部松散。分子对接显示蛋白通过氢键、盐桥及疏水作用与大肠埃希菌外膜脂多糖转运蛋白结构发生结合。结论 林氏扇头蜱抗菌肽Microplusin-like蛋白具有抗革兰阴性菌活性,初步分析抗菌机制为破坏细胞壁及细胞膜结构,为开发蜱的新防治策略、新型抗生素替代提供了参考依据。 展开更多
关键词 林氏扇头蜱 Microplusin-like基因 抗菌肽 抗菌活性 原核表达
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江西铅山红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因克隆和生物信息学分析
9
作者 柯维忠 章茜 +2 位作者 樊美怡 何思思 董佳颖 《上饶师范学院学报》 2025年第6期39-49,共11页
通过铅山红芽芋和铅山青秆芋转录组数据库筛选到其烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因的核心片段,利用RT-PCR技术成功克隆了红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明:红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like... 通过铅山红芽芋和铅山青秆芋转录组数据库筛选到其烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因的核心片段,利用RT-PCR技术成功克隆了红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明:红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型基因的cDNA总长度为885碱基对(base pair,bp),G+C含量为45.88%。红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型的相对分子量为33626.15道尔顿(dalton,Da),理论等电点为9.49,带负电荷的残基总数为17个,带正电荷的残基总数为29个,原子总数量为4855个,不稳定性指数为33.46,脂肪族指数为125.88,总平均亲水性为0.705,属于疏水性蛋白。红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型的二级结构由α-螺旋、延伸链及无规则卷曲构成,以α-螺旋和无规则卷曲为主。红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型的三级结构为单体,其亚细胞定位为细胞质膜或液泡膜。红芽芋烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型与橡胶树烟草病毒增殖蛋白1(tobamovirus multiplication protein 1,TOM1)、可可TOM1、枣TOM1、茶TOM1、葡萄TOM1、阿拉比卡咖啡TOM1、加州白栎TOM1类蛋白(TOM1-like,TOL)、蓝星睡莲TOM1 X2亚型、侏儒睡莲TOM1及沉水樟TOM1的亲缘关系较远,但其蛋白同源性较高,存在较多的保守结构域。 展开更多
关键词 江西铅山红芽芋 烟草病毒增殖蛋白1-like X1亚型 基因克隆 生物信息学分析
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DAM-like基因在蔷薇科落叶果树芽休眠调控中的研究进展 被引量：1
10
作者 赵亚林 王力荣 《果树学报》 北大核心 2025年第4期890-899,共10页
休眠是植物在长期演化过程中获得的一种适应季节性变化的生物学特性。研究休眠机制对确保果树安全越冬和探索设施果树栽培新模式具有重要意义。在全球气候急剧变化的大背景下,对多年生落叶果树芽休眠进行研究,有利于进一步加深对休眠过... 休眠是植物在长期演化过程中获得的一种适应季节性变化的生物学特性。研究休眠机制对确保果树安全越冬和探索设施果树栽培新模式具有重要意义。在全球气候急剧变化的大背景下,对多年生落叶果树芽休眠进行研究,有利于进一步加深对休眠过程调控机制的理解。对当前在调控芽休眠进程中起关键作用的DAM-like基因鉴定及其功能、DAM基因与激素的关系、表观遗传调控对DAM-like基因的影响进行梳理和综述,以期为解析果树芽休眠调控机制及休眠相关分子育种奠定基础。 展开更多
