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深圳市伤寒PulseNet数据库的初步建立与应用 被引量:6
1
作者 石晓路 扈庆华 +6 位作者 王冰 林一曼 兰全学 程锦泉 张顺祥 阚飙 徐建国 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2007年第17期3201-3203,3206,共4页
[目的]建立深圳市伤寒PulseNet数据库,用于伤寒的实时监测和分子流行病学调查。[方法]采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术,对深圳市2002~2005年106株伤寒的染色体DNA进行酶切,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型... [目的]建立深圳市伤寒PulseNet数据库,用于伤寒的实时监测和分子流行病学调查。[方法]采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术,对深圳市2002~2005年106株伤寒的染色体DNA进行酶切,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型数据库。[结果]深圳市各年的伤寒菌株变异较多,呈现30多种PFGE图谱。同一起伤寒暴发的临床分离株具有相同的PFGE图谱。[结论]深圳市伤寒PulseNet数据库的初步建立,对直观地分析各起疫情之间的相互关系,对疫情的控制和传染来源的追踪具有重要意义。 展开更多
关键词 伤寒 脉冲场凝胶电泳 pulsenet
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转化预防医学的实践:PulseNet China 被引量:10
2
作者 李伟 崔志刚 +1 位作者 阚飙 徐建国 《疾病监测》 CAS 2012年第2期88-92,共5页
PulseNet China是我国细菌性传染病分子分型实验室监测网络,是中国疾控系统在病原菌监测领域技术进步和科技创新的平台。本文阐述了PulseNet China网络在传染病暴发的早期预警、溯源、突发公共卫生事件应对中的作用,介绍了PulseNet Chin... PulseNet China是我国细菌性传染病分子分型实验室监测网络,是中国疾控系统在病原菌监测领域技术进步和科技创新的平台。本文阐述了PulseNet China网络在传染病暴发的早期预警、溯源、突发公共卫生事件应对中的作用,介绍了PulseNet China工作进展、发展目标以及2012年重点工作,讨论了PulseNet China现阶段存在的问题及对策。PulseNet China是我国细菌性传染病分型监测网络化理念创新,是未来我国实验室病原体监测的发展方向和关键支撑技术。PulseNet China将病原菌分子分型监测形成的技术成果和创新转化为我国传染病预防控制的技术手段,是我国转化预防医学的实践,也是为我国传染病预防控制和食品安全以及为我国民生事业做出相应贡献的专业实践。 展开更多
关键词 传染病 分子分型 实验室监测网络-pulsenet
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深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库的建立与应用
3
作者 石晓路 扈庆华 +5 位作者 王冰 林一曼 程锦泉 马汉武 阚飙 徐建国 《中国热带医学》 CAS 2010年第8期936-938,共3页
目的建立深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库,用于甲型副伤寒的实时监测和分子流行病学调查。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术,对深圳市2002-2007年散发和爆发的243株甲型副伤寒沙门菌的染色体DNA进行酶切电泳,用BioNumerics软件对PFGE... 目的建立深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库,用于甲型副伤寒的实时监测和分子流行病学调查。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术,对深圳市2002-2007年散发和爆发的243株甲型副伤寒沙门菌的染色体DNA进行酶切电泳,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型数据库。结果深圳市甲型副伤寒菌株各年间差异较小,用Xba酶切仅呈现6种PFGE图谱。同一起甲副暴发的临床分离株具有相同的PFGE图谱。各区和各年代的分离株都存在有相同的PFGE带型。结论深圳市甲型副伤寒沙门菌变异较小,呈长期流行趋势,甲型副伤寒PulseNet数据库的初步建立,对直观地分析各起疫情之间的相互关系,对疫情的控制和传染来源的追踪具有重要意义。 展开更多
关键词 甲型副伤寒 脉冲场凝胶电泳 pulsenet
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PulseNet与美国食源性疾病的监测
4
作者 唐琳琳 《解放军预防医学杂志》 CAS 2013年第5期479-480,共2页
食品安全关系国计民生,其中食源性疾病的快速监测,无论在食源性疾病的预防还是后续反应中都至关重要。PulseNet是近十年来美国最有影响力的食品安全情报收集系统和检测系统,文章概述了PulseNet在食源性疾病监测方面的应用,为我国开展食... 食品安全关系国计民生,其中食源性疾病的快速监测,无论在食源性疾病的预防还是后续反应中都至关重要。PulseNet是近十年来美国最有影响力的食品安全情报收集系统和检测系统,文章概述了PulseNet在食源性疾病监测方面的应用,为我国开展食源性疾病监测提供借鉴。 展开更多
