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斜纹夜蛾核多角体病毒gp37及其邻近序列的克隆及分析 被引量:6
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作者 李充璧 李朝飞 +2 位作者 闫庆生 胡国栋 庞义 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第5期677-682,共6页
从斜纹夜蛾核多角体病毒 (Spodopteralituranucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)基因组中克隆了 gp37基因 .分子生物学软件分析表明 ,在 gp37基因内部存在糖基化位点 .含有晚期表达基因的启动子序列(ATAAG) ,推测为晚期表达的病毒膜糖蛋白基... 从斜纹夜蛾核多角体病毒 (Spodopteralituranucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)基因组中克隆了 gp37基因 .分子生物学软件分析表明 ,在 gp37基因内部存在糖基化位点 .含有晚期表达基因的启动子序列(ATAAG) ,推测为晚期表达的病毒膜糖蛋白基因 .通过GP37蛋白的同源性比较 ,绘制了以 gp37基因为基础的杆状病毒进化树 ,发现与以多角体蛋白基因 (polyhedrin)为基础所绘制的杆状病毒分子进化树有较大差异 .以polyhedrin基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树将家蚕核多角体病毒 (Bombyxmorinucleopolyhedrovirus,BmNPV)与杆状病毒代表种———苜蓿丫纹夜蛾核多角体病毒 (Autographacalifornicamultinucleocapsidnucleopolyhedrovirus,AcMNPV)分开 ,根据 gp37基因分析则将二者归到同一分枝 。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾核多角体病毒 gp37基因簇 克隆 序列分析
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甜菜夜蛾核多角体病毒(SeMNPV)gp37基因的克隆及序列分析 被引量:2
2
作者 李充璧 闫庆生 +2 位作者 李朝飞 庞义 杨凯 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期70-73,共4页
通过鸟枪法克隆了甜菜夜蛾核多角体病毒 (SeMNPV)基因组DNAEcoRⅠ酶切的 2 2kb片段 .序列分析表明 ,该片段含有gp37基因 .SeMNPVgp37基因的开放阅读框为 80 1个核苷酸 ,编码 2 6 8个氨基酸 ,预测蛋白质相对分子质量为 30 40 0 .在gp37... 通过鸟枪法克隆了甜菜夜蛾核多角体病毒 (SeMNPV)基因组DNAEcoRⅠ酶切的 2 2kb片段 .序列分析表明 ,该片段含有gp37基因 .SeMNPVgp37基因的开放阅读框为 80 1个核苷酸 ,编码 2 6 8个氨基酸 ,预测蛋白质相对分子质量为 30 40 0 .在gp37基因起始密码子上游有一典型的杆状病毒晚期基因启动子序列ATAAG .同其它昆虫杆状病毒和昆虫痘病毒GP37/Fusolin蛋白的比较结果表明 ,SeMNPVGP37与已知gp37/fusolin基因的氨基酸序列同源性较高 (5 0 %~ 6 8% ) ,在其蛋白序列内存在类似的保守区和可能的N_连接糖基化位点 .在SeMNPVgp37基因下游存在一个完整阅读框和部分egt基因序列 . 展开更多
关键词 甜菜夜蛾核多角体病毒 gp37基因 克隆 序列分析 生物杀虫剂
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GP37蛋白结构分析与昆虫病毒分子进化的关系 被引量:5
3
作者 刘德立 金天权 齐义鹏 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期277-281,共5页
The gp37 gene from LsMNPV has been sequenced and the deduced amino acid sequence was compared with other GP37 amino acid sequences from 8 insect viruses. The maximum homology of amino acid sequences and the conserved ... The gp37 gene from LsMNPV has been sequenced and the deduced amino acid sequence was compared with other GP37 amino acid sequences from 8 insect viruses. The maximum homology of amino acid sequences and the conserved structural regions were analyzed with PROSIS software. The relationship of evolution of 9 insect viruses was discussed and the evolutionary tree was drawned. 展开更多