关键词 落叶果树 芽休眠 DAM-like基因 植物激素 表观遗传
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棉花酵母双杂交文库构建及GhbHLH149-like互作蛋白筛选
11
作者 刘迪 甄军波 +3 位作者 刘琳琳 封丛华 冯晓晴 迟吉娜 《核农学报》 北大核心 2025年第8期1657-1664,共8页
basic helix-loop-helix(bHLH)是植物中广泛存在的一类转录因子,在植物生长发育及非生物胁迫响应中起重要作用,其中GhbHLH149-like基因的表达受盐胁迫诱导。为筛选鉴定与GhbHLH149-like互作的蛋白并从分子层面解析GhbHLH149-like在棉花... basic helix-loop-helix(bHLH)是植物中广泛存在的一类转录因子,在植物生长发育及非生物胁迫响应中起重要作用,其中GhbHLH149-like基因的表达受盐胁迫诱导。为筛选鉴定与GhbHLH149-like互作的蛋白并从分子层面解析GhbHLH149-like在棉花幼苗盐胁迫响应中的调控机制,本研究以陆地棉品种JZ-1为材料,构建了陆地棉酵母双杂交混合cDNA文库。结果表明,获得的初级文库库容量为1.12×10^(7)CFU,次级文库库容量为1.44×10^(7)CFU,两种文库重组率皆为100%,插入片段的平均长度大于1000 bp,酵母文库滴度为1.40×10^(8)cells·mL^(-1)。文库质量合格,满足后续酵母双杂交筛选要求。成功构建了诱饵表达载体pGBKT7-GhbHLH149-like,经鉴定其对酵母菌株无毒性,且无自激活活性。利用诱饵载体对文库进行酵母双杂交筛选,共筛选出8个与GhbHLH149-like互作的候选蛋白,并进行酵母回交一对一验证进一步确认互作关系。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示候选互作蛋白KNOX1-4和EF-Tu的编码基因的表达明显受盐处理诱导。相关结果为进一步研究GhbHLH149-like参与调控棉花幼苗盐胁迫响应的分子机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 棉花 酵母双杂交 互作蛋白 GhbHLH149-like
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马铃薯StZIP8–like基因的克隆及镉转运功能分析
12
作者 杨丽红 席银凯 +1 位作者 王丹 胡新喜 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期16-23,共8页
为了探讨StZIP8–like基因的表达模式和功能,从马铃薯中克隆得到StZIP8–like基因的全长序列,通过生物信息学方法对该基因的结构、理化性质及亲缘关系进行预测;利用RT–qPCR技术,分析其在镉胁迫下的表达模式;构建融合表达载体,分析StZIP... 为了探讨StZIP8–like基因的表达模式和功能,从马铃薯中克隆得到StZIP8–like基因的全长序列,通过生物信息学方法对该基因的结构、理化性质及亲缘关系进行预测;利用RT–qPCR技术,分析其在镉胁迫下的表达模式;构建融合表达载体,分析StZIP8–like蛋白在烟草叶片中的亚细胞定位;通过酵母异源表达试验,分析St ZIP8–like的镉转运功能。结构分析结果表明,StZIP8–like序列全长1 044 bp,编码347个氨基酸,含有1个ZIP保守结构域及7个跨膜结构域;系统进化分析结果表明,StZIP8–like蛋白与番茄及烟草中的ZIP8蛋白的亲缘关系较近。亚细胞定位结果显示,St ZIP8–like蛋白定位于细胞质膜;RT–q PCR结果表明,St ZIP8–like在马铃薯幼苗的根中表达量较高,并且Cd胁迫诱导下St ZIP8–like基因在马铃薯根、茎和叶中的表达量均上调;酵母试验结果显示,St ZIP8–like过表达的酵母对Cd更加敏感,具有Cd吸收转运活性。以上结果说明St ZIP8–like受到Cd胁迫的诱导表达,可能参与马铃薯吸收Cd的过程。 展开更多
