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红掌两个bZIPs基因片段的克隆与低温响应特性分析 被引量:1
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作者 彭英 杜凤凤 +2 位作者 田丹青 潘晓韵 刘晓静 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期622-626,共5页
本研究以红掌‘Alabama’幼苗为材料,克隆了2个b ZIP转录因子基因Aab ZIP1和Aab ZIP2。Aab ZIP1片段长度462 bp,Aab ZIP2片段长度为369 bp,两基因核苷酸序列的相似度为46.97%,推定的氨基酸序列相似性为31.17%。Blastx发现两个基因均具... 本研究以红掌‘Alabama’幼苗为材料,克隆了2个b ZIP转录因子基因Aab ZIP1和Aab ZIP2。Aab ZIP1片段长度462 bp,Aab ZIP2片段长度为369 bp,两基因核苷酸序列的相似度为46.97%,推定的氨基酸序列相似性为31.17%。Blastx发现两个基因均具有亮氨酸拉链的保守结构域,具备b ZIP转录因子家族的基本特征。RT-PCR分析检测表明,低温处理后,Aab ZIP1基因为组成型表达,不响应低温胁迫;Aab ZIP2基因表达受低温诱导,其表达强度随着低温处理时间的延长而增强,Aab ZIP2可能在红掌的低温胁迫响应过程中起重要作用。 展开更多
关键词 红掌 BZIP 亮氨酸拉链 低温 克隆
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木薯MebZIP27基因的克隆与原核表达分析
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作者 曾力旺 张小燕 +7 位作者 林墁 杨静琳 林素妍 潘子墨 雷鑫芳 吴春来 曾坚 胡伟 《福建农业学报》 北大核心 2025年第1期1-9,共9页
【目的】碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物中一类独特的转录因子,在植物的生长、发育和生理代谢调控中发挥着关键作用。特别是A类bZIPs通常负责调控携带ABA依赖元件的基因,进而引发ABA响应或实现环境适应。深... 【目的】碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物中一类独特的转录因子,在植物的生长、发育和生理代谢调控中发挥着关键作用。特别是A类bZIPs通常负责调控携带ABA依赖元件的基因,进而引发ABA响应或实现环境适应。深入研究A类木薯bZIPs转录因子的功能,可进一步了解其调控ABA表达的分子机理。【方法】通过RT-PCR技术克隆MebZIP27基因,并运用生物信息学方法对其进行基因和蛋白质水平的分析。此外,通过荧光定量PCR检测MebZIP27基因的时空表达模式及其对逆境的响应,并尝试通过原核表达获得MebZIP27蛋白。【结果】MebZIP27基因位于木薯第5号染色体上,编码区全长1251 bp,具备典型的bZIP结构域特征。该基因与麻风树(Hevea brasiliensis)和橡胶树(Jatropha curcas)的A类bZIP序列一致性分别高达80.00%和85.41%,表明其属于A类bZIP亚族成员。亚细胞定位结果显示,MebZIP27基因位于细胞核。qRT-PCR分析结果表明,MebZIP27基因在木薯储藏根中表达最为显著。在甘露醇、NaCl和低温处理下,MebZIP27基因未表现出显著诱导表达,但在ABA和H2O2处理下表现出显著诱导。通过原核表达成功获得了MebZIP27基因编码的蛋白,并通过谷胱甘肽琼脂糖珠微球分离技术对GST-MebZIP27蛋白进行了纯化。【结论】木薯中的MebZIP27基因属于A类bZIP基因家族,定位于细胞核,在木薯储藏根中的表达最为显著。此外,MebZIP27基因在ABA和H2O2处理下表现出显著诱导。这些结果为深入研究MebZIP27基因在ABA信号调控中的作用提供了参考依据。 展开更多
关键词 木薯 bzips 非生物胁迫 原核表达
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续随子bZIP转录因子家族鉴定及其响应干旱胁迫的分析
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作者 葛丽萍 苏云婷 +3 位作者 张玉胜 王子瑜 孙岩 李润植 《植物生理学报》 北大核心 2025年第9期1331-1348,共18页
