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青枯菌GMI 1000菌株c-di-GMP代谢酶调控基因vsrD功能研究
1
作者 杨晓欣 许景升 +3 位作者 徐进 韩文超 李志明 冯洁 《植物保护》 北大核心 2025年第3期102-112,共11页
青枯菌Ralstonia solanacearum是全球作物生产中的一种重要病原细菌。由青枯菌引起的植物细菌性枯萎病(简称青枯病)危害数百种经济作物并造成严重经济损失。环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的第二信使分... 青枯菌Ralstonia solanacearum是全球作物生产中的一种重要病原细菌。由青枯菌引起的植物细菌性枯萎病(简称青枯病)危害数百种经济作物并造成严重经济损失。环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的第二信使分子,通过调控生物膜形成、运动性等影响病原菌致病力。但在青枯菌中,c-di-GMP的调控网络并不清楚。本试验以青枯菌GMI 1000中的c-di-GMP降解酶基因gedrG缺失突变体菌株(ΔgedrG-GMI)为研究对象,将pMiniHimarI RB1质粒通过双亲共结合法导入ΔgedrG-GMI突变体,筛选运动性表型恢复的转座子插入突变体(transposon mutagenesis),共鉴定了13272株转座子插入突变体。其中,转座子插入vsrD基因时,ΔgedrG-GMI运动性恢复为野生型水平。分析表明vsrD基因缺失后,突变株运动性极显著增强,胞内c-di-GMP水平降低,致病力丧失,vsrD基因互补菌株运动性恢复至缺失前水平。以上结果表明,vsrD参与了青枯菌GMI 1000中c-di-GMP调控通路,影响GMI 1000运动性,且与致病性密切相关。 展开更多
关键词 青枯菌 c-DI-gmp 致病力 运动性 调控
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汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3中第二信使c-di-GMP相关结构域蛋白质的生物信息学分析
2
作者 杨承 庄梓涵 +3 位作者 吴昊基 陈炫 雷虹 李元敬 《黑龙江大学自然科学学报》 2025年第1期81-89,共9页
为探究汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3所包含的GGDEF结构域对合成环二鸟苷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的作用,挖掘c-di-GMP对该菌种产细菌纤维素(Bacterial cellulose,BC)的作用,采用... 为探究汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3所包含的GGDEF结构域对合成环二鸟苷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的作用,挖掘c-di-GMP对该菌种产细菌纤维素(Bacterial cellulose,BC)的作用,采用生物信息学方法系统分析了K.hansenii HDM1-3菌株的基因组,发现K.hansenii HDM1-3菌株中共有8个基因含有GGDEF-EAL结构域。利用Hmmer软件、Pfam数据库、SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)平台、MEME Suite平台、MEGA11(Molecular Evolutionary Genetics Analysis 11)软件、ClustalW平台、Swiss-model平台、NCBI(National Center for Biotechnology Information)平台、InterPro平台及BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)平台对该菌株所含有GGDEF-EAL结构域的功能进行了分析,并深入探究了该结构域对细菌纤维素产量的影响。功能预测分析表明,K.hansenii HDM1-3中含有GGDEF-EAL结构域的8个基因均参与c-di-GMP的合成、降解及信号传导。 展开更多
关键词 汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3 c-DI-gmp 生物信息学 GGDEF-EAL结构域
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外源性C-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响 被引量：3
3
作者 闫文娟 吴补领 +4 位作者 屈铁军 高杰 赵红萍 苏凌云 余擎 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期510-512,共3页
目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产... 目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产酸、耐酸能力明显下降,差异有统计学意义,经t检验,P<0.05。结论:c-di-GMP可以抑制变形链球菌的产酸、耐酸能力,可以单独也可以与其它的抗龋制剂联合应用控制龋病。 展开更多
