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广州城市人工水系统中军团菌的发生和分布 被引量:18
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作者 施海琼 黄炯威 +4 位作者 吴夏飞 林尤海 徐润林 周世宁 陆勇军 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2003年第6期635-638,共4页
综合运用平板分离法、半巢式PCR和EnviroAmpPCR反向杂交检测试剂盒 ,对广州市部分人工水系统中条件致病菌军团菌属细菌进行分离和检测 .结果表明 ,虽然阳性率随着采样时间和地点的不同而有所差异 ,但总体来说 ,广州市人工水系统中存在... 综合运用平板分离法、半巢式PCR和EnviroAmpPCR反向杂交检测试剂盒 ,对广州市部分人工水系统中条件致病菌军团菌属细菌进行分离和检测 .结果表明 ,虽然阳性率随着采样时间和地点的不同而有所差异 ,但总体来说 ,广州市人工水系统中存在较高程度的军团菌的污染 ,中央空调冷却塔水中军团菌阳性率平均为 84 % ,个别路段甚至达到了 10 0 % ,自来水池中则达到了 35 % ,但在后者的水样中没有检测到最常见的致病菌嗜肺军团菌 .对各种培养方法的优劣及军团菌的季节性发生和分布进行了初步讨论 .图 2表 2参 展开更多
关键词 军团菌 中央空调冷却塔水 自来水 半巢式PCR
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脱氧雪腐镰刀菌烯醇对人外周血单个核细胞TAP-1表达的抑制作用 被引量:3
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作者 李月红 张祥宏 +4 位作者 邢凌霄 左连富 严霞 王俊灵 王凤荣 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期246-248,共3页
 目的: 探讨脱氧雪腐镰刀菌烯醇 (DON)对人外周血单个核细胞 (PBMC)中TAP- 1表达的影响。方法: 采用流式细胞仪(FCM)和半定量RT- PCR方法, 从蛋白和mRNA水平上分析不同浓度的DON对体外培养的人PBMC中TAP- 1分子表达的影响及量 效关系...  目的: 探讨脱氧雪腐镰刀菌烯醇 (DON)对人外周血单个核细胞 (PBMC)中TAP- 1表达的影响。方法: 采用流式细胞仪(FCM)和半定量RT- PCR方法, 从蛋白和mRNA水平上分析不同浓度的DON对体外培养的人PBMC中TAP- 1分子表达的影响及量 效关系。结果: FCM定量检测表明, 用不同浓度的DON处理, 均可一定程度地抑制人PBMC中TAP -1蛋白的表达, 且二者呈显著的负相关 (r= -0. 865,P<0. 01)。半定量RT -PCR检测显示, 不同浓度的DON处理均可抑制人PBMC中TAP -1mRNA的表达。结论: DON可剂量依赖地抑制体外培养的人PBMC中TAP- 1蛋白和其mRNA的表达, 对阐明食管癌高发区被DON污染的粮食与食管癌发生的关系具有重要的意义。 展开更多
关键词 脱氧雪腐镰刀菌烯醇 人外周血单个核细胞 TAP-1 RT—PCR
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抗原肽处理相关运载蛋白体基因多态性与1型糖尿病 被引量:3
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作者 翟金霞 沈冲 叶冬青 《中国慢性病预防与控制》 CAS 2007年第1期28-31,共4页
目的检测安徽省1型糖尿病患者的抗原肽相关运载蛋白体(transporter associated with antigen processing,TAP)基因位点多态性。方法采用聚合酶反应-限制片断长度多态性技术,检测16名1型糖尿病患者和50名健康对照TAP位点的多态性。TAP1和... 目的检测安徽省1型糖尿病患者的抗原肽相关运载蛋白体(transporter associated with antigen processing,TAP)基因位点多态性。方法采用聚合酶反应-限制片断长度多态性技术,检测16名1型糖尿病患者和50名健康对照TAP位点的多态性。TAP1和TAP2基因分别有2和4个多态性位点,其限制性内切酶分别是TAP1等位基因333位点(TAP1-1,Ile-Val)的Sau3Al内切酶,637位点(TAP1-2,Asp-Gly)的AccI酶;TAP2等位基因379位点(TAP2-1,Val-Ile)的BstuI酶;665位点(TAP2-2,Ala-Thr)的MspI酶;565位点(TAP2-3,Thr-Ala)的RsaI酶以及687位点(TAP2-2,Stop-Gln)的BfaI酶。结果病例组和对照组的TAP1等位基因型分别以637 Gly和637Asp为主;TAP2等位基因分别以379Ile和379Val为主,两组间差异均有统计学意义(P<0.01)。其余等位基因型差异均无统计学意义(P>0.05)。结论在1型糖尿病患者与正常对照人群间的某些TAP基因位点有差异,提示TAP基因可能与该病有密切关联。 展开更多
关键词 抗原肽处理相关运载蛋白体 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 1型糖尿病
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利用分枝杆菌的重组工程系统将TAP标签敲入耻垢分枝杆菌的方法研究 被引量:2
