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N-myc downstream regulated gene 1 inhibition of tumor progression in Caco2 cells 被引量:2
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作者 Yi-Xiao He Hong Shen +5 位作者 Yu-Zhu Ji Hai-Rong Hua Yu Zhu Xiang-Fei Zeng Fang Wang Kai-Xin Wang 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2022年第12期2313-2328,共16页
BACKGROUND Invasion and migration are the irreversible stages of colorectal cancer(CRC).The key is to find a sensitive,reliable molecular marker that can predict the migration of CRC at an early stage.N-myc downstream... BACKGROUND Invasion and migration are the irreversible stages of colorectal cancer(CRC).The key is to find a sensitive,reliable molecular marker that can predict the migration of CRC at an early stage.N-myc downstream regulated gene 1(NDRG1)is a multifunctional gene that has been tentatively reported to have a strong relationship with tumor invasion and migration,however the current molecular role of NDRG1 in CRC remains unknown.AIM To explore the role of NDRG1 in the development of CRC.METHODS NDRG1 stably over-expressed Caco2 cell line was established by lentiviral infection and NDRG1 knock-out Caco2 cell line was established by CRISPR/Cas9.Furthermore,the mRNA and protein levels of NDRG1 in Caco2 cells after NDRG1 over-expression and knockout were detected by real-time polymerase chain reaction and western blot.The cell proliferation rate was measured by the cell counting kit-8 method;cell cycle and apoptosis were detected by flow cytometry;invasion and migration ability were detected by the 24-transwell method.RESULTS NDRG1 over-expression inhibited Caco2 proliferation and the cell cycle could be arrested at the G1/S phase when NDRG1 was over-expressed,while the number of cells in the G2 phase was significantly increased when NDRG1 was knocked out.This suggests that NDRG1 inhibited the proliferation of Caco2 cells by arresting the cell cycle in the G1/S phase.Our data also demonstrated that NDRG1 promotes early cell apoptosis.Invasion and migration of cells were extensively inhibited when NDRG1 was over-expressed.CONCLUSION NDRG1 inhibits tumor progression in Caco2 cells which may represent a potential novel therapeutic strategy for the treatment of CRC. 展开更多
关键词 N-myc downstream regulated gene 1 Caco2 Colorectal cancer Tumor progression CRISPR/Cas9 Lentivirus infection
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Regulation of HIF-1 α to Expression of N-myc Downstream Regulated Gene 1 in Colorectal Carcinoma
2
作者 ZHAO Duanyi LIU Zhisu +3 位作者 JIANG Congqing BANGOURA Gassimou WU Kailang WU Jianauo 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 2007年第3期563-568,共6页
