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利用PCR-DGGE技术监测Lactobacillus plantarum WCFS1对小鼠肠道菌群的动态变化 被引量:4
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作者 吴青龙 陈廷涛 +3 位作者 熊顺强 姜淑英 李胜杰 魏华 《南昌大学学报(理科版)》 CAS 北大核心 2011年第6期559-563,共5页
利用传统培养法和变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)评价Lactobacillus plantarum WCFS1对小鼠肠道微生物数量和种类的影响。结果表明,乳酸杆菌数量在灌胃期和恢复期较空白期显著升高(P<0.05),而肠杆菌数量在灌胃期和恢复期较空白期显... 利用传统培养法和变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)评价Lactobacillus plantarum WCFS1对小鼠肠道微生物数量和种类的影响。结果表明,乳酸杆菌数量在灌胃期和恢复期较空白期显著升高(P<0.05),而肠杆菌数量在灌胃期和恢复期较空白期显著下降(P<0.01);DGGE图谱及多样性分析显示小鼠灌胃期间菌群多样性显著提高(P<0.01),但在停止灌胃7d后与空白期相比无显著性差异(P>0.05)。此外,DGGE条带测序表明Lacto-bacillus plantarum WCFS1在灌胃期间可在大部分小鼠肠道内占据优势地位。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 LACTOBACILLUS PLANTARUM wcfs1 微生物菌群 活菌计数
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植物乳植杆菌WCFS1胞外多糖生物合成基因簇鉴定及其转录组差异表达基因功能研究
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作者 孙娅西 王智浩 +5 位作者 刘莹莹 黄淑婷 赵芳 吕广萍 宦海琳 杨瑶 《食品工业科技》 2026年第2期180-190,共11页
目的:本研究针对植物乳植杆菌WCFS1菌株,研究其不同胞外多糖合成基因簇(cps)的构效关系,为进一步研究乳酸菌胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)的菌株特异性奠定基础。方法:利用Cre-loxP同源重组和CRISPR/Cas9技术构建WCFS1菌株的突变株W... 目的:本研究针对植物乳植杆菌WCFS1菌株,研究其不同胞外多糖合成基因簇(cps)的构效关系,为进一步研究乳酸菌胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)的菌株特异性奠定基础。方法:利用Cre-loxP同源重组和CRISPR/Cas9技术构建WCFS1菌株的突变株WCFS1∆cps1-3和WCFS1∆cps4;以野生菌为对照,研究不同突变株生长、合成EPS产量及单糖组成等理化特性;利用转录组学分析WCFS1∆cps1-3突变株在3种培养条件下差异表达基因功能。结果:WCFS1∆cps4突变株菌体合成EPS产量下降更多,降至野生型的62.2%,菌体生长迟缓,到达稳定期的时间由12 h延迟至32 h,但生物量不变;WCFS1∆cps1-3突变株合成EPS单糖组成变化较大,甘露糖的组分显著上升至32.68%,半乳糖组分显著下降至3.83%,而鼠李糖组分则未检出;相比野生菌,改变不同培养条件,WCFS1∆cps1-3突变株显著性差异表达的基因数目仅占MRS培养条件下的5.1%(上调)和6.8%(下调),GO和KEGG分析显示功能也有较大变化。结论:WCFS1菌株不同cps簇构效关系不同,基因序列高度保守的cps4簇可能通过调控合成EPS的产量以保证菌体正常生长,而cps1-3簇可能通过调控EPS的单糖组成使菌株在环境适应性方面更具优势。 展开更多
关键词 植物乳植杆菌wcfs1 胞外多糖(EPS) cps基因簇 基因敲除 转录组分析
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PPI网络比对用于植物乳杆菌的糖代谢研究 被引量:2
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作者 苗孟君 丁彦蕊 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2018年第6期49-54,共6页
蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI网络)比对是预测蛋白质相互作用,分析不同物种之间功能差异的重要手段。为研究植物乳杆菌WCFS1和JDM1糖代谢功能模块差异,采用Evolutionary Graph Edit Distance Algorithm算法对两者的糖酵解、戊糖磷酸... 蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI网络)比对是预测蛋白质相互作用,分析不同物种之间功能差异的重要手段。为研究植物乳杆菌WCFS1和JDM1糖代谢功能模块差异,采用Evolutionary Graph Edit Distance Algorithm算法对两者的糖酵解、戊糖磷酸途径、柠檬酸循环三个模块PPI网络进行比对。实验表明,两者的三个模块边正确性分别达到93.6%、96%、100%,表明其拓扑结构极其相似,戊糖磷酸途径中,WCFS1存在蛋白质2-keto-3-deoxygluconate kinase(kdg K),但JDM1中没有kdg K,却有其产物2-keto-3-deoxy-6-phospho-gluconate aldolase(JDM1_0578)。糖酵解模块中,推测蛋白质pyruvate dehydrogenase complex,E2 component(pdh C)与pyruvate kinase(pyk)具有相互作用。实验表明,PPI网络比对可以阐明两者糖代谢PPI网络的拓扑相似性及模块差异,预测蛋白质之间的相互作用。 展开更多
关键词 PPI网络比对 植物乳杆菌wcfs1和JDM1 糖代谢功能模块
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