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基于Ualcan数据库分析WASH2P在结肠癌中的表达及预后 被引量:4
1
作者 吴迪 苏琪 殷红专 《解剖科学进展》 2019年第6期645-647,共3页
目的通过Ualcan数据库分析WASH2P在结直肠癌中的表达及意义。方法利用UALCAN数据库分析结肠癌中WASH2P的表达水平,并分析其与肿瘤分期、种族、性别、体重、病理亚型之间的关系;对WASH2P进行生存分析,并利用GEPIA数据库进行验证;对结肠癌... 目的通过Ualcan数据库分析WASH2P在结直肠癌中的表达及意义。方法利用UALCAN数据库分析结肠癌中WASH2P的表达水平,并分析其与肿瘤分期、种族、性别、体重、病理亚型之间的关系;对WASH2P进行生存分析,并利用GEPIA数据库进行验证;对结肠癌中WASH2P与MSH5和PMS2的协同表达情况进行分析。结果 WASH2P在结肠癌组织中的表达高于正常组织,WASH2P高表达的结肠癌患者预后差,WASH2P与MSH5、PMS2的表达存在明显的相关性。结论 WASH2P可能是治疗结肠癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 结肠癌 WASH2P TCGA ualcan数据库
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利用UALCAN与ENCORI数据库分析lncRNAH19在甲状腺癌中的表达及其作用机制 被引量:2
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作者 张晓敏 徐坤 +1 位作者 胡彩虹 何继瑞 《甘肃科技》 2022年第12期103-108,共6页
本研究旨在研究长链非编码RNA(lncRNA)H19在甲状腺癌(THCA)中的表达情况及其潜在分子机制。通过UALCAN数据库对H19在THCA中的表达和预后进行分析;利用RNA相互作用百科全书(ENCORI)和调控性RNA 2.0(RegRNA 2.0)数据库对H19靶基因进行预测... 本研究旨在研究长链非编码RNA(lncRNA)H19在甲状腺癌(THCA)中的表达情况及其潜在分子机制。通过UALCAN数据库对H19在THCA中的表达和预后进行分析;利用RNA相互作用百科全书(ENCORI)和调控性RNA 2.0(RegRNA 2.0)数据库对H19靶基因进行预测,并对预测获得的靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析;分析靶基因母体抗生物皮肤生长因子同源物4(SMAD4)在THCA中的表达、预后及其与H19的表达相关性。结果显示:H19在THCA中的表达与肿瘤分期显著相关,进入3期以后则显著升高,H19高表达的THCA患者其预后生存率明显低于中低表达的患者;H19和SMAD4基因的表达呈显著负相关,SMAD4在THCA中的表达显著下调,且SMAD4表达下调与THCA患者不良预后有关。推测在THCA中,H19可能通过与SMAD4相互作用下调其表达,从而对转化生长因子-β(GF-β)信号通路产生抑制,进而促进了THCA的发生、发展。 展开更多
关键词 长链非编码RNA ualcan H19 母体抗生物皮肤生长因子同源物4(SMAD4) 甲状腺癌
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FOXP3和FOXO4基因在口腔鳞状细胞癌中的预后分析
3
作者 毛家奇 赵力如 +5 位作者 杨冬茹 魏梓轩 齐霞 李雅 梁向阳 李淑娟 《现代口腔医学杂志》 2025年第2期125-129,共5页
目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后... 目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后分析。real-timePCR检测人口腔角质细胞(HumanOral Keratinocytes,HOK)和CAL27人舌鳞状细胞癌细胞(CAL27 Human Tongue Squamous Cell Carcinoma,CAL27)中FOXP3和FOXO4的mRNA表达。结果①FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达均出现明显差异性变化。②FOXP3和FOXO4的mRNA表达与OSCC患者的癌症分期、肿瘤分级和预后显著相关。③FOXP3和FOXO4的基因改变可能会显著影响OSCC患者的预后。④与HOK细胞相比,CAL27细胞中FOXP3和FOXO4的mRNA表达明显降低(P<0.05)。结论①FOXP3和FOXO4是口腔鳞状细胞癌OS的独立生存因素。②FOXP3和FOXO4可以作为口腔鳞状细胞癌患者生存的预后标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 FOXP3 FOXO4 口腔鳞状细胞癌 ualcan Kaplan-Meier Plotter