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子是普遍存在于真核生物中相对保守的一类转录调节因子,广泛参与调节植物生长发育及逆境胁迫应答等生物学过程。为解析续随子(Euphorbia lathyris)bZIP蛋白的生物学功能,本研究鉴定续随... 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子是普遍存在于真核生物中相对保守的一类转录调节因子,广泛参与调节植物生长发育及逆境胁迫应答等生物学过程。为解析续随子(Euphorbia lathyris)bZIP蛋白的生物学功能,本研究鉴定续随子bZIP基因家族成员并分析其理化特性,探究其在干旱胁迫下的表达谱。结果表明,从续随子全基因组中鉴定出44个bZIP基因家族成员,不均匀分布在9条染色体上,片段重复是ElbZIP基因家族进化和扩增的主要驱动力。续随子bZIP家族成员划分为12个亚族。启动子顺式作用元件分析显示,ElbZIP基因启动子区域含有多种胁迫响应元件。选择启动子区域同时包含干旱胁迫响应元件(MBS)和防御与胁迫应答元件(TC-rich repeats)的7个ElbZIP候选基因分析其表达谱,发现ElbZIP基因在7个组织中都有表达,但表达量有差异,其中ElbZIP1整体表达水平较高。ElbZIP1基因在干旱胁迫的叶片和根部表达量较高。ElbZIP1蛋白位于细胞核,行使转录调控功能。与非转基因对照植株相比,异源超表达ElbZIP1转基因烟草植株的超氧化物歧化酶(SOD)活性和可溶性糖含量升高,丙二醛(MDA)含量显著下降,膜脂氧化减少。进一步对烟草内源相关基因表达分析揭示,过表达ElbZIP1显著上调干旱胁迫信号通路相关的NtRD22、NtRD29A等抗逆基因的表达。本研究结果表明,部分bZIP家族成员参与了续随子干旱胁迫应答,其中ElbZIP1正向调控植物抗旱性。 展开更多
关键词 续随子 碱性亮氨酸拉链(bZIP) 干旱胁迫 烟草遗传转化 亚细胞定位
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构树bZIP基因家族鉴定及硒代谢相关基因筛选
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作者 卜宪辰 郭龙飞 +5 位作者 祝嫦晔 陈强文 程水源 张威威 许锋 廖咏玲 《南方农业学报》 北大核心 2025年第1期135-148,共14页
【目的】对构树bZIP基因家族成员进行鉴定及分析,并筛选构树中参与硒代谢的关键基因,为深入研究构树bZIP基因家族生物学功能及其在构树硒代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】基于构树全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定构树bZIP... 【目的】对构树bZIP基因家族成员进行鉴定及分析,并筛选构树中参与硒代谢的关键基因,为深入研究构树bZIP基因家族生物学功能及其在构树硒代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】基于构树全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定构树bZIP基因家族成员,并对其基因结构、启动子顺式作用元件、蛋白的系统进化关系等进行分析,并通过根癌农杆菌介导烟草叶片的瞬时转化法进行蛋白亚细胞定位。通过转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量PCR分析构树bZIP家族基因在不同硒源及不同浓度处理下的表达水平。【结果】共鉴定得到38个bZIP基因家族成员(BpbZIP01~BpbZIP38),编码的氨基酸数量为140~894个,相对分子质量为16357.39~96969.63 Da,理论等电点为5.24~9.76,均为亲水性蛋白,不稳定系数为52.54~73.89,36个BpbZIPs蛋白定位于细胞核,BpbZIP15和BpbZIP19分别定位于过氧化物酶体和内质网。由系统发育进化树可知,将BpbZIPs蛋白分为10个亚族,BpbZIPs蛋白在各亚族中的数量为6个(A亚族)、1个(B亚族)、1个(C亚族)、7个(D亚族)、2个(E亚族)、1个(F亚族)、4个(G亚族)、2个(H亚族)、6个(I亚族)和8个(S亚族),各亚族中多数BpbZiPs与桑树bZIP聚成一支。不同BpbZIPs基因在外显子数量上差异较大,为1~16个,但相同亚族的基因长度和结构具有一定的相似性。BpbZIPs基因启动子含有光响应、激素和胁迫应答等多种响应元件。在不同浓度的硒酸钠和亚硒酸钠处理下,除BpbZIP17基因未表达外,其余BpbZIPs基因均对硒处理有上调或下调表达。结合相关分析和实时荧光定量PCR结果可知,亚硒酸钠和硒酸钠处理后BpbZIP04和BpbZIP05基因的表达水平均与总硒含量密切相关。【结论】构树bZIP基因家族成员参与多种生物和非生物胁迫,BpbZIP04和BpbZIP05基因在构树硒代谢与耐受性中发挥重要作用。 展开更多
关键词 构树 bZIP基因家族 生物信息学分析 表达模式 硒代谢
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蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定、生物信息学及表达分析 被引量:2
