期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到8,785篇文章
< 1 2 … 250 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
余甘子转录组与SSR信息分析及分子标记开发
1
作者 王建超 张小艳 +2 位作者 谢丽雪 张立杰 李韬 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第3期35-45,共11页
【目的】明确余甘子转录组SSR位点的分布特征,开发余甘子SSR分子标记技术,为余甘子的亲缘关系鉴定、遗传育种和创新利用提供理论依据。【方法】以6份表型差异较大的余甘子叶片为材料,通过高通量测序技术获得余甘子叶非参转录组数据,分... 【目的】明确余甘子转录组SSR位点的分布特征,开发余甘子SSR分子标记技术,为余甘子的亲缘关系鉴定、遗传育种和创新利用提供理论依据。【方法】以6份表型差异较大的余甘子叶片为材料,通过高通量测序技术获得余甘子叶非参转录组数据,分析其转录组和SSR位点分布特征,设计SSR引物并进行有效性和多态性筛选,最终开发余甘子SSR分子标记技术。【结果】余甘子叶转录组测序共获得65074条基因,平均长度为1064 bp,71.77%的基因成功获得功能注释;所有基因中共获得18245个SSR位点,发生频率为21.68%,含有192种重复基元,其中A/T重复基元数目最多;多态性SSR位点共2714个,占比为14.88%,表明SSR位点可用于遗传多样性分析的潜力较大。对18245个含有SSR位点的基因进行SSR引物设计,共设计出12488对SSR引物,成功率为73.88%,其中7602对引物的重复基元为单核苷酸,占比为60.87%。随机挑选154对引物进行SSR位点有效性和多态性分析,筛选出10对扩增条带清晰且多态性较好的SSR引物,这10对SSR引物重复基元分别为二核苷酸7个,三核苷酸1个和五核苷酸2个,扩增产物大小为127~270 bp,平均为220.5 bp。【结论】多态性SSR位点用于余甘子遗传多样性分析的潜力较大,筛选出10对扩增条带清晰且多态性较好的SSR引物。 展开更多
关键词 余甘子 转录组 ssr 引物筛选 分子标记
在线阅读 下载PDF
花生野生种Arachis duranensis特异SSR标记开发与种间杂交外源染色体系鉴定
2
作者 杜培 李晨玉 +6 位作者 王思雨 付留洋 韩锁义 苗利娟 刘华 董文召 张新友 《中国油料作物学报》 北大核心 2026年第1期133-142,共10页
A.duranensis是花生栽培种的祖先野生种之一,具有栽培种不具备的很多优良基因。然而,由于其与栽培种很近的亲缘关系,缺乏有效的染色体鉴定手段,导致对导入的野生种外源染色体信息获取困难。为了解决A.duranensis外源染色体系的创制和鉴... A.duranensis是花生栽培种的祖先野生种之一,具有栽培种不具备的很多优良基因。然而,由于其与栽培种很近的亲缘关系,缺乏有效的染色体鉴定手段,导致对导入的野生种外源染色体信息获取困难。为了解决A.duranensis外源染色体系的创制和鉴定问题,本研究首先利用栽培种Tifrunner和二倍体野生种A.duranensis参考基因组序列,通过生物信息学分析从A.duranensis和Tifrunner基因组中分别鉴定出135529和512900个SSR位点。基于SSR侧翼序列,设计出37027对A.duranensis的SSR引物。利用电子PCR对SSR引物在Tifrunner和A.duranensis基因组上进行扩增分析,获得了3815个在A.duranensis基因组上产生特异扩增位点的标记。然后从A01、A02、A03、A05、A07和A08号染色体上分别挑选出120个特异性SSR标记,对六倍体花生Am1210及其亲本四粒红和A.duranensis基因组DNA进行引物扩增和电泳,筛选到29个A.duranensis特异性SSR标记。最后将这些标记应用于四粒红和A.duranensis的BC_(2)F_(4)后代外源染色体系鉴定,并利用顺序FISH/GISH验证鉴定材料的准确性,最终筛选到了两个5A^(du)和7A^(du)的单染色体附加系,显示了新开发的SSR标记在栽培种与A.duranensis外源染色体材料鉴定中的应用潜力。 展开更多
关键词 花生 Arachis duranensis ssr标记 种间杂交 外源染色体系
在线阅读 下载PDF
云南边境地区稻种资源的SSR标记遗传多样性及其主要农艺性状关联性分析
3
作者 汤翠凤 阿新祥 +5 位作者 董超 张斐斐 杨雅云 杨红梅 戴陆园 苏振喜 《作物杂志》 北大核心 2026年第1期33-46,I0004-I0007,共18页