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作者 赵丽丽 夏强 +1 位作者 赵秀芹 万康林 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期539-542,546,共5页
目的利用pJV53质粒编码的分枝杆菌重组工程系统将TAP标签敲入耻垢分枝杆菌基因组。方法将pJV53质粒转入耻垢分枝杆菌,使其表达重组蛋白,制备带有重组蛋白的感受态细胞;从质粒pBS1479中扩增出tap片段,从质粒pSMT3中扩增hyg片段,从耻垢分... 目的利用pJV53质粒编码的分枝杆菌重组工程系统将TAP标签敲入耻垢分枝杆菌基因组。方法将pJV53质粒转入耻垢分枝杆菌,使其表达重组蛋白,制备带有重组蛋白的感受态细胞;从质粒pBS1479中扩增出tap片段,从质粒pSMT3中扩增hyg片段,从耻垢分枝杆菌基因组中分别扩增出aasf基因及其5′端非编码区片段AASF5和aasf基因下游3′端非编码区片段AASF3,利用重叠PCR将以上4个片段拼接在一起,形成最终的敲入片段A5THA3;将构建好的敲入片段转入感受态细胞,使其重组入耻垢分枝杆菌基因组中,PCR和DNA测序鉴定敲入效果。结果重叠PCR技术得到全长为3 200 bp的敲入片段,PCR与DNA测序结果证实带有TAP标签的A5THA3片段已成功敲入耻垢分枝杆菌基因组中。结论成功将TAP标签敲入耻垢分枝杆菌基因组,为下一步进行目的基因功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 重组工程系统 pJV53质粒 串联亲和纯化标签 敲入片段 重叠PCR 耻垢分枝杆菌
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利用oligo芯片技术鉴定橡胶树死皮相关基因 被引量:4
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作者 覃碧 刘向红 +1 位作者 邓治 李德军 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期296-301,共6页
橡胶树死皮(Tapping Panel Dryness,TPD)是天然橡胶单产提高的主要限制因子之一,给橡胶种植业带来严重危害。本研究利用定制橡胶树oligo芯片,通过提取死皮和健康橡胶树胶乳总RNA,标记并反转录成cDNA后与橡胶树oligo芯片进行杂交鉴定TPD... 橡胶树死皮(Tapping Panel Dryness,TPD)是天然橡胶单产提高的主要限制因子之一,给橡胶种植业带来严重危害。本研究利用定制橡胶树oligo芯片,通过提取死皮和健康橡胶树胶乳总RNA,标记并反转录成cDNA后与橡胶树oligo芯片进行杂交鉴定TPD相关基因,利用RT-PCR技术对芯片结果进行验证。对芯片数据分析结果显示,以2倍标准在死皮与健康橡胶树间筛选到26个差异表达基因,其功能涉及橡胶生物合成、细胞程序性死亡、细胞抗性及防御反应、活性氧代谢、DNA甲基化、泛素-蛋白酶体、信号传导、蛋白质合成、加工及转运等调控途径。进一步的RT-PCR验证结果表明,随机选取12个基因的表达模式均与芯片结果一致。本研究为大规模鉴定TPD相关基因和揭示TPD发生分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 橡胶树 死皮 oligo芯片 TPD相关基因 RT-PCR
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Microbiological, Physico-Chemical and Sensorial Characteristics of Serrano, an Artisanal Brazilian Cheese
6
作者 Ana Paula Longaray Delamare Cristiane Conte Paim de Andrade +2 位作者 Fernanda Mandelli Renata Chequeller de Almeida Sergio Echeverrigaray 《Food and Nutrition Sciences》 2012年第8期1068-1075,共8页
The microbiological, chemical and sensory characteristics of licensed and unlicensed commercial Serrano cheese, a traditional product from the highlands of South Brazil, were studied. The average bacteria counts (log ... The microbiological, chemical and sensory characteristics of licensed and unlicensed commercial Serrano cheese, a traditional product from the highlands of South Brazil, were studied. The average bacteria counts (log CFU/g) were 8.8, 3.4, 3.4, 5.1, and 8.8, for mesophilic bacteria, fecal coliforms, staphylococci, yeasts and moulds, and lactic acid bacteria (LAB), respectively. Differences