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基于SRAP分子标记的五十份木槿种质资源亲缘关系的分析
1
作者 方茹 罗优波 +3 位作者 胡亚芬 王衍彬 王丽玲 杨少宗 《北方园艺》 北大核心 2025年第1期8-14,共7页
以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为... 以木槿(Hibiscus syriacus L.)为试材,采用UPGMA法,通过16对SRAP引物组合研究50份木槿种质亲缘关系,以期为加速木槿新品种的选育进程提供参考依据。结果表明:16对SRAP引物组合共扩增出390条条带,其中有388条具有多态性,多态性比率平均为99.49%。在遗传距离为0.3620处,50份木槿样本被分为5组,分类结果显示木槿品种间的亲缘关系与木槿花花瓣基部色斑和花瓣型这2个形态特征呈现密切相关,而与花色以及植株、叶片以及果实等形态特征未呈现相关性。综上所述,SRAP标记技术对木槿基因组检测多态性水平高,可用于木槿种质资源鉴定以及分子标记辅助育种等工作。 展开更多
关键词 木槿 srap分子标记 种质资源 亲缘关系
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基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
2
作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 SCoT标记 srap标记 SSR标记
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基于SSR和SRAP标记的沙芥属种质资源遗传多样性分析
3
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 张凤兰 郝丽珍 《北方园艺》 北大核心 2025年第2期1-7,共7页
以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、... 以沙芥属植物和十字花科部分属植物叶片为试材,采用SSR和SRAP 2种分子标记技术,研究了沙芥属植物的亲缘关系与遗传多样性,以期为沙芥属植物应用提供参考依据。结果表明:7对引物检测到的有效等位基因数平均值、多态性位点百分比平均值、Nei′s基因多样性平均值和Shannon多态性指数平均值分别为1.2607、54.88%、0.1593和0.2644;沙芥属植物遗传分化75.18%发生在沙芥种内和斧翅沙芥种各类型内,24.82%存在于种间和斧翅沙芥种内各个类型间;SRAP扩增结果显示斧翅沙芥种内不同类型之间的有效等位基因数平均值、多态性位点比率平均值、Nei′s基因多样性平均值、Shannon多态性指数的平均值分别为1.7032、70.32%、0.2342、0.3533;斧翅沙芥种遗传分化80.18%存在于类型内,19.82%存在于不同类型间。SSR分析表明沙芥种的遗传多样性水平要低于斧翅沙芥种,斧翅沙芥种内特殊类型的遗传多样性水平最高,依次是宽翅类型、距果类型、齿冠类型和斧形类型。SRAP对沙芥属与十字花科部分属植物亲缘关系分析表明沙芥属与供试的芸薹属、萝卜属、大青属、诸葛菜属、拟南芥属的亲缘关系均较远。 展开更多
关键词 沙芥属 遗传多样性 亲缘关系 SSR标记 srap标记
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SRAP和ISSR分子标记技术在久星系列韭菜遗传多样性的应用
4
作者 孙楠 王宇欣 +4 位作者 王平智 林聪 马金海 张明 胡彬 《分子植物育种》 北大核心 2025年第13期4391-4399,共9页
为深化韭菜品种资源遗传多样性研究,本研究应用ISSR和SRAP分子标记方法,以24份具有高抗耐寒的久星系列韭菜栽培品种为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果显示:(1)从24个ISSR引物中筛选出6个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,... 为深化韭菜品种资源遗传多样性研究,本研究应用ISSR和SRAP分子标记方法,以24份具有高抗耐寒的久星系列韭菜栽培品种为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果显示:(1)从24个ISSR引物中筛选出6个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得84条稳定的条带,其中多态性条带52条(占61.90%);从24个SRAP引物中筛选出16个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得293条稳定的条带,其中多态性条带141条(占48.12%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了两分子标记技术关于24份材料间的遗传相似性系数(genetic similarity coefficient,GS),通过ISSR分析得到,其GS在0.70~0.98之间,品种间相似度高;通过SRAP分析得到,其GS在0.75~0.99之间,与ISSR分析结果一致;(3)对24份韭菜栽培品种的系统聚类分析表明:育种顺序接近的部分品种有相对聚合现象或少部分品种和类型出现交叉聚类,与其亲缘关系较近有关;‘久星28号’自成一类,与其特异的遗传基础差异较大有关。说明SRAP和ISSR是两种较稳定和可靠的进行韭菜遗传多样性分析的分子标记。通过24个韭菜品种样品的分析可知,久星系列韭菜品种的亲缘关系较近,在日后的韭菜育种工作中,可以通过加强与其他地区不同品种之间的合作育种、拓宽亲本的地域来源,以提升久星系列品种的遗传多样性,完善韭菜品种的结构。 展开更多