Plasmid expressing small interfering RNA (siRNA) against HIF-1α (pSilence-2.1-U6-siRNA) was constructed and transfected into LS174T cells in hypoxia condition.After expression of siRNA against HIF-1 α in LS174T ... Plasmid expressing small interfering RNA (siRNA) against HIF-1α (pSilence-2.1-U6-siRNA) was constructed and transfected into LS174T cells in hypoxia condition.After expression of siRNA against HIF-1 α in LS174T cells, expressions of HIF-1 α and N-myc downstream regulated gene 1 (NDRG1) gene were inhibited significantly. HIF-1 cta transcripts were positive in 67.7% (42/62) and 44.4% (8/18) of colorectal adenocarcinoma and adenoma, re- spectively. The mean percentage of cells with positive hybridization of HIF-1 α mRNA increases with the development from Duke stage A to stage C+D (p〈 0.05). The positive staining rate of NDRG1 protein was significant higher in than that in colorectal adenoma colorectal adenocarcinoma group group (p〈 0.05). The level of HIF-1 a transcripts was positively correlated with the level of NDRG1 protein (p 〈 0.05) during colorectal tumor progression. HIF-1α and its down stream gene NDRG1 may play roles in tumor progression of human colorectal carcinoma. 展开更多
关键词 hypoxia inducible factor-1 α (HIF-1 α N-myc downstream regulated gene 1 small interfering RNA colorectal carcinoma
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Expression of N-myc downstream regulatory gene 4(NDRG4)in glioma and its relationship with glioma prognosis
3
作者 Zhumei Niu Yinyan Bai +1 位作者 Xiaopeng Li Xiaolong Jia 《Journal of Translational Neuroscience》 2021年第2期8-11,共4页
Objective:the N-myc downstream regulatory gene 4(NDRG4)is involved in cell growth,cell proliferation,cell survival and tumor invasion.In this paper,the role of NDRG4 in glioma was explored.Method:the expression of NDR... Objective:the N-myc downstream regulatory gene 4(NDRG4)is involved in cell growth,cell proliferation,cell survival and tumor invasion.In this paper,the role of NDRG4 in glioma was explored.Method:the expression of NDRG4 in glioma clinical specimens and its relationship with the prognosis of glioma patients were analyzed by the Cancer Genome Atlas(TCGA)and the Chinese Glioma Genome Atlas(CGGA),and the expression of NDRG4 protein and mRNA in glioma cell lines were tested and verified by Western blot and quantitative real-time fluorescence polymerase chain reaction(qRT-PCR).Result:it showed that the expression of NDRG4 in glioma tissues and cell lines is closely related to the prognosis of glioma patients.Conclusion:NDRG4 is a highly potential target gene for glioma therapy. 展开更多
关键词 N-myc downstream regulatory gene 4(NDRG4) GLIOMA MRNA
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NDRG2 gene copy number is not altered in colorectal carcinoma
4
作者 Anders Lorentzen Cathy Mitchelmore 《World Journal of Clinical Oncology》 CAS 2017年第1期67-74,共8页
AIM To investigate if the down-regulation of N-myc Downstream Regulated Gene 2(NDRG2) expression in colorectal carcinoma(CRC) is due to loss of the NDRG2 allele(s).METHODS The following were investigated in the human ... AIM To investigate if the down-regulation of N-myc Downstream Regulated Gene 2(NDRG2) expression in colorectal carcinoma(CRC) is due to loss of the NDRG2 allele(s).METHODS The following were investigated in the human colorectal cancer cell lines DLD-1, Lo Vo and SW-480: NDRG2 mRNA expression levels using