关键词 昆虫病毒 gp37蛋白 分子进化
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J亚群禽白血病病毒跨膜蛋白gp37基因克隆与表达 被引量:2
4
作者 王晓伟 刘青 +4 位作者 徐晴晴 蔡黎明 王真真 王桂花 成子强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期178-184,共7页
禽白血病病毒(ALV)跨膜蛋白(TM)在病毒-细胞融合过程中起关键作用,其蛋白内部存在的许多高度保守序列有可能成为抗病毒的重要靶点。对TM结构和功能的深入研究将为抗禽白血病病毒乃至其它反转录病毒相关制剂的研制提供科学的理论基础。... 禽白血病病毒(ALV)跨膜蛋白(TM)在病毒-细胞融合过程中起关键作用,其蛋白内部存在的许多高度保守序列有可能成为抗病毒的重要靶点。对TM结构和功能的深入研究将为抗禽白血病病毒乃至其它反转录病毒相关制剂的研制提供科学的理论基础。本研究通过PCR从本实验室分离的ALV-J山东汶上毒株获得表达TM的gp37基因,克隆连接pMD18-T载体并测序,从已构建的质粒pMD18-T-gp37中酶切回收gp37基因,构建重组转移载体pFastBacHTb-gp37。利用昆虫杆状病毒表达系统对gp37基因进行表达,通过间接免疫荧光和Western blot检测gp37基因表达产物,间接免疫荧光显示,重组杆状病毒感染的sf9细胞呈现明显的强阳性反应;Western blot分析,重组病毒感染的sf9细胞蛋白显示出约21kD的阳性条带。结果表明,gp37基因在sf9细胞内表达成功。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 gp37基因 跨膜蛋白 真核表达
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6株T4类噬菌体尾丝蛋白gp37基因密码子特性比较 被引量:1
5
作者 逯凯 韩姗姗 +4 位作者 张灿 刘文华 邹玲 温建新 任慧英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1330-1335,共6页
利用多种生物信息学软件对本实验室分离的1株T4类多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37基因与其他5株T4类噬菌体gp37基因进行密码子特征的分析比较。结果显示:Bp7与其他5株T4类噬菌体gp37基因密码子使用模式基本一致;Bp7尾丝蛋白gp37基因密码... 利用多种生物信息学软件对本实验室分离的1株T4类多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37基因与其他5株T4类噬菌体gp37基因进行密码子特征的分析比较。结果显示:Bp7与其他5株T4类噬菌体gp37基因密码子使用模式基本一致;Bp7尾丝蛋白gp37基因密码子偏好性较低,且偏爱使用以A或U为结尾的密码子;除AUG(Met)和JGG(Trp)外,确定了17种高频密码子;6株菌体gp37之间密码子偏好性比较发现,Bp7与JS98密码子使用最相近,与T4和T4T相对较远;gp37基因密码子的使用模式可能受中性突变和选择压力的共同作用。gp37基因密码子的分析结果将为Bp7尾丝蛋白的基因改造,以进一步拓宽其裂解谱及提高表达水平提供理论指导。 展开更多
关键词 噬菌体 gp37基因 密码子偏好性 生物信息学
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昆虫病毒gp37/fusolin基因研究进展 被引量:2
6
作者 李朝飞 庞义 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2003年第11期16-18,共3页
昆虫病毒gp37 fusolin基因属病毒复制非必需基因 ,其编码的蛋白能形成一种纺锤形包涵体 (spindlebodies,SBs) ,该包涵体内不含有病毒粒子。Fusolin蛋白形成的SBs与纯化的Fusolin蛋白均能提高靶昆虫对杆状病毒的敏感性 ,推测GP37蛋白也... 昆虫病毒gp37 fusolin基因属病毒复制非必需基因 ,其编码的蛋白能形成一种纺锤形包涵体 (spindlebodies,SBs) ,该包涵体内不含有病毒粒子。Fusolin蛋白形成的SBs与纯化的Fusolin蛋白均能提高靶昆虫对杆状病毒的敏感性 ,推测GP37蛋白也具有类似的功能。对gp37 fusolin基因的深入研究 。 展开更多
关键词 杆状病毒 痘病毒 gp37/fusolin基因 病毒增效剂
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J亚群禽白血病病毒gp37基因的克隆和序列分析
7
作者 张志 赵宏坤 崔治中 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期36-39,共4页