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作者 王冬艳 张春玲 +3 位作者 冯研 王丽新 昝睿 狄建军 《安徽农学通报》 2025年第2期27-35,共9页
为了解蓖麻bZIP基因家族成员的组成和家族进化关系及特征,本研究利用生物信息学鉴定家族成员,进行基因结构、蛋白质保守基序分析及系统发育分析,同时分析其蛋白的理化性质、磷酸化位点和互作关系,以及该基因在组织中的表达模式和表达量... 为了解蓖麻bZIP基因家族成员的组成和家族进化关系及特征,本研究利用生物信息学鉴定家族成员,进行基因结构、蛋白质保守基序分析及系统发育分析,同时分析其蛋白的理化性质、磷酸化位点和互作关系,以及该基因在组织中的表达模式和表达量。结果表明,共鉴定出46个蓖麻bZIP基因家族成员,位于10个染色体上;基因结构与蛋白质保守基序较为复杂,可分为11个亚族,包含25个基序;与拟南芥进化相似,较为保守;bZIP蛋白为亲水性蛋白,位于细胞核、细胞膜和叶绿体,主要通过丝氨酸的磷酸化来发挥生物学作用,蛋白RcbZIP18、RcbZIP27、RcbZIP2、RcbZIP17和RcbZIP46之间的联系较多,通过蛋白间的相互作用参与蓖麻各个生长时期;该基因家族均参与叶、茎、根和胚等生长时期的发育调控,其中RcbZIP10、RcbZIP25和RcbZIP44在叶片和种子中表现出明显的组织差异性。上述结果为蓖麻bZIP基因家族成员的功能研究提供参考。 展开更多
关键词 蓖麻 bZIP家族 生物信息学分析 系统进化 表达分析
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未折叠蛋白反应通过调控色氨酸代谢提高植物抗病性
6
作者 曹园园 周舒浩 +1 位作者 张海荣 崔晓娜 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期155-164,共10页
【目的】探究内质网胁迫(endoplasmic reticulum stress, ERS)引发的未折叠蛋白反应(unfolded protein response,UPR)与色氨酸代谢和植物抗病性的关系;明确UPR中的转录因子bZIP28和bZIP60在色氨酸代谢中的调控机制及对植物抗病性的影响... 【目的】探究内质网胁迫(endoplasmic reticulum stress, ERS)引发的未折叠蛋白反应(unfolded protein response,UPR)与色氨酸代谢和植物抗病性的关系;明确UPR中的转录因子bZIP28和bZIP60在色氨酸代谢中的调控机制及对植物抗病性的影响。【方法】利用转录组测序和RT-qPCR分析内质网胁迫后,色氨酸代谢通路相关基因的表达;检测内质网胁迫对色氨酸代谢产物植保素-亚麻荠素(camalexin)和吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)合成的影响;检测病原菌侵染后bZIP28和bZIP60的表达及其过表达植株的抗病能力;通过酵母单杂交和双荧光素酶报告实验探究bZIP28/60对WRKY33的调控。【结果】UPR使色氨酸代谢基因表达上调,植保素Camalexin和IAA的水平升高;病原菌感染上调bZIP28和bZIP60的表达,且bZIP28和b ZIP60过表达植株的抗病性增强;bZIP28和b ZIP60间接调控WRKY33的转录,且WRKY33启动子的-364--566 bp区段为核心序列。【结论】内质网胁迫通过转录因子bZIP28和b ZIP60调控WRKY33的表达,进而上调色氨酸代谢基因的表达,提高Camalexin和IAA的水平,抵御病原菌的感染,缓解内质网胁迫。 展开更多
关键词 内质网胁迫 未折叠蛋白反应 bZIP28 bZIP60 WRKY33 色氨酸代谢 植保素 吲哚乙酸
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野菊CibZIP43基因及其启动子的克隆与表达分析
7
作者 刘晏廷 黄沁梅 何淼 《北方园艺》 北大核心 2025年第11期23-31,共9页
以野菊(Chrysanthemum indicum)为试材,基于镉胁迫转录组数据,采用RT-PCR克隆、生物信息学分析及启动子功能验证技术,解析CibZIP43基因在镉胁迫响应中的作用机制,以期为发掘野菊抗逆基因资源提供参考依据。结果表明:CibZIP43基因开放阅... 以野菊(Chrysanthemum indicum)为试材,基于镉胁迫转录组数据,采用RT-PCR克隆、生物信息学分析及启动子功能验证技术,解析CibZIP43基因在镉胁迫响应中的作用机制,以期为发掘野菊抗逆基因资源提供参考依据。结果表明:CibZIP43基因开放阅读框长516 bp,编码171个氨基酸,其蛋白相对分子质量为20144.29,属不稳定亲水性蛋白,与菊科青蒿同源关系最近;该基因受镉胁迫显著诱导,在叶中的表达量于1 h降至最低,根中于8 h达最低值。启动子序列含MYB结合位点、脱落酸、乙烯及光响应等顺式作用元件。构建5′端缺失片段瞬时表达载体后通过GUS活性检测证实其启动子具有功能活性。 展开更多