关键词 c—dj—gmp 变形链球菌 产酸 耐酸
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病原细菌受体介导的c-di-GMP信号传导及其调控机制 被引量：3
4
作者 杨凤环 田芳 +1 位作者 陈华民 何晨阳 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期9-14,共6页
细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白... 细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白、退化的GGDEF和EAL结构域蛋白、核糖体开关、多核苷酸磷酸化酶和新发现的蛋白激酶等。c-di-GMP受体接受信号后,可以在转录、翻译以及翻译后水平上对下游靶标进行调控,从而影响细菌的毒性、运动性、生物膜形成、细胞分裂等生理生化过程。本文结合本实验室对水稻白叶枯病菌的研究结果,综述了近年来国内外在c-di-GMP信号受体介导的调控机制等方面的研究进展。 展开更多
关键词 c-DI-gmp 信号代谢 受体 传导 调控
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Biofilm与c-di-GMP专刊序言--微生物的社会性、c-di-GMP调控及研究新技术 被引量：2
5
作者 钱韦 马旅雁 +1 位作者 谷立川 张炼辉 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1351-1356,共6页
生物被膜(Biofilm)是微生物生存的主要形式。它是一种或多种微生物通过胞外多糖、胞外DNA、蛋白质等组成的基质聚集在一起形成的细胞多聚体。生物被膜中的微生物细胞之间存在密切的信号通讯,并且表现出与浮游生活时完全不同的生理代谢特... 生物被膜(Biofilm)是微生物生存的主要形式。它是一种或多种微生物通过胞外多糖、胞外DNA、蛋白质等组成的基质聚集在一起形成的细胞多聚体。生物被膜中的微生物细胞之间存在密切的信号通讯,并且表现出与浮游生活时完全不同的生理代谢特征,其发育过程受到环二鸟苷单磷酸(c-di-GMP)等细胞第二信使的控制。由于生物被膜在基础生命科学和医疗、工业、农业、环境治理等应用科学中的重要性,相关研究是微生物学领域的前沿之一。本期专刊从生物工程、研究技术、感染与免疫、环境生物学和植物病理学等角度,较系统地对生物被膜的形成机制、调控分子机理、理化特性和应用技术等进行了综述或研究,展示了我国在本领域的研究水平,同时也对本领域未来发展趋势进行了有益的讨论。 展开更多
关键词 生物被膜 环二乌苷单磷酸 调控机制 新技术
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)作为潜在免疫佐剂的研究进展 被引量：1
6
作者 丛晓燕 时建立 +6 位作者 孙文博 李俊 杜以军 吴家强 陈蕾 陈智 王金宝 《中国兽药杂志》 2014年第2期59-62,共4页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本文综述了c-di-GMP的结构,生物学功能、免疫特性和作为疫苗佐剂研究等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 疫苗 佐剂 免疫
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老年高血压病患者血vWF、GMP-140、CRP含量的研究 被引量：8
7
作者 李轶男 史瑞英 +1 位作者 袁洪 张梦玺 《心血管康复医学杂志》 CAS 2001年第1期24-26,共3页
目的 :研究老年高血压病 (EH)患者的血管内皮细胞损伤、血小板活化和炎症因子改变。方法 :选择 31例 、 期 EH患者和 2 8例老年正常对照者 ,测定其血浆 v WF因子、α颗粒膜蛋白 - 140 (GMP- 140 )和血清 C反应蛋白 (CRP)含量。结果 :E... 目的 :研究老年高血压病 (EH)患者的血管内皮细胞损伤、血小板活化和炎症因子改变。方法 :选择 31例 、 期 EH患者和 2 8例老年正常对照者 ,测定其血浆 v WF因子、α颗粒膜蛋白 - 140 (GMP- 140 )和血清 C反应蛋白 (CRP)含量。结果 :EH组患者血浆 v WF、GMP- 140含量明显高于对照组 ;EH组血浆 v WF含量与收缩压呈正相关。结论 : 、 期老年 EH患者有明显的内皮细胞损伤和血小板活化 ,血管内皮细胞损伤与收缩压呈正相关。 展开更多
关键词 老年人 高血压病 Von WILLEBRAND因子 VWF Α颗粒膜蛋白-140 gmp c反应蛋白 cRP
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氯吡格雷对不稳定心绞痛患者血清CRP及GMP-140的影响 被引量：2
8
作者 齐晓云 马丽娟 +1 位作者 徐崇泽 徐萍 《沈阳医学院学报》 2006年第1期13-15,共3页