关键词 马铃薯 StZIP8–like 镉 基因表达 酵母
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新疆野苹果MsPYR1-like基因生物信息学分析及其在种子萌发过程中的表达模式
13
作者 房震 李静 +2 位作者 马娟 张凯 叶春秀 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第4期23-33,共11页
【目的】克隆新疆野苹果(Malus sieversii)脱落酸受体基因MsPYR1-like,研究其在4℃低温沙藏过程中的表达规律,为揭示MsPYR1-like基因的功能及其在新疆野苹果种子休眠解除中的作用提供依据。【方法】从NCBI数据库中选择金冠苹果(Malus do... 【目的】克隆新疆野苹果(Malus sieversii)脱落酸受体基因MsPYR1-like,研究其在4℃低温沙藏过程中的表达规律,为揭示MsPYR1-like基因的功能及其在新疆野苹果种子休眠解除中的作用提供依据。【方法】从NCBI数据库中选择金冠苹果(Malus domestica)PYR1-like基因序列,将其与新疆野苹果转录组数据库进行BLAST同源比对,获得新疆野苹果PYR1-like基因序列。采用在线网站Expasy ProtParma、Expasy ProtScale、TMHMM2.0、SignalP-6.0和Plant-mPLoc,对MsPYR1-like蛋白进行理化特性和亲疏水性分析以及跨膜结构、信号肽和亚细胞定位预测。使用NCBI的CDD数据库、SOPMA和Swiss-Model Workspace,分析MsPYR1-like蛋白的保守结构域、预测蛋白二级和三级结构。利用DNAMAN和MEGA 11进行蛋白序列比对和构建蛋白系统进化树,构建MsPYR1-like基因载体并对侵染烟草叶片进行亚细胞定位。采用室温和4℃低温沙藏层积法处理新疆野苹果种子,于处理0,30,60,90和120 d时取样测定种子萌发率,同时采用实时荧光定量PCR检测种子MsPYR1-like的相对表达量,采用酶联免疫吸附法测定脱落酸含量,分析种子萌发率、MsPYR1-like相对表达量和脱落酸含量三者之间的关系。【结果】MsPYR1-like基因开放阅读框全长621 bp,编码206个氨基酸,分子质量为23.14 ku,等电点5.37,不稳定系数41.16,脂肪族氨基酸指数74.17,为亲水性蛋白,不含信号肽和跨膜结构。其蛋白序列具有SRPBCC超家族结构域,属于PYR/PYL/RACR蛋白家族,α-螺旋和无规则卷曲为二级结构主要组成。MsPYR1-like亚细胞定位在细胞核和细胞质膜中。同源性分析和系统进化树结果显示,MsPYR1-like与欧洲野苹果(Malus sylvestris)同源蛋白的亲缘关系最近。室温处理不同时间的新疆野菜果种子萌发率均为0%,低温沙藏0,30,60,90,120 d的种子萌发率分别为0%,0%,7%,95%和100%;随沙藏层积时间的增加,室温和4℃低温处理新疆野苹果种子的脱落酸含量均呈下降趋势,室温处理MsPYR1-like基因的相对表达量逐渐增加,而低温沙藏处理MsPYR1-like基因的相对表达量呈下降趋势。【结论】MsPYR1-like基因可能参与了新疆野苹果种子的休眠解除。 展开更多
关键词 种子休眠 种子萌发 脱落酸 新疆野苹果 MsPYR1-like 生物信息学
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基于多尺度聚合与Mamba-Like线性注意力机制的医学影像分割方法研究 被引量：1
14
作者 吴能光 林志刚 +2 位作者 陈拓 庄菲菲 陈虹 《中国医疗设备》 2025年第10期51-57,共7页