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基于Ualcan数据库分析caspase-7在结肠癌中的表达和意义
4
作者 闫兆鹏 王睿 苏琪 《中国医师进修杂志》 2019年第2期158-160,共3页
目的通过Ualcan数据库探讨caspase-7(CASP7)在结肠癌中的表达和意义。方法统计Ualcan数据库中CASP7在结肠癌中的表达情况并进行生存分析,通过Oncolnc数据库对得出的结果进行验证。并分析CASP7与KRAS基因和TP53I3基因的协同表达情况。结... 目的通过Ualcan数据库探讨caspase-7(CASP7)在结肠癌中的表达和意义。方法统计Ualcan数据库中CASP7在结肠癌中的表达情况并进行生存分析,通过Oncolnc数据库对得出的结果进行验证。并分析CASP7与KRAS基因和TP53I3基因的协同表达情况。结果在结肠癌中,CASP7的表达较低,且低表达者的预后劣于高表达者。CASP7与KRAS基因和TP53I3基因存在共表达。结论CASP7在结肠癌中存在低表达且与不良预后相关。 展开更多
关键词 结肠癌 CASPASE-7 ualcan数据库
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CEACAM8与胃癌患者生存关系的生物信息学分析
5
作者 孙烨煜 姜艳芳 +2 位作者 李娜 李浩 贺延新 《临床医学进展》 2025年第1期49-54,共6页
胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研... 胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研究了CEACAM8在胃癌预后中的作用。发现CEACAM8的过表达与胃癌患者的临床肿瘤分期和病理肿瘤分级显著相关。此外,CEACAM8 mRNA的高表达与胃癌患者较短的总生存期(OS)显著相关。总的来说,CEACAM8可能是胃癌患者生存的预后生物标志物。Gastric cancer directly affects human quality of life worldwide, and some members of the carcinoembryonic antigen-associated cell adhesion molecule (CEACAM) subfamily are not regulated in tumors. Little is known about the function of CEACAM8 in gastric cancer. In order to solve this problem, this study used UALCAN, Kaplan-Meier Plotter and metascape databases to study the role of CEACAM8 in the prognosis of gastric cancer. It was found that the overexpression of CEACAM8 was significantly correlated with the clinical tumor stage and pathological tumor grade of gastric cancer patients. In addition, high expression of CEACAM8 mRNA was significantly associated with shorter overall survival (OS) in patients with gastric cancer. Overall, CEACAM8 may be a prognostic biomarker for survival in patients with gastric cancer. 展开更多
关键词 胃癌 CEACAM8 预后 ualcan Kaplan-Meier Plotter
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B细胞淋巴瘤因子3基因mRNA在肾透明细胞癌中的表达及其与预后的关系 被引量:1
6
作者 孙向飞 龚伟 +1 位作者 董济民 陈小波 《临床内科杂志》 CAS 2020年第12期855-858,共4页