目的:检测不稳定心绞痛(UA)患者血清CRP(C-反应蛋白),GMP-140(血小板α颗粒膜蛋白-140)的浓度及氯吡格雷对其影响和临床疗效。方法:59例UA患者随机分为常规治疗组29例,氯吡格雷组(在常规治疗基础上加用氯吡格雷首次顿服300 mg,次日起75 ... 目的:检测不稳定心绞痛(UA)患者血清CRP(C-反应蛋白),GMP-140(血小板α颗粒膜蛋白-140)的浓度及氯吡格雷对其影响和临床疗效。方法:59例UA患者随机分为常规治疗组29例,氯吡格雷组(在常规治疗基础上加用氯吡格雷首次顿服300 mg,次日起75 mg/d,连服2周)30例,另选正常对照组(无任何治疗)20例。测定59例UA患者治疗前后及20例正常对照者血清CRP,GMP-140浓度。结果:氯吡格雷组临床总有效率(93.3%)优于常规治疗组(72.4%)(P<0.05)。UA患者血清CRP,GMP-140浓度显著高于正常对照组(P<0.01)。治疗后氯吡格雷组和常规治疗组血清CRP,GMP-140浓度均显著下降(P<0.01),且氯吡格雷组下降水平优于常规治疗组(P<0.01)。结论:氯吡格雷可降低UA患者血清CRP,GMP-140浓度,有利于减轻炎症反应,稳定斑块。 展开更多
关键词 心绞痛 不稳定 氯吡格雷 c-反应蛋白 血小板Α颗粒膜蛋白-140
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ToxR负调控副溶血弧菌中c-di-GMP的合成
9
作者 张苗苗 薛星帆 +6 位作者 孙君芳 吴齐敏 李雪 周冬生 倪斌 陆仁飞 张义全 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期4719-4730,共12页
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是世界范围内引起海产品相关食物中毒的主要致病菌,具有很强的生物膜形成能力。ToxR是一种膜结合调控蛋白,对副溶血弧菌生物膜形成具有一定的调控作用,但具体机制尚未见报道。c-di-GMP是一种普遍存... 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是世界范围内引起海产品相关食物中毒的主要致病菌,具有很强的生物膜形成能力。ToxR是一种膜结合调控蛋白,对副溶血弧菌生物膜形成具有一定的调控作用,但具体机制尚未见报道。c-di-GMP是一种普遍存在于细菌中重要的第二信使,参与调控细菌的多种生物学行为包括生物膜的形成。本文探究ToxR对副溶血弧菌中c-di-GMP代谢的调控作用。利用酶联免疫吸附法(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)测定副溶血弧菌野生株(wild-type,WT)和toxR突变株(ΔtoxR)中c-di-GMP水平的差异。挑选c-di-GMP代谢相关基因scrA、scrG和vpa0198为进一步研究的靶标,采用实时定量qPCR实验检测靶基因在WT和ΔtoxR中的转录水平差异;将靶基因调控区DNA序列克隆入pHRP309质粒中无启动子的β半乳糖苷酶基因上游,采用lacZ报告基因融合实验进一步研究ToxR对靶基因的转录调控关系;将重组质粒分别导入含有pBAD33或pBAD33-toxR的EC100λpir中,采用lacZ报告基因融合实验研究ToxR是否能在异体宿主中调控靶基因的表达;PCR扩增靶基因上游调控区DNA序列,并纯化His-ToxR蛋白,用凝胶阻滞实验(electrophoresis mobility shift assay,EMSA)研究His-ToxR与靶基因启动子区DNA序列是否具有结合作用。ELISA结果显示ΔtoxR中c-di-GMP含量显著性高于WT中的,说明ToxR抑制c-di-GMP的产生;实时定量qPCR结果表明WT中scrA、scrG和vpa0198的转录水平显著性高于ΔtoxR中的,表明ToxR抑制它们的转录;lacZ报告基因融合实验结果表明ToxR可抑制副溶血弧菌和EC100λpir中scrA、scrG和vpa0198的启动子区活性;EMSA实验显示His-ToxR能特异性地结合到scrA和scrG的上游调控区DNA序列上,而对vpa0198的上游调控区DNA序列无结合作用。综上所述,ToxR通过直接调控相关酶蛋白基因的转录来抑制副溶血弧菌内c-di-GMP的合成,从而有助于精确调控生物膜形成等细菌行为。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 转录调控 ToxR c-DI-gmp
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2型糖尿病患者GMP-140,PC,Fbg和D-D含量检测的临床意义
10
作者 张新华 江强 +3 位作者 李爱群 何世安 朱凌 周天红 《血栓与止血学》 1999年第4期160-162,共3页
目的:探讨2型糖尿病患者检测血小板α-颗粒膜蛋白(GMP-140)。蛋白C(PC),纤维蛋白原(Fbg)和 D二聚体(D-D)含量的临床意义。方法:用 ELISA法和免疫比浊法分别检测,GMP-140、PC、Fbg和D-D含量结果:2型糖尿病患者GMP-140、Fbg和D-D含量明显... 目的:探讨2型糖尿病患者检测血小板α-颗粒膜蛋白(GMP-140)。蛋白C(PC),纤维蛋白原(Fbg)和 D二聚体(D-D)含量的临床意义。方法:用 ELISA法和免疫比浊法分别检测,GMP-140、PC、Fbg和D-D含量结果:2型糖尿病患者GMP-140、Fbg和D-D含量明显高于健康年轻人组,而PC明显低于健康年轻人组,与脑梗死患者相同除D-D外,GMP-140、PC和Fbg与健康老年人组比较无显著性差异。结论:糖尿病的治疗应在控制血糖的同时结予抗凝和改善血液循环的治疗,以预防血栓形成。 展开更多
