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基于单细胞测序数据探索阿尔茨海默病的发病机制
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作者 任彦学 赵琳琳 +4 位作者 何敏 于倩 汪煜楠 黄山 张惊宇 《中国实验诊断学》 2025年第6期634-642,共9页
目的应用单细胞测序技术探索阿尔茨海默病的发病机制。方法从单细胞转录组数据库下载疾病组及对照组数据,下载后进行数据质控,利用Seurat软件进行数据整合、聚类,利用T-分布随机邻域嵌入和一致流形逼近与投影软件进行图的可视化。利用Si... 目的应用单细胞测序技术探索阿尔茨海默病的发病机制。方法从单细胞转录组数据库下载疾病组及对照组数据,下载后进行数据质控,利用Seurat软件进行数据整合、聚类,利用T-分布随机邻域嵌入和一致流形逼近与投影软件进行图的可视化。利用SingleR与人工检查的综合方式完成细胞注释,最后将进一步进行基因差异分析、拟时序分析、细胞间通讯分析。结果细胞图谱构建结果显示:疾病组细胞类型为中性粒细胞、小胶质细胞、神经元以及星形胶质细胞。对照组细胞类型为神经元与星形胶质细胞;基因表达差异结果显示:CD74、B2M、SPP1、NEAT等基因在两组数据中均差值较为显著;拟时序分析结果显示:疾病组中神经元分布不均,对照组中的神经元均匀分布,星形胶质细胞则是相反的结果。细胞间通讯分析显示:在疾病组中神经元与其他细胞类型的细胞间通讯较弱,而星形胶质细胞细胞与其他细胞通讯作用强,小胶质细胞与其他细胞也有着若干受体配体对以及信号转导通路。并且小胶质细胞与星形胶质细胞通过SPP1信号通路进行细胞间相互作用的数量多。结论本研究通过单细胞测序技术得知在疾病组CD74、B2M、SPP1、NEAT1等基因表达量较高,且SPP1通路间的细胞相互作用可能为阿尔茨海默病的潜在发病机制。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序 阿尔茨海默病 数据图谱 拟时序分析 细胞通讯
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超量放血对家兔细胞免疫功能的影响 被引量:15
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作者 武桂英 张占恒 +4 位作者 阎世庆 薛宗丽 杨淑亚 武秋双 徐均平 《中国针灸》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期354-356,共3页
以成年健康家兔为实验对象 ,通过淋巴细胞转化试验 (L TT) ,二硝基氯苯 (DNCB)和植物血凝素 (PHA)皮肤试验 ,以及抗疲劳和抗缺氧试验等 ,观察放血后对其细胞免疫功能和抗应激能力的影响。实验结果证明 ,超量放血 (每千克体重 6~ 8ml)... 以成年健康家兔为实验对象 ,通过淋巴细胞转化试验 (L TT) ,二硝基氯苯 (DNCB)和植物血凝素 (PHA)皮肤试验 ,以及抗疲劳和抗缺氧试验等 ,观察放血后对其细胞免疫功能和抗应激能力的影响。实验结果证明 ,超量放血 (每千克体重 6~ 8ml)能提高家兔细胞免疫功能并增强其抗应激能力 (P<0 .0 5 ,P<0 .0 1 )。 展开更多
关键词 刺血疗法 细胞免疫 放血疗法
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亚低温对大鼠局灶性脑缺血神经元细胞凋亡及调控基因Bcl-2和Bax表达的影响(英文) 被引量:8
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作者 袁存国 杨期东 +1 位作者 朱武生 曹贵方 《中国临床康复》 CSCD 2003年第22期3066-3068,共3页
目的研究不同时程的亚低温治疗对大鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型的神经元细胞凋亡及Bcl-2,Bax基因表达的影响。方法健康雄性SD大鼠共40只,月龄两三个月。按抽签法随机分为5组,每组8只(n=8),分别为:假手术组(A)、对照组(B)、亚低温0.5h组... 目的研究不同时程的亚低温治疗对大鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型的神经元细胞凋亡及Bcl-2,Bax基因表达的影响。方法健康雄性SD大鼠共40只,月龄两三个月。按抽签法随机分为5组,每组8只(n=8),分别为:假手术组(A)、对照组(B)、亚低温0.5h组(C)、亚低温1.0h组(D)、亚低温3.0h组(E)。采用Longa线栓法制作MCAO模型,缺血3.0h后再灌注。缺血后即刻分别进行不同时程(0.5,1.0,3.0h)的亚低温治疗,再灌注后24h断头取脑,连续切片作TUNEL染色及Bcl-2,Bax免疫组化染色。结果凋亡神经元细胞(TUNEL阳性细胞)主要见于梗死灶周围的纹状体及额顶部皮层。Bcl-2及Bax阳性细胞也主要见于梗死灶周围的纹状体及额顶部皮层,与该区凋亡细胞的集中分布相一致。与对照组的Bcl-2细胞阳性率相比,亚低温3.0h组增加犤(23.0±3.8)%,P<0.05)犦;与对照组的Bax细胞阳性率相比,亚低温1.0,3.0h组均降低犤分别为(45.9±4.1)%,(32.4±3.7)%,P<0.05,P<0.01犦;凋亡细胞阳性率与Bcl-2/Bax的比值呈负相关关系(r=-0.9759,P<0.01)。结论亚低温1.0h以上有抑制细胞凋亡作用;Bcl-2/Bax的比值能影响细胞凋亡的发生。 展开更多