近两年我们从国内不同省份先后分离和鉴定了 8株J亚群禽白血病病毒 (ALV_J) ,并对其中的 5株进行了gp3 7基因的克隆和序列分析。结果表明 ,我们分离的 5株ALV_J之间的同源性为 94.6%~ 99.0 % ;与国内最早分离的SD990 1、SD990 2和YZ99... 近两年我们从国内不同省份先后分离和鉴定了 8株J亚群禽白血病病毒 (ALV_J) ,并对其中的 5株进行了gp3 7基因的克隆和序列分析。结果表明 ,我们分离的 5株ALV_J之间的同源性为 94.6%~ 99.0 % ;与国内最早分离的SD990 1、SD990 2和YZ990 1等毒株之间的同源性分别为 95 .3 %~ 98.5 %、95 .6%~ 99.0 %和 94.9%~ 98.6% ;与国际最先报道的原型株HPRS_1 0 3之间的同源性为 93 .4%~ 95 .1 % ;与其它国外毒株的同源性为 92 .7%~ 96.8%。这表明我国ALV_J的gp3 7基因正在不断发生变异 ,但相对于gp85基因的变异性要小。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 gp37基因 序列分析 基因克隆 分离 鉴定
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多价噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37结构分析
8
作者 张灿 刘文华 +2 位作者 宋玉芹 逯凯 任慧英 《青岛农业大学学报(自然科学版)》 2016年第2期113-118,共6页
利用多种生物信息学软件对分离的一株多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37进行结构预测及分析。结果表明:尾丝蛋白gp37与多株T4类噬菌体的尾丝蛋白亲缘关系较近,但与T4噬菌体尾丝蛋白亲缘关系远。氨基酸序列保守性分析显示Bp7尾丝蛋白gp37序... 利用多种生物信息学软件对分离的一株多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37进行结构预测及分析。结果表明:尾丝蛋白gp37与多株T4类噬菌体的尾丝蛋白亲缘关系较近,但与T4噬菌体尾丝蛋白亲缘关系远。氨基酸序列保守性分析显示Bp7尾丝蛋白gp37序列呈马赛克特征,N端序列高度保守,C端变异性强,存在亮氨酸拉链基元。二级结构分析显示其结构特征与T4噬菌体尾丝蛋白的二级结构具有相似性,但其C末端多出一个α螺旋区域。本研究结果将为Bp7尾丝蛋白gp37的基因改造并进一步拓宽噬菌体Bp7的宿主范围提供依据。 展开更多
关键词 噬菌体Bp7 尾丝蛋白gp37 结构分析
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噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37的原核表达与鉴定 被引量:1
9
作者 孙虎芝 任慧英 张灿 《动物医学进展》 北大核心 2016年第5期10-14,共5页
为了研究噬菌体尾丝蛋白gp37在识别宿主菌大肠埃希菌K12过程中的作用,PCR扩增获得gp37基因C端1 161bp序列,以EGFP为荧光标签,构建重组表达质粒pET-28a-EGFP-gp37,在大肠埃希菌BL21(DE3)中IPTG诱导表达重组蛋白EGFP-gp37,亲和层析纯化蛋... 为了研究噬菌体尾丝蛋白gp37在识别宿主菌大肠埃希菌K12过程中的作用,PCR扩增获得gp37基因C端1 161bp序列,以EGFP为荧光标签,构建重组表达质粒pET-28a-EGFP-gp37,在大肠埃希菌BL21(DE3)中IPTG诱导表达重组蛋白EGFP-gp37,亲和层析纯化蛋白。SDS-PAGE及Western blot检测结果表明,重组蛋白EGFP-gp37在大肠埃希菌BL21(DE3)为可溶性表达,表达量占菌体总蛋白量的23%。EGFP-gp37融合蛋白与大肠埃希菌K12相互作用,激光共聚焦显微镜检测结果显示,尾丝蛋白gp37能够吸附到宿主菌K12表面,表明尾丝蛋白gp37参与宿主菌受体的识别和吸附过程。 展开更多
关键词 噬菌体Bp7 尾丝蛋白gp37 绿色荧光蛋白EGFP 大肠埃希菌K12
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禽白血病病毒gp37基因生物信息学分析及克隆表达 被引量:1
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作者 张雪 曹利利 +4 位作者 郭衍冰 董航 苑淑贤 姚新华 赵权 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第10期73-77,共5页
为建立新的禽白血病诊断方法,以临床分离得到的JL-2株禽白血病前病毒cDNA为模板,用PCR技术扩增gp37基因,测序后进行序列分析,并构建原核表达质粒pET-gp37,在大肠杆菌BL21(DE3)中经IPTG诱导表达,SDS-PAGE及Western blot鉴定并纯化。结果... 为建立新的禽白血病诊断方法,以临床分离得到的JL-2株禽白血病前病毒cDNA为模板,用PCR技术扩增gp37基因,测序后进行序列分析,并构建原核表达质粒pET-gp37,在大肠杆菌BL21(DE3)中经IPTG诱导表达,SDS-PAGE及Western blot鉴定并纯化。结果显示:gp37基因全长591 bp,编码197个氨基酸,分子量22 kDa,无信号肽,为疏水性蛋白;PCR及双酶切鉴定表明,重组原核表达质粒pET-gp37构建成功;经SDS-PAGE及Western blot鉴定,表达蛋白分子质量与理论值一致,均为22 kDa,并以可溶形式表达,纯化后纯度达98%以上。结论:成功表达和纯化了gp37蛋白,为预防禽白血病病毒的感染及建立新的禽白血病诊断方法提供了参考。 展开更多