关键词 2型糖尿病 血小板颗粒膜蛋白 蛋白c 纤维蛋白原 D二聚体
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DN患者血清Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140检测的临床意义 被引量：2
11
作者 史秀岩 肖厚勤 朱忠华 《放射免疫学杂志》 CAS 2012年第3期249-251,共3页
目的:探讨糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)患者血清Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140水平的变化及临床意义。方法:应用放射免疫分析、胶乳增强免疫比浊法和生化法对32例DN患者进行了Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140的检测,并与35名正常... 目的:探讨糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)患者血清Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140水平的变化及临床意义。方法:应用放射免疫分析、胶乳增强免疫比浊法和生化法对32例DN患者进行了Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140的检测,并与35名正常健康人作比较。结果:DN患者血清Cys-C和尿液Alb及血小板GMP-140水平均非常显著地高于正常人组(P<0.01),且血清Cys-C水平与尿mAlb、血小板GMP-140水平呈显著正相关(r=0.5642、0.6038,P<0.01)。结论:检测DN患者血清Cys-C、尿mAlb和血小板GMP-140水平的变化对了解病情、观察疗效和预后判断均有重要的临床价值。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 胱抑素c 尿微量白蛋白 血小板gmp-140
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c-di-GMP对细菌胞外多糖合成与运输的调控 被引量：8
12
作者 赵腊梅 孙惠芳 +2 位作者 刘正杰 林春 毛自朝 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1196-1205,共10页
环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)的发现已有29年。作为重要的细菌第二信使,c-di-GMP可参与调节细菌生物膜的合成与降解、运动、毒性、细胞周期、细胞分化等多种活动过程。胞外多糖(EPS)是细菌生物膜的主要组成成分,其合成和运... 环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)的发现已有29年。作为重要的细菌第二信使,c-di-GMP可参与调节细菌生物膜的合成与降解、运动、毒性、细胞周期、细胞分化等多种活动过程。胞外多糖(EPS)是细菌生物膜的主要组成成分,其合成和运输主要受c-di-GMP调控。目前细菌胞外多糖在医药、食品、农业、工业和环保等多个领域均有广泛的应用,其相关研究备受关注。本文旨在论述细菌中c-di-GMP合成与降解的调控,部分合成酶(Diguanylate cyclase,DGC)与降解酶(Phosphodiesterase,PDE)及其受体分子(Receptor)晶体结构等研究成果,并结合我们研究农杆菌ATCC31749中c-di-GMP对可德胶合成调控的基础上,重点阐述c-di-GMP对纤维素、藻酸盐、多聚氮乙酰葡萄糖胺(PNAG)和可德胶等EPS合成与运输的调控机制。 展开更多
关键词 细菌 环二鸟苷酸 胞外多糖 调控 生物合成
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美罗培南对胞内不同c-di-GMP浓度表型铜绿假单胞菌生物被膜形成的影响 被引量：5
13
作者 谢杰鹏 孔晋亮 +4 位作者 陈一强 王可 罗劲 张真强 刘冬梅 《广西医科大学学报》 CAS 2020年第6期1001-1006,共6页
目的:探究美罗培南对胞内不同环二鸟苷酸(c-di-GMP)浓度表型铜绿假单胞菌(PA)生物被膜形成的影响。方法:两倍稀释法测定美罗培南对各菌株的抑菌浓度(MIC);设阴性对照组和3个美罗培南干预组(1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC)。用1/2MIC、1/4MIC、... 目的:探究美罗培南对胞内不同环二鸟苷酸(c-di-GMP)浓度表型铜绿假单胞菌(PA)生物被膜形成的影响。方法:两倍稀释法测定美罗培南对各菌株的抑菌浓度(MIC);设阴性对照组和3个美罗培南干预组(1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC)。