目的探讨B细胞淋巴瘤因子3(BCL3)基因mRNA在肾透明细胞癌中的表达及其与预后的关系。方法纳入癌症基因组图谱(TCGA)数据库截止2019年10月收录的肾脏正常组织(正常肾组织组,72例)及原发肾透明细胞癌组织(肾透明细胞癌组织组,533例),根据... 目的探讨B细胞淋巴瘤因子3(BCL3)基因mRNA在肾透明细胞癌中的表达及其与预后的关系。方法纳入癌症基因组图谱(TCGA)数据库截止2019年10月收录的肾脏正常组织(正常肾组织组,72例)及原发肾透明细胞癌组织(肾透明细胞癌组织组,533例),根据分期将原发肾透明细胞癌组织组分为Ⅰ期组(267例)、Ⅱ期组(57例)、Ⅲ期组(123例)、Ⅳ期组(84例)。再根据是否有淋巴结转移将256例组织分为无转移组(N0组,240例)和转移组(N1组,16例),根据基因表达信息将380例组织分为透明细胞A型(ccA)组(205例)及透明细胞B型(ccB)组(175例)。收集肾透明细胞癌患者的临床特征数据,包括肿瘤分期、透明细胞亚型、淋巴结转移状态及总生存(OS)期。同时收集正常肾组织组及肾透明细胞癌组织组中BCL3基因mRNA的表达水平并比较。采用Kaplan-Meier生存分析法对BCL3基因mRNA表达情况与肾透明细胞癌患者OS期的关系进行分析。结果BCL3基因mRNA在肾透明细胞癌组织组中的表达水平明显高于正常组织组(P=0.0004)。肾透明细胞癌组织Ⅰ~Ⅳ期组组织中BCL3基因mRNA表达水平均高于正常肾组织组(P<0.05);Ⅲ期、Ⅳ期组组织中BCL3基因mRNA的表达水平均高于Ⅰ期组(P<0.01)。N0组和N1组组织中BCL3基因mRNA表达水平比较差异无统计学意义(P=0.1115)。ccB组组织中BCL3基因mRNA表达水平高于ccA组(P=0.010)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,BCL3基因mRNA的高表达预示肾透明细胞癌患者OS期更短(P<0.001)。结论BCL3基因mRNA在肾透明细胞癌组织中呈高表达,且这种高表达与更差的预后有关。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 B细胞淋巴瘤因子3 MRNA 癌症基因组图谱 ualcan
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基于数据挖掘分析LUM基因在胃癌中的表达及意义 被引量:1
7
作者 彭帅 田敏秀 +2 位作者 王珊珊 李慧敏 沈磊 《肿瘤预防与治疗》 2020年第7期561-566,共6页
目的:通过数据库分析LUM基因在胃癌中的表达情况及意义。方法:通过Oncomine数据库分析LUM基因在胃癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析LUM基因表达与胃癌患者生存周期的关系;同时利用MethHC数据库分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA数... 目的:通过数据库分析LUM基因在胃癌中的表达情况及意义。方法:通过Oncomine数据库分析LUM基因在胃癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析LUM基因表达与胃癌患者生存周期的关系;同时利用MethHC数据库分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA数据集的UALCAN在线数据库对LUM在胃癌患者中的表达及预后进行验证;并通过String数据库分析LUM基因的蛋白相互作用及上下游调控关系。结果:胃癌组织中LUM的mRNA表达较正常对照组明显增高;Meta分析进一步证实LUM基因的表达在胃癌组织中明显增高。GEPIA分析发现高表达组患者生存周期明显短于低表达组(P<0.05)。与此同时,甲基化分析中得出LUM基因甲基化水平肿瘤组明显高于正常组;TCGA数据集验证显示LUM在胃癌组织中的表达量与预后有关;蛋白质网络分析得出,LUM可能与OGN、CHST1、CHST5、CHST6、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A2、ACAN等蛋白相互作用。结论:基于多个数据库的数据挖掘发现,LUM基因在胃癌组织中呈现高表达,且其表达水平与胃癌患者总体生存相关;LUM是与胃癌预后相关的生物标志物,参与肿瘤的发生发展,或可作为诊断和治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 胃癌 LUM 数据挖掘 Oncomine ualcan
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CEACAM5在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
8
作者 刘传 李丽娟 +1 位作者 王嵘 汤兵祥 《临床肺科杂志》 2022年第2期256-261,共6页