为分析我国云南边境地区稻种资源的遗传多样性,并发掘与主要农艺性状密切相关的SSR标记,以新收集自我国云南及毗邻的缅甸、老挝的376份稻种资源为材料,分为3个分析单元,观测11个表型性状,采用27对SSR标记进行遗传多样性及与表型性状的... 为分析我国云南边境地区稻种资源的遗传多样性,并发掘与主要农艺性状密切相关的SSR标记,以新收集自我国云南及毗邻的缅甸、老挝的376份稻种资源为材料,分为3个分析单元,观测11个表型性状,采用27对SSR标记进行遗传多样性及与表型性状的关联性分析。结果显示,共检测到142个等位变异位点,其中100个为稀有等位变异位点,9个为特有等位变异位点;基于6个遗传多样性参数的综合评估,3个分析单元稻种资源的得分排序为中国云南分析单元>缅甸分析单元>老挝分析单元;在27对SSR标记中,RM214、RM1086、RM5481、RM6089、RM1509和RM7479与表型性状的关联性较密切,可解释穗长、穗抽出度、穗实粒数、穗秕粒数、穗粒数和千粒重等性状10.0%以上的变化。表型性状的主成分分析提取出4个主成分,累计贡献率为77.218%;筛选出综合得分>1.000的优异资源36份,其中得分>2.000的为花壳、纳列5和毫糯浪,分别具有作为多穗大穗型、大穗型和糯性亲本的潜力。 展开更多
关键词 云南边境地区 稻种资源 遗传多样性 ssr标记 关联性分析
原文传递
基于SSR标记的4种榧树属植物遗传多样性及遗传结构研究
4
作者 马长乐 张金丽 +3 位作者 杨建欣 李靖 岳亮亮 周炳江 《山东农业科学》 北大核心 2026年第1期36-46,共11页
为揭示榧树属植物的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护和利用提供理论依据,本试验以4个榧树属物种累计295个样本为研究对象,用筛选出的15对引物对所有样本进行SSR-PCR扩增,并将扩增产物进行毛细管电泳检测,探究其遗传... 为揭示榧树属植物的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护和利用提供理论依据,本试验以4个榧树属物种累计295个样本为研究对象,用筛选出的15对引物对所有样本进行SSR-PCR扩增,并将扩增产物进行毛细管电泳检测,探究其遗传多样性和遗传结构并进行聚类分析。结果表明:(1)以有效等位基因为标准,遗传多样性从高到低依次为巴山榧(多态位点百分率P=87.50%,期望杂合度H_(e)=0.396,Shannon’s信息指数I=0.740)、佛罗里达榧(P=86.67%,H_(e)=0.342,I=0.596)、四川榧(P=73.33%,H_(e)=0.285,I=0.480)、云南榧(P=57.57%,H_(e)=0.194,I=0.332)。(2)榧树属21个居群的居群内近交系数(F_(is))平均值为0.174,居群间遗传系数(F_(st))平均值为0.490,居群间基因流(Nm)为0.260,说明基因交流不频繁。榧树居群的居群总近交系数(F_(it))值均大于F_(is)值,说明居群间的杂合水平要大于居群内。(3)分子方差分析结果表明,榧属植物的遗传变异主要来源于居群间,变异系数为58%。21个居群间的Nei’s标准遗传距离在0.018~2.453之间,平均值为0.609。总体而言遗传距离与地理距离呈正相关关系(r=0.759,P<0.05),而云南榧和巴山榧的遗传距离与地理距离之间没有显著的相关性。(4)21个居群的遗传相似系数在0.403~0.983之间。当相似系数为0.12时,可将4种榧树属物种21个居群分为2个大类,佛罗里达榧的1个居群为一大类,其余3个物种的20个居群为另一大类;当相似系数为0.58时,可将其分为4个大类。 展开更多
关键词 榧树属 ssr标记 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
应用SSR分子标记技术对山茶属杂交品种F_(1)代的初步鉴定
5
作者 韦晓娟 杨德任 +2 位作者 张幸 刘凯 蓝金宣 《中国农学通报》 2026年第3期57-64,共8页
