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Fractal Geometry of a Dendrogram 被引量:1
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作者 Francisco Casanova-del-Angel 《Journal of Mathematics and System Science》 2014年第1期14-18,共5页
The fractal structure shown by the poligonal created by unions of middle points of vertices, nodes or peaks of dendograms terminal classes is presented. Its generating fractal, the details of its construction, and the... The fractal structure shown by the poligonal created by unions of middle points of vertices, nodes or peaks of dendograms terminal classes is presented. Its generating fractal, the details of its construction, and the way to measure its segments are defined; its property of inverted scale, the type of meshing, its property of axial symmetry and a theorem on transformation of linear affinity are considered. This is exemplified by means of one application with real data. 展开更多
关键词 dendrogram FRACTAL axial symmetry engenderer.
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A novel method for clustering cellular data to improve classification
2
作者 Diek W.Wheeler Giorgio A.Ascoli 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第9期2697-2705,共9页
Many fields,such as neuroscience,are experiencing the vast prolife ration of cellular data,underscoring the need fo r organizing and interpreting large datasets.A popular approach partitions data into manageable subse... Many fields,such as neuroscience,are experiencing the vast prolife ration of cellular data,underscoring the need fo r organizing and interpreting large datasets.A popular approach partitions data into manageable subsets via hierarchical clustering,but objective methods to determine the appropriate classification granularity are missing.We recently introduced a technique to systematically identify when to stop subdividing clusters based on the fundamental principle that cells must differ more between than within clusters.Here we present the corresponding protocol to classify cellular datasets by combining datadriven unsupervised hierarchical clustering with statistical testing.These general-purpose functions are applicable to any cellular dataset that can be organized as two-dimensional matrices of numerical values,including molecula r,physiological,and anatomical datasets.We demonstrate the protocol using cellular data from the Janelia MouseLight project to chara cterize morphological aspects of neurons. 展开更多
关键词 cellular data clustering dendrogram data classification Levene's one-tailed statistical test unsupervised hierarchical clustering
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EFFECTIVE AUTOMATED NEGOTIATION BASED ON ISSUE DENDROGRAMS AND PARTIAL AGREEMENTS 被引量:2
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作者 ShinjiKakimoto Katsuhide Fujita 《Journal of Systems Science and Systems Engineering》 SCIE EI CSCD 2018年第2期201-214,共14页