关键词 大鼠 局灶性脑缺血 神经元 细胞凋亡 调控基因 Bcl-2 Bax 基因表达 亚低温治疗
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针灸防治心肌缺血再灌注损伤的线粒体通路研究进展 被引量:4
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作者 樊海龙 赵凌 +1 位作者 任玉兰 梁繁荣 《世界中医药》 CAS 2015年第4期494-498,共5页
目的:探讨针灸防治心肌缺血再灌注损伤的线粒体细胞信号转导机制,为后续研究提供思路。方法:通过对近年来国内外有关线粒体心脏损伤的研究入手,分析针灸防治心肌缺血再灌注损伤的线粒体通路的研究进展。结果:研究多以大鼠为观察对象,主... 目的:探讨针灸防治心肌缺血再灌注损伤的线粒体细胞信号转导机制,为后续研究提供思路。方法:通过对近年来国内外有关线粒体心脏损伤的研究入手,分析针灸防治心肌缺血再灌注损伤的线粒体通路的研究进展。结果:研究多以大鼠为观察对象,主要从针刺改善线粒体功能,减少线粒体活性氧类(ROS)产生过量引起氧化应激,防止细胞内Ca2+超载和阻止线粒体通透性转换孔(m PTP)的开放等角度切入研究。结论:微小RNA(microRNA,miRNA)是基因网络、蛋白网络、代谢网络等的上游网络的调控环节。鉴于针灸作用的整体性特点,将miRNA引入针灸作用机制研究领域,可在基因或其他水平层面更好地揭示针灸作用机制。 展开更多
关键词 针灸 心肌缺血再灌注损伤 线粒体功能障碍 线粒体通路 细胞信号转导
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微波改性竹炭颗粒对实验性腹泻大鼠免疫性能和消化吸收功能的影响 被引量:1
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作者 王建辉 刘永乐 +4 位作者 李赤翎 刘冬敏 尹欣欣 李艳 王群辉 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期677-681,共5页
旨以研究活性竹炭颗粒(MABCP)对实验性腹泻大鼠免疫性能和消化吸收功能的影响,在大鼠饲粮中分别添加0.05,0.10,0.15%的经KOH微波活化处理的竹炭颗粒,对模型大鼠进行为期一周的饲养试验。研究发现:经KOH微波活化的竹炭颗粒,比表面积与吸... 旨以研究活性竹炭颗粒(MABCP)对实验性腹泻大鼠免疫性能和消化吸收功能的影响,在大鼠饲粮中分别添加0.05,0.10,0.15%的经KOH微波活化处理的竹炭颗粒,对模型大鼠进行为期一周的饲养试验。研究发现:经KOH微波活化的竹炭颗粒,比表面积与吸附性能大幅增强,其能显著降低腹泻大鼠稀便率(P<0.05),有效增加胸腺和脾脏指数(P<0.05);显著提高腹泻大鼠血清D-木糖含量(P<0.05),但对消化酶如淀粉酶活性无显著影响(P>0.05);肠道线粒体琥珀酸脱氢酶、NADH脱氢酶、H+-ATP酶活性显著增强(P<0.05),MDA生成量显著降低(P<0.05)。试验表明MABCP可提高体积免疫性能,改善小肠吸收功能,减少肠道自由基生成,有效维持或改善细胞氧化磷酸化水平,其中以低剂量添加效果更为明显。 展开更多
关键词 微波改性竹炭颗粒 大鼠 免疫性能 消化吸收功能 细胞氧化磷酸化
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Value of Magnetic Resonance Diffusion Weighted Imaging in Evaluating Cellular Density of Astrocytomas 被引量:1
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作者 CHEN Jun XIA Jun ZHOU Yi-cheng 《Journal of Nanjing Medical University》 2004年第5期262-266,共5页
Objective:To evaluate the value of apparent diffusion coefficients(ADC)in Magnetic Resonance diffusion weighted imaging(MR DWI)with echo-planar technique in depicting the tumor cellularity and grading of astrocytomas.... Objective:To evaluate the value of apparent diffusion coefficients(ADC)in Magnetic Resonance diffusion weighted imaging(MR DWI)with echo-planar technique in depicting the tumor cellularity and grading of astrocytomas.Methods:Thirty-four patients with astrocytomas(18 male,16 female,ages from 10-73 with average of 38.41)were examined by MRI and proved by surgery and pathology,and the number of gradeⅠ-Ⅱ(low-grade)and gradeⅢ-Ⅳ(high-grade)is 26 and 8 respectively.ADC values