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翅果油树WRKY基因家族鉴定及EmWRKY29调控维生素E合成作用的研究
1
作者 冯宇奇 李昊炀 +6 位作者 胡晓艳 杨秀云 王升级 赵凯 任瑞芬 王兆山 杜淑辉 《植物生理学报》 北大核心 2025年第8期1121-1128,共8页
为了明确WRKY转录因子在调控翅果油树(Elaeagnus mollis)维生素E合成中的作用,对翅果油树WRKY基因家族成员进行了全基因组鉴定并且对EmWRKY29进行瞬时转化烟草叶片分析。结果显示,翅果油树有104个EmWRKYs,其氨基酸数目为175~1019 aa;平... 为了明确WRKY转录因子在调控翅果油树(Elaeagnus mollis)维生素E合成中的作用,对翅果油树WRKY基因家族成员进行了全基因组鉴定并且对EmWRKY29进行瞬时转化烟草叶片分析。结果显示,翅果油树有104个EmWRKYs,其氨基酸数目为175~1019 aa;平均相对分子量为46353.57;理论等电点为4.87~9.79。亚细胞定位预测显示,大部分蛋白定位在细胞核。系统进化分析将EmWRKYs分为3组,Ⅱ组分为5个亚组,同一亚组的EmWRKY蛋白具有相似的基序分布模式并且所有的蛋白都具有WRKY结构域。EmWRKYs的启动子中存在多个与生长发育、激素响应和应激反应相关的顺式作用元件。染色体定位分析表明,EmWRKYs在14条染色体上分布不均匀,染色体Chr01含有的基因最多(21个),染色体Chr12最少(1个)。通过基因复制分析发现位于染色体Chr01上的EmWRKY7和EmWRKY17为一对串联复制,其余47对EmWRKYs为片段复制。共表达分析结果表明转录因子EmWRKY29可能是翅果油树维生素E合成的关键调控因子,瞬时过表达EmWRKY29的烟草叶片中维生素E总含量由138.47μg·g^(-1)下降至104.58μg·g^(-1)。本研究不仅为翅果油树WRKY家族成员的功能研究和利用奠定了基础,还为探索植物维生素E合成机理提供了重要的基因资源。 展开更多
关键词 翅果油树 wrky基因家族 Emwrky29 维生素E
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WRKY转录因子在水稻抗逆基因工程中的应用进展
2
作者 段俊枝 燕照玲 +5 位作者 齐红志 张会芳 陈海燕 杨翠苹 王楠 卓文飞 《中国稻米》 北大核心 2025年第1期61-67,73,共8页
水稻在其生长过程中经常面临各种非生物胁迫(包括干旱、高盐度、低温及高温等)和生物胁迫(如病虫害),严重影响其正常生长发育。WRKY转录因子家族作为植物界中最为庞大的转录因子家族之一,在调控植物生长发育及应对非生物胁迫和生物胁迫... 水稻在其生长过程中经常面临各种非生物胁迫(包括干旱、高盐度、低温及高温等)和生物胁迫(如病虫害),严重影响其正常生长发育。WRKY转录因子家族作为植物界中最为庞大的转录因子家族之一,在调控植物生长发育及应对非生物胁迫和生物胁迫方面发挥着关键作用。本文综述了WRKY转录因子的结构特点及其在水稻抗非生物胁迫(干旱、高盐、低温、高温等)、生物胁迫(稻瘟病、白叶枯病、纹枯病、稻飞虱等)基因工程中的应用进展,旨在为WRKY转录因子在水稻及其他作物抗逆性遗传改良中的应用提供理论基础和实践指导。 展开更多
关键词 水稻 wrky转录因子 干旱 高盐度 温度胁迫 稻瘟病 白叶枯病 纹枯病 稻飞虱
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枇杷WRKY基因家族鉴定及其表达分析
3
作者 张雅玲 邓朝军 +3 位作者 苏文炳 陈秀萍 蒋际谋 郑少泉 《福建农业学报》 北大核心 2025年第5期487-499,共13页
【目的】系统分析枇杷(Eriobotrya japonica)WRKY基因家族成员(EjWRKY),为解析其在果皮着色过程中的生物学功能奠定基础。【方法】基于枇杷基因组数据,采用生物信息学方法鉴定枇杷EjWRKY基因家族,并对其理化性质、系统进化和结构特征等... 【目的】系统分析枇杷(Eriobotrya japonica)WRKY基因家族成员(EjWRKY),为解析其在果皮着色过程中的生物学功能奠定基础。【方法】基于枇杷基因组数据,采用生物信息学方法鉴定枇杷EjWRKY基因家族,并对其理化性质、系统进化和结构特征等进行全面分析。同时,结合转录组测序技术,比较分析‘解放钟’和‘山牌3号’枇杷果皮着色过程中EjWRKY基因的表达情况,并采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术对部分差异表达基因的进行试验验证。