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SRAP Marker Analysis of Genomic Mutation Induced by ^(60)Coγ-Ray Irradiation in Potato (Solanum tuberosum) 被引量:1
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作者 黄先群 刘子瑜 +5 位作者 黄团 唐章林 李丽 丁小令 林平 陈梦玉 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第8期1092-1098,共7页
[Objective] This study was to explore the mutagenic effect of 60Co γ-ray on Solanum tuberosum chromosomes.[Method] The 60Co γ-ray at different irradiation doses was applied to treat the minitubers of potato variety ... [Objective] This study was to explore the mutagenic effect of 60Co γ-ray on Solanum tuberosum chromosomes.[Method] The 60Co γ-ray at different irradiation doses was applied to treat the minitubers of potato variety 'Favorita',and the genomic mutations in VM1 and VM2 gene rations in treatments with different doses were analyzed by SRAP markers.[Resalt] Thirty pairs of SRAP primers out of 88 pairs exhibited polymorphism with a rate of 34.1% in the bulked selection of VM1 generation.A total of 225 bands were obtained,of which 64 were polymorphic with a rate of 28.4%.The polymorphism was reflected in the forms of deleted bands and added bands.Based on the result of the bulked selection of VM1 generation,25 primers with polymorphism were selected to scan VM2 generation.Five primers performed poorly,and nine of the rest 20 pairs revealed polymorphism and obtained nine polymorphic bands,of which only four bands were detected in VM1 generation and the other five ones were newly deleted bands.Only 9.8% of the bands detected in VM1 generation were obtained in VM2 generation.Eventually,nine stable and dear polymorphic bands were recovered and cloned,and DNA sequences of six bands of them were acquired by sequencing.According to the comparative analysis,five fragments sequences were similar to potato chromosome with a similarity rate of 77%-89%,three of them located at the resistance gene cluster; another one fragment had a similarity of 93% with some regions of the No.5 chromosome in tomato.[Conclusion] 60Co γ-ray irradiation can cause mutation of genomic DNA in potato;there is no significant correlation between the number of polymorphic bands and the irradiation dose; potymorphic bands are characterized by a larger number of deleted bands than that of the added ones. 展开更多
关键词 POTATO ^60Co γ-ray irradiation srap markers MUTATION
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Development of SRAP Markers Linked to a Gene for Stem Nematode Resistance in Sweetpotato, Ipomoea batatas (L.) Lam. 被引量:5
2
作者 ZHAO Ning ZHAI Hong +5 位作者 YU Xiao-xia LIU Zhe-sheng HE Shao-zhen LI Qiang MA Dai-fu LIU Qing-chang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2013年第3期414-419,共6页
Sequence-related amplification polymorphism (SRAP) markers closely linked to stem nematode resistance gene were developed in sweetpotato, lpomoea batatas (L.) Lam. Using bulked segregant analysis (BSA), 200 SRAP... Sequence-related amplification polymorphism (SRAP) markers closely linked to stem nematode resistance gene were developed in sweetpotato, lpomoea batatas (L.) Lam. Using bulked segregant analysis (BSA), 200 SRAP primer combinations were screened with the resistant and susceptible bulked DNA from the 196 progenies of an F1 