目的通过检测癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)在肺腺癌中的表达,探究其临床意义及预后。方法回顾性分析2016年8月-2017年8月在本院确诊为肺腺癌的患者51例,取肺腺癌患者病变肺部组织作为实验组;从中选取42例取癌旁组织作为对照组。... 目的通过检测癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)在肺腺癌中的表达,探究其临床意义及预后。方法回顾性分析2016年8月-2017年8月在本院确诊为肺腺癌的患者51例,取肺腺癌患者病变肺部组织作为实验组;从中选取42例取癌旁组织作为对照组。采用免疫组化SP法检测肺部肺腺癌组织和癌旁组织CEACAM5的表达,并利用UALCAN数据库(http://ualcan.path.uab.edu/analysis.html)分析肺腺癌中CEACAM5的表达与性别、年龄、分期的关系;采用Kaplan-Meier生存曲线对CEACAM5进行生存分析,COX回归分析影响肺腺癌的因素,并分析肺腺癌中CEACAM5表达与CEACAM6、CEACAM1的相关性。结果 Ualcan数据库显示CEACAM5在肺腺癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05);CEACAM5高表达的肺腺癌患者远期生存率与低表达患者相比,差异无统计学意义(P>0.05);肺腺癌中CEACAM5与CEACAM6、CEACAM1存在明显的相关性(r=0.48,0.43,P<0.05)。本实验结果显示,实验组CEACAM5阳性率62.75%高于对照组21.43%(P<0.05),其中CEACAM5阳性组在年龄、临床分期、淋巴结转移、肿瘤分化程度、肿瘤大小与阴性组比较差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier生存曲线显示,CEACAM5阳性表达患者生存率50%,低于阴性表达生存率78.9%,两组比较log-rank值为4.324,P=0.038;COX回归分析显示,CEACAM5及临床分期、淋巴结转移均是影响肺腺癌预后的危险因素。结论肺腺癌患者CEACAM5阳性率高于癌旁组织,与肺腺癌患者预后有关,且CEACAM5及临床分期、淋巴结转移,均是影响肺腺癌预后的危险因素,推测CEACAM5可能是治疗肺腺癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 癌胚抗原相关细胞黏附分子5 ualcan数据库 临床意义
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CLDN11在肿瘤中的表达水平及临床预后价值研究 被引量:2
9
作者 陈倩雅 杨广达 谢德荣 《国际医药卫生导报》 2020年第19期2875-2880,共6页
目的探讨claudin-11(CLDN11)在各种肿瘤中的表达水平及其与临床预后的相关性。方法采用ONCOMINE和UALCAN数据库分析CLDN11在肿瘤中的转录水平;利用KM-plotter数据库评估CLDN11对肿瘤的临床预后价值。结果综合ONCOMINE和UALCAN数据库分... 目的探讨claudin-11(CLDN11)在各种肿瘤中的表达水平及其与临床预后的相关性。方法采用ONCOMINE和UALCAN数据库分析CLDN11在肿瘤中的转录水平;利用KM-plotter数据库评估CLDN11对肿瘤的临床预后价值。结果综合ONCOMINE和UALCAN数据库分析表明:CLDN11在大多数肿瘤中是低表达的,尤其在乳腺癌、结直肠腺癌、肾癌、肺腺癌等肿瘤中。使用KM-plotter数据库进行临床预后分析表明:CLDN11在食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肾乳头状细胞癌、胰腺癌、胃癌、子宫内膜癌、睾丸生殖细胞肿瘤的高表达水平,预示更差的无进展生存期;而在肝癌、肉瘤中则预示更好的无进展生存期。CLDN11在肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、胃癌、甲状腺癌和子宫内膜癌中的高表达水平预示更差的总生存期,而在乳腺癌中则预示更好的总生存期。结论CLDN11能够作为多种肿瘤的预后指标,但是仍需要进一步的实验验证。 展开更多
关键词 CLDN11 ONCOMINE ualcan KM-plotter 无进展生存期
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Clinical data analysis reveals the role of OGR1 (GPR68) in head and neck squamous cancer 被引量:4
10
作者 Wenlong Zhang Yong Han +4 位作者 Weisha Li Lin Cao Libo Yan Chuan Qin Ran Gao 《Animal Models and Experimental Medicine》 CSCD 2020年第1期55-61,I0002,共8页