关键词 韭菜 ISSR srap 遗传多样性 亲缘关系
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春兰杂交后代的表型性状及SRAP分子标记分析
5
作者 林榕燕 孔兰 +2 位作者 林兵 吴建设 钟淮钦 《北方园艺》 北大核心 2025年第20期23-30,共8页
以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于... 以春兰‘黄荷梅’‘黄荷’及其18个杂交后代株系为试材,采用表型性状观测结合SRAP分子标记鉴定的方法,对表型性状进行变异系数、多样性指数、主成分分析,利用筛选的SRAP分子标记引物组合进行杂交后代真实性和遗传多样性分析,并分别基于表型性状和SRAP数据进行聚类分析,以期为春兰新品种选育提供参考依据。结果表明:20个数量性状变异系数为8.43%~37.41%,花序长度、花朵数和植株高度变异幅度较大;8个质量性状的信息多样性指数为0.47~1.57,遗传多样性指数为0.18~0.66,花型、花姿态、萼片形状和唇瓣姿态多样性较为丰富;共选出8个主成分,可以代表表型性状89.914%的遗传信息;基于表型性状的聚类分析将杂交后代分为2个类群,其中14个杂交后代株系与母本聚为一类;其他4个杂交后代株系与父本聚为一类。根据6对SRAP引物组合的父本特征带扩增情况,鉴定出18个杂交后代为真杂种;6对SRAP引物组合的平均多态性比例为80.43%,多态性信息含量均值为0.81;基于SRAP数据的聚类分析在遗传距离为0.34时将杂交后代分为三大类群,77.78%的杂交后代在亲缘关系上与母本聚为一类。综上所述,供试的‘黄荷梅’ב黄荷’杂交后代均为真杂种,其表型性状具有丰富的遗传多样性,且表现为偏母本遗传。 展开更多
关键词 春兰 杂交后代 表型性状 srap分子标记
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基于SRAP标记的生姜种质资源遗传多样性分析
6
作者 李晋华 王少铭 +3 位作者 罗莉斯 冷家归 侯颖辉 李德文 《分子植物育种》 北大核心 2025年第1期182-193,共12页
为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采... 为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术,对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析,并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数,并采用NTSYS pc-2.1软件进行种质间的UPGMA(Unweighted pair-group method,非加权组平均法)聚类分析和基于遗传一致度的群体间聚类分析。结果表明:供试96份生姜种质资源具有较为丰富的遗传多样性,利用筛选出的13对差异SRAP引物从生姜资源中扩增出多态性条带96条,多态性比率为88.89%,说明生姜种质资源的遗传变异较为广泛。根据来源相同或相近,将生姜种质资源分为13个群体,生姜资源品种间基于Nei's遗传多样性指数和Shannon多态性信息指数的分析结果表明,生姜虽为无性繁殖作物,但其具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记技术对生姜资源的多态性检出率水平较高,可有效揭示其遗传多样性和亲缘关系,群体内具有丰富的遗传多样性,但群体间遗传变异较小。 展开更多
关键词 生姜 srap分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
7
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省合肥市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 srap分子标记 ISSR分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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山桐子SRAP-PCR反应体系的优化及有效引物筛选
8
作者 严莉 仝铸 +7 位作者 苏春莉 何秀娟 肖翠 王泽琼 周明芹 袁龙义 邱文明 孙中海 《分子植物育种》 北大核心 2025年第16期5388-5394,共7页
为建立适用于山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)的SRAP-PCR反应体系,用于山桐子资源分析和鉴定,本研究以山桐子幼嫩叶片DNA为材料,采用L_(16)(4~5)正交试验设计,对影响山桐子SRAP-PCR反应体系的主要影响因素Mg^(2+)、d NTPs和引物浓度以... 为建立适用于山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)的SRAP-PCR反应体系,用于山桐子资源分析和鉴定,本研究以山桐子幼嫩叶片DNA为材料,采用L_(16)(4~5)正交试验设计,对影响山桐子SRAP-PCR反应体系的主要影响因素Mg^(2+)、d NTPs和引物浓度以及Taq DNA聚合酶和模板DNA用量进行优化。结果表明:山桐子SRAP-PCR最优反应体系中模板DNA为30ng、Taq DNA聚合酶用量为1.5U、dNTPs浓度为0.25mmol/L、引物浓度为0.5μmol/L、Mg^(2+)浓度为3 mmol/L、1×PCR buffer,总体系20μL。各因素对山桐子SRAP-PCR扩增效果影响从大到小依次为:Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、引物浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度。采用优化后的体系对267组SRAP引物进行筛选,其中220对引物组合可扩增出目的条带(引物有效性82.39%);157对引物组合能够扩增出清晰且多态性较高的条带。利用其中6对引物组合对24份山桐子资源进行了遗传分析,聚类结果客观反映了这些资源的地理分布和亲缘关系。以上结果表明本研究优化的山桐子SRAP-PCR反应体系稳定、可靠,可用于山桐子遗传资源研究等应用。 展开更多