用1/2MIC、1/4MIC、1/8MIC的美罗培南分别干预野生株PAO1、PA胞内c-di-GMP高表达株(PAO1ΔwspF)、PA胞内c-di-GMP低表达株(PAO1/Plac-yhjH),观察美罗培南对其运动能力的影响,用结晶紫染色法测定美罗培南对PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH菌株的生物被膜形成以及对生物被膜清除能力的影响。结果:在美罗培南的干预下,PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的运动区域直径均比阴性对照组小(P<0.05),所形成的的生物被膜也均比阴性对照组少(P<0. 05),而破坏的生物被膜均比阴性对照组多(P<0. 05)。结论:美罗培南能抑制PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的运动能力以及生物被膜形成,美罗培南能破坏PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH形成的生物被膜,美罗培南对PAO1、PAO1ΔwspF、PAO1/Plac-yhjH的抑制效果不同。 展开更多
关键词 美罗培南 c-DI-gmp 铜绿假单胞菌 生物被膜
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水稻白叶枯病菌第二信使c-di-GMP代谢酶基因的预测和分析 被引量：3
14
作者 薛丁榕 田芳 +3 位作者 李海云 杨凤环 陈华民 何晨阳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期131-138,共8页
旨在从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)中鉴定出含有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶(DGC)和含有EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶(PDE)编码基因。预测分析了Xoo已测序菌株中的GGDEF、EAL和HD-GYP结构域蛋白的种类、数量及... 旨在从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)中鉴定出含有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶(DGC)和含有EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶(PDE)编码基因。预测分析了Xoo已测序菌株中的GGDEF、EAL和HD-GYP结构域蛋白的种类、数量及其序列特征,鉴别了基序保守的DGC或PDE、基序退化的信号受体以及信号输入结构域,验证了部分不同类型结构域蛋白作为DGC/PDE、信号受体以及在细菌毒性调控等方面的功能。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 c-di-gmp信号途径 鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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c-GMP诱导对盐胁迫下番茄的转录组分析 被引量：3
15
作者 朱晓林 魏小红 +2 位作者 王宝强 王贤 张明君 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第10期1788-1797,共10页
以市场常见的番茄为材料,采用Illumina高通量测序技术对NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下番茄幼苗进行转录组测序。结果表明:共获得83.35 Gb的原始数据,Q30碱基百分比在90.91%及以上,分别将各样品的原始读数与指定的参考基因组进... 以市场常见的番茄为材料,采用Illumina高通量测序技术对NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下番茄幼苗进行转录组测序。结果表明:共获得83.35 Gb的原始数据,Q30碱基百分比在90.91%及以上,分别将各样品的原始读数与指定的参考基因组进行序列比对,比对效率从88.03%到92.74%不等。同时将得到的31734条序列注释到不同的数据库(GO、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot和egg NOG),通过GO数据库,将其划分到细胞组分、分子功能以及生物学过程三大注释类别下的51个亚功能组中,通过COG数据库与KEGG数据库将其分别注释到25个类别与128个代谢通路。在NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下共发现SNP位点127944个,其中仅有22.6%的SNP位点位于非编码区。差异基因结果显示,c-GMP能诱导盐胁迫下更多基因的表达。该转录组测序数据可靠,结果覆盖面广,为番茄c-GMP诱导盐胁迫下基因挖掘与功能研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 番茄 盐胁迫 c-gmp诱导 转录组分析
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)在微生物体内的作用及其类似物的研究 被引量：5
16