关键词 禽白血病病毒 gp37蛋白 序列分析 原核表达
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K亚群禽白血病病毒分离株基因测序与鉴定分析 被引量:2
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作者 沈晓鹏 曹斌 +8 位作者 王传峰 陈则东 马跃 朱建平 王成丽 叶建强 俞燕 李拓凡 张俊 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第23期88-93,155,共7页
为了对从江苏省某种鸡场保种的崇仁麻鸡血浆中分离的禽白血病病毒(ALV)进行序列测定和亚群鉴定,试验采用ELISA法检测血浆样品p27抗原,并用从阳性血浆中分离的病毒接种DF1细胞进行免疫荧光检测,提取前病毒DNA,用ALV亚群鉴定引物进行PCR鉴... 为了对从江苏省某种鸡场保种的崇仁麻鸡血浆中分离的禽白血病病毒(ALV)进行序列测定和亚群鉴定,试验采用ELISA法检测血浆样品p27抗原,并用从阳性血浆中分离的病毒接种DF1细胞进行免疫荧光检测,提取前病毒DNA,用ALV亚群鉴定引物进行PCR鉴定,前病毒DNA分3段扩增并测序,对测序结果进行拼接,用MEGA 7.0软件以NJ法对分离株病毒gp85基因编码的氨基酸序列和参考株进行遗传进化分析,采用DNAStar 7.0软件以Clustal W法对参考株与分离株病毒的gp37基因进行比对分析。结果表明:有1份样品的p27抗原ELISA反应呈阳性,免疫荧光检测也呈阳性,将该分离株命名为JS20CR13。K亚群引物PCR检测出大小为560 bp的目的片段。前病毒全基因组总长7 481 bp,其中env基因大小为1 617 bp(gp85基因1 008 bp,编码336个氨基酸;gp37基因大小为609 bp,编码203个氨基酸)。与各参考株对比,分离株JS20CR13的gp85基因序列与K亚群参考株同源性为94.0%~99.0%,明显高于其他亚群;gp85基因编码氨基酸序列与已经鉴定为ALV-K的参考株病毒位于同一个进化分支,而与其他亚群的遗传进化距离较远。分离株JS20CR13的gp37基因序列与ALV-K参考株JS14CZ01同源性最高,达99.0%。说明分离株JS20CR13与已经鉴定为ALV-K的参考株病毒位于同一个进化分支,分离株为K亚群ALV。 展开更多
关键词 K亚群禽白血病病毒 崇仁麻鸡 遗传进化树 GP85基因 gp37基因
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中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒gp^(37)基因的序列分析 被引量:1
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作者 邓菲 陈新文 +2 位作者 Basil.M.Arif Just.M.Vlak 胡志红 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第S1期38-45,共8页
昆虫杆状病毒的 gp37基因与昆虫痘病毒纺锤体蛋白 (fusolin)基因具有较高的同源性。本研究通过末端测序法和引物步移法双向测定了中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 (HaSNPV)gp37基因的核苷酸全序列。HaSNPV的 gp37基因开放阅读框为 84 ... 昆虫杆状病毒的 gp37基因与昆虫痘病毒纺锤体蛋白 (fusolin)基因具有较高的同源性。本研究通过末端测序法和引物步移法双向测定了中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 (HaSNPV)gp37基因的核苷酸全序列。HaSNPV的 gp37基因开放阅读框为 84 0个核苷酸 ,共编码 2 79个氨基酸 ,预计蛋白质分子量为 31kDa。在 gp37基因起始密码子上游有一典型的杆状病毒晚期转录启动子结构GTAAG和两个TATAboxes。HaSNPVGP37前 18个氨基酸有很强的疏水性 ,可能是分泌信号肽序列。 16种GP37/Fusolin的氨基酸序列同源性比较分析表明 ,HaSNPVGP37与其它gp37基因的同源性较高 ( 4 0 60 % ) ,与痘病毒的Fusolin的同源性达 30 % 4 0 %左右。这些蛋白有 5个高度保守区 ,预计这 5个保守区为GP37/Fusolin的功能区。 展开更多
关键词 gp^37基因 fusolin基因 中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 核苷酸全序列
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Recombination of T4-like Phages and Its Activity against Pathogenic Escherichia coli in Planktonic and Biofilm Forms 被引量:2
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作者 Min Li Donglin Shi +5 位作者 Yanxiu Li Yuyi Xiao Mianmian Chen Liang Chen Hong Du Wei Zhang 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第5期651-661,共11页