Negotiation is both an important topic in multi-agent systems research and an important aspect of daily life. Many real-world negotiations are complex and involve multiple interdependent issues, therefore, there has b... Negotiation is both an important topic in multi-agent systems research and an important aspect of daily life. Many real-world negotiations are complex and involve multiple interdependent issues, therefore, there has been increasing interest in such negotiations. Existing nonlinear automated negotiation protocols have difficulty in finding solutions when the number of issues and agents is large. In automated negotiations covering multiple independent issues, it is useful to separate out the issues and reach separate agreements on each in turn. In this paper, we propose an effective approach to automated negotiations based on recursive partitioning using an issue dendrogram. A mediator first finds partial agreements in each sub-space based on bids from the agents, then combines them to produce the final agreement. When it cannot find a solution, our proposed method recursively decomposes the negotiation sub-problems using an issue dendrogram. In addition, it can improve the quality of agreements by considering previously-found partial consensuses. We also demonstrate experimentally that our protocol generates higher-optimality outcomes with greater scalability than previous methods. 展开更多
关键词 Multi-issue negotiation issue dendrogram partial agreement
原文传递
ASUN:一种基于最大最近邻比率的任意形状层次聚类方法
4
作者 郑爱宇 《计算机时代》 2025年第10期31-37,43,共8页
传统层次聚类算法虽然能够输出完整的树状图,但通常无法有效识别任意形状的类簇;而现有大多数针对任意形状类簇的层次聚类算法基于重构的类簇结构,往往依赖更复杂的概念和参数,且难以输出完整树状图。本文提出一种单一参数的基于最大最... 传统层次聚类算法虽然能够输出完整的树状图,但通常无法有效识别任意形状的类簇;而现有大多数针对任意形状类簇的层次聚类算法基于重构的类簇结构,往往依赖更复杂的概念和参数,且难以输出完整树状图。本文提出一种单一参数的基于最大最近邻比率的任意形状层次聚类算法ASUN,该算法既能保证任意形状类簇的聚类精度,又能输出高质量树状图。首先,我们定义了基于类簇间k-最近邻对关系(kNNP)的相似性度量,kNNP关系表征类簇局部边界的内在关联性,该相似性度量能最大化两个类簇局部边界的聚合程度;其次,详细阐述了ASUN算法的实现流程以及其优化版本f-ASUN;最后,通过在合成数据集和真实数据集上与同类算法的对比实验,验证了所提算法的有效性和高效性。 展开更多
关键词 任意形状类簇 树状图 局部边界 最大最近邻比率 单一参数
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Genetic variability and trait association analysis in linseed(Linum usitatissimum L.)for yield and related traits
5
作者 Sandeep Kumar Yadav Neha Singh Hemant Kumar Yadav 《Oil Crop Science》 CSCD 2024年第3期151-159,共9页
Diversity information mining about a crop for different attributes is an essential step for effective breeding programs.The present investigation evaluates the quantum of genetic variability and determines the relatio... Diversity information mining about a crop for different attributes is an essential step for effective breeding programs.The present investigation evaluates the quantum of genetic variability and determines the relationship among the important agro-economic traits based on two years of phenotypic data of 210 accessions of linseed.The traits,capsule weight per plant,capsule per plant,husk weight per plant,and seed weight per plant exhibited comparatively higher genetic coefficient of variation(GCV)and phenotypic coefficient of variation(PCV).In contrast,oil content and seed per capsule exhibited a lower value.The high magnitude of broad sense heritability was observed for all traits except seeds per capsule and husk weight per plant.The trait,capsules per plant,plant height,and days to 50%flowering showed high genetic advance coupled with high heritability.Hierarchical cluster analysis grouped 210 accessions into six distinct clusters.Out of 210,144(68.57%)accessions were grouped into three clusters(I,II,and III),in which cluster-III was the largest,containing 64 accessions followed by cluster II and cluster-I.The highest inter-cluster distance was observed between clusters-I and V(127.85),while the lowest was between clusters-II and IV(27.09).The positive correlation of capsule weight per plant with the seed weight per plant and a negative correlation