【结果】鉴定出100个具有典型结构域的WRKY,命名为EjWRKY1~EjWRKY100。WRKY长度150~732 aa,分子量介于17189.36~79765.13 Da,等电点(isoelectric point,pI)介于4.92~10.25。亚细胞定位预测结果表明,绝大多数亚细胞定位于细胞核。染色体定位分析显示,其中97个WRKY基因不均匀地分布在17条染色体上。根据WRKY结构域和锌指基序可将枇杷EjWRKY分为3个大类。多数EjWRKY基因在解放钟和山牌3号枇杷果皮中均有表达。EjWRKY基因的qRT-PCR分析结果与转录组数据一致。【结论】鉴定出100个枇杷EjWRKY家族基因,并发现其中部分基因的表达模式与枇杷果皮着色过程显著相关,为进一步研究EjWRKY基因调控枇杷果皮色素合成的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 枇杷 wrky 基因家族 表达分析 果皮着色
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西兰花灰霉病响应基因BoWRKY15的克隆与功能鉴定
4
作者 蒋明 张胜 +1 位作者 陈孝赏 张慧娟 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第8期1723-1732,共10页
灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是西兰花(Brassica oleracea var.italica)生产中的重要病害之一,每年造成的经济损失巨大。WRKY转录因子是植物特有的一类调控蛋白,在逆境防御中起重要作用。本研究以西兰花为材料,在克隆BoWRK... 灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是西兰花(Brassica oleracea var.italica)生产中的重要病害之一,每年造成的经济损失巨大。WRKY转录因子是植物特有的一类调控蛋白,在逆境防御中起重要作用。本研究以西兰花为材料,在克隆BoWRKY15基因的基础上,利用生物信息学手段明确BoWRKY15的序列特征,采用qRT-PCR技术检测其在灰葡萄孢菌侵染下的表达模式,并利用过表达技术明确转基因西兰花的抗病性变化,从而明确该基因在抗病响应中的功能。结果表明,BoWRKY15的基因组全长为1172 bp,有2个内含子,分别为90 bp和86 bp;编码区全长为996 bp,编码331个氨基酸,包含1个由61个氨基酸组成的WRKY结构域,其锌指结构类型为C2H2。多重序列比对发现,BoWRKY15及其同源序列的WRKY结构域十分保守,仅个别氨基酸残基存在差异。系统发育分析显示,BoWRKY15与来自芸薹属植物的同源序列聚于一组。亚细胞定位结果表明,BoWRKY15在细胞核中表达,与在线预测结果一致。qRT-PCR结果表明,BoWRKY15的表达受灰葡萄孢菌诱导,在接种48 h时的表达量最大,为对照组的2.64倍。BoWRKY15过表达导致西兰花对灰葡萄孢菌的抗性显著降低,同时病程相关蛋白基因BoiPR1的表达量升高。BoWRKY15在灰霉病抗性响应中起负调控作用,该基因的克隆与表达分析为后续开展西兰花抗病机理研究和分子育种奠定了基础。 展开更多
关键词 西兰花 wrky转录因子 过表达 灰霉病 灰葡萄孢菌
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基于全长转录组的白蜡树WRKY基因家族的鉴定与密码子偏好性分析
5
作者 孙晓春 李爽 +3 位作者 刘雅君 蔡兴航 黄文静 李会容 《中草药》 北大核心 2025年第7期2482-2494,共13页
目的对白蜡树Fraxinus chinensis WRKY基因家族进行鉴定、生物信息学和密码子偏好性分析。方法基于白蜡树全长转录组数据,利用生物信息学方法对其WRKY基因家族进行鉴定,并对其理化性质、系统发育、保守基序进行分析;基于白蜡树叶片和枝... 目的对白蜡树Fraxinus chinensis WRKY基因家族进行鉴定、生物信息学和密码子偏好性分析。方法基于白蜡树全长转录组数据,利用生物信息学方法对其WRKY基因家族进行鉴定,并对其理化性质、系统发育、保守基序进行分析;基于白蜡树叶片和枝皮的二代转录组数据,对白蜡树WRKY基因家族的表达模式进行分析,并采用实时荧光定量PCR方法进行验证;利用CodonW、EMBOSS等程序对密码子偏好性进行分析,并进行最优密码子分析、中性绘图、ENC-plot和PR2偏倚分析。