in microbiological quality were detected between licensed and unlicensed cheeses. However, the presence of potential gastroentheric bacteria in both kind of cheeses is disturbing and point out the necessity of alternative manufacturing process and good manufacturing practices to minimize consumers’ health risks. The most prevalent LAB were Lactobacillus (91%), followed Lactococcus and Enterococcus. Lactobacillus isolates comprised L. plantarum (57.7%), L. paracasei (19.2%), L. rhamnosus (7.7%), L. acidophilus (7.7%), and 3.8% of both L. curvatus and L. fermentum. Non-significant physico-chemical differences were detected between licensed and unlicensed cheeses. Cheeses that received the highest sensorial scores exhibited the presence of both L. plantarum and L. paracasei, indicating that mixed populations of these species positively contributed to flavor development. 展开更多
关键词 Serrano CHEESE LACTIC Acid Bacteria MICROBIOLOGICAL Characterization tap-pcr
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One-year survey of opportunistic premise plumbing pathogens and free-living amoebae in the tap-water of one northern city of China 被引量:11
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作者 Lizhong Liu Xueci Xing +1 位作者 Chun Hu Haibo Wang 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第3期20-31,共12页
In this study, qPCR was used to quantify opportunistic premise plumbing pathogens(OPPPs) and free-living amoebae in 11 tap water samples collected over four seasons from a city in northern China. Results demonstrated ... In this study, qPCR was used to quantify opportunistic premise plumbing pathogens(OPPPs) and free-living amoebae in 11 tap water samples collected over four seasons from a city in northern China. Results demonstrated that the average numbers of gene copies of Legionella spp. and Mycobacterium spp. were significantly higher than those of Aeromonas spp.(p < 0.05). Legionella spp. and Mycobacterium spp. were 100%(44/44) positively detected while P. aeruginosa and Aeromonas spp. were 79.54%(35/44) and 77.27%(34/44) positively detected. Legionella pneumophila was only detected in 4 samples(4/44), demonstrating its occasional occurrence. No Mycobacterium avium or Naegleria fowleri was detected in any of the samples. The average gene copy numbers of target OPPPs were the highest in summer,suggesting seasonal prevalence of OPPPs. Average gene copy numbers of OPPPs in the taps of low-use-frequency were higher than in taps of