关键词 pulsenet 食源性疾病 食品安全 食品安全监测
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PulseNetChina数据库在安徽省4起霍乱疫情溯源中的应用 被引量:2
5
作者 胡守奎 郑田利 +6 位作者 胡万富 王建军 李伟 崔志刚 周海健 逄波 阚飙 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1003-1005,共3页
目的通过PulseNetChina数据库对安徽省2012年4起霍乱疫情进行溯源分析。方法应用PCR扩增霍乱弧菌CT和TCP毒力基因,并利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型,使用BioNumericsV4.0软件对电泳结果进行聚类分析,并与PulseNetChina数... 目的通过PulseNetChina数据库对安徽省2012年4起霍乱疫情进行溯源分析。方法应用PCR扩增霍乱弧菌CT和TCP毒力基因,并利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型,使用BioNumericsV4.0软件对电泳结果进行聚类分析,并与PulseNetChina数据库进行比对。结果16株菌经PCR扩增,CT和TCP基因均出现目的条带。菌株经NotI和踊I酶切,PFGE聚类分析显示,13株菌的同源性〉98%。其中2株菌与PulseNetChina数据库中湖南、四川、浙江、上海、湖北5省(市)同年霍乱疫情菌株同源性达100%。结论安徽省2012年4起霍乱疫情均源自食用霍乱弧菌感染甲鱼。PulseNetChina数据库能有效、快速地对霍乱疫情溯源和预警。 展开更多
关键词 中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络 霍乱 预警
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PulseNet China,a model for future laboratory-based bacterial infectious disease surveillance in China 被引量:6
6
作者 Wei Li Shan Lu +7 位作者 Zhigang Cui Jinghua Cui Haijian Zhou Yiqing Wang Zhujun Shao Changyun Ye Biao Kan Jianguo Xu 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2012年第4期366-375,共10页
Surveillance is critical for the prevention and control of infectious disease.China’s real-time web-based infectious disease reporting system is a distinguished achievement.However,many aspects of the current China I... Surveillance is critical for the prevention and control of infectious disease.China’s real-time web-based infectious disease reporting system is a distinguished achievement.However,many aspects of the current China Infectious Disease Surveillance System do not yet meet the demand for timely outbreak detection and identification of emerging infectious disease.PulseNet,the national molecular typing network for foodborne disease surveillance was first established by the Centers for Disease Control and Prevention of the United States in 1995 and has proven valuable in the early detection of outbreaks and tracing the pathogen source.Since 2001,the China CDC laboratory for bacterial pathogen analysis has been a member of the PulseNet International family;and has been adapting the idea and methodology of PulseNet to develop a model for a future national laboratory-based surveillance system for all bacterial infectious disease.We summarized the development progress for the PulseNet China system and discussed it as a model for the future of China’s national laboratory-based surveillance system. 展开更多