quantitative reverse transcriptionpolymerase chain reaction(qRT-PCR); interaction of the MYC gene-regulatory protein with the NDRG2 promoter using chromatin immunoprecipitation; and NDRG2 promoter methylation using bisulfite sequencing.Furthermore, we performed qPCR to analyse the copy numbers of NDRG2 and MYC genes in the above three cell lines, 8 normal colorectal tissue samples and 40 CRC tissue samples.RESULTS As expected, NDRG2 mRNA levels were low in the three colorectal cancer cell lines, compared to normal colon.Endogenous MYC protein interacted with the NDRG2 core promoter in all three cell lines.In addition, the NDRG2 promoter was heavily methylated in these cell lines, suggesting an epigenetic regulatory mechanism.Unaltered gene copy numbers of NDRG2 were observed in the three cell lines.In the colorectal tissues, one normal and three CRC samples showed partial or complete loss of one NDRG2 allele.In contrast, the MYC gene was amplified in one cell line and in more than 40% of the CRC cases.CONCLUSION Our study suggests that the reduction in NDRG2 expression observed in CRC is due to transcriptional repression by MYC and promoter methylation, and is not due to allelic loss. 展开更多
关键词 N-MYC downstream-regulated gene 2 Colorectal carcinoma MYC Tumor SUPPRESSOR Allelic loss gene amplification COPY number
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分化型甲状腺癌根治术后FGFR-4、NDRG3与复发的关系研究 被引量:1
5
作者 李玲 刘莲 +2 位作者 彭茜 刘华 陈玉华 《成都医学院学报》 2025年第5期818-822,共5页
目的探究分化型甲状腺癌(DTC)根治术后成纤维生长因子受体4(FGFR-4)、N-myc下游调控基因3(NDRG3)与复发的关系。方法选取2021年4月至2024年3月川北医学院附属医院227例行根治术治疗的DTC患者作为研究对象,根据DTC患者根治术后6个月内复... 目的探究分化型甲状腺癌(DTC)根治术后成纤维生长因子受体4(FGFR-4)、N-myc下游调控基因3(NDRG3)与复发的关系。方法选取2021年4月至2024年3月川北医学院附属医院227例行根治术治疗的DTC患者作为研究对象,根据DTC患者根治术后6个月内复发情况分为复发组(n=57)与未复发组(n=170),比较两组患者基线资料、手术前后血清FGFR-4、NDRG3水平,分析术后FGFR-4、NDRG3水平与甲状腺癌根治术后复发的关系,并采用受试者工作特征曲线(ROC)、临床影响曲线(CIC)、决策曲线(DCA)分别评价术后FGFR-4、NDRG3预测甲状腺癌根治术后复发的预测效能、实际符合率及临床效用。结果相较于术前,术后两组患者血清FGFR-4水平下降,NDRG3水平升高(P<0.05);复发组手术前后血清FGFR-4水平均高于未复发组,NDRG3水平均低于未复发组(P<0.05);以术后FGFR-4、NDRG3水平为自变量,进行Logistic回归分析,校正混杂因素后,结果显示,术后FGFR-4、NDRG3水平均为甲状腺癌根治术后复发的影响因素(P<0.05);经ROC曲线分析显示,术后FGFR-4、NDRG3预测甲状腺癌根治术后复发的最佳截断值分别为25.04、489.62μg/L,二者联合预测的AUC值最大,为0.888(95%CI:0.809~0.943);DCA曲线显示,在0.1~0.8阈值区间内,FGFR-4、NDRG3联合预测甲状腺癌根治术后复发具有明显正向获益;CIC曲线显示,术后FGFR-4、NDRG3联合预测甲状腺癌根治术后复发与实际情况符合率较高。结论DTC患者根治术后血清FGFR-4升高,NDRG3下降,与复发风险有关,二者联合预测患者术后复发效能较高,可为临床早期识别复发高风险人群提供依据。 展开更多
关键词 分化型甲状腺癌 成纤维生长因子受体4 N-myc下游调控基因3 根治术 复发
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大肠杆菌中终止子对下游转录单元基因表达的影响
6
作者 任家卫 张金鹏 +3 位作者 徐国强 张晓梅 许正宏 张晓娟 《合成生物学》 北大核心 2025年第1期213-227,共15页
在基因转录过程中,RNA聚合酶通过识别启动子序列启动转录过程,而当其识别到位于3′-UTR的终止子序列后,转录复合物解离,转录过程终止。因此,转录单元内的启动子和终止子分别发挥启动和终止转录的作用。然而,对于下游的转录单元,终止子... 在基因转录过程中,RNA聚合酶通过识别启动子序列启动转录过程,而当其识别到位于3′-UTR的终止子序列后,转录复合物解离,转录过程终止。因此,转录单元内的启动子和终止子分别发挥启动和终止转录的作用。然而,对于下游的转录单元,终止子除了终止转录本通读这一直接作用以外,其与RNA聚合酶之间的解离可能会影响后续转录单元中启动子与RNA聚合酶的结合,从而间接改变下游转录单元的表达。这种跨转录单元的终止子和启动子之间的互作关系目前尚缺少研究,因此,明确终止子对下游转录单元的转录反应强度的影响对于精准调控基因表达、开发高效终止子具有重要的意义。本研究通过one-pot技术将9种终止子、5种间隔序列和9种启动子进行组合构建了一个包含405种不同组合元件(终止子-间隔序列-启动子)的组装文库,基于FlowSeq技术对文库中所有组合进行测序和荧光强度分析,进而建立组合序列-下游基因表达之间的相关性。结果表明弱终止子、短间隔以及强启动子的组合更有利于提高下游基因的表达。通过对转录本的定量分析发现弱终止子不仅提高下游的渗漏转录(提高21~70倍),同时也促进了下游启动子重新招募RNA聚合酶进行重启转录(提高2~3倍)。本研究解析了终止子对下游转录单元基因表达的调控效果和机制,为利用终止子构建基因回路提供设计依据。 展开更多