关键词 山桐子 srap-PCR 引物筛选 体系优化
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基于SRAP标记的葡萄种质资源遗传多样性分析
9
作者 闫晓伟 魏一杰 +2 位作者 唐凡 王进 梁东 《北方园艺》 北大核心 2025年第21期8-15,共8页
以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表... 以77份葡萄种质为试材,采用SRAP分子标记,从DNA分子水平进行分析,使用非加权组平均法对葡萄种质进行聚类分析,研究了77份葡萄种质的遗传多样性;并根据蒙特卡洛模拟算法进行群体结构分析,以期为推动葡萄分子辅助育种提供参考依据。结果表明:运用SRAP分子标记技术,77份葡萄种质共检测出67个等位基因,每对引物平均扩增出等位基因6.70个,其中有效等位基因5.71个,遗传多样性分析所得遗传多样性指数为0.3882,香农指数平均为0.5637,77份葡萄品种试材通过聚类分析分为5类,群体分析为3类。综上所述,77份葡萄种质展现出丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 葡萄 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
10
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 郝丽珍 张凤兰 《安徽农业科学》 2025年第19期89-92,共4页
[目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过... [目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过一系列检测后,结果显示共138个位点被检出,其中多态位点百分比达到92.70%;Nei’s基因多样性指数平均值、Shannon’s信息多样性指数平均值、总基因多样性指数、遗传分化系数和基因流值分别为0.2204、0.3315、0.3112、0.2917和1.2140。沙芥不同居群之间存在一定的遗传分化,大部分发生在居群内,约占70.83%,29.17%发生在居群间。[结论]该研究结果可为后续开展沙芥珍稀物种的保护和利用奠定基础。 展开更多
关键词 沙芥 遗传多样性 亲缘关系 srap标记
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杉木球果形态变异及与SRAP标记的关联分析
11
作者 林慧珠 曾韦珊 +2 位作者 黄荣 黄少伟 郑会全 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第2期50-57,共8页
为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形... 为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形态特征在亲本间存在极显著差异;各球果表型变异系数达到了11.01%~31.90%,遗传变异系数达到了8.13%~21.54%,所有球果性状的重复力均高于0.8,说明杉木球果形态特征变化受到强烈的遗传因素控制。关联分析共得到59个标记与8个性状显著关联,其中与球果纵径、球果横径、单个球果鲜质量、球果体积、苞鳞层数、苞鳞总数、苞鳞长和苞鳞宽显著关联的标记分别有9、10、6、3、6、9、8、8个。 展开更多
关键词 杉木 球果 多态性 亲本 srap 关联分析
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基于SRAP标记的黄岩凤仙花遗传多样性和遗传结构研究
12
作者 方宇洁 朱晏 +6 位作者 周靓雯 王顺莉 张凯伦 何佳薇 鲍洪华 张慧娟 蒋明 《台州学院学报》 2025年第3期35-41,共7页
黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中... 黄岩凤仙花为浙江省特有植物,它具有较好的观赏和药用价值,由于该物种分布狭窄,植株数量稀少,因此亟须被保护。本文以4个居群的黄岩凤仙花叶片样品为材料,在建立和优化SRAP-PCR条件的基础上,展开遗传多样性研究。结果显示:从通用引物中共筛选得到了7组多态性高且稳定性好的引物;利用这些引物共扩增到DNA条带112条,其中多态性条带111条。在物种水平上,黄岩凤仙花的多态性比率(PPB)、Nei′s基因多样性指数(H)和Shannon′s指数(I)分别为98.98%、0.2747和0.4223;在居群水平上,PPB、H和I的均值分别为51.50%、0.1798和0.2691,表明遗传多样性低于物种水平。居群间的遗传距离介于0.1349~0.2309之间,基因分化系数(Gst)为0.3454,表明遗传变异主要分布在居群内部;基因流(Nm)为0.9475,表明居群间的基因流动较少。UPGAM聚类结果显示:40个单株可分为4组,分别为葫芦田、花积山、沙埠和涌泉,与地理分布完全一致;当基因型数量K=4时,40个样品可划分成4个亚类,这一结果与主成分分析一致。 展开更多
