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中国杏自交不亲和花粉特异SFB基因的鉴定与序列分析 被引量：15
1
作者 吴俊 谷超 +3 位作者 张绍铃 张树军 宋宏峰 赵习平 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1329-1338,共10页
利用花粉SFB基因的同源扩增结合内切酶酶切的方法,在9个中国杏品种中首次克隆了6个花粉SFB基因,对应花柱S-RNase基因序号将其分别命名为Par-SFB8、Par-SFB9、Par-SFB11、Par-SFB17、Par-SFB23和Par-SFB26,在GenBank上的登录号分别为EU65... 利用花粉SFB基因的同源扩增结合内切酶酶切的方法,在9个中国杏品种中首次克隆了6个花粉SFB基因,对应花柱S-RNase基因序号将其分别命名为Par-SFB8、Par-SFB9、Par-SFB11、Par-SFB17、Par-SFB23和Par-SFB26,在GenBank上的登录号分别为EU652883、EU935588、EU652884、EU652885、EU652886和EU652887。序列分析表明杏的花粉SFB基因具有蔷薇科李属植物SFB基因的典型结构特征;其内含子位于5′端非翻译区,长度90～108bp,核苷酸序列的同源性为63.9%～93.3%。氨基酸序列的同源性比较表明,杏花粉SFB基因的种内同源性为73.7%～85.3%;与李属其他植物花粉SFB基因的种间同源性为75.2%～97.7%。利用特异PCR扩增进一步确定了杏的S9、S11、S17和S26单元型花柱S-RNase与花粉SFB基因间距离,表明花柱S-RNase与花粉SFB基因紧密连锁;同时组织特异性表达分析确定SFB基因在花粉组织中特异表达。以上结果说明获得的SFB基因为杏的花粉候选S基因。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 花粉sfb基因 克隆 序列
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2个中亚杏品种自交不亲和SFB基因的克隆及序列分析 被引量：13
2
作者 刘月霞 冯建荣 +2 位作者 王大江 曹晓艳 张虎平 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期551-557,共7页
【目的】为了获得杏中亚生态品种群中自交不亲和花粉特异表达的SFB基因全长,探讨SFB基因序列多态性,【方法】以中亚生态品种群‘馒头玉吕克’和‘索格佳娜丽’2个杏品种为材料,利用RT-PCR及RACE技术和DNAMAN软件分析,克隆得到了2个新的... 【目的】为了获得杏中亚生态品种群中自交不亲和花粉特异表达的SFB基因全长,探讨SFB基因序列多态性,【方法】以中亚生态品种群‘馒头玉吕克’和‘索格佳娜丽’2个杏品种为材料,利用RT-PCR及RACE技术和DNAMAN软件分析,克隆得到了2个新的SFB基因的全长cDNA,SFB33(HQ148064)和SFB50(HQ148074)。【结果】SFB33全长1 378 bp,SFB50全长1 313 bp,两个基因开放阅读框均为1 131 bp,编码376个氨基酸;与GenBank上已登录的SFB基因核苷酸序列进行Blast比对,SFB33基因与SFB-c(FJ362527)同源性为79%;SFB50基因与SFB23(EU652886)同源性为99%。在两个基因上均找到F-box区域和两个变异区及两个高变区。李亚科SFB氨基酸序列同源性比对显示SFB50与李亚科其他SFB基因亲缘关系较近,而SFB33与李亚科其他SFB基因亲缘关系较远。【结论】杏中亚生态品种群中SFB基因显示明显的序列多态性。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 sfb基因 序列
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扁桃SFB基因的克隆及其生物信息学分析 被引量：11
3
作者 郭长奎 罗淑萍 +2 位作者 何天明 李疆 高启明 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期170-175,共6页
