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干旱胁迫下白沙蒿SIP 2-1的表达和序列分析 被引量:1
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作者 唐思如 王铁娟 《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》 CAS 2020年第5期447-452,共6页
水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235... 水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235个氨基酸;属于水通道蛋白SIP2-1家族的成员;AsSIP 2-1与5个参考物种的比对结果显示6个物种的总体同源性为82.92%,并具有SIP2-1家族的特有的NPL和NPA保守性结构域;AsSIP 2-1的等电点为9.32;分子量为26.145 kDa;分子式为C1218H1893N301O317S10;属于疏水性、稳定性蛋白;具有内质网膜保留信号EKKT基序;具有6个跨膜区,属于跨膜蛋白;无信号肽,属于非分泌蛋白。在干旱迫下,AsSIP 2-1表达量显著下调,参与了应答反应。 展开更多
关键词 白沙蒿 水通道蛋白 sip2-1 生物信息学分析
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