single-cross population of resistant parent Xu 781xsusceptible parent Xushu 18, 77 of them showed polymorphic bands between resistant and susceptible DNA. Primer combinations detecting polymorphism between the two bulks were used to screen both parents and 10 individuals from each of the bulks. The results showed that primer combination A9B4 produced 3 specific bands in the resistant plants but not in the susceptible plants, suggesting that the markers, named Nspl, Nsp2 and Nsp3, respectively, linked to a gene for stem nematode resistance. Primer combination A3B6 also produced a SRAP marker named Nsp4 linking to the resistance gene. Amplified analysis of the 196 F1 individuals indicated that the genetic distance between these markers and the resistance gene was 4.7, 4.7, 6.3, and 9.6 cM, respectively. 展开更多
关键词 Ipomoea batatas (L.) Lam. srap marker stem nematode
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基于Touchdown程序的甜菜SRAP核心引物的筛选
3
作者 张程伟 刘佳俊 +2 位作者 阚文亮 宋玥 吴则东 《中国糖料》 2026年第1期40-46,共7页
【目的】旨在筛选出高多态性、高稳定性的SRAP核心引物用于甜菜遗传多样性的鉴定。【方法】利用Touchdown程序对SRAP引物组合进行扩增,用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对扩增条带进行分离,基于扩增结果进行数据分析筛选出符合要求的引... 【目的】旨在筛选出高多态性、高稳定性的SRAP核心引物用于甜菜遗传多样性的鉴定。【方法】利用Touchdown程序对SRAP引物组合进行扩增,用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对扩增条带进行分离,基于扩增结果进行数据分析筛选出符合要求的引物。【结果】从24种上游引物与21种下游引物的504对组合中筛选出43对高多态性、高稳定性的引物组合,其中40对引物组合的多态性信息量(PIC)值大于0.75,24对引物组合PIC值大于0.8,4对引物组合PIC值大于0.9。多态性信息量范围在0.657~0.953,引物对的平均PIC值为0.812。【结论】SRAP核心引物的筛选为甜菜的遗传多样性鉴定以及进一步杂交育种的亲本选择、分子标记辅助育种等提供理论支撑。 展开更多
关键词 甜菜 srap引物 分子标记 核心引物
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基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
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作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 SCoT标记 srap标记 SSR标记
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基于SRAP分子标记的五十份木槿种质资源亲缘关系的分析
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作者 方茹 罗优波 +3 位作者 胡亚芬 王衍彬 王丽玲 杨少宗 《北方园艺》 北大核心 2025年第1期8-14,共7页
以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为... 以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为99.49%。在遗传距离为0.3620处,50份木槿样本被分为5组,分类结果显示木槿品种间的亲缘关系与木槿花花瓣基部色斑和花瓣型这2个形态特征呈现密切相关,而与花色以及植株、叶片以及果实等形态特征未呈现相关性。综上所述,SRAP标记技术对木槿基因组检测多态性水平高,可用于木槿种质资源鉴定以及分子标记辅助育种等工作。 展开更多
关键词 木槿 srap分子标记 种质资源 亲缘关系
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析 被引量:1
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作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省合肥市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 srap分子标记 ISSR分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于SSR和SRAP标记的沙芥属种质资源遗传多样性分析
7
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 张凤兰 郝丽珍 《北方园艺》 北大核心 2025年第2期1-7,共7页
以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、... 以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、Nei′s基因多样性平均值和Shannon多态性指数平均值分别为1.2607、54.88%、0.1593和0.2644;沙芥属植物遗传分化75.18%发生在沙芥种内和斧翅沙芥种各类型内,24.82%存在于种间和斧翅沙芥种内各个类型间;SRAP扩增结果显示斧翅沙芥种内不同类型之间的有效等位基因数平均值、多态性位点比率平均值、Nei′s基因多样性平均值、Shannon多态性指数的平均值分别为1.7032、70.32%、0.2342、0.3533;斧翅沙芥种遗传分化80.18%存在于类型内,19.82%存在于不同类型间。SSR分析表明沙芥种的遗传多样性水平要低于斧翅沙芥种,斧翅沙芥种内特殊类型的遗传多样性水平最高,依次是宽翅类型、距果类型、齿冠类型和斧形类型。SRAP对沙芥属与十字花科部分属植物亲缘关系分析表明沙芥属与供试的芸薹属、萝卜属、大青属、诸葛菜属、拟南芥属的亲缘关系均较远。 展开更多
关键词 沙芥属 遗传多样性 亲缘关系 SSR标记 srap标记