以新疆扁桃栽培品种麻壳的花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,克隆到了一个全长为1131bp的SFB基因(Genbank登录号为:EU909685),命名为AcSFB10。该基因编码376个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序。经生物信息学分析,... 以新疆扁桃栽培品种麻壳的花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,克隆到了一个全长为1131bp的SFB基因(Genbank登录号为:EU909685),命名为AcSFB10。该基因编码376个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序。经生物信息学分析,推测AcSFB10蛋白的分子式为C2000H3033N517O558S23,相对分子质量为43985.5,等电点为6.02,二级结构以α螺旋为主;理论推导半衰期大约为30h,不稳定参数为53.21,属于不稳定蛋白;并且推测此蛋白为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起裂合酶的作用,特异性的识别底物,正好吻合了F-box蛋白的作用。 展开更多
关键词 扁桃 自交不亲和 sfb基因 生物信息学
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新疆杏品种SFB基因的克隆及实时定量表达 被引量：11
4
作者 王大江 冯建荣 +3 位作者 刘月霞 姜新 曹晓艳 赵宝龙 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期60-65,共6页
以新疆杏27个品种花粉为材料,进行转录水平SFB基因的克隆与测序;选取冬杏、苏陆克、库尔勒托拥3个杏品种,对其进行花粉离体培养,分析SFB基因在不同时期的表达特性。结果表明,在27个品种中扩增出4种大小不同的条带,引物组合1在26个品种... 以新疆杏27个品种花粉为材料,进行转录水平SFB基因的克隆与测序;选取冬杏、苏陆克、库尔勒托拥3个杏品种,对其进行花粉离体培养,分析SFB基因在不同时期的表达特性。结果表明,在27个品种中扩增出4种大小不同的条带,引物组合1在26个品种中扩增出条带,其中品种贝新纳尔,赛买提的片段大小为447 bp;大优佳的片段大小为446 bp,其余品种的大小为434 bp。引物组合2在品种托乎提中扩增出大小为660 bp大小的条带。序列比对显示27个品种的SFB基因为20种基因序列,与其他物种SFB基因序列比对显示20种基因序列均为新SFB基因序列,在GenBank上的登录号为:HQ148064-HQ148083;SFB基因在3个杏品种花粉离体培养不同培养时期均有表达,其表达丰度的变化趋势一致,呈先增后减的趋势,均在培养24 h时表达丰度最高,但是每个品种的表达峰值不同。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 sfb基因 实时定量PCR
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7个杏李品种花粉SFB基因的克隆鉴定 被引量：10
5
作者 李芳东 乌云塔娜 +2 位作者 杜红岩 李洪果 杨绍彬 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1-5,共5页
以美国杏李品种为试验材料,利用Prunus的SFB基因特异性引物,对7个杏李品种进行PCR扩增,并进行克隆、测序。采用生物信息学分析方法分离鉴定了‘恐龙蛋’等7个杏李品种的花粉SFB基因。PCR结果显示,‘风味皇后’、‘味帝’、‘味王’、‘... 以美国杏李品种为试验材料,利用Prunus的SFB基因特异性引物,对7个杏李品种进行PCR扩增,并进行克隆、测序。采用生物信息学分析方法分离鉴定了‘恐龙蛋’等7个杏李品种的花粉SFB基因。PCR结果显示,‘风味皇后’、‘味帝’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味馨’、‘恐龙蛋’等7个品种均扩增出一条460 bp左右的片段;对PCR产物回收克隆后测序,并通过BLAST比对和生物信息学分析表明,‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味帝’、‘恐龙蛋’等6个品种中克隆到了一个SFBh基因;‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味馨’等5个品种中克隆到了一个SFBe基因;‘味帝’和‘恐龙蛋’中分离克隆了SFBb基因;‘味馨’中分离克隆了一个SFB2基因;故7个杏李品种的花粉SFB基因型鉴定为:‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’和‘味厚’等4个品种的花粉SFB基因型相同,为SFBeSFBh;‘味帝’和‘恐龙蛋’的花粉SFB基因型相同,为SFBbSFBh;味馨’的花粉SFB基因型为SFBeSFB2。 展开更多