关键词 终止子 启动子 基因表达调控 one-pot组装 FlowSeq技术
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大豆GmNF-YA3与GmWRKY39启动子结合特异性分析
7
作者 高歌 孙睿加 +1 位作者 于月华 倪志勇 《大豆科学》 北大核心 2025年第3期20-26,共7页
为探究GmNF-YA3的抗旱作用机理,本研究对GmNF-YA3与GmWRKY39基因是否存在靶向作用关系进行了分析。利用在线网站对已克隆的GmWRKY39基因启动子序列进行生物信息学分析,将GmWRKY39上游2000 bp启动子连接到pHis2和pGreenⅡ0800-LUC载体上,... 为探究GmNF-YA3的抗旱作用机理,本研究对GmNF-YA3与GmWRKY39基因是否存在靶向作用关系进行了分析。利用在线网站对已克隆的GmWRKY39基因启动子序列进行生物信息学分析,将GmWRKY39上游2000 bp启动子连接到pHis2和pGreenⅡ0800-LUC载体上,将GmNF-YA3基因的开放阅读框(ORF)构建到pGADT7和pGreenⅡ62-SK载体上。利用酵母单杂交实验与双荧光素酶实验,鉴定并验证了GmNF-YA3的下游调控靶基因。生物信息学分析结果表明GmWRKY39启动子片段含有6个CCAAT-box元件和必备核心保守元件CAAT-box和TATA-box,含有2种与植物激素反应相关的顺式元件,9种与光响应相关的顺式元件等。酵母单杂交实验和双荧光素酶实验结果表明GmNF-YA3在体外和体内均能够结合GmWRKY39启动子,并且增强GmWRKY39启动子的活性。结果证明GmNF-YA3可以转录激活大豆GmWRKY39表达。研究为探究大豆GmNF-YA3响应干旱胁迫的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 核转录因子 GmNF-YA 双荧光素酶 酵母单杂 下游靶基因
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MRI联合血清SDF-1、NDRG4诊断卵巢癌的应用价值
8
作者 王静静 李莹 相世峰 《中国CT和MRI杂志》 2025年第1期137-139,共3页
目的 分析磁共振成像(MRI)联合血清基质细胞衍生因子-1(SDF-1)、N-myc下游调节因子4(NDRG4)诊断卵巢癌的应用价值。方法 选取2021年11月至2023年11月本院收治的96例经病理学确诊的卵巢癌患者即为卵巢癌组,同期收治确诊为卵巢良性肿瘤患... 目的 分析磁共振成像(MRI)联合血清基质细胞衍生因子-1(SDF-1)、N-myc下游调节因子4(NDRG4)诊断卵巢癌的应用价值。方法 选取2021年11月至2023年11月本院收治的96例经病理学确诊的卵巢癌患者即为卵巢癌组,同期收治确诊为卵巢良性肿瘤患者96例为对照组。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测血清中SDF-1、NDRG4水平;血清SDF-1、NDRG4对卵巢癌的诊断价值绘制ROC曲线。采用四格表检测MRI联合血清SDF-1、NDRG4对卵巢癌的诊断价值。结果 与对照组相比,卵巢癌组患者血清中SDF-1水平显著升高, NDRG4水平显著降低(P<0.05)。卵巢癌患者血清SDF-1、NDRG4水平与TNM分期、琳巴结转移、分化程度、 CA125相关(P<0.05)。血清SDF-1、NDRG4联合诊断卵巢癌发生的AUC显著高于单独诊断的AUC值(Z_(SDF-1~SDF-1+NDRG4)=2.084,P=0.037;Z_(NDRG4~SDF-1+NDRG4)=2.570,P=0.010)。MRI联合血清SDF-1、NDRG4检测诊断卵巢癌的敏感性低于单一指标,特异性高于单一指标。结论 卵巢癌患者血清中SDF-1高表达、NDRG4低表达, MRI联合血清SDF-1、NDRG4检测能够提高对卵巢癌的诊断效能。 展开更多
关键词 磁共振成像 基质细胞衍生因子-1 N-myc下游调节因子4 卵巢癌 诊断
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铁皮石斛CNR 基因克隆及其对下游基因和代谢物的调控研究 被引量:1
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作者 陈宏宇 于莹 《种子》 北大核心 2025年第8期209-215,共7页
为了研究铁皮石斛CNR基因的功能和对下游基因及代谢物的调控,利用铁皮石斛茎部中段和茎部顶端组织转录组分析,克隆了1个CNR基因,在本氏烟草中超表达,并对超表达基因的本氏烟草植株进行转录组测序和代谢物测定。结果表明,共识别了28个可... 为了研究铁皮石斛CNR基因的功能和对下游基因及代谢物的调控,利用铁皮石斛茎部中段和茎部顶端组织转录组分析,克隆了1个CNR基因,在本氏烟草中超表达,并对超表达基因的本氏烟草植株进行转录组测序和代谢物测定。结果表明,共识别了28个可能的铁皮石斛CNR基因,克隆了其中1个基因,在超表达株系中发现232个显著差异表达基因,其中上调表达146个基因,下调表达86个基因。在超表达株系中存在194个显著差异代谢物,其中正调控115个代谢物,负调控79个代谢物。铁皮石斛CNR基因可能调控植物生长发育,在本氏烟草中表达后导致大量基因和代谢物发生变化,表明该基因对下游基因和代谢物具有明显调控作用。 展开更多
关键词 铁皮石斛 CNR基因 调控 下游基因
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高血压脑出血患者预后的预测模型构建
10
作者 郭静川 李晓鹏 +7 位作者 刘吉祥 张延虎 马岩朋 高小恒 耿炜 胡艳芳 肖丽平 周涛 《心脑血管病防治》 2025年第11期15-19,共5页