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QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR,TRAP,SRAP and AFLP Markers in Cultivated Tetraploid Cotton 被引量:1
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作者 YU Ji-wen1,YU Shu-xun1,ZHANG Jin-fa2,ZHAI Hong-hong1(1.Cotton Research Institute of CAAS Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture,Anyang,Henan 455000,China 2.Department of Plant and Environmental Sciences,New Mexico State University,Las Cruces,NM 88003) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期34-,共1页
Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,b... Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,both cotton yield and quality should be enhanced.However,cotton yield 展开更多
关键词 QTLs AFLP QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR TRAP srap and AFLP markers in Cultivated Tetraploid Cotton SSR Map
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基于SRAP标记的生姜种质资源遗传多样性分析
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作者 李晋华 王少铭 +3 位作者 罗莉斯 冷家归 侯颖辉 李德文 《分子植物育种》 北大核心 2025年第1期182-193,共12页
为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采... 为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采用NTSYS pc-2.1软件进行种质间的UPGMA(Unweighted pair-group method,非加权组平均法)聚类分析和基于遗传一致度的群体间聚类分析。结果表明:供试96份生姜种质资源具有较为丰富的遗传多样性,利用筛选出的13对差异SRAP引物从生姜资源中扩增出多态性条带96条,多态性比率为88.89%,说明生姜种质资源的遗传变异较为广泛。根据来源相同或相近,将生姜种质资源分为13个群体,生姜资源品种间基于Nei's遗传多样性指数和Shannon多态性信息指数的分析结果表明,生姜虽为无性繁殖作物,但其具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记技术对生姜资源的多态性检出率水平较高,可有效揭示其遗传多样性和亲缘关系,群体内具有丰富的遗传多样性,但群体间遗传变异较小。 展开更多
关键词 生姜 srap分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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春兰杂交后代的表型性状及SRAP分子标记分析
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作者 林榕燕 孔兰 +2 位作者 林兵 吴建设 钟淮钦 《北方园艺》 北大核心 2025年第20期23-30,共8页
以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于... 以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于表型性状和SRAP数据进行聚类分析,以期为春兰新品种选育提供参考依据。结果表明:20个数量性状变异系数为8.43%~37.41%,花序长度、花朵数和植株高度变异幅度较大;8个质量性状的信息多样性指数为0.47~1.57,遗传多样性指数为0.18~0.66,花型、花姿态、萼片形状和唇瓣姿态多样性较为丰富;共选出8个主成分,可以代表表型性状89.914%的遗传信息;基于表型性状的聚类分析将杂交后代分为2个类群,其中14个杂交后代株系与母本聚为一类;其他4个杂交后代株系与父本聚为一类。根据6对SRAP引物组合的父本特征带扩增情况,鉴定出18个杂交后代为真杂种;6对SRAP引物组合的平均多态性比例为80.43%,多态性信息含量均值为0.81;基于SRAP数据的聚类分析在遗传距离为0.34时将杂交后代分为三大类群,77.78%的杂交后代在亲缘关系上与母本聚为一类。综上所述,供试的‘黄荷梅’ב黄荷’杂交后代均为真杂种,其表型性状具有丰富的遗传多样性,且表现为偏母本遗传。 展开更多
关键词 春兰 杂交后代 表型性状 srap分子标记
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基于SRAP标记的葡萄种质资源遗传多样性分析
11
作者 闫晓伟 魏一杰 +2 位作者 唐凡 王进 梁东 《北方园艺》 北大核心 2025年第21期8-15,共8页
以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表... 以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表明:运用SRAP分子标记技术,77份葡萄种质共检测出67个等位基因,每对引物平均扩增出等位基因6.70个,其中有效等位基因5.71个,遗传多样性分析所得遗传多样性指数为0.3882,香农指数平均为0.5637,77份葡萄品种试材通过聚类分析分为5类,群体分析为3类。综上所述,77份葡萄种质展现出丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 葡萄 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
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作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 郝丽珍 张凤兰 《安徽农业科学》 2025年第19期89-92,共4页
[目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过... [目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过一系列检测后,结果显示共138个位点被检出,其中多态位点百分比达到92.70%;Nei’s基因多样性指数平均值、Shannon’s信息多样性指数平均值、总基因多样性指数、遗传分化系数和基因流值分别为0.2204、0.3315、0.3112、0.2917和1.2140。沙芥不同居群之间存在一定的遗传分化,大部分发生在居群内,约占70.83%,29.17%发生在居群间。[结论]该研究结果可为后续开展沙芥珍稀物种的保护和利用奠定基础。 展开更多
