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结合分子对接技术研究牦牛乳苦味肽RK7和KQ7的HMG-CoA还原酶抑制活性
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作者 王鹏 梁琪 +1 位作者 赵保堂 宋雪梅 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第11期208-215,I0013-I0020,共16页
牦牛乳干酪酪蛋白的苦味肽具有血管紧张素转换酶(angiotension converting enzyme,ACE)抑制活性、抑菌活性、抗糖活性等多种良好的生物活性。HMG-CoA还原酶是治疗高胆固醇血症(hypercholesterolemia,HC)的主要靶点之一,是体内生物合成... 牦牛乳干酪酪蛋白的苦味肽具有血管紧张素转换酶(angiotension converting enzyme,ACE)抑制活性、抑菌活性、抗糖活性等多种良好的生物活性。HMG-CoA还原酶是治疗高胆固醇血症(hypercholesterolemia,HC)的主要靶点之一,是体内生物合成胆固醇的关键限速酶。该试验以牦牛乳干酪苦味肽RPKHPIK(RK7)和KVLPVPQ(KQ7)为研究对象,阿托伐他汀、辛伐他汀、瑞舒伐他汀和普伐他汀为对照样品,通过生物信息学工具研究RK7和KQ7的理化性质,运用分子对接和分子动力学模拟揭示抑制HMG-CoA还原酶的作用机制,并结合体外试验测定RK7和KQ7对HMG-CoA还原酶的抑制活性。研究结果表明,RK7与KQ7的分子质量分别为874.90 Da和779.50 Da;RK7与KQ7以及4种他汀类药物均能与HMG-CoA还原酶生成配体-受体复合构象;将RK7和KQ7与抑制HMG-CoA还原酶肽数据库比对之后发现,KQ7与已知的抑制肽段相似度为75%,RK7为具有抑制HMG-CoA还原酶的新型抑制肽;体外试验表明,RK7和KQ7 HMG-CoA还原酶的IC50分别为1.045 mg/mL和1.228 mg/mL。该试验通过生物信息学平台及体外验证试验高效快速的获得牦牛乳源HMG-CoA还原酶抑制肽,并通过分子对接及分子动力学模拟研究分子间的相互作用机制,为HMG-CoA还原酶抑制肽提供新的思路。 展开更多
关键词 牦牛乳干酪 苦味肽 分子对接 分子动力学 HMG-coa还原酶抑制活性
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多策略改进COA算法优化LSSVM的变压器故障诊断研究 被引量:2
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作者 李斌 白翔旭 《电工电能新技术》 北大核心 2025年第4期112-119,共8页
为解决变压器故障诊断准确率低的问题,本文提出一种多策略改进浣熊优化算法(ICOA)与最小二乘支持向量机(LSSVM)相结合的变压器故障诊断方法。首先,通过核主成分分析(KPCA)将变压器故障数据集进行特征提取,降低故障数据维度;其次,应用混... 为解决变压器故障诊断准确率低的问题,本文提出一种多策略改进浣熊优化算法(ICOA)与最小二乘支持向量机(LSSVM)相结合的变压器故障诊断方法。首先,通过核主成分分析(KPCA)将变压器故障数据集进行特征提取,降低故障数据维度;其次,应用混沌映射、透镜反向学习、Levy飞行等策略对浣熊优化算法(COA)进行优化,提高全局寻优能力;然后,应用ICOA算法进行LSSVM参数寻优,构建ICOA-LSSVM故障诊断模型;最后,将特征提取后的数据导入ICOA-LSSVM中并与其他模型对比。实验结果表明所提方法准确率为96.19%,相比其他诊断模型具有更高的故障诊断精度。 展开更多
关键词 变压器故障诊断 浣熊优化算法 核主成分分析 最小二乘支持向量机
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基于CH-COA神经网络的飞机后机身眼镜框装配实时变形预测研究
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作者 刘畅 刘红军 《南方农机》 2025年第S1期156-159,共4页