关键词 野菊 BZIP 镉胁迫 启动子 表达分析
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富民枳bZIP基因家族的鉴定和干旱胁迫表达 被引量:1
8
作者 张珊珊 张攀 杨文忠 《东北林业大学学报》 北大核心 2025年第4期12-22,共11页
为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚... 为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚族,不同亚族的内含子数目及保守基序差异较大。共线性分析表明,富民枳bZIP基因之间存在片段复制事件,富民枳bZIP与拟南芥和枳分别存在62和69个同源基因对。GO和KEGG富集分析表明,PpbZIPs成员响应ABA和渗透压刺激,参与植物激素信号转导途径。顺式作用元件分析表明,PpbZIPs基因启动子含大量的干旱响应元件和ABA响应元件。利用枳的转录组数据,筛选了8个富民枳bZIP抗旱候选基因。qRT-PCR分析结果表明,在干旱胁迫下,除了PpbZIP46其余7个基因表达均显著上升,表明这些基因参与了干旱胁迫响应。受干旱胁迫诱导上调表达的7个PpbZIPs基因,可能是重要的抗旱基因,研究结果为挖掘富民枳bZIP抗旱基因提供参考。 展开更多
关键词 富民枳 BZIP 干旱胁迫 系统进化 表达分析
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黄栌枯萎病菌转录因子VdbZIP2的功能
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作者 李洒 王永林 《中国森林病虫》 北大核心 2025年第2期1-11,共11页
为深入探究引起毁灭性林木病害——黄栌枯萎病病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae的致病机制,通过PEG介导原生质体遗传转化法获得黄栌枯萎病菌bZIP转录因子VdbZIP2突变体,开展VdbZIP2突变体的生物学性状分析,并进行致病性测定。结果... 为深入探究引起毁灭性林木病害——黄栌枯萎病病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae的致病机制,通过PEG介导原生质体遗传转化法获得黄栌枯萎病菌bZIP转录因子VdbZIP2突变体,开展VdbZIP2突变体的生物学性状分析,并进行致病性测定。结果表明:敲除VdbZIP2明显影响了黄栌枯萎病菌黑色素合成、微菌核发育、细胞壁胁迫敏感性以及对速效氮源的利用,VdbZIP2不是毒性必需的基因。明确黄栌枯萎病菌转录因子VdbZIP2参与微菌核形成、逆境胁迫和氮源利用过程,为后续深入解析VdbZIP2的分子调控网络提供重要线索。 展开更多
关键词 大丽轮枝菌 黄栌枯萎病 bZIP转录因子 黑色素 微菌核 毒性
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药用植物中bZIP转录因子家族的研究进展
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作者 胡漪文 陈丽娟 +1 位作者 黄利 王光志 《中药与临床》 2025年第2期56-61,16,共7页
中药材的产量和品质受其基原植物的生长发育及活性物质的合成与积累影响。碱性亮氨酸拉链(basic-region leucinezipper,bZIP)转录因子能够调控基因表达,从而参与植物的多个生理过程。目前从多种药用植物中鉴定出的bZIP转录因子家族成员... 中药材的产量和品质受其基原植物的生长发育及活性物质的合成与积累影响。碱性亮氨酸拉链(basic-region leucinezipper,bZIP)转录因子能够调控基因表达,从而参与植物的多个生理过程。目前从多种药用植物中鉴定出的bZIP转录因子家族成员显示出其在药用植物生长发育、抗逆胁迫和活性物质的合成与积累过程中发挥积极作用。本研究围绕bZIP转录因子的结构、在药用植物中的分类与鉴定、参与调控药用植物生理过程等方面,讨论了利用bZIP转录因子深入挖掘功能基因的潜力,为bZIP转录因子的分子调控机制研究和提高中药材产量和品质奠定基础。 展开更多
关键词 BZIP 药用植物 生长发育 胁迫 活性物质
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铁皮石斛bZIP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 曾丹 黄园 +5 位作者 王健 张艳 刘庆霞 谷荣辉 孙庆文 陈宏宇 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期197-210,共14页