关键词 杏李 自交不亲和性 F-BOX sfb基因
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新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因的检测 被引量：10
6
作者 刘月霞 冯建荣 +2 位作者 王大江 樊新民 姜新 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期666-674,共9页
为系统鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因型,以新疆25个主栽杏品种为试材,利用蔷薇科保守序列设计引物对叶片基因组DNA进行SFB基因特异PCR扩增,筛选出有效的扩增引物;对成功扩增的杏品种的特异条带克隆测序,在GenBank上进行BLASTN比... 为系统鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因型,以新疆25个主栽杏品种为试材,利用蔷薇科保守序列设计引物对叶片基因组DNA进行SFB基因特异PCR扩增,筛选出有效的扩增引物;对成功扩增的杏品种的特异条带克隆测序,在GenBank上进行BLASTN比对,确定各品种的SFB基因型。结果显示:引物组合Ⅱ-1、Ⅳ-2,1-Ⅰ、1-Ⅱ对新疆杏品种的扩增效果最好,成功地在18个品种上扩增出了5种大小不同的条带,14种不同的基因型,其中两个基因(SFB-36,SFB-42)与GenBank上已经登录的SFB-13(the Accession No.EF062342)为同一基因,其余12个为新基因,暂命名为:SFB-30、SFB-31、SFB-32、SFB-33、SFB-34、SFB-35、SFB-37、SFB-38、SFB-39、SFB-40、SFB-41和SFB-43。对扩增出的SFB氨基酸序列进行比较,发现3个保守区和两个高变区;将试验所得基因与李属果树62个SFB基因构建系统进化树,显示李属果树SFB基因的种内相似性并不高于种间相似性。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 sfb基因
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甜樱桃SFB4与SFB4’基因的鉴别 被引量：13
7
作者 朱墨 张开春 +1 位作者 姜立杰 张晓明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期97-100,共4页
本研究以最近发现的李属花粉决定子候选基因“S单元型特异F-box蛋白基因(SFB)”为基 础,根据甜樱桃SFB4基因设计引物,从自交不亲和‘雷尼’和‘佳红’以及自交亲和的‘斯坦拉’总 DNA中分别扩增出SFB4和SFB4’基因的部分序列。经... 本研究以最近发现的李属花粉决定子候选基因“S单元型特异F-box蛋白基因(SFB)”为基 础,根据甜樱桃SFB4基因设计引物,从自交不亲和‘雷尼’和‘佳红’以及自交亲和的‘斯坦拉’总 DNA中分别扩增出SFB4和SFB4’基因的部分序列。经测序结果发现:SFB4’基因比SFB4基因缺失了4 个碱基TAAA。根据这个缺失差异,设计了一对引物BFP200和BFP201,这对引物只能扩增SFB4’基因, 而不能扩增SFB4基因,从而利用SFB基因区分开了甜樱桃自交不亲和的S4和自交亲和的S4’单元型。 展开更多
关键词 李属 S单元型特异F-box蛋白基因(sfb) 单元型
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新疆桃花柱S-RNase和花粉SFB基因的克隆与分析 被引量：5
8
作者 陈秋菊 孟冬 +5 位作者 李威 顾钊宇 段续伟 袁晖 张懿 李天忠 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期76-83,共8页