The increasing emergence of multi-drug resistant Escherichia coli(E.coli)has become a global concern,primarily due to the limitation of antimicrobial treatment options.Phage therapy has been considered as a promising ... The increasing emergence of multi-drug resistant Escherichia coli(E.coli)has become a global concern,primarily due to the limitation of antimicrobial treatment options.Phage therapy has been considered as a promising alternative for treating infections caused by multi-drug resistant E.coli.However,the application of phages as a promising antimicrobial agent is limited by their narrow host range and specificity.In this research,a recombinant T4-like phage,named WGqlae,has been obtained by changing the receptor specificity determinant region of gene 37,using a homologous recombination platform of T4-like phages established by our laboratory previously.The engineered phage WGqlae can lyse four additional hosts,comparing to its parental phages WG01 and QL01.WGqlae showed similar characteristics,including thermo and pH stability,optimal multiplicity of infection and one-step growth curve,to the donor phage QL01.In addition,sequencing results showed that gene 37 of recombinant phage WGqlae had genetically stable even after 20 generations.In planktonic test,phage WGqlae had significant antimicrobial effects on E.coli DE192 and DE205 B.The optical density at 600 nm(OD600)of E.coli in phage WGqlae treating group was significantly lower than that of the control group(P\0.01).Besides,phage WGqlae demonstrated an obvious inhibitory effect on the biofilm formation and the clearance of mature biofilms.Our study suggested that engineered phages may be promising candidates for future phage therapy applications against pathogenic E.coli in planktonic and biofilm forms. 展开更多
关键词 T4-like phages Escherichia coli(E.coli) Homologous recombination gp37 PLANKTONIC BIOFILM
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差异极大的不同准种隐藏于同一J亚型禽白血病病毒野毒株中 被引量:3
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作者 毛娅卿 李卫华 +2 位作者 董宣 刘金华 赵鹏 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2013年第6期492-498,共7页