of astrocytomas were determined on MR DWI.Cellularity of astrocytomas was analyzed with Adobe Photoshop 7.0 software.Results:Mean ADC values of high-grade astrocytomas(7.34±2.95)×10^(-4)mm^(2)/s were significantly different from that of lowgrade astrocytomas(13.76±3.31)×10^(-4)mm^(2)/s(t=4.913,P<0.001).Cellularity of high-grade astrocytomas(19.81±9.73)%were significantly higher than that of low-grade astrocytomas(4.74±2.96)%(t=4.32,P=0.003).ADC values of astrocytomas significantly negatively correlated with their cellularities(r=-0.535,P=0.001).Conclusion:The cellularities of astrocytomas contribute very much to ADC values in MR DWI.MR DWI is very valuable in predicting and evaluating the cellularity of astrocytomas.MR DWI might have a potential in predicting the degree of astrocytomas. 展开更多
关键词 GLIOMA ASTROCYTOMA MRI magnetic resonance diffusion weighted imaging echo-planar technique cel-lularity
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原发性肝癌患者血清SICAM-1、VEGF水平测定的临床意义
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作者 刘忠娟 时步卿 《淮海医药》 2005年第3期193-194,共2页
目的 探讨原发性肝癌患者血清SICAM- 1、VEGF水平及临床意义。方法 应用双抗体夹心EL ISA法对33例原发性肝癌患者进行血清SICAM- 1和VEGF水平测定。并以35名正常健康人作比较。结果 原发性肝癌患者血清中SICAM- 1和VEGF水平非常显著... 目的 探讨原发性肝癌患者血清SICAM- 1、VEGF水平及临床意义。方法 应用双抗体夹心EL ISA法对33例原发性肝癌患者进行血清SICAM- 1和VEGF水平测定。并以35名正常健康人作比较。结果 原发性肝癌患者血清中SICAM- 1和VEGF水平非常显著地升高(P<0 .0 1) ,且以转移者更为显著。结论 检测血清SICAM- 1和VEGF水平的变化对了解病情、指导临床实践均具有十分重要的临床价值。 展开更多
关键词 血清SICAM-1 原发性肝癌患者 VEGF 临床意义 水平测定 双抗体夹心ELISA法 正常健康人 临床价值 临床实践
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蜂窝D2D异构网络非对称干扰对齐算法 被引量:2
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作者 章扬 秦智超 +1 位作者 张纬栋 陆洲 《中国电子科学研究院学报》 北大核心 2017年第3期232-236,共5页
针对蜂窝D2D异构网络中蜂窝通信与D2D用户间的相互干扰问题,提出了一种基于分组的干扰对齐算法,通过对D2D用户进行分组,将蜂窝通信基站对D2D通信用户的干扰对齐到相同的信号空间,并根据蜂窝通信和D2D通信对传输速率的不同需求,设计相应... 针对蜂窝D2D异构网络中蜂窝通信与D2D用户间的相互干扰问题,提出了一种基于分组的干扰对齐算法,通过对D2D用户进行分组,将蜂窝通信基站对D2D通信用户的干扰对齐到相同的信号空间,并根据蜂窝通信和D2D通信对传输速率的不同需求,设计相应的预编码矩阵和接收滤波矩阵,消除用户间干扰对通信的影响。仿真实验表明,在有限的天线配置条件下,提出的干扰对齐算法,能够满足蜂窝D2D异构网络中对系统传输容量的不同需求,具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 多输入多输出系统 干扰对齐 设备到设备网络 蜂窝网络 预编码矩阵
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基于UPLC-MS/MS建立同时测定自发性高血压大鼠主动脉血管内皮细胞中杜仲7个活性成分含量的方法 被引量:1
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作者 李梦婷 胡贺佳 +7 位作者 金阳 陈艺 陈思颖 李月婷 黄勇 郑林 黄静 巩仔鹏 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第13期3623-3632,共10页