结果共鉴定得到49个WRKY转录因子,均为酸性、亲水蛋白,编码氨基酸数目为426~2175,相对分子质量33933.48~179137.94,理论等电点4.91~5.27,不稳定蛋白占比65.31%,预测均定位到细胞核;系统进化表明FcWRKY基因家族成员归为Ⅰ(11个)、Ⅱ(30个)、Ⅲ(7个)大类以及2个特殊成员(FcWRKY23和FcWRKY37),其中第Ⅱ类分为Ⅱa(5个)、Ⅱb(5个)、Ⅱc(8个)、Ⅱd(7个)、Ⅱe(7个)5个亚类;Motif 1和Motif 2存在于所有的WRKY转录因子中,是其保守序列;二代转录组数据筛选到16个WRKY基因在叶片和枝皮中具有显著差异表达,其中仅有FcWRKY11在枝皮中的表达量高于叶片。白蜡树FcWRKYs偏好使用以A/U结尾的密码子,并且偏好性较弱;确定了3个最优密码子,分别是CUU、AGG、和UAU;中性绘图分析和ENC-plot分析均表明自然选择是影响其密码子偏好性的主要因素,PR2偏倚分析结果表明突变压力亦影响其密码子偏好性。结论鉴定了白蜡树WRKY基因,其中8个WRKY基因表达量与转录组学测序结果趋势一致,为研究白蜡树WRKY的基因功能奠定基础。 展开更多
关键词 白蜡树 wrky转录因子 生物信息学 密码子偏好性分析 全长转录组
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蓖麻WRKY转录因子家族的鉴定及其响应灰霉病侵染的表达分析
6
作者 孙敬彭 唐杰松 +3 位作者 曹丽 鲁亚楠 胡晓航 郑志民 《分子植物育种》 北大核心 2025年第9期2912-2921,共10页
WRKY家族在植物生命历程中参与广泛的调控作用,某些WRKY转录因子在植物对抗各种胁迫时发挥积极作用,当坏死性病原菌侵染植物的时候,WRKY33以不同的方式引导植物分配资源产生有效的免疫。为研究蓖麻WRKY家族的基因功能特点,以及蓖麻WRKY3... WRKY家族在植物生命历程中参与广泛的调控作用,某些WRKY转录因子在植物对抗各种胁迫时发挥积极作用,当坏死性病原菌侵染植物的时候,WRKY33以不同的方式引导植物分配资源产生有效的免疫。为研究蓖麻WRKY家族的基因功能特点,以及蓖麻WRKY33同源基因在对抗病原侵染中的表达情况,利用生物信息学技术,鉴定了蓖麻DL01品系中的WRKY基因,详细地分析了蓖麻WRKY的基因结构、保守基序、启动子胁迫相关的作用元件、系统进化与共线性分析等方面的数据。结果显示,蓖麻WRKY基因家族分为3个亚簇,并且第二亚簇分为5个小类,除WRKY结构域具有较高保守性,其他预测的保守基序分布在不同组别里,并有较大差异。启动子分析显示了多个生物胁迫相关元件。蓖麻灰霉菌侵染蓖麻,随着侵染时间变化,蓖麻中WRKY33的同源基因表达量有明显的上调。本研究为进一步研究WRKY基因家族在蓖麻中的生物功能,以及蓖麻中WRKY33抵抗生物胁迫所发挥的作用提供前期基础。 展开更多
关键词 wrky基因家族 wrky33 蓖麻灰霉病
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番茄SlWRKY25基因克隆及表达特性分析
7
作者 狄谦芊 单梦伟 +3 位作者 陈春林 李猛 肖怀娟 杜清洁 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第13期40-46,共7页
为阐明SlWRKY25基因在植物应对外界环境变化中的作用,以番茄品种Ailsa Craig为材料,对SlWRKY25基因进行克隆,通过生物信息学分析和SlWRKY25在不同逆境胁迫和激素处理下的表达模式分析预测其功能。结果表明,SlWRKY25的cDNA片段长936 bp,... 为阐明SlWRKY25基因在植物应对外界环境变化中的作用,以番茄品种Ailsa Craig为材料,对SlWRKY25基因进行克隆,通过生物信息学分析和SlWRKY25在不同逆境胁迫和激素处理下的表达模式分析预测其功能。结果表明,SlWRKY25的cDNA片段长936 bp,编码311个氨基酸;SlWRKY25蛋白质为不稳定亲水蛋白质,具有第Ⅱ类WRKY家族的典型结构特征;蛋白质二级结构中无规则卷曲占比最高,其次是α-螺旋、延伸链、β-转角。系统进化分析显示,SlWRKY25蛋白质与野生种潘那利番茄的氨基酸序列同源性最高。启动子分析发现,SlWRKY25启动子序列含有多种响应光、激素以及逆境胁迫的顺式作用元件。qRT-PCR结果显示,SlWRKY25受逆境(低温、干旱、盐)和激素[脱落酸、茉莉酸甲酯(ABA、MeJA)]的诱导。其中,SlWRKY25在低温胁迫下表达上调,在ABA和MeJA处理下表达量呈先增后减的趋势,在盐和干旱胁迫下表达下调。研究表明,番茄SlWRKY25表达与逆境胁迫响应关系密切,为进一步揭示番茄WRKY转录因子在逆境中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 wrky Slwrky25基因 非生物胁迫 表达特性