为探索新疆桃自交亲和的原因及其与普通桃的分类关系,以4个新疆桃(Prunus ferganensis Kost.et Riab)品种为试材,分别在花柱S-RNase和花粉SFB基因保守区设计引物,在DNA中鉴定其S基因型,并通过全长引物分别克隆4个品种中的S-RNase和SFB... 为探索新疆桃自交亲和的原因及其与普通桃的分类关系,以4个新疆桃(Prunus ferganensis Kost.et Riab)品种为试材,分别在花柱S-RNase和花粉SFB基因保守区设计引物,在DNA中鉴定其S基因型,并通过全长引物分别克隆4个品种中的S-RNase和SFB全长基因。测序后经分析确定S基因型分别是:‘和田黄肉’S2S2m,‘喀什1号’S1S2,‘喀什4号’S2S2,‘黄李光’S1S2。DNAMAN软件比对结果表明:S2m-RNase的第602个碱基鸟嘌呤G变成了腺嘌呤A,导致半胱氨酸变成了酪氨酸;SFB1m在第978个碱基后插入155bp的片段,导致蛋白质翻译提前终止;SFB2m基因由于在第492个碱基处有5bp的片段插入,使翻译在525bp处终止。RT-PCR组织特异性分析发现新疆桃4个品种的S-RNase均具有花柱组织特异性表达,SFB均具有花粉组织特异性表达;酵母双杂交试验显示突变的SFB1m和SFB2m能分别与S1-RNase、S2-RNase和S2m-RNase相互作用。以上结果表明新疆桃的S基因与桃其他栽培品种一致,自交亲和性可能与S基因的突变相关,且S基因的突变类型与目前鉴定出的普通桃(Prunus persica L.)突变类型一致,该研究进一步说明新疆桃与普通桃的进化关系较近。 展开更多
关键词 新疆桃 自交亲和性 花柱S-RNase 花粉sfb 克隆与分析
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扁桃AcSFB基因的克隆与原核表达分析 被引量：5
9
作者 郭长奎 罗淑萍 +1 位作者 李疆 高启明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1215-1220,共6页
利用RT-PCR和RACE技术,从新疆栽培扁桃‘鹰嘴’花药中获得了一个全长的SFB(S-hap-lotype-specific F-boxgene)基因(GenBank登录号为FJ362525),命名为AcSFBd。该基因全长1125bp,编码374个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-bo... 利用RT-PCR和RACE技术,从新疆栽培扁桃‘鹰嘴’花药中获得了一个全长的SFB(S-hap-lotype-specific F-boxgene)基因(GenBank登录号为FJ362525),命名为AcSFBd。该基因全长1125bp,编码374个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序,含有两个高变区(Hva和Hvb)和两个可变区(V1和V2)。生物信息学的方法成功预测了AcSFBd蛋白分子质量为43kD,为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起连接酶(EC6.-.-.-)的作用。成功构建了原核表达载体,并转化大肠杆菌BL21(DE3),SDS-PAGE检测结果显示表达了一个约60kD的蛋白。 展开更多
关键词 扁桃 基因 克隆 sfb基因 原核表达 生物信息学
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赛买提杏自交不亲和SFB基因全长的克隆与序列分析 被引量：4
10
作者 李亚兰 李淑玲 +2 位作者 曹晓艳 刘月霞 冯建荣 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1787-1791,共5页
【目的】克隆新疆主栽杏(Prunus armeniaca)赛买提自交不亲和性花粉SFB基因全长序列,为今后通过分子改良培育具有自交亲和性的赛买提杏奠定基础。【方法】通过RT-PCR法克隆获得赛买提杏花粉SFB基因中间片段,RACE技术克隆c DNA全长,DNAMA... 【目的】克隆新疆主栽杏(Prunus armeniaca)赛买提自交不亲和性花粉SFB基因全长序列,为今后通过分子改良培育具有自交亲和性的赛买提杏奠定基础。【方法】通过RT-PCR法克隆获得赛买提杏花粉SFB基因中间片段,RACE技术克隆c DNA全长,DNAMAN预测其氨基酸序列,并将编码蛋白与自交亲和的杏SFBC基因进行比对。【结果】克隆到1个全长为1 373 bp的SFB基因,命名为SFB60(Gen Bank登录中)。该基因包含1个1 122 bp的开放阅读框,编码373个氨基酸。与SFBC基因相比,该蛋白有2个变异区(V1和V2)和2个高变区(HVa和HVb),N端有一段由42个氨基酸组成的F-box结构域,而SFBC基因缺少2个高变区。【结论】获得了赛买提杏花粉自交不亲和SFB60基因c DNA全长序列,为进一步以分子育种的方法来改良赛买提杏的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 sfb基因 RACE
