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SRAP Marker Analysis of Genomic Mutation Induced by ^(60)Coγ-Ray Irradiation in Potato (Solanum tuberosum) 被引量:1
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作者 黄先群 刘子瑜 +5 位作者 黄团 唐章林 李丽 丁小令 林平 陈梦玉 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第8期1092-1098,共7页
[Objective] This study was to explore the mutagenic effect of 60Co γ-ray on Solanum tuberosum chromosomes.[Method] The 60Co γ-ray at different irradiation doses was applied to treat the minitubers of potato variety ... [Objective] This study was to explore the mutagenic effect of 60Co γ-ray on Solanum tuberosum chromosomes.[Method] The 60Co γ-ray at different irradiation doses was applied to treat the minitubers of potato variety 'Favorita',and the genomic mutations in VM1 and VM2 gene rations in treatments with different doses were analyzed by SRAP markers.[Resalt] Thirty pairs of SRAP primers out of 88 pairs exhibited polymorphism with a rate of 34.1% in the bulked selection of VM1 generation.A total of 225 bands were obtained,of which 64 were polymorphic with a rate of 28.4%.The polymorphism was reflected in the forms of deleted bands and added bands.Based on the result of the bulked selection of VM1 generation,25 primers with polymorphism were selected to scan VM2 generation.Five primers performed poorly,and nine of the rest 20 pairs revealed polymorphism and obtained nine polymorphic bands,of which only four bands were detected in VM1 generation and the other five ones were newly deleted bands.Only 9.8% of the bands detected in VM1 generation were obtained in VM2 generation.Eventually,nine stable and dear polymorphic bands were recovered and cloned,and DNA sequences of six bands of them were acquired by sequencing.According to the comparative analysis,five fragments sequences were similar to potato chromosome with a similarity rate of 77%-89%,three of them located at the resistance gene cluster; another one fragment had a similarity of 93% with some regions of the No.5 chromosome in tomato.[Conclusion] 60Co γ-ray irradiation can cause mutation of genomic DNA in potato;there is no significant correlation between the number of polymorphic bands and the irradiation dose; potymorphic bands are characterized by a larger number of deleted bands than that of the added ones. 展开更多
关键词 POTATO ^60Co γ-ray irradiation srap markers MUTATION
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Development of SRAP Markers Linked to a Gene for Stem Nematode Resistance in Sweetpotato, Ipomoea batatas (L.) Lam. 被引量:5
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作者 ZHAO Ning ZHAI Hong +5 位作者 YU Xiao-xia LIU Zhe-sheng HE Shao-zhen LI Qiang MA Dai-fu LIU Qing-chang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2013年第3期414-419,共6页