目的解决医学影像分割时普遍面临复杂化、组织边界模糊、器官对比度低等问题,尤其是随着Transformer自注意力机制在医学影像分割中被广泛应用,其存在分割效果不佳的缺点。方法将多尺度注意力聚合和Mamba-Like线性注意力机制进行融合,构... 目的解决医学影像分割时普遍面临复杂化、组织边界模糊、器官对比度低等问题,尤其是随着Transformer自注意力机制在医学影像分割中被广泛应用,其存在分割效果不佳的缺点。方法将多尺度注意力聚合和Mamba-Like线性注意力机制进行融合,构建U型网络MM-UNet。其中,引入Mamba-Like线性注意力机制,增强模型对全局依赖的学习能力;同时采用多尺度注意力聚合机制,通过多尺度卷积有针对性地捕获和利用关键特征,更加全面地捕获多尺度语义信息,以提升模型对影像边缘分割的准确性。结果MM-UNet、UNet、VM-UNet、LightM-UNet等算法在皮肤镜ISIC18、ISIC17、超声甲状腺结节TN3K共3个数据集上进行对比实验,结果表明,MM-UNet在皮肤镜ISIC18、ISIC17、超声甲状腺TN3K数据集上的mIoU分别为83.22%、83.63%、80.19%,Dice系数分别为90.84%、91.08%、89.00%,准确度分别为95.86%、96.57%、97.38%,特异性分别为97.95%、98.36%、98.70%。其中,与UNet、VM-UNet、LightM-UNet等模型相比,MM-UNet的mIoU、Dice系数和准确度均表现最优;MM-UNet的特异性在ISIC18、TN3K数据集上表现最优。结论MM-UNet在多种不同成像背景医学影像数据上均实现了较高的分割精度,其泛化性也较好,具有一定的应用价值。 展开更多
关键词 MM-UNet 卷积神经网络 Mamba-like线性注意力机制 多尺度注意力聚合 Transformer自注意力机制 医学影像分割
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类NADC30-like株和HP-PRRSV鉴别诊断RT-PCR方法的建立及应用
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作者 乔璐 柳海云 +4 位作者 杨健 黄国梁 郭慧琛 孙世琪 牛家强 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第12期1635-1642,共8页
本研究旨在建立一种猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)类NADC30株(NADC30-like)和高致病PRRSV(HP-PRRSV)鉴别诊断的RT-PCR方法,为该病的检测和防控提供依据。根据PRRSV Nsp2基因核苷酸序列特征,设计一种可同时鉴定HP-PRRSV和NADC30-like株... 本研究旨在建立一种猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)类NADC30株(NADC30-like)和高致病PRRSV(HP-PRRSV)鉴别诊断的RT-PCR方法,为该病的检测和防控提供依据。根据PRRSV Nsp2基因核苷酸序列特征,设计一种可同时鉴定HP-PRRSV和NADC30-like株的RT-PCR方法。结果显示,该方法扩增出的HP-PRRSV和NADC30-like株Nsp2基因片段分别为931 bp和628 bp,最低检测下限分别为472 copies/μL和132 copies/μL,对其他基因亚型PRRSV和病毒均未扩增出特异性条带。针对此方法,分离优势毒株并纯化。对来自甘肃省部分地区猪场的196份临床样品进行检测,发现28份样品为HP-PRRSV核酸阳性,15份样品为NADC30-like核酸阳性,3份样品为HP-PRRSV+NADC30-like核酸阳性;RT-PCR检测ORF5基因,发现HP-PRRSV和NADC30-like核酸阳性样品数量分别为37份和9份,但未发现混合感染样品;分离优势毒株,得到了传代稳定的病毒;纯化后获得了纯度较高且结构完整的病毒粒子。本研究建立的RT-PCR方法可用于HP-PRRSV和NADC30-like株快速鉴别诊断和分子流行病学调查研究,但其灵敏度稍差;且其无法检测其他PRRSV亚型毒株。 展开更多
