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干旱胁迫下白沙蒿SIP 2-1的表达和序列分析
被引量:
1
1
作者
唐思如
王铁娟
《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》
CAS
2020年第5期447-452,共6页
水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235...
水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235个氨基酸;属于水通道蛋白SIP2-1家族的成员;AsSIP 2-1与5个参考物种的比对结果显示6个物种的总体同源性为82.92%,并具有SIP2-1家族的特有的NPL和NPA保守性结构域;AsSIP 2-1的等电点为9.32;分子量为26.145 kDa;分子式为C1218H1893N301O317S10;属于疏水性、稳定性蛋白;具有内质网膜保留信号EKKT基序;具有6个跨膜区,属于跨膜蛋白;无信号肽,属于非分泌蛋白。在干旱迫下,AsSIP 2-1表达量显著下调,参与了应答反应。
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关键词
白沙蒿
水通道蛋白
sip2-1
生物信息学分析
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题名
干旱胁迫下白沙蒿SIP 2-1的表达和序列分析
被引量:
1
1
作者
唐思如
王铁娟
机构
内蒙古师范大学生命科学与技术学院
出处
《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》
CAS
2020年第5期447-452,共6页
基金
内蒙古自然科学基金资助项目(2019MS03041)。
文摘
水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235个氨基酸;属于水通道蛋白SIP2-1家族的成员;AsSIP 2-1与5个参考物种的比对结果显示6个物种的总体同源性为82.92%,并具有SIP2-1家族的特有的NPL和NPA保守性结构域;AsSIP 2-1的等电点为9.32;分子量为26.145 kDa;分子式为C1218H1893N301O317S10;属于疏水性、稳定性蛋白;具有内质网膜保留信号EKKT基序;具有6个跨膜区,属于跨膜蛋白;无信号肽,属于非分泌蛋白。在干旱迫下,AsSIP 2-1表达量显著下调,参与了应答反应。
关键词
白沙蒿
水通道蛋白
sip2-1
生物信息学分析
Keywords
Artemisia sphaerocephala
Aquaporins
sip2-1
bioinformatics analysis
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
干旱胁迫下白沙蒿SIP 2-1的表达和序列分析
唐思如
王铁娟
《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》
CAS
2020
1
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