目的构建基于N-myc下游调节基因3(NDRG3)及神经营养因子的高血压脑出血患者预后的预测模型并验证其效能。方法回顾性分析2020年1月至2023年12月河北省邯郸市第一医院收治的126例高血压脑出血患者的资料,按照8:2随机分为训练集(101例)和... 目的构建基于N-myc下游调节基因3(NDRG3)及神经营养因子的高血压脑出血患者预后的预测模型并验证其效能。方法回顾性分析2020年1月至2023年12月河北省邯郸市第一医院收治的126例高血压脑出血患者的资料,按照8:2随机分为训练集(101例)和验证集(25例)。患者均给予穿刺引流术,并根据随访3个月的格拉斯哥预后评分分为预后良好组、预后不良组。分析影响高血压脑出血患者预后的因素,建立高血压脑出血患者预后的预测模型,并进行模型的验证及效能评估。结果训练集34例预后不良,验证集10例预后不良。Logistic回归分析显示脑出血量、破入脑室、脑源性神经营养因子(BDNF)、NDRG3水平是影响高血压脑出血预后不良的因素[OR(95%CI)=5.043(2.075~12.256)、4.433(1.824~10.773)、3.540(1.456~8.602)、3.979(1.637~9.669),P<0.05]。以影响因素为预测变量建立列线图预测模型。列线图模型Bootstrap内部验证显示C-index指数为0.791(95%CI=0.723~0.801),Calibration曲线结果显示校准曲线趋近于理想曲线(χ^(2)=0.289,P>0.05)。训练集ROC曲线显示,列线图模型预测高血压脑出血患者预后的AUC为0.854(95%CI=0.772~0.935),敏感度为76.47%,特异度为89.55%。验证集ROC曲线显示,列线图模型预测高血压脑出血患者预后的AUC为0.869(95%CI=0.789~0.941),敏感度为80.00%,特异度为86.67%。结论脑出血量、破入脑室、BDNF、NDRG3水平是高血压脑出血患者预后不良的危险因素,基于NDRG3及BDNF等影响因素构建的高血压脑出血预后的预测模型效能良好。 展开更多
关键词 高血压脑出血 N-myc下游调节基因3 神经营养因子 预后 列线图模型
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组织CRIP2表达与miR-362-5p/NDRG1轴的相关性及对前列腺癌多西他赛敏感性的影响
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作者 赵得堡 张钧硕 +3 位作者 刘璐璐 孙星 刘越 屈中玉 《海南医学》 2025年第13期1832-1837,共6页
目的探讨前列腺癌组织中富含半胱氨酸肠蛋白2(CRIP2)表达与微小核糖核酸(miR)-362-5p/N-myc下游调节基因1(NDRG1)轴的相关性及对前列腺癌多西他赛(DTX)敏感性的影响。方法选取2021年3月至2023年10月南阳市中心医院收治的36例DTX敏感的... 目的探讨前列腺癌组织中富含半胱氨酸肠蛋白2(CRIP2)表达与微小核糖核酸(miR)-362-5p/N-myc下游调节基因1(NDRG1)轴的相关性及对前列腺癌多西他赛(DTX)敏感性的影响。方法选取2021年3月至2023年10月南阳市中心医院收治的36例DTX敏感的前列腺癌术后化疗患者、36例DTX耐药的前列腺癌术后化疗患者,分别纳入DTX敏感组、DTX耐药组;均于术中留取患者前列腺癌组织、癌旁组织。比较两组患者前列腺癌组织CRIP2表达阳性率、miR-362-5p/NDRG1轴指标水平,采用点二列相关性分析癌组织CRIP2表达与miR-362-5p、NDRG1的相关性,采用多因素Logistic回归法分析癌组织CRIP2表达、miR-362-5p/NDRG1轴对前列腺癌DTX敏感性的影响,采用交互作用系数(γ)分析癌组织CRIP2、miR-362-5p/NDRG1轴的交互作用对前列腺癌DTX敏感性的影响,采用受试者工作特征曲线(ROC)分析癌组织CRIP2、miR-362-5p/NDRG1轴对前列腺癌DTX耐药的评估作用。结果DTX敏感组癌组织CRIP2表达阳性率为50.00%(18/36),低于DTX耐药组的75.00%(27/36),差异有统计学意义(P<0.05);DTX敏感组miR-362-5p表达量为0.74±0.09,明显低于DTX耐药组的0.98±0.07,DTX敏感组NDRG1蛋白表达量为0.58±0.11,明显高于DTX耐药组的0.29±0.04,差异均有统计学意义(P<0.05);相关性分析显示组织CRIP2表达与miR-362-5p表达量呈正相关(r=0.537),与NDRG1蛋白表达量呈负相关(r=-0.602),P<0.05;Logistic回归分析显示癌组织CRIP2表达、miR-362-5p、NDRG1均为前列腺癌患者DTX耐药的独立影响因素(P<0.05);癌组织CRIP2阳性与miR-362-5p高表达、癌组织CRIP2阳性与NDRG1蛋白低表达同时暴露时交互作用OR分别为31.167、25.333,γ分别为2.216、2.074,两两呈正向交互作用(P<0.05);ROC曲线结果显示,癌组织CRIP2、miR-362-5p/NDRG1轴联合评估前列腺癌DTX耐药的AUC最大,为0.945(95%CI:0.865~0.985,P<0.05)。结论癌组织CRIP2表达与miR-362-5p/NDRG1轴存在明显相关性,且均与前列腺癌DTX敏感性有关,检测癌组织CRIP2表达与miR-362-5p/NDRG1轴水平对评估前列腺癌DTX敏感性具有重要意义。 展开更多
关键词 前列腺癌 富含半胱氨酸肠蛋白2 多西他赛 微小核糖核酸-362-5p N-myc下游调节基因1 敏感性
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LncRNA KCNQ1OT1调控miR-214-3p/NDRG3轴对脑出血模型大鼠神经功能的影响
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作者 高小恒 刘一鑫 +3 位作者 耿炜 张瑜 马岩朋 周涛 《河北医学》 2025年第12期2004-2013,共10页
目的:探讨长链非编码RNA(LncRNA)KCNQ1OT1调节微小RNA(miR)-214-3p/N-myc下游调控基因3(NDRG3)轴对脑出血(ICH)模型大鼠神经功能的影响。方法:将SD大鼠分为假手术(Sham)组、ICH组、LncRNA KCNQ1OT1干扰质粒对照(sh-NC)组、LncRNA KCNQ1... 目的:探讨长链非编码RNA(LncRNA)KCNQ1OT1调节微小RNA(miR)-214-3p/N-myc下游调控基因3(NDRG3)轴对脑出血(ICH)模型大鼠神经功能的影响。方法:将SD大鼠分为假手术(Sham)组、ICH组、LncRNA KCNQ1OT1干扰质粒对照(sh-NC)组、LncRNA KCNQ1OT1干扰质粒(sh-KCNQ1OT1)组、sh-KCNQ1OT1+miR-214-3p抑制剂对照(miR-In-NC)组和sh-KCNQ1OT1+miR-214-3p抑制剂(miR-214-3p-In)组,每组12只。改良神经功能缺损评分(mNSS)评估各组大鼠神经功能变化;测量各组大鼠脑部血肿体积;HE染色观察各组大鼠脑组织病理变化;TUNEL染色观察脑组织细胞凋亡;免疫组织化学染色观察NDRG3表达量变化;ELISA检测大鼠脑组织中TNF-α和IL-1β水平;qRT-PCR检测各组大鼠脑组织中LncRNA KCNQ1OT1、miR-214-3p和NDRG3mRNA水平;Western blot检测各组大鼠脑组织中NDRG3、Bax和Bcl-2蛋白表达水平;双荧光素酶报告基因实验测定miR-214-3p与LncRNA KCNQ1OT1或NDRG3的靶向关系。