with the days to 50%flowering indicates that high yielding linseed varieties with early flowering/maturity could be developed through direct and indirect selection.Further,seed yield and oil content could be enhanced together as indicated by ghe positive association among these two important traits.In this study,high yielding accessions with moderate to high oil content such as GP36,GP31,GP14,GP54,GP26,GP24,GP34,GP21,GP37 and GP27 and early flowering(less than 70 days)accessions such as GP2,GP26,GP27,CG33,CG44,CG42,CG132,and CG31 identified as potential genetic materials that could be exploited for developing early maturing varieties with high yield.In addition,information’s on various genetic parameters will help breeders to devise suitable breeding methodology for linseed genetic improvement for targeted traits. 展开更多
关键词 LINSEED Genetic variability HERITABILITY Genetic advance PCA dendrogram
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无序样品聚类分析——基于兰氏和最长距离法
6
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期54-59,共6页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括数据变换的必要性、中心化变换、标准化变换、尺度变换和对数变换;计算方法涉及兰氏距离计算公式和最长距离计算公式;两... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括数据变换的必要性、中心化变换、标准化变换、尺度变换和对数变换;计算方法涉及兰氏距离计算公式和最长距离计算公式;两个实例分别是“1982年我国16个地区农民支出情况的调查数据”和“13个运动项目在两项定量指标上的测定值”;借助SAS软件,对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 无序样品 兰氏距离 最长距离 聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于马氏和中间距离法
7
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期60-65,共6页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及SAS实现计算的方法。基本概念包括样品间距离的定义、类的定义、类的特征;计算方法涉及马氏距离计算公式和中间距离计算公式;两个实例分别为“反映美国39座城... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及SAS实现计算的方法。基本概念包括样品间距离的定义、类的定义、类的特征;计算方法涉及马氏距离计算公式和中间距离计算公式;两个实例分别为“反映美国39座城市空气污染情况的调查数据”和“24种菌株的16种脂肪酸百分含量的测定结果”;借助SAS软件,对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 无序样品 马氏距离 中间距离 聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于第二组距离法和质心法
8
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期78-83,94,共7页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括相似性、相异性、度量型和非度量型;计算方法涉及度量两个样品之间距离的第二组距离法(共12个)和度量两类样品之间距离的... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括相似性、相异性、度量型和非度量型;计算方法涉及度量两个样品之间距离的第二组距离法(共12个)和度量两类样品之间距离的质心法(centroid法);两个实例分别为“1982年我国16个地区农民支出情况的调查数据”以及“13个运动项目在两项定量指标上的测定值”;借助SAS软件,对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 距离 相异性 非度量型 谱系聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于欧氏和最短距离法
9
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期48-53,共6页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括无序样品与有序样品、影响距离计算的要素、并类规则、谱系聚类及其两个步骤、聚类资料与分类资料的区别;计算方法涉及闵... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括无序样品与有序样品、影响距离计算的要素、并类规则、谱系聚类及其两个步骤、聚类资料与分类资料的区别;计算方法涉及闵科夫斯基距离(含欧氏距离)计算公式和最短距离计算公式;两个实例分别是“我国27个少数民族16岁男孩身体形态学数据”和“1995年我国14个省、直辖市的劳动卫生监督数据”;借助SAS软件,对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 无序样品 欧氏距离 最短距离 聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于斜交空间和平均距离法
10
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期66-70,共5页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括R2统计量、半偏R2统计量、伪F统计量和伪t2统计量;计算方法涉及斜交空间距离计算公式和平均距离计算公式;两个实例分别为... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括R2统计量、半偏R2统计量、伪F统计量和伪t2统计量;计算方法涉及斜交空间距离计算公式和平均距离计算公式;两个实例分别为“某地1962年—1988年三化螟种群消长资料”和“10种红葡萄酒在6项指标上的得分”;借助SAS对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 无序样品 斜交空间距离 平均距离 聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于第四组距离法和质心法