关键词 沙芥 遗传多样性 亲缘关系 srap标记
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黄精SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选
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作者 陈卫易 徐昌艳 +4 位作者 钱志瑶 吴红 王友峰 覃容贵 罗忠圣 《山东化工》 2025年第6期4-8,共5页
目的:优化并建立黄精SRAP反应体系,为黄精遗传多样性研究及其资源保护、良种选育提供更多理论依据。方法:在单因素试验的基础上,以Taq PCR MasterMix用量、Mg^(2+)浓度、模板DNA用量、Taq DNA聚合酶用量进行正交试验设计,优化黄精SRAP-... 目的:优化并建立黄精SRAP反应体系,为黄精遗传多样性研究及其资源保护、良种选育提供更多理论依据。方法:在单因素试验的基础上,以Taq PCR MasterMix用量、Mg^(2+)浓度、模板DNA用量、Taq DNA聚合酶用量进行正交试验设计,优化黄精SRAP-PCR反应体系,并进行有效引物筛选。结果:黄精的SRAP最佳反应体系为:12μL Taq PCR Master Mix,30 ng模板DNA,1.25μmol/L引物,0.375 mmol/L Mg^(2+),0.17 mmol/L dNTPs,1.5 U Taq DNA聚合酶,加入ddH_(2)O至20μL;从99对随机引物中筛选出7对有效引物。结论:建立的黄精SRAP-PCR反应体系稳定性、重复性良好,可用于黄精遗传多样性研究。 展开更多
关键词 黄精 相关序列扩增多态性 分子标记 遗传多样性
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基于SRAP标记的黄岩凤仙花遗传多样性和遗传结构研究
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作者 方宇洁 朱晏 +6 位作者 周靓雯 王顺莉 张凯伦 何佳薇 鲍洪华 张慧娟 蒋明 《台州学院学报》 2025年第3期35-41,共7页
黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中... 黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中共筛选得到了7组多态性高且稳定性好的引物;利用这些引物共扩增到DNA条带112条,其中多态性条带111条。在物种水平上,黄岩凤仙花的多态性比率(PPB)、Nei′s基因多样性指数(H)和Shannon′s指数(I)分别为98.98%、0.2747和0.4223;在居群水平上,PPB、H和I的均值分别为51.50%、0.1798和0.2691,表明遗传多样性低于物种水平。居群间的遗传距离介于0.1349~0.2309之间,基因分化系数(Gst)为0.3454,表明遗传变异主要分布在居群内部;基因流(Nm)为0.9475,表明居群间的基因流动较少。UPGAM聚类结果显示:40个单株可分为4组,分别为葫芦田、花积山、沙埠和涌泉,与地理分布完全一致;当基因型数量K=4时,40个样品可划分成4个亚类,这一结果与主成分分析一致。 展开更多
关键词 黄岩凤仙花 srap 分子标记 遗传多样性 遗传结构
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基于SRAP分子标记的石斛兰杂交后代鉴定及其遗传多样性分析
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作者 林榕燕 陈艺荃 +2 位作者 林觅 伍莉娟 钟海丰 《东南园艺》 2025年第2期162-168,共7页
【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定... 【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定及遗传多样性分析。【结果】从90对SRAP引物中筛选7对特异性引物,实现对杂交后代的高效鉴定,效率达100%;多态性分析显示,7对引物的多态性比例为81.03%,揭示了丰富的遗传变异。聚类分析表明,在遗传距离为0.24时,153个样本材料可分为五个类群;82.78%的杂交后代与父本聚为一类,亲缘关系更近;杂交后代株系间的遗传相似系数普遍高于其与双亲的遗传相似系数,父本和母本与杂交后代株系的遗传相似系数接近。【结论】SRAP分子标记可用于石斛兰杂交后代早期鉴定,能够有效辅助石斛兰新品种鉴定和选育。 展开更多
关键词 石斛兰 srap标记 多态性 真实性鉴定 遗传多样性 特异性引物
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Interspecific Hybridization between Cucumis ssp. Plants and SRAP Analysis of Hybrids 被引量:2
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作者 王吉明 包文风 +2 位作者 尚建立 马双武 樊辉 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第8期1118-1120,1128,共4页
To understand the inter-hybridization between Cucumis ssp.plants,we used 150 melon varieties as female parents to cross with Cucumis metuliferus and Cucumis anguria.Only melon accessions V2 and V129 set fruits,but see... To understand the inter-hybridization between Cucumis ssp.plants,we used 150 melon varieties as female parents to cross with Cucumis metuliferus and Cucumis anguria.Only melon accessions V2 and V129 set fruits,but seeds from fruits V2(V129)×C.metuliferus were abortive.A few of seeds from the bottom of fruit V2(V129)×C.anguria were fertile.Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)molecular markers were used to analyze the progenies of inter-specific hybridization between C.anguria and melon V129.One pair primer(E14/M2)was found effective in amplification on male parent characteristic bands from the hybrids,suggesting that some DNA exchange had happened between C.anguria and melon V129.This study provided data for analyzing the mechanism of inter-hybridization between Cucumis plants. 展开更多