开展人工杂交授粉以培育高价值山茶新品种,为珍稀山茶在引种、园林景观及茶饮等方面的开发利用提供参考。以宛田红花油茶等6种山茶为亲本,设计8个杂交组合开展人工授粉,统计杂交结实及F_(1)代幼苗情况,对F_(1)代幼苗开展形态学鉴定,并结... 开展人工杂交授粉以培育高价值山茶新品种,为珍稀山茶在引种、园林景观及茶饮等方面的开发利用提供参考。以宛田红花油茶等6种山茶为亲本,设计8个杂交组合开展人工授粉,统计杂交结实及F_(1)代幼苗情况,对F_(1)代幼苗开展形态学鉴定,并结合SSR技术进行分子鉴定。结果显示,(1)8个杂交组合均获杂交苗,其中“宛田红花油茶♀×广宁红花油茶♂”出苗数最多(41株);(2)F_(1)代幼苗叶形、叶脉、锯齿等特征与母本更接近,叶型及大小、锯齿、叶片光泽等呈中性,叶片整体形态则更趋向父本;(3)SSR分子鉴定显示,14株F_(1)代幼苗则鉴定为真实杂交种,2株幼苗(2-3、14-1)为自交种,5株(1-1、1-2、1-4、1-5、9-4)出现杂新带,鉴定为外来血缘。杂交授粉的山茶F_(1)代幼苗形态特征与父本更接近,SSR技术鉴定出14株F_(1)代幼苗为真实杂交种。未来可扩大引物数量与杂交组合范围,持续跟踪真实杂交种的优良性状遗传稳定性,为山茶定向育种提供更全面支撑。 展开更多
关键词 山茶属 杂交授粉 杂交苗培育 形态学鉴定 ssr分子标记 杂交F_(1)代鉴定
原文传递
基于SSR分子标记分析葡萄‘M10’分子遗传特性及QR码构建
6
作者 高雯雯 钟海霞 +7 位作者 纪佳慧 伍新宇 张付春 周晓明 王建成 潘明启 曾斌 师玮 《分子植物育种》 北大核心 2026年第1期95-101,共7页
为了研究新疆乡土葡萄白木纳格、莫莉莎无核及其杂交种‘M10’的遗传关系,为新疆本土种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SSR分子标记技术,对3个品种的葡萄进行遗传多样性分析,通过GenAlex软件计算各个遗传多样性参... 为了研究新疆乡土葡萄白木纳格、莫莉莎无核及其杂交种‘M10’的遗传关系,为新疆本土种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SSR分子标记技术,对3个品种的葡萄进行遗传多样性分析,通过GenAlex软件计算各个遗传多样性参数,并采用NTSYS pc-2.1软件进行种质间的遗传相似性系数分析,再将种质名称、种质信息以及引物信息汇总构建种质信息二维码。结果表明,利用40对引物共扩增出120个条带,平均每个引物扩增出3个位点,遗传多样性系数在0.429~0.933之间,平均为0.641。每对引物对3个品种扩增的等位位点数量范围在1~5之间,表明有较高多态性。此外,3个品种间的遗传相似性系数在0.6757~0.8125之间,‘M10’与莫莉莎无核之间的遗传相似性系数为0.8125,与白木纳格的遗传相似性系数为0.7143,说明‘M10’与莫莉莎无核较白木纳格葡萄的亲缘关系较近。以SSR标记为基础设计3个品种的分子身份证,并给出包含种质名称、种质信息以及引物信息的二维码。本研究采用SSR标记技术对‘M10’及其亲本进行种质资源鉴定及分析,为新种质的保护、利用和推广提供遗传基础。 展开更多
关键词 M10 ssr分子标记 种质资源鉴定 亲缘关系
原文传递
基于SSR标记的‘天山菜茶’遗传多样性和亲缘关系分析
7
作者 赵翊暄 俞滢 +5 位作者 梁子钧 陈强 陈言概 雷荣杰 张磊 杨如兴 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2026年第1期53-62,共10页
为探究茶树‘天山菜茶’(Camellia sinensis‘Tianshancaicha’)种质资源的遗传多样性,以宁德市其他产区的地方茶树种质资源为参照,采用SSR分子标记技术对143份种质资源进行分子标记,分析‘天山菜茶’种质资源的遗传背景及其与参照茶树... 为探究茶树‘天山菜茶’(Camellia sinensis‘Tianshancaicha’)种质资源的遗传多样性,以宁德市其他产区的地方茶树种质资源为参照,采用SSR分子标记技术对143份种质资源进行分子标记,分析‘天山菜茶’种质资源的遗传背景及其与参照茶树种质资源的亲缘关系。结果表明,6对引物共扩增出55个等位基因,平均9.166个;观测杂合度平均值为0.649;期望杂合度平均值为0.779;Shannon指数平均值为1.870;PIC平均值为0.742;遗传聚类分析将不同产区的143份种质资源分为5个类群,其中112份‘天山菜茶’种质资源(含蕉城野生苦茶树)分散在各个类群中,说明其可能同属‘闽东菜茶’的遗传背景;不同产区间基因流为2.225,表明‘闽东菜茶’之间的基因交流性较强。‘天山菜茶’种质资源间存在交叉遗传现象,遗传差异较大,遗传多样性较丰富,可辅助核心和优异资源筛选。 展开更多
关键词 茶树 ssr分子标记 遗传多样性 天山菜茶 聚类分析
在线阅读 下载PDF
青花菜线粒体基因组SSR标记开发及应用
8
作者 昂海燕 裴徐梨 +6 位作者 倪敏杰 莫丽玲 唐征 荆赞革 康家香 赵玉霞 陆明钒 《中国蔬菜》 北大核心 2026年第2期83-88,共6页