关键词 HP-PRRSV NADC30-like 鉴别诊断 RT-PCR 分离纯化
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低温胁迫下外源油菜素内酯对冬小麦REVEILLE 7-like基因表达的影响
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作者 陈宇姝 张军保 +4 位作者 王雪松 邵庆一 杨森 曹佳昂 刘丽杰 《广西植物》 北大核心 2025年第7期1260-1269,共10页
‘东农冬麦1号’(‘Dn1’)是首个能在严寒地带大面积种植、返青率超过85%的强抗寒冬小麦品种。为探索冬小麦中REVEILLE 7-like基因的功能,以及低温胁迫下外源油菜素内酯(BR)对该基因表达的影响,该研究利用RT-PCR法克隆了冬小麦(Dn1)REVE... ‘东农冬麦1号’(‘Dn1’)是首个能在严寒地带大面积种植、返青率超过85%的强抗寒冬小麦品种。为探索冬小麦中REVEILLE 7-like基因的功能,以及低温胁迫下外源油菜素内酯(BR)对该基因表达的影响,该研究利用RT-PCR法克隆了冬小麦(Dn1)REVEILLE 7-lik e基因的cDNA序列,并对其进行了生物信息学分析,在冬小麦三叶期时叶面喷施BR,并分别于4、0、-10、-25℃时对冬小麦叶片和分蘖节进行取样,用qRT-PCR技术分析该基因在以上不同处理组冬小麦叶片和分蘖节中的表达模式。结果表明:(1)REVEILLES属于MYB类转录因子家族,REVEILLE 7-like基因全长1251 bp,共编码416个氨基酸,编码蛋白为不稳定亲水性蛋白,主要定位于细胞核。(2)REVEILLE 7-like与节节麦、二粒小麦亲缘关系最近,蛋白序列总相似度78.62%。(3)REVEILLE 7-like基因启动子包含参与逆境响应、激素响应及MYB结合位点的顺式作用元件。(4)表达模式分析发现,对照组中REVEILLE 7-like基因的表达量在0、-10、-25℃时与4℃时相比较均有显著提高。处理组与对照组相比,该基因的表达量在-10℃和-25℃时均显著提高。综上推测,该基因在冬小麦受到低温胁迫时起重要作用,并且BR可以提高该基因的表达,从而进一步提高冬小麦的耐寒性。 展开更多
关键词 寒地冬小麦 油菜素内酯 REVEILLE 7-like 基因克隆 低温胁迫
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表达PRRSV NADC30-like GP3重组腺病毒的构建及小鼠免疫效果评价
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作者 李红欢 王泽轩 +9 位作者 乔彦杰 李益涛 刘紫威 马忠臣 刘才冬 崔耀成 王震 王月丽 易继海 陈创夫 《中国兽医学报》 北大核心 2025年第11期2309-2317,共9页
通过体外同源重组构建猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)NADC30-like GP3重组腺病毒载体疫苗,以探究其小鼠水平的免疫效果评价。以5型腺病毒为载体,制备表达PRRSV GP3蛋白的重组腺病... 通过体外同源重组构建猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)NADC30-like GP3重组腺病毒载体疫苗,以探究其小鼠水平的免疫效果评价。以5型腺病毒为载体,制备表达PRRSV GP3蛋白的重组腺病毒,通过荧光观察、PCR和Western blot法对重组腺病毒进行体外鉴定。将重组腺病毒免疫小鼠,采用间接ELISA和ELISpot等方法检测重组腺病毒诱导的体液免疫和细胞免疫反应。经酶切、PCR、荧光和Western blot鉴定,表明重组腺病毒rAdGP3构建和包装成功。免疫小鼠后,能产生特异性抗体和中和抗体,表明重组腺病毒能产生较强的体液免疫。ELISpot和淋巴细胞增殖试验显示重组腺病毒疫苗能刺激机体分泌IFN-γ特异性T淋巴细胞数量和诱导机体淋巴细胞增殖,表明重组腺病毒能增强机体细胞免疫应答水平。本研究成功构建了rAdGP3重组腺病毒,且在小鼠水平上具有良好的免疫原性,为PRRSV新型疫苗的研发提供了参考。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 NADC30-like GP3 重组腺病毒 免疫效果评价