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果树配子体自交不亲和关键基因S-RNase与SFB同源基因研究进展 被引量：6
11
作者 林蔚 何新华 +2 位作者 罗聪 杜明富 王青 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1663-1671,共9页
近年来,随着果树自交不亲和研究的深入,在果树中发现了许多属于配子体自交不亲和(GSI)的树种。本综述着重从基因的分离鉴定、结构功能分析综述了果树配子体自交不亲和的关键基因S-RNase与SFB同源基因的研究进展及作用机制,对于果树品种... 近年来,随着果树自交不亲和研究的深入,在果树中发现了许多属于配子体自交不亲和(GSI)的树种。本综述着重从基因的分离鉴定、结构功能分析综述了果树配子体自交不亲和的关键基因S-RNase与SFB同源基因的研究进展及作用机制,对于果树品种杂交育种亲和性的选择及无核品种选育有着重要意义。 展开更多
关键词 果树 配子体自交不亲和 S-RNASE sfb SLF
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甜樱桃‘拉宾斯’自交亲和性与SFB4′基因的关系研究 被引量：7
12
作者 李洋 李长龙 +5 位作者 王晶 闫国华 张晓明 李威 张开春 李天忠 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1251-1259,共9页
甜樱桃品种‘拉宾斯’与‘雷尼’均为S1S4基因型。调查其自花结实率,‘拉宾斯’为31.3%,表现自交亲和;‘雷尼’为0,表现为自交不亲和。将‘拉宾斯’与‘雷尼’相互授粉,‘拉宾斯’为父本时表现亲和,反之不亲和,推断‘拉宾斯’的自交亲... 甜樱桃品种‘拉宾斯’与‘雷尼’均为S1S4基因型。调查其自花结实率,‘拉宾斯’为31.3%,表现自交亲和;‘雷尼’为0,表现为自交不亲和。将‘拉宾斯’与‘雷尼’相互授粉,‘拉宾斯’为父本时表现亲和,反之不亲和,推断‘拉宾斯’的自交亲和性由花粉侧突变导致;调查花粉萌发率,‘拉宾斯’为58.08%,‘雷尼’为57.82%。鉴定‘拉宾斯’自交后代及其与‘雷尼’杂交后代的S-RNase的基因型,发现所有后代中均出现S4基因型,部分后代中出现S1基因型,证明‘拉宾斯’花粉育性是正常的,其亲和性可能是由S4基因座上花粉侧的基因突变导致。测序发现‘拉宾斯’花粉SFB4′在911 bp处有4个碱基缺失。分析‘拉宾斯’花粉SFB4′与花柱S4-RNase的连锁性,发现两者连锁率为100%。以‘拉宾斯’为父本的带有SFB4′的杂交后代的自花结实率为23.3%~61.4%,表现自交亲和,说明来源于‘拉宾斯’的SFB4′基因与自交亲和性有关。RT-PCR及测序显示‘雷尼’SFB4与‘拉宾斯’SFB4′均能正常转录,但4个碱基缺失导致其C端翻译提前终止,原核表达SFB4和SFB4′蛋白发现SFB4略大于SFB4′,推测是由于SFB4′的翻译提前终止导致的。以上结果表明：‘拉宾斯’的自交亲和性可能是由花粉侧SFB4′C端的氨基酸缺失导致,该缺失可能使其丧失了与S-RNase的识别能力。 展开更多
关键词 甜樱桃 自交亲和性 花粉 sfb4′ 氨基酸缺失
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2个野扁桃自交不亲和SFB基因全长的克隆与序列分析 被引量：4
13
作者 曾斌 关鹏 +4 位作者 李疆 罗淑萍 李伟阳 田嘉 李鹏 《经济林研究》 北大核心 2017年第2期1-9,共9页
为给野扁桃的遗传改良和自交不亲和机制的进一步研究提供理论依据,以新疆野扁桃花药为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆野扁桃自交不亲和性花粉特异性决定因子编码基因SFB全长序列。采用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找开放阅读框,CDD... 为给野扁桃的遗传改良和自交不亲和机制的进一步研究提供理论依据,以新疆野扁桃花药为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆野扁桃自交不亲和性花粉特异性决定因子编码基因SFB全长序列。