为探究青花菜的遗传多样性和亲缘关系,利用线粒体SSR分子标记对24份青花菜高代自交系进行亲缘相似度和遗传多样性分析。结果表明,20对引物共扩增出66条条带,其中多态性条带39条。遗传相似系数在0.6212~0.9848之间,平均值为0.8430,其中Q... 为探究青花菜的遗传多样性和亲缘关系,利用线粒体SSR分子标记对24份青花菜高代自交系进行亲缘相似度和遗传多样性分析。结果表明,20对引物共扩增出66条条带,其中多态性条带39条。遗传相似系数在0.6212~0.9848之间,平均值为0.8430,其中QD06和QD05、QD18和QD16、QD22和QD21的亲缘关系最近,遗传相似系数均为0.9848;QD01和QD23的亲缘关系最远,遗传相似系数为0.6212。聚类分析亦表明,QD05和QD06、QD16和QD18、QD21和QD22的亲缘关系最近;而QD14、QD23均单独聚为一类,与其他材料亲缘关系较远。研究结果可为后续青花菜杂交亲本选配提供参考。 展开更多
关键词 青花菜 线粒体基因组 ssr标记 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
罗浮柿EST-SSR分子标记开发和种群遗传多样性评价
9
作者 汤瑞瑜 李想 +2 位作者 黄钰琳 冯钰 张永华 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2026年第1期63-71,共9页
该研究基于罗浮柿(Diospyros morrisiana)幼苗转录组数据,利用Candi SSR软件开发了1620对具有多态性的EST-SSR分子标记,并基于随机筛选的15对EST-SSR分子标记对8个天然种源地的157株罗浮柿野生植株的遗传多样性进行评价。结果表明,转录... 该研究基于罗浮柿(Diospyros morrisiana)幼苗转录组数据,利用Candi SSR软件开发了1620对具有多态性的EST-SSR分子标记,并基于随机筛选的15对EST-SSR分子标记对8个天然种源地的157株罗浮柿野生植株的遗传多样性进行评价。结果表明,转录组数据集包含100285条Unigene序列,总长为98738602 bp;其中含有34121个SSR位点,发生频率为34.02%,约每2.89 kb含1个SSR位点。从中随机选择的15对具有良好多态性的EST-SSR引物,多态性信息含量(PIC)为0.244~0.877,均值为0.623,其中12个位点具有高度多态性(PIC:0.543~0.788)。基于15对EST-SSR引物的8个罗浮柿野生种群的观测杂合度为0.503~0.650,期望杂合度为0.574~0.610,Shannon多样性指数为1.072~1.245,表现出中等遗传多样性。罗浮柿野生种群的遗传变异绝大部分在种群内(83.29%),种群间存在广泛的基因流,遗传关系较近。该研究为开展罗浮柿的种质资源评价、遗传多样性分析和分子标记辅助育种提供技术支持和科学依据。 展开更多
关键词 罗浮柿 引物开发 EST-ssr 遗传结构 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
基于转录组数据的玉米小斑病菌EST-SSR分子标记开发及多态性分析
10
作者 徐超 李迪 +5 位作者 杨艳艳 马旭阳 马庆周 郭雅双 施艳 张猛 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第1期33-44,共12页
【目的】基于玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)转录组数据鉴定简单重复序列(SSR)位点,开发可用于该植物病原真菌种内遗传变异分析的全新DNA分子标记。【方法】使用MISA软件对玉米小斑病菌去冗余的unigenes进行SSR标记检索与分析,采用Prim... 【目的】基于玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)转录组数据鉴定简单重复序列(SSR)位点,开发可用于该植物病原真菌种内遗传变异分析的全新DNA分子标记。【方法】使用MISA软件对玉米小斑病菌去冗余的unigenes进行SSR标记检索与分析,采用Primer 3.0设计SSR引物,通过本地BLASTN比对以及原始测序数据的mapping筛选具有潜在扩增多态性的SSR引物,并通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳验证所筛选引物的有效性、多态性和通用性。【结果】在14549条玉米小斑病菌unigenes序列中共检索到5767个SSR位点,发生频率和分布频率分别为23.52%和39.64%,平均分布距离为4.94 kb。