结果:与Sham组相比,ICH组大鼠mNSS评分、脑血肿体积和脑组织细胞凋亡率显著增加(P<0.05),脑组织结构被破坏,红细胞、炎性细胞浸润和神经胶质细胞的数量增加,脑组织中TNF-α、IL-1β、LncRNA KCNQ1OT1、NDRG3和Bax表达水平显著升高(P<0.05),miR-214-3p和Bcl-2表达水平显著降低(P<0.05);与sh-NC组相比,sh-KCNQ1OT1组大鼠mNSS评分、脑血肿体积和脑组织细胞凋亡率显著减少(P<0.05),脑组织结构恢复,红细胞、炎性细胞和神经胶质细胞的数量减少,脑组织中TNF-α、IL-1β、LncRNA KCNQ1OT1、NDRG3和Bax表达水平显著降低(P<0.05),miR-214-3p和Bcl-2表达水平显著升高(P<0.05);与sh-KCNQ1OT1+miR-In-NC组相比,sh-KCNQ1OT1+miR-214-3p-In组大鼠mNSS评分、脑血肿体积和脑组织细胞凋亡率显著增加(P<0.05),脑组织结构被破坏,红细胞、炎性细胞浸润,神经胶质细胞数量增加,脑组织中TNF-α、IL-1β、NDRG3和Bax表达水平显著升高(P<0.05),miR-214-3p和Bcl-2表达水平显著降低(P<0.05);与miR-NC组相比,miR-214-3p组转染KCNQ1OT1-WT或NDRG3-WT的细胞的相对荧光素酶活性均显著降低(P<0.05)。结论:LncRNA KCNQ1OT1下调可能通过调控miR-214-3p/NDRG3轴,缓解ICH大鼠神经功能损伤。 展开更多
关键词 长链非编码RNA KCNQ1OT1 微小RNA-214-3p/N-myc下游调控基因3轴 脑出血 神经功能
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NDRG3通过VEGFA/VEGFR2通路促进喉鳞状细胞癌细胞的增殖迁移与血管生成 被引量:1
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作者 马俊 陈佩佩 +3 位作者 李姚 张真 唐莹 高峰 《中国组织化学与细胞化学杂志》 2025年第3期257-263,共7页
目的探究N-Myc下游调控基因3(N-Myc downstream regulatory gene 3,NDRG3)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达及其调控LSCC细胞增殖、迁移和血管生成的作用与机制。方法用qRT-PCR和Western blot检测NDRG3在LSCC细胞中的表达。敲低NDRG3表达和... 目的探究N-Myc下游调控基因3(N-Myc downstream regulatory gene 3,NDRG3)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达及其调控LSCC细胞增殖、迁移和血管生成的作用与机制。方法用qRT-PCR和Western blot检测NDRG3在LSCC细胞中的表达。敲低NDRG3表达和(或)上调VEGFA表达后,MTT实验检测细胞增殖,Transwell实验检测细胞迁移,小管形成实验检测细胞血管生成能力,Western blot检测VEGFA/VEGFR2通路相关蛋白的表达。结果NDRG3在LSCC细胞中高表达。敲低NDRG3后,LSCC细胞的增殖能力、迁移能力、血管生成能力、VEGFA蛋白水平及VEGFR2磷酸化水平均下降,而上调VEGFA后可逆转敲低NDRG3导致的上述变化。结论NDRG3可通过VEGFA/VEGFR2信号通路促进LSCC细胞的增殖、迁移和血管生成。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 N-Myc下游调控基因3 血管生成 迁移
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增强CT及PD-L1、CD8、NDRG2表达对结直肠癌患者微卫星不稳定性的预测价值
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作者 刘秋宁 祝雨田 +2 位作者 叶阳 管斯琪 贾小强 《临床和实验医学杂志》 2025年第8期878-883,共6页
目的探究增强CT及程序性死亡配体1(PD-L1)、CD8、N-myc下游调节基因2(NDRG2)表达对结直肠癌患者微卫星不稳定性(MSI)的预测价值。方法回顾性选取2022年4月至2024年9月中国中医科学院西苑医院收治的157例结直肠癌患者作为研究对象。所有... 目的探究增强CT及程序性死亡配体1(PD-L1)、CD8、N-myc下游调节基因2(NDRG2)表达对结直肠癌患者微卫星不稳定性(MSI)的预测价值。方法回顾性选取2022年4月至2024年9月中国中医科学院西苑医院收治的157例结直肠癌患者作为研究对象。所有患者均行增强CT检查并进行结直肠癌根治术治疗,采用免疫组织化学法检测癌组织PD-L1、CD8、NDRG2蛋白表达情况及结直肠癌患者微卫星状态。根据微卫星状态将患者分为MSI组(n=41)和微卫星稳定(MSS)组(n=115)。比较两组临床资料、增强CT特征及癌组织PD-L1、CD8、NDRG2蛋白表达情况;采用二元Logistic回归分析法分析影响结直肠癌患者MSI的相关因素;采用受试者操作特征(ROC)曲线分析癌组织增强CT特征及PD-L1、CD8、NDRG2蛋白表达对结直肠癌患者MSI的预测价值。结果两组的性别构成比、年龄、体重指数、肿瘤最大直径、临床分期比较,差异均无统计学意义(P>0.05);MSI组的低分化、淋巴结转移、浸润至浆膜层及以外占比分别为50.00%、30.95%、54.76%,均显著高于MSS组(26.09%、13.04%、31.30%),差异均有统计学意义(P<0.05)。两组癌灶部位、增厚形式、强化程度比较,差异均无统计学意义(P>0.05);MSI组弥漫浸润型占比、不均匀强化占比、低密度>2/3占比分别为85.71%、88.10%、71.43%,均显著高于MSS组(67.83%、57.39%、41.74%),差异均有统计学意义(P<0.05)。MSI组PD-L1、CD8阳性表达率分别为66.67%、71.43%,均显著高于MSS组(26.09%、37.39%),NDRG2阳性表达率为23.81%,显著低于MSS组(58.26%),差异均有统计学意义(P<0.05)。二元Logistic回归分析显示,不均匀强化、低密度>2/3、PD-L1、CD8表达阳性是影响结直肠癌患者MSI的危险因素(P<0.05),NDRG2表达阳性为保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析显示,强化形式、低密度占比、PD-L1、CD8、NDRG2表达单独及联合预测结直肠癌患者MSI的敏感度分别为88.10%、71.42%、66.67%、71.43%、76.19%、92.86%,特异度分别为42.61%、58.26%、73.91%、62.61%、58.26%、50.43%,曲线下面积(AUC)分别为0.654、0.648、0.690、0.670、0.660、0.870,联合预测价值更高。结论增强CT部分影像特征及PD-L1、CD8、NDRG2表达对结直肠癌患者MSI具有一定的预测价值,临床上可通过参考相关参数和指标辅助术前MSI诊断。 展开更多