【目的】鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale) bZIP基因家族,通过生物信息学和基因表达分析,阐明DobZIP转录因子的生物学功能,为后续深入探究DobZIP转录因子的分子机制提供理论指导。【方法】基于IMP数据库中的铁皮石斛基因组数据鉴定... 【目的】鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale) bZIP基因家族,通过生物信息学和基因表达分析,阐明DobZIP转录因子的生物学功能,为后续深入探究DobZIP转录因子的分子机制提供理论指导。【方法】基于IMP数据库中的铁皮石斛基因组数据鉴定出铁皮石斛bZIP基因家族成员,对该家族成员进行多项生物信息学分析,同时利用转录组数据和实时荧光定量PCR技术对DobZIP转录因子进行组织表达模式及非生物胁迫表达分析。【结果】共鉴定出54个DobZIP基因,DobZIP蛋白均无信号肽,仅有DobZIP54有跨膜结构域,亚细胞定位主要在细胞核中。DobZIP家族成员划分在10个亚家族,且同一亚家族成员含有相似的结构和基序;DobZIP不均匀地分布在18条染色体上,有两对基因间存在串联关系,种间存在多条共线性关系,与水稻的b ZIP家族同源性较高。顺势作用元件分析表明,DobZIP家族成员均含有多个参与生长发育和响应逆境胁迫的顺式作用元件。基因表达模式分析显示,DobZIP家族成员存在组织表达特异性,且DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28、DobZIP32、DobZIP37在不同程度上受低温、干旱和氯化钠胁迫的诱导。除DobZIP32和DobZIP37外,DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28还受高温胁迫的诱导。【结论】铁皮石斛基因组中共鉴定出54个DobZIP基因,DobZIP具有组织表达特异性,且DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28、DobZIP32、DobZIP37在低温、干旱和氯化钠胁迫下均受到不同程度的诱导。 展开更多
关键词 铁皮石斛 转录因子 BZIP 生信分析 基因表达分析
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党参bZIP转录因子家族的鉴定和表达分析
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作者 张晨 刘吉爽 +1 位作者 姚远 肖莹 《植物生理学报》 北大核心 2025年第6期777-788,共12页
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物生长发育、胁迫响应和次生代谢产物生物合成等过程。本研究在党参(Codonopsis pilosula)基因组中鉴定出41个bZIP家族基因。系统发育分析将其分为13个亚族;... 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物生长发育、胁迫响应和次生代谢产物生物合成等过程。本研究在党参(Codonopsis pilosula)基因组中鉴定出41个bZIP家族基因。系统发育分析将其分为13个亚族;基因结构和保守基序分析表明,同一亚族的蛋白具有相似的保守基序和结构域,Motif 1为bZIP家族特有的碱性区域,保守性最强,在党参bZIP蛋白中均有分布;顺式作用元件分析表明,bZIP成员上游启动子区域存在多种非生物胁迫元件、激素响应元件和防御应激反应元件,其中光信号响应元件占比最大;转录组表达模式分析显示,17条bZIP基因在高光处理下表达量升高,其中的6条积极响应光信号。本研究将为党参bZIP转录因子的功能研究奠定基础,为参与光信号响应的bZIP转录因子的筛选提供依据。 展开更多
关键词 bZIP转录因子 党参 系统发育分析 光信号响应
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多刺绿绒蒿bZIP基因家族的鉴定及生物信息学分析
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作者 李真 马兰民 +2 位作者 张文惠平 东主南加 孙胜男 《种子》 北大核心 2025年第8期10-20,29,共12页
bZIP转录因子家族在植物生长发育、次生代谢调控以及环境响应等过程中发挥着关键作用。为探究bZIP基因家族在藏药多刺绿绒蒿中的功能,整合藏药多刺绿绒蒿全长转录组的数据,鉴定了bZIP基因家族成员,并对这些基因及其编码的蛋白进行理化... bZIP转录因子家族在植物生长发育、次生代谢调控以及环境响应等过程中发挥着关键作用。为探究bZIP基因家族在藏药多刺绿绒蒿中的功能,整合藏药多刺绿绒蒿全长转录组的数据,鉴定了bZIP基因家族成员,并对这些基因及其编码的蛋白进行理化性质、保守结构域、系统进化关系等生物信息学分析。结果表明,成功筛选出87个bZIP基因,编码的蛋白均具有bZIP结构域,氨基酸数目介于107~723个之间,分子量介于12497.14~44951.86 Da之间,理论等电点在5.18~9.98之间;预测大多数蛋白为亲水性不稳定蛋白且定位于细胞核。系统进化分析表明,多刺绿绒蒿bZIP蛋白与拟南芥和水稻的bZIP基因在多个分支中均有分布,表明这些基因在序列上具有较高的相似性,且具有相似的进化方式,可能在功能上也具有一定的保守性。蛋白三级结构显示,这些蛋白在进化过程中发生了不同程度的进化,包含α-螺旋、β-转角、无规则卷曲及延伸链等空间构象。 展开更多