其中,单核苷酸重复类型最丰富,占总SSR位点总数的40.70%,二核苷酸(28.18%)和三核苷酸重复类型(26.69%)次之。A/T、AC/GT、C/G和AG/CT是其优势重复基序,共占SSR位点总数的67.05%。SSR基序的重复次数主要在5~14次之间,以10次重复最多(占25.92%),其中,绝大部分为单核苷酸。SSR序列长度的分布范围为10~84 bp,以长度为10 bp的SSR位点数量最多,占SSR位点总数的23.32%,序列长度≥20 bp(高多态性)的SSR共有1309条,占总数的22.70%。进一步通过生物信息学手段和PCR产物电泳检测从100对随机抽选的引物中筛选得到29对扩增性好且多态性较高的SSR引物。【结论】玉米小斑病菌转录组含丰富的SSR位点,具有开发多态性引物的潜力;本次筛选得到的SSR引物可用于后续玉米小斑病菌的种群变异及遗传图谱等研究。 展开更多
关键词 玉米小斑病 玉蜀黍平脐蠕孢 转录组 EST-ssr 多态性
在线阅读 下载PDF
菘蓝基因组SSR位点分析及分子标记开发
11
作者 孙天琦 周蕾 +3 位作者 徐林贵 孙晓波 陈勇 隋春 《中国农学通报》 2026年第2期50-56,共7页
针对菘蓝种质鉴别缺乏有效分子标记,现有方法难以区分种内栽培类型的问题,为开发适用于菘蓝种质鉴别及遗传多样性分析的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记。基于菘蓝全基因组数据,利用MISA软件筛选SSR位点,通过Primer3.... 针对菘蓝种质鉴别缺乏有效分子标记,现有方法难以区分种内栽培类型的问题,为开发适用于菘蓝种质鉴别及遗传多样性分析的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记。基于菘蓝全基因组数据,利用MISA软件筛选SSR位点,通过Primer3.0设计引物,以3份栽培类型菘蓝(18个单株)为材料,验证引物的扩增稳定性、多态性、有效性及品种鉴别能力,计算遗传多样性参数。结果显示:(1)菘蓝基因组共检测到139,852个SSR位点,数目最多的单核苷酸SSR位点约占总数的72.51%,最多的SSR基序A/T,也是总核苷酸SSR基序总重复次数最高的序列,其数目为100,205次,占总重复基序的71.65%;(2)筛选出8对能够稳定扩增出基因且多态性丰富的引物,其中引物SSRSL02可用于本次供试菘蓝种质的鉴别;(3)8对引物的平均期望杂合度(He)为0.65,Shannon’s信息指数(I)为1.34,多态性信息含量(PIC)的平均值为0.614,表明菘蓝样本具有较高的遗传多样性。综上,本研究开发的8对SSR分子标记可用于菘蓝种质资源的鉴定、遗传多样性分析和品种选育,未来可扩大菘蓝种质样本量,结合表型与有效成分含量,构建指纹图谱,为菘蓝种质资源精准评价提供更全面的技术支撑。 展开更多
关键词 菘蓝 ssr 分子标记 多态性 遗传多样性 种质资源
原文传递
五味子EST-SSR反应体系建立及多态性引物筛选
12
作者 朱滨红 石广丽 +3 位作者 孙丹 王振兴 于淼 艾军 《分子植物育种》 北大核心 2026年第1期215-221,共7页
为建立并优化五味子SSR-PCR反应体系,进一步筛选具有多态性的EST-SSR引物。本研究以19份五味子种质资源为试验材料,利用L_(16)(45)正交试验设计,对反应体系中的模板DNA、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及Mg^(2+)5个因素进行优化。利用优化... 为建立并优化五味子SSR-PCR反应体系,进一步筛选具有多态性的EST-SSR引物。本研究以19份五味子种质资源为试验材料,利用L_(16)(45)正交试验设计,对反应体系中的模板DNA、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及Mg^(2+)5个因素进行优化。利用优化后的体系对自主挖掘的EST-SSR多态性引物进行PCR反应并筛选最适退火温度。结果表明,五味子SSR最佳反应体系为16μL,包括DNA20ng,SSR正反向引物各0.2μmol/L,dNTP0.3mmol/L,TaqDNA聚合酶2U,Mg^(2+)4mmol/L。该体系在100对引物中成功扩增出72对,扩增效率为72%,其中41对具有多态性,多态性比率为41%。试验所获得的优化体系及多态性引物为五味子种质资源鉴定、遗传多样性分析及遗传图谱构建等奠定了重要基础。 展开更多
关键词 五味子 ssr-PCR反应体系 正交试验设计 体系优化 引物筛选
原文传递
48份鲜食葡萄种质遗传多样性的SSR分析
13