采用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找开放阅读框,CDD分析蛋白保守结构域,Prot Param分析蛋白理化性质,TMHMM预测蛋白跨膜区,Signal P预测蛋白信号肽,Sub Loc预测蛋白亚细胞定位,SOPMA分析蛋白二级结构,DANMAN进行氨基酸多序列比对,MEGA6进行系统进化分析,Prot Fun预测蛋白功能。结果表明:克隆到的Pt SFB16基因和Pt SFB17基因属于F-box基因家族,与其它多种植物的SLF/SFB基因的序列相似度为88%,推导的氨基酸序列均具有F-box蛋白典型结构;Pt SFB16基因ORF长1 146 bp,编码381个氨基酸,Pt SFB17基因ORF长1 131 bp,编码376个氨基酸;预测2个SFB蛋白均为略显亲水性、不稳定的细胞质蛋白,二级结构均以α-螺旋,延伸链和无规则卷曲为主,SFB/SLF蛋白在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,种间同源性可能大于种内同源性,SFB蛋白可能的功能主要有辅助因子生物合成、能量代谢和裂合酶。 展开更多
关键词 新疆野扁桃 自交不亲和性 sfb基因 生物信息学 RACE
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扁桃花粉SFB基因的鉴定和序列分析 被引量：8
14
作者 郭长奎 李疆 +1 位作者 罗淑萍 高启明 《经济林研究》 2009年第3期18-23,共6页
以新疆栽培扁桃品种"石头"花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,获得了一个全长的SFB基因(Genbank登录号为:FJ415321),命名为AcSFBg。该基因全长1 134 bp,编码377个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序,含有两... 以新疆栽培扁桃品种"石头"花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,获得了一个全长的SFB基因(Genbank登录号为:FJ415321),命名为AcSFBg。该基因全长1 134 bp,编码377个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序,含有两个高变区(Hva和Hvb)和两个可变区(V1和V2)。组织特异性表达分析表明:AcSFBg基因仅在花药中表达,雌蕊、花瓣以及叶片等组织中没有表达。F-box基因系统发育树的构建,发现在桃属不同种之间的SFB基因出现了交叉的现象,但与矮牵牛和金鱼草SLF基因具有比较远的亲缘关系。同时利用生物信息学的方法成功预测了AcSFBg蛋白为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起连接酶和主要中间产物新陈代谢的重要作用。结果表明:获得的AcSFBg基因就是花粉S决定子,也将为花粉自交不亲和机制的研究提供重要的理论依据。 展开更多
关键词 sfb基因 花药 序列分析 扁桃 自交不亲和
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‘小白杏’自交不亲和SFB基因RNAi表达载体的构建 被引量：2
15
作者 刘海楠 冯建荣 +3 位作者 罗明 刘小芳 李文慧 白茹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期148-155,共8页
【目的】应用RNA干扰(RNAi)技术在分子水平调控杏自交不亲和性状,为培育自交亲和杏品种奠定基础。【方法】基于南疆自交不亲和杏品种‘小白杏’(Prunus armeniaca‘Xiaobaixing’)花粉决定子SFB(S-haplotype-specific Fbox protein)基因... 【目的】应用RNA干扰(RNAi)技术在分子水平调控杏自交不亲和性状,为培育自交亲和杏品种奠定基础。【方法】基于南疆自交不亲和杏品种‘小白杏’(Prunus armeniaca‘Xiaobaixing’)花粉决定子SFB(S-haplotype-specific Fbox protein)基因3’端c DNA全长序列,选取SFB基因变异区上游距起始密码子61 bp处、大小为29 bp的片段作为干扰序列,棉花基因组DNA 242 bp的序列作为间隔片段,利用融合PCR(Fusion PCR)构建SFB基因发卡结构(intron-containing hairpin RNA,ihp RNA),再酶切连接到植物表达载体p CAMBIA-35S-MCS-NOS-NPTII上,构建SFB基因RNAi表达载体;用冻融转化法将重组质粒转化至农杆菌菌株(Agrobacterium tumefaciens)LBA4404中。【结果】测序结果表明臂长29 bp、茎环242 bp的SFB基因ihp RNA结构融合成功,双酶切检验和PCR验证结果表明,该结构正确地插入p CAMBIA-35S-MCS-NOS-NPTII的启动子和终止子之间,说明SFB基因的RNAi表达载体p CAMBIA-RNAi-SFB构建成功;PCR验证和测序结果也表明重组质粒已经成功转入农杆菌LBA4404中。【结论】研究结果表明,应用融合PCR结合酶切连接的方法构建SFB基因的RNAi表达载体是可行的,为RNAi技术在果树自交不亲和性状改良上的应用创造了条件。 展开更多