关键词 多刺绿绒蒿 bZIP基因家族 生物信息学 全长转录组
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OsbZIP27 coordinates with OsHUB1 and OsHUB2 to modulate drought tolerance in rice
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作者 Zuntao Xu Yachun Yang +4 位作者 Fei Zhang Hao Li Hui Ma Wenge Wu Yong Ding 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第2期168-178,共11页
Histone H2B ubiquitination(H2Bub)is positively linked to transcriptional activation,but the genetic programs affected by H2Bub to enhance drought tolerance remain largely unknown.Here,we show that OsbZIP27 interacts d... Histone H2B ubiquitination(H2Bub)is positively linked to transcriptional activation,but the genetic programs affected by H2Bub to enhance drought tolerance remain largely unknown.Here,we show that OsbZIP27 interacts directly with OsHUB1/2 to regulate drought tolerance in rice by binding to the promoters of OsHAK1 and OsGLN1 to achieve H2Bub and transcriptional activation.Consistently,mutations in OsbZIP27 reduce transcription of OsHAK1 and OsGLN1,resulting in increased sensitivity to drought stress.Moreover,loss of OsHUB1 and OsHUB2 function causes hypersensitivity to drought stress,whereas OsHUB2 overexpression enhances drought tolerance.Together,our results indicate that OsbZIP27 coordinates with OsHUB1/2 to enhance rice drought tolerance by increasing H2Bub and expression of OsHAK1 and OsGLN1. 展开更多
关键词 H2B monoubiquitination Drought stress bZIP transcription factor Ring domain protein Potassium transporter GLUCANASE
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CEBPA bZIP框内突变在急性髓系白血病中的研究进展
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作者 陈克敏 黄志斌 +1 位作者 王顺清 张文清 《广州医药》 2025年第2期139-150,共12页
CCAAT增强子结合蛋白A(CEBPA)是调节血液发育过程中髓系分化和造血干祖细胞活性的关键转录因子之一。CEBPA基因突变常见于急性髓系白血病(AML)中,最近研究表明CEBPA bZIP框内单位点和经典双等位基因突变AML患者均具有类似的临床特征,已... CCAAT增强子结合蛋白A(CEBPA)是调节血液发育过程中髓系分化和造血干祖细胞活性的关键转录因子之一。CEBPA基因突变常见于急性髓系白血病(AML)中,最近研究表明CEBPA bZIP框内单位点和经典双等位基因突变AML患者均具有类似的临床特征,已被单独划分为AML亚群。CEBPA bZIP框内突变而非传统的双等位CEBPA基因突变成为AML良好预后的分子指标,表明其在AML疾病进展和治疗预后中的重要性和特殊性。本文将从CEBPA蛋白在血液系统中的功能、CEBPA bZIP框内突变AML的临床特征与分子作用机制、以及伴CEBPA突变AML的治疗现状等方面进行综述,为进一步研究CEBPA bZIP框内突变在AML中的致病性和精准治疗新药物开发提供参考。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 CCAAT增强子结合蛋白A bZIP框内突变