2012年山东省某地方品系鸡发生疑似血管瘤的肿瘤病例,对发病鸡群随机抽取9只鸡分别接种鸡胚成纤维细胞和DF-1细胞进行病毒分离鉴定,结果显示,在鸡的3种常见肿瘤病毒中仅分离到9株J亚型禽白血病病毒(ALV-J),定名为LY1201-LY1209.选取LY... 2012年山东省某地方品系鸡发生疑似血管瘤的肿瘤病例,对发病鸡群随机抽取9只鸡分别接种鸡胚成纤维细胞和DF-1细胞进行病毒分离鉴定,结果显示,在鸡的3种常见肿瘤病毒中仅分离到9株J亚型禽白血病病毒(ALV-J),定名为LY1201-LY1209.选取LY1201株扩增同时包含有gp85和gp37的env基因,扩增产物连接T载体后转化大肠杆菌,对鉴定后的9个阳性克隆子进行测序和序列分析.结果显示,9个克隆子其相对保守的gp37氨基酸同源性为98.5%~100.0%,而其gp85序列之间氨基酸同源性仅为96.6%~100.0%;其中2个克隆子与其他7个克隆子相比在gp85的210#~219#缺失了10个氨基酸,这表明在LY1201存在着差异极大的不同ALV准种,并且变异较大的gp85基因比gp37基因能更好地显示ALV-J准种的多样性;在9个克隆子中3个克隆子gp85和gp37氨基酸同源性均为100.0%,表明这3个准种为同一准种,代表了在该分离株中占优势的准种.本研究利用单一基因证明了禽反转录病毒的准种多样性,并在单一病毒株中发现了差异极大的不同准种,特别是发现了一个具有明显缺失的ALV-J准种. 展开更多
关键词 地方品系鸡 J亚型禽白血病病毒 GP85基因 gp37基因 准种多样性
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Different quasispecies with great mutations hide in the same subgroup J field strain of avian leukosis virus 被引量:6
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作者 MAO YaQing LI WeiHua +2 位作者 DONG Xuan LIU JinHua ZHAO Peng 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第5期414-420,共7页
Blood samples were collected from a local strain of chickens associated with serious tumor cases in Shandong Province. The samples were inoculated into chicken embryo fibroblast and DF-1 cells for virus isolation and ... Blood samples were collected from a local strain of chickens associated with serious tumor cases in Shandong Province. The samples were inoculated into chicken embryo fibroblast and DF-1 cells for virus isolation and identification, respectively. The inoculated cells were screened for three common chicken tumor viruses. Nine strains of avian leukosis virus subgroup J (ALV-J) were identified, and were designated LY1201-LYI209. The env gene from the LY1201 strain was amplified and cloned. All nine resultant env clones (clones 01-09) were sequenced, and the gp85 and gp37 amino acid regions were subjected to homology analysis. Clones 01 and 03 had 10 amino acid deletions in the gp85 region compared to the other seven clones, suggesting that at least two quasispecies with obvious mutations coexist in the same field strain. Among these nine clones, three had identical gp85 and gp37 sequences, and were recognized as the dominant LY1201 quasispecies. The amino acid sequence homology of gp37 and gp85 among the nine clones was 98.5%-100.0% and 96.6%-100.0% respectively, suggesting that the gp85 region of the env gene can better display the quasispecies diversity of ALV-J than gp37. 展开更多
关键词 avian leukosis virus subgroup J(ALV-J) gp85 gp37 quasispecies diversity
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