11
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期90-94,共5页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括不对称名义变量、不对称比率变量、Dice系数和Kulcynski 1系数;计算方法涉及度量两个样品之间距离大小的第四组距离法(共8... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括不对称名义变量、不对称比率变量、Dice系数和Kulcynski 1系数;计算方法涉及度量两个样品之间距离大小的第四组距离法(共8个)和度量两类样品之间距离大小的质心法(centroid法);两个实例分别为“九个离婚理由是否适用于美国各州”以及“缺血性中风病患者首发证候情况”;借助SAS软件,对第一个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 不对称名义变量 无序样品 Dice系数 谱系聚类分析 树形图
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无序样品聚类分析——基于第三组距离法和类平均法
12
作者 胡纯严 胡良平 《四川精神卫生》 2024年第S1期84-89,共6页
本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括对称名义变量、缺失值、匹配系数和海曼(Hamann)系数;计算方法涉及第三组距离法(共8个)和类平均法(average法);两个实例... 本文目的是介绍与无序样品聚类分析有关的基本概念、计算方法、两个实例以及使用SAS实现计算的方法。基本概念包括对称名义变量、缺失值、匹配系数和海曼(Hamann)系数;计算方法涉及第三组距离法(共8个)和类平均法(average法);两个实例分别为“反映美国39座城市空气污染情况的调查数据”和“某地1962年—1988年三化螟种群消长资料”;借助SAS软件,对两个实例的数据进行了无序样品聚类分析,并对SAS输出结果做出了解释。 展开更多
关键词 对称名义变量 匹配系数 海曼系数 谱系聚类分析 树形图
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应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究 被引量:36
13
作者 汤青萍 陈宽维 +2 位作者 李慧芳 章双杰 赵东伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期755-760,共6页
利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关,并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表... 利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关,并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明,各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡,为0.670;最低的是江山乌骨鸡,为0.581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位,1个低度多态座位,22个为高度多态座位;LEI0234与LEI0192分别检测到了10.3与12.2个等位基因。以标准遗传距离为准,遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡,为0.1002,而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远,为0.2546。通过UPG-MA法聚类后,略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类,江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类;金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类;乌蒙乌骨鸡独为一类。 展开更多
关键词 乌骨鸡 微卫星 遗传多样性 聚类分析
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家蚕不同地理品种分子系统学研究 被引量:66
14
作者 夏庆友 周泽扬 +1 位作者 鲁成 向仲怀 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期32-40,共9页
利用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)标志,在DNA分子水平上对不同系统、化性和眠性共六类59个家蚕Bombyxmori品种及野蚕B.mandarina之间的遗传差异进行了研究。在34个随机引物中有12个(35.2... 利用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)标志,在DNA分子水平上对不同系统、化性和眠性共六类59个家蚕Bombyxmori品种及野蚕B.mandarina之间的遗传差异进行了研究。在34个随机引物中有12个(35.29%)引物出现稳定的扩增带,扩增总带数为103条,其中86条具多态性,占83.5%,平均每个引物7.2条。利用单匹配相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现其RAPD不但具有品种特异性,而且具有系统特异性,证明中国一化性四眠种为最早从野蚕中分化出来的系统,中国一化性三眠种与中国一化性四眠种在进化上属有显著差异的两个类群。 展开更多
关键词 家蚕 遗传差异 分子系统树 品种 地理种群
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面向大规模定制的产品模块化设计方法 被引量:49
15
作者 王海军 孙宝元 +1 位作者 王吉军 魏小鹏 《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2004年第10期1171-1176,共6页
对零件进行了功能和物理特性分析 ,得到了零件之间的交互值并形成了关系矩阵 ,采用层次分析法对影响模块形成的因素进行了权重分配 ;基于模糊树图方法对产品模块进行了合理、有效的划分 ,并应用基于多专家的综合评判法对取不同阈值的模... 对零件进行了功能和物理特性分析 ,得到了零件之间的交互值并形成了关系矩阵 ,采用层次分析法对影响模块形成的因素进行了权重分配 ;基于模糊树图方法对产品模块进行了合理、有效的划分 ,并应用基于多专家的综合评判法对取不同阈值的模块划分结果进行方案评价 ;结合典型实例说明了该文提出的设计方法可以解决面向大规模定制的产品模块化形成问题。与其他优化算法相比 ,基于模糊树图理论的模块形成方法可以对产品进行有效、合理的模块划分 ,具有良好的适应性和通用性 ;基于多专家的模糊综合评判方法可以对模块的划分方案进行科学的决策 。 展开更多
关键词 模块化 大规模定制 模糊树图 综合评判
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中国灌木辣椒种质遗传多样性的SRAP和SSR分析 被引量:22
