植物运输抑制响应蛋白1(transport inhibitor protein 1,TIR1)是一种生长素受体,在生长素信号转导过程中发挥重要作用。目前有关马铃薯生长素受体基因的研究尚未见报道。本研究是从前期工作中获得EST序列,利用NCBI中的BLAST工具,对原始...植物运输抑制响应蛋白1(transport inhibitor protein 1,TIR1)是一种生长素受体,在生长素信号转导过程中发挥重要作用。目前有关马铃薯生长素受体基因的研究尚未见报道。本研究是从前期工作中获得EST序列,利用NCBI中的BLAST工具,对原始序列进行同源性分析,选择与原始序列相似度最高的一条同源序列。通过电子克隆技术,得到TIR1基因。采用生物信息学方法对基因序列、编码氨基酸、理化性质、跨膜结构域、亲/疏水性、信号肽、磷酸化位点、N-端糖基化位点、高级结构等进行分析。结果表明,TIR1基因cDNA全长1740 bp,编码580个氨基酸,分子量64.68 kD,理论等电点5.60,亲水性系数0.034,不稳定系数56.67,为不稳定酸性疏水性蛋白,编码蛋白含有59个磷酸化位点,4个N-端糖基化位点,无信号肽、跨膜区域,高级结构主要由α螺旋和无规卷曲序列组成。通过系统进化分析,TIR1蛋白与烟草、番茄和拟南芥等植物中的TIR1蛋白同源性较高。亚细胞定位分析,TIR1基因主要位于细胞核,小部分可能位于线粒体。研究结果为马铃薯TIR1基因的试验克隆及功能验证研究提供了理论依据。展开更多