关键词 infectious disease laboratory-based infectious disease surveillance pulse field gel electrophoresis multilocus sequencing typing pulsenet China
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厦门地区ICU多重耐药鲍曼不动杆菌的耐药性及同源性分析 被引量:3
7
作者 黄连江 黄仕杰 +3 位作者 梁小亮 翁琴云 姚艺辉 黄建炜 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第24期3744-3746,共3页
目的 分析厦门地区ICU多重耐药鲍曼不动杆菌的耐药表型及同源性,为确定其感染流行特征和制定防控措施提供依据.方法 收集厦门地区3家综合性医院ICU患者分离的鲍曼不动杆菌,以K-B法检测16种抗菌药物的敏感性,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)... 目的 分析厦门地区ICU多重耐药鲍曼不动杆菌的耐药表型及同源性,为确定其感染流行特征和制定防控措施提供依据.方法 收集厦门地区3家综合性医院ICU患者分离的鲍曼不动杆菌,以K-B法检测16种抗菌药物的敏感性,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子生物学分型.结果 45株都属于多重耐药菌株,在16种抗菌药物中仅有个别菌株对阿米卡星和头孢哌酮/舒巴坦呈现中度敏感;PFGE分析可分为PT1~11共11个型别,其中在收集菌株期间导致某次感染暴发的菌株属于PT4型(26株,58%).结论 厦门地区ICU存在多重耐药鲍曼不动杆菌流行,菌株PFGE带型分布离散性较大,不同医院在不同时期流行菌株型别不同.建议应合理使用抗菌药物,治疗首选头孢哌酮/舒巴坦,加强其耐药性变迁和流行菌型的监测,建议采用网络实验室的标准(PulseNet 标准)开展对优势流行菌型的监测. 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 耐药性 脉冲场凝胶电泳分型 pulsenet标准 医院感染
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中国六省伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳分析及数据库的建立 被引量:2
8
作者 陈春霞 赵英伟 +2 位作者 崔志刚 刁保卫 阚飙 《疾病监测》 CAS 2009年第8期569-572,共4页
目的对中国六省分离的伤寒沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国伤寒沙门菌的数据库。方法采用PFGE技术,对中国1979-2005年六省分离的伤寒沙门菌用XbaⅠ酶切,用BioNumerics软件对PFGE图谱进行分析,并且建立中国分子分型数... 目的对中国六省分离的伤寒沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国伤寒沙门菌的数据库。方法采用PFGE技术,对中国1979-2005年六省分离的伤寒沙门菌用XbaⅠ酶切,用BioNumerics软件对PFGE图谱进行分析,并且建立中国分子分型数据库。结果收集的417株菌株共有288种不同的PFGE带型,相似性系数在55.2%~100%之间,不同的省份和年份之间有交叉带型。结论中国伤寒沙门菌的菌株变异较大,不同的省份可能存在不同克隆系的伤寒沙门菌菌株的流行。通过建立中国伤寒沙门菌PFGE带型数据库,对中国以后伤寒沙门菌的监测具有重要的意义。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 pulsenet
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一起基于国家致病菌识别网的志贺菌病暴发事件实验室分析 被引量:6
9
作者 张萍 李颖 +6 位作者 甄博珺 高翔 江南 郑燃燃 张扬 邹林 王建国 《疾病监测》 CAS 2020年第8期729-734,共6页
目的对基于国家致病菌识别网监测体系的志贺菌病暴发事件进行实验室分析。方法对2019年北京市通州区志贺菌病暴发疫情菌株进行分离和鉴定,结合2015—2019年北京市通州区监测和暴发疫情菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型和药敏试验比对分... 目的对基于国家致病菌识别网监测体系的志贺菌病暴发事件进行实验室分析。方法对2019年北京市通州区志贺菌病暴发疫情菌株进行分离和鉴定,结合2015—2019年北京市通州区监测和暴发疫情菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型和药敏试验比对分析。结果28株志贺菌中27株带型相似度≥92.0%,疫情相关菌株带型相似度≥97.1%,说明本地区存在一组亲缘关系接近的志贺菌并以低流行态势存在。所有菌株均为多重耐药菌,2019年宋内志贺菌分离株对庆大霉素耐药与2015—2018年比较差异有统计学意义(χ2=49.907,P<0.001),提示庆大霉素在志贺菌病治疗中应慎重使用。全部菌株对环丙沙星、氯霉素、头孢西丁和亚胺培南均敏感,提示该类药物对志贺菌感染具有较好的治疗效果。结论近年来,通州区流行的痢疾菌株主要为宋内志贺菌,菌株同源性较高,多重耐药情况严重,应利用国家致病菌识别网监测体系加强志贺菌的日常监测和耐药监测。 展开更多