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灰毡毛忍冬bZIP25基因的克隆及其表达模式分析 被引量:2
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作者 王珊 曾娟 +6 位作者 谢瑜 周日宝 刘湘丹 童巧珍 龙雨青 陈言 刘小丽 《中南药学》 CAS 2024年第2期335-340,共6页
目的克隆灰毡毛忍冬bZIP25基因序列全长,并进行生信分析及表达模式分析,以初步探索其在灰毡毛忍冬中的生物学功能。方法通过逆转录PCR技术克隆bZIP25基因的序列全长,采用生物信息学分析方法对bZIP25及其编码的蛋白进行分析。运用实时荧... 目的克隆灰毡毛忍冬bZIP25基因序列全长,并进行生信分析及表达模式分析,以初步探索其在灰毡毛忍冬中的生物学功能。方法通过逆转录PCR技术克隆bZIP25基因的序列全长,采用生物信息学分析方法对bZIP25及其编码的蛋白进行分析。运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术测定其在茎、叶及七个花期花中的表达水平。结果克隆得到LmbZIP25基因(OR551766),其编码191个氨基酸,具有典型的bZIP家族结构,在bZIP结构域中与其他植物同源性较高。LmbZIP25基因具有组织特异性,在茎中的表达量显著高于花和叶,在七个花期中黄色花蕾期的表达量最高。结论克隆得到LmbZIP25基因全长,分析其在不同器官和不同花期的表达差异,为进一步探索其在灰毡毛忍冬中花发育中的功能奠定了研究基础。 展开更多
关键词 灰毡毛忍冬 bZIP25 基因克隆 生物信息学分析 表达模式分析
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石仙桃中4种转录因子鉴定及其组织表达的研究 被引量:1
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作者 刘保财 张武君 +2 位作者 赵云青 黄颖桢 陈菁瑛 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期141-152,共12页
【目的】石仙桃Pholidota chinensis Lindl为珍稀濒危的附生兰,附生较地生而言进化出了许多特殊的形态结构和生理生化特性,而转录因子对调控植物的生长发育具有作用,旨在探讨和发掘石仙桃中调控其生长发育的转录因子。【方法】利用PacBi... 【目的】石仙桃Pholidota chinensis Lindl为珍稀濒危的附生兰,附生较地生而言进化出了许多特殊的形态结构和生理生化特性,而转录因子对调控植物的生长发育具有作用,旨在探讨和发掘石仙桃中调控其生长发育的转录因子。【方法】利用PacBio和Illumina测序技术获得石仙桃的全长转录组数据以及在根、根状茎、假鳞茎和叶片中的基因表达量,通过进一步生信分析,探讨石仙桃4种转录因子家族成员、理化特性及其组织表达特异性,并用氯化钠(NaCl)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导逆境胁迫,用RT-qPCR分析了C2H2家族和bHLH家族的表达量。【结果】石仙桃中鉴定的4种转录因子及其家族成员转录本为:C2H2家族21个、bHLH家族27个、WRKY家族30个、bZIP家族19个,这4个家族及其成员主要为亲水的不稳定性蛋白,亚细胞定位主要位于细胞核内,bHLH家族的部分成员位于细胞质、叶绿体等细胞器中,各基因家族均具有典型的保守结构域特征,在石仙桃的根、根状茎、假鳞茎和叶片呈现出明显的组织特异性。21个C2H2家族和27个bHLH家族中所有基因表达均受NaCl和MeJA影响,但家族成员受到促进或抑制表达及其表达量存在差异。【结论】鉴定了石仙桃中4个转录因子家族成员的数量,各家族成员主要是位于细胞核内的亲水不稳定性蛋白,并具有保守结构域特征和组织表达特异性。 展开更多
关键词 石仙桃 C2H2 BHLH WRKY BZIP 理化特性 组织表达
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玉米逆境胁迫响应基因ZmbZIP15的克隆与抗旱功能分析
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作者 曹丽茹 叶飞宇 +4 位作者 庞芸芸 马晨晨 张新 王振华 鲁晓民 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期53-61,共9页