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菠萝蜜 WRKY 基因家族注释及在低温胁迫下的表达模式分析 被引量：1
8
作者 马湘玮 朱鹏锦 +7 位作者 杜英俊 宋奇琦 叶维雁 唐秀观 何江 钟云婕 欧景莉 庞新华 《广西植物》 北大核心 2025年第5期903-915,共13页
WRKY转录因子家族在植物生物和非生物胁迫响应过程中发挥着重要作用。该研究基于菠萝蜜全基因组,共注释出61个菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)WRKY基因家族成员,并利用生物信息学方法和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析WRKY基因家族... WRKY转录因子家族在植物生物和非生物胁迫响应过程中发挥着重要作用。该研究基于菠萝蜜全基因组,共注释出61个菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)WRKY基因家族成员,并利用生物信息学方法和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析WRKY基因家族成员在不同品种菠萝蜜低温胁迫下的表达特征。结果表明:(1)进化树分析表明,菠萝蜜、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)WRKY基因家族成员被分为4个亚族。(2)染色体定位结果显示,61个菠萝蜜WRKY基因家族成员不均匀地分布在23条染色体上。(3)保守基序和基因结构分析表明,位于同一亚族的菠萝蜜WRKY基因家族成员具有相似的保守基序和基因结构。(4)进化分析显示,菠萝蜜WRKY基因家族成员在物种内存在124对片段复制基因对;物种间分析表明,菠萝蜜与拟南芥之间的同源基因对较多,而与水稻和无花果(Ficus carica)之间的同源基因对较少且有8个基因在3个物种中形成同源基因对。(5)低温胁迫下不同品种菠萝蜜转录组分析结果表明,菠萝蜜WRKY基因家族成员在不同品种中的表达模式存在差异,qRT-PCR分析进一步验证这一结果,说明WRKY基因家族成员在不同品种菠萝蜜响应低温胁迫的过程中发挥重要作用。该研究结果为了解WRKY基因家族成员的进化和功能提供了新的见解,为菠萝蜜WRKY基因家族成员的功能研究和利用奠定了基础。 展开更多
关键词 菠萝蜜 wrky 基因家族 低温胁迫 表达模式 生物信息学分析
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WRKY转录因子调控植物次生代谢物研究进展 被引量：2
9
作者 罗贵 朱历勇 +5 位作者 谷雷 王洪程 杜旭烨 朱斌 曾拓 王彩云 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期115-128,共14页
植物次生代谢物是植物在生长过程中通过次生代谢途径合成的一类具有生理活性的有机化合物,其并不是植物生长发育的必需成分,但在植物生存、环境适应、抗逆性等方面发挥着关键作用。WRKY转录因子家族因具有特征性的保守核心序列WRKYGQK... 植物次生代谢物是植物在生长过程中通过次生代谢途径合成的一类具有生理活性的有机化合物,其并不是植物生长发育的必需成分,但在植物生存、环境适应、抗逆性等方面发挥着关键作用。WRKY转录因子家族因具有特征性的保守核心序列WRKYGQK结构域而得名,是高等植物中规模最大且功能最为多样化的转录因子家族之一,在植物界广泛分布。WRKY转录因子通过调控次生代谢产物合成参与植物的生长发育、环境应答和化学防御等多种生理过程。文章综述了WRKY转录因子的结构特征与分类,并重点讨论了其在调控植物次生代谢产物(如萜类、酚类和生物碱)合成中的研究进展。未来研究应进一步探索WRKY转录因子在植物次生代谢调控网络中的作用机制,以及在增强植物抗逆性和改良次生代谢产物品质方面的潜在应用,以期为农业生物技术的发展和植物功能性改良提供理论与实践支持。 展开更多
关键词 wrky转录因子 植物次生代谢物 萜类 酚类 生物碱
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云南红豆杉WRKY基因家族鉴定及表达模式分析 被引量：1
10
作者 甘胜美 赵燕波 +3 位作者 李洪非 王勇 王刚 黄雄 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第2期42-50,共9页