【目的】解决后机身眼镜框装配变形预测的难题,实现眼镜框壁板变形量的精确预测。【方法】提出了一种改进的神经网络预测算法,首先,利用小龙虾群优化算法(COA)将神经网络的初始值和阈值进行初步优化。其次,在算法觅食阶段引入天鹰座优... 【目的】解决后机身眼镜框装配变形预测的难题,实现眼镜框壁板变形量的精确预测。【方法】提出了一种改进的神经网络预测算法,首先,利用小龙虾群优化算法(COA)将神经网络的初始值和阈值进行初步优化。其次,在算法觅食阶段引入天鹰座优化算法(AO)第一阶段来弥补全局搜索能力的不足,调整搜索边界、扩展搜索策略,并引入垂直交叉操作进行多维度搜索,提高预测精准度,从而建立了CH-COA后机身眼镜框装配变形预测模型。最后,利用ANSYS软件获取50组眼镜框变形数据作为神经网络的训练和预测数据,对神经网络模型进行了训练,并分别与未改进的COA、MOV、HHO、MPA预测模型进行了对比。【结果】基于CH-COA神经网络模型的后机身眼镜框装配变形预测精度标准差为0.21%,显著低于其他算法,验证了CH-COA具有更好的稳定性和可靠性。【结论】本研究创新性地提出了基于垂直交叉操作的解更新机制、设计了动态调整的缩放因子、引入了边界处理策略,可为后机身装配中的形变控制提供理论支持与技术参考。 展开更多
关键词 变形预测 coa优化算法 BP神经网络 ANSYS仿真
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COA6在乳腺癌中的表达及其与肿瘤免疫细胞浸润相关
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作者 金晓霞 刘玉山 +1 位作者 胡继平 朱兴华 《基础医学与临床》 2025年第6期755-761,共7页
目的 检测细胞色素c氧化酶组装因子6(COA6)在乳腺癌中的表达及临床意义,分析COA6与乳腺癌免疫浸润的相关性。方法 全转录组测序筛选差异基因,并联合TCGA数据库验证COA6的表达。免疫组化技术检测125例乳腺癌组织及癌旁组织COA6蛋白表达,... 目的 检测细胞色素c氧化酶组装因子6(COA6)在乳腺癌中的表达及临床意义,分析COA6与乳腺癌免疫浸润的相关性。方法 全转录组测序筛选差异基因,并联合TCGA数据库验证COA6的表达。免疫组化技术检测125例乳腺癌组织及癌旁组织COA6蛋白表达,分析其与临床特征的相关性。分别用qRT-PCR、Western blot检测乳腺癌细胞、组织中COA6 mRNA及蛋白表达。利用TIMER数据库分析COA6基因的高表达与免疫细胞浸润的关系。结果 乳腺癌组织中COA6的阳性表达率为(88%, 110/125),显著高于癌旁组织(7.2%, 9/125)(P<0.05),并且与肿瘤的大小和组织学分级呈正相关。在新鲜乳腺癌组织中,COA6蛋白的表达水平明显高于癌旁组织。在乳腺癌细胞系中,COA6 mRNA和蛋白表达均明显增加。COA6与辅助T细胞、NK细胞、CD8+T细胞、M1型巨噬细胞、调节性T细胞、树突细胞、记忆性CD4+T细胞在肿瘤微环境中的浸润有关。结论 COA6在乳腺癌中的表达水平升高,并且与肿瘤免疫浸润呈正相关,这为乳腺癌治疗提供了潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 细胞色素c氧化酶组装因子6(coa6) 乳腺癌 免疫组织化学 免疫浸润
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基于COA优化BP神经网络的药厂温度控制研究
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作者 张长天 张琦 +2 位作者 姚满 李智乐 张硕伦 《企业科技与发展》 2025年第2期96-99,共4页
药厂技术车间因其占地面积大及高挑空的结构特点,形成一个温度控制较为复杂的滞后系统。在此环境下,传统的PID(比例-积分-微分)控制器难以实现自适应参数调整,而人工调节参数既烦琐,又无法确保达到最佳的控制效果。针对此问题,文章设计... 药厂技术车间因其占地面积大及高挑空的结构特点,形成一个温度控制较为复杂的滞后系统。在此环境下,传统的PID(比例-积分-微分)控制器难以实现自适应参数调整,而人工调节参数既烦琐,又无法确保达到最佳的控制效果。针对此问题,文章设计了一种新型控制器,该控制器结合基于小龙虾优化算法(Crayfish Optimization Algorithm,COA)来优化的BP(反向传播)神经网络算法与Smith预估补偿机器,旨在实现对药厂技术车间温度的精准控制。实验结果表明,相较于经典的PID控制器,这一新型控制器能显著降低超调量达33.2%,同时使稳态时间缩短了59.77%。这些数据验证了该控制器在药厂技术车间温度控制中的快速响应能力、准确性,以及在复杂环境下的优越性能。 展开更多
关键词 coa BP神经网络 SMITH预估器 PID 滞后
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基于ICOA-P&O算法的MPPT控制研究
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作者 王金玉 李新宇 董秀波 《自动化与仪表》 2025年第4期6-10,28,共6页