16
作者 陈学军 周坤华 +1 位作者 宗洪霞 方荣 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2201-2205,共5页
应用SRAP和SSR分子标记对8份辣椒种质进行了遗传多样性分析,结果表明,15对SRAP引物组合共扩增出321条带,平均每对引物扩增出21.40条,多态性位点比率为72.90%;18对SSR引物共扩增出109条带,平均每对引物扩增出6.06条,多态性位点比率为98.... 应用SRAP和SSR分子标记对8份辣椒种质进行了遗传多样性分析,结果表明,15对SRAP引物组合共扩增出321条带,平均每对引物扩增出21.40条,多态性位点比率为72.90%;18对SSR引物共扩增出109条带,平均每对引物扩增出6.06条,多态性位点比率为98.17%。与SRAP比较,SSR检测到的Shannon多样性指数(I)、观测等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)等遗传多样性参数都较大,说明SSR有更高的多态性检测效率。基于SRAP的聚类与基于SSR的聚类之间存在极显著正相关,且都能将中国灌木辣椒种质与美洲灌木辣椒种质及一年生辣椒种质有效区分。 展开更多
关键词 灌木辣椒 遗传多样性 SRAP SSR 聚类分析
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中国7个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析 被引量:29
17
作者 杨燕 马月辉 +1 位作者 吕慎金 张英汉 《生物多样性》 CAS CSCD 2004年第6期586-593,共8页
利用 2 6个微卫星标记分析了中国 7个地方绵羊 (Ovisaries)品种的遗传多样性。通过计算基因频率、平均杂合度 (H)、多态信息含量 (PIC)及有效等位基因数 (Ne) ,并根据Nei氏标准遗传距离 ,利用UPGMA法进行了聚类分析 ,评估其种内遗传变... 利用 2 6个微卫星标记分析了中国 7个地方绵羊 (Ovisaries)品种的遗传多样性。通过计算基因频率、平均杂合度 (H)、多态信息含量 (PIC)及有效等位基因数 (Ne) ,并根据Nei氏标准遗传距离 ,利用UPGMA法进行了聚类分析 ,评估其种内遗传变异和品种间遗传关系。结果表明 :2 6个微卫星位点共检测到 2 78个等位基因 ,Ne在 2 .12 88- 13.392 4之间 ;以等位基因频率为基础 ,得出位点的平均杂合度在 0 .0 6 2 9- 0 .5 90 3之间 ,品种平均杂合度在0 .36 33- 0 .4 4 89之间。 2 6个位点均为高度多态位点 ,PIC在 0 .6 6 2 8- 0 .8712之间。聚类分析表明哈萨克羊、阿勒泰羊和巴音布鲁克羊遗传关系最近 ;然后与白藏羊、黑藏羊聚为一类 ;湖羊和晋中羊聚为一类。各绵羊品种的聚类关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。 展开更多
关键词 绵羊 遗传多样性 遗传距离 聚类关系
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10个绵羊品种的微卫星DNA多态性研究 被引量:23
18
作者 仲涛 马月辉 +4 位作者 关伟军 凌英会 郭军 赵倩君 何晓红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期555-561,共7页
本研究利用FAO和ILRI推荐的21个微卫星引物,结合荧光标记PCR,检测了中国9个地方绵羊(Ovisaries)品种和1个外来绵羊品种的遗传多样性。21个微卫星座位均呈现出高度多态,多态性信息含量和杂合度均表明我国地方绵羊品种有着丰富的遗... 本研究利用FAO和ILRI推荐的21个微卫星引物,结合荧光标记PCR,检测了中国9个地方绵羊(Ovisaries)品种和1个外来绵羊品种的遗传多样性。21个微卫星座位均呈现出高度多态,多态性信息含量和杂合度均表明我国地方绵羊品种有着丰富的遗传多样性。本研究共检测到342个等位基因,有效等位基因数在2.1752~9.4997之间,座位平均杂合度在0.5248~0.8551之间,品种平均杂合度在0.633-0.761之间。聚类关系和主成分分析结果与其起源、育成历史及地理分布基本一致。 展开更多
关键词 绵羊 遗传多样性 遗传距离 聚类关系
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中国红花遗传多样性的AFLP分子标记(英文) 被引量:41
19
作者 张磊 黄蓓蓓 +1 位作者 开国银 郭美丽 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期91-96,共6页
目的考察红花的种内变异,为进一步进行红花种质资源选育和筛选品质相关基因奠定基础。方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,研究中国红花28个不同栽培居群在DNA水平的多态性。采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离。... 目的考察红花的种内变异,为进一步进行红花种质资源选育和筛选品质相关基因奠定基础。方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,研究中国红花28个不同栽培居群在DNA水平的多态性。采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离。结果筛选得到的12对引物的扩增片段具有丰富的多态性。各居群间的遗传相似系数在0.48-0.96。聚类分析显示它们分为3大主要类群和一个中间类群。结论红花种内存在一定的遗传多样性。基于AFLP条带统计的聚类结果和表型特征并不完全一致,可能是基因型和环境共同作用于表型的结果。 展开更多
关键词 扩增片段长度多态性 中国红花 系统树图 遗传多样性
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酸马奶中乳杆菌Lb.casei.Zhang和ZL12-1的16S rDNA基因序列及聚类分析 被引量:74
20
作者 乌日娜 张和平 孟和毕力格 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2005年第6期4-9,共6页
利用遗传学方法对分离自内蒙古锡林郭勒盟牧区采集的酸马奶样品中的乳杆菌Lb.casei.Zhang和ZL12-1进行16SrDNA基因扩增与测序,并将结果与同属的乳杆菌作同源性分析,建立系统发育树,以求更准确地确定其归属,为益生菌的筛选奠定基础。结... 利用遗传学方法对分离自内蒙古锡林郭勒盟牧区采集的酸马奶样品中的乳杆菌Lb.casei.Zhang和ZL12-1进行16SrDNA基因扩增与测序,并将结果与同属的乳杆菌作同源性分析,建立系统发育树,以求更准确地确定其归属,为益生菌的筛选奠定基础。结果表明,菌株Lb.casei.Zhang与标准菌株Lb.caseiATCC334T的同源性为100%,菌株ZL12-1与标准菌株Lb.gallinarumATCC33199T的同源性为98%。结合系统发育树及16SrDNA的部分序列分析结果,将Lb.casei.Zhang判定为Lb.caseisubsp.casei,ZL12-1鉴定为Lb.gallinarum,这与传统分类方法所得鉴定结果一致。 展开更多
关键词 乳杆菌 16S rDNA同源性 系统发育树 酸马奶
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