原文传递
柑橘木虱黏液样蛋白DcMucin-like抗体制备及应用 被引量：1
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作者 蒋丽琴 苏巧灵 +2 位作者 李猷 魏太云 宾羽 《中国农业科学》 北大核心 2025年第2期281-290,共10页
【目的】黏液样蛋白(mucin-like protein)参与半翅目昆虫取食过程中唾液鞘的形成。本研究旨在制备柑橘木虱(Diaphorina citri)黏液样蛋白DcMucin-like特异性抗体并对木虱取食孔进行免疫荧光标记,为DcMucin-like生物学功能研究提供依据... 【目的】黏液样蛋白(mucin-like protein)参与半翅目昆虫取食过程中唾液鞘的形成。本研究旨在制备柑橘木虱(Diaphorina citri)黏液样蛋白DcMucin-like特异性抗体并对木虱取食孔进行免疫荧光标记,为DcMucin-like生物学功能研究提供依据。【方法】通过解剖柑橘木虱唾液腺、中肠、卵巢和精巢组织,根据木虱DcMcuin-like序列设计特异性引物,利用实时荧光定量PCR检测分析各组织中DcMcuin-like在转录水平的差异;扩增无信号肽的DcMucin-like序列并插入pET-28a中构建重组质粒,测序验证后转化Rosetta表达菌株,以终浓度0.5 mmol·L-1 IPTG在37℃下振荡培养8 h诱导重组蛋白表达,SDS-PAGE凝胶电泳检测重组蛋白表达情况;扩大培养后裂解菌体,裂解液上清经Ni-NTA纯化作为抗原免疫家兔5次,纯化血清IgG获得DcMucin-like多克隆抗体,Western blot检测抗体特异性;利用实时荧光定量PCR和Western blot比较健康木虱和感染黄龙病菌(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)木虱中DcMucin-like在转录水平和蛋白水平的差异;利用交联荧光素(FITC)的DcMucin-like多克隆抗体标记木虱取食后的柑橘叶片,在共聚焦显微镜下观察柑橘木虱取食孔和唾液鞘。【结果】实时荧光定量PCR检测显示DcMcuin-like在木虱唾液腺中大量表达,且表达量显著高于中肠、卵巢和精巢组织。携带有pET28a-DcMucin的Rosetta表达菌株经IPTG诱导后在菌体裂解液的上清中获得大量表达的重组蛋白。重组蛋白免疫家兔后取抗血清纯化IgG,Western blot结果表明获得特异性好的DcMucin-like多克隆抗体。实时荧光定量PCR和Western blot分析结果显示DcMucin-like在木虱响应黄龙病菌侵染时上调表达。DcMucin-like(FITC)荧光抗体标记木虱取食后的柑橘叶片组织切片,共聚焦显微镜下观察到木虱的取食孔,并在取食孔周围检测到特异的FITC荧光信号,表明DcMucin-like随木虱取食释放到植株组织中参与唾液鞘形成。【结论】DcMucin-like在柑橘木虱唾液腺中高表达并响应黄龙病菌侵染上调表达;成功制备了特异性好的柑橘木虱DcMucin-like多克隆抗体;验证了DcMucin-like随木虱取食分泌到柑橘植株组织中。研究结果可为深入探究DcMucin-like在黄龙病菌-木虱-柑橘三者互作中的作用打下基础。 展开更多
关键词 柑橘木虱 唾液鞘蛋白 DcMucin-like 抗体制备 免疫荧光
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过表达BnNRT2.3-like对油菜氮素吸收利用及产量的影响
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作者 黄绒 周渠晨 +6 位作者 陈楚铭 罗倩 易东 杜常欢 黄祥宇 盛锋 杜雪竹 《作物学报》 北大核心 2025年第12期3184-3197,共14页