关键词 结直肠癌 微卫星不稳定性 增强CT 程序性死亡配体1 CD8 N-myc下游调节基因2 预测价值
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基于转录组学的拟南芥AtNDX下游潜在靶基因挖掘与分析
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作者 王洁瑶 马蓉 +2 位作者 邢孔丫 柯丽萍 华学军 《浙江理工大学学报(自然科学版)》 2025年第5期646-655,共10页
植物线粒体在受到环境胁迫时会产生逆向信号,通过调节核基因的表达来协调植物生长和抗逆的平衡,但其内在作用机制还有待深入研究。首先对拟南芥SSR1基因突变体(ssr1-2)、ssr1-2抑制子(sus3)、sus3回补株系(sus3C)及野生型Wassilewskija(... 植物线粒体在受到环境胁迫时会产生逆向信号,通过调节核基因的表达来协调植物生长和抗逆的平衡,但其内在作用机制还有待深入研究。首先对拟南芥SSR1基因突变体(ssr1-2)、ssr1-2抑制子(sus3)、sus3回补株系(sus3C)及野生型Wassilewskija(WS)植株的根进行转录组测序;其次利用主成分分析和Pearson相关系数评估转录组数据之间的相关性,绘制差异表达基因的火山图和相关性聚类分析热图;最后结合KEGG和GO分析,筛选同时受线粒体胁迫和AtNDX调控的基因,分析AtNDX在线粒体胁迫下调控植物生长发育的作用机制。结果表明:4个材料的高通量测序数据重复性好,且ssr1-2与sus3C高度相关,sus3C能互补sus3抑制子突变造成的影响;筛选到线粒体胁迫下受AtNDX负调控的基因有288个,受AtNDX正调控的基因有178个;利用实时荧光定量PCR技术对筛选出的15个在线粒体胁迫下受AtNDX调控的潜在下游靶基因进行了验证,发现这些基因均在植物生长发育和细胞代谢过程中发挥重要作用。该结果表明,AtNDX通过调控根系发育和细胞代谢相关基因的表达参与线粒体逆向信号的响应和植物生长发育调节,为深入解析植物线粒体在平衡生长发育和胁迫响应中的作用提供了重要线索。 展开更多
关键词 拟南芥 转录组 AtNDX 下游靶基因 线粒体胁迫
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星形胶质细胞N-myc下游调节基因-2在神经系统疾病中的研究进展
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作者 李乐乐 李开阔 +1 位作者 郭海云 侯武刚 《中国临床研究》 2025年第10期1607-1611,共5页
N-myc下游调节基因-2(NDRG2)是与细胞增殖、分化和凋亡密切相关的抑癌基因,其在脑内主要表达于星形胶质细胞。研究表明NDRG2可通过调控星形胶质细胞的增殖活化、炎症反应、谷氨酸兴奋性毒性及血脑屏障完整性等参与脑卒中、精神类疾病、... N-myc下游调节基因-2(NDRG2)是与细胞增殖、分化和凋亡密切相关的抑癌基因,其在脑内主要表达于星形胶质细胞。研究表明NDRG2可通过调控星形胶质细胞的增殖活化、炎症反应、谷氨酸兴奋性毒性及血脑屏障完整性等参与脑卒中、精神类疾病、神经退行性疾病的发生与发展。本文主要对星形胶质细胞特异性表达的NDRG2在不同中枢神经系统疾病进程中的重要作用作一综述。 展开更多
关键词 N-myc下游调节基因-2 星形胶质细胞 脑肿瘤 脑卒中 阿尔茨海默症 抑郁症 焦虑症 血脑屏障
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意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中长链非编码RNA的差异表达分析 被引量:18
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作者 郭睿 耿四海 +7 位作者 熊翠玲 郑燕珍 付中民 王海朋 杜宇 童新宇 赵红霞 陈大福 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第18期3600-3613,共14页
【目的】长链非编码RNA(lncRNA)在真核生物的基因表达、表观遗传和细胞周期调控等方面发挥重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中lncRNA的表达谱及其作用。【方法】利用RNA-seq技... 【目的】长链非编码RNA(lncRNA)在真核生物的基因表达、表观遗传和细胞周期调控等方面发挥重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中lncRNA的表达谱及其作用。【方法】利用RNA-seq技术和链特异性建库方法对意蜂7和10日龄工蜂中肠(Am7、Am10)进行深度测序,下机的原始数据经过Perl脚本过滤得到高质量有效读段。利用bowtie工具将有效读段比对核糖体数据库,进一步利用Top Hat2软件将未比对到核糖体数据库上的数据比对到参考基因组。利用CPC和CNCI软件对转录本的编码能力进行预测。通过RT-PCR对部分lncRNA进行鉴定。利用edgeR软件进行差异表达lncRNA(DElncRNA)分析,进而预测lncRNA的上下游基因,并对上下游基因进行GO及KEGG代谢通路富集分析。联用RNAhybrid、Miranda和Target Scan软件预测DElncRNA靶向结合的mi RNA及mi RNA靶向结合的靶基因,并通过Cytoscape软件构建DElncRNAs-mi RNAs-m RNAs的调控网络。最后,通过RT-qPCR验证测序数据的可靠性。【结果】Am7和Am10的深度测序分别获得134 802 058和147 051 470条原始读段,经严格过滤分别得到134 166 157和146 293 288条有效读段;共得到3 890个DElncRNA,包括2 005个上调lncRNA与1 885个下调lncRNA。RT-PCR验证结果显示共有8个lncRNA能扩增出符合预期的目的片段,表明预测出的lncRNA真实存在。DElncRNA的上下游基因数为1 793个,它们涉及42个GO条目,包括代谢进程、发育进程、细胞进程、应激反应和免疫系统进程等;这些上下游基因还涉及251条代谢通路,包括碳代谢、嘌呤代谢和脂肪酸的生物合成等物质代谢通路,硫代谢、甲烷代谢和氧化磷酸化等能量代谢通路,Hippo信号通路、Wnt信号通路和Notch信号通路等信号通路,溶酶体、内吞作用和泛素介导的蛋白水解等细胞免疫通路,以及MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路和NF-kappa B信号通路等体液免疫通路,上述结果表明DElncRNA在意蜂中肠发育过程中参与物质和能量代谢、细胞生命活动和免疫调控。