Background:Head and neck squamous cancer(HNSC)frequently occurs in the clinic.Revealing the role of the genes that correlate with cancer cell outgrowth will contribute to potential treatment target identification and ... Background:Head and neck squamous cancer(HNSC)frequently occurs in the clinic.Revealing the role of the genes that correlate with cancer cell outgrowth will contribute to potential treatment target identification and tumor inhibition.Methods:The gene expression profiles and gene ontology of the proton-sensing G-protein-coupled receptor OGR1 were analyzed using the TCGA(The Cancer Genome Atlas)database.The effects of sex,age,race,and degree of malignancy on HNSC were investigated,and the survival times of HNSC patients with high or low/medium expression levels of OGR1 were compared.Methylation of the OGR1 promoter CpG sites was also investigated and OGR1-related genes were analyzed using gene set enrichment analysis.Results:OGR1 is overexpressed in HNSC patients.However,compared with the low/median expression group,the high OGR1 expression group did not have different survival rates.The OGR1 expression level differed across sex,age,race,and degree of malignancy,while the methylation of the OGR1 promoter CpG sites was maintained at a similar level.Gene set enrichment analysis revealed that OGR1 was positively correlated with head and neck cancer,cisplatin resistance,hypoxia,angiogenesis,cell migration,and TGF-β.Conclusion:The expression of OGR1 correlated with HNSC progression and survival and thus can serve as a potential treatment target and prognostic marker. 展开更多
关键词 HEAD and NECK SQUAMOUS cancer(HNSC) OGR1 TCGA ualcan
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基于数据分析CDKN2A基因在软组织肉瘤中的表达和意义
11
作者 齐江华 秦三利 +5 位作者 梁福东 刘利兵 潘东升 甘雨灵 李廷栋 梁鹏 《甘肃医药》 2023年第3期224-227,共4页
目的:分析挖掘CDKN2A基因与软组织肉瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较CDKN2A基因在软组织肉瘤中的表达及与临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:CDKN2A基因在软组织肉瘤组织... 目的:分析挖掘CDKN2A基因与软组织肉瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较CDKN2A基因在软组织肉瘤中的表达及与临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:CDKN2A基因在软组织肉瘤组织中高度表达,但其表达与临床预后无统计学差异,仅仅表现出相关性趋势。与CDKN2A基因关系紧密的上下游基因蛋白有11个,相互作用关系较为复杂。结论:CDKN2A基因表达与软组织肉瘤高度相关,并且在软组织肉瘤中参与多条细胞信号通路,所起的作用非常复杂,可作为研究软组织肉瘤病因及治疗的切入点。 展开更多
关键词 CDKN2A基因 软组织肉瘤 GEPIA数据库 ualcan数据库 String数据库
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基于数据挖掘分析ABCB5基因在恶性黑色素瘤中的表达和意义