关键词 自交不亲和 sfb基因 RNAi表达载体
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新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB基因的克隆及生物信息学分析 被引量：2
16
作者 曾斌 刘楠楠 +3 位作者 夏江宏 刘梦雯 王建友 王波 《中国农学通报》 2017年第25期22-30,共9页
旨在克隆获得新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB新基因,以新疆野扁桃花药为试材,应用分子同源克隆及RT-PCR等技术,并进一步采用在线软件分析SFB基因的蛋白质理化性质,实验成功克隆到了PtSFB5与PtSFB6 2个新SFB基因的cDNA全长,2个基因的cDNA... 旨在克隆获得新疆野扁桃自交不亲和花粉SFB新基因,以新疆野扁桃花药为试材,应用分子同源克隆及RT-PCR等技术,并进一步采用在线软件分析SFB基因的蛋白质理化性质,实验成功克隆到了PtSFB5与PtSFB6 2个新SFB基因的cDNA全长,2个基因的cDNA全长分别为1124 bp和1072 bp,分别编码了374和348个氨基酸,2个基因都具有F-Box基因结构,属于F-Box基因家族,预测的相对分子量分别为30787.26和44037.74,等电点为5.93和5.43,均属于水溶性不稳定蛋白。 展开更多
关键词 新疆野扁桃 自交不亲和 sfb基因 克隆 生物信息学
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果梅自交不亲和相关基因型(S、SFB/SLF)研究进展 被引量：2
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作者 王培培 高志红 章镇 《中国农学通报》 CSCD 2012年第22期119-123,共5页
果梅(Prunus mume Sieb.etZucc.)原产于中国,为蔷薇科典型的配子体自交不亲和(GSI)品种。GSI至少由S位点的花柱S(S-RNase)基因和花粉S(SFB/SLF)基因决定。主要介绍了果梅GSI决定基因S基因和SFB/SLF基因的研究现状,并对基因型的鉴定技术A... 果梅(Prunus mume Sieb.etZucc.)原产于中国,为蔷薇科典型的配子体自交不亲和(GSI)品种。GSI至少由S位点的花柱S(S-RNase)基因和花粉S(SFB/SLF)基因决定。主要介绍了果梅GSI决定基因S基因和SFB/SLF基因的研究现状,并对基因型的鉴定技术AS-PCR的理论基础进行了介绍,对目前国内外已经鉴定出基因型的果梅品种进行了总结,这些将对果梅品种授粉树的合理配置和杂交育种的亲本选择具有重要的意义。 展开更多
关键词 果梅 自交不亲和 S基因 sfb/SLF基因
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融合FPN与SFB的Swin Transformer图像去噪网络
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作者 袁姮 华乾勇 《计算机系统应用》 2025年第10期32-43,共12页
为了提升图像去噪网络对局部与全局信息的捕捉能力,本文提出一种基于特征金字塔网络(feature pyramid network, FPN)和空间频率块(spatial frequency block, SFB)的Swin Transformer图像去噪网络(SwinFPSFNet).该网络由3个阶段组成:在... 为了提升图像去噪网络对局部与全局信息的捕捉能力,本文提出一种基于特征金字塔网络(feature pyramid network, FPN)和空间频率块(spatial frequency block, SFB)的Swin Transformer图像去噪网络(SwinFPSFNet).该网络由3个阶段组成:在浅层特征提取阶段,设计了特征金字塔网络以增强局部特征提取能力;在深层特征提取阶段,结合快速傅里叶卷积(fast Fourier convolution, FFC)设计空间频率块,用于同时捕捉全局与局部信息;最后,通过聚合浅层与深层特征,进一步增强网络去噪能力.此外,本文构建了一种高斯噪声退化模型并结合多种数据增强策略,以提升网络的泛化能力.在CBSD68、Kodak24和Urban100数据集上的实验结果表明,与当前主流去噪方法如BM3D、DnCNN、FFDNet、SwinIR等相比, SwinFPSFNet能够兼顾局部与全局信息,在噪声抑制和保留图像细节方面表现出显著优势. 展开更多