进一步分析发现TCONS_00020918可通过调控西方蜜蜂王浆主蛋白1编码基因在意蜂工蜂中肠的营养吸收、级型分化中发挥功能。DElncRNA的调控网络分析结果显示DElncRNA与mi RNA、m RNA间存在复杂的调控关系,部分DElncRNA处于调控网络的中心位置且能靶向结合较多的mi RNA,也有部分mi RNA可被多个DElncRNA共同靶向,表明这些DElncRNA可能在中肠发育中发挥重要作用。随机挑取5个DElncRNA进行RT-qPCR验证,结果显示它们的表达量变化趋势与测序结果一致,证实了本研究测序数据的可靠性。【结论】差异表达长链非编码RNA(DElncRNA)广泛参与意蜂工蜂中肠的新陈代谢、细胞活动和免疫调控并作为竞争性内源RNA(ce RNA)发挥作用,研究结果为关键lncRNA的筛选和功能研究提供了必要的数据支持。 展开更多
关键词 意大利蜜蜂 中肠 发育 长链非编码RNA 上下游基因
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意大利蜜蜂工蜂中肠的长链非编码RNA的预测、分析及鉴定 被引量:9
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作者 熊翠玲 耿四海 +9 位作者 王心蕊 刘思亚 陈大福 郑燕珍 付中民 杜宇 王海朋 陈华枝 周丁丁 郭睿 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1034-1044,共11页
【目的】预测、分析和鉴定意大利蜜蜂Apismelliferaligustica工蜂中肠的长链非编码RNA(lncRNA),探究lncRNA的作用。【方法】结合lncRNA-seq技术和链特异性cDNA建库方法对意大利蜜蜂工蜂中肠进行深度测序;利用Perl脚本对原始数据进行过滤... 【目的】预测、分析和鉴定意大利蜜蜂Apismelliferaligustica工蜂中肠的长链非编码RNA(lncRNA),探究lncRNA的作用。【方法】结合lncRNA-seq技术和链特异性cDNA建库方法对意大利蜜蜂工蜂中肠进行深度测序;利用Perl脚本对原始数据进行过滤;联用CPC和CNCI软件对测序数据进行lncRNA预测,并比较lncRNA基因与其邻近的蛋白编码基因的结构特征;通过RT-PCR对随机选取的lncRNA进行鉴定;利用相关生物信息学软件对lncRNA、的上下游基因进行GO分类和KEGG代谢通路富集分析。【结果】意大利蜜蜂工蜂中肠样品的lncRNA-seq共得到1 956 118 858原始读段,经过滤得到1 946 489 304有效读段,共预测出6 353个lncRNA,它们较蛋白编码基因含有较少的外显子数、较短的转录本长度。通过RT-PCR验证了9个lncRNA的表达。lncRNA的上下游基因富集在42个GO条目和256条代谢通路,进一步分析结果表明这些lncRNA参与调控意大利蜜蜂工蜂中肠的新陈代谢和细胞生命活动等生物学过程。【结论】研究结果丰富了蜜蜂的lncRNA信息,也为阐明lncRNA在意大利蜜蜂工蜂中肠发育及胁迫响应过程中的作用打下了基础。 展开更多
关键词 意大利蜜蜂 中肠 lncRNA—seq技术 长链非编码RNA 上下游基因
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NDRG2在人胚胎组织中的表达分布特点 被引量:12
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作者 胡晓兰 药立波 +2 位作者 张远强 邓艳春 刘新平 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期331-336,共6页
本文旨在研究NDRG2在不同胎龄人胚胎组织中的表达水平及细胞定位。利用RT-PCR和Western blot研究NDRG2 mRNA和蛋白在胎心、肺、肝和肾中的表达水平,免疫组织化学分析NDRG2蛋白在多种胚胎组织中的分布特点。结果表明,NDRG2在胚胎组织中... 本文旨在研究NDRG2在不同胎龄人胚胎组织中的表达水平及细胞定位。利用RT-PCR和Western blot研究NDRG2 mRNA和蛋白在胎心、肺、肝和肾中的表达水平,免疫组织化学分析NDRG2蛋白在多种胚胎组织中的分布特点。结果表明,NDRG2在胚胎组织中的表达随胚龄的延长而增加。NDRG2 mRNA和蛋白在胎心和肺中的变化一致;在胎肝中mRNA表达低而蛋白表达高,在胎肾中则相反。NDRG2蛋白阳性反应产物存在于细胞胞浆,见于小肠绒毛上皮细胞、结肠上皮细胞、皮肤表层细胞及毛囊、肺内小气道内衬上皮细胞、肝细胞、心肌细胞、胸腺小体、肾小管上皮细胞。结果提示,NDRG2蛋白可能不是一个组织特异性蛋白,并在组织和器官的形成中起作用。 展开更多
关键词 NDRG2 胚胎 组织分布
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Ndrg2基因表达对胃癌细胞增殖调控及其机理的研究 被引量:12
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作者 刘新平 邓艳春 +4 位作者 韩炯 李剑 王吉村 李莹 药立波 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期116-121,共6页
为研究Ndrg2基因在人类肿瘤发生发展中的作用 ,以不表达Ndrg2基因的胃癌细胞系HGC 2 7和表达Ndrg2基因的胃癌细胞系SGC 790 1作为对比材料 ,以Ndrg2基因转染HGC 2 7胃癌细胞系 ,以及用Ndrg2的反义寡核苷酸封闭SGC 790 1胃癌细胞系中Ndrg... 为研究Ndrg2基因在人类肿瘤发生发展中的作用 ,以不表达Ndrg2基因的胃癌细胞系HGC 2 7和表达Ndrg2基因的胃癌细胞系SGC 790 1作为对比材料 ,以Ndrg2基因转染HGC 2 7胃癌细胞系 ,以及用Ndrg2的反义寡核苷酸封闭SGC 790 1胃癌细胞系中Ndrg2基因的表达 .发现Ndrg2可以抑制HGC 2 7胃癌细胞的软琼脂集落形成 ,有一定诱导细胞凋亡的作用 ,对细胞周期蛋白E的表达有明显下调作用 .当封闭了SGC 790 1胃癌细胞中Ndrg2基因表达的软琼脂集落形成受到抑制 ,流式细胞仪检测发现此时的SGC 790 1细胞周期被阻滞在G1期 ,细胞周期蛋白D1和E表达下调 .Ndrg2基因对两种肿瘤细胞中的细胞外信号调节激酶 (ERK)和P38的表达也有不同的影响 . 展开更多
关键词 NDRG2基因 胃癌细胞增殖 调控 机理 细胞周期蛋白
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