云南红豆杉是天然的抗癌植物,具有较高的药用价值。为探索WRKY转录因子在云南红豆杉次生代谢物合成过程中的作用,基于云南红豆杉基因组数据和5个组织(树皮、根、叶、茎、枝皮)的转录组数据,鉴定和分析WRKY基因家族。研究结果表明,共鉴... 云南红豆杉是天然的抗癌植物,具有较高的药用价值。为探索WRKY转录因子在云南红豆杉次生代谢物合成过程中的作用,基于云南红豆杉基因组数据和5个组织(树皮、根、叶、茎、枝皮)的转录组数据,鉴定和分析WRKY基因家族。研究结果表明,共鉴定出了25个结构较为保守的WRKY基因,其中编码蛋白的氨基酸为157~726个,分子质量为18079.40~79474.03 u,等电点为5.44~9.51,不稳定数为39.97~64.58,脂肪指数为45.17~80.41,所有蛋白质的亚细胞定位都处于细胞核内;24个TyuWRKY(云南红豆杉WRKY)基因不均衡地分布于7条染色体上,另1个WRKY基因处于ctg100上。系统发育分析表明,25个TyuWRKY蛋白被划分为3大类:6个属于Ⅰ类,18个属于Ⅱ类,1个属于Ⅲ类;同一类中TyuWRKY蛋白的Motif分布也大体相同,且成员内含子数量介于1~7个,外显子数量介于2~8个。表达量分析结果显示,除TyuWRKY5基因只在根部表达外,所有TyuWRKY基因都在5个组织中表达;通过启动子顺式作用元件分析,TyuWRKY基因包含多个与激素、胁迫以及生长发育相关的元件。 展开更多
关键词 云南红豆杉 wrky转录因子 基因家族鉴定 表达分析
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芥菜WRKY12通过与SOC1和FUL启动子相互作用调节抽薹开花 被引量：1
11
作者 黄一芳 董悦 +6 位作者 余月 刘大坤 邓琴霖 王远达 魏大勇 王志敏 汤青林 《生物工程学报》 北大核心 2025年第7期2818-2828,共11页
抽薹开花是芥菜等十字花科作物的重要农艺性状,适时开花能够确保作物产品器官的产量、品质以及种子繁育。WRKY家族在植物抽薹开花调控中起着重要作用,但芥菜WRKY12的功能及机制并不清楚。为探究WRKY12调控抽薹开花的功能及作用机制,本... 抽薹开花是芥菜等十字花科作物的重要农艺性状,适时开花能够确保作物产品器官的产量、品质以及种子繁育。WRKY家族在植物抽薹开花调控中起着重要作用,但芥菜WRKY12的功能及机制并不清楚。为探究WRKY12调控抽薹开花的功能及作用机制,本研究克隆并表征了芥菜BjuWRKY12基因,发现它在花和花序中的表达水平显著高于叶片。BjuWRKY12属于WRKY家族Ⅱc亚族,亚细胞定位表明该蛋白位于细胞核。BjuWRKY12转基因异源过表达会促进抽薹开花,使开花整合子SOC1和FUL的表达水平显著提高。进一步通过酵母单杂交和双荧光素酶报告系统实验证实,芥菜BjuWRKY12蛋白能够直接结合BjuSOC1和BjuFUL基因的启动子,发生蛋白-DNA相互作用。本研究为深入研究芥菜BjuWRKY12的调控网络及分子机制提供了新见解,并为芥菜高产优质新品种选育奠定了理论基础。 展开更多
关键词 芥菜 wrky12 抽薹开花 SOC1 FUL
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花生中镰刀菌抗性相关WRKY转录因子的挖掘及功能分析
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作者 朱立飞 王冕 +5 位作者 唐月异 张初署 陈静 周海翔 曹世宁 张建成 《花生学报》 北大核心 2025年第2期117-124,133,共9页
由镰刀菌感染引起的根腐病、果腐病等花生病害严重制约花生产业的发展,镰刀菌相关抗性基因的挖掘以及抗病新品种的培育成为亟待解决的问题。本研究以接种镰刀菌的花育20幼苗为材料,利用转录组测序挖掘花生中的差异表达基因。通过转录因... 由镰刀菌感染引起的根腐病、果腐病等花生病害严重制约花生产业的发展,镰刀菌相关抗性基因的挖掘以及抗病新品种的培育成为亟待解决的问题。本研究以接种镰刀菌的花育20幼苗为材料,利用转录组测序挖掘花生中的差异表达基因。通过转录因子预测、功能注释等方法筛选获得31个受镰刀菌诱导表达的WRKY转录因子;利用多序列比对、保守基序分析、GO分类和KEGG富集分类分析以及蛋白互作网络分析等方法对31个转录因子进行分类及功能鉴定。结果显示:镰刀菌侵染后,31个WRKY转录因子均为上调表达;31个转录因子根据结构域特点分为3类,Ⅰ类4个,Ⅱ类18个、Ⅲ类9个;在植物-病原体互作通路中有4个WRKY转录因子均与VQ蛋白互作,且共同富集在植物MAPK级联途径中。本研究为镰刀菌抗性相关基因的挖掘及功能分析提供了新方向,也为后续开展花生中抗病调控网络机制的解析工作奠定了基础。 展开更多
关键词 花生 wrky转录因子 镰刀菌 抗性基因挖掘 功能分析