Sequence-related amplification polymorphism (SRAP) markers closely linked to stem nematode resistance gene were developed in sweetpotato, lpomoea batatas (L.) Lam. Using bulked segregant analysis (BSA), 200 SRAP... Sequence-related amplification polymorphism (SRAP) markers closely linked to stem nematode resistance gene were developed in sweetpotato, lpomoea batatas (L.) Lam. Using bulked segregant analysis (BSA), 200 SRAP primer combinations were screened with the resistant and susceptible bulked DNA from the 196 progenies of an F1 single-cross population of resistant parent Xu 781xsusceptible parent Xushu 18, 77 of them showed polymorphic bands between resistant and susceptible DNA. Primer combinations detecting polymorphism between the two bulks were used to screen both parents and 10 individuals from each of the bulks. The results showed that primer combination A9B4 produced 3 specific bands in the resistant plants but not in the susceptible plants, suggesting that the markers, named Nspl, Nsp2 and Nsp3, respectively, linked to a gene for stem nematode resistance. Primer combination A3B6 also produced a SRAP marker named Nsp4 linking to the resistance gene. Amplified analysis of the 196 F1 individuals indicated that the genetic distance between these markers and the resistance gene was 4.7, 4.7, 6.3, and 9.6 cM, respectively. 展开更多
关键词 Ipomoea batatas (L.) Lam. srap marker stem nematode
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基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
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作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 SCoT标记 srap标记 SSR标记
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基于SRAP分子标记的五十份木槿种质资源亲缘关系的分析
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作者 方茹 罗优波 +3 位作者 胡亚芬 王衍彬 王丽玲 杨少宗 《北方园艺》 北大核心 2025年第1期8-14,共7页
以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为... 以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为99.49%。在遗传距离为0.3620处,50份木槿样本被分为5组,分类结果显示木槿品种间的亲缘关系与木槿花花瓣基部色斑和花瓣型这2个形态特征呈现密切相关,而与花色以及植株、叶片以及果实等形态特征未呈现相关性。综上所述,SRAP标记技术对木槿基因组检测多态性水平高,可用于木槿种质资源鉴定以及分子标记辅助育种等工作。 展开更多
关键词 木槿 srap分子标记 种质资源 亲缘关系
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基于SSR和SRAP标记的沙芥属种质资源遗传多样性分析
5
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 张凤兰 郝丽珍 《北方园艺》 北大核心 2025年第2期1-7,共7页
以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、... 以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、Nei′s基因多样性平均值和Shannon多态性指数平均值分别为1.2607、54.88%、0.1593和0.2644;沙芥属植物遗传分化75.18%发生在沙芥种内和斧翅沙芥种各类型内,24.82%存在于种间和斧翅沙芥种内各个类型间;SRAP扩增结果显示斧翅沙芥种内不同类型之间的有效等位基因数平均值、多态性位点比率平均值、Nei′s基因多样性平均值、Shannon多态性指数的平均值分别为1.7032、70.32%、0.2342、0.3533;斧翅沙芥种遗传分化80.18%存在于类型内,19.82%存在于不同类型间。SSR分析表明沙芥种的遗传多样性水平要低于斧翅沙芥种,斧翅沙芥种内特殊类型的遗传多样性水平最高,依次是宽翅类型、距果类型、齿冠类型和斧形类型。SRAP对沙芥属与十字花科部分属植物亲缘关系分析表明沙芥属与供试的芸薹属、萝卜属、大青属、诸葛菜属、拟南芥属的亲缘关系均较远。 展开更多