在光伏阵列发生局部遮荫时会出现多个功率极值点,传统的MPPT控制算法以及一般的优化算法不能够准确地跟踪光伏最大功率点(MPP),进而导致整个光伏系统的效率降低。小龙虾优化算法(COA)是2023年提出的一种优化算法,该文针对光伏阵列功率... 在光伏阵列发生局部遮荫时会出现多个功率极值点,传统的MPPT控制算法以及一般的优化算法不能够准确地跟踪光伏最大功率点(MPP),进而导致整个光伏系统的效率降低。小龙虾优化算法(COA)是2023年提出的一种优化算法,该文针对光伏阵列功率多峰值的问题,选取对应的多峰值函数对小龙虾算法与其他优化算法进行测试,验证了小龙虾算法的优异性能。为了应对光伏MPP跟踪的实际问题,提出了一种改进小龙虾算法(ICOA)与二分步长的扰动观察法(P&O)相结合的复合算法跟踪MPP,通过在Simulink中模拟静态遮荫与动态遮荫,验证了所提算法可以快速准确地跟踪到MPP。 展开更多
关键词 小龙虾算法 扰动观察 局部遮荫 最大功率点跟踪
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基于COA-CNN模型的综采工作面煤与瓦斯突出灾害预测研究
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作者 许爱国 《陕西煤炭》 2025年第2期62-66,共5页
随着煤矿开采持续向深部延伸,工作面面临的地质压力不断增大,瓦斯释放和积聚的风险显著增加。此外,深部矿井中煤层的物理性质和构造特征也与浅部煤层存在一定差异,进一步增加了煤与瓦斯突出的潜在风险。本研究基于某矿数据,首先应用箱线... 随着煤矿开采持续向深部延伸,工作面面临的地质压力不断增大,瓦斯释放和积聚的风险显著增加。此外,深部矿井中煤层的物理性质和构造特征也与浅部煤层存在一定差异,进一步增加了煤与瓦斯突出的潜在风险。本研究基于某矿数据,首先应用箱线图(Boxplot)与多重插补法(MI)进行数据清洗,结合相关系数(Correlation)筛选影响因素,建立基于Boxplot-MI-C的煤与瓦斯突出预测指标体系。然后运用深度学习中的卷积神经网络(CNN)搭建模型框架,结合鸬鹚搜索算法(COA)优化模型超参数,建立基于COA-CNN的煤与瓦斯突出预测模型。最后,建立支持向量机(SVM)、COA-SVM、人工神经网络(ANN)、COA-ANN、CNN模型进行对比验证,其中,COA-CNN模型预测结果的准确率最高,拥有更优的鲁棒性与泛化能力,可以为煤与瓦斯突出灾害的预测与防控提供更好的决策参考。 展开更多
关键词 煤与瓦斯突出 数据清洗 指标体系 coa优化算法 CNN预测模型
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基于K均值聚类和VMD-COA-BiLSTM的光伏功率预测 被引量:1
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作者 查航伟 成燕 黄瑞承 《热能动力工程》 北大核心 2025年第5期157-165,共9页
光伏发电功率受气象因素的影响呈现出不稳定性和间歇性,准确预测光伏功率有助于实现大规模并网并保障电网的稳定运行。以澳大利亚DKASC Solar Centre光伏电站数据为研究对象,提出一种基于气象相似日的变分模态分解算法、长鼻浣熊算法和... 光伏发电功率受气象因素的影响呈现出不稳定性和间歇性,准确预测光伏功率有助于实现大规模并网并保障电网的稳定运行。以澳大利亚DKASC Solar Centre光伏电站数据为研究对象,提出一种基于气象相似日的变分模态分解算法、长鼻浣熊算法和双向长短期记忆神经网络(VMD-COA-BiLSTM)的光伏功率短期预测模型。针对光伏数据的复杂非线性特征、噪声干扰以及高维特征等问题,通过K均值聚类将数据划分为3种天气类型,增强模型映射能力;利用VMD将聚类之后的原始信号分解,采用中心频率法确定最佳模态数,充分提取集合中的输入因素信息,提高数据质量;将分解后的各分量分别输入BiLSTM网络进行预测,采用COA优化BiLSTM的超参数配置,实现不同天气类型下的光伏功率的准确预测。结果表明:K均值聚类和VMD算法有效提升了数据质量,增强了输入、输出数据的耦合强度;COA优化BiLSTM模型在优化能力和收敛速度上均优于粒子群算法(PSO);所提出的VMD-COA-BiLSTM模型在晴天、多云和阴雨天的RMSE分别降低了35.24%,45.54%和42.88%,显著提高了预测精度,且能适应不同环境下的可靠预测。 展开更多
关键词 光伏发电功率 预测 K-MEANS聚类 变分模态分解 长鼻浣熊算法 双向长短期记忆神经网络