作者 那路新 杨振军 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期307-312,258,共6页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)调控,DGC和PDE共处于同一个蛋白中,是一个双功能蛋白酶的两个区域,分别负责菌体内c-di-GMP的合成和降解。c-di-GMP作用菌体内下游靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型。目前发现c-di-GMP核开关是唯一不参与代谢活动而参与信号传导的一类核开关。本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机制、生物学功能,以及c-di-GMP结构类似物合成及生物学评价等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 c-DI-gmp 细菌信号传导 代谢酶 GEMM核开关
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铜绿假单胞菌PAO1中c-di-GMP代谢相关基因PA0575对表型的影响 被引量：3
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作者 詹学良 姚严翔 +2 位作者 芦晓红 郭嘉义 黄卫东 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1927-1934,共8页
【背景】铜绿假单胞菌PAO1中存在与环鸟苷二磷酸(cyclic-di-guanosine monophosphate,c-di-GMP)代谢相关基因PA0575。【目的】探讨铜绿假单胞菌PAO1中环鸟苷二磷酸代谢相关基因PA0575对运动能力及生物膜的影响。【方法】通过PCR对菌株... 【背景】铜绿假单胞菌PAO1中存在与环鸟苷二磷酸(cyclic-di-guanosine monophosphate,c-di-GMP)代谢相关基因PA0575。【目的】探讨铜绿假单胞菌PAO1中环鸟苷二磷酸代谢相关基因PA0575对运动能力及生物膜的影响。【方法】通过PCR对菌株遗传背景进行确认;利用刚果红结合实验及电转PcdrA-gfp质粒间接测量胞内c-di-GMP水平;利用泳动性(swimming)、蜂群泳动(swarming)、蹭行运动(twiching)和生物膜定量实验对细菌进行表型分析,并在运动培养基中添加抗生素研究其对运动能力的影响;针对PA0575基因进行融合蛋白表达载体的构建,并对蛋白进行原核诱导表达。【结果】3株突变体菌株的转座子插入突变位点不一致,胞内c-di-GMP水平检测结果显示,PA0575-1菌株的c-di-GMP含量高于野生型PAO1菌株(P<0.05),PA0575-2、PA0575-3菌株胞内c-di-GMP水平与野生型PAO1菌株无差异(P>0.05)。运动能力检测实验中,与野生型PAO1菌株相比,PA0575-1菌株泳动性增强(P<0.05);PA0575-2、PA0575-3菌株的泳动性、蜂群运动均增强(P<0.05);该基因不同位点的突变均导致氯霉素对菌株的运动能力产生抑制作用。生物膜定量结果显示,与野生型PAO1菌株相比,细菌培养18 h后PA0575-1的生物膜含量降低(P<0.05),PA0575-2、PA0575-3菌株的生物膜含量升高。最后成功构建了PA0575基因不同结构域的8个表达载体,并获得了异源表达蛋白。【结论】PA0575基因降低铜绿假单胞菌胞内c-di-GMP的水平,影响表型的同时也抑制了氯霉素抗性基因的表达。以上研究为PA0575基因对表型的影响奠定了基础。 展开更多
关键词 GGDEF/EAL结构域 PA0575转座子突变体 铜绿假单胞菌PAO1 环鸟苷二磷酸
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西瓜噬酸菌中C-di-GMP代谢相关基因Aave2620的功能研究 被引量：4
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作者 郭彦彤 张美玉 +3 位作者 田二渊 杨玉文 关巍 赵廷昌 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期30-40,共11页
环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于植物病原细菌中的第二信使,调控细菌多种生物学功能,从而影响病原细菌的致病性,但其在西瓜噬酸菌中的研究还未见报道。本实验以Aac5菌株为研究对象,通过构建c-di-GMP代谢相... 环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于植物病原细菌中的第二信使,调控细菌多种生物学功能,从而影响病原细菌的致病性,但其在西瓜噬酸菌中的研究还未见报道。本实验以Aac5菌株为研究对象,通过构建c-di-GMP代谢相关基因Aave_2620缺失突变株和互补菌株,从其致病能力及其生长能力两部分进行测定,探究此信号途径是否在西瓜噬酸菌中调控致病机制。结果表明,基因Aave_2620的缺失显著降低Aac5菌株致病力、生物膜形成能力和生长能力,减弱烟草过敏性反应以及运动能力,互补菌株表型基本得到恢复。基因Aave_2620的缺失显著影响三型分泌系统相关基因、毒性相关基因以及鞭毛及趋化性相关基因在西瓜噬酸菌中的表达量。以上结果表明c-di-GMP代谢相关基因Aave_2620与西瓜噬酸菌的致病密切相关。 展开更多