作者 宋超然 曹朝 +1 位作者 李俊鹏 陈晓峰 《贵州农业科学》 2026年第2期1-12,共12页
【目的】探明48份鲜食葡萄种质的遗传多样性水平和亲缘关系,为葡萄种质鉴定和遗传多样性保护及种质创新提供参考。【方法】以烟台地区48份鲜食葡萄种质为研究对象,运用SSR技术分析遗传多样性并进行遗传结构聚类分析,构建相应的DNA指纹... 【目的】探明48份鲜食葡萄种质的遗传多样性水平和亲缘关系,为葡萄种质鉴定和遗传多样性保护及种质创新提供参考。【方法】以烟台地区48份鲜食葡萄种质为研究对象,运用SSR技术分析遗传多样性并进行遗传结构聚类分析,构建相应的DNA指纹图谱及分子身份证。【结果】在48份供试鲜食葡萄种质中,筛选出9对SSR引物(A1~A4、B1~B3、C1~C2),多态性较好、条带清晰,Shannon’s信息指数为2.37,Nei’s基因多样性指数为0.86,多态性信息含量为0.85,表明48份鲜食葡萄种质存在明显遗传差异且遗传多样性丰富。对SSR扩增条带进行分析并编码,成功构建48份鲜食葡萄种质的指纹图谱和分子身份证。聚类结果表明,皇家秋天与其余鲜食葡萄种质亲缘关系明显较远。当遗传距离为0.05时,其余47份种质可分为两大类,其中,第一大类细分为2类(遗传距离为0.08);第二大类细分为11类(遗传距离为0.10),且可再向下细分3级(遗传距离分别为0.26、0.20、0.30),聚类结果与以农艺形态特征和成熟季节类别聚类大致相符。【结论】在48份供试鲜食葡萄种质中,筛选的9对引物多态性好,基于SSR技术对鲜食葡萄种质的区分率达100%,并成功构建48份鲜食葡萄种质的SSR分子指纹图谱和分子身份证。 展开更多
关键词 ssr 引物 多态性 鲜食葡萄 分子身份证 聚类分析 指纹图谱
在线阅读 下载PDF
基于SSR标记的104份苦荞种质资源遗传多样性及群体结构分析
14
作者 吴叶宁 胡昊驰 +4 位作者 王春勇 谢锐 张永虎 温蕊 金晓蕾 《作物杂志》 北大核心 2026年第1期26-32,共7页
利用SSR分子标记,对我国104份苦荞地方种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果显示,9对多态性较高的SSR引物在104份苦荞种质资源中共扩增出22个等位基因,每对引物扩增等位基因数在2~4个,平均每个位点为2.444个,有效等位基因数(Ne)... 利用SSR分子标记,对我国104份苦荞地方种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果显示,9对多态性较高的SSR引物在104份苦荞种质资源中共扩增出22个等位基因,每对引物扩增等位基因数在2~4个,平均每个位点为2.444个,有效等位基因数(Ne)、Shannon’s多样性指数(I)、观测杂合度(H_(o))和期望杂合度(He)平均值分别为1.820、0.629、0.058和0.401,多态性信息含量(PIC)范围为0.0096~0.6115,平均值为0.3312。通过非加权类平均聚类法(UPGMA)进行聚类分析,将104份苦荞种质资源分为4个组群,内蒙古、云南、贵州和四川苦荞分布相似,主要分布在组群Ⅲ和Ⅳ,其余省份材料分布均匀,存在较丰富的遗传多样性。通过群体结构分析及二维主坐标分析(PCoA)验证,组群划分情况与聚类分析基本一致。本研究进一步明确了苦荞地方种质间的遗传多样性和亲缘关系,筛选出17份亲缘关系单一的种质材料,为苦荞种质资源的有效利用及新品种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 苦荞 ssr分子标记 种质资源 遗传多样性 群体结构
原文传递
基于SSR的猪喘气病易感性分子标记筛选
15
作者 岑晓丽 姜方雄 +5 位作者 田姣 龙菊烟 牛熙 黄世会 冉雪琴 王嘉福 《西南农业学报》 北大核心 2026年第1期217-224,共8页
【目的】筛选与猪喘气病易感性相关的SSR标记并探明与猪喘气病易感的相关候选基因,为抗病选育在动物辅助育种中的应用提供理论依据。【方法】采用30对SSR引物对健康(n=95)和病变(n=73)共168头大白猪和香猪样本进行PCR扩增;通过琼脂糖凝... 【目的】筛选与猪喘气病易感性相关的SSR标记并探明与猪喘气病易感的相关候选基因,为抗病选育在动物辅助育种中的应用提供理论依据。【方法】采用30对SSR引物对健康(n=95)和病变(n=73)共168头大白猪和香猪样本进行PCR扩增;通过琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)双重筛选,以获取具有高度多态性的SSR标记;通过相关性分析,探明与猪喘气病相关联的SSR标记,并将SSR标记差异片段回收测序及BLAST比对,从而确定SSR标记位置。