硝酸盐转运蛋白2(NRT2)是一种高亲和硝酸盐转运蛋白,在植物硝酸盐的吸收和转运过程中发挥重要作用。本研究利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)鉴定到响应低氮胁迫的关键基因BnNRT2.3-like,对其进行生物信息学分析,构建BnNRT2.3-like过表达载... 硝酸盐转运蛋白2(NRT2)是一种高亲和硝酸盐转运蛋白,在植物硝酸盐的吸收和转运过程中发挥重要作用。本研究利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)鉴定到响应低氮胁迫的关键基因BnNRT2.3-like,对其进行生物信息学分析,构建BnNRT2.3-like过表达载体,获得转基因植株,通过盆栽试验对油菜成熟期的重要农艺性状进行观察和分析,并在油菜苗期测定其氮素积累量、氮素利用效率、叶绿素含量、氮素利用相关基因表达量以及硝酸还原酶(NR)和谷氨酰胺合成酶(GS)活性。结果表明,BnNRT2.3-like蛋白分子量为61.87 kD,等电点为9.08,具有MFS超家族和NNP家族基因的典型特征。与野生型相比,BnNRT2.3-like过表达植株的株高、千粒重和单株籽粒产量分别提高9.1%、20.0%和62.1%,有效分枝高度、主轴有效长度、主轴有效角果数、全株有效角果数、每角果长度、平均每角果粒数均显著提高。在低氮处理下,过表达油菜与野生型相比主根长平均增加1.22 cm,植株鲜重增加0.633 g,地上部和根部干重分别增加55.0%和13.6%,单株总干重增加42.1%;地上部氮积累量较野生型增加17.0%。此外,在低氮胁迫下,过表达植株苗期的氮素积累量、氮素利用效率、硝酸还原酶和谷氨酰胺合成酶活性以及叶绿素含量与野生型相比均显著提高,氮素利用相关基因BnNPF4.6、BnNPF6.3-like和BnAMT1.1a在叶片中表达水平上升而在根中显著降低。因此,过表达BnNRT2.3-like可以增强油菜对低氮胁迫的耐受性,提高油菜产量性状,为提高油菜氮素利用效率提供了种质资源及理论依据。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 BnNRT2.3-like 硝酸盐 氮素利用率 产量
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苹果溶质转运蛋白家族MdSLC25A44-like基因特征和表达分析
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作者 申亚楠 张雪珂 +4 位作者 孙晓慧 秦鑫蓉 赵玲玲 宋来庆 刘学卿 《烟台大学学报(自然科学与工程版)》 2025年第1期47-54,共8页
为研究苹果溶质转运蛋白家族基因MdSLC25A44-like的序列和表达模式,利用荧光定量及生物信息学技术分析该基因序列特征及在不同类型苹果组织中的表达水平,分析结果显示,MdSLC25A44-like蛋白序列与白梨PbSLC25A44-like同源性最高;通过构... 为研究苹果溶质转运蛋白家族基因MdSLC25A44-like的序列和表达模式,利用荧光定量及生物信息学技术分析该基因序列特征及在不同类型苹果组织中的表达水平,分析结果显示,MdSLC25A44-like蛋白序列与白梨PbSLC25A44-like同源性最高;通过构建系统进化树得出,MdSLC25A44-like与白梨、秋子梨×西洋梨亲缘关系最近;生物信息学分析结果表示MdSLC25A44-like蛋白是一个α螺旋转运蛋白、稳定性蛋白并具有疏水性,定位于线粒体;花青苷测定结果表示,苹果红色果皮和红色果肉中的花青苷含量明显高于绿色果皮和白色果肉;实时荧光定量PCR结果表明,在苹果红色果皮和红色果肉中MdSLC25A44-like基因的表达量显著高于绿色果皮和白色果肉。MdSLC25A44-like基因可能参与了花青苷积累过程,基因的表达与花青苷积累量呈正相关关系,本结果为进一步研究苹果果实花青苷积累与转运以及提高果实果色品质提供了一定的科学基础。 展开更多
关键词 苹果 MdSLC25A44-like基因 序列特征 表达分析 花青苷
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