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洋葱WRKY基因家族鉴定及其在鳞茎发育过程中的表达分析
13
作者 李艳伟 王振宝 +3 位作者 杨妍妍 霍雨猛 孙亚玲 刘冰江 《山东农业科学》 北大核心 2025年第1期1-11,共11页
为了探讨洋葱WRKY转录因子家族的功能,本研究基于洋葱全基因组和鳞茎不同发育时期的转录组数据,利用生物信息学方法筛选并鉴定到55个AcWRKY基因家族成员,其编码蛋白序列长度为144~683 aa,等电点为5.11~9.65,脂肪系数为47.14~77.24,均为... 为了探讨洋葱WRKY转录因子家族的功能,本研究基于洋葱全基因组和鳞茎不同发育时期的转录组数据,利用生物信息学方法筛选并鉴定到55个AcWRKY基因家族成员,其编码蛋白序列长度为144~683 aa,等电点为5.11~9.65,脂肪系数为47.14~77.24,均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果表明,这55个AcWRKY蛋白都定位在细胞核中。进化树分析显示,洋葱WRKY家族基因分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ三大类,其中GroupⅡ组可进一步分为5个亚组,洋葱和拟南芥WRKY蛋白在各组中均有分布,推测相同组或亚组中洋葱与拟南芥的WRKY转录因子可能具有相似的功能。保守结构域分析发现,所有AcWRKYs均具有高度保守的WRKYGQK基序及其特有的锌指结构,少数成员存在保守结构域的变异。基因结构和保守基序分析结果显示,不同AcWRKY成员的外显子和motif在数量和分布上存在一定差异,同一组或亚组的成员表现出一定的相似性。转录组数据分析结果表明,绝大多数AcWRKYs基因直接或者间接参与了洋葱鳞茎的发育与形成。本研究结果可为深入研究AcWRKY基因在洋葱鳞茎形成中的机制提供参考。 展开更多
关键词 洋葱 wrky基因家族 生物信息学分析 基因表达 转录组分析
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基于氮素响应转录组的青檀(Pteroceltis tatarinowii)WRKY基因鉴定
14
作者 郭伟 李国华 +7 位作者 罗磊 王迎 杜辉 高红 燕语 穆淑媛 韩秀 张林 《分子植物育种》 北大核心 2025年第7期2338-2344,共7页
青檀是中国特有的单属种植物,耐干旱瘠薄,是石灰岩山地造林的先锋树种,其韧皮纤维是用来制作“宣纸”的原材料。WRKY蛋白是一类在植物应对生物和非生物胁迫中发挥关键作用的超级转录因子家族。为了挖掘青檀在不同氮素水平响应过程中的W... 青檀是中国特有的单属种植物,耐干旱瘠薄,是石灰岩山地造林的先锋树种,其韧皮纤维是用来制作“宣纸”的原材料。WRKY蛋白是一类在植物应对生物和非生物胁迫中发挥关键作用的超级转录因子家族。为了挖掘青檀在不同氮素水平响应过程中的WRKY转录因子基因,本研究利用青檀全长转录组数据,筛选到了10个包含完整蛋白编码区的WRKY基因,随后对这些WRKY蛋白的保守结构域进行了分析。生物信息学分析的结果表明:PtaWRKY1、PtaWRKY2、PtaWRKY3、PtaWRKY4、PtaWRKY7、PtaWRKY9、PtaWRKY10属于WRKY转录因子的第Ⅱ组;PtaWRKY5、PtaWRKY6、PtaWRKY8属于WRKY转录因子的第Ⅰ组。PtaWRKY2编码的蛋白序列最短,为289 aa,等电点为5.40;PtaWRKY8编码的蛋白序列最长,为519 aa,等电点为5.52。表达分析结果显示PtaWRKY1、PtaWRKY4、PtaWRKY5、PtaWRKY7、PtaWRKY8、PtaWRKY10的表达水平随着氮素浓度升高而降低,表明这6个基因在青檀的氮素响应过程中可能起到重要作用。 展开更多
关键词 青檀 全长转录组 wrky转录因子
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过表达野菊CiWRKY15基因增强拟南芥镉耐性
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作者 付季城 陈胜艳 +4 位作者 岳莉然 孙颖 李强 何淼 郑永莉 《东北林业大学学报》 北大核心 2025年第4期30-36,共7页
