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题名玉米ZmZFP36基因的克隆与生物信息学分析
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作者
肖英粟
刘珍
陈熹
黄志刚
蔺万煌
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机构
湖南农业大学
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第10期3150-3156,共7页
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基金
湖南省自然科学基金(2018JJ2170)
国家重点实验室培育基地开放课题(17KFXM11)共同资助。
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文摘
玉米(Zea mays)是世界上最重要的粮食作物之一,研究其抗逆性机理有着十分重要的意义。本研究用在线软件预测了玉米miR408的靶基因,对其中编码锌指蛋白的靶基因Zm ZFP36进行了生物信息学分析,并构建了该基因的植物表达载体。研究结果表明,Zm ZFP36的转录本全长为1169 bp,无内含子,开放阅读框长度为702 bp,编码的蛋白质分子量为24.52 kD;具有亲水性,无跨膜结构域;二级结构包含无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角,所占比例分别为69.10%、20.60%、7.73%和2.58%;系统进化树分析表明ZmZFP36蛋白与小米(Setaria italica)、高粱(Sorghum bicolor)蛋白亲缘关系最近。启动子分析结果表明,它含有低温、干旱及脱落酸等多种非生物胁迫响应元件,有助于后期通过遗传转化的方法进一步研究miR408的调控机理。
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关键词
玉米
MICRORNA
靶基因
zmzfp36
生物信息学分析
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Keywords
Maize
microRNA
Target gene
Zm ZFP36
Bioinformatics analysis
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分类号
S513
[农业科学—作物学]
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