关键词 志贺菌病 暴发 脉冲场凝胶电泳 耐药 国家致病菌识别网
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阿贡纳沙门菌引起的聚集性腹泻病例监测及分析 被引量:5
10
作者 曲梅 张新 +6 位作者 王小莉 黄瑛 钱海坤 刘桂荣 李伟 阚飙 王全意 《疾病监测》 CAS 2013年第3期193-196,共4页
目的应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型技术分析时间上高度集中的散发腹泻病例,发现可能的聚集性,并进行流行病学调查和追溯。方法利用已建立的北京市肠道多病原分子分型监测系统,采集腹泻病例粪便标... 目的应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型技术分析时间上高度集中的散发腹泻病例,发现可能的聚集性,并进行流行病学调查和追溯。方法利用已建立的北京市肠道多病原分子分型监测系统,采集腹泻病例粪便标本进行病原菌分离培养、生化鉴定、血清凝集、药敏试验及PFGE分子分型。结果2012年5月2-7日连续一周内,从北京市某区(县)肠道门诊采集的22份腹泻病例粪便标本中分离到9株沙门菌,血清学鉴定为阿贡纳沙门菌。XbaⅠ酶切的PFGE带型一致,与中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络(PulseNet China)中心数据库及各地区网络实验室数据比对分析后,确认该带型为一新的图谱带型,编码为JABX01.CN0072。结论 9例阿贡纳沙门菌感染病例的发病时间和地理分布高度集中,且PFGE带型聚集成簇,提示感染菌株具有同一克隆来源。随后的流行病学调查和感染来源分析,虽并未发现共同暴露因素,但说明PFGE技术的应用可以提高监测的敏感性,应长期持续的进行病原菌分子分型监测,进一步完善PulseNet网络和运行机制。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳 阿贡纳沙门菌 监测 中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络
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中国嗜肺军团菌分离株脉冲场凝胶电泳分型分析以及数据库的建立 被引量:7
11
作者 秦天 任红宇 +3 位作者 周海健 朱兵清 崔志刚 邵祝军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期285-289,共5页
目的 对分离的262株嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国嗜肺军团菌的PFGE分型数据库.方法 采用PFGE技术,对2004-2009年中国11个省(市)分离的嗜肺军团菌用AscⅠ酶切,BioNumerics软件分析PFGE图谱,并建立分子分型... 目的 对分离的262株嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国嗜肺军团菌的PFGE分型数据库.方法 采用PFGE技术,对2004-2009年中国11个省(市)分离的嗜肺军团菌用AscⅠ酶切,BioNumerics软件分析PFGE图谱,并建立分子分型数据库.结果 262株嗜肺军团菌的PFGE图谱共分为108种不同的PFGE带型,相似性系数在16%~100%之间,通过聚类分析,可以分为差异明显的不同簇.不同省份、年份和血清型的菌株之间有交叉带型.结论 中国环境分离的嗜肺军团菌菌株基因组变异较大,同时也具有克隆化特征,且可能有多个克隆系存在. 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 脉冲场凝胶电泳 监测网络 中国病原细菌实验室
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沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型在流行病学调查中的应用 被引量:9
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作者 王晨 袁巧 邓小玲 《国际流行病学传染病学杂志》 CAS 2012年第3期212-216,共5页
沙门菌造成的食物中毒和食源性疾病暴发是全球性的公共卫生问题。对人感染的沙门菌进行血清分型,进一步对同一血清型菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型,可以增强识别食源性疾病暴发的能力,发现暴发病例,掌握流行趋势,追溯感染源头。... 沙门菌造成的食物中毒和食源性疾病暴发是全球性的公共卫生问题。对人感染的沙门菌进行血清分型,进一步对同一血清型菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型,可以增强识别食源性疾病暴发的能力,发现暴发病例,掌握流行趋势,追溯感染源头。此文对沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型的研究进展及应用作了综述。 展开更多
关键词 沙门菌属 血清分型 暴发 脉冲场凝胶电泳 PluseNet
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