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Research on multiple-strategy improved coati optimization algorithm for engineering applications
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作者 GAO Yaqiong WU Jin +1 位作者 SU Zhengdong LI Chaoxing 《High Technology Letters》 EI CAS 2024年第4期405-414,共10页
In this paper,a multi-strategy improved coati optimization algorithm(MICOA)for engineering applications is proposed to improve the performance of the coati optimization algorithm(COA)in terms of convergence speed and ... In this paper,a multi-strategy improved coati optimization algorithm(MICOA)for engineering applications is proposed to improve the performance of the coati optimization algorithm(COA)in terms of convergence speed and convergence accuracy.First,a chaotic mapping is applied to initial-ize the population in order to improve the quality of the population and thus the convergence speed of the algorithm.Second,the prey’s position is improved during the prey-hunting phase.Then,the COA is combined with the particle swarm optimization(PSO)and the golden sine algorithm(Gold-SA),and the position is updated with probabilities to avoid local extremes.Finally,a population decreasing strategy is applied as a way to improve the performance of the algorithm in a comprehen-sive approach.The paper compares the proposed algorithm MICOA with 7 well-known meta-heuristic optimization algorithms and evaluates the algorithm in 23 test functions as well as engineering appli-cation.Experimental results show that the MICOA proposed in this paper has good effectiveness and superiority,and has a strong competitiveness compared with the comparison algorithms. 展开更多
关键词 coati optimization algorithm(coa) chaotic map multi-strategy
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应用HMG-CoA还原酶抑制剂筛选虾青素高产突变株 被引量:2
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作者 梁新乐 励建荣 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期23-25,共3页