该文旨在采用UPLC-MS/MS技术建立同时测定自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)主动脉血管内皮细胞中杜仲7个活性成分京尼平苷酸(genipinic acid,GA)、原儿茶酸(protocatechuic acid,PCA)、新绿原酸(neochlorogenic a... 该文旨在采用UPLC-MS/MS技术建立同时测定自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)主动脉血管内皮细胞中杜仲7个活性成分京尼平苷酸(genipinic acid,GA)、原儿茶酸(protocatechuic acid,PCA)、新绿原酸(neochlorogenic acid,NCA)、绿原酸(chlorogenic acid,CA)、隐绿原酸(cryptochlorogenic acid,CCA)、松脂醇二葡萄糖苷[(+)-pinoresinol di-O-β-D-glucopyranosid,PDG]、松脂醇单葡萄糖苷[(+)-pinoresinol 4′-O-β-D-glucopyranoside,PG]含量的方法。首先选取合格的SHR模型,采用结扎贴壁法分离、培养原代大鼠主动脉血管内皮细胞(VEC),并进行传代培养,鉴定成功后,以VEC为研究对象,采用超高效液相色谱-三重四极杆质谱联用仪(UPLC-MS/MS)建立同时测定VEC中GA、PCA、NCA、CA、CCA、PDG、PG等7个成分含量的方法,包括专属性、线性、基质效应、回收率、准确度、精密度和稳定性等。该文所建方法的最低定量限为0.97~4.95μg·L^(-1),准确度为87.26%~109.6%,提取回收率为89.23%~105.3%,基质效应为85.86%~106.2%,稳定性为86.00%~112.5%,能够满足测量的要求。表明该文建立了快速、准确地同时测定自发性高血压大鼠主动脉血管内皮细胞中杜仲7个活性成分含量的UPLC-MS/MS测定方法,为开展杜仲提取物7个活性成分的细胞药代动力学研究奠定基础。 展开更多
关键词 杜仲提取物 血管内皮细胞 京尼平苷酸 松脂醇二葡萄糖苷 细胞药代动力学
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Sensitivity analysis for stochastic and deterministic models of nascent focal adhesion dynamics
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作者 Hannah R. Biegel Alex Quackenbush Hannah Callender Highlander 《International Journal of Biomathematics》 2017年第7期237-265,共29页
Sensitivity analysis (SA) is a critical part of modeling any biological system due to the inherent uncertainty in model output, as introduced by parameter values that have not been experimentally determined. SA ther... Sensitivity analysis (SA) is a critical part of modeling any biological system due to the inherent uncertainty in model output, as introduced by parameter values that have not been experimentally determined. SA therefore provides deeper understanding of the system by painting a picture of the extent to which certain model outputs vary in rela- tionship to changes in model parameters. Here we explore two types of global SA for recently developed models of nascent focal adhesion formation, a key step in cellular movement. While many SA methods have been used for deterministic methods, we uti- lize methods for both stochastic and deterministic models, providing a more complete description of the parameters to which the focal adhesion model is most sensitive. Spe- cific recommendations for further experimentation in the process of cellular motility are proposed in response to the SA. 展开更多
关键词 Sensitivity analysis method of Morris FAST focal adhesion dynamics cel-lular motility stochastic models.
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