12
作者 齐江华 秦三利 +4 位作者 梁福东 刘利兵 甘雨灵 李廷栋 梁鹏 《甘肃医药》 2022年第7期604-607,614,共5页
目的:挖掘ABCB5基因与恶性黑色素瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较ABCB5基因在恶性黑色素瘤中的表达及与病理分期、临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:ABCB5基因在恶性黑色... 目的:挖掘ABCB5基因与恶性黑色素瘤之间的关系。方法:利用GEPIA数据库、UALCAN数据库及String数据库中的数据资料,分析比较ABCB5基因在恶性黑色素瘤中的表达及与病理分期、临床生存期及相关上下游蛋白的关系。结果:ABCB5基因在恶性黑色素瘤组织中高度表达,但其表达与肿瘤的病理分期、临床预后等方面无统计学差异,仅仅表现出相关性趋势。与ABCB5基因关系紧密的上下游基因蛋白有10个,之间相互作用关系较为复杂,尤其与SLC22C14、KDM5B及CD44三者之间有密切的相互作用。结论:ABCB5基因是恶性黑色素瘤细胞中高度特异性表达的基因之一,在恶性黑色素瘤细胞中参与多条信号通路,所起的作用非常复杂,可作为研究恶性黑色素瘤发生及治疗的切入点。 展开更多
关键词 ABCB5基因 恶性黑色素瘤 GEPIA数据库 ualcan数据库 String数据库
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基于公共数据库分析MFAP2在食管癌中表达及其预后意义
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作者 孙文 舒扬 《国际医药卫生导报》 2021年第7期951-956,共6页
目的探讨微纤维相关糖蛋白2(MFAP2)基因在食管癌中的表达及预后意义。方法检索Oncomine和GEPIA数据库中有关MFAP2的基因表达信息,利用UALCAN数据库从不同临床信息分析MFAP2在食管癌组织中的基因表达。采用Kaplan-Meier Plotter在线网站... 目的探讨微纤维相关糖蛋白2(MFAP2)基因在食管癌中的表达及预后意义。方法检索Oncomine和GEPIA数据库中有关MFAP2的基因表达信息,利用UALCAN数据库从不同临床信息分析MFAP2在食管癌组织中的基因表达。采用Kaplan-Meier Plotter在线网站进行预后分析。利用STRING构建MFAP2蛋白互作网络。结果Oncomine及GEPIA分析表明MFAP2基因在食管癌组织中表达上调。UALCAN分析表明:与癌旁组织相比,MFAP2基因在21~60岁人群、1级食管癌患者、吸烟的患者中显著上调。Kaplan-Meier Plotter在线网站分析表明当MFAP2基因高表达时,食管腺癌患者的预后较差。探索MFAP2在不同临床信息的食管腺癌患者的生存预后关系,结果显示:在男性、调节性T细胞等免疫细胞浸润的食管腺癌患者中预后较差。蛋白互作网络分析提示MFAP2可能引起染色体异常。结论MFAP2是食管腺癌中潜在的癌基因,可能与染色体异常相关,其中肿瘤微环境中的免疫细胞影响着食管腺癌的预后,其有望成为诊断和治疗食管腺癌的重要生物学指标。 展开更多
关键词 MFAP2 食管癌 Oncomine数据库 GEPIA数据库 ualcan数据库
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GTSE1基因在乳头状肾细胞癌中的表达及临床意义 被引量:1
14
作者 顾颢 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2020年第3期153-156,共4页
目的通过数据库探索G2/S期应答相关蛋白1(GTSE1)在乳头状肾细胞癌中的表达及意义。方法通过UALCAN数据库明确GTSE1在乳头状肾细胞癌中的表达差异并进行生存分析,进一步明确GTSE1相关基因,随后利用Metascape工具对相关基因进行通路富集,... 目的通过数据库探索G2/S期应答相关蛋白1(GTSE1)在乳头状肾细胞癌中的表达及意义。方法通过UALCAN数据库明确GTSE1在乳头状肾细胞癌中的表达差异并进行生存分析,进一步明确GTSE1相关基因,随后利用Metascape工具对相关基因进行通路富集,最后通过OncoLnc数据库对生存分析结果进行验证。结果与正常组相比,GTSE1在乳头状肾细胞癌中高表达(P<0.001),并且以组织亚型、癌症临床分期以及淋巴结转移等作进一步分析后发现,GTSE1在亚组中依然显著高表达(P<0.05),且GTSE1高表达患者生存率显著降低(P<0.01)。同时,乳头状肾细胞癌中GTSE1启动子区甲基化水平显著降低(P<0.001)。通路富集结果表明,GTSE1相关基因主要富集在细胞周期相关通路。结论GTSE1在乳头状肾细胞癌中显著高表达,且与患者不良预后显著相关,其可能通过调控细胞周期来发挥促癌作用。 展开更多
关键词 ualcan数据库 GTSE1 乳头状肾细胞癌