研究了HMG-CoA还原酶抑制剂辛伐他汀对法夫酵母生长及其虾青素合成的影响,实验结果表明,当辛伐他汀浓度在4·78×10-6mol/L时对酵母细胞的生长的抑制表现不明显,但对虾青素合成具有显著的抑制作用。以此浓度作为筛选浓度,经亚... 研究了HMG-CoA还原酶抑制剂辛伐他汀对法夫酵母生长及其虾青素合成的影响,实验结果表明,当辛伐他汀浓度在4·78×10-6mol/L时对酵母细胞的生长的抑制表现不明显,但对虾青素合成具有显著的抑制作用。以此浓度作为筛选浓度,经亚硝基胍(NTG)诱变后,通过辛伐他汀平板初筛与摇瓶复筛,获得较高虾青素产率的突变株。实验结果表明,菌体生物量、类胡萝卜总量和虾青素产量都有明显的提高,其中NPX-3_05突变株类胡萝卜总量与虾青素产量分别达到3·823、2·755mg/L,比出发菌株依次提高了163%、143%(1·453mg/L、1·134mg/L)。菌株NPX-3_05经连续发酵5次的稳定性实验表明其性状稳定。目标产物经HPLC定性分析,确定为反式虾青素。因此,以辛伐他汀等HMG-CoA还原酶抑制剂作为选择压力,对虾青素高产突变株的筛选上具有较好的“筛分”能力。 展开更多
关键词 辛伐他汀 虾青素 法夫酵母 HMG-coa还原酶 Petri DISH HMG-coa还原酶抑制剂 高产突变株 筛选 稳定性实验
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哺乳动物丙二酰CoA的调控与功能 被引量:3
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作者 胡洪 闻爱友 +3 位作者 白晰 戴四发 王立克 华金玲 《安徽科技学院学报》 2015年第5期1-6,共6页
丙二酰CoA不仅是脂肪酸合成的中间产物,而且对脂肪酸代谢、胰岛素分泌、机体能量消耗和采食量的调控具有重要作用。乙酰辅酶A羧化酶、丙二酰CoA脱羧酶及营养状况调控机体内丙二酰CoA的水平,而丙二酰CoA主要经由肉毒碱脂酰转移酶来调节... 丙二酰CoA不仅是脂肪酸合成的中间产物,而且对脂肪酸代谢、胰岛素分泌、机体能量消耗和采食量的调控具有重要作用。乙酰辅酶A羧化酶、丙二酰CoA脱羧酶及营养状况调控机体内丙二酰CoA的水平,而丙二酰CoA主要经由肉毒碱脂酰转移酶来调节脂肪酸代谢,进而调控胰岛素分泌,采食量等。本文主要综述了丙二酰CoA的调控与功能及其在哺乳动物的研究进展。 展开更多
关键词 哺乳动物 丙二酰coa 乙酰辅酶A羧化酶 丙二酰coa脱羧酶 CPTs
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丹参乙酰CoA酰基转移酶基因全长克隆和SNP分析 被引量:34
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作者 崔光红 王学勇 +2 位作者 冯华 赵静雪 黄璐琦 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期785-790,共6页
乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)为萜类化合物生物合成甲羟戊酸(MVA)途径的起始酶,催化使2个分子的乙酰CoA缩合为乙酰乙酰CoA。利用基因芯片结合RACE方法,从丹参毛状根中得到一个AACT基因(SmAACT,accession No.... 乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)为萜类化合物生物合成甲羟戊酸(MVA)途径的起始酶,催化使2个分子的乙酰CoA缩合为乙酰乙酰CoA。利用基因芯片结合RACE方法,从丹参毛状根中得到一个AACT基因(SmAACT,accession No.EF635969),该基因全长1623bp,含有1个1200bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码399个氨基酸,对应基因组序列含有9个内含子。序列同源性分析和分子进化分析表明SmAACT是一种与植物类异戊二烯MVA途径相关的蛋白,其表达量受到生物和非生物诱导子酵母和Ag+的诱导,并伴随丹参酮类成分积累。在丹参根、茎、叶中均有表达,根中的表达量明显高于茎和叶中的表达量。单核苷酸多态性分析表明,在第6至第9内含子约600bp范围内,SmAACT共存在33个多态位点,且表现出产地特异基因型。该基因的克隆分析为研究丹参酮类成分的次生代谢调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 丹参 乙酰coa酰基转移酶 单核苷酸多态性
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植物脂酰-CoA合成酶基因家族研究进展 被引量:3
13
作者 张士花 邹恩强 杜希华 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第3期119-123,共5页
脂酰-CoA合成酶在植物的脂肪酸代谢中有非常重要的作用.本文对长链脂酰-CoA合成酶(LACS)与一种新的脂酰-CoA合成酶(ACOS)的基因功能、酶学特性和基因家族表达调控的研究进展进行了综述.