关键词 沙芥属 遗传多样性 亲缘关系 SSR标记 srap标记
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基于SRAP标记的生姜种质资源遗传多样性分析
6
作者 李晋华 王少铭 +3 位作者 罗莉斯 冷家归 侯颖辉 李德文 《分子植物育种》 北大核心 2025年第1期182-193,共12页
为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采... 为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采用NTSYS pc-2.1软件进行种质间的UPGMA(Unweighted pair-group method,非加权组平均法)聚类分析和基于遗传一致度的群体间聚类分析。结果表明:供试96份生姜种质资源具有较为丰富的遗传多样性,利用筛选出的13对差异SRAP引物从生姜资源中扩增出多态性条带96条,多态性比率为88.89%,说明生姜种质资源的遗传变异较为广泛。根据来源相同或相近,将生姜种质资源分为13个群体,生姜资源品种间基于Nei's遗传多样性指数和Shannon多态性信息指数的分析结果表明,生姜虽为无性繁殖作物,但其具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记技术对生姜资源的多态性检出率水平较高,可有效揭示其遗传多样性和亲缘关系,群体内具有丰富的遗传多样性,但群体间遗传变异较小。 展开更多
关键词 生姜 srap分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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春兰杂交后代的表型性状及SRAP分子标记分析
7
作者 林榕燕 孔兰 +2 位作者 林兵 吴建设 钟淮钦 《北方园艺》 北大核心 2025年第20期23-30,共8页
以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于... 以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于表型性状和SRAP数据进行聚类分析,以期为春兰新品种选育提供参考依据。结果表明:20个数量性状变异系数为8.43%~37.41%,花序长度、花朵数和植株高度变异幅度较大;8个质量性状的信息多样性指数为0.47~1.57,遗传多样性指数为0.18~0.66,花型、花姿态、萼片形状和唇瓣姿态多样性较为丰富;共选出8个主成分,可以代表表型性状89.914%的遗传信息;基于表型性状的聚类分析将杂交后代分为2个类群,其中14个杂交后代株系与母本聚为一类;其他4个杂交后代株系与父本聚为一类。根据6对SRAP引物组合的父本特征带扩增情况,鉴定出18个杂交后代为真杂种;6对SRAP引物组合的平均多态性比例为80.43%,多态性信息含量均值为0.81;基于SRAP数据的聚类分析在遗传距离为0.34时将杂交后代分为三大类群,77.78%的杂交后代在亲缘关系上与母本聚为一类。综上所述,供试的‘黄荷梅’ב黄荷’杂交后代均为真杂种,其表型性状具有丰富的遗传多样性,且表现为偏母本遗传。 展开更多
关键词 春兰 杂交后代 表型性状 srap分子标记
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
8
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省合肥市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 srap分子标记 ISSR分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于SRAP标记的葡萄种质资源遗传多样性分析
9
作者 闫晓伟 魏一杰 +2 位作者 唐凡 王进 梁东 《北方园艺》 北大核心 2025年第21期8-15,共8页
以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表... 以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表明:运用SRAP分子标记技术,77份葡萄种质共检测出67个等位基因,每对引物平均扩增出等位基因6.70个,其中有效等位基因5.71个,遗传多样性分析所得遗传多样性指数为0.3882,香农指数平均为0.5637,77份葡萄品种试材通过聚类分析分为5类,群体分析为3类。综上所述,77份葡萄种质展现出丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 葡萄 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
10
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 郝丽珍 张凤兰 《安徽农业科学》 2025年第19期89-92,共4页
[目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过... [目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过一系列检测后,结果显示共138个位点被检出,其中多态位点百分比达到92.70%;Nei’s基因多样性指数平均值、Shannon’s信息多样性指数平均值、总基因多样性指数、遗传分化系数和基因流值分别为0.2204、0.3315、0.3112、0.2917和1.2140。沙芥不同居群之间存在一定的遗传分化,大部分发生在居群内,约占70.83%,29.17%发生在居群间。[结论]该研究结果可为后续开展沙芥珍稀物种的保护和利用奠定基础。 展开更多