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TDP1基因表达水平在肺腺癌患者预后中的价值研究 被引量:3
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作者 段惠龙 李雪石 +1 位作者 王丹 孙向飞 《临床医学研究与实践》 2020年第13期4-6,9,共4页
目的探究TDP1基因mRNA在肺腺癌组织中的表达及其与患者预后之间的关系。方法以TCGA数据库内登记的肺腺癌患者的临床信息及TDP1表达情况为研究数据,通过UALCAN数据库挖掘分析工具对TDP1基因mRNA的表达情况进行分析,并通过Kaplan-Meier生... 目的探究TDP1基因mRNA在肺腺癌组织中的表达及其与患者预后之间的关系。方法以TCGA数据库内登记的肺腺癌患者的临床信息及TDP1表达情况为研究数据,通过UALCAN数据库挖掘分析工具对TDP1基因mRNA的表达情况进行分析,并通过Kaplan-Meier生存分析法分析TDP1表达水平与患者总生存期(OS)之间的关系。结果肺腺癌组织中TDP1基因mRNA的表达水平高于正常肺组织(P=0.0000),TDP1基因mRNA的高表达与更差的OS相关(P=0.0057)。亚组分析中,TDP1基因mRNA的表达水平在男性患者和女性患者之间无显著差异(P=0.9412),在不同种族人群间的表达水平也无显著差异(P>0.05),但在女性患者及高加索患者中,TDP1基因mRNA的高表达均与更差的OS相关(女性患者:P=0.031;高加索患者:P=0.016)。结论 TDP1在肺腺癌组织中呈高表达,与更短的OS相关,提示TDP1可能在肺腺癌发生发展过程中有驱动作用,TDP1可作为肺腺癌治疗的下一个潜在靶点,但其内在机制需要更多的基础与临床研究予以揭示。 展开更多
关键词 肺腺癌 酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1 总生存期 TCGA ualcan
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胃癌中RNA解旋酶DDX19A的表达及临床意义
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作者 张美智子 郭佳雯 +1 位作者 周丽丽 程玉 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期899-904,共6页
背景与目的:RNA解旋酶DDX19A(DEAD-box helicases 19A)是DDX蛋白超家族的成员之一,主要参与RNA的转运过程。该家族的许多成员参与肿瘤的发生及发展过程,然而关于DDX19A在胃癌中的作用,目前尚未见报道。结合生物信息学分析,探讨胃癌组织... 背景与目的:RNA解旋酶DDX19A(DEAD-box helicases 19A)是DDX蛋白超家族的成员之一,主要参与RNA的转运过程。该家族的许多成员参与肿瘤的发生及发展过程,然而关于DDX19A在胃癌中的作用,目前尚未见报道。结合生物信息学分析,探讨胃癌组织中DDX19A的表达情况及临床意义。方法:采用UALCAN数据库,转录水平分析胃癌及癌旁胃组织中DDX19A的表达差异,进一步分析其在胃癌中的表达及与临床分期的关系;采用Kaplan-Meier Plotter数据库分析DDX19A表达水平与胃癌患者总生存期(overall survival,OS)及无病生存期(disease-free survival,DFS)的相关性。采用蛋白质印迹法(Western blot)检测16对冻存的新鲜胃癌组织及配对癌旁胃黏膜中DDX19A蛋白的表达。收集2011—2015年承德医学院附属医院病理科存档的胃癌石蜡包埋标本109例、癌旁胃黏膜标本30例,所有患者临床病理学资料完整。免疫组织化学S-P四步法检测109例胃癌及30例癌旁胃黏膜中DDX19A蛋白的表达,分析其高表达与胃癌临床病理学特征及预后的关系。结果:UALCAN及Kaplan-Meier Plotter数据库检索结果显示,DDX19A mRNA在胃癌组织中的表达明显高于癌旁胃组织(P<0.01),其高表达与胃癌临床分期及患者不良预后正相关(P<0.05)。Western blot结果显示,胃癌组织中DDX19A蛋白显著高表达(P<0.01)。免疫组织化学结果显示,胃癌组织中的DDX19A阳性表达率为68.8%(75/109),显著高于其在癌旁胃黏膜中的表达(33.3%,10/30),差异有统计学意义(P<0.01)。DDX19A高表达与胃癌分化程度、浸润深度、TNM分期密切相关(P<0.05),而与患者性别、年龄、肿瘤大小、淋巴结转移无关(P>0.05)。69例随访资料完整的病例中,DDX19A高表达患者的OS明显短于低表达患者(P<0.05)。结论:DDX19A在胃癌组织中明显高表达,并且其高表达与胃癌临床分期、侵袭性及患者不良预后相关。DDX19A有望成为与胃癌预后相关的潜在生物标志物及治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃肿瘤 DDX19A 预后 ualcan Kaplan-Meier Plotter