关键词 西瓜噬酸菌 c-DI-gmp 功能研究
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水稻白叶枯病菌c-di-GMP受体Clpxoo关键结合功能位点的确定 被引量：1
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作者 李建宇 李波 +3 位作者 陈华民 杨凤环 何晨阳 田芳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期124-129,共6页
旨在确定水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体Clpxoo的关键功能位点。通过对Clpxoo蛋白氨基酸位点基因突变,表达载体构建、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进行了Clpxoo及其点突变蛋白的原核表达... 旨在确定水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体Clpxoo的关键功能位点。通过对Clpxoo蛋白氨基酸位点基因突变,表达载体构建、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进行了Clpxoo及其点突变蛋白的原核表达和产物纯化;通过等温滴定量热法(ITC),检测了Clpxoo及其点突变蛋白与c-di-GMP的结合作用。利用基因定点突变和桥接PCR方法,在优化的诱导表达和纯化条件下,成功地获得了Clpxoo点突变蛋白和与c-di-GMP不发生结合的Clpxoo点突变体。结果表明,Clpxoo蛋白第70位天冬氨酸和第99位谷氨酸是与c-di-GMP结合的关键功能位点。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 c-DI-gmp 信号受体蛋白 点突变体 结合作用
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c-di-GMP的磷酸二酯酶PA4781在抗菌肽Merecidin抑制铜绿假单胞菌生物被膜中的作用 被引量：7
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作者 王雅蓉 朱明星 +3 位作者 张帆 杨婷婷 贾琴琴 王秀青 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期868-879,共12页
【背景】抗菌肽Merecidin可抑制临床菌株铜绿假单胞菌PA03生物被膜。PA4781基因是课题组通过生物信息学分析筛选出的差异表达基因,PA4781作为细菌第二信使分子环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)的磷酸二酯酶具有降解c-di-GMP的作... 【背景】抗菌肽Merecidin可抑制临床菌株铜绿假单胞菌PA03生物被膜。PA4781基因是课题组通过生物信息学分析筛选出的差异表达基因,PA4781作为细菌第二信使分子环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)的磷酸二酯酶具有降解c-di-GMP的作用,其在抗菌肽Merecidin抑制生物被膜中的作用机制尚不清楚。【目的】研究细菌第二信使分子c-di-GMP的磷酸二酯酶PA4781基因在抗菌肽Merecidin抑制铜绿假单胞菌生物被膜中的作用。【方法】利用单碱基突变技术敲除PA4781基因,Sanger测序方法检测敲除的正确性。采用结晶紫染色法观察PA03菌株、PA4781过表达菌株、PA4781敲除菌株24 h生物被膜生长情况,以及在抗菌肽Merecidin 24、48、72μmol/L作用下各菌株生物被膜的生长情况。采用对羟基联苯溶液显色法检测在抗菌肽Merecidin 48、72μmol/L作用下,PA03菌株、PA4781过表达菌株、PA4781敲除菌株生物被膜藻酸盐的变化情况。【结果】Sanger测序结果显示,用pnCasPABEC系统成功实现了靶点位置的单碱基突变,提前终止了PA4781的转录;结晶紫染色结果显示,培养24 h时,在24μmol/L抗菌肽Merecidin作用下PA03菌株、PA4781过表达菌株、PA4781敲除菌株生物被膜形成情况无显著性差异(P>0.05),在抗菌肽Merecidin 48、72μmol/L处理下,过表达株与正常株和敲除株有显著性差异(P<0.05),生物被膜明显减少,敲除株生物被膜厚度高于PA03组(P<0.05)。随着抗菌肽Merecidin浓度升高各组藻酸盐含量下降,其中过表达菌株在抗菌肽Merecidin作用下藻酸盐生成量抑制率最高,可达65%。【结论】抗菌肽Merecidin能够促进细菌第二信使分子磷酸二酯酶PA4781的表达,为抗菌肽Merecidin抑制铜绿假单胞菌生物被膜的作用机制可能通过细菌第二信使分子这一信号途径提供新的研究思路。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 生物被膜 抗菌肽Merecidin 环二鸟苷酸 单碱基突变
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