关键词 图像去噪 Swin Transformer 特征金字塔网络 空间频率块
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果树自交不亲和SFB与S-RNase作用分子机制研究进展 被引量：3
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作者 杨芩 付燕 《中国果树》 2015年第2期70-73,共4页
综述了蔷薇科果树自交不亲和性分子机制的相关研究进展,对果树自交不亲和关键基因SFB与S-RNase的生物合成与表达,序列结构特点及对应功能、作用机理及其在花柱传输组织中的相互作用等方面进行了总结,并在此基础上提出了改进修正抑制子... 综述了蔷薇科果树自交不亲和性分子机制的相关研究进展,对果树自交不亲和关键基因SFB与S-RNase的生物合成与表达,序列结构特点及对应功能、作用机理及其在花柱传输组织中的相互作用等方面进行了总结,并在此基础上提出了改进修正抑制子假说的相互作用机理,以期为开展果树自交不亲和分子机制的深入研究提供基础资料。 展开更多
关键词 果树 自交不亲和 分子机制 sfb S-RNASE SP
原文传递
‘小白杏’自交不亲和SFB基因的克隆及其表达载体的构建
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作者 刘海楠 冯建荣 +3 位作者 李文慧 罗明 刘小芳 孙军利 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1055-1061,共7页
【目的】利用基因工程技术改良杏自交不亲和性状,为培育自交亲和杏品种奠定基础。【方法】以新疆自交不亲和杏品种‘小白杏’(Prunus armeniaca L.‘Xiaobaixing’)的花粉为材料,通过RT-PCR(Reverse Transcription PCR)和3’RACE(Rapid ... 【目的】利用基因工程技术改良杏自交不亲和性状,为培育自交亲和杏品种奠定基础。【方法】以新疆自交不亲和杏品种‘小白杏’(Prunus armeniaca L.‘Xiaobaixing’)的花粉为材料,通过RT-PCR(Reverse Transcription PCR)和3’RACE(Rapid Amplification of c DNA Ends)技术克隆SFB基因(S-haplotype-specific F-box protein)片段。以克隆载体p MD19-T为基础,结合p BS-T上的酶切位点,利用酶切连接的方法将SFB基因的ORF框正向重组到表达载体p CAMBIA-35S-MCS-NOS-NPTII的Kpn I和Sac I酶切位点之间,构建SFB基因正义表达载体p CAMBIA-S-SFB;将SFB基因的ORF框反向重组到表达载体的Kpn I和Sal I酶切位点之间,构建SFB基因反义表达载体p CAMBIA-A-SFB;用电击转化法将重组质粒转化至农杆菌菌株(Agrobacterium tumefaciens)LBA4404中。【结果】通过RT-PCR和RACE技术获得了1136 bp SFB基因片段(Gen Bank登录中),其中含912 bp ORF框(Open Reading Frame),由它推导的氨基酸序列与蔷薇科SFB基因高度同源,具有F-box结构域、2个变异区和2个高变区的完整结构;表达载体酶切检验结果表明,SFB基因的ORF框正确地插入p CAMBIA-35S-MCS-NOS-NPTII的启动子和终止子之间,表明SFB基因的正、反义表达载体构建成功;特异引物PCR验证结果也表明重组质粒已经成功转入农杆菌LBA4404中。【结论】研究的结果为利用基因工程技术改良杏自交不亲和性状、培育自交亲和杏品种的遗传转化提供了载体。 展开更多
关键词 杏 自交不亲和 sfb基因 表达载体
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