关键词 脂肪酸代谢 脂酰-coa合成酶 LACS ACOS 4-香豆酸coa连接酶(4CL)相似基因
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酰基激酶和酰基CoA合成酶对螺旋霉素合成的影响 被引量:9
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作者 李友元 陈长华 +2 位作者 李永东 李东红 陈国豪 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期251-253,共3页
螺旋霉素链霉菌生物合成螺旋霉素的过程受许多酶的调控作用。酰基激酶和酰基 Co A合成酶是螺旋霉素内酯环合成的重要酶。实验测定了它们的酶活趋势和酶的影响因子。结果表明 ,酰基激酶和酰基 Co A合成酶都有两个活力峰 ,前者活性集中在... 螺旋霉素链霉菌生物合成螺旋霉素的过程受许多酶的调控作用。酰基激酶和酰基 Co A合成酶是螺旋霉素内酯环合成的重要酶。实验测定了它们的酶活趋势和酶的影响因子。结果表明 ,酰基激酶和酰基 Co A合成酶都有两个活力峰 ,前者活性集中在发酵中前期 ,后者活性集中在发酵中后期。实验发现 Co2 + 、Mn2 + 对酰基激酶和酰基 Co A合成酶有较强的激活作用 ,Cu2 + 对酰基激酶有抑制作用 ,但对酰基 Co A合成酶有很强的激活作用。在发酵中期向摇瓶中补加二价阳离子比在发酵初期加入有更明显的激活作用 ,平均效价最高提高了 31 % 展开更多
关键词 螺旋霉素 酰基激酶 酰基coa合成酶 影响因子 生物合成 激活作用 抗生素
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油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析 被引量:21
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作者 张琳 谭晓风 +2 位作者 胡姣 姚小华 林萍 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期108-112,共5页
在已知油茶乙酰COA酰基转移酶基因EST序列基础上,设计6条特异引物,以油茶优良无性系‘湘林1号’种仁总RNA为模板,通过反应体系和反应条件优化,最终扩增出一条700 bp左右的目的片段,将该片段回收、克隆、测序,获得718 bp的cDNA序列,将该... 在已知油茶乙酰COA酰基转移酶基因EST序列基础上,设计6条特异引物,以油茶优良无性系‘湘林1号’种仁总RNA为模板,通过反应体系和反应条件优化,最终扩增出一条700 bp左右的目的片段,将该片段回收、克隆、测序,获得718 bp的cDNA序列,将该序列与油茶乙酰COA酰基转移酶基因进行序列拼接,确定了油茶乙酰COA酰基转移酶基因的全长cDNA序列,将该序列提交至GeneBank,登录号为GU594059。油茶乙酰COA酰基转移酶基因全长cDNA序列为1 495 bp,含有一个1 227 bp的ORF,编码408个氨基酸残基。在氨基酸序列水平上,该基因与胡黄连(P.kurrooa)的乙酰COA酰基转移酶基因的相似性最高,为86%,与稻瘟病菌(M.grisea)的最低,为65%。通过在线预测,油茶乙酰COA酰基转移酶基因编码蛋白的等电点pI为6.19,分子量Mw为41 628.6 Da。本研究为揭示油茶油脂合成规律和油茶的分子育种提供了理论依据和科学基础。 展开更多
关键词 油茶 乙酰coa酰基转移酶 快速扩增CDNA末端 生物信息学分析
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油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析 被引量:8
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作者 江南 谭晓风 +3 位作者 张琳 李泽 蒋瑶 黄丽媛 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期139-147,共9页
长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LA... 长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LACS1基因全长c DNA序列,命名为CoLACS1(Gene Bank登录号:KJ960228),全长2114 bp,开放阅读框2088 bp,编码695个氨基酸;生物信息学分析显示CoLACS1具有3个B1ock,从分子特征可判断CoLACS1属于LACS家族;氨基酸同源比对显示与其他物种的LACS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与拟南芥LACS7相似性为78%,与麻风树、大豆、毛果杨等物种LACS6(peroxisomal)相似性可达80%以上;对CoLACS1进行原核表达分析,构建的p ET30a-CoLACS1载体成功转化至BL21(DE3)中经1 mmol/L IPTG诱导表达,菌液检测获得预测的目的蛋白(分子量约为76 k D);分析转录组数据中CoLACS1的Unigene序列RTKM值并对CoLACS1进行实时荧光定量PCR分析,结果表明CoLACS1在油茶华硕种子发育各时期平稳表达,表达丰度变化不大,荧光定量结果变化规律与转录组数据分析一致;同时分析华硕种仁不同时期含油率和脂肪酸成分变化,双变量统计分析发现CoLACS1表达模式与油茶油脂积累规律呈显著相关性。本研究为进一步研究油茶油脂积累与代谢的基因调控提供理论依据。 展开更多