【结果】获得6个具有高度多态性的SSR标记,分别为SW904、S0092、SW995、SW439、SW252和SW1071。相关性分析结果表明,2个SSR标记(SW252、SW1071)与猪喘气病易感性相关(P<0.05);BLAST比对结果显示,SSR标记分别定位于PSEN1(早老素1)和GRIN2B(N-甲基-D-天冬氨酸受体2B亚基)基因内含子上,且均存在重复序列的插入或缺失。【结论】得到与猪喘气病易感相关的SSR标记,并将其定位于基因上,PSEN1和GRIN2B可能通过重复序列的插入或缺失,对Notch、NF-κB等信号通路产生影响,进而调节机体的天然免疫,影响炎症反应。PSEN1和GRIN2B可能是猪喘气病易感的关键基因。 展开更多
关键词 猪喘气病 ssr标记 候选基因 PSEN1基因 GRIN2B基因
在线阅读 下载PDF
基于SSR标记的浙江省地方玉米种质遗传关系分析
16
作者 何苏悦 李燕 +3 位作者 丁云倩 李欣泽 韩庆辉 陈小央 《浙江农业学报》 北大核心 2026年第1期24-34,共11页
为探究浙江省地方玉米种质的遗传基础与亲缘关系,本研究利用40对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记对来自浙江省的259份地方玉米种质进行了遗传多样性分析。结果表明,40对SSR标记引物共检测出399个等位变异,每对引物检测到... 为探究浙江省地方玉米种质的遗传基础与亲缘关系,本研究利用40对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记对来自浙江省的259份地方玉米种质进行了遗传多样性分析。结果表明,40对SSR标记引物共检测出399个等位变异,每对引物检测到的等位基因变异数为4~22个,平均为9.975个;有效等位基因数范围为0.8185~1.0000,平均为0.9822;基因多样性指数范围为0.3036~0.9033,平均为0.7171;多态信息含量范围为0.2890~0.8954,平均为0.6868;Shannon指数范围为0.655~2.527,平均值为1.615。通过UPGMA聚类分析,将259份地方玉米种质划分为3个类群,第Ⅰ类群包含72份种质,占27.8%;第Ⅱ类群包含72份种质,占27.8%;第Ⅲ类群包含115份种质,占44.4%。主坐标分析表明,类群内个体距离较近,类群间距离大且无重叠,进一步证实聚类分析结果的可靠性。综上所述,浙江省地方玉米种质在育种实践过程中形成了相对独立的优势类群,遗传多样性丰富,可为玉米优异基因挖掘、优异种质创制和新品种培育奠定基础。 展开更多
关键词 玉米 简单重复序列(ssr)标记 聚类分析 主坐标分析 遗传关系 地方种质
在线阅读 下载PDF
厚壳贻贝转录组SSR位点分析与开发应用
17
作者 邵艳卿 方军 +2 位作者 刘一江 金涵誉 李腾腾 《浙江农业科学》 2026年第2期470-476,共7页
为进一步开发适合厚壳贻贝的EST-SSR分子标记,利用转录组序列信息获得了大量SSR位点,并分析了位点信息及群体遗传多样性。结果表明,转录组测序获得134331条UniGene序列,共检测出15988个SSR位点,出现频率为11.900%,平均每4.16 kb出现1个... 为进一步开发适合厚壳贻贝的EST-SSR分子标记,利用转录组序列信息获得了大量SSR位点,并分析了位点信息及群体遗传多样性。结果表明,转录组测序获得134331条UniGene序列,共检测出15988个SSR位点,出现频率为11.900%,平均每4.16 kb出现1个SSR位点。完整型SSR位点中共有172种重复基序,其中单核苷酸重复和二核苷酸重复为主要类型,分别占总SSR位点的83.00%和11.22%,以A/T基序(80.91%)和AT/AT基序(7.70%)为主。共设计出31125对SSR引物,在随机选取的60对引物中有11对表现出多态性,占比18.33%。利用多态性引物分析了厚壳贻贝群体遗传多样性,共检测到39个等位基因,各位点的等位基因数(Na)为3~5个,平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别为0.33、0.56和0.48,其中有8个位点极显著(p<0.01)偏离了哈代-温伯格平衡。这些EST-SSR分子标记的开发可为厚壳贻贝的种群遗传研究、亲缘关系、基因连锁、遗传多样性评价等提供有效支撑。 展开更多
关键词 厚壳贻贝 简单序列重复 转录组
在线阅读 下载PDF
长眉驼种群遗传多样性的SSR标记分析
18
作者 孙晓雯 《中国动物保健》 2026年第1期126-127,共2页