high-use-frequency, but the difference was not significant for some OPPPs(p > 0.05). Moderate negative correlations between the chlorine concentration and the gene copy numbers of OPPPs were observed by Spearman analysis(rsranged from -0.311 to -0.710, p < 0.05). However, no significant correlations existed between OPPPs and AOC, BDOC, or turbidity. Moderate positive correlations were observed between the target microorganisms, especially for Acanthamoeba spp., through Spearman analysis(p < 0.05). Based on our studies, it is proposed that disinfectant concentration, season, taps with different-use frequency, OPPP species, and potential microbial correlations should be considered for control of OPPPs in tap water. 展开更多
关键词 OPPORTUNISTIC premise PLUMBING pathogens(OPPPs) Free-living amoebae(FLA) Drinking WATER distribution systems(DWDS) Tap-water Quantitative PCR(qPCR)
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上海人群中TAP与IgA肾炎相关性的研究 被引量:7
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作者 刘彬彬 奚宏康 王福庆 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期128-130,共3页
目的探讨上海人群中抗原处理相关转运蛋白(TAP)与IgA肾炎的相关性。方法用PCR-SSO方法对上海地区88名正常人及40名IgA肾炎患者TAP进行分型。结果在病人组及对照组中共发现3种TAP1(TAP1A、1B、1... 目的探讨上海人群中抗原处理相关转运蛋白(TAP)与IgA肾炎的相关性。方法用PCR-SSO方法对上海地区88名正常人及40名IgA肾炎患者TAP进行分型。结果在病人组及对照组中共发现3种TAP1(TAP1A、1B、1C)及4种TAP2(TAP2*0101、*0102、*0201、*0202)等位基因。未发现病人组与对照组之间TAP等位基因分布的差异。结论本文结果未能证明TAP基因与IgA肾炎相关,但不排除未检测的多态位点与IgA肾炎关联的可能性。 展开更多
关键词 抗原处理 相关转运蛋白 IGA肾炎 聚合酶链反应
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抗原肽运载体TAP2基因与乙型肝炎病毒感染预后的相关性研究 被引量:4
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作者 夏天 郝妍 +4 位作者 王小华 刘洋 陈兆鹏 沈锡中 朱乃硕 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期331-337,共7页
目的 研究上海地区中国人群抗原肽运载体(transporter associated with antigen processing, TAP)基因与HBV感染以及慢性HBV感染和慢性肝炎并发肝硬化之间的相关性。方法 收集临床病例,检测乙型肝炎病毒标志,参照“病毒性肝炎防治方案... 目的 研究上海地区中国人群抗原肽运载体(transporter associated with antigen processing, TAP)基因与HBV感染以及慢性HBV感染和慢性肝炎并发肝硬化之间的相关性。方法 收集临床病例,检测乙型肝炎病毒标志,参照“病毒性肝炎防治方案2000”,选取101例乙型肝炎病毒感染者,21例HBV感染康复者及113例正常对照,进行TAP2 等位基因分型。对数据分组进行统计分析。结果 慢性乙型肝炎组的TAP2 *0201基因频率显著低于感染恢复组(χ2 =4.95, P<0.03);肝硬化组的TAP2 *0101基因频率显著高于正常对照组(χ2 =5.72, P<0.02);在慢性乙型肝炎并发肝硬化组中DR4与TAP2 *0101等位基因间存在显著的连锁不平衡(△=0.026,P<0.05)。结论 TAP2 *0101等位基因型携带者易感慢性乙型肝炎和乙型肝炎并发肝硬化,而TAP2 *0201则表现出对慢性乙型肝炎的抗性。两者均与HBV感染的预后似有一定相关。 展开更多
关键词 抗原肽运载体 乙型肝炎病毒感染 相关性研究 P2基因 预后 慢性乙型肝炎 慢性HBV感染 TA 肝炎病毒标志 等位基因分型 基因频率 病毒性肝炎 病毒感染者 正常对照组 连锁不平衡 等位基因型 肝硬化 中国人群 上海地区 慢性肝炎
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