为探究野菊CiWRKY15转录因子在镉胁迫下的功能,丰富野菊遗传资源。以野菊(Chrysanthemum indicum)为材料,克隆了野菊CiWRKY15基因并转化拟南芥,测定和分析了其在镉胁迫下的各项生理指标。结果表明:野菊CiWRKY15基因开放阅读框长801 bp,... 为探究野菊CiWRKY15转录因子在镉胁迫下的功能,丰富野菊遗传资源。以野菊(Chrysanthemum indicum)为材料,克隆了野菊CiWRKY15基因并转化拟南芥,测定和分析了其在镉胁迫下的各项生理指标。结果表明:野菊CiWRKY15基因开放阅读框长801 bp,编码266个氨基酸,属于WRKYⅡ亚族,受镉诱导其表达量在叶、茎、根中均显著上调。在镉胁迫条件下,过表达拟南芥株系幼苗根长更长;植株表现出更强的镉转运能力,同时叶绿素、可溶性糖、脯氨酸质量分数及抗氧化酶活性相比野生型显著增加,而过氧化氢、丙二醛质量摩尔浓度及相对电导率显著降低。说明野菊CiWRKY15基因受镉胁迫诱导,在增强镉耐性方面发挥积极作用。 展开更多
关键词 野菊 wrky转录因子 镉胁迫 拟南芥
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WRKY基因家族在植物中的研究进展
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作者 陈彩锦 马琳 +6 位作者 包明芳 蒋庆雪 张国辉 张尚沛 高婷 刘文辉 王学敏 《草地学报》 北大核心 2025年第7期2059-2069,共11页
WRKY蛋白是植物中发现的最大转录因子(Transcription factors,TFs)家族之一。该家族成员在植物的生长发育、生物量形成、次生代谢物合成、响应生物或非生物胁迫中发挥着重要的双向调控作用。本文主要从WRKY TFs的结构特征、分类,以及近... WRKY蛋白是植物中发现的最大转录因子(Transcription factors,TFs)家族之一。该家族成员在植物的生长发育、生物量形成、次生代谢物合成、响应生物或非生物胁迫中发挥着重要的双向调控作用。本文主要从WRKY TFs的结构特征、分类,以及近5年挖掘出的在植物生长发育、次生代谢物合成、生物和非生物胁迫下的生物学功能进行全面综述,并对WRKY家族成员后续的相关研究进行了展望,旨在为植物WRKY基因家族成员的进一步挖掘及其生物学功能的研究提供参考依据。 展开更多
关键词 wrky 生长发育 次生代谢 生物胁迫 非生物胁迫
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基于福建柏转录组数据的WRKY转录因子的鉴定和分析
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作者 杨靖 周成城 +3 位作者 徐艳萍 荣俊冬 郑郁善 陈礼光 《分子植物育种》 北大核心 2025年第1期92-98,共7页
本研究基于福建柏叶根茎的转录组数据并筛选鉴定福建柏的WRKY转录因子,以期挖掘出参与福建柏生长发育及抗逆反应的WRKY转录因子,为日后利用遗传改良手段调控福建柏生长发育及抗逆反应调节提供理论基础。结果表明,共鉴定出WRKY的数量为61... 本研究基于福建柏叶根茎的转录组数据并筛选鉴定福建柏的WRKY转录因子,以期挖掘出参与福建柏生长发育及抗逆反应的WRKY转录因子,为日后利用遗传改良手段调控福建柏生长发育及抗逆反应调节提供理论基础。结果表明,共鉴定出WRKY的数量为61个;亚细胞定位结果表明均定位于细胞核中;GO结果显示与生物过程、分子功能和细胞组分相关的GO terms的数量分别为453、196和128个;61个福建柏WRKY转录因子中的N端和C端的保守基序分别为:-WRKYGQK-,-C-(X4-7)-C-(X22-23)-H(X)H/C-;与拟南芥WRKY转录因子的系统进化树表明,除了Ⅱa、Ⅲb亚家族没有分布,其他亚家族中均有福建柏与拟南芥WRKY转录因子聚为一类。热图分析表明福建柏WRKY转录因子具有组织差异性表达,RT-qPCR的结果验证了部分WRKY基因存在组织差异性表达。 展开更多
关键词 福建柏 wrky 功能注释 抗逆反应
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青花菜BoWRKY53基因克隆与表达模式分析
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作者 丁强强 贾利 +8 位作者 葛治欢 严从生 翟永琪 俞飞飞 张其安 王艳 江海坤 董言香 王明霞 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第10期136-141,共6页