木垒长眉驼是我国特有的珍稀畜牧遗传资源,其突出的抗逆性与独特的遗传特性具有重要的保护价值与研究意义。本研究采用SSR分子标记技术,对新疆木垒哈萨克自治县65头长眉驼个体(ML种群)的遗传多样性进行分析。结果表明,木垒长眉驼种群具... 木垒长眉驼是我国特有的珍稀畜牧遗传资源,其突出的抗逆性与独特的遗传特性具有重要的保护价值与研究意义。本研究采用SSR分子标记技术,对新疆木垒哈萨克自治县65头长眉驼个体(ML种群)的遗传多样性进行分析。结果表明,木垒长眉驼种群具有中等水平的遗传多样性,遗传变异较为丰富,显示出良好的进化潜力与选育价值。本研究为该种群的遗传资源保护、亲缘关系鉴定及育种规划提供了分子层面的科学依据,也为木垒哈萨克自治县打造“中国长眉驼之乡”特色产业提供了遗传学支撑。 展开更多
关键词 长眉驼 ssr标记 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
基于EST-SSR的牡丹遗传多样性及观赏性状关联分析
19
作者 高凯 张智慧 +5 位作者 归凯旋 周晓君 王璇 王二强 张延召 程彦伟 《安徽农业科学》 2026年第4期79-85,共7页
[目的]研究牡丹种质资源遗传多样性和牡丹观赏性状之间关系。[方法]以30份不同品种牡丹为材料,采用20对高多态性EST-SSR引物开展遗传多样性分析,利用Structure软件进行群体遗传结构分析,利用Tassel 5.0软件将分子标记位点与花型、花朵... [目的]研究牡丹种质资源遗传多样性和牡丹观赏性状之间关系。[方法]以30份不同品种牡丹为材料,采用20对高多态性EST-SSR引物开展遗传多样性分析,利用Structure软件进行群体遗传结构分析,利用Tassel 5.0软件将分子标记位点与花型、花朵大小、花色、花期早晚、生长势、开花率6个观赏性状进行关联分析。[结果]15对高多态性引物的多态信息指数(PIC)平均值为0.584;Shannon’s信息指数(I)平均值为1.261,期望杂合度(H_(e))平均值为0.632;通过关联分析,统计到5个EST-SSR分子标记位点与5个观赏性状显著相关(P<0.05),其中3个位点(PS021、PS062、PS071)与花期早晚、花色、成花率3个观赏性状呈极显著相关(P<0.01)。[结论]参试的30份牡丹品种资源遗传多样性丰富,自然群体结构简单,可降低群体结构对关联分析的影响,并获得5个与观赏性状显著相关的分子标记。 展开更多
关键词 EST-ssr 牡丹 遗传多样性 观赏性状 关联分析
在线阅读 下载PDF
常绿杜鹃种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建 被引量：3
20
作者 张露 张平萍 +5 位作者 解玮佳 许凤 彭绿春 宋杰 杜光辉 李世峰 《园艺学报》 北大核心 2025年第2期380-394,共15页
利用马缨杜鹃(Rhododendron delavayi Franch.)基因组测序数据进行genomic-SSR的分布特征分析和多态性SSR引物开发,并对61份常绿杜鹃种质进行亲缘关系分析和指纹图谱构建,以实现种质间亲缘关系聚类及其亲本来源推测。开发出了15对多态... 利用马缨杜鹃(Rhododendron delavayi Franch.)基因组测序数据进行genomic-SSR的分布特征分析和多态性SSR引物开发,并对61份常绿杜鹃种质进行亲缘关系分析和指纹图谱构建,以实现种质间亲缘关系聚类及其亲本来源推测。开发出了15对多态性高、稳定性好、亚属间通用性强的SSR引物,在61份种质中共检测到等位基因位点126个,每对引物的平均等位基因数(N_(a))为8.400,平均有效等位基因数(N_(e))为3.4681,平均观测杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))分别为0.3421和0.5347,平均多态信息含量(PIC)为0.6338。群体遗传结构分析结果将61份常绿杜鹃种质分成3个亚类群,与亲缘关系聚类结果基本一致,结合已知谱系资料推测所引进日本品种的祖先亲本来源于两个不同的分布地,且包括自育品种在内的所有品种均是以常绿杜鹃亚属(subgen.Hymenanthes)常绿杜鹃组(sect.Ponticum)内物种为亲本的杂交种。利用5个SSR标记成功构建出61份常绿杜鹃种质的指纹图谱。 展开更多
关键词 常绿杜鹃 基因组ssr标记 遗传多样性 指纹图谱
原文传递
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 2 … 250 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部