关键词 油茶 长链脂肪酰基coa合成酶 基因表达 油脂积累
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油茶3羟酰CoA脱水酶基因的克隆与表达分析 被引量:6
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作者 王建勇 谭晓风 +3 位作者 曾艳玲 龙洪旭 陈鸿鹏 刘凯 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1574-1584,共11页
3羟酰CoA脱水酶是一类催化3羟酰CoA脱水转化成为烯酰CoA形式的酶。本研究以国审油茶品种‘华硕’种子为材料,在已构建的转录组和表达谱数据库的基础之上,采用RACE技术,克隆到一个油茶3羟酰CoA脱水酶基因的cDNA全长,命名为CoHCD(Gen... 3羟酰CoA脱水酶是一类催化3羟酰CoA脱水转化成为烯酰CoA形式的酶。本研究以国审油茶品种‘华硕’种子为材料,在已构建的转录组和表达谱数据库的基础之上,采用RACE技术,克隆到一个油茶3羟酰CoA脱水酶基因的cDNA全长,命名为CoHCD(GenBank,登录号KJ910336)。该基因cDNA全长为1145bp,含有666bp的开放读码框,编码221个氨基酸,分子量为25.2kDa,理论等电点pI为9.4,疏水残基占整个氨基酸残基的48.9%,是亲水性蛋白,具有4个比较明显的跨膜区和蛋白质酪氨酸磷酸酶基序“HGXXGXXRS”。在基因cDNA全长序列的基础上,分别成功地构建了原核表达载体、超表达载体和RNA干扰载体,其中,原核表达载体在宿主细胞BL21(DE3)上成功诱导表达,获得表观分子量约为25kDa的相应目的蛋白。实时荧光定量PCR分析表明,在5个不同发育时期的油茶种子中CoHCD高效表达主要集中在8~10月,转录最高峰发生在9月,其表达量在种子发育过程中呈增加趋势。 展开更多
关键词 油茶 3羟酰coa脱水酶 克隆 表达分析
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油茶丙二酰单酰CoA:ACP转酰基酶基因的克隆与原核表达 被引量:5
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作者 王建勇 谭晓风 +4 位作者 陈鸿鹏 曾艳玲 龙洪旭 梅芳芳 刘凯 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期148-154,共7页
【目的】油茶种仁含油率较低且易遭逆性环境等的影响,这些都严重影响和制约了油茶产业的快速发展。丙二酰单酰Co A:ACP转酰酶是脂肪酸合成酶(FASⅡ)复合体的组成酶之一,在脂肪酸合成中起着装载作用,它的酶促反应产物丙二酰单酰ACP是脂... 【目的】油茶种仁含油率较低且易遭逆性环境等的影响,这些都严重影响和制约了油茶产业的快速发展。丙二酰单酰Co A:ACP转酰酶是脂肪酸合成酶(FASⅡ)复合体的组成酶之一,在脂肪酸合成中起着装载作用,它的酶促反应产物丙二酰单酰ACP是脂肪酸合成关键组成部分。开展该基因的功能研究,能为油茶的分子遗传育种奠定基础。【方法】以油茶品种‘华硕’种子为材料,借助其种子转录组和表达谱数据库,通过RACE技术,克隆丙二酰单酰Co A:ACP转酰酶基因并对该基因进行生物信息学分析。利用常规的酶切连接技术构建基因的原核表达载体,并利用α酮戊二酸脱氢酶(KDH)偶联系统测定表达产物的酶活性。【结果】丙二酰单酰Co A:ACP转酰酶基因的全长c DNA 1 867 bp,含有1 131 bp的开放读码框,编码376个氨基酸,具有58个氨基酸长度的叶绿体转运肽,该基因被命名为Co MCAT(Gen Bank登录号KJ910337)。在malonyl-Co A结合位点和ACP结合位点上分别存在高度保守的基序"GQGXQ"和"GXSXG"。原核表达载体p ET30a-Co MCAT在BL21(DE3)细胞中被成功地诱导表达,目的重组蛋白分子量约为40 k Da。酶活性分析表明,重组蛋白Co MCAT的最佳催化温度为30℃,最佳p H为7.0,比酶活性约为2.384 U·μg-1。【结论】以本实验室构建的油茶转录组数据库为基础,首次克隆获得油茶MCAT基因的全长c DNA序列,构建其原核表达载体在宿主细胞BL21(DE3)中成功诱导表达目的蛋白,并对重组蛋白进行初步的酶活性分析。研究结果为今后进一步深入开展和揭示油茶MCAT基因在油脂合成的代谢过程中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 油茶 丙二酰单酰coa:ACP转酰酶 基因克隆 原核表达 酶活性