关键词 沙芥 遗传多样性 亲缘关系 srap标记
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黄精SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选
11
作者 陈卫易 徐昌艳 +4 位作者 钱志瑶 吴红 王友峰 覃容贵 罗忠圣 《山东化工》 2025年第6期4-8,共5页
目的:优化并建立黄精SRAP反应体系,为黄精遗传多样性研究及其资源保护、良种选育提供更多理论依据。方法:在单因素试验的基础上,以Taq PCR MasterMix用量、Mg^(2+)浓度、模板DNA用量、Taq DNA聚合酶用量进行正交试验设计,优化黄精SRAP-... 目的:优化并建立黄精SRAP反应体系,为黄精遗传多样性研究及其资源保护、良种选育提供更多理论依据。方法:在单因素试验的基础上,以Taq PCR MasterMix用量、Mg^(2+)浓度、模板DNA用量、Taq DNA聚合酶用量进行正交试验设计,优化黄精SRAP-PCR反应体系,并进行有效引物筛选。结果:黄精的SRAP最佳反应体系为:12μL Taq PCR Master Mix,30 ng模板DNA,1.25μmol/L引物,0.375 mmol/L Mg^(2+),0.17 mmol/L dNTPs,1.5 U Taq DNA聚合酶,加入ddH_(2)O至20μL;从99对随机引物中筛选出7对有效引物。结论:建立的黄精SRAP-PCR反应体系稳定性、重复性良好,可用于黄精遗传多样性研究。 展开更多
关键词 黄精 相关序列扩增多态性 分子标记 遗传多样性
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基于SRAP标记的黄岩凤仙花遗传多样性和遗传结构研究
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作者 方宇洁 朱晏 +6 位作者 周靓雯 王顺莉 张凯伦 何佳薇 鲍洪华 张慧娟 蒋明 《台州学院学报》 2025年第3期35-41,共7页
黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中... 黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中共筛选得到了7组多态性高且稳定性好的引物;利用这些引物共扩增到DNA条带112条,其中多态性条带111条。在物种水平上,黄岩凤仙花的多态性比率(PPB)、Nei′s基因多样性指数(H)和Shannon′s指数(I)分别为98.98%、0.2747和0.4223;在居群水平上,PPB、H和I的均值分别为51.50%、0.1798和0.2691,表明遗传多样性低于物种水平。居群间的遗传距离介于0.1349~0.2309之间,基因分化系数(Gst)为0.3454,表明遗传变异主要分布在居群内部;基因流(Nm)为0.9475,表明居群间的基因流动较少。UPGAM聚类结果显示:40个单株可分为4组,分别为葫芦田、花积山、沙埠和涌泉,与地理分布完全一致;当基因型数量K=4时,40个样品可划分成4个亚类,这一结果与主成分分析一致。 展开更多
关键词 黄岩凤仙花 srap 分子标记 遗传多样性 遗传结构
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基于SRAP分子标记的石斛兰杂交后代鉴定及其遗传多样性分析
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作者 林榕燕 陈艺荃 +2 位作者 林觅 伍莉娟 钟海丰 《东南园艺》 2025年第2期162-168,共7页
【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定... 【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定及遗传多样性分析。【结果】从90对SRAP引物中筛选7对特异性引物,实现对杂交后代的高效鉴定,效率达100%;多态性分析显示,7对引物的多态性比例为81.03%,揭示了丰富的遗传变异。聚类分析表明,在遗传距离为0.24时,153个样本材料可分为五个类群;82.78%的杂交后代与父本聚为一类,亲缘关系更近;杂交后代株系间的遗传相似系数普遍高于其与双亲的遗传相似系数,父本和母本与杂交后代株系的遗传相似系数接近。【结论】SRAP分子标记可用于石斛兰杂交后代早期鉴定,能够有效辅助石斛兰新品种鉴定和选育。 展开更多
关键词 石斛兰 srap标记 多态性 真实性鉴定 遗传多样性 特异性引物
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巴马火麻性别相关的SRAP和SCAR分子标记
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作者 赵艳红 赵洪涛 +6 位作者 侯文焕 廖小芳 韦袭芹 唐美丽 黄善华 唐兴富 黄其椿 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第19期6390-6395,共6页
本研究以巴马火麻为试验材料,采用SRAP分子标记技术,筛选与巴马火麻性别相关或连锁的特异条带。结果显示,引物ISSR839在巴马火麻雌雄单株之间存在较好多态性且条带清晰。因此,利用ISSR839引物检测雌雄单株之间的遗传稳定性,用于构建极... 本研究以巴马火麻为试验材料,采用SRAP分子标记技术,筛选与巴马火麻性别相关或连锁的特异条带。结果显示,引物ISSR839在巴马火麻雌雄单株之间存在较好多态性且条带清晰。因此,利用ISSR839引物检测雌雄单株之间的遗传稳定性,用于构建极端雌雄DNA池。此外,560对SRAP引物组合中24对引物在雌雄DNA池间能扩增出差异条带,其中引物对me11/em12在雄性DNA池中能稳定的扩增出一条1431 bp的特异条带,而相应的雌性DNA池未能扩增出此条带。为了将此特异条带转化为稳定的SCAR标记,基于me11/em12引物对的基础,分别向5'和3'端延伸了2~3个碱基,获得SCAR标记的特异引物HXF/HXR,该引物经火麻雌雄单株验证。结果显示,雄性单株能扩增出唯一的1436 bp条带,命名为SCAR-1436,而相应的雌性单株未能扩增此条带。该特异片段经克隆测序与比对,在NCBI上未找到与该片段同源的序列。本研究结果可为苗期的火麻植株进行雌雄性别鉴定,合理控制雌雄植株比例,提高火麻籽产量提供技术手段。 展开更多