关键词 黄岩凤仙花 srap 分子标记 遗传多样性 遗传结构
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基于SRAP分子标记的石斛兰杂交后代鉴定及其遗传多样性分析
13
作者 林榕燕 陈艺荃 +2 位作者 林觅 伍莉娟 钟海丰 《东南园艺》 2025年第2期162-168,共7页
【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定... 【目的】构建基于SRAP分子标记技术的石斛兰杂交后代真实性鉴定方法,为石斛兰品种(系)鉴定提供可靠技术支撑。【方法】利用SRAP分子标记技术,对报春石斛、檀香石斛以及以报春石斛为母本、檀香石斛为父本的151个杂交后代进行真实性鉴定及遗传多样性分析。【结果】从90对SRAP引物中筛选7对特异性引物,实现对杂交后代的高效鉴定,效率达100%;多态性分析显示,7对引物的多态性比例为81.03%,揭示了丰富的遗传变异。聚类分析表明,在遗传距离为0.24时,153个样本材料可分为五个类群;82.78%的杂交后代与父本聚为一类,亲缘关系更近;杂交后代株系间的遗传相似系数普遍高于其与双亲的遗传相似系数,父本和母本与杂交后代株系的遗传相似系数接近。【结论】SRAP分子标记可用于石斛兰杂交后代早期鉴定,能够有效辅助石斛兰新品种鉴定和选育。 展开更多
关键词 石斛兰 srap标记 多态性 真实性鉴定 遗传多样性 特异性引物
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茄子SRAP反应体系的构建与优化
14
作者 李冠男 王宝春 +2 位作者 吴天珍 付蓉 张庆霞 《粮油与饲料科技》 2025年第9期82-86,共5页
研究采用正交试验L_(16)(4^(5))结合单因素试验设计,构建并优化了所选茄子品种的SRAP反应体系,筛选出各因素的最佳水平。针对所选用茄子品种得出结论:影响此次试验反应体系的主要因素的作用大小依次为:Mg^(2+)浓度>dNTPs浓度>模板... 研究采用正交试验L_(16)(4^(5))结合单因素试验设计,构建并优化了所选茄子品种的SRAP反应体系,筛选出各因素的最佳水平。针对所选用茄子品种得出结论:影响此次试验反应体系的主要因素的作用大小依次为:Mg^(2+)浓度>dNTPs浓度>模板DNA用量>Taq酶用量>引物浓度。同时确定了所选茄子品种SRAP-PCR反应体系的25 uL最佳组合:引物0.40μmol/L,Taq酶2 U,dNTPs 0.2 mmol/L,Mg^(2+)2 mmol/L,模板DNA 20 ng。经过多次重复试验,证明该试验体系具有较好的重复性和稳定性。构建这一优化体系为后续茄子利用SRAP分析提供了一定的参考。 展开更多
关键词 茄子 srap 反应体系 建立与优化
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运用SRAP和SSR分子标记鉴定铁皮石斛与金钗石斛F1代杂种的真实性 被引量：1
15
作者 杜俊峰 袁瑗 +1 位作者 邓春莉 任羽 《现代园艺》 2025年第2期6-8,共3页
为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定... 为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定石斛杂交后代可行,对加快石斛育种的速度,缩短育种的时间年限和石斛的种质资源保护具有重要意义。 展开更多
关键词 SSR分子标记 srap分子标记 铁皮石斛 金钗石斛 杂种鉴定
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河南省牛至及其近缘种甘牛至SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量：2
16
作者 田慧鑫 于婵 +7 位作者 杨帆 苏亚楠 王晓东 周艳 李贺敏 黄勇 梁妍 夏至 《河南农业科学》 北大核心 2025年第1期55-65,共11页
探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)... 探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,选取牛至野生居群(7个)、栽培居群(1个)及甘牛至栽培居群(1个)共9个居群77份牛至和甘牛至种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱。结果表明,9对引物共扩增出98个条带,多态性条带94条,多态性条带比率为95.92%,平均每对引物扩增出10.89条。等位基因数(Na)为1.9592、有效等位基因数(Ne)为1.4195、Nei基因多样性指数(H)为0.2632、Shannon’s指数(I)为0.4119。基于SRAP分子标记数据建立的UPGMA亲缘关系聚类图,遗传相似系数介于0.66~0.95。当遗传相似系数为0.66时,将牛至和甘牛至分为2个单独分支。在遗传相似系数为0.75时,不同区域牛至分为5个分支。综上,SRAP分子标记可以有效鉴别牛至与甘牛至;河南省南阳牛至种群遗传多样性高于其他区域;筛选出了5对SRAP引物(Me1/em6、Me1/em11、Me3/em4、Me3/em11、Me5/em3)构建牛至和甘牛至种质DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 牛至 甘牛至 相关序列扩增多态性 遗传多样性 DNA指纹图谱