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瘦素及硬脂酰CoA去饱和酶-1在高脂饮食大鼠非酒精性脂肪肝发病中的作用 被引量:9
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作者 陆元善 范建高 +2 位作者 方继伟 丁晓东 杨兆瑞 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第19期2327-2331,共5页
目的:研究瘦素及SCD-1在高脂饮食引起非酒精性脂肪肝形成及其药物治疗中的作用.方法:42只SD大鼠分成正常组、高脂组和干预组(自高脂饮食喂养8 wk起用罗格列酮进行干预16 wk).酶联免疫法测定血清瘦素,RT-PCR实时荧光分析大鼠肝 SCD-1 m... 目的:研究瘦素及SCD-1在高脂饮食引起非酒精性脂肪肝形成及其药物治疗中的作用.方法:42只SD大鼠分成正常组、高脂组和干预组(自高脂饮食喂养8 wk起用罗格列酮进行干预16 wk).酶联免疫法测定血清瘦素,RT-PCR实时荧光分析大鼠肝 SCD-1 mRNA与β-actin mRNA的比值.结果:肝组织HE染色显示高脂组大鼠肝脏内有弥漫性肝细胞脂肪变性,8 wk达到脂肪肝诊断标准.8,24 wk高脂组大鼠血清瘦素水平升高,与正常组相比有显著性差异(8 wk:5.29±1.83 μg/L vs 3.06±1.35 μg/L, P<0.05;24 wk:7.89±3.01 μg/L vs 3.09±1.52 μg/L, P<0.05);肝SCD-1 mRNA与β-actin mRNA的比值明显下降(8 wk:0.37±0.25 vs 0.82±0.34,P<0.05).干预组与高脂组相比,血清瘦素水平下降(5.95±3.31 μg/L vs 7.89±3.01 g/L,P>0.05);肝SCD-1 mRNA表达明显增强(SCD-1/β-actin:1.02±0.11 vs 0.52±0.22,P<0.01).结论:长期高脂饮食可导致血清瘦素水平升高,其通过下调肝SCD-1表达促进非酒精性脂肪肝的形成.罗格列酮可降低血清瘦素水平,上调肝SCD-1的表达,减轻因高脂饮食引起的非酒精性肝脂肪变. 展开更多
关键词 高脂饮食 非酒精性脂肪肝 罗格列酮 瘦素 硬脂酰coa去饱和酶-l
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甘蓝型油菜烯脂酰-CoA还原酶基因BnECR的克隆及功能分析 被引量:3
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作者 倪郁 张飞萃 +4 位作者 王亚超 蒲飞 王瑞 柴友荣 李加纳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期424-432,共9页
反式烯脂酰-CoA还原酶(trans-2,3-enoyl-CoA reductase,ECR)是催化超长链脂肪酸(VLCFAs)合成的脂肪酰-CoA延长酶之一。根据已报道拟南芥ECR基因设计引物,采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)方法从甘蓝型油菜中克隆ECR的全长cDN... 反式烯脂酰-CoA还原酶(trans-2,3-enoyl-CoA reductase,ECR)是催化超长链脂肪酸(VLCFAs)合成的脂肪酰-CoA延长酶之一。根据已报道拟南芥ECR基因设计引物,采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)方法从甘蓝型油菜中克隆ECR的全长cDNA序列和对应的基因组序列,命名为BnECR(GenBank登录号分别为FJ899705和FJ899706)。序列分析结果显示,BnECR的全长cDNA序列为1328bp,对应的基因组序列为2093bp,由4个外显子组成,在ORF的上、下游分别有一个163bp的5′UTR和一个232bp的3′UTR。根据编码区预测BnECR前体蛋白为一个310个氨基酸残基的多肽链,包含ECR蛋白的重要功能位点K144、R145及一个NAD(P)H结合基序G225SGGYQIPR/HG234。NCBIBlastn、氨基酸序列多重比对及保守域分析表明,该基因与拟南芥AtECR基因的同源性最高,是对应拟南芥AtECR的垂直同源基因。RT-PCR分析表明,BnECR基因在甘蓝型油菜根、茎、叶、花及角果中均有表达,其中在茎中的表达量最高。BnECR在高芥酸材料种子发育中后期的表达量显著高于低芥酸种子,表明BnECR可能参与甘蓝型油菜芥酸的合成。将BnECR克隆到酿酒酵母的穿梭表达载体中,分别转化野生型酵母By4743和突变体菌株YDL015c,添加半乳糖诱导表达。气相色谱分析表明,BnECR在酿酒酵母中有效表达,转化菌株中的芥酸(C22:1)占总脂肪酸含量的1.34%,比对照增加52%;对突变体的转化结果表明芥酸含量恢复到野生型水平。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 烯脂酰coa还原酶 克隆 芥酸 酿酒酵母
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