以青花菜自交系V04D0002为试验材料,利用PCR技术在幼苗cDNA中克隆得到2个WRKY53同源基因BoWRKY53-1和BoWRKY53-2,其编码区长度分别为948和966 bp,分别编码315和321个氨基酸,蛋白序列相似度为95%,亚细胞定位预测均定位于细胞核中。qRT-PC... 以青花菜自交系V04D0002为试验材料,利用PCR技术在幼苗cDNA中克隆得到2个WRKY53同源基因BoWRKY53-1和BoWRKY53-2,其编码区长度分别为948和966 bp,分别编码315和321个氨基酸,蛋白序列相似度为95%,亚细胞定位预测均定位于细胞核中。qRT-PCR结果表明,这2个基因在青花菜的叶片、花球和花中都有表达,且均在花球中的相对表达量较高。此外,BoWRKY53-2在低温胁迫处理后3、6、9 h的相对表达量均显著高于对照,BoWRKY53-1在低温胁迫处理后6 h的相对表达量显著高于对照,表明这2个基因能够积极响应低温胁迫。 展开更多
关键词 青花菜 wrky53 序列分析 表达模式
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多花黄精PcWRKY1基因的克隆及响应高温胁迫功能分析
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作者 贾慧 赵玉龙 +4 位作者 郭晓阳 杨铁钢 郭红霞 苏秀红 腊贵晓 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期200-208,共9页
探究WRKY转录因子家族在多花黄精(Polygonatum cyrtonema Hua)适应高温胁迫中的作用,基于前期转录组分析鉴定到受高温影响显著下调的基因PcWRKY1,克隆了PcWRKY1基因,并利用生物信息学、RT-qPCR和玉米原生质体瞬时转化体系等技术对其编... 探究WRKY转录因子家族在多花黄精(Polygonatum cyrtonema Hua)适应高温胁迫中的作用,基于前期转录组分析鉴定到受高温影响显著下调的基因PcWRKY1,克隆了PcWRKY1基因,并利用生物信息学、RT-qPCR和玉米原生质体瞬时转化体系等技术对其编码蛋白的基本特性、组织表达特异性、高温胁迫下表达模式及功能进行了分析。结果显示:PcWRKY1基因CDS序列全长共1560 bp,编码519个氨基酸;PcWRKY1蛋白没有跨膜结构,分子量为56.93 ku,等电点为7.2,具有2个WRKY保守结构域,属于GroupⅠa类群;RT-qPCR分析结果显示,PcWRKY1基因在多花黄精不同组织中均有表达,且在种子中表达量最高,其转录水平受高温胁迫的抑制;玉米原生质体中PcWRKY1定位于细胞核中,且高温处理不影响其位点;在玉米原生质体中瞬时过表达PcWRKY1,与无高温胁迫相比,抑制了过氧化氢酶(CAT)活性的增加,提高了高温胁迫诱导的丙二醛(MDA)含量的增加,说明过表达PcWRKY1降低了原生质体在高温胁迫下的耐性。综上所述,PcWRKY1可能在多花黄精响应高温胁迫中起负调控作用。 展开更多
关键词 多花黄精 wrky转录因子 高温胁迫 生物信息学分析 功能分析
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半夏WRKY转录因子家族鉴定及温度调控下表达模式分析
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作者 曹小凤 刘汶泽 +8 位作者 周省委 宋焕芬 王梦萍 谢冰倩 初雷霞 杨林林 董宁 乔璐 董诚明 《植物生理学报》 北大核心 2025年第10期1401-1413,共13页
WRKY转录因子在植物生长发育及逆境响应中具有重要调控作用,然而其在半夏中的功能及对“倒苗”现象的调控机制尚不明确。本研究通过全基因组鉴定半夏PtWRKY基因家族成员,分析其分子特性及功能。基于半夏基因组数据,利用生物信息学方法... WRKY转录因子在植物生长发育及逆境响应中具有重要调控作用,然而其在半夏中的功能及对“倒苗”现象的调控机制尚不明确。本研究通过全基因组鉴定半夏PtWRKY基因家族成员,分析其分子特性及功能。基于半夏基因组数据,利用生物信息学方法系统筛选PtWRKY基因家族成员,分析其理化性质、系统进化关系、基因结构、保守基序、染色体分布及启动子顺式作用元件,并对温度调控下PtWRKY基因家族的表达模式进行分析。结果共鉴定到43个PtWRKY基因,可分为四个亚家族;基因结构分析显示外显子-内含子数量具有特异性;启动子区域包含光响应、激素(如脱落酸、茉莉酸甲酯)及胁迫相关元件;半夏PtWRKY基因形成3对同源基因对,并有7个基因与拟南芥存在共线性关系。温度控制条件下表达模式分析发现9个PtWRKY基因在高温条件下表达量提升。PtWRKY基因家族可能通过响应环境信号调控半夏生长发育及倒苗过程。本研究旨在揭示该家族在半夏生长发育中的调控机制,为解析半夏温度胁迫响应及倒苗机理提供理论依据。 展开更多
关键词 半夏 wrky转录因子 生物学功能 表达模式 温度 倒苗
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