关键词 Cucumis ssp. Interspecific hybridization srap markers
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新疆野苹果群体遗传结构和遗传多样性的SRAP分析 被引量:74
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作者 张春雨 陈学森 +5 位作者 林群 苑兆和 张红 张小燕 刘崇祺 吴传金 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期7-14,共8页
采用SRAP分析中国新疆野苹果4个种下居群的群体遗传结构和遗传多样性。结果表明:10对SRAP引物总共扩增了209条带,其中206条是多态性带(98.56%)。巩留群体、新源群体、霍城群体和裕民群体分别扩增了180、169、178和165条多态性带,巩留群... 采用SRAP分析中国新疆野苹果4个种下居群的群体遗传结构和遗传多样性。结果表明:10对SRAP引物总共扩增了209条带,其中206条是多态性带(98.56%)。巩留群体、新源群体、霍城群体和裕民群体分别扩增了180、169、178和165条多态性带,巩留群体的随机交配杂合度(hs=0.3037±0.0058)最高,其次为霍城群体。UPGMA聚类分析和群体间遗传分化系数显示,巩留群体和新源群体之间,以及霍城群体和裕民群体之间,遗传关系最近,群体间遗传变异最低。新疆野苹果群体内遗传变异高于群体间,占总变异的87.9%,主坐标轴分析显示4个群体是相对独立的,其中巩留群体和新源群体,霍城群体和裕民群体之间有较高的基因交流。所有参数分析表明,巩留群体遗传多样性最丰富,故在制定新疆野苹果原地和异地种质保护计划时应优先考虑巩留群体。 展开更多
关键词 新疆野苹果 srap 遗传多样性 群体遗传结构
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利用SRAP与SSR标记分析不同类型甜菜的遗传多样性 被引量:69
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作者 王华忠 吴则东 +1 位作者 王晓武 方智远 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期37-46,共10页
为选育优质甜菜新品种,指导种质资源引进和利用,为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据,采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64... 为选育优质甜菜新品种,指导种质资源引进和利用,为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据,采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64对引物组合及SSR的11对引物组合进行扩增,分别筛选出有效引物组合11对和9对。SRAP的11对引物组合共产生199条扩增带,其中有86条多态性带,多态性带的比率平均为43.7%。SSR的9对引物共产生35条扩增带,多态性比率为100%。全部材料的平均遗传距离为0.3860,平均遗传相似系数为0.6795,大约30%的材料遗传距离或遗传相似系数具显著或极显著差异。遗传相似系数平均值比较,多胚四倍体品系0.7264>单胚杂交组合0.7243>国外品种0.7060>多胚二倍体品系0.6908>单胚品系0.6837。在遗传距离0.20处,将49个甜菜材料划分为A、B、C、D4个类群,D类群又分为4个亚类,较好地显示了甜菜材料丰富的遗传多样性。表明不同甜菜品种具有相当高的异质性,国外与国内材料的遗传基础存在一定差异,但生产应用的甜菜品种间存在亲缘关系较近、遗传基础较窄的倾向。 展开更多
关键词 甜菜 SSR标记 srap标记 遗传多样性 亲缘关系
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结缕草属植物杂交后代杂种真实性鉴定--SRAP分子标记 被引量:39
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作者 薛丹丹 郭海林 +2 位作者 郑轶琦 陈宣 刘建秀 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第1期72-79,共8页
SRAP标记是基于PCR技术的一种新型分子标记。本研究通过SRAP分子标记技术对结缕草属植物种间杂交的5个组合37份杂交后代进行了真假杂种的鉴定,以为育种工作进一步开展奠定基础。首先筛选出在父本中能扩增出,而在母本中没有的特征带的引... SRAP标记是基于PCR技术的一种新型分子标记。本研究通过SRAP分子标记技术对结缕草属植物种间杂交的5个组合37份杂交后代进行了真假杂种的鉴定,以为育种工作进一步开展奠定基础。首先筛选出在父本中能扩增出,而在母本中没有的特征带的引物,共筛选出9对引物对后代进行真实性鉴定。把父母本和后代一起进行PCR扩增、电泳,根据后代中是否能扩增出父本特征带而进行鉴定。结果表明,37个杂交后代中有32个后代具有父本特征带,被鉴定为真杂种。同时,从杂种扩增的谱带来看,条带清晰、稳定且后代出现了丰富的变异,主要表现为新谱带的出现或某些谱带的消失。据此认为,SRAP标记可以有效地对结缕草属杂交后代进行真实性鉴定和遗传分析,为杂交育种提供了理论依据。 展开更多
关键词 结缕草 杂交育种 srap标记 杂种鉴定
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利用SRAP标记构建甘薯分子连锁图谱 被引量:38
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作者 李爱贤 刘庆昌 +3 位作者 王庆美 张立明 翟红 刘树震 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1286-1295,共10页
以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别... 以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别构建了2个亲本的分子连锁图谱。其中漯徐薯8号的图谱包括由473个SRAP标记组成的81个连锁群,总图距为5802.46cM,标记间平均图距为10.16cM;郑薯20的图谱包括由328个SRAP标记组成的66个连锁群,总图距为3967.90cM,标记间平均图距为12.02cM。该高密度分子连锁图谱的构建,为甘薯分子标记辅助选择、基因定位及克隆研究奠定了基础。 展开更多
关键词 甘薯 分子连锁图谱 srap标记
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