关键词 火麻 分子标记 srap SCAR 性别鉴定
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石斛兰杂交后代SRAP鉴定与遗传多样性分析 被引量:5
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作者 林榕燕 陈艺荃 +3 位作者 孔兰 钟淮钦 林兵 叶秀仙 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第15期46-52,共7页
以麝香石斛、檀香石斛及麝香石斛×檀香石斛的100个杂交后代株系为试材,采用SRAP分子标记的方法,研究了杂交后代的真实性及亲本与杂交后代群体的遗传多样性,以期为加速石斛兰新品种的选育提供参考依据。结果表明:综合6对SRAP引物组... 以麝香石斛、檀香石斛及麝香石斛×檀香石斛的100个杂交后代株系为试材,采用SRAP分子标记的方法,研究了杂交后代的真实性及亲本与杂交后代群体的遗传多样性,以期为加速石斛兰新品种的选育提供参考依据。结果表明:综合6对SRAP引物组合的扩增情况,共鉴定出100个杂交后代为真杂种,鉴定效率达100%;6对SRAP引物组合的多态性比例达97.26%,多态性信息含量均值为0.85;由聚类分析可知,92%的杂交后代在亲缘关系上与父本聚为一类;由遗传相似系数分析可知,杂交后代与父本间的遗传相似系数平均值大于母本。综上所述,供试的麝香石斛×檀香石斛杂交后代均为真杂种,且表现为偏父本遗传,SRAP分子标记可作为石斛兰杂交后代早期鉴定的有效手段。 展开更多
关键词 石斛兰 srap标记 杂交后代鉴定 遗传多样性
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基于SRAP分子标记的郁金香遗传多样性分析 被引量:2
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作者 秦斗文 刘伟强 +2 位作者 田吉婷 唐楠 巨秀婷 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期783-792,共10页
为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性... 为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性研究的多态性引物共21对,在40个品种中共扩增出249条清晰稳定的条带,其中多态性条带245条,多态性比率为98.39%。供试的40个品种遗传相似性指数为0.5020~0.8675,遗传多样性参数等位基因数(N*a)、有效等位基因数(N*e)、Nei’s基因多样性指数(H*)、Shannon’s信息指数(I*)和多态性信息含量分别为1.9810、1.5149、0.3042、0.4603和0.3212,供试材料遗传多样性丰富。聚类结果和主坐标分析将40个郁金香品种分为两大类,其中‘Christmas Magical’‘Banja Luka’‘Madame Lefeber’与其他品种亲缘关系较远,在遗传背景上具有一定差异。 展开更多
关键词 郁金香 srap 遗传多样性 聚类分析
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基于SRAP分子标记构建云南旱冬瓜核心种质 被引量:1
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作者 邹广权 王晓丽 +3 位作者 曹现富 李艳 张新洛 曹子林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期49-55,共7页
【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐... 【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐步取样法取样,采用4个遗传多样性指数分析种质子集对原种质的代表性,通过均值t检验和方差F检验分析种质子集与原种质集变异是否同质,利用相关系数分析种质子集与原种质集的相关性,通过遗传距离比较和聚类分析确认核心种质。【结果】25%抽样比例构建的种质子集的多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数和等位基因保留率与原种质集一致,其余4个评价指数皆显著大于原种质集,均值和方差与原种质的相关系数均接近或者等于1,平均遗传距离较原种质提高16.82%,因此认为在25%抽样比例构建的种质子集能很好地代表原种质。【结论】综合考虑核心种质的有效性、实用性、费用和工作量等,认为25%抽样比例构建的旱冬瓜核心种质能充分代表原种质的遗传多样性。 展开更多
关键词 旱冬瓜 srap标记数据 核心种质
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基于SRAP分子标记和农艺性状的大球盖菇种质资源遗传多样性分析 被引量:1
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作者 詹美蓉 严胜泽 +5 位作者 罗情情 王圣铕 谢婷 王爱琴 陆欢 王瑞娟 《南方农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期3563-3573,共11页