从转录组数据中筛选到27个参与干旱-复水胁迫响应的bZIP基因,构建共表达网络图。结果发现,ZmbZIP15处于核心节点位置,该基因位于第5号染色体,编码176个氨基酸,包含高度保守的bZIP结构域,属于亲水性蛋白。蛋白进化树分析发现,该蛋白与芒... 从转录组数据中筛选到27个参与干旱-复水胁迫响应的bZIP基因,构建共表达网络图。结果发现,ZmbZIP15处于核心节点位置,该基因位于第5号染色体,编码176个氨基酸,包含高度保守的bZIP结构域,属于亲水性蛋白。蛋白进化树分析发现,该蛋白与芒草、高粱的亲缘关系最近,与大麦、小麦的亲缘关系最远。ZmbZIP15基因ATG上游2 K启动子的顺式元件分析,发现含有多个参与调控脱落酸、低温和干旱的结合元件。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,ZmbZIP15是组成型表达基因,在雌穗高表达,幼茎的表达量最低。干旱、高温、盐、氮胁迫处理下,该基因的表达量显著上调,说明ZmbZIP15基因积极参与并调控非生物胁迫途径。过表达ZmbZIP15转基因拟南芥抗旱性检测分析,发现干旱胁迫处理下过表达ZmbZIP15基因能够提高拟南芥幼苗的抗旱性。亚细胞定位显示,该基因编码的蛋白定位于细胞核。 展开更多
关键词 玉米 BZIP 非生物胁迫 抗旱性 亚细胞定位
原文传递
转录因子bZIP60调控植物抗病抗逆的研究进展
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作者 江连强 宫燕伟 +2 位作者 刘东阳 刘国 申莉莉 《四川农业科技》 2024年第2期57-62,共6页
未折叠蛋白反应(UPR)在植物的逆境胁迫、病原物侵染、生长发育中发挥重要作用,转录因子bZIP60是UPR信号之一。在明确了拟南芥、水稻、玉米、小麦等内质网应激时需肌醇酶(IRE1)介导bZIP60 mRNA剪接激活的基础上,归纳了bZIP60对逆境和病... 未折叠蛋白反应(UPR)在植物的逆境胁迫、病原物侵染、生长发育中发挥重要作用,转录因子bZIP60是UPR信号之一。在明确了拟南芥、水稻、玉米、小麦等内质网应激时需肌醇酶(IRE1)介导bZIP60 mRNA剪接激活的基础上,归纳了bZIP60对逆境和病原物的响应机制,总结了IRE1/bZIP60信号在植物抗病抗逆中的研究进展。正常生长条件下,以前体蛋白bZIP60U的形式跨内质网膜。发生应激时,IRE1识别并剪切bZIP60 mRNA的双茎环结构,产生含转录激活域和核定位信号的活性蛋白bZIP60S,并在细胞核内形成二聚体,结合到应激反应相关基因的启动子,通过上调胁迫应答相关基因提高植株抗性。 展开更多
关键词 转录因子bZIP60 内质网胁迫 未折叠蛋白反应 抗病 抗逆
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西洋参bZIP基因家族全基因组鉴定和表达分析 被引量:2
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作者 郭纯 宋桂梅 +2 位作者 闫艳 邸鹏 王英平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期167-178,共12页
【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功... 【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功能提供理论依据。【方法】利用生物信息学对西洋参bZIP基因进行理化性质、系统发育关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位、进化选择压力分析、以及组织特异性表达分析,同时利用外源激素ABA处理西洋参后进行转录组数据分析及荧光定量验证。【结果】西洋参中共鉴定出121个bZIPs基因;根据系统发育树,这些基因被分为12个亚组;基因结构和保守基序分析表明,同一亚组的蛋白具有相似的保守基序和结构域,保守基序1在西洋参bZIP蛋白质中分布最广,保守性最强;顺式作用元件分析表明,bZIP上游启动子元件存在激素响应元件、防御和应激反应元件,其中ABA激素响应元件占比最大;染色体定位分析显示bZIP基因不均匀的分布在24条染色体上;进行进化选择压力分析,发现纯化选择在西洋参bZIP基因家族进化过程中起着重要作用;组织特异性表达分析,PqbZIPs基因在花和根中的表达量相对较高;转录组数据发现bZIP转录因子积极响应ABA激素处理,随后进行荧光定量实验验证,发现基因表达变化趋势基本一致。【结论】PqbZIP基因家族成员具有组织特异性表达模式且多数成员响应ABA激素处理。 展开更多
关键词 BZIP 转录因子 西洋参 ABA 转录组
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