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ISSR和SRAP分子标记在石斛属植物杂交育种上的应用效果
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作者 黄佳维 陈小玲 +1 位作者 陈前程 余松金 《现代农业科技》 2025年第12期145-148,共4页
以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标... 以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标记的聚类分析结果均将杯鞘石斛、喇叭唇石斛和紫婉石斛聚为一组,与传统分类结果和杂交结果一致,而兜唇石斛自成一组。区别在于ISSR分子标记将重唇石斛和黄喉石斛分开各自为一组,而SRAP分子标记将两者归为一组,遗传相似系数为0.500,与杂交结果相符。综上所述,ISSR和SRAP 2种分子标记均能在一定程度上指导石斛属植物的分类,ISSR在多态性分析上效果更好,SRAP则更能准确地表达种间亲缘关系,对杂交育种亲本的选择具有指导意义。 展开更多
关键词 石斛 杂交育种 ISSR srap 遗传多样性 结实率
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19个苦荞种质资源的SRAP分析
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作者 郑竹 解芬 文霞 《农技服务》 2025年第1期23-26,共4页
为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共... 为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共检测出69个等位变异,平均每对引物组合可检出4.643个等位变异。UPGMA聚类分析表明,19个苦荞供试材料遗传相似系数变幅为0.37~0.72,当遗传相似系数为0.39时,可将19份苦荞品种分为2类;当遗传相似系数为0.418时,可分为4类,说明19个苦荞品种在遗传组成上具有一定的差异,SRAP引物适用于苦荞多态性分析。 展开更多
关键词 苦荞 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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美味扇菇SRAP-PCR反应体系优化及菌盖颜色特异性引物筛选
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作者 张警丹 杨婷 +2 位作者 张慧敏 丁佳瑶 姜婉竹 《食药用菌》 2025年第5期350-356,共7页
以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:... 以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:美味扇菇SRAP-PCR的最优反应体系为Taq DNA聚合酶1.0 U、Mg^(2+)3.0 mmol/L、dNTPs 0.5 mmol/L、引物0.2μmol/L、模板DNA 40 ng/μL、ddH_(2)O补足至20μL。采用优化后的体系对153对SRAP引物进行筛选,有124对引物可以扩增出目的条带(引物有效性81.05%),其中105对引物组合能扩增出清晰且多态性较高的条带。研究结果可为美味扇菇分子标记开发及遗传多样性分析提供理论依据。 展开更多
关键词 美味扇菇 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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白及SRAP-PCR反应体系正交设计优化及引物筛选
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作者 桂腾琴 李春艳 +2 位作者 韦燕 武忠亮 张思平 《福建农业科技》 2025年第3期18-24,共7页
建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省... 建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省安龙县白及嫩叶为材料,应用正交设计L_(9)(3^(4))对反应体系中4个因素(引物、Taq DNA聚合酶、Mg2+和dNTPs)的用量进行优化,正交设计引物组合为(Me1/Em1),探索建立白及最佳SRAP-PCR反应体系并对引物进行筛选,筛选稳定性高、多态性好的引物组合。结果表明:白及的最佳SRAP-PCR反应体系(25μL)为:2.50μL10×Buffer、2.50 mmol·L^(−1)Mg^(2+)、0.30 mmol·L^(−1)dNTPs、0.25μmol·L^(−1)引物、1.50 U Taq DNA聚合酶以及20~80 ng模板DNA。利用21份白及对最佳SRAP-PCR反应体系稳定性检测,该体系稳定性高、重复性好。以白及基因组DNA为模板,选用最佳的SRAP-PCR反应体系对80对引物组合进行筛选,最终获得多态性引物13对,共扩增出182个位点,其中多态性位点152个,多态性位点百分比为83.52%。该体系稳定性高、重复性好,为后续遗传多样性研究提供相关的技术支持。 展开更多
关键词 白及 正交设计 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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