【目的】综合评价大球盖菇菌株的农艺性状及遗传多样性,筛选出适宜在福建三明地区栽培的优质菌株,为大球盖菇育种及其开发利用提供参考依据。【方法】通过ITS序列分析、拮抗试验及SRAP分子标记对收集的17株大球盖菇菌株进行遗传多样性分... 【目的】综合评价大球盖菇菌株的农艺性状及遗传多样性,筛选出适宜在福建三明地区栽培的优质菌株,为大球盖菇育种及其开发利用提供参考依据。【方法】通过ITS序列分析、拮抗试验及SRAP分子标记对收集的17株大球盖菇菌株进行遗传多样性分析,分别测定子实体长度、菌盖直径、菌盖厚度、菌柄上端直径、菌柄下端直径及单朵重等农艺性状后,采用相关分析和主成分分析对大球盖菇的农艺性状进行分析。【结果】ITS序列分析证实,17株供试菌株均为大球盖菇,在进化关系上分属于三大分支;拮抗试验结果表明,具有拮抗反应的培养组合共有87组,无拮抗反应的培养组合有49组,即大球盖菇菌株间存在较大差异性;17株大球盖菇菌株的遗传相似系数为0.66~0.92,遗传背景较丰富;当遗传相似系数为0.79时,17株大球盖菇菌株可分为六大类(I~VI)。不同农艺性状的遗传多样性指数(H')均大于1.50,变异系数为14.29%~47.82%。其中,单朵重的变异系数最大(47.82%),产量的变异系数较小(14.29%),说明大球盖菇农艺性状存在丰富的变异,具有高的遗传多样性。相关分析发现,培养皿菌丝形态与培养皿菌丝生长速率呈显著负相关(r=-0.565)(P<0.05,下同),与栽培袋菌丝形态、产量呈极显著正相关(r=0.772和r=0.664)(P<0.01,下同);培养皿菌丝生长速率与产量呈显著负相关(r=-0.524);栽培袋菌丝形态与产量呈极显著正相关(r=0.721)。主成分分析结果表明,第一主成分(PC1)的贡献率为50.768%,其特征向量较高的农艺性状是子实体长度和产量;第二主成分(PC2)的贡献率为38.729%,其特征向量较高的农艺性状是菌盖直径和菌柄上端直径。【结论】大球盖菇D-3菌株的菌丝生长均匀、浓密,生长速率较快,产量高且稳定,子实体菌柄粗壮,整体商品性好,可作为大球盖菇品种选育亲本,适宜在福建三明地区推广种植。 展开更多
关键词 大球盖菇 种质资源 srap分子标记 农艺性状 遗传多样性
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燕麦倒伏相关性状的SRAP关联分析 被引量:2
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作者 隋白婧 孙艳楠 +3 位作者 纪明雪 王永聪 杨超 齐冰洁 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第12期73-81,104,共10页
【目的】挖掘与燕麦倒伏性状相关的SRAP分子标记,为燕麦倒伏相关性状的研究及分子标记辅助育种提供遗传基础。【方法】以62份燕麦种质为试材,测定其表型性状、茎秆力学特性以及茎秆生理生化指标,并进行描述性和相关性分析;利用筛选的10... 【目的】挖掘与燕麦倒伏性状相关的SRAP分子标记,为燕麦倒伏相关性状的研究及分子标记辅助育种提供遗传基础。【方法】以62份燕麦种质为试材,测定其表型性状、茎秆力学特性以及茎秆生理生化指标,并进行描述性和相关性分析;利用筛选的10对SRAP引物组合对其进行多态性和关联分析。【结果】供试燕麦种质的茎壁厚度、茎秆弯曲强度、茎秆穿刺强度、茎秆压碎强度、倒伏指数、产量,以及茎秆第2节间的可溶性糖含量、纤维素含量、氮含量、磷含量和钾含量等11个性状差异较大;燕麦的株高、重心高度、穗位高和茎秆第2节间氮含量与倒伏指数呈极显著正相关,而茎秆第2节间的可溶性糖、纤维素、木质素和钾含量及茎秆穿刺强度与倒伏指数呈显著负相关。SRAP多样性分析显示,多态信息含量均值为0.4076,遗传多样性较高。关联分析分别检测到46个和25个标记位点与倒伏相关性状关联,其中位点A17B2和T4G4与多个倒伏性状关联。【结论】供试燕麦种质遗传差异大,多样性指数较高。关联分析找到与燕麦倒伏相关性状显著关联的SRAP分子标记,可用于燕麦分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 燕麦育种 倒伏性状 srap分子标记
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QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR,TRAP,SRAP and AFLP Markers in Cultivated Tetraploid Cotton 被引量:1
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作者 YU Ji-wen1,YU Shu-xun1,ZHANG Jin-fa2,ZHAI Hong-hong1(1.Cotton Research Institute of CAAS Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture,Anyang,Henan 455000,China 2.Department of Plant and Environmental Sciences,New Mexico State University,Las Cruces,NM 88003) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期34-,共1页
Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,b... Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,both cotton yield and quality should be enhanced.However,cotton yield 展开更多
关键词 QTLs AFLP QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR TRAP srap and AFLP markers in Cultivated Tetraploid Cotton SSR Map
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