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CLIC3在胰腺癌中的表达及预后相关性的生物信息学分析
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作者 龚治忠 李清月 刘刚 《安徽卫生职业技术学院学报》 2020年第6期85-87,共3页
目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况... 目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况,对胰腺癌中CLIC3与MMP28和TRIM29的协同表达情况进行分析。结果:CLIC3在胰腺癌组织中的表达高于正常组织,与肿瘤年龄、性别和病理组织学分级存在部分相关性,CLIC3高表达的胰腺癌患者预后较差,CLIC3与MMP28和TRIM29的表达存在明显的正相关性。结论:CLIC3可能是治疗胰腺癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 CLIC3 PAAD GEPIA数据库 ualcan数据库
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基于数据库分析KIF4A基因在肾透明细胞癌中临床意义
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作者 朱东生 许祥飞 +2 位作者 张明 王彤 罗洪 《国际生物医学工程杂志》 CAS 2022年第3期241-246,共6页
目的:分析驱动蛋白超家族4A(KIF4A)在肾透明细胞癌中的表达和预后的关系,并探索其潜在机制。方法:从UALCAN数据库中检索KIF4A基因在肾透明细胞癌中信息,包括表达水平、生存分析和正负相关基因数据,可以得到KIF4A在肾透明细胞癌中的表达... 目的:分析驱动蛋白超家族4A(KIF4A)在肾透明细胞癌中的表达和预后的关系,并探索其潜在机制。方法:从UALCAN数据库中检索KIF4A基因在肾透明细胞癌中信息,包括表达水平、生存分析和正负相关基因数据,可以得到KIF4A在肾透明细胞癌中的表达水平、预后信息以及潜在机制。结果:在肾透明细胞癌中KIF4A高表达,其中男性患者高于女性患者,肿瘤级别越高、N分期越晚,其表达也越高(P<0.05);生存分析表明KIF4A的表达水平和预后呈负相关(P<0.05);细胞周期蛋白B2(CCNB2)、驱动蛋白超家族23(KIF23)、细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)与KIF4A存在着明显正相关,而短链脱氢酶家族12(DHRS12)、细胞极性蛋白3(CRB3)、β-羟丁酸脱氢酶2(BDH2)与KIF4A存在着负相关,它们之间的相互关系可能是其潜在机制。结论:KIF4A在肾透明细胞癌发生发展中扮演重要的角色,可作为潜在的肾透明细胞癌诊断、预后的标志物和治疗靶点,包括儿童。 展开更多
关键词 ualcan数据库 驱动蛋白超家族4A 肾透明细胞癌
原文传递
基于数据库挖掘分析TPX2基因在肺腺癌中的表达及意义
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作者 王源 陈丹 +1 位作者 孙建 楚亚楠 《医学信息》 2023年第1期24-28,共5页
目的探讨TPX2基因在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine、Ualcan、GEPIA在线数据库中有关TPX2的信息,并对所获取的数据库资料中关于TPX2在肺腺癌中的研究进行荟萃分析。结果Oncomine数据库中肺腺癌和正常组织中TPX2表达有... 目的探讨TPX2基因在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine、Ualcan、GEPIA在线数据库中有关TPX2的信息,并对所获取的数据库资料中关于TPX2在肺腺癌中的研究进行荟萃分析。结果Oncomine数据库中肺腺癌和正常组织中TPX2表达有差异的有8项,共有869例样本。荟萃分析8项研究成果,结果显示肺腺癌中TPX2的表达高于正常组织(P<0.05);Ualcan结果表明,男性患者TPX2含量高于女性;肺腺癌患者TPX2表达与肿瘤分期、年龄、种族无关;GEPIA数据库中生存分析曲线结果显示肺腺癌患者TPX2水平越高,生存时间越短,预后更差(P<0.05)。结论TPX2在肺腺癌组织中呈现高表达,TPX2与肺腺癌患者预后密切相关,TPX2为肺腺癌治疗提供新的治疗靶点。 展开更多
关键词 TPX2 肺腺